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IgG1型单克隆抗体对照品的一级结构解析 预览
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作者 崔新玲 胡志上 +3 位作者 孟晓光 钱小红 朱涛 万涛 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期939-945,共7页
对单克隆抗体药物对照品(IgG1型)进行了全面的结构表征。采用ExactiveplusEMR质谱测定了去N糖前后抗体的精确分子量,并通过计算N糖含量得出其完整分子量为148285.0~149020.8,完整去糖后分子量为145810.4,N糖含量为1.67%~2.15%。优化了... 对单克隆抗体药物对照品(IgG1型)进行了全面的结构表征。采用ExactiveplusEMR质谱测定了去N糖前后抗体的精确分子量,并通过计算N糖含量得出其完整分子量为148285.0~149020.8,完整去糖后分子量为145810.4,N糖含量为1.67%~2.15%。优化了全柱成像实时等电聚焦毛细管电泳(WCID-cIEF)检测方法,结果显示该抗体等电点分布在8.21~8.74之间,其中主成分等电点为8.61,相对含量为61.43%。继而使用离子交换色谱检测了电荷异质性,发现碱性峰含量为4.1%,酸性峰含量为23.9%,主峰含量为72.0%,与WCID-cIEF结果吻合,并证明了方法间良好的重现性。通过切糖前后的肽图分析,获得糖肽分布信息,识别出糖修饰位点及重轻链的互补决定区(CDR),甲硫氨酸(M)的氧化位点及氧化率,并通过抗体还原前后的肽图解析出二硫键连接。研究结果同时提示该抗体对照品无C末端糖化修饰现象。 展开更多
关键词 抗体对照品 分子量 等电点 电荷异质性 肽图
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基于转录组的肝细胞癌分子分型研究进展
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作者 赵洋 张勇 +3 位作者 燕蒙 王子叶 万涛 钱小红 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第1期10-17,共8页
肝细胞癌是恶性程度极高的肿瘤之一,患者的发病率和死亡率都位居恶性肿瘤前列.虽然传统临床病理诊断和分级治疗策略得到了极大的发展,并显著改善了肝细胞癌患者的生存情况,但至今肝细胞癌患者的5年生存率仍然较低.基因测序技术的进步和... 肝细胞癌是恶性程度极高的肿瘤之一,患者的发病率和死亡率都位居恶性肿瘤前列.虽然传统临床病理诊断和分级治疗策略得到了极大的发展,并显著改善了肝细胞癌患者的生存情况,但至今肝细胞癌患者的5年生存率仍然较低.基因测序技术的进步和发展加速了肿瘤基因组学的研究,也帮助科学家认识了肿瘤的异质性及其发生、发展的分子机制.近20年,科学家基于转录组数据提出了许多与病理特征相关的肝细胞癌分子亚型,并对其生物学特性和分子特征进行了深入的挖掘.若能将转录组分子亚型与临床病理分级系统综合考虑,用于肝细胞癌病理诊断和分级治疗,将有望改善病人的生存情况,推进肝细胞癌病人的个体化医疗进程. 展开更多
关键词 肝细胞癌 转录组 分子亚型 生存率
基于超高效液相色谱-八端口转子阀的微升级预分级系统的建立 预览 被引量:1
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作者 燕蒙 赵洋 +2 位作者 张养军 万涛 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期477-483,共7页
复杂生物系统蛋白质组的深度覆盖鉴定得益于近年来快速发展的高效色谱分离和串联质谱分析技术。二维高效液相色谱(2-DHPLC)是实现复杂肽混合物正交分离的有效手段,但其缺点是运行时间长,通常要求肽上样量在毫克级别,且收集时的组分体积... 复杂生物系统蛋白质组的深度覆盖鉴定得益于近年来快速发展的高效色谱分离和串联质谱分析技术。二维高效液相色谱(2-DHPLC)是实现复杂肽混合物正交分离的有效手段,但其缺点是运行时间长,通常要求肽上样量在毫克级别,且收集时的组分体积大,后续合并流程复杂,而有望替代其的StageTip技术,则由于有限的色谱分离梯度,难以达到充分的正交分离。该文探索了超高效液相色谱(UPLC)和八端口转子阀联用,作为高效、便捷肽段预分离和收集系统的可行性。研究结果显示,将UPLC的高pH反相色谱分馏与在线LC-MS/MS相结合,可以实现高pH和低pH条件下基于肽段不同色谱保留行为的正交互补分离,在蛋白质鉴定方面表现出优越的性能。应用该方法对人肝癌细胞系HepG2进行3次技术重复试验,重复试验间具有非常高的定量重现性(决定系数R^2>0.95)。与传统StageTip方法相比,肽段鉴定数提高了23.52%。该分级方法灵活、稳定,能够针对较少的样品开展蛋白质组深度覆盖分析。 展开更多
关键词 二维液相色谱 超高效液相色谱 八端口转子阀 蛋白质组学 分馏
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基因工程药物宿主细胞蛋白的研究进展
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作者 崔新玲 朱涛 万涛 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1533-1541,共9页
根据宿主细胞蛋白(HCPs)的来源、影响因素等背景,综合近年来国内外在HCPs检测方面所取得的进展,重点介绍新型质谱技术在HCPs检测中的应用。HCPs的分析方法有免疫分析法(例如Western Blot和ELISA)或其他方法(例如电泳和质谱),目前最常用... 根据宿主细胞蛋白(HCPs)的来源、影响因素等背景,综合近年来国内外在HCPs检测方面所取得的进展,重点介绍新型质谱技术在HCPs检测中的应用。HCPs的分析方法有免疫分析法(例如Western Blot和ELISA)或其他方法(例如电泳和质谱),目前最常用的检测方法是ELISA法,但ELISA法存在很多问题与不足。新型检测技术,如邻位连接分析法(PLA)、生物传感器技术等也被用于HCPs检测,但这些方法难以推广使用。HCPs是产品质量控制的关键属性之一,其细胞丰度检测是药物放行并进行临床研究的重要参数。本文详细比较说明了各种HCPs检测方法的优缺点,基于质谱的蛋白质组学技术对HCPs进行定性与定量分析,目前已取得了较好的结果,弥补了ELISA方法的不足。 展开更多
关键词 基因工程药物 宿主细胞蛋白 免疫分析法 蛋白质组学 质谱
质谱方法实现抗体类药物糖链修饰的鉴定与定量研究
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作者 黄怡 李晓宇 +2 位作者 田芳 钱小红 万涛 《中国生物工程杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期32-41,共10页
目的:基于液质联用的串联质谱技术,建立基于完整糖肽水平的抗体药糖型定性定量分析方法,并用于生物仿制药糖型研究。方法:基于液相色谱质谱技术,从完整糖肽水平对糖型进行定性定量分析,同时与传统超高效液相荧光检测(ultra performan... 目的:基于液质联用的串联质谱技术,建立基于完整糖肽水平的抗体药糖型定性定量分析方法,并用于生物仿制药糖型研究。方法:基于液相色谱质谱技术,从完整糖肽水平对糖型进行定性定量分析,同时与传统超高效液相荧光检测(ultra performance liquid chromatography_fluorescence detection,UPLC-FLR)结果比较,获得最优分析策略,并用于曲妥珠单抗仿制药批次间糖型定性定量分析。结果:UPLC-FLR方法定量分析了贝伐单抗7种糖型;液质联用方法定量19种糖型;经亲水相互作用色谱(hydrophilic interaction liquid chromatography,HILIC)富集后,定量22种糖型。曲妥珠单抗仿制药批次间糖型定量结果显示良好的一致性。结论:基于液质联用的方法,具有速度快、灵敏度高、检测糖型种类多等优势,有望作为一种稳定的抗体药物糖蛋白位点特异性定量分析策略。 展开更多
关键词 超高效液相荧光检测 液质联用 抗体药物 完整糖肽定量
分泌体系O-GalNAc修饰研究方法与应用进展 被引量:2
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作者 张勇 赵洋 +1 位作者 万涛 钱小红 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第2期124-133,共10页
蛋白质O-GalNAc糖基化作为蛋白质翻译后修饰的一种重要形式,参与重要的生理和病理过程.在血浆及其他分泌体系中,O-GalNAc修饰的异常改变可能作为疾病预警的标志分子.鉴于O-GalNAc结构的多样性,系统性分析O-GalNAc修饰具有极大的挑战.随... 蛋白质O-GalNAc糖基化作为蛋白质翻译后修饰的一种重要形式,参与重要的生理和病理过程.在血浆及其他分泌体系中,O-GalNAc修饰的异常改变可能作为疾病预警的标志分子.鉴于O-GalNAc结构的多样性,系统性分析O-GalNAc修饰具有极大的挑战.随着富集方法、质谱分析技术以及数据解析工具的发展,近年来O-GalNAc修饰的研究取得了一系列进展,促进了对蛋白O-GalNAc糖基化在人类健康中所起作用的深入理解.本文主要介绍近年来分泌体系中的O-糖基化蛋白、O-糖链以及O-糖基化位点的富集与鉴定方法和最新进展. 展开更多
关键词 生物质谱 血浆 O-糖基化蛋白 O-糖基化位点 O-糖链
重组含糖识别结构域的人源半乳糖凝集素-3在糖蛋白/糖肽富集中的应用 预览 被引量:1
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作者 赵洋 张勇 +3 位作者 王明超 孟波 万涛 钱小红 《色谱》 CSCD 北大核心 2018年第12期1197-1205,共9页
植物凝集素是广泛使用的糖蛋白富集和识别材料,动物凝集素则较少被尝试用于糖蛋白富集。基于人源半乳糖凝集素-3的糖识别结构域(CRD),设计了两种重组凝集素:Gal3C(一个CRD)和Tetra-Gal3C(四重串联CRD)。通过将两种凝集素固定于链霉亲和... 植物凝集素是广泛使用的糖蛋白富集和识别材料,动物凝集素则较少被尝试用于糖蛋白富集。基于人源半乳糖凝集素-3的糖识别结构域(CRD),设计了两种重组凝集素:Gal3C(一个CRD)和Tetra-Gal3C(四重串联CRD)。通过将两种凝集素固定于链霉亲和素琼脂糖小球上,构造了富集糖蛋白的重组凝集素亲和柱。使用凝胶电泳、免疫印迹以及生物质谱技术对重组凝集素的生物特征及其糖蛋白富集能力进行了表征与评价,发现两种类型的重组凝集素对糖蛋白/糖肽都有良好的富集效果,并具有较高的特异性和灵敏度。相对于Gal3C而言,Tetra-Gal3C由于具有四重串联的CRD结构域,表现出更高的糖蛋白/糖肽富集能力。该凝集素亲和柱成功用于人肝癌细胞系HepG2的糖蛋白富集,表明重组凝集素具有从复杂生物样本中选择性识别和富集糖蛋白/糖肽的能力。 展开更多
关键词 液相色谱-质谱 半乳糖凝集素-3 糖识别结构域 糖蛋白富集
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糖基化蛋白质组学:结构、功能和研究方法 被引量:1
8
作者 张勇 沈丙权 +2 位作者 秦伟捷 钱小红 万涛 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第4期480-490,共11页
蛋白质糖基化修饰结构多样、分布广泛,以N-糖基化、O-Gal NAc糖基化和O-Glc NAc糖基化等不同修饰形式存在。糖修饰以各种方式广泛参与基本生物学过程,包括基因转录、蛋白质翻译、信号转导、细胞-细胞间以及宿主-病原体相互作用等。糖基... 蛋白质糖基化修饰结构多样、分布广泛,以N-糖基化、O-Gal NAc糖基化和O-Glc NAc糖基化等不同修饰形式存在。糖修饰以各种方式广泛参与基本生物学过程,包括基因转录、蛋白质翻译、信号转导、细胞-细胞间以及宿主-病原体相互作用等。糖基化修饰的异常变化与多种重要疾病的发生发展相关,包括免疫性疾病、肿瘤、先天性糖缺陷等。该文系统展示几种常见糖修饰的结构、参与的生理病理过程,以及最新的研究方法,尤其是糖修饰蛋白质或肽段的特异性富集方法和基于质谱的序列分析方法进展,以期丰富糖修饰蛋白质的研究手段,为糖蛋白质功能机制研究、疾病治疗靶标或候选标志物的发现提供新视角。 展开更多
关键词 糖基化修饰 亲和富集 质谱 肿瘤
基于固定化Pronase E酶与质谱的糖链结构分析方法 被引量:2
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作者 张曼丽 于子翔 +1 位作者 钱小红 万涛 《分析试验室》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-6,共6页
位点特异性糖链结构的解析,是糖蛋白质结构分析面临的巨大挑战。Pronase E蛋白水解酶,能够降解糖蛋白或糖肽中大部分的氨基酸序列,而保留糖链与少量氨基酸的序列,与色谱、质谱分析等联用,可以实现糖链结构的鉴定,同时,保留的氨基酸序列... 位点特异性糖链结构的解析,是糖蛋白质结构分析面临的巨大挑战。Pronase E蛋白水解酶,能够降解糖蛋白或糖肽中大部分的氨基酸序列,而保留糖链与少量氨基酸的序列,与色谱、质谱分析等联用,可以实现糖链结构的鉴定,同时,保留的氨基酸序列可以辅助实现修饰位点的识别,两者结合,可以获取位点特异性糖链结构的信息。但Pronase E酶解的缺点是,酶解效率较低,常需要较高浓度的蛋白酶。本实验将Pronase E固定化在基质上,固定化后的Pronase E具备较高的局部浓度,从而实现目标糖蛋白的快速高效酶解。采用核糖核酸酶B作为标准糖蛋白,优化了Pronase E酶切的方案,包括酶切时蛋白与酶的用量比、酶切时间、固定化Pronase E酶的有效贮存时间等;同时优化选择了糖链的富集方法,并对于基质辅助激光解吸飞行时间质谱分析中,糖链适合的基质进行对比选择,从而获得更好的糖链谱图及更为丰富的糖链结构信息。 展开更多
关键词 糖蛋白 糖链结构 固定化Pronase E 基质辅助激光解吸飞行时间质谱
一种简单的毛细管色谱柱电加热装置的制作方法及其在液相色谱-质谱联用系统中的应用 预览
10
作者 金祖耀 吕雅瑶 +5 位作者 周珊珊 郝斐然 付斌 万涛 钱小红 张养军 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期563-570,共8页
为了实现蛋白质组的深度覆盖,特别是低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,目前常用的方法是采用更长或装填更小粒径填料的毛细管色谱柱,但因此带来的问题是色谱柱反向柱压显著升高。针对以上问题发展了一种简单的毛细管色谱柱电加热装置... 为了实现蛋白质组的深度覆盖,特别是低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,目前常用的方法是采用更长或装填更小粒径填料的毛细管色谱柱,但因此带来的问题是色谱柱反向柱压显著升高。针对以上问题发展了一种简单的毛细管色谱柱电加热装置制作方法,并将该装置安装于液相色谱-质谱联用系统,分别以牛血清白蛋白(BSA)酶切肽段混合物和酵母蛋白(yeast)酶切肽段混合物为样品,从柱压和柱效两方面对该装置的性能进行了评价。实验结果表明,所制作的毛细管柱电加热装置安装在装填粒径为3μm反相色谱填料的毛细管柱上,在最佳电流(100 mA)下对BSA及yeast酶切肽段混合物进行分离时的柱压比不加电流时的柱压降低至少50%,柱效略有升高。这说明所制作的毛细管色谱柱电加热装置能显著降低柱压,为在较低的柱压条件下选择更小粒径色谱颗粒填料的毛细管色谱柱提供了一种有效的方法。 展开更多
关键词 毛细管高效液相色谱-串联质谱 蛋白质组学 电加热装置 柱压 柱效
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蛋白质组研究中低丰度蛋白质的富集与鉴定技术 被引量:2
11
作者 杨景晶 钱小红 +1 位作者 蔡耘 万涛 《生命的化学》 CAS CSCD 2015年第5期686-690,共5页
随着分离技术、质谱设备与生物信息学的发展,对复杂蛋白质组的深度覆盖研究已不再是遥不可及,对8000个基因产物的规模化鉴定已经趋于常规化。然而,更深一步的蛋白质组覆盖,就遇到了低丰度蛋白质分离、鉴定等更高的挑战。因此,针对... 随着分离技术、质谱设备与生物信息学的发展,对复杂蛋白质组的深度覆盖研究已不再是遥不可及,对8000个基因产物的规模化鉴定已经趋于常规化。然而,更深一步的蛋白质组覆盖,就遇到了低丰度蛋白质分离、鉴定等更高的挑战。因此,针对低丰度蛋白质鉴定方法与相关分离分析技术的发展,本文综述了改善低丰度蛋白质鉴定效率的三种方法的最新进展,包括蛋白质的高分辨分离与质谱分析策略、低丰度蛋白质的选择性富集方法和高丰度蛋白质的消减策略等。针对生物体系蛋白质组成的深度鉴定研究,逐步用于探索生命体在不同条件下蛋白质组的表达与修饰的动态变化,并最终发现具备重要生理与病理功能的调控性蛋白质、寻找候选药物靶标。 展开更多
关键词 蛋白质组学 质谱鉴定 低丰度蛋白质富集 高丰度蛋白质去除
亲水相互作用色谱结合串联质谱多重碎裂模式在完整糖肽研究中的应用 预览 被引量:6
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作者 江静 万涛 钱小红 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第2期159-165,共7页
蛋白质的糖基化修饰在生理及病理过程中发挥着重要作用。由于技术条件的限制,传统的糖蛋白分析方法中,通常分别鉴定蛋白质和糖链两者的结构,而忽略了蛋白质与糖链的连接关系。本研究旨在以完整糖肽作为检测对象,对糖肽中肽段序列和糖链... 蛋白质的糖基化修饰在生理及病理过程中发挥着重要作用。由于技术条件的限制,传统的糖蛋白分析方法中,通常分别鉴定蛋白质和糖链两者的结构,而忽略了蛋白质与糖链的连接关系。本研究旨在以完整糖肽作为检测对象,对糖肽中肽段序列和糖链结构的同步解析。采用亲水相互作用色谱对完整糖肽进行分离纯化,联合生物质谱中碰撞诱导解离(CID)、高能诱导解离(HCD)、电子转移解离(ETD)等裂解模式,对完整糖肽的糖基化位点、糖链结构、肽段序列等进行全方面的解析。结果表明,亲水相互作用色谱中样品与填料比1∶50可有效富集糖肽,采用30%CID能量,主要产生糖苷键断裂的碎片,为糖链的结构组成分析提供了线索;采用25%HCD能量,在低分子量区域提供了糖链的特征离子信息,并产生明确的糖肽Y1特征离子;ETD保留了完整的修饰基团而产生肽段骨架的断裂,可以提供有效的肽段序列信息。本研究结合亲水相互作用色谱与质谱仪中的多种碎裂方式,为完整糖肽的结构解析提供了一种快速、有效的研究方案。 展开更多
关键词 亲水作用色谱 串联质谱 完整糖肽 碰撞诱导解离 高能诱导解离 电子转移解离
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代谢光反应交联技术在生物大分子相互作用研究中的应用
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作者 王明超 万涛 钱小红 《生命的化学》 CAS CSCD 2014年第6期779-786,共8页
具备光反应交联活性的苯甲酮基团、叠氮苯基团以及双吖丙啶基团被广泛应用于对糖、氨基酸等代谢底物的修饰。利用生物自身的代谢机制,引入带有光反应交联基团的底物类似物,可以实现生物大分子间相互作用的原位、实时研究,从而获得更为... 具备光反应交联活性的苯甲酮基团、叠氮苯基团以及双吖丙啶基团被广泛应用于对糖、氨基酸等代谢底物的修饰。利用生物自身的代谢机制,引入带有光反应交联基团的底物类似物,可以实现生物大分子间相互作用的原位、实时研究,从而获得更为准确的相互作用复合物的信息。本文将综述代谢光反应交联技术在聚糖-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用研究中的应用进展。 展开更多
关键词 代谢引入 光反应交联基团 光反应交联糖类似物 光反应交联氨基酸类似物
完整糖肽质谱解析的研究进展 预览 被引量:4
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作者 王继峰 江静 +3 位作者 彭博 钟儒刚 万涛 钱小红 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第2期108-117,共10页
糖基化是一种普遍存在并且具有重要生物学功能的蛋白质翻译后修饰,与疾病发生、诊断、预后和治疗有密切的关系.基于生物质谱的糖蛋白质结构解析技术迅速发展,其中,将糖链与蛋白质分解开,分别进行糖基化位点的确认、肽段序列分析及糖链... 糖基化是一种普遍存在并且具有重要生物学功能的蛋白质翻译后修饰,与疾病发生、诊断、预后和治疗有密切的关系.基于生物质谱的糖蛋白质结构解析技术迅速发展,其中,将糖链与蛋白质分解开,分别进行糖基化位点的确认、肽段序列分析及糖链结构分析的技术已经趋于成熟.但对于涉及蛋白质与糖链之间连接方式的质谱解析却面临很多困难和挑战.本研究着重于位点特异性完整糖肽的质谱解析技术,确定了该领域的主要研究方向,从质谱技术的离子源、质量分析器、碎裂方式,以及质谱数据解析等方面对近年来完整糖肽的质谱分析技术的发展进行综述. 展开更多
关键词 糖基化修饰 糖肽 质谱 糖蛋白质组学
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超支化聚合物新材料富集糖肽方法的研究 被引量:2
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作者 邓珊珊 王明超 +4 位作者 曹琦琛 白海红 彭博 万涛 蔡耘 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期67-73,共7页
目的:将自合成的超支化聚合物固定到氨基硅球上形成一种新型的糖肽富集材料,用于糖肽的高效分离与富集。方法:阴离子开环聚合法合成的超支化聚缩水甘油,经高碘酸氧化成为超支化聚甘油醛(hyperbranched polyglycerol-aldehydes,HPG-AL... 目的:将自合成的超支化聚合物固定到氨基硅球上形成一种新型的糖肽富集材料,用于糖肽的高效分离与富集。方法:阴离子开环聚合法合成的超支化聚缩水甘油,经高碘酸氧化成为超支化聚甘油醛(hyperbranched polyglycerol-aldehydes,HPG-ALD)后固定于氨基硅球上,再用己二酸二酰肼修饰得到的酰肼材料应用于糖肽富集。结果:经扫描电镜(Scanning Electron Microscope,SEM)、热重分析(thermogravimetric analysis,TGA)等手段证明材料被成功合成。同时,使用制备成功的新材料来富集标准糖蛋白和糖肽都获得了良好的富集效果。结论:实验证明超支化缩水甘油酰肼材料(hyperpolymer-assisted hydrazide functionalized microspheres,HHMs)可用于低丰度糖蛋白/糖肽的富集。 展开更多
关键词 HHMs 糖肽 富集
基于超滤辅助样品制备方法的优化 预览 被引量:1
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作者 马成 潘一廷 +3 位作者 覃培斌 钱小红 万涛 张琪 《生物技术通讯》 CAS 2014年第1期82-86,共5页
目的:基于超滤辅助样品制备(FASP)方法的出现使得使用去污剂(如SDS)的蛋白质提取方法与溶液内酶切方法得以兼容,因此提高了难溶性蛋白的鉴定数量。然而,超滤膜的非特异性吸附作用依然会造成蛋白的损失。我们拟针对该方法存在的... 目的:基于超滤辅助样品制备(FASP)方法的出现使得使用去污剂(如SDS)的蛋白质提取方法与溶液内酶切方法得以兼容,因此提高了难溶性蛋白的鉴定数量。然而,超滤膜的非特异性吸附作用依然会造成蛋白的损失。我们拟针对该方法存在的问题对其进行改进。方法:对FASP方法进行了蛋白酶切条件、洗脱液选择、洗脱次数的改进;为测试优化方法的有效性和适用范围,选择标准蛋白BSA、鼠肝和鼠脑等3种样品进行考察。结果:相比报道的FASP方法,采用改进后的FASP方法使BSA的回收率提高了20%;经高精度质谱检测,对鼠肝、鼠脑的蛋白质鉴定结果分别比采用未优化的FASP多鉴定到2086和3592条特异肽段。结论:通过对FASP方法的优化,蛋白鉴定数量得到较大提高,该方法为蛋白质组深度覆盖研究提供了可靠的技术手段。 展开更多
关键词 基于超滤辅助样品制备 蛋白酶切 超滤管 深度覆盖
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一种基于聚酰胺-胺型树枝状聚合物富集糖肽的新策略 预览
17
作者 邓珊珊 曹琦琛 +4 位作者 马成 白海红 任晓君 万涛 蔡耘 《生物技术通讯》 CAS 2014年第2期158-164,共7页
目的:提出了一种新型的糖肽富集试剂,将不同代数的含高密度N端的聚酰胺一胺(PAMAM)型树枝状聚合物固定到溴化氰活化的琼脂糖凝胶上用于糖肽的高效分离。方法:先用标准糖蛋白对试剂的富集条件进行优化,包括是否使用还原剂、不同酸... 目的:提出了一种新型的糖肽富集试剂,将不同代数的含高密度N端的聚酰胺一胺(PAMAM)型树枝状聚合物固定到溴化氰活化的琼脂糖凝胶上用于糖肽的高效分离。方法:先用标准糖蛋白对试剂的富集条件进行优化,包括是否使用还原剂、不同酸度的结合溶液、不同洗脱液、不同试剂比例,将优化后的方法用于鼠脑裂解液糖肽的富集。结果与结论:将优化的方法用于鼠脑糖肽的富集,用第6代PAMAM鉴定到的糖肽数目是采用商业化酰肼材料的3倍,该试剂对糖肽富集的高选择性和高重现性为糖蛋白组学研究提供了新的工具。 展开更多
关键词 树枝状聚合物 聚酰胺一胺 糖肽 富集
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等电聚焦预分离用于肝癌细胞分泌蛋白质组的分级与鉴定 预览 被引量:4
18
作者 李贤煜 赵新元 +1 位作者 万涛 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期831-837,共7页
分泌蛋白质组(secretome)是指在特定的时空条件下,细胞、组织等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白质组可能包含了大量的疾病诊断生物标志物,因此其相关研究越来越受到重视。分泌蛋白质组的组成高度复杂且浓度范围宽,这对分析方法提出了挑战... 分泌蛋白质组(secretome)是指在特定的时空条件下,细胞、组织等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白质组可能包含了大量的疾病诊断生物标志物,因此其相关研究越来越受到重视。分泌蛋白质组的组成高度复杂且浓度范围宽,这对分析方法提出了挑战。建立有效的蛋白质或肽段预分离策略,将有利于分泌蛋白质的高覆盖率鉴定。本研究以肝癌细胞系MHCC97L的无血清培养分泌蛋白质为研究对象,采用一种新型等电聚焦预分离(OFFGEL)系统,考察了肽段水平的分级对蛋白质鉴定结果的影响。结果表明,分离后各馏分中肽段的等电点分布与理论预测基本一致,每个馏分中单独鉴定的肽段比例接近80%,显示了该系统对肽段的高分辨分离能力。结合生物质谱技术,在肝癌细胞分泌系统中鉴定了2 995个蛋白质,显示了该系统在复杂体系蛋白质组研究中的应用潜力。 展开更多
关键词 等电聚焦 预分离 分泌蛋白质组 分级 鉴定 肝癌细胞
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利用亲水富集策略分析人血浆中N-糖基化蛋白及N-糖类型 预览 被引量:6
19
作者 马成 潘一廷 +3 位作者 张琪 王继峰 钱小红 万涛 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1057-1063,共7页
蛋白质的N-糖基化是最重要的翻译后修饰之一,许多已知的血浆肿瘤诊断标志物及治疗靶标都是N-糖基化蛋白.针对血浆的糖蛋白质组研究有利于发现新的蛋白标志物.然而,血浆蛋白质浓度分布的动态范围非常宽,且同一位点上的糖链存在微观不均一... 蛋白质的N-糖基化是最重要的翻译后修饰之一,许多已知的血浆肿瘤诊断标志物及治疗靶标都是N-糖基化蛋白.针对血浆的糖蛋白质组研究有利于发现新的蛋白标志物.然而,血浆蛋白质浓度分布的动态范围非常宽,且同一位点上的糖链存在微观不均一性,影响了血浆中糖蛋白的鉴定效率.本文利用亲水材料ZIC-HILIC制备亲水富集柱分别对人血浆中的N-糖链和N-糖肽进行富集,并结合碱性反相色谱进行肽段的预分离和高准确度质谱分析,最终在健康人的血浆中鉴定到了299个糖基化蛋白、637个糖基化位点,并识别出31种不同的糖型.在这些鉴定到的糖基化位点中,新发现有107个N-糖基化位点(占总位点数的16.8%).本方法操作简单,可以有效富集N-糖肽和N-糖,为在血浆中寻找糖蛋白和糖链生物标志物提供了可靠的手段. 展开更多
关键词 超滤辅助样品制备 亲水相互作用色谱 反相色谱 N-糖基化蛋白 N-糖
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O-GlcNAc糖蛋白/糖肽的分离富集方法 被引量:1
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作者 覃培斌 董润安 +2 位作者 彭博 万涛 钱小红 《生命的化学》 CAS CSCD 2013年第2期59-66,共8页
O-GlcNAc糖基化是一种发生在蛋白质丝氨酸或苏氨酸上的翻译后修饰,广泛分布在细胞核与细胞质中,是一种重要的胞内修饰调控方式。O-GlcNAc修饰具有表达丰度低、高度动态化、容易分解等特点,往往需要先对糖蛋白/糖肽进行分离富集,方... O-GlcNAc糖基化是一种发生在蛋白质丝氨酸或苏氨酸上的翻译后修饰,广泛分布在细胞核与细胞质中,是一种重要的胞内修饰调控方式。O-GlcNAc修饰具有表达丰度低、高度动态化、容易分解等特点,往往需要先对糖蛋白/糖肽进行分离富集,方能有效鉴定。近期针对O-GlcNAc发展了多种衍生及富集方法,结合新型质谱技术,已经在O-GlcNAc糖蛋白的鉴定上取得较大进展。 展开更多
关键词 O-GlcNAc糖基化 糖蛋白 糖肽 富集
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