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二代测序技术在临床微生物领域中的应用进展 被引量:1
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作者 郭凌云 李勤静 +1 位作者 刘钢 杨永 《中华儿科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第5期396-399,共4页
二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)是相对于第一代DNA测序技术而言的新型测序手段.1977年Frederick Sanger发明了双脱氧链终止法核酸测序技术,使得基因测序成为可能,也成就了人类基因组测序的完成.Sanger测序法被称为第... 二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)是相对于第一代DNA测序技术而言的新型测序手段.1977年Frederick Sanger发明了双脱氧链终止法核酸测序技术,使得基因测序成为可能,也成就了人类基因组测序的完成.Sanger测序法被称为第一代测序技术,其测序准确性高,在PCR产物、载体克隆测序等方面得到极为广泛地应用.但Sanger测序法也存在一些缺陷,如测序反应时间较长、测序通量低、成本高.为了解决这一问题,美国国立人类基因组研究所(The National Human Genome Research Institute,NHGRI)于2004年启动了NGS项目.2005年基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统被报道,开创了NGS的先河.NGS最大的优势在于通量高、成本较低、敏感性高,可以同时测定几百万甚至上亿条DNA或者RNA序列,大大加快了全基因组测序的速度,从而极大地降低单个碱基测序的成本.这完全改变了过去的研究模式,给人类和动植物基因组学、转录组学、宏基因组学研究等方面带来了全新的变化,并逐步深入到微生物学研究领域中.为提高对该技术的认识,现就NGS在临床微生物领域中的应用进行综述. 展开更多
关键词 DNA测序技术 临床微生物 应用 人类基因组测序 基因组研究所 全基因组测序 基因组学 PCR产物
“2017第十届世界儿科感染性疾病大会”会议纪要
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作者 黄文献 郑跃杰 杨永 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期6-7,共2页
由世界儿科感染性疾病学会(worldSocietyforPediatricInfectiousDiseases,WSHD)主办、深圳市儿童医院及中华医学会儿科学分会联合承办的“2017第十届世界儿科感染性疾病大会(thelOthCongressoftheWorldSocietyforPediatricInfectiou... 由世界儿科感染性疾病学会(worldSocietyforPediatricInfectiousDiseases,WSHD)主办、深圳市儿童医院及中华医学会儿科学分会联合承办的“2017第十届世界儿科感染性疾病大会(thelOthCongressoftheWorldSocietyforPediatricInfectiousDiseases,WSPID2017)”于2017年12月2日至5日在深圳会展中心成功召开。 展开更多
关键词 儿科 感染性疾病 会议纪要
2012至2017年1138例儿童侵袭性肺炎链球菌病多中心临床研究
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作者 朱亮 李文辉 +37 位作者 王新红 谭锟 方庆丰 朱庆雄 武抗抗 杨巧芝 林爱伟 邓慧玲 毕晶 刘静 赵仕勇 刘耘 景淑军 王育民 李莲梅 赵青 姚开虎 王曦 贾莉 王芳 邓继岿 孙静 朱春晖 周凯 梁珺 聂秀真 曹三成 王冬萌 李双杰 陈雪夏 李娟 王屹 叶岚 张艳虹 董芳 李志 杨永 刘钢 《中华儿科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第12期915-922,共8页
目的了解我国儿童侵袭性肺炎链球菌病(IPD)的临床特点及菌株分型、细菌耐药情况。方法本研究为多中心回顾性研究。通过检索2012--2017年18家儿童医院的细菌培养信息管理系统查找自无菌部位(血、脑脊液、胸腹水、关节积液等)分离出肺炎... 目的了解我国儿童侵袭性肺炎链球菌病(IPD)的临床特点及菌株分型、细菌耐药情况。方法本研究为多中心回顾性研究。通过检索2012--2017年18家儿童医院的细菌培养信息管理系统查找自无菌部位(血、脑脊液、胸腹水、关节积液等)分离出肺炎链球菌的住院患儿,收集患儿临床信息及菌株血清型和耐药性检测结果。将患儿按随访结果分为死亡组和好转组,多因素Logistics回归分析IPD死亡危险因素。结果共确定1138例IPD患儿,其中男684例、女454例,男女比例为1.5:1,年龄范围为1日龄~16岁,中位年龄为1岁3月龄,5岁以下1016例,占89.3%,尤其是2岁以下(704例,61.9%);社区感染者1004例(88.2%)。临床类型包括脑膜炎446例(39.2%)、菌血症性肺炎339例(29.8%)、无病灶血流感染232例(20.4%)等。患儿有基础疾病者242例(21.3%)。混合感染支原体62例(5.4%),腺病毒27例(2.4%),流感病毒34例(3.0%)。脑膜炎和非脑膜炎菌株对青霉素的不敏感率分别为69.5%(276/397)和35.9%(221/615)。81株确定了血清型,其中13价肺炎球菌蛋白多糖结合疫苗(PCVl3)覆盖血清型占93.8%(76/81)。预后随访965例,确定死亡156例,病死率16.2%。多因素Logistics回归分析表明<2岁[比值比(OR)=2.143,95%可信区间(c,)为1.284—3.577,P=0.004],脑膜炎(OR=3.066,95%CI为1.852~5.074,P<0.01),有基础病(OR=4.801,95%CI为2.953—7.804,P<O.01),感染性休克(OR=3.542,95%CI为1.829~6.859,P<0.01),弥漫性血管内凝血(OR=4.150,95%CI为1.468—11.733,P=0.007),多脏器衰竭(OR=12.693,95%CI为6.623—24.325,P<0.01)和中枢神经系统并发症(OR=1.975,95%CI为1.144~3.410,P=0.015)为患儿死亡的独立危险因素。结论我国儿科确诊的IPD多为5岁以下、有基础疾病的社区感染患儿,<2岁、脑膜炎、基础病及多脏器衰竭等是死亡的独立危险因素,IPD致病株耐药严重,推广接种PCVl3疫苗有助于我国儿童预防IPD。 展开更多
关键词 肺炎球菌感染 多中心研究 儿童
要更进一步加强儿科抗生素的应用与管理 预览 被引量:2
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作者 申昆玲 杨永 《中国研究型医院》 2017年第3期42-45,共4页
2016年5月英国Jim O’Neille爵士发表《全球抗生素耐药回顾:报告及建议》中指出,目前每年已有70万人死于抗生素耐药,到2050年,抗生素每年会导致1000万人死亡,同时还可造成累计100万亿美元的经济损失。
关键词 抗生素 合理用药
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读诸福棠教授旅欧扎记有感
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作者 杨永 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期319-320,共2页
诸福棠教授以其渊博的学识和扎实的功底成为我国现代儿科奠基人,他的为人更是有口皆碑,激励我一生。30多年前,当我只身在京就读他的研究生时,每逢节假日他总是让人要我去他家过节,体现了长者对离乡游子的莫大关怀,所见所闻迄今历... 诸福棠教授以其渊博的学识和扎实的功底成为我国现代儿科奠基人,他的为人更是有口皆碑,激励我一生。30多年前,当我只身在京就读他的研究生时,每逢节假日他总是让人要我去他家过节,体现了长者对离乡游子的莫大关怀,所见所闻迄今历历在目。 展开更多
关键词 奠基人 研究生 节假日
中德链球菌合作研究的推动者——辛·查特瓦教授
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作者 何宏 高福 杨永 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第34期3726-3727,共2页
我们谨以十分沉痛的心情,悼念我们的朋友、德国亥姆霍兹联合会感染研究中心的优秀科学家辛·查特瓦(G.Singh Chhatwal)教授.2016年8月5日,在与白血病抗争多年之后,辛·查特瓦教授,留下妻子和两个孩子,永远离开人世.辛·... 我们谨以十分沉痛的心情,悼念我们的朋友、德国亥姆霍兹联合会感染研究中心的优秀科学家辛·查特瓦(G.Singh Chhatwal)教授.2016年8月5日,在与白血病抗争多年之后,辛·查特瓦教授,留下妻子和两个孩子,永远离开人世.辛·查特瓦教授是国际著名的印度裔(锡克族)学者,主要从事链球菌多样性研究,尤其是定植(colonization)和感染(infection)关系的研究, 展开更多
关键词 链球菌 合作 亥姆霍兹 科学家 白血病 多样性 感染
我国儿科常见致病菌抗生素耐药形势严峻 被引量:9
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作者 杨永 刘钢 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期241-244,共4页
近年来,各种致病菌抗菌药物耐药性不断增加,已成为全球关注的公共卫生热点问题之一。儿科常见致病菌耐药状况尤为突出,随着各种获得性耐药机制研究的深入,儿科细菌耐药感染现状形势严峻。限制抗生素的滥用、制备新型抗生素和制备疫... 近年来,各种致病菌抗菌药物耐药性不断增加,已成为全球关注的公共卫生热点问题之一。儿科常见致病菌耐药状况尤为突出,随着各种获得性耐药机制研究的深入,儿科细菌耐药感染现状形势严峻。限制抗生素的滥用、制备新型抗生素和制备疫苗等措施是解决细菌耐药问题的关键,然而应对细菌耐药性挑战的当务之急应该是临床医师和临床微生物工作者密切合作,掌握常见致病菌耐药性数据与变化趋势,了解微生物学,充分了解抗菌药物,参照药敏结果,按照抗菌药物分级管理原则选择抗菌药物,对感染性疾病进行正确的诊断与治疗。同时广泛加强国内外不同领域细菌耐药性监测与明确机制是控制细菌耐药的重要举措。 展开更多
关键词 致病菌 抗生素 耐药 耐药性监测
百日咳杆菌耐药 被引量:2
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作者 杨永 杨颖 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期263-265,共3页
大环内酯类抗生素是治疗百日咳的首选药物。然而,近年来出现了百日咳杆菌对红霉素等大环内酯类抗生素耐药的现象,局部监测耐药率甚至达到90%。现将从百日咳杆菌耐药情况、耐药机制、耐药后的抗生素选择、耐药的防治和控制等方面进行... 大环内酯类抗生素是治疗百日咳的首选药物。然而,近年来出现了百日咳杆菌对红霉素等大环内酯类抗生素耐药的现象,局部监测耐药率甚至达到90%。现将从百日咳杆菌耐药情况、耐药机制、耐药后的抗生素选择、耐药的防治和控制等方面进行综述。 展开更多
关键词 百日咳杆菌 红霉素 耐药
56株B族链球菌血清型耐药性及多位点序列分型研究 被引量:5
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作者 仝净净 王萍 +3 位作者 史伟 姚开虎 俞桑洁 杨永 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2015年第3期194-198,共5页
目的研究B族链球菌(GBS)的血清型、耐药性和多位点序列分型,供防治GBS感染参考。方法 2012—2013年间共收集到56株GBS菌株,自就诊于北京市妇产医院和北京大兴医院的妊娠35-37周孕妇的阴道和直肠拭子的分离培养。采用乳胶凝集试验检测... 目的研究B族链球菌(GBS)的血清型、耐药性和多位点序列分型,供防治GBS感染参考。方法 2012—2013年间共收集到56株GBS菌株,自就诊于北京市妇产医院和北京大兴医院的妊娠35-37周孕妇的阴道和直肠拭子的分离培养。采用乳胶凝集试验检测菌株的血清型,E-test法和纸片扩散法检测细菌对9种抗生素的敏感性,PCR方法检测红霉素耐药基因ermB和mefA,管家基因测序确定菌株的序列型(ST),eBURST软件分析菌株间亲缘性关系。结果 56株菌共鉴定出5种血清型,常见型为Ⅲ型(32.1%)、Ⅰa型(17.9%)、Ⅰb型(16.1%)和Ⅴ型(14.3%)。分离株对青霉素和头孢曲松均敏感,对左氧氟沙星、红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素和四环素的不敏感率依次为39.3%、85.7%、92.9%、98.2%、30.4%、73.2%和91.0%。56株菌株共检测出14种STs,ST19(30.4%)最为常见。Ⅲ型菌株主要属于ST19(14/18),92.9%的Ⅲ/ST19型菌株对左氧氟沙星耐药,75%的左氧氟耐药菌株属于CC19。44株红霉素耐药菌株中,32株(72.7%)erm B阳性。结论北京GBS菌株以Ⅲ、Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型常见;GBS菌株对青霉素和头孢曲松敏感,对红霉素和克林霉素等耐药率高,超过90%的Ⅲ/ST19型菌株耐左氧氟沙星;红霉素耐药菌株多携带ermB。 展开更多
关键词 B族链球菌 血清型 耐药性 多位点序列分型
上呼吸道感染儿童鼻咽部携带流感嗜血杆菌状况及血清型和耐药性研究 被引量:2
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作者 高薇 史伟 +3 位作者 俞桑洁 袁林 姚开虎 杨永 《结核病与肺部健康杂志》 2015年第3期179-183,共5页
目的 了解北京儿童医院门诊上呼吸道感染儿童流感嗜血杆菌的携带情况、血清分型情况及对抗生素的敏感性,为临床合理用药提供参考.方法 自2013年3月至2014年2月从本院门诊就诊的2930例上呼吸道感染儿童采集鼻咽拭子标本,进行细菌培养和鉴... 目的 了解北京儿童医院门诊上呼吸道感染儿童流感嗜血杆菌的携带情况、血清分型情况及对抗生素的敏感性,为临床合理用药提供参考.方法 自2013年3月至2014年2月从本院门诊就诊的2930例上呼吸道感染儿童采集鼻咽拭子标本,进行细菌培养和鉴定,从分离的流感嗜血杆菌中采用数字表法随机选择100株,采用乳胶凝集法检测菌株血清型,E-test方法检测其对抗生素的敏感性.应用软件WHONET 5.3进行抗菌药物敏感性分析,统计学分析使用软件SPSS 16.0进行.有关率的比较采用x2检验或Fisher精确概率法,P<0.05为差异有统计学意义.结果 共采集2930例1月龄至16岁患儿的鼻咽拭子,分离出流感嗜血杆菌271株,总携带率为9.2%.4-6月份分离阳性率高,分别为19.5%(8/41)、20.6%(14/68)和24.5%(25/102);~4岁至~6岁年龄组儿童分离阳性率最高,均超过10.0%;男性患儿分离阳性率高于女性,分别为10.4% (181/1733)和7.5%(90/1197)(x2=7.219,P<0.05).所有菌株均不能分型.100株菌株中对青霉素不敏感率为35.0%,产酶率为23.0%;对阿莫西林-克拉维酸、头孢呋辛、四环素和氯霉素的敏感率较高,分别为91.0%、82.0%、97.0%和96.0%.结论 本院门诊上呼吸道感染儿童鼻咽部流感嗜血杆菌携带率为9.2%,分离株对青霉素的敏感性较低. 展开更多
关键词 呼吸道感染 鼻咽 流感嗜血菌 抗药性 细菌 带病原状态
原发性免疫缺陷病患儿的疫苗接种 被引量:2
11
作者 姚开虎 杨永 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期647-650,共4页
原发性免疫缺陷病 ( primary immunodeficiency diseases, PID )是一组由不同先天和遗传因素导致的一个或多个固有和/或获得性免疫功能受损的疾病,影响疫苗接种决策,而感染可能是影响PID患儿最终预后的关键因素。PID患儿因为其免... 原发性免疫缺陷病 ( primary immunodeficiency diseases, PID )是一组由不同先天和遗传因素导致的一个或多个固有和/或获得性免疫功能受损的疾病,影响疫苗接种决策,而感染可能是影响PID患儿最终预后的关键因素。PID患儿因为其免疫功能受损,接种疫苗后可能并不能产生保护免疫效应,有些免疫缺陷患儿对接种疫苗均不产生反应,甚至因疫苗含有的活病毒/细菌感染引起疾病。现主要介绍不同类型PID的疫苗选择和密切接触者的疫苗接种等方面的状况。 展开更多
关键词 原发性免疫缺陷病 疫苗 免疫 儿童
部分cpsA-cpsB血清型预测系统预测94株肺炎链球菌血清型分析 被引量:1
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作者 窦珍珍 张二清 +4 位作者 高薇 姚开虎 俞桑洁 杨永 刘钢 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期934-937,共4页
目的 评价部分cpsA-cpsB血清型预测系统在预测肺炎链球菌血清型的应用价值.方法 用荚膜肿胀实验对首都医科大学附属北京儿童医院提供的94株肺炎链球菌进行传统分型,以其分型结果为血清型金标准.按照文献进行目的基因cpsA-cpsB片段扩增... 目的 评价部分cpsA-cpsB血清型预测系统在预测肺炎链球菌血清型的应用价值.方法 用荚膜肿胀实验对首都医科大学附属北京儿童医院提供的94株肺炎链球菌进行传统分型,以其分型结果为血清型金标准.按照文献进行目的基因cpsA-cpsB片段扩增、测序、序列编辑及比对.结果 94株肺炎链球菌菌株,经荚膜肿胀反应检测,83株确定血清型/群,11株为未分型菌株.在83株确定血清型的菌株中,67株菌株目的片段聚合酶链式反应(PCR)呈阳性结果(占80.72%);在这67株菌株中,60株(占89.55%)菌株血清型的预测结果和金标准一致或者包含了金标准.其中,12株血清型为19F的PCR阳性菌株中,10株的预测结果和金标准一致,另外2株的预测结果分别为6A、23F/10A.在19株血清型为19A的PCR阳性菌株中,18株的预测结果和金标准一致,另外1株的预测结果为35F/47F.在10株血清型为14的PCR阳性菌株中,9株的预测结果和金标准一致,另外1株的预测结果为19A.7株血清型为6B的PCR阳性菌株的预测结果为6A/6B.在4株血清型为23F的PCR阳性菌株的预测结果为23F/10A.11株未分型的菌株中,3株(占27.27%)PCR阳性,血清型预测结果分别为6A/6C、6A/6B、19A.结论 部分cpsA-cpsB血清型预测系统在预测我国肺炎链球菌血清型方面有一定的临床应用价值. 展开更多
关键词 肺炎链球菌 血清型 分子生物学方法 cpsA cpsB
反向线性点杂交技术在肺炎链球菌分型中的应用
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作者 王亚娟 高薇 +2 位作者 俞桑洁 姚开虎 杨永 《北京医学》 CAS 2015年第6期567-570,I0001共5页
目的探讨反向线性点杂交技术在肺炎链球菌分型中的应用。方法对临床诊断为肺炎的16例5岁以下患儿,从呼吸道吸取物、血和胸水培养分离获得的30株肺炎链球菌菌株应用反向线性点杂交技术进行分型,并与传统的血清学分型方法-夹膜肿胀实验进... 目的探讨反向线性点杂交技术在肺炎链球菌分型中的应用。方法对临床诊断为肺炎的16例5岁以下患儿,从呼吸道吸取物、血和胸水培养分离获得的30株肺炎链球菌菌株应用反向线性点杂交技术进行分型,并与传统的血清学分型方法-夹膜肿胀实验进行比较。结果反向线性点杂交技术和血清学方法对30株临床分离获得的肺炎链球菌菌株的分型结果完全一致,其分布情况为:血清型19A(n=9),14(n=5),23F(n=4),19F(n=4),6B(n=3),7F(n=2),15B(n=2),9V(n=1)。16例肺炎患儿的肺炎链球菌血清型分布情况为血清型19A、14、23F及19F各来自3例患儿,血清型6B、7F、15B及19V各来自1例患儿。其中10例(62.5%)肺炎患儿分离获得的肺炎链球菌菌株涵盖在7价肺炎链球菌结合疫苗中,所有患儿获得的菌株均包含在23价多糖疫苗中。结论对于肺炎链球菌,反向线性点杂交技术是一种可靠的分子生物学分型方法;在本组研究中,7价肺炎链球菌结合疫苗的涵盖率为62.5%,所有菌株均包含在23价多糖疫苗中。 展开更多
关键词 反向线性点杂交技术 肺炎链球菌 分型
新生儿侵袭性社区获得性金黄色葡萄球菌感染的临床及分离株的分子特征 被引量:1
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作者 李文婷 董燕红 +8 位作者 宁雪 曾婷 俞桑洁 姚开虎 史伟 高薇 袁琳 杨永 沈叙庄 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2015年第22期1692-1696,共5页
目的了解新生儿侵袭性社区获得性金黄色葡萄球菌(CA-SA)感染的临床及分子特征。方法收集国内3所儿童医院侵袭性CA—SA感染新生儿56例并进行分析,对分离株行多位点基因分型(MLST)、SCCmec及spa分型,检测pvl基因并进行体外药物敏感... 目的了解新生儿侵袭性社区获得性金黄色葡萄球菌(CA-SA)感染的临床及分子特征。方法收集国内3所儿童医院侵袭性CA—SA感染新生儿56例并进行分析,对分离株行多位点基因分型(MLST)、SCCmec及spa分型,检测pvl基因并进行体外药物敏感试验。结果56例侵袭性CA—SA感染的新生儿中,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)感染37例(66.07%),耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染19例(33.93%);晚发型感染48例(85.71%),16例(28.57%)需入住重症监护病房(ICU)。最常见诊断:肺炎41例(73.20%),脓毒症33例(58.93%)。MSSA组脓毒症比例(70.27%,26/37例)显著高于MRSA组(36.84%,7/19例)(P=0.016)。43例(76.79%)患儿存在多部位感染,21例(37.50%)患儿有并发症,2例患儿死亡。45例患儿(80.36%)联合使用抗生素,MRSA组使用万古霉素的比例(52.63%,10/19例)明显高于MSSA组(16.22%,6/37例)(P=0.004);22例(39.29%)患儿接受外科干预治疗。分离株共检测到16种ST型,ST59最常见(19株,33.93%),5种SCCmec型以Ⅳ型(10株,52.63%)为主,Ⅳ亚型主要为Ⅳa(9/10株),有25种spa型,t437(17株,30.36%)为主,13株(23.21%)检测到pvl基因。各ST型在疾病谱分布上差异均无统计学意义(P均〉0.05),多重耐药率为42.86%。结论新生儿侵袭性CA—SA感染多见于重症、晚发型,以肺炎和脓毒症为主,MSSA组发生脓毒症比例高于MRSA组,多部位感染多见,联合用药和外科干预率高。分离株最常见克隆为ST59-t437,不同分型分离株感染在疾病谱上无明显差别。 展开更多
关键词 婴儿 新生 社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 侵袭性感染 耐药
儿童耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染分离株毒力特征研究 被引量:2
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作者 董燕红 李士朋 +8 位作者 乔艳红 宁雪 曾婷 俞桑洁 姚开虎 高薇 袁琳 杨永 沈叙庄 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期733-737,共5页
目的 探讨儿童耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染分离株的毒力特征.方法 收集2004年6月至2012年7月4家儿童医院分离的243株MRSA,采用PCR法对MRSA进行多位点序列分型(MLST);按随机分层抽样法对136株菌进行42种毒力基因及4种重要毒... 目的 探讨儿童耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染分离株的毒力特征.方法 收集2004年6月至2012年7月4家儿童医院分离的243株MRSA,采用PCR法对MRSA进行多位点序列分型(MLST);按随机分层抽样法对136株菌进行42种毒力基因及4种重要毒力基因hla、psmα、RNAⅢ和pvl的表达水平检测.结果 MRSA分离株大多数来源于肺炎和皮肤软组织感染(SSTIs),占88.1%(214/243株).243株菌检测到22种MLST,6种主要流行克隆是ST59、ST239、ST1、ST910、ST88和ST338.131株菌(96.3%)至少含有1种超抗原基因.所有菌株均携带黏附基因中的fnbA、clfA和spa.所有菌株均携带hla,psmα和RNAⅢ,pvl的携带率为39%.pvl在ST59、ST910、ST338分离株中的携带率较ST239、ST1、ST88高(P均<0.05).hla、smα、RNAⅢ在ST59中的表达水平较其他分型高(P均<0.05).社区获得性MRSA (CA-MRSA)分离株pvl的携带率高于医院获得性MRSA(HA-MRSA)分离株(48.8%比24.1%,x2 =8.356,P=0.004),但pvl表达水平比较差异无统计学意义(t=-0.777,P=0.441).CA-MRSA分离株hla、smα和RNAⅢ的表达水平较HA-MRSA分离株高(P均<0.05).肺炎分离株fnbB的携带率明显高于SSTIs分离株(27.5%比12.7%,x2 =4.050,P=0.044),而SSTIs分离株pvl的携带率明显高于肺炎分离株(52.7%比27.5%,x22=8.186,P=0.004).侵袭性感染分离株的hla表达水平较非侵袭性感染高(=2.433,P=0.0163).结论 儿童MRSA感染分离株的主要流行克隆间部分毒力基因携带存在差异.CA-MRSA较HA-MRSA高表达hla、psmα、RNAⅢ,尤其是ST59型,提示该型菌株可能具有较强的致病性.fnbB与肺炎、pvl与SSTIs可能有关.菌株高表达hla可能与侵袭性感染有关. 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 儿童 毒力 基因 表达
儿童A族β溶血链球菌的主要毒力特征 被引量:1
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作者 曾婷 王全意 +11 位作者 吴琼 董燕红 刘岚 郑跃杰 王丽娟 杨鹏 袁琳 俞桑洁 姚开虎 杨永 沈叙庄 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第16期1235-1239,共5页
目的研究儿童A族β溶血链球菌(GAS)分离株超抗原、链球菌DNA酶(DNase)、纤维结合蛋白(FBP)基因的分布特征,分析其与感染儿童及主要cram流行型的关系。方法收集2008年至2012年3所儿童医院临床分离的GAS72株感染菌株,40株健康携... 目的研究儿童A族β溶血链球菌(GAS)分离株超抗原、链球菌DNA酶(DNase)、纤维结合蛋白(FBP)基因的分布特征,分析其与感染儿童及主要cram流行型的关系。方法收集2008年至2012年3所儿童医院临床分离的GAS72株感染菌株,40株健康携带株。PCR扩增及测序对菌株进行emm分型;PCR检测12种超抗原(speA、speC、speH、speI、speG、speJ、ssa、smeZ、speL、speM、speK和speF)、5种DNase基因(sda、sdn、spdI、spd3和spd4)及磷脂酶A2基因sla和FBP基因(prtFl、prtF2、fba)的携带。结果112株GAS分离株,共7种emm型,包括:emml、emml2、emm22、emm4、emm77、emm86、stG485,以emml2型为主,占68.8%,感染株与非感染株emm型分布一致。112株GAS超抗原基因携带率分别为speA 13.4%,speC 95.5%,speF 85.7%,speG 74.1%,speH 63.4%,speI 63.4%,speJ 14.3%,speK、speL、speM各占0.9%,ssa 74,1%,smeZ 93.8%;DNase基因:sda 66.96%,sdn 12.5%,spdI 94.64%,spd 327.68%,spd 40.89%,没有分离株携带sla;FBP基因:prtFI 69.6%,prtF 279.5%,加030.4%,prtFI和prtF2同时阳性67.9%,三者都不携带的占3.6%。感染儿童分离株speJ、spd3的携带率明显高于健康儿童携带株,而ssa,speF,speG、prtFl、prtF2、同时携带prtFl/prtF2甩基因在健康儿童携带株更常见。在emml2型GAS中,speH、speI、speG、sda、spdl、prtFl、prtF2、prtFl和prtF2同时阳性的携带率高于非emml2型,而speA、speJ、sdn、spd3、fba的携带率则低于非emml2型。结论儿童GAS主要流行型为emml2型,其次为emml、emm22型,与菌株来源无关;感染儿童分离株与健康儿童携带株有不同的毒力基因分布特征;emml2型的流行可能与特定毒力基因的高携带有关。 展开更多
关键词 A族链球菌 毒力因子 emm分型
上呼吸道感染儿童鼻咽部携带肺炎链球菌状况及血清型和耐药性研究 被引量:16
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作者 俞桑洁 高薇 +4 位作者 史伟 袁林 申阿东 姚开虎 杨永 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期988-992,共5页
目的:了解上呼吸道感染儿童鼻咽部携带肺炎链球菌状况,以及分离株的耐药性和血清型分布。方法2013年3月至2014年2月采集在北京儿童医院门诊就诊的上呼吸道感染儿童鼻咽拭子进行细菌培养和鉴定,采用Etest方法检测抗生素敏感性,荚膜... 目的:了解上呼吸道感染儿童鼻咽部携带肺炎链球菌状况,以及分离株的耐药性和血清型分布。方法2013年3月至2014年2月采集在北京儿童医院门诊就诊的上呼吸道感染儿童鼻咽拭子进行细菌培养和鉴定,采用Etest方法检测抗生素敏感性,荚膜肿胀试验检测血清型。结果共采集到2?941例1月龄至16岁患儿的鼻咽拭子,分离出肺炎链球菌699株,携带率为23.8%。随机选取100株菌检测了抗生素敏感性和血清型。分离株对静脉青霉素敏感率达98.0%,口服青霉素敏感率仅为33.0%,头孢克洛耐药率为54.0%,头孢曲松和亚胺培南中介率也分别达到18.0%和38.0%。红霉素和阿奇霉素不敏感率均为97.0%。多重耐药率为86.0%。常见血清型为6A(12.0%)、19F(12.0%)、6B(10.0%)、23F(9.0%)和14型(8.0%),7、10和13价结合疫苗覆盖率分别为41.0%、42.0%和59.0%。结论门诊上呼吸道感染儿童中,鼻咽部肺炎链球菌携带率约为25%,抗生素耐药分离株常见,13价结合疫苗覆盖率接近60.0%。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 携带率 抗生素耐药 血清分型 儿童
北京儿童医院14型肺炎链球菌耐药性分析及分子流行病学研究 被引量:1
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作者 何明明 姚开虎 +4 位作者 史伟 袁林 高薇 俞桑洁 杨永 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2014年第3期199-204,共6页
目的了解14型肺炎链球菌的抗生素敏感性及分子流行病学特征。方法以北京儿童医院1997-2010年分离自儿童鼻咽拭子的14型肺炎链球菌分离株为研究对象,采用E-test法和纸片扩散法检测菌株对11种抗生素的敏感性,采用多位点序列分型(MLST... 目的了解14型肺炎链球菌的抗生素敏感性及分子流行病学特征。方法以北京儿童医院1997-2010年分离自儿童鼻咽拭子的14型肺炎链球菌分离株为研究对象,采用E-test法和纸片扩散法检测菌株对11种抗生素的敏感性,采用多位点序列分型(MLST)确定菌株序列型(ST),eBURST软件分析确定克隆群(CC)。聚合酶链式反应(PCR)检测红霉素耐药基因ermB和mefA,扩增并测序二氢叶酸还原酶基因dhfr。结果肺炎链球菌分离株中14型所占比例在监测期间升高,从1997-1999年的3.9%升高至2010年的9.3%。61株14型肺炎链球茵均对青霉素、阿莫西林-克拉维酸、头孢曲松敏感,但MIC50、MIC90和最大MIC值在监测期间升高。头孢呋辛不敏感率从1997-1999年的0上升至2010年的84.6%。61株均对红霉素耐药,携带ermB基因,4株(6.6%)同时携带mefA基因。36株磺胺耐药菌株均携带Ilel00-Leu变异。MLST共分出11种STs,ST875最常见(32株,占52.5%),其次是ST876(13株,占213%)。从1997到2010年,CC875的构成比下降(ZZ1997-1999年的100%降为2010年的0),CC876的构成比升高(从1997-1999年的0升至2010年的92.3%)。CC876对β-内酰胺类抗生素耐药性明显高于CC875。结论1997年到2010年肺炎链球菌中14型的构成比升高,14型菌株对β-内酰胺类抗生素耐药性增强,与具有高β-内酰胺类抗生素耐药性的克隆群CC876的播散有关。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 血清型 抗生素敏感性 分子流行病学
儿童社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌肺炎分离株的多重耐药克隆研究 预览 被引量:4
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作者 李娟 王群 +12 位作者 王丽娟 孙明姣 李士朋 孙静 王传清 邓秋莲 郑跃杰 刘岚 李昌崇 尚云晓 赵长安 杨永 沈叙庄 《中国感染与化疗杂志》 CAS 北大核心 2014年第1期32-37,共6页
目的研究中国儿童社区获得性耐甲氧西林金葡菌(CA—MRSA)肺炎分离株的多重耐药情况与克隆之间的关系。方法2006--2012年收集85株CA—MRSA分离株和50株医院获得性MRSA(HA-MRSA)分离株,进行多位点序列分型(MLST)和16种抗菌药物药... 目的研究中国儿童社区获得性耐甲氧西林金葡菌(CA—MRSA)肺炎分离株的多重耐药情况与克隆之间的关系。方法2006--2012年收集85株CA—MRSA分离株和50株医院获得性MRSA(HA-MRSA)分离株,进行多位点序列分型(MLST)和16种抗菌药物药敏试验,用脉冲场凝胶电脉(PFGE)和Southern印迹杂交定位莫匹罗星耐药基因mupA。结果CA—MRSA和HA—MRSA对红霉素和克林霉素的耐药率较高,CA—MRSA对庆大霉素、四环素和利福平的耐药率低于HA-MRSA(分别为36.5%和60.0%,P〈0.01;34.1%和54.0%,P〈0.05;8.2%和48.0%,P〈0.01),对头孢呋辛、氯霉素和红霉素的耐药率高于HA—MRSA(100%和72.0%,P〈0.01;22.3%和2.0%,P〈0.01;87.0%和72.0%,P〈0.05)。CA-MRSA多重耐药率明显低于HA-MRSA。CA-MRSA多重耐药表型呈多样化,4种克隆(ST59、ST88、ST965和ST45)的多重耐药率高于50.0%。CA—MRSA中,1株对夫西地酸耐药,5株对莫匹罗星耐药,高水平莫匹罗星耐药基因mupA位于23~54.2kb的质粒上。结论儿童CA-MRSA分离株对非β内酰胺类抗菌药物有较高的耐药率,并且多重耐药率和耐药谱与菌株克隆有关。 展开更多
关键词 儿童 社区获得性肺炎 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 多位点序列分型 多重耐药
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儿童A族链球菌emm分型变迁与大环内酯类耐药的关系 预览 被引量:4
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作者 吴琼 曾婷 +6 位作者 王全意 杨鹏 蒲秀红 姚开虎 俞桑洁 杨永 沈叙庄 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第27期18-23,共6页
目的通过对1993-1994年和2005-2008年456株儿童A族β溶血性链球菌(GAS)分离株抗生素敏感性、耐药基因及转座子Tn916的emm分型检测,探讨GAS对抗菌药物敏感性的变化与转座子Tn916的关系。方法采用琼脂稀释法检测临床分离株对8种抗生素... 目的通过对1993-1994年和2005-2008年456株儿童A族β溶血性链球菌(GAS)分离株抗生素敏感性、耐药基因及转座子Tn916的emm分型检测,探讨GAS对抗菌药物敏感性的变化与转座子Tn916的关系。方法采用琼脂稀释法检测临床分离株对8种抗生素敏感性;PCR检测大环内酯类耐药基因ermB、ermTR、mefA,四环素耐药基因tetM和Tn916家族转座子基因int、xis;PCR扩增及测序对菌株进行emm分型;对每种emm型的代表菌株进行PFGE分型。结果与1993-1994年比较,2005-2008年GAS菌株,红霉素、克林霉素、泰利霉素的耐药率增加(79.7%vs 94.0%,75.4%vs 96.9%,20.37%vs 87.93%);大环内酯类抗生素耐药菌株int、xis、tetM和ermB基因的携带率增加(P〈0.05);emm1型和emm12型菌株ermB基因携带率增加(65.20%vs 86.23%,7.7%vs 91.8%)。结论我国儿童GAS大环内酯耐药性在16年间增加,可能与emm型变化及大环内酯类抗生素耐药机制的变化有关,分离菌株的Tn916族变化可能与耐药性增加相关。 展开更多
关键词 链球菌 大环内酯类抗生素 ERMB基因 Tn916家族
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