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茄子冷诱导转录因子CBF的分离及分析 预览
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作者 姜涛 申艳红 +1 位作者 赵湾 林碧英 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第9期1756-1762,共7页
利用白菜CBF基因序列搜索茄子基因组DNA序列和茄子EST序列,然后参考这些序列设计开放型阅读框两端的特异引物,以茄子叶片cDNA为模板克隆获得了该基因的cDNA序列。经生物信息学分析证实该序列是CBF基因,命名为SmCBF(登录号:KY780486.1)... 利用白菜CBF基因序列搜索茄子基因组DNA序列和茄子EST序列,然后参考这些序列设计开放型阅读框两端的特异引物,以茄子叶片cDNA为模板克隆获得了该基因的cDNA序列。经生物信息学分析证实该序列是CBF基因,命名为SmCBF(登录号:KY780486.1)。该基因编码211个氨基酸,包含AP2功能域和DNA结合位点,属于AP2超基因家族。用PlantCARE分析SmCBF基因启动子序列的顺式作用元件,发现了1个MYC识别位点和1个MYB结合位点,说明该基因受到MYC和MYB的调控。采用Real-timePCR研究了SmCBF基因在低温诱导茄子中的表达情况,结果显示该基因随着低温处理时间延长表达量逐渐升高,在6h达到最高值,说明低温诱导该基因表达。 展开更多
关键词 茄子 CBF基因 基因克隆 荧光定量PCR 启动子
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番木瓜ERF家族与果实成熟相关成员的分析
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作者 陈永萍 高峰 +3 位作者 申艳红 赵湾 陈桂信 王平 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期252-264,共13页
通过比较分析番木瓜ERF家族成员的系统进化关系、基本理化性质、保守基序、启动子顺式元件,结合分析番木瓜在乙烯利和乙烯抑制剂1–甲基环丙烯(1-MCP)处理下以及不同成熟期果肉的RNA-seq数据,筛选出22个ERF家族成员进行表达差异分析,最... 通过比较分析番木瓜ERF家族成员的系统进化关系、基本理化性质、保守基序、启动子顺式元件,结合分析番木瓜在乙烯利和乙烯抑制剂1–甲基环丙烯(1-MCP)处理下以及不同成熟期果肉的RNA-seq数据,筛选出22个ERF家族成员进行表达差异分析,最终比较得出两个处理数据中显著差异表达基因有18个,推测这些基因可能在番木瓜果实成熟过程中起重要作用。 展开更多
关键词 番木瓜 ERF 果实 成熟 转录因子
乙烯处理水仙催多花技术和机理的研究
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作者 申艳红 姜涛 +5 位作者 赵湾 阮蔚华 张寒 周斌 陈红梅 陈晓静 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1003-1015,共13页
花葶数量是衡量水仙(Narcissus tazetta var. chinensis)商品鳞茎品质的重要指标之一。传统的水仙鳞茎熏蒸方法由于不能严格控制乙烯浓度,导致花芽诱导效果不佳。本实验研发了乙烯处理水仙催多花技术,采用200 μL/L乙烯气体在密闭容器... 花葶数量是衡量水仙(Narcissus tazetta var. chinensis)商品鳞茎品质的重要指标之一。传统的水仙鳞茎熏蒸方法由于不能严格控制乙烯浓度,导致花芽诱导效果不佳。本实验研发了乙烯处理水仙催多花技术,采用200 μL/L乙烯气体在密闭容器中熏蒸水仙三年生鳞茎两次,可使花葶和小花数量提高1倍。为探讨乙烯催多花的原因,测定了不同处理的生理生化指标,并将处理后1 d的样品分别进行了转录组测序。外源乙烯增加了可溶性糖与蛋白质含量,提高了过氧化物酶(peroxidase, POD)活性、吲哚乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)和玉米素(zeatin, ZA)水平。对水仙鳞茎转录组测序,共获得了65 898个unigenes,其中对照55 793个unigene、1-甲基环丙烯(1-methylcyclopropene, 1-MCP)处理57 321个unigene、乙烯处理64 350个unigene。基因本体(Gene Ontology, GO)分析显示,外源乙烯处理提高了水仙鳞茎的活性,促进了GO term中大部分基因的上调表达。通过比较不同处理间基因的差异表达,筛选了62个候选基因,包含4个淀粉与蔗糖代谢途径基因、9个多胺合成与转运基因、11个木质素合成与转运基因、31个成花相关基因和7个其他调控基因。12个基因的qRT-PCR结果验证了RNA-Seq的正确性。这些差异表达基因在水仙花芽分化过程中可能具有重要作用。本研究在生理生化和分子水平对乙烯处理促进水仙鳞茎花芽分化机制进行了探讨,为进一步阐明水仙花芽分化分子机制和指导水仙提供了理论依据。 展开更多
关键词 水仙 花芽分化 转录组测序 乙烯
番木瓜果实软化相关CpEXPA2基因的克隆与表达分析 预览
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作者 赵湾 冯力 +7 位作者 胡绍彬 代亚兰 李春侠 赵秋月 郑小华 吴迪 王平 申艳红 《果树学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期785-793,共9页
【目的】克隆一个与番木瓜果实软化相关的扩展蛋白基因,分析其功能,明确其在不同组织器官和不同成熟时期果实的表达模式。【方法】基于对番木瓜果实转录组学的研究,筛选并克隆了一个与果实软化相关的扩展蛋白基因Cp EXPA2。采用同源序... 【目的】克隆一个与番木瓜果实软化相关的扩展蛋白基因,分析其功能,明确其在不同组织器官和不同成熟时期果实的表达模式。【方法】基于对番木瓜果实转录组学的研究,筛选并克隆了一个与果实软化相关的扩展蛋白基因Cp EXPA2。采用同源序列对比和系统进化树分析对该基因进行序列分析;运用生物信息学的方法对该基因编码的蛋白进行结构分析;使用RT-q PCR方法分析Cp EXPA2基因在不同组织器官、不同成熟时期果实中的表达量;采用GY-4硬度计测定不同成熟时期番木瓜果实的硬度。【结果】Cp EXPA2基因的开放阅读框(ORF)为780 bp(Gene Bank登录号为MF662209),编码259个氨基酸。该基因编码的氨基酸序列具有典型的扩展蛋白保守结构:N端富含8个半胱氨酸、C端富含4个色氨酸和中间1个组氨酸功能域(His-Phe-Asp,HFD)。同源序列比对分析发现该扩展蛋白与山木瓜(ABF48653.1)、番茄(AAC64201.1)、草莓(AAF21101.1)、拟南芥(AAB38073.1)等扩展蛋白氨基酸序列有较高的同源性,分别为66.15%、64.86%、66.80%、65.00%。进化树分析表明,Cp EXPA2蛋白与拟南芥At EXPA6(U30480)、At EXPA16(NM_115407)关系最近。Cp EXPA2在不同组织器官中的表达量依次为成熟果实〉叶〉花〉茎〉根;在不同发育时期的果实中,Cp EXPA2在果皮的表达量相对高于果肉,且随着果实成熟软化程度提高,其表达量也相应提高。番木瓜果实的硬度随着果实的成熟呈逐渐下降趋势,在破色期开始硬度急剧下降,果实迅速软化。【结论】Cp EXPA2基因的扩展蛋白家族高度保守,且该基因编码的蛋白与山木瓜、番茄、草莓、拟南芥等扩展蛋白的氨基酸序列有较高的同源性。系统进化树分析发现番木瓜Cp EXPA2与拟南芥At EXPA6和At EXPA16亲缘关系较近。Cp EXPA2受乙烯诱导,且与果实发育进程有关,因此推测该基因可能在番木瓜果实成� 展开更多
关键词 番木瓜 扩展蛋白 表达模式 果实成熟软化
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丹东地区“空巢”老人健康现状的调查 预览
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作者 林静 郭甜甜 +1 位作者 李聪 赵湾 《时代教育》 2015年第17期3-4,9共3页
目的:了解机构养老院"空巢"老人身心健康现状。方法:按照人口学基本特征、日常生活需求、经济状况、健康和医疗及身心理状况等设计问卷调查表。对城市-城乡结合部-农村空巢老人进行分类调查,了解丹东市养老机构内60岁以上养老机构... 目的:了解机构养老院"空巢"老人身心健康现状。方法:按照人口学基本特征、日常生活需求、经济状况、健康和医疗及身心理状况等设计问卷调查表。对城市-城乡结合部-农村空巢老人进行分类调查,了解丹东市养老机构内60岁以上养老机构内空巢老人的身心问题。结果:三组样本的部分人口学特征:年龄结构、性别结构、文化程度(小学及以下学历,大专以上学历)、婚姻状况、健康状况(患心血管病,患糖尿病,患高血压)、心情状况、娱乐活动情况(打牌及其他)及是否知道如何预防高血压等数据的p值大于0.05,无差异性。而三组对正常血压值及自己血压值描述、三组看电视,散步,无娱乐活动、三组初中,高中/中专/技校学历分布、三组患脑血管病p值小于0.05,认为以上数据有差别。结论:对空巢老人进行护理干预,提高老人生活质量。 展开更多
关键词 机构养老 空巢老人 健康状况
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