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克氏原螯虾抗菌肽crustin5基因克隆及其表达分析 认领
1
作者 李博 王凯 +5 位作者 于晓东 刘睿哲 蔺思函 商静 沈秀丽 杜志强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期953-960,共8页
【目的】深入了解克氏原螯虾先天免疫过程中抗菌肽的作用与功能,丰富先天免疫中抗菌肽的理论知识,为克氏原螯虾的病害机理研究及防控措施制定提供参考依据。【方法】从克氏原螯虾肝胰腺组织提取总RNA,利用PCR扩增crustin5基因全长cDNA序... 【目的】深入了解克氏原螯虾先天免疫过程中抗菌肽的作用与功能,丰富先天免疫中抗菌肽的理论知识,为克氏原螯虾的病害机理研究及防控措施制定提供参考依据。【方法】从克氏原螯虾肝胰腺组织提取总RNA,利用PCR扩增crustin5基因全长cDNA序列,运用DNAMAN 6.0、ProtParam、ProtScale、SOPMA和SWISS-MODEL等在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测crustin5基因在克氏原螯虾各组织中的表达情况。【结果】克氏原螯虾crustin5基因cDNA序列全长954 bp,开放阅读框(ORF)为429 bp,共编码167个氨基酸残基,其编码蛋白相对分子量为16485.42 Da,理论等电点为8.58,为不稳定的疏水性蛋白。克氏原螯虾crustin5蛋白具有典型的crustins家族结构特征,包括N端的信号肽,C端的WAP结构域,以及二者间的半胱氨酸富集区;其二级结构中α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占20.36%、7.78%、58.08%和13.77%。crustin5基因在克氏原螯虾血细胞、肝胰腺、鳃、肠道、肌肉和淋巴器官等6种组织中均有不同程度的表达,以在血细胞中的相对表达量最高,淋巴器官次之,在肌肉组织中的相对表达量最少。【结论】克氏原螯虾抗菌肽crustin5具有典型的crustins家族结构特征,且主要分布在血细胞和淋巴器官中,说明crustin5是在克氏原螯虾的血淋巴中参与先天免疫并发挥抗菌作用。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 抗菌肽 crustin5基因 先天免疫 表达差异
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急性温度胁迫对妊娠期许氏平鲉血清皮质醇和血液生理指标的影响 认领 被引量：9
2
作者 张亚晨 温海深 +1 位作者 李兰敏 冯启超 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1872-1882,共11页
为探究鱼类对温度突变水体的适应性和恢复性,将妊娠期许氏平鲉由正常水温（16℃）直接转入高温（25℃）和低温（7℃）水体,急性胁迫2 h后再恢复至16℃,检测恢复期第0、6、12、24、48和72 h时妊娠期许氏平鲉血清皮质醇（COR）和血液生理... 为探究鱼类对温度突变水体的适应性和恢复性,将妊娠期许氏平鲉由正常水温（16℃）直接转入高温（25℃）和低温（7℃）水体,急性胁迫2 h后再恢复至16℃,检测恢复期第0、6、12、24、48和72 h时妊娠期许氏平鲉血清皮质醇（COR）和血液生理指标的变化情况。结果显示,25℃急性胁迫导致2尾鱼发生产仔行为;25℃和7℃急性胁迫后的恢复过程中,血清（COR）、血糖（GLU）、球蛋白（GLB）、丙氨酸氨基转移酶（GPT）、天门冬氨酸氨基转移酶（GOT）和白细胞（WBC）水平均显著升高,总蛋白（TP）、白蛋白（ALB）、总胆固醇（TC）及甘油三酯（TG）水平显著降低,血清钙（Ca~（2＋））、镁（Mg~（2＋））和无机磷（P）水平无显著变化;红细胞（RBC）和血红蛋白（HGB）水平在25℃胁迫后明显上升,而在7℃胁迫后显著下降（P〈0.05）。与急性低温胁迫相比,急性高温胁迫对妊娠期许氏平鲉机体生理情况的影响更显著。除COR和无机离子外,多个生理指标在72 h后仍未恢复至正常水平。研究表明,急性温度胁迫导致妊娠期许氏平鲉生理状况和代谢水平受到显著影响,甚至发生提前产仔行为。在养殖生产中,对于进入生殖期的雌鱼,应密切监测水温变化,尤其是水温的上升,以减少温度应激导致的妊娠损伤。 展开更多
关键词 许氏平鲉 温度 皮质醇 血液生理
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4个文蛤群体鲜味物质比较分析 认领
3
作者 王超 陈爱华 +4 位作者 姚国兴 曹奕 吴杨平 张雨 蔡永祥 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期45-52,共8页
以江苏文蛤（Meretrix meretrix）为研究对象,采集红壳色文蛤原种、黄壳色文蛤原种、红壳色文蛤选育F1、红壳色文蛤选育F2 4个群体,检测其主要非挥发性鲜味物质成分单磷酸腺苷（AMP）、单磷酸鸟苷（GMP）、次黄嘌呤核苷酸（IMP）、琥珀... 以江苏文蛤（Meretrix meretrix）为研究对象,采集红壳色文蛤原种、黄壳色文蛤原种、红壳色文蛤选育F1、红壳色文蛤选育F2 4个群体,检测其主要非挥发性鲜味物质成分单磷酸腺苷（AMP）、单磷酸鸟苷（GMP）、次黄嘌呤核苷酸（IMP）、琥珀酸、游离氨基酸、无机离子（Na^＋、K^＋、Cl^–、PO_4^3-）的含量,并通过味道强度值（TAV）评价其呈味作用。鉴于核苷酸与氨基酸在呈味方面的协同效应,采用味精当量（EUC）评价不同文蛤群体的鲜味品质。结果表明,文蛤软体组织中AMP、琥珀酸、谷氨酸、精氨酸、丙氨酸、Na＋、K^＋、Cl^–的TAV值大于1,是文蛤鲜味的主要贡献者;红壳色文蛤原种的鲜味强度最大（4.92 g/100g）,其子代红壳色文蛤F1（4.08 g/100g）、红壳色文蛤F2（4.09 g/100g）稍有降低,但仍显著高于黄壳色文蛤原种（3.34 g/100g）（P〈0.05）,表明江苏红壳色文蛤在鲜味品质方面具有相对稳定的较高品质。 展开更多
关键词 文蛤(Meretrix meretrix) 红壳色 黄壳色 选育 鲜味物质
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合浦珠母贝matrilin-1基因的克隆和表达分析 认领 被引量：1
4
作者 王珍珍 黄桂菊 +4 位作者 范嗣刚 刘宝锁 张博 苏家齐 喻达辉 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期76-84,共9页
以合浦珠母贝（Pinctada fucata）转录组中的matrilin-1基因片段为基础,开展了matrilin-1的c DNA全长（Pfmatrilin-1）克隆和定量表达分析。Pfmatrilin-1基因c DNA全长2 036 bp,开放阅读框（open reading frame,ORF）1 194 bp,编码397... 以合浦珠母贝（Pinctada fucata）转录组中的matrilin-1基因片段为基础,开展了matrilin-1的c DNA全长（Pfmatrilin-1）克隆和定量表达分析。Pfmatrilin-1基因c DNA全长2 036 bp,开放阅读框（open reading frame,ORF）1 194 bp,编码397个氨基酸,包括1个信号肽序列和2个血管性血友病因子A（von Willebrand factor A,VWA）样结构域。系统进化分析显示无脊椎动物的matrilins与脊椎动物的matrilins进化关系较远。荧光定量PCR表达分析结果显示,Pfmatrilin-1 mRNA在合浦珠母贝各个组织中均有表达,其中在血液中表达量最高（P〈0.05）;Pfmatrilin-1从担轮幼虫期至变态期均有表达,眼点期表达量最高（P〈0.05）,而贝类幼虫发育到眼点期就会开始附着,眼点期幼虫原壳生长停滞,次生壳形成,因此推测其可能与次生壳的形成有关。这些结果表明Pfmatrilin-1在合浦珠母贝生物矿化中发挥重要作用。 展开更多
关键词 合浦珠母贝 Pfmatrilin-1 表达谱 基因克隆
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葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘 认领 被引量：1
5
作者 严璐琪 郭香 +4 位作者 巫旗生 祁剑飞 宁岳 王晓清 曾志南 《湖南农业大学学报：自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期409-414,共6页
采用Illumina 高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎(Crassostrea angulata)外套膜组织开展转录组测序研究，其中黑壳组总计产出5 857 718 092 nt 数据，筛选后的干净阅读子58 004 560 个；金壳组产出6 727 447 326 nt数据，干净阅读子... 采用Illumina 高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎(Crassostrea angulata)外套膜组织开展转录组测序研究，其中黑壳组总计产出5 857 718 092 nt 数据，筛选后的干净阅读子58 004 560 个；金壳组产出6 727 447 326 nt数据，干净阅读子66 614 854 个。将发掘的新基因与COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR 数据库进行序列比对，最终得到各数据库注释的新基因数量分别为147、397、203、567、1 347 个。通过对差异表达基因的序列进行生物学功能注释和聚类分析以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行搜索，鉴定出14 条可能与壳色表达有关的贝壳基质蛋白基因，其中5 条下调基因可能与金壳基因表达相关。 展开更多
关键词 葡萄牙牡蛎 壳色 转录组
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中华绒螯蟹不同可食部位对重金属镉的富集效应研究 认领
6
作者 董欣悦 宋超 +4 位作者 张石云 张聪 邹剑敏 裘丽萍 陈家长 《中国农学通报》 2019年第21期141-147,共7页
在实验室模拟条件下构建养殖生态系统,设置4个镉暴露浓度(0、5、50、100μg/L),以探究镉在中华绒螯蟹体内不同可食部位(性腺、蟹身肉、蟹腿肉)的富集残留效应差异。结果表明:(1)镉在中华绒螯蟹体内的残留值为:性腺>蟹身肉>蟹腿肉... 在实验室模拟条件下构建养殖生态系统,设置4个镉暴露浓度(0、5、50、100μg/L),以探究镉在中华绒螯蟹体内不同可食部位(性腺、蟹身肉、蟹腿肉)的富集残留效应差异。结果表明:(1)镉在中华绒螯蟹体内的残留值为:性腺>蟹身肉>蟹腿肉,且性腺的占比均达85%以上。(2)各可食部位镉的残留量随暴露时间的增加而增加,且与水环境中镉的浓度呈正相关。同一可食部位,低、中和高浓度处理的富集系数与水环境中镉浓度呈负相关;同一浓度处理下,中华绒螯蟹体内不同可食部位的富集系数均为:性腺>蟹身肉>蟹腿肉。(3)镉在中华绒螯蟹体内的残留可能存在一定的性别差异。研究结果系统揭示水环境中镉在中华绒螯蟹体内不同可食部位的富集残留差异,为镉在中华绒螯蟹体内的分布、富集和迁移规律提供理论依据,为中国中华绒螯蟹的安全养殖和质量控制提供科学依据。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 镉 富集 可食部位 性腺 蟹身肉 蟹腿肉
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星斑川鲽仔稚鱼消化系统发育的组织学研究 认领 被引量：4
7
作者 方华华 王波 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第14期 50-54,共5页
使用石蜡切片技术对1-35日龄星斑川鲽的仔稚鱼消化系统进行组织学观察和研究。结果表明,星斑川鲽消化系统的发育主要分成3个阶段：从初孵到3日龄是卵黄阶段,其消化道为一细长的管道;从3日龄到5日龄是后卵黄阶段（混合营养阶段）,卵黄被... 使用石蜡切片技术对1-35日龄星斑川鲽的仔稚鱼消化系统进行组织学观察和研究。结果表明,星斑川鲽消化系统的发育主要分成3个阶段：从初孵到3日龄是卵黄阶段,其消化道为一细长的管道;从3日龄到5日龄是后卵黄阶段（混合营养阶段）,卵黄被逐渐吸收,是卵黄阶段转向外源性营养阶段的过渡,消化道明显分化成口咽腔、食道、胃、前中肠、后肠和肛门,仔鱼消化系统具备了摄食和消化外源性食物的能力。此后,随着鱼体的生长,粘膜层的褶皱增加,消化道上皮细胞进一步分化,消化系统从功能和结构上逐步完善。16日龄,胃腺出现,标志着稚鱼期的开始,也表明星斑川鲽是一种发育较快的鱼类。 展开更多
关键词 星斑川鲽 消化系统 发育 组织学 胃腺
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嘉庚蛸生殖系统结构观察 认领 被引量：5
8
作者 许著廷 李来国 +1 位作者 王春琳 母昌考 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1058-1064,共7页
采用解剖和组织切片技术对嘉庚蛸生殖系统结构进行了系统研究。雄性生殖系统除已报道的精巢、输精管、精囊、摄护腺、精荚囊和阴茎等部分之外,新发现了盲囊结构。精巢属于小叶型精巢,由精巢壁和实质部分组成。精囊分为前、中、后3段,前... 采用解剖和组织切片技术对嘉庚蛸生殖系统结构进行了系统研究。雄性生殖系统除已报道的精巢、输精管、精囊、摄护腺、精荚囊和阴茎等部分之外,新发现了盲囊结构。精巢属于小叶型精巢,由精巢壁和实质部分组成。精囊分为前、中、后3段,前段与输精管相连,后段与摄护腺相连。精囊壁组成复杂,有两个舌状突起伸入囊腔中,两个舌状突起结构从精囊中段渐行至精囊后段,一个逐渐膨大,另外一个逐渐缩小,精囊壁及舌状突起上密布腺体细胞,分泌作用旺盛。精荚及胶质尾巴均在摄护腺中形成,在精荚囊中浓缩、储存。雌性生殖系统包括卵巢、输卵管和输卵管腺等部分。输卵管较长,开口于漏斗口处。输卵管腺着生在输卵管上,结构复杂,内部有纳精囊结构。 展开更多
关键词 嘉庚蛸 生殖系统 解剖学 组织学
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洱海鱼类群落的空间分布格局 认领 被引量：8
9
作者 费骥慧 汪兴中 邵晓阳 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1225-1233,共9页
根据2009年8—11月对洱海鱼类调查获得的有关资料,研究了洱海鱼类群落的空间分布格局,旨在为洱海鱼类资源的保护和利用提供有价值的资料。研究结果表明：洱海鱼类群落可分为3种群落类型,分别为洱海西岸与南北端湖滨带群落类型（群落Ⅰ... 根据2009年8—11月对洱海鱼类调查获得的有关资料,研究了洱海鱼类群落的空间分布格局,旨在为洱海鱼类资源的保护和利用提供有价值的资料。研究结果表明：洱海鱼类群落可分为3种群落类型,分别为洱海西岸与南北端湖滨带群落类型（群落Ⅰ）、东岸与湖心区群落类型（群落Ⅱ）和上游小型湖泊群落类型（群落Ⅲ）。群落Ⅰ的主要特征种为（Hemiculterleucisculus）、鲫（Carassius auratus）、麦穗鱼（Pseudorasbora parva）、黄（Hypseleotris swin-honis）、子陵栉虎鱼（Ctenogobius giurinus）,对群落内平均相似性贡献率为80.71%。群落Ⅱ的主要特征种为鳙（Aristichthys nobilis）、鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、团头鲂（Megalobrama amblycephala）、草鱼（Ctenopharyngodon idella）、鲤（Cyprinus carpio）,对群落内平均相似性贡献率为98.20%。群落Ⅲ的主要特征种为鲫、麦穗鱼、长身（Acheilognathuselongatus）、棒花鱼（Abbottina rivularis）、中华鳑鲏（Oryzias latipes sinensis）、子陵栉虎鱼等,对群落内平均相似性贡献率为94.94%。群落Ⅰ和群落Ⅲ在种类和数量组成上以小型鱼类为主,群落Ⅱ则以大中型鱼类为主,鱼类群落在空间分布上的环境差异明显。 展开更多
关键词 鱼类群落 鱼类多样性 空间格局 洱海
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不同来源嗜水气单胞菌外膜蛋白基因检测及序列分析 认领 被引量：1
10
作者 葛慕湘 张艳英 +2 位作者 靳晓敏 房海 陈翠珍 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第2期75-79,共5页
采用PCR方法,对分离于发病宽体金线蛭（Whitmania pigra）、中国林蛙（Rana temporaria chensinensis）、牙鲆（Paralichthys olivaceus）、草鱼（Ctenopharyngodon idellua）、青鱼（Mylopharyngodon piceus）、鲤（Cyprinus carpio）... 采用PCR方法,对分离于发病宽体金线蛭（Whitmania pigra）、中国林蛙（Rana temporaria chensinensis）、牙鲆（Paralichthys olivaceus）、草鱼（Ctenopharyngodon idellua）、青鱼（Mylopharyngodon piceus）、鲤（Cyprinus carpio）的42株致病性嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）进行了外膜蛋白（OMP）基因的检测;将代表菌株的外膜蛋白基因通过DNAStar软件与GenBank中报道的4株嗜水气单胞菌（FJ437030.1、AF183931.1、AF276639.2、CP000462.1）和1株温和气单胞菌（A.sobria,FJ437029.1）参考菌株进行了核苷酸同源性比较分析。结果表明,所检不同来源嗜水气单胞菌的OMP基因携带率为100%;所测代表菌株的OMP基因与参考菌株的同源性在86.0%～99.2%之间。所测得的不同来源嗜水气单胞菌OMP基因的同源性98.3%～100%,其中分离于宽体金线蛭的HTQ010505-1与青鱼的HL060811-4两菌株间同源性高达100%。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) 外膜蛋白基因 序列分析
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异精雌核发育草鱼F1与普通草鱼的SCAR标记鉴别初报 认领 被引量：2
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作者 刘敏 肖调义 +3 位作者 孙念 刘巧林 苏建明 许宝红 《水生态学杂志》 北大核心 2013年第3期94-100,共7页
以赤眼鳟生理失活精子诱导的雌核发育草鱼F1群体（CC）和与之母本同源的普通草鱼群体（PC）为材料,采用RAPD和SCAR分子标记相结合的技术,在100条RAPD随机引物扩增的16条有效引物中扩增筛选出7条群体差异条带,其中1条为异精雌核发育草鱼... 以赤眼鳟生理失活精子诱导的雌核发育草鱼F1群体（CC）和与之母本同源的普通草鱼群体（PC）为材料,采用RAPD和SCAR分子标记相结合的技术,在100条RAPD随机引物扩增的16条有效引物中扩增筛选出7条群体差异条带,其中1条为异精雌核发育草鱼群体中特有,其余均表现为异精雌核发育草鱼群体缺失;对7条RAPD特异条带的回收中仅得到S32和S336的特异条带。经回收、克隆、测序后根据序列信息设计了4对SCAR引物,其中S336的2对SCAR引物在两群体间扩增出的条带一致,特异性消失;S32的2对SCAR引物能扩增出两群体间的特异条带;对S32-Scar1F/S32-Scar1R扩增出的SCAR标记S321643进行大样本检测结果表明：该标记在异精雌核发育草鱼群体中的出现频率为0（0/55）,在普通草鱼群体中出现频率为76.7%（46/60）。 展开更多
关键词 异精雌核发育草鱼 RAPD SCAR标记 群体鉴别
中华绒螯蟹高血糖激素基因的克隆和分子结构解析 认领 被引量：4
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作者 王艳华 张亦陈 +3 位作者 孙妍 刘逸尘 耿绪云 孙金生 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期987-993,共7页
为深入研究中华绒螯蟹高血糖激素（crustacean hyperglycemic hormone,CHH）基因的结构与功能,首次从中华绒螯蟹眼柄中克隆得到高血糖激素基因的全长cDNA序列（Ers-CHH,GenBank登录号：JX485664）。序列及分子结构分析结果显示：Ers-CH... 为深入研究中华绒螯蟹高血糖激素（crustacean hyperglycemic hormone,CHH）基因的结构与功能,首次从中华绒螯蟹眼柄中克隆得到高血糖激素基因的全长cDNA序列（Ers-CHH,GenBank登录号：JX485664）。序列及分子结构分析结果显示：Ers-CHH基因全长585 bp,ORF区为453 bp,编码150个氨基酸,N端30个氨基酸为预测的信号肽区域,其后为42个氨基酸的前体相关肽和78个氨基酸的成熟肽。其成熟肽区具有典型的CHH家族结构域,包括3个二硫键C7-C43、C23-C39、C26-C52和4个α螺旋（alpha-helix）,但不具有β折叠结构（beta-sheet）。Ers-CHH成熟肽氨基酸序列与溪蟹相比有92%的相似性;其三维结构与其它物种CHH三维结构比较结果显示,4个α螺旋所处的位置及所含氨基酸的相似性较高。与中华绒螯蟹MIH相比,CHH序列前段缺少一个螺旋,但其4个α螺旋的位置及氨基酸数目与MIH的α2-α5螺旋高度一致,空间结构也基本相同,这可能是两种激素功能部分重叠的分子基础。上述结果为进一步研究CHH在中华绒螯蟹生长发育及能量代谢过程中的调节机制和人工控制甲壳动物生长代谢提供了重要信息。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 高血糖激素 克隆 分子结构
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大菱鲆生长激素基因cDNA的克隆、序列分析及分子系统研究 认领 被引量：3
13
作者 刘滨 臧晓南 +2 位作者 刘顺梅 张学成 雷霁霖 《中国海洋大学学报：自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期 726-732,共7页
为了从分子水平研究大菱鲆生长激素作用机制及进化机制。以大菱鲆（Scophthalmus maximus）为材料从脑垂体中提取mRNA，利用SMART～RACE技术建立大菱鲆脑垂体cDNA文库，并从该文库中克隆出大菱鲆生长激素（growth Hormone，GH）cDNA全... 为了从分子水平研究大菱鲆生长激素作用机制及进化机制。以大菱鲆（Scophthalmus maximus）为材料从脑垂体中提取mRNA，利用SMART～RACE技术建立大菱鲆脑垂体cDNA文库，并从该文库中克隆出大菱鲆生长激素（growth Hormone，GH）cDNA全长序列。测序结果表明，克隆的大菱鲆GH cDNA序列全长为876bp，包括108bp的5’UTR和174bp的3’UTR序列。该基因的开放阅读框全长591bp，编码由197氨基酸残基组成的生长激素成熟肽序列，用生物软件DNASTAR计算大菱鲆生长激素蛋白分子量为1909．22，等电点为6．24。将大菱鲆与漠斑牙鲆、褐牙鲆等共7种鲆鲽鱼类GH成熟肽氨基酸序列进行比较分析，结果显示大菱鲆与其他6种鲆鲽鱼类序列同源性均为70％左右，而鲆科鱼类与鲽科鱼类间生长激素基因同源性很高（≥80％），说明大菱鲆与鲆科、鲽科鱼类的同源性较低。另外，运用PAUP软件对7种鲆蝶科鱼类与另外8种不同种属鱼类进行了分子系统进化树分析，结果与根据传统的形态学和生化特征分类进化地位基本一致，大菱鲆单独形成1个分支且与鲆科和鲽科鱼类相距较远，此结果为在形态学分类基础上进一步定义菱鲆属鱼类分类提供了理论依据。 展开更多
关键词 大菱鲆 生长激素基因 CDNA sMART—RACE 序列分析
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基于转录组数据的大菱鲆(Scophthalmus maximus)SNP标记开发及多态性分析 认领 被引量：8
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作者 王婷 黄智慧 +4 位作者 马爱军 马得友 王新安 夏丹丹 马本贺 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1300-1307,共8页
大菱鲆(Scophthalmus maximus)是最具商业价值和养殖前途的海水鱼类之一,雌雄间生长有一定的差异。其高通量雌雄转录组测序的完成为大规模鉴定和开发SNP标记提供了参考序列。本研究基于大菱鲆雌雄转录组测序数据,选择其中45个SNP位点,... 大菱鲆(Scophthalmus maximus)是最具商业价值和养殖前途的海水鱼类之一,雌雄间生长有一定的差异。其高通量雌雄转录组测序的完成为大规模鉴定和开发SNP标记提供了参考序列。本研究基于大菱鲆雌雄转录组测序数据,选择其中45个SNP位点,设计引物63组,其中21个位点(46.7%)应用小片段高分辨率熔解曲线(HRM)技术分型成功。对其进行多态性检测,21个位点均具有二个单倍型。观测杂合度Ho的分布范围为0.256—1.000,期望杂合度He的范围为0.276—0.518,19个位点符合Hardy-Weinberg平衡。14个SNP位点位于基因编码区,其中3个属于非同义突变。含有这些SNP位点的基因大多与信号转导和转录翻译相关。本研究结果表明,高通量转录组测序和小片段HRM适合大规模SNP标记开发,为大菱鲆的分子遗传育种提供了候选标记资源。 展开更多
关键词 大菱鲆 单核苷酸多态性(SNP) 转录组 高分辨率溶解曲线(HRM)
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水温和溶解氧对州河鲤鱼胚胎和胚后发育的影响 认领
15
作者 滕淑芹 王玮 +3 位作者 方旭 杨建利 马艳红 葛学利 《中国水产》 2019年第3期83-84,共2页
本文采用正交设计分析实验,发现鲤鱼在室温范围(17℃~25℃)内,溶解氧为影响胚后发育的主要因素,其次是温度,并且二者有显著的交互作用。胚胎发育所需时间与水温成负相关关系。溶解氧对胚胎发育的速度和时间的影响没有温度的影响显著,也... 本文采用正交设计分析实验,发现鲤鱼在室温范围(17℃~25℃)内,溶解氧为影响胚后发育的主要因素,其次是温度,并且二者有显著的交互作用。胚胎发育所需时间与水温成负相关关系。溶解氧对胚胎发育的速度和时间的影响没有温度的影响显著,也不呈相关关系。经实验分析得出,鲤鱼胚胎和胚后发育的最佳孵化温度为21℃左右,溶解氧为7.5mg/L。 展开更多
关键词 胚后发育 胚胎发育 州河鲤 溶解氧 效应期 鲤鱼卵 鱼类胚胎
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菊黄东方鲀♀×红鳍东方鲀♂杂交后代早期形态特征及生长速度的比较 认领 被引量：12
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作者 范文涛 刘海金 +1 位作者 赵文江 张福崇 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1065-1071,共7页
对菊黄东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交后代的早期形态特征和生长速度进行了比较。在全长5 cm和10 cm时,形态上的主要差异是：（1）菊黄东方鲀的尾鳍为浅黄色,无黑杂色;红鳍东方鲀的尾鳍为黑色,其杂交后代与菊黄东方鲀相似,尾鳍浅黄色,略带... 对菊黄东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交后代的早期形态特征和生长速度进行了比较。在全长5 cm和10 cm时,形态上的主要差异是：（1）菊黄东方鲀的尾鳍为浅黄色,无黑杂色;红鳍东方鲀的尾鳍为黑色,其杂交后代与菊黄东方鲀相似,尾鳍浅黄色,略带黑色;（2）菊黄东方鲀背部皮刺无或极少超出侧线,超出部分与体背黑斑不相交;红鳍东方鲀背部皮刺超出侧线,超出部分与黑斑相交,向下延伸至腹部,其杂交后代背部皮刺超出侧线,与体背黑斑部分相交,向下未能延伸至腹部;（3）菊黄东方鲀背部皮刺向前延伸至两眼连接线,红鳍东方鲀向前延伸至两鼻孔连接线,其杂交后代超过两眼连接线而未达鼻孔连接线。以尾鳍颜色和皮刺的分布特征可以区分幼鱼阶段的菊黄东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交后代。在体长为5 cm及10 cm时分别选取了2个和4个框架参数建立判别函数,判别菊黄东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交种的准确率达到96.8%和100%。经过110 d的饲养,红鳍东方鲀、杂交东方鲀以及菊黄东方鲀的平均体长分别达到（110.24±3.78）、（101.16±6.56）和（82.92±4.29）mm,体质量分别为（35.68±5.04）、（33.00±6.24）和（20.99±3.00）g,无论体长还是体质量,都是红鳍东方鲀〉杂交东方鲀〉菊黄东方鲀,差异极显著。研究表明,菊黄东方鲀♀与红鳍东方鲀♂杂交,其后代早期形态与母本菊黄东方鲀相似,生长比红鳍东方鲀慢,而比菊黄东方鲀快,具有显著的经济杂交价值。 展开更多
关键词 菊黄东方鲀 红鳍东方鲀 杂交 形态 生长
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长江口青草沙水库正式供水前的鱼类群落结构特征 认领 被引量：11
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作者 胡忠军 吴昊 +1 位作者 陈立侨 刘其根 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1234-1241,共8页
为研究上海青草沙水库的鱼类物种组成、多样性及其空间变化,2010年7—10月在该水库共捕获鱼类993尾,隶属5目,18种,其中淡水鲤形目鱼类最多,占总物种数的72.2%。群落优势种为贝氏、刀鲚、鲫、光泽黄颡鱼。聚类分析表明,鱼类群落类型存在... 为研究上海青草沙水库的鱼类物种组成、多样性及其空间变化,2010年7—10月在该水库共捕获鱼类993尾,隶属5目,18种,其中淡水鲤形目鱼类最多,占总物种数的72.2%。群落优势种为贝氏、刀鲚、鲫、光泽黄颡鱼。聚类分析表明,鱼类群落类型存在较显著的空间差异,刺网网目大小对渔获物物种组成有较显著的影响。物种多样性与丰富度和均匀度均显著正相关,但更多地受丰富度的影响。单因素方差分析表明,鱼类物种多样性在空间上无显著差异。4种摄食功能群中,无脊椎动物食性（44.4%）和杂食性（33.3%）鱼类物种数比例较高;4种生态类群中,定居性鱼类占绝对优势（77.8%）。青草沙水库鱼类群落表现出淡水或长江口低盐淡水区鱼类区系的主要特征,与以近海鲈形目鱼类为优势的长江口邻近水域的鱼类群落差异巨大,推测水库建设导致的隔离与盐度下降是形成该水库鱼类群落趋于淡水区系的主要原因。 展开更多
关键词 鱼类多样性 摄食功能群 生态类群 水源地水库 长江口
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太平洋鳕性腺发育及营养来源的初步研究 认领 被引量：10
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作者 姜志强 张志明 +3 位作者 赵翀 李丞 姜柏桥 孙阳 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期315-320,共6页
通过对大连海域太平洋鳕Gadus macrocephalus的繁殖力、卵径分布、性腺指数（GSI）和肝指数（HSI）进行周年调查,确定出太平洋鳕的繁殖期,分别测定了不同发育期太平洋鳕性腺、肝脏和肌肉的生化组成、能量密度变化,并观察了不同发育期太... 通过对大连海域太平洋鳕Gadus macrocephalus的繁殖力、卵径分布、性腺指数（GSI）和肝指数（HSI）进行周年调查,确定出太平洋鳕的繁殖期,分别测定了不同发育期太平洋鳕性腺、肝脏和肌肉的生化组成、能量密度变化,并观察了不同发育期太平洋鳕性腺和肝脏的组织学变化。结果表明：大连海域太平洋鳕的卵巢从12月开始进入第Ⅳ期,至翌年2月份排放;精巢处于Ⅳ、Ⅴ期的时间较长,11月份就有达到成熟的个体;从太平洋鳕肝脏组织学的变化来看,脂滴的体积变化很大,说明在繁殖过程中,肝脏经历了一个脂肪先积累又被大量消耗的过程;太平洋鳕在繁殖过程中,各个组织的能量密度变化较小,但粗蛋白、粗脂肪、粗灰分等成分变化较大。研究表明,太平洋鳕性腺发育的脂肪主要可能来源于肝脏,而肌肉蛋白的下降可能充当了性腺发育中蛋白质的主要来源。 展开更多
关键词 太平洋鳕 性腺 肝脏 肌肉 营养来源
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三疣梭子蟹FAMeT基因克隆及其在蜕皮周期中的表达水平 认领 被引量：10
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作者 谢熙 朱冬发 +2 位作者 崔晓雨 汤洁 邱锡尔 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期994-1001,共8页
为了研究法尼酸甲基转移酶（FAMeT）在甲壳动物蜕皮调控中的作用,采用反转录PCR（RT-PCR）和cDNA末端快速扩增技术（RACE）克隆得到了三疣梭子蟹FAMeT的全长cDNA序列（GenBank登录号：KC192659）,它包括一个201 bp的5＇非编码区、一个31... 为了研究法尼酸甲基转移酶（FAMeT）在甲壳动物蜕皮调控中的作用,采用反转录PCR（RT-PCR）和cDNA末端快速扩增技术（RACE）克隆得到了三疣梭子蟹FAMeT的全长cDNA序列（GenBank登录号：KC192659）,它包括一个201 bp的5＇非编码区、一个318 bp的3＇非编码区和一个825 bp的开放阅读框（ORF）,编码274个氨基酸;推导的氨基酸序列与已公布的其他甲壳动物FAMeT进行比对,发现一致性达75%～97%,其中与远海梭子蟹FAMeT的一致性最高;而且该氨基酸序列由两个CF（CPAMD8/FAMeT）区域组成,这两个CF区域是FAMeT的标志,在所有甲壳动物的FAMeT里均有发现,因此推导的氨基酸序列是三疣梭子蟹FAMeT基因。运用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）的方法分析了其在不同组织中、不同蜕皮周期中的表达量变化,发现FAMeT在三疣梭子蟹的各个组织里均有表达,且在胸神经节里表达最强;在三疣梭子蟹蜕皮过程中,大颚器中FAMeT在D1期表达最强,然后逐渐下降至D4最低。该结果表明FAMeT在三疣梭子蟹蜕皮调控中起着重要的作用。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 法尼酸甲基转移酶 克隆 蜕皮周期 表达水平
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尼罗罗非鱼γ-干扰素基因的克隆、结构分析及组织表达 认领 被引量：5
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作者 余嘉欣 吴芳 +3 位作者 孙成飞 董浚键 田园园 叶星 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期85-93,共9页
γ-干扰素（interferon,IFN）是调控天然免疫与细胞免疫的一种重要细胞因子,在抵抗病毒入侵和细菌感染中发挥重要作用。该研究从尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）脾脏组织中扩增到γ-干扰素基因的c DNA,大小为621 bp,编码206个氨基... γ-干扰素（interferon,IFN）是调控天然免疫与细胞免疫的一种重要细胞因子,在抵抗病毒入侵和细菌感染中发挥重要作用。该研究从尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）脾脏组织中扩增到γ-干扰素基因的c DNA,大小为621 bp,编码206个氨基酸。生物信息学分析表明,尼罗罗非鱼γ-干扰素分子（On IFNγ）具有信号肽、IFN特征序列及核定位信号。预测的三级结构与人类IFNγ晶体结构最相似。q PCR检测显示,IFNγ在正常鱼体内的脾脏中表达量最高,其次是肠、鳃和肾脏。感染无乳链球菌（Streptococcus agalactiae）后,On IFNγ在脾脏、肾和鳃中的表达均显著上调（P〈0.05）。On IFNγ在相关免疫器官中的高表达、受感染后的表达上调,说明其在罗非鱼免疫防御中可能具有重要作用。该研究为进一步开展On IFNγ基因的功能研究、探讨其在抗病转基因及抗病选育中的开发应用奠定了基础。 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 Γ-干扰素 序列分析 结构分析 生物信息学 组织分布
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