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A novel approach based on metabolomics coupled with network pharmacology to explain the effect mechanisms of Danggui Buxue Tang in anaemia
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作者 HUA Yong-Li MA Qi +5 位作者 YUAN Zi-Wen ZHANG Xiao-Song YAO Wan-Ling JI Peng HU Jun-Jie WEI Yan-Ming 《中国天然药物:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期275-290,共16页
Danggui Buxue Tang(DBT) is a famous Chinese medicinal decoction. Mechanism of DBT action is wide ranging and unclear. Exploring new ways of treatment with DBT is useful. Sprague–Dawley(SD) rats were randomly divided ... Danggui Buxue Tang(DBT) is a famous Chinese medicinal decoction. Mechanism of DBT action is wide ranging and unclear. Exploring new ways of treatment with DBT is useful. Sprague–Dawley(SD) rats were randomly divided into 3 groups including control(NC, Saline), the DBT(at a dose of 8.10 g·kg^–1), and blood deficiency(BD)(Cyclophosphamide(APH)-and Cyclophosphamide(CTX)-induced anaemia). A metabolomics approach using Liquid Chromatography-Quadrupole-Time-of-Flight/Mass Spectrometry(LC/Q-TOFMS) was developed to perform the plasma metabolic profiling analysis and differential metabolites were screened according to the multivariate statistical analysis comparing the NC and BD groups, and the hub metabolites were outliers with high scores of the centrality indices. Anaemia disease-related protein target and compound of DBT databases were constructed. The TCMSP, Chem Mapper and STITCH databases were used to predict the protein targets of DBT. Using the Cytoscape 3.2.1 to establish a phytochemical component–target protein interaction network and establish a component, protein and hub metabolite protein–protein interaction(PPI) network and merging the three PPI networks basing on BisoGenet. The gene enrichment analysis was used to analyse the relationship between proteins based on the relevant genetic similarity by ClueGO. The results shown DBT effectively treated anaemia in vivo. 11 metabolic pathways are involved in the therapeutic effect of DBT in vivo;S-adenosyl-L-methionine, glycine, L-cysteine, arachidonic acid(AA) and phosphatidylcholine(PC) were screened as hub metabolites in APH-and CTX-induced anaemia. A total of 288 targets were identified as major candidates for anaemia progression. The gene-set enrichment analysis revealed that the targets are involved in iron ion binding, haemopoiesis, reactive oxygen species production, inflammation and apoptosis. The results also showed that these targets were associated with iron ion binding, haemopoiesis, ROS production, apoptosis, inflammation and related signal 展开更多
关键词 Danggui Buxue TANG Metabolomics NETWORK PHARMACOLOGY ANAEMIA
电离辐射对小鼠肾脏影响的代谢组学研究 预览
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作者 肖雄杰 HU Mary +1 位作者 张许 HU Jian-zhi 《波谱学杂志》 CAS 北大核心 2019年第2期172-181,共10页
电离辐射对生物体影响是目前生物医学领域研究的热点之一.本文利用基于核磁共振氢谱(1H NMR)的代谢组学技术研究来自暴露于不同的电离辐射的C57BL/6J小鼠的肾脏的水溶性萃取物,并试图寻找电离辐射对小鼠肾脏影响的特异性生物标志物.分... 电离辐射对生物体影响是目前生物医学领域研究的热点之一.本文利用基于核磁共振氢谱(1H NMR)的代谢组学技术研究来自暴露于不同的电离辐射的C57BL/6J小鼠的肾脏的水溶性萃取物,并试图寻找电离辐射对小鼠肾脏影响的特异性生物标志物.分析结果表明,辐射组可与相应的对照组明显区分.在所发现的75个代谢物中,有6种代谢物的浓度发生显著性变化,分别为2-氨基丁酸、3-羟基丁酸、高丝氨酸、1,3-丙二胺、β-丙氨酸和抗坏血酸.这些代谢物可能成为高剂量电离辐射对生物体肾脏代谢影响的标志物. 展开更多
关键词 核磁共振氢谱(1H NMR) 代谢组学 电离辐射 肾脏 多变量数据分析
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基于洛杉矶–北京迁徙人群的大气污染暴露相关急性健康效应标志物的代谢组学研究 预览
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作者 谢天宁 林岩 邱兴华 《北京大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期501-508,共8页
采用定组设计,以14名洛杉矶加州大学–北京大学交换学生为受试者,建立基于气相色谱–质谱联用的尿液非靶向代谢组学方法,采用包括(正交)偏最小二乘回归判别分析在内的多种统计方法识别差异物质,并基于色谱–质谱信息进行结构鉴定。通过... 采用定组设计,以14名洛杉矶加州大学–北京大学交换学生为受试者,建立基于气相色谱–质谱联用的尿液非靶向代谢组学方法,采用包括(正交)偏最小二乘回归判别分析在内的多种统计方法识别差异物质,并基于色谱–质谱信息进行结构鉴定。通过固定站点监测数据评价研究期间两地的大气污染物暴露,采用混合效应线性模型探索污染物与指征氧化损伤的生物标志物间的关联。结果表明,两地的暴露变化与人体能量代谢、氧化损伤、肠胃菌群、蛋白质与RNA代谢(可能涉及细胞凋亡)等通路变化之间可能存在关联,受试者尿液中的尿囊素、胱氨酸和假尿嘧啶水平在北京显著上升。当以尿囊素作为指征机体急性氧化损伤的标志物时,其变化与0~96小时的PM2.5、0~24小时的CO、24~48小时的NO2、48~72小时的O3以及24~72小时的SO2暴露有较强的相关性。结果表明北京与洛杉矶间大气污染物暴露的差异可能导致受试者体内氧化损伤负担发生变化,同时体内可能产生抗氧化损伤的生理活动,例如通过调动能量代谢通路抵御氧化还原失衡造成的氧化损伤负担。 展开更多
关键词 代谢组学 生物标志物 氧化损伤 大气污染物 混合效应模型
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基于血浆代谢组学的附子脂溶性生物碱对佐剂性关节炎模型大鼠的毒性作用机制研究 预览
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作者 谢运飞 李芸霞 +3 位作者 刘美辰 周忆梦 王彪 彭成 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第1期78-83,共6页
目的:研究附子脂溶性生物碱对佐剂性关节炎(AIA)模型大鼠的毒性作用机制。方法:将40只大鼠随机分为空白组(超纯水)、模型组(超纯水)和附子脂溶性生物碱低、高剂量组(12.5、35 mg/kg),每组10只。除空白组外,其余各组大鼠均于右后足垫部... 目的:研究附子脂溶性生物碱对佐剂性关节炎(AIA)模型大鼠的毒性作用机制。方法:将40只大鼠随机分为空白组(超纯水)、模型组(超纯水)和附子脂溶性生物碱低、高剂量组(12.5、35 mg/kg),每组10只。除空白组外,其余各组大鼠均于右后足垫部位注射0.1 mL完全弗氏佐剂复制AIA模型。造模19 d后开始灌胃给药,每天1次。连续给药14 d后,采用超高效液相色谱-线性离子阱/静电场轨道阱结合高分辨质谱技术分离并鉴定血浆中内源性代谢物,然后对数据进行主成分分析(PCA)和偏最小二乘判别分析(PLS-DA),通过变量投影重要度值(VIP)>1和P值(<0.05)筛选血浆中的差异代谢物;并根据差异代谢物查阅京都基因与基因组百科全书数据库,推测附子脂溶性生物碱对AIA大鼠的毒性作用机制。结果:共鉴定出57个血浆代谢物,并确定了L-脯氨酸、6-羟基烟酸、腺苷等11个差异代谢物。AIA造模后可引起大鼠血浆中L-脯氨酸和尿苷酸含量显著降低(P<0.05或P<0.01),脱氧胞苷含量显著升高(P<0.01)。低剂量附子脂溶性生物碱给药后可使模型大鼠血浆中腺苷和L-脯氨酸含量显著降低(P<0.05或P<0.01),血浆中脱氧胆酸含量显著升高(P<0.05);而高剂量附子脂溶性生物碱给药后可使模型大鼠血浆中6-羟基烟酸、腺苷、肉碱、L-脯氨酸、N-甲酰氨基苯甲酸含量显著降低(P<0.05或P<0.01),血浆中脱氧胆酸、L-精氨酸、脱氧胞苷、L-赖氨酸含量显著升高(P<0.05或P<0.01)。结论:低剂量附子脂溶性生物碱对AIA模型大鼠的毒性较小;高剂量附子脂溶性生物碱对AIA模型大鼠的毒性作用可能与其引起胆汁分泌异常及赖氨酸生物合成及嘌呤、嘧啶、色氨酸、脯氨酸、精氨酸代谢紊乱有关。 展开更多
关键词 附子 脂溶性生物碱 代谢组学 佐剂性关节炎 毒性机制 大鼠
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南美油藤种子发育过程的代谢组学和转录组学联合分析 预览
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作者 刘果 陈鸿鹏 +2 位作者 吴志华 彭彦 谢耀坚 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第5期169-179,共11页
【目的】南美油藤种子油中富含不饱和脂肪酸,是一种具有重要经济价值和应用前景的油料植物。目前影响南美油藤种子油脂合成的关键基因、途径及其调控机理尚未清晰。因此,对南美油藤种子的脂质代谢物的动态变化规律及重要脂肪酸代谢相关... 【目的】南美油藤种子油中富含不饱和脂肪酸,是一种具有重要经济价值和应用前景的油料植物。目前影响南美油藤种子油脂合成的关键基因、途径及其调控机理尚未清晰。因此,对南美油藤种子的脂质代谢物的动态变化规律及重要脂肪酸代谢相关调控基因的研究,不仅能够为提高其种子油产量和改善油脂品质提供理论基础,也可为其他木本油料植物高效开发利用提供有价值的参考依据。【方法】选用不同生长阶段的南美油藤种子(形成初期、发育初期、中期、后期、成熟期)为研究对象,结合GC-MC代谢组学技术和高通量转录组测序技术,分析种子发育过程中脂质代谢物含量的动态变化规律,并根据种子不同生长阶段的差异表达基因寻找出脂质代谢物生物合成与累积的关联酶基因。【结果】脂质代谢组学分析发现,南美油藤种子中高含量的α-亚麻酸和亚油酸主要在种子成熟阶段合成与累积,是判别南美油藤种子中脂肪酸缓慢累积时期与快速累积阶段的依据。转录组学分析表明,南美油藤种子成熟阶段前后的基因表达存在显著差异。结合代谢组学与转录组学的分析结果显示,与脂肪酸生物合成和累积相关的6个关键酶基因的表达模式与脂肪酸的合成和累积存在显著的相关性,基因家族的不同成员存在生物学功能的差异性和多样性。其中FAD2-3、FAD7、FATA、KAS2、LACS2、LACS8和SAD酶基因表达与脂肪酸总含量及主要脂肪酸含量呈显著正相关,说明7个酶基因表达对南美油藤种子油脂的合成与累积有促进作用;FAD2-2、KCS1、KCS10和LACS1酶基因与脂肪酸总含量及主要脂肪酸含量呈显著负相关,说明4个酶基因的表达对南美油藤种子油脂的合成与累积具有抑制作用。【结论】南美油藤种子成熟前后脂肪酸含量及差异表达基因存在显著差异,可依据种子中α-亚麻酸和亚油酸的含量 展开更多
关键词 南美油藤 代谢组学 转录组学 油脂合成 不饱和脂肪酸
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代谢组学解析遮阴对茶叶主要品质成分的影响 预览
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作者 陈勤操 戴伟东 +3 位作者 蔺志远 解东超 吕美玲 林智 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1066-1077,共12页
【目的】茶叶生产上常采用遮阴处理来提高其品质,然而,黑暗遮阴对茶叶品质的影响尚未清楚。本文重点研究黑暗遮阴对茶叶中主要品质成分的影响,以期更加详细了解遮阴与茶叶品质的关系。【方法】利用遮阳网对茶树进行中度(65.0%)、黑暗(99... 【目的】茶叶生产上常采用遮阴处理来提高其品质,然而,黑暗遮阴对茶叶品质的影响尚未清楚。本文重点研究黑暗遮阴对茶叶中主要品质成分的影响,以期更加详细了解遮阴与茶叶品质的关系。【方法】利用遮阳网对茶树进行中度(65.0%)、黑暗(99.7%)两个遮阴处理,不遮阴作为对照;采用紫外分光光度法检测总多酚、总氨基酸、总黄酮的含量,同时采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOF/MS)对茶叶中的主要品质成分进行详细调查。【结果】与对照相比,中度遮阴显著降低了茶叶的总氨基酸、总黄酮含量(P<0.05),轻微降低了总多酚含量,增加了酚氨比;黑暗遮阴显著降低了总氨基酸和总黄酮含量,显著增加了总多酚含量和酚氨比(P<0.05)。主成分分析(PCA)表明,两个遮阴处理明显改变了茶树叶片的代谢组。进一步鉴定得到了87个化合物,包括2个生物碱、18个氨基酸、12个儿茶素类、8个儿茶素二聚体类、19个黄酮(醇)糖苷、5个香气糖苷、6个核苷(酸)、9个酚酸、8个其他化合物;与对照相比,82个化合物在遮阴处理后出现显著差异(P<0.05)。遮阴后,生物碱含量显著增加;氨基酸呈现多样性变化,半数以上氨基酸含量显著下降;部分儿茶素类及二聚儿茶素类物质的含量在中度遮阴后显著降低,然而大部分儿茶素类和儿茶二聚体素类物质的含量却在黑暗遮阴后显著上升;绝大部分黄酮(醇)糖苷的含量在遮阴后出现显著下降,且遮阴程度越高,下降越多;大部分香气糖苷含量在遮阴后显著上升;大部分核苷(酸)含量在遮阴后显著降低;多数酚酸的含量在遮阴后显著上升。【结论】黑暗遮阴后,生物碱、儿茶素类及儿茶素二聚体类等物质含量显著上升,氨基酸含量显著下降,酚氨比显著上升,预示黑暗遮阴处理可能不利于提高茶叶的品质。 展开更多
关键词 茶叶 遮阴 代谢组学 液质联用 次生代谢
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组学技术应用于茶树物质代谢研究中的进展
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作者 温贝贝 罗勇 +2 位作者 李娟 王坤波 黄建安 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期862-868,共7页
茶树是多年生常绿木本植物,对种质资源进行有效地评价与分析是茶学研究的重要领域,茶树代谢产物如多酚类、咖啡碱、茶氨酸和多糖类等物质不仅是重要的植物天然产物,也是构成茶叶滋味、香气的特征品质成分,被广泛应用于食品、医药等行业... 茶树是多年生常绿木本植物,对种质资源进行有效地评价与分析是茶学研究的重要领域,茶树代谢产物如多酚类、咖啡碱、茶氨酸和多糖类等物质不仅是重要的植物天然产物,也是构成茶叶滋味、香气的特征品质成分,被广泛应用于食品、医药等行业。组学技术具有高通量、高灵敏度和系统性的特点,已成为生命科学研究中的强有力工具,也为茶树研究提供了新的方法。茶树系统生物学的研究离不开组学技术的发展,功能基因组学、蛋白质组学、代谢组学等技术已应用于儿茶素、氨基酸、咖啡碱、多糖等重要功能成分的代谢研究。本研究综述了组学技术在茶树物质代谢中的研究进展,对研究中的不足之处进行了阐述,并讨论了组学技术在茶树物质代谢研究中的应用前景。 展开更多
关键词 功能基因组学 蛋白质组学 代谢组学 物质代谢 茶树
预测急性心肌梗死患者转归的血清代谢物谱研究 预览
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作者 刘婕 石欣荣 +3 位作者 周淑芬 许宏敏 张磊 刘树业 《检验医学》 CAS 2019年第5期383-389,共7页
目的采用液-质联用代谢组学研究平台寻找能在急性心肌梗死(AMI)患者入院时即预测患者转归的特异性代谢物。方法运用超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)代谢组学研究平台分析48例心绞痛患者、24例AMI好转者、24例AMI死亡者及48名体检健... 目的采用液-质联用代谢组学研究平台寻找能在急性心肌梗死(AMI)患者入院时即预测患者转归的特异性代谢物。方法运用超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)代谢组学研究平台分析48例心绞痛患者、24例AMI好转者、24例AMI死亡者及48名体检健康者(正常对照组)代谢物数据,对代谢轮廓数据的变异性进行分析,构建疾病区分模型。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估特征代谢物的临床诊断效能。结果成功构建了“正常对照组-心绞痛组-AMI好转组-AMI死亡组”的主成分分析(PCA)模型(R2X=40.2%,Q2=13.9%)及正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)模型(R2X=79.0%,R2Y=83.2%,Q2=65.0%)。验证结果显示模型的预测准确度达100%。筛选并鉴定出10种可用于AMI预后判断的代谢物离子,其中4-羟基-6-二十二烷酮、N-乙酰-白三烯、溶血磷脂酰胆碱(LPC)[18:2(9Z,12Z)]、LPC(18: 0)、LPC(P-16:0)、LPC[P-18:1(9Z)]、LPC[20:1(11Z)]、LPC[20:2(11Z,14Z)]在AMI死亡患者的血清中水平较低,L-苏氨酸、3-甲基-2-丁烯-1-硫醇水平较高,与AMI好转患者比较差异均有统计学意义(P<0.05)。结论采用代谢组学分析方法找到的特征代谢物具有很好的预测AMI患者预后的能力,可作为潜在的疾病转归标志物进一步研究。 展开更多
关键词 代谢组学 心绞痛 心肌梗死 超高效液相色谱串联质谱
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小麦代谢组学技术及其研究进展
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作者 王丽娜 王步军 《食品安全质量检测学报》 CAS 2019年第4期830-836,共7页
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展的一门学科,真正反映在生物体内已经发生的生命活动,揭示生物体在特定时间、特定条件下的整体功能性状态,为生物体内在规律的研究提供信息,在植物学研究中得到广泛关注。本研究主要介绍了代... 代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展的一门学科,真正反映在生物体内已经发生的生命活动,揭示生物体在特定时间、特定条件下的整体功能性状态,为生物体内在规律的研究提供信息,在植物学研究中得到广泛关注。本研究主要介绍了代谢组学常用的高通量检测技术(如核磁共振、气相色谱-质谱联用、超高压液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用等)、数据分析方法、检索数据库等,对比了不同检测方法的优缺点。小麦作为世界上的主要的粮食作物之一,在代谢组学方面也有相关研究。本文重点概述了发芽小麦代谢组学的研究现状,通过分析代谢物及小麦理化性质,揭示了小麦萌发的主要能量来自糖酵解,同时增加有益活性成分,为了解在代谢水平上的谷物种子萌发的生化机制及代谢产物发生的系列变化提供了理论基础。 展开更多
关键词 小麦 代谢组学 主成分分析 萌发 逆境胁迫
代谢组学在动物应激研究中的应用
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作者 李文杰 连帅 +1 位作者 王立鹏(综述) 杨焕民(审校) 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第4期482-484,488共4页
代谢组学是生物机体在病理生理、遗传、环境或行为的不同刺激下,对机体所产生代谢产物变化的研究,是生物领域研究中一种重要的研究手段,已在植物学、营养学、中药学、微生物学、临床疾病诊断等研究领域得到广泛应用。动物应激一直是畜... 代谢组学是生物机体在病理生理、遗传、环境或行为的不同刺激下,对机体所产生代谢产物变化的研究,是生物领域研究中一种重要的研究手段,已在植物学、营养学、中药学、微生物学、临床疾病诊断等研究领域得到广泛应用。动物应激一直是畜牧行业关注的热点,许多因素可导致动物应激,常见的应激类型有冷应激、热应激、氧化应激、束缚应激、噪音应激、运输应激,还有不可预知的慢性应激等,这些应激均可对动物机体产生一定危害。目前,代谢组学也已应用于动物应激领域的研究,本文对代谢组学在动物的冷应激、热应激、氧化应激及束缚应激研究中的应用作一综述。 展开更多
关键词 代谢组学 冷应激 热应激 氧化应激 束缚应激
基于化学、体内过程和代谢组学的甘草解毒作用研究概况 预览
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作者 王志琪 张序晴 +4 位作者 王尚尧 陈燕盈 彭兰 李赛 曾嵘 《湖南中医药大学学报》 CAS 2019年第1期132-137,共6页
甘草是一味可以解百毒、调和诸药的中药。通过研究甘草对有毒中药/毒性成分及其体内变化过程的影响和甘草对生物体内小分子代谢物的作用来探索其配伍减毒的机制,有助于更好地认识甘草与有毒中药/毒性成分的配伍规律。主要从化学、药动... 甘草是一味可以解百毒、调和诸药的中药。通过研究甘草对有毒中药/毒性成分及其体内变化过程的影响和甘草对生物体内小分子代谢物的作用来探索其配伍减毒的机制,有助于更好地认识甘草与有毒中药/毒性成分的配伍规律。主要从化学、药动学和代谢组学3个方面介绍了甘草减缓有毒中药/毒性成分的作用及相关机制。 展开更多
关键词 甘草 化学 超分子化学 体内过程 代谢组学 解毒 减毒
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基于细胞代谢组学技术的人参皂苷Rb1对SH-SY5Y细胞保护机制研究 预览
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作者 杨银平 律广富 +5 位作者 张乔 姚梦杰 梁新合 李茎 张辉 孙佳明 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期49-58,共10页
采用基于1H NMR的细胞代谢组学技术探讨人参皂苷Rb 1对谷氨酸诱导SH-SY5Y细胞凋亡的保护作用机制。应用MTT比色法及流式细胞术分析SH-SY5Y细胞在造模和给药前后的细胞存活率和凋亡率,利用1H NMR技术平台结合多元统计分析对细胞代谢的动... 采用基于1H NMR的细胞代谢组学技术探讨人参皂苷Rb 1对谷氨酸诱导SH-SY5Y细胞凋亡的保护作用机制。应用MTT比色法及流式细胞术分析SH-SY5Y细胞在造模和给药前后的细胞存活率和凋亡率,利用1H NMR技术平台结合多元统计分析对细胞代谢的动态变化进行研究,揭示SH-SY5Y细胞在造模和给药前后内源性代谢物变化情况。结果表明,人参皂苷Rb 1能通过减少谷氨酸诱导SH-SY5Y细胞凋亡而产生保护作用,结合正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)共鉴定出谷氨酸、牛磺酸、乙酸、精氨酸、肌酸、丙氨酸和脯氨酸共7个差异代谢物。经Metaboanalyst分析,主要涉及牛磺酸和亚牛磺酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢、丙酮酸代谢共5条能量代谢及氨基酸代谢途径。结果表明,人参皂苷Rb 1主要通过影响多种能量及氨基酸代谢对氧化损伤的神经细胞产生保护作用。 展开更多
关键词 人参皂苷RB1 细胞代谢组学 1H核磁共振 凋亡保护 正交偏最小二乘法判别分析
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Effects of the ambient fine particulate matter(PM2.5) exposure on urinary metabolic profiles in rats using UPLC-Q-TOF-MS
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作者 Lin Zhang Tengfei Xu +3 位作者 Zifeng Pi Meizhu Zheng Fengrui Song Zhiqiang Liu 《中国化学快报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期90-94,共5页
In order to study the damage of ambient fine particulate matter(PM2.5) to organism in the environment,the method of urinary metabolomics was used to detect the potential endogenous metabolites and their related metabo... In order to study the damage of ambient fine particulate matter(PM2.5) to organism in the environment,the method of urinary metabolomics was used to detect the potential endogenous metabolites and their related metabolic pathways to clarify the toxicity mechanisms. Particles of PM2.5 collected from the fibrous membrane were extracted ultrasonically and dissolved in physiological saline to prepare PM2.5 suspension. The solution of saline and fine particular matter was injected into the trachea of rats respectively. The rats were injected two times a week for four weeks. Samples of 24-h urine were collected at the 14 th day after the end of exposure, and the ultra performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry(UPLC-Q-TOF-MS) was used for the metabolomics detection. Principal component analysis(PCA) was used to investigate the global metabolomic alterations and a clear separation in the scatter diagram were observed. 17 potential endogenous metablites were identified from urinary samples in rats by UPLC-Q-TOF-MS. The primary metabolism pathways involved pentose and glucuronate interconversions, starch and sucrose metabolism, tryptophan metabolism, tyrosine metabolism, phenylalanine metabolism, purine metabolism, acetaminophen metabolism pathway, retinol metabolism and valproic acid metabolism pathway.The results are helpful to understand the toxicological mechanisms of PM2.5 and screened out potential biomarkers of rats which exposure to PM2.5. 展开更多
关键词 AMBIENT fine PARTICULATE MATTER UPLC -Q-TOF-MS Metabolomics URINE
基于代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制 预览
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作者 黄烈城 陈红燕 +1 位作者 庞凤舜 秦有 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第10期1545-1549,共5页
目的运用代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制。方法雄性SD大鼠20只随机分为模型组与正常组,利用LC MS(液相色谱-质谱联用)获取大鼠血浆代谢图谱,并采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS DA)进行多变量... 目的运用代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制。方法雄性SD大鼠20只随机分为模型组与正常组,利用LC MS(液相色谱-质谱联用)获取大鼠血浆代谢图谱,并采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS DA)进行多变量统计分析,筛选出区分术后疲劳大鼠与正常大鼠的重要差异代谢物及相关代谢途径。结果术后疲劳大鼠与正常大鼠相比,得到差异性代谢离子5680个,两组大鼠血浆代谢谱存在明显差异,同时色氨酸代谢,戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化,精氨酸和脯氨酸代谢,细胞色素P450对外源化合物代谢的影响,卟啉和叶绿素、叶酸合成、维生素B6、亚油酸代谢等代谢通路存在明显差异。结论中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳与色氨酸、精氨酸、戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化等代谢途径变化引起的脑内5 HT合成增多、血液循环功能减弱、能量供给障碍相关。由于目前非靶向代谢物的鉴定仍有不足,具体各种代谢物定性及定量分析仍需进一步实验研究。 展开更多
关键词 代谢组学 液相色谱-质谱联用 术后疲劳 主成分分析 偏最小二乘法-判别分析
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甜菜组学技术研究进展 预览
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作者 耿贵 吕春华 +2 位作者 於丽华 李任任 王宇光 《中国农学通报》 2019年第12期124-129,共6页
转录组学、蛋白组学、基因组学和代谢组学等组学技术具有高通量、高灵敏度和系统性等优点,已成为在分子水平研究植物应对生物胁迫和非生物胁迫的强有力工具。本研究综述了近年来国内外在甜菜组学技术方面的相关研究,包括甜菜在生物和非... 转录组学、蛋白组学、基因组学和代谢组学等组学技术具有高通量、高灵敏度和系统性等优点,已成为在分子水平研究植物应对生物胁迫和非生物胁迫的强有力工具。本研究综述了近年来国内外在甜菜组学技术方面的相关研究,包括甜菜在生物和非生物胁迫下的抗逆分子机理研究、细胞质雄性不育(CMS)结构基因和基因辅助甜菜育种功能研究,这些研究对于培育优良甜菜品种具有重要的理论价值。下一步应加强多种组学结合的研究策略,并结合基因功能鉴定发掘更多的甜菜优质基因资源。 展开更多
关键词 甜菜 转录组学 蛋白质组学 基因组学 代谢组学
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代谢组学法研究转录因子SlNAC4对番茄果实代谢产物的影响 预览
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作者 郑海英 张冬青 赵晓丹 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第10期36-42,共7页
以SlNAC4基因沉默番茄和野生型番茄为研究对象,采用高效液相色谱-串联高分辨率质谱仪对破色期番茄果实代谢产物进行代谢组学分析,探究转录因子SlNAC4对果实成熟中代谢产物的影响。利用XCMS软件和inhouse标准品、HMDB、KEGG等数据库对化... 以SlNAC4基因沉默番茄和野生型番茄为研究对象,采用高效液相色谱-串联高分辨率质谱仪对破色期番茄果实代谢产物进行代谢组学分析,探究转录因子SlNAC4对果实成熟中代谢产物的影响。利用XCMS软件和inhouse标准品、HMDB、KEGG等数据库对化合物进行定性分析,用metaX软件进行定量及差异代谢产物的筛选。对两组番茄代谢组学分析结果显示,既能与数据库物质的一级离子m/z匹配也能与数据库物质的碎片离子(二级)m/z匹配到的差异代谢物质共有67种,包括氨基酸衍生物及二肽类(19种)、维生素类(7种)、糖类及其衍生物(4种)、核酸及其衍生物(11种)、生物碱类(4种)、香精香料(4种)及有机酸(9种)等。其中有29种化合物含量上调,38种含量显著下降,表明番茄转录因子SlNAC4影响了番茄果实成熟过程中的代谢。 展开更多
关键词 番茄 转录因子SlNAC4 代谢组学 代谢产物
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基于高分辨质谱的非靶向代谢组学在食品造假鉴定中的研究进展 预览
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作者 赖博文 刘玢 梁永康 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期192-197,共6页
食品造假属于以经济利益为驱动的食品欺诈(Economically motivated adulteration,EMA),是目前影响及破坏食品安全秩序的重要因素之一。而随着人们生活水平的迅速提高,对食品品质提出了更高的要求,当下食品造假现象是公众极为关注的问题... 食品造假属于以经济利益为驱动的食品欺诈(Economically motivated adulteration,EMA),是目前影响及破坏食品安全秩序的重要因素之一。而随着人们生活水平的迅速提高,对食品品质提出了更高的要求,当下食品造假现象是公众极为关注的问题。以往,针对已知的目标物质进行定量检测的靶向代谢组学技术在食品检测中广泛应用,代谢组学技术已经成为食品科学研究中不可或缺的工具。近年来,针对食品造假现象,代谢组学的另一个分支,基于高分辨质谱(High-resolution mass spectrometry,HRMS)的非靶向代谢组学(Non-targeted metabolomics,NTM)开始运用到食品造假的鉴定中,并已取得快速的发展。对基于HRMS的非靶向代谢组学的食品造假鉴定工作流程进行了介绍,对其数据处理方式进行了概括,并就其在食品物种(品种)、产地和品质等造假鉴定相关应用分别进行了总结,最后还对基于高分辨质谱的非靶向代谢组学应用于食品检测中优点和缺点进行了概括,并对其在其他研究方向进行了展望,旨在对食品检测中代谢组学的最新研究进展进行总结和归纳。 展开更多
关键词 高分辨质谱 代谢组学 食品造假
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慢性肾脏疾病晚期患者的尿代谢组学特征分析 预览
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作者 冯琴 尚小玲 +1 位作者 李智 胡芳 《现代检验医学杂志》 CAS 2019年第1期93-96,共4页
目的研究尿代谢物在慢性肾脏疾病(CKD)晚期患者中的变化及与肾脏疾病发展的相关性。方法通过NMR分析15例患者和15例健康人的尿代谢组分,进行主成分分析(PCA)检验,并进一步运用液相色谱-三重四极杆质谱法分析另外16例CKD患者和15例对照... 目的研究尿代谢物在慢性肾脏疾病(CKD)晚期患者中的变化及与肾脏疾病发展的相关性。方法通过NMR分析15例患者和15例健康人的尿代谢组分,进行主成分分析(PCA)检验,并进一步运用液相色谱-三重四极杆质谱法分析另外16例CKD患者和15例对照的尿液样本进行验证,并鉴定CKD和非CKD尿样之间的尿代谢物。结果发现CKD和非CKD尿样之间有七种尿代谢物显著不同(P<0.05),其中枸橼酸盐、牛磺酸、5-羟脯氨酸在CKD患者中显著降低(P<0.05),而谷氨酸、鸟苷酸乙酸酯、α-苯乙酰谷氨酰胺和N-氧化三甲胺显著上升(P<0.05)。根据这些代谢物的变化趋势,5例CKD患者中有4例被鉴定为CKD患者(80%准确性),7例健康人中有6例被划分到对照区(86%准确性)。结论该方法特异度高,可以用来预测CKD,其临床引用前景良好。 展开更多
关键词 慢性肾病 质谱 代谢组学
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基于气相色谱质谱联用的酵母菌代谢组学分析方法的建立 预览
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作者 明明 王希越 娄大伟 《吉林化工学院学报》 CAS 2019年第5期1-5,共5页
近年来微生物代谢组学逐渐成为一种新兴的分析手段.微生物虽然有着结构简单、营养需求单一的特点,但也存在自身种类繁多、细胞内代谢物质理化性质各不相同的弊端.因此,在前期样品处理方面仍存在很大的不足.基于GC-MS的分析方法,建立了... 近年来微生物代谢组学逐渐成为一种新兴的分析手段.微生物虽然有着结构简单、营养需求单一的特点,但也存在自身种类繁多、细胞内代谢物质理化性质各不相同的弊端.因此,在前期样品处理方面仍存在很大的不足.基于GC-MS的分析方法,建立了一种用于酵母菌S288C的代谢组学分析方法,通过考察甲醇(-20℃)、V(乙腈)V(水)=11(-20℃)、V(乙腈)V(甲醇)V(水)=221(-20℃)、V(水)V(异丙醇)V(甲醇)=225(-20℃)、75%乙醇(煮沸)5种溶剂对胞内物提取的影响,确定最佳的提取溶剂为V(水)V(异丙醇)V(甲醇)=225(-20℃).该方法可检测348种代谢物,通过数据库检索可定性出142种物质,包括46种氨基酸类代谢物、9种糖类代谢物、30种有机酸代谢物、17种醇类代谢物以及23种酯类代谢物. 展开更多
关键词 代谢组学 样品处理 气相色谱-质谱联用
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中医病证相符的大鼠疮疡模型的建立及其血浆、尿液代谢组学研究 预览
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作者 陈德轩 蔡红蝶 +1 位作者 宿树兰 朱永康 《中医药学报》 CAS 2019年第1期17-22,共6页
目的:观察胶带表皮剥脱加金葡菌菌液注射方法致大鼠背部疮疡模型的造模效果。方法:20只SD大鼠分为正常组和模型组各10只,模型组麻醉后背部脱毛,以胶带粘扯背部软毛脱表皮,滴注菌液待其自然苏醒,以后连续3d于其皮下注射菌液,正常组以生... 目的:观察胶带表皮剥脱加金葡菌菌液注射方法致大鼠背部疮疡模型的造模效果。方法:20只SD大鼠分为正常组和模型组各10只,模型组麻醉后背部脱毛,以胶带粘扯背部软毛脱表皮,滴注菌液待其自然苏醒,以后连续3d于其皮下注射菌液,正常组以生理盐水代替菌液。至第4天取局部组织进行HE染色和革兰氏染色,收集血浆及尿液备检测。通过观察正常组大鼠与模型组大鼠全身及局部疮面情况、病理标本,判断大鼠疮疡模型建模成功。利用代谢组学分析方法,对正常组与模型组大鼠的血浆与尿液进行代谢轮廓分析。结果:模型大鼠表现出阳证疮疡中期成脓的证候特点,病理切片观察显示造模成功,代谢组学检测显示实验模型大鼠血浆、尿液的图谱与正常组大鼠的图谱存在一定的差异,PCA图可以看出正常组与模型组大鼠血浆、尿液代谢谱分为两类,两者明显区分。OPLS-DA图可以看出正常与模型大鼠的血浆、尿液生物样品呈现聚拢状态,且区分明显。结论:模型大鼠表现出中医“阳证”证型特点,胶带表皮剥脱菌液滴注加皮下菌液注射造模方法可制作出符合实验需要的体表感染疮疡模型(中期)。 展开更多
关键词 中医病证 疮疡模型 代谢组学 血浆 尿液
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