期刊文献+
共找到2,073篇文章
< 1 2 104 >
每页显示 20 50 100
葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析 预览
1
作者 苏玲 王鹏飞 +3 位作者 杨阳 任凤山 王咏梅 陈万钧 《黑龙江农业科学》 2019年第1期13-22,共10页
为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型、进化分析、染色体定位、基因结构、保守元件和基因表达模式。结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子。序列比对和系谱... 为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型、进化分析、染色体定位、基因结构、保守元件和基因表达模式。结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子。序列比对和系谱进化表明,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个组,Ⅱ组分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e五个亚组。染色体定位表明,存在串联复制和分布不均现象,但是在3号染色体上无该家族基因定位。结构域和保守元件分析都说明葡萄WRKY(VvWRKY)家族的WRKY结构域是高度保守的。葡萄叶片中基因表达模式分析表明,VvWRKY家族的部分基因参与非生物胁迫。 展开更多
关键词 葡萄 WRKY 转录因子 进化分析 表达分析
在线阅读 下载PDF
偏肿革裥菌系统发育与Lg-mnp2和Lg-mnp3基因克隆及结构特征 预览
2
作者 池玉杰 闫洪波 吴书景 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期64-69,87共7页
白腐菌偏肿革裥菌Lenzites gibbosa能分泌降解木质素的锰过氧化物酶(MnPs),为进一步鉴定试验菌株,对菌株L.gibbosa CB1进行了ITS序列(GenBank登录号为JF279440)扩增与测序,并进行了基于ITS序列的比对与系统发育分析,结果表明CB1与桦革裥... 白腐菌偏肿革裥菌Lenzites gibbosa能分泌降解木质素的锰过氧化物酶(MnPs),为进一步鉴定试验菌株,对菌株L.gibbosa CB1进行了ITS序列(GenBank登录号为JF279440)扩增与测序,并进行了基于ITS序列的比对与系统发育分析,结果表明CB1与桦革裥菌L.betulina和栓菌属Trametes等相关白腐菌的亲缘关系较近而聚类在一起,并与24个同种其他菌株的ITS序列覆盖度在85%~97%期间内的相似性都为99%,说明该菌株为偏肿革裥菌。为了获得该菌株多个编码MnP家族的基因,从而为研究MnP基因的表达调控奠定序列结构的基础,根据已知白腐菌MnPs基因保守区和已经扩增出的基因片段设计引物,以L.gibbosa CB1的基因组DNA和总RNA为模板,采用PCR、RT-PCR、RACE及染色体步移等方法,克隆到该菌株编码MnP2和MnP3的全长cDNA和DNA基因(GenBank登录号分别为JQ388597、JN571114;JQ411249、JN571116),分别命名为Lg-mnp2和Lg-mnp3。2个基因DNA全长分别为2 869、3 992 bp,都含有6个外显子和5个内含子;其启动子区域都含有TATA-Box、CAAT-Box、AP2、MRE等顺式作用元件,Lg-mnp2还含有AP1,Lg-mnp3还含有HSE;其cDNA基因分别含有50、52 bp的5′UTR,150、249 bp的3′UTR和1098、1 101 bp的完整开放阅读框ORF,分别编码了365、366个氨基酸的蛋白质多肽前体(GenBank登录号分别为AFC37493、AFC37494),成熟的Lg-mnp2蛋白含有339个氨基酸,比Lg-MnP1蛋白(GenBank登录号为ACO92620)多1个氨基酸;成熟的Lg-mnp3蛋白含有340个氨基酸,比Lg-MnP2蛋白多1个氨基酸。 展开更多
关键词 偏肿革裥菌 系统发育 锰过氧化物酶 基因克隆 序列分析
在线阅读 下载PDF
Kras基因性质与结构分析 预览
3
作者 陈薄羲 《当代化工研究》 2019年第2期184-186,共3页
Kras蛋白作为肿瘤“开关”,参与了大多数肿瘤的突变。本文对Kras基本特性进行了初步地分析,通过分析Kras氨基酸组成、疏水性表明Kras蛋白具有酸性蛋白质、胶原蛋白、核蛋白、能量蛋白、一些RNA结合模体等特征,整体呈现亲水性。利用MEGA... Kras蛋白作为肿瘤“开关”,参与了大多数肿瘤的突变。本文对Kras基本特性进行了初步地分析,通过分析Kras氨基酸组成、疏水性表明Kras蛋白具有酸性蛋白质、胶原蛋白、核蛋白、能量蛋白、一些RNA结合模体等特征,整体呈现亲水性。利用MEGA软件进行Kras系统发育分析,结果表明人Kras与大鼠、小鼠的Kras亲缘关系高度相近。使用PSORTII分析工具对Kras亚细胞定位进行预测,表明Kras蛋白主要分布在细胞质中。 展开更多
关键词 KRAS 氨基酸组成分析 系统发育分析 亚细胞定位预测 三级结构预测
在线阅读 下载PDF
石榴ARF基因家族鉴定及表达分析
4
作者 黄贤斌 张太奎 +4 位作者 刘翠玉 赵玉洁 魏洪珉 周涧青 苑兆和 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期43-55,共13页
[目的]筛选并分析石榴生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族,为解析石榴ARF基因功能及信号转导调控机制的研究提供参考。[方法]利用生物信息学工具,系统地分析石榴ARF基因家族成员的基因结构、蛋白理化性质、蛋白结构、... [目的]筛选并分析石榴生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族,为解析石榴ARF基因功能及信号转导调控机制的研究提供参考。[方法]利用生物信息学工具,系统地分析石榴ARF基因家族成员的基因结构、蛋白理化性质、蛋白结构、保守基序、系统进化和RNA-Seq数据。[结果]石榴全基因组中鉴定出19个可能的ARF家族基因,根据系统发育树可以划分为4类。PgARF基因家族成员的扩张与全基因组复制事件有关,存在串联重复现象。RNA-Seq数据分析表明,PgARF有一定的组织表达特异性,存在假基因化和新功能化的可能。[结论]整合以上基因结构、系统发育与进化、RNA-Seq表达等分析结果,发现石榴ARF蛋白具有典型的B3、Auxin_resp结构域,多数还具有Aux/IAA结构域。石榴ARF基因家族基因结构和保守基序的进化与进化时间相关,同时家族成员扩张主要与全基因组复制事件相关。 展开更多
关键词 石榴 ARF基因家族 进化分析 表达分析
大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究
5
作者 程琳 薛亚杰 +3 位作者 付觉民 刘旭阳 曲骁冲 代幸龙 《信阳师范学院学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第1期27-38,共12页
減性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息... 減性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的farm蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91~815aa,相对分子量为10273.88~91300.38,理论等电点为4.56~10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Argl3保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大. 展开更多
关键词 大豆 HLH 转录因子 系统发育分析 表达分析
在线阅读 免费下载
3个黑龙江烟区烟草花叶病毒分离物的全基因组序列测定与分析
6
作者 姜瀚林 郭兆奎 +4 位作者 刘永中 万秀清 刘文涛 李现道 李向东 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期77-85,共9页
为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,3... 为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,3个分离物全长均为6395核苷酸(GenBank登录号分别为MH595919、MH595920和MH595921)。HEB1和MDJ与辽宁分离物Beipiao(HE818412)一致率最高,分别为98.9%和99.6%;HEB2与云南分离物Chuxiong1(HE818417)一致率最高,为97.1%。HEB1是MDJ和HEB2的重组体。在根据全基因组序列构建的系统进化树中,TMV分为3个组,其中HEB1和MDJ均属Ⅰ(U1)组,HEB2属Ⅱ(Rakkyo)组。TMV的4个基因均处于负选择,其中衣壳蛋白基因的选择压力最大。 展开更多
关键词 烟草花叶病毒 基因组全序列 系统发育分析 重组分析
在线阅读 免费下载
基于线粒体COⅡ基因和D-loop区序列对江西安南光唇鱼(Acrossocheilus)物种鉴定及系统发育位置分析 预览
7
作者 薛艳洁 潘娜 李明云 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期25-28,共4页
以采自江西赣州安南的野生鱼为实验材料,分别设计引物扩增其线粒体DNACOⅡ和D-loop序列并进行序列比对分析,经扩增得到的COⅡ序列全长为691bp,D-loop序列的全长为937~944bp,其中COⅡ序列中A、T、G、C的平均占比分别为31.00%、25.80%、15... 以采自江西赣州安南的野生鱼为实验材料,分别设计引物扩增其线粒体DNACOⅡ和D-loop序列并进行序列比对分析,经扩增得到的COⅡ序列全长为691bp,D-loop序列的全长为937~944bp,其中COⅡ序列中A、T、G、C的平均占比分别为31.00%、25.80%、15.30%和27.90%,而D-loop序列的占比则分别为35.60%、32.30%、12.00%和20.00%,两序列都是A+T含量高于G+C,G的含量在4种碱基中最低。COⅡ序列中仅存在6个碱基位点的转换,D-loop则有多个碱基位点存在转换、颠换、缺失或插入,群体内遗传距离分别为0.0075、0.0050。用最大似然法构建的COⅡ和D-loop系统发育树显示赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼(Acrossocheilus hemispinus)亲缘性最近,序列相似性分别为98.70%、98.69%,遗传距离最近分别为0.0130、0.0260,未达到种间分化的水平(0.05)。2个序列分析结果一致,结合外部形态特征观察,可以断定赣州安南光唇鱼与半刺光唇鱼为同一种,研究为江西赣州安南光唇鱼的资源利用提供了资料。 展开更多
关键词 光唇鱼 形态特征 COⅡ D-LOOP 序列分析 系统发育分析
在线阅读 下载PDF
小反刍兽疫病毒四川简阳株N基因的系统进化分析 预览
8
作者 张毅 张东 +3 位作者 陈斌 蔡冬冬 裴超信 李春 《四川畜牧兽医》 2019年第2期31-33,35共4页
为了调查小反刍兽疫病毒四川简阳株(SCJY株)的分子遗传特征,我们对四川简阳发病羊鼻拭子中的小反刍兽疫病毒N基因进行了遗传进化分析。通过RT-PCR、克隆测序获得SCJY株N基因序列,使用DNASTAR软件将其与GenBank中的15条参考株序列进行同... 为了调查小反刍兽疫病毒四川简阳株(SCJY株)的分子遗传特征,我们对四川简阳发病羊鼻拭子中的小反刍兽疫病毒N基因进行了遗传进化分析。通过RT-PCR、克隆测序获得SCJY株N基因序列,使用DNASTAR软件将其与GenBank中的15条参考株序列进行同源性比对,使用MEGA6软件进行系统进化分析。结果显示:SCJY株N基因序列全长1578nt,与参考株的核苷酸同源性为88.9%~100%,氨基酸同源性为92.8%~100%,与2013~2014年小反刍兽疫中国流行毒株高度同源;系统进化分析将16个毒株N基因划分为4个谱系,SCJY株属于Ⅳ系。 展开更多
关键词 小反刍兽疫病毒 核衣壳蛋白基因 四川简阳株 系统进化分析
在线阅读 下载PDF
1株黑斑蛙源蛙病毒的分离鉴定及系统进化分析 预览
9
作者 牟维豪 耿毅 +5 位作者 欧阳萍 陈德芳 黄小丽 汪开毓 赵若璇 白明焕 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期40-46,共7页
【目的】为探究四川某养殖场黑斑蛙Rana nigromaculata蝌蚪爆发传染病病因。【方法】通过对患病蝌蚪进行病理学检查与病毒分离,并结合人工感染试验、电镜观察、PCR检测和系统发育分析对分离的病原进行鉴定。【结果】黑斑蛙患病蝌蚪主要... 【目的】为探究四川某养殖场黑斑蛙Rana nigromaculata蝌蚪爆发传染病病因。【方法】通过对患病蝌蚪进行病理学检查与病毒分离,并结合人工感染试验、电镜观察、PCR检测和系统发育分析对分离的病原进行鉴定。【结果】黑斑蛙患病蝌蚪主要临床特征为体表出血、腹部肿胀、腹腔内淡黄色腹水;组织病理学上,患病蝌蚪肝、肾、脾与胰腺等组织器官受损,出现明显的变性与坏死病灶,且在一些病变细胞胞浆内见嗜碱性包涵体。患病蝌蚪组织匀浆接种鲤鱼上皮瘤(EPC)细胞,25℃培养4 d后出现明显细胞病变效应(CPE),TCID50为108 mL^–1。用病毒液进行人工感染试验,感病蝌蚪表现出与自然患病蝌蚪相似的症状,死亡率达到80%,证实分离病毒的病原性。电镜观察发现,病毒颗粒为正六边形,有囊膜,对角线直径(135±8) nm,在胞质中呈晶格状排列或游离状。针对蛙病毒MCP基因的PCR检测显示,自然患病蝌蚪、饲养水源以及分离病毒均为阳性,基于MCP全序列的遗传进化分析发现,分离病毒与蛙病毒属病毒的相似性在99%以上,且与蛙病毒属FV3病毒类群聚为同一分支。【结论】证实导致此次黑斑蛙蝌蚪大量死亡的病原为蛙病毒属病毒,将其命名为黑斑蛙蛙病毒(Rana nigromaculata ranavirus,RNRV)。 展开更多
关键词 蛙病毒 分离鉴定 系统发育分析 病理损伤 黑斑蛙
在线阅读 下载PDF
云南甘蔗白条病的多基因联合鉴定 预览
10
作者 张荣跃 李文凤 +6 位作者 王晓燕 单红丽 仓晓燕 李婕 罗志明 尹炯 黄应昆 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期181-185,215共6页
甘蔗白条病是由白条黄单胞菌 Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson引起的甘蔗重要病害。2017年在云南保山、孟定和金平蔗区的甘蔗上发现疑似白条病的病害。从病株蔗茎中分离得到圆形,凸面,光滑,有光泽,黄色的细菌菌落。经柯赫氏法... 甘蔗白条病是由白条黄单胞菌 Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson引起的甘蔗重要病害。2017年在云南保山、孟定和金平蔗区的甘蔗上发现疑似白条病的病害。从病株蔗茎中分离得到圆形,凸面,光滑,有光泽,黄色的细菌菌落。经柯赫氏法则验证,分离得到的细菌为该病害的病原菌。使用16S rRNA基因、 gyrB 基因和 rpoD 基因对分离得到的病原菌进行了分子鉴定,BLAST和系统发育分析表明本研究所获得的病原菌的3个基因的核苷酸序列与白条黄单胞菌GPE PC73菌株(GenBank登录号: FP565176)对应基因的核苷酸序列一致性均为100%,在系统发育树中处于同一分支。根据田间症状诊断、柯赫氏法则验证及分子鉴定结果,确认云南保山、孟定和金平发生的甘蔗病害为 X. albilineans 引起的甘蔗白条病。 展开更多
关键词 甘蔗白条病 白条黄单胞菌 系统发育分析 云南
在线阅读 下载PDF
一株淡水红藻的形态及分子系统发育研究 预览
11
作者 方鵾鹏 南芳茹 +3 位作者 冯佳 吕俊平 刘琪 谢树莲 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期220-235,共16页
以采自山西晋祠泉的一株淡水红藻JC1712001为实验材料,对其进行分子系统发育分析和形态特征鉴定,同时利用分子数据对其进行生物地理学研究.结果显示,该株淡水红藻JC1712001与美国、西班牙地区报道的马赫拉熊野藻(Kumanoa mahlacensis Ku... 以采自山西晋祠泉的一株淡水红藻JC1712001为实验材料,对其进行分子系统发育分析和形态特征鉴定,同时利用分子数据对其进行生物地理学研究.结果显示,该株淡水红藻JC1712001与美国、西班牙地区报道的马赫拉熊野藻(Kumanoa mahlacensis Kumano)遗传距离最近,基于rbcL、COI和UPA序列的遗传距离均为0.基于3个序列,利用贝叶斯法、最大似然法和邻接法3种方法构建的系统发育树具有高度一致的系统发育关系,JC1712001均与西班牙及美国地区已报道的马赫拉熊野藻聚为一支,支持率都在97%以上,支持其为马赫拉熊野藻,同时也表明3个基因的高度保守性.形态特征的观察也支持这个结果.马赫拉熊野藻在欧洲、亚洲、北美洲均有分布,RASP软件构建的地理起源图谱显示,欧洲类群地理起源更为古老.马赫拉熊野藻为稀有种,本文的研究结果丰富了我国淡水红藻的分布,为其系统发育和地理起源研究提供了依据. 展开更多
关键词 马赫拉熊野藻 RBCL COI UPA 系统发育 地理起源
在线阅读 下载PDF
北京市腹泻儿童人博卡病毒VP1区基因特征分析 预览
12
作者 吉彦莉 王永全 +1 位作者 崔海洋 靳博 《传染病信息》 2019年第1期42-44,共3页
目的 了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)感染状况及分子流行病学特征。方法 收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行... 目的 了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)感染状况及分子流行病学特征。方法 收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行基因特征分析。结果 共采集粪便标本396例,检出HBoV 30例(7.58%),包括3种基因型别,分别为HBoV1型(17例)、HBoV2型(11例)、HBoV3型(2例),未检出HBoV4型。进化分析表明,HBoV1序列在进化树上包括两簇,其中,BJ16-325变异程度较大,自成一簇;其他HBoV1序列共同形成一簇。北京地区所有HBoV2序列均位于一个新的HBoV2亚型分支上。结论 2015—2016年北京市5岁以下腹泻儿童检出的HBoV包括3种基因型(1~3型);北京市至少存在2组不同来源HBoV1的流行;本地区流行的HBoV2为一种新的亚型。 展开更多
关键词 病毒性腹泻 人博卡病毒 进化分析
在线阅读 下载PDF
北极海洋沉积物反硝化细菌的多样性分析
13
作者 孟盈盈 林敬 +2 位作者 张政 吕英涛 林学政 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期119-126,共8页
中国北方地区冬季污水的生物处理存在着处理不彻底、效率低和出水水质难以达标等难题。根据菌落形态特征,利用反硝化细菌培养基对26个站位的北极海洋沉积物进行富集培养,且纯化菌株,获得了克隆到16S rRNA基因有效序列的菌株达59株;基于1... 中国北方地区冬季污水的生物处理存在着处理不彻底、效率低和出水水质难以达标等难题。根据菌落形态特征,利用反硝化细菌培养基对26个站位的北极海洋沉积物进行富集培养,且纯化菌株,获得了克隆到16S rRNA基因有效序列的菌株达59株;基于16S r RNA基因的相似性分析与系统发育研究结果表明,分离的菌株属于细菌域,门、纲、目、科、属、种的数量分别是3、4、8、13、16和23,γ-Proteobacteria占比例最大(57.63%);得到1株菌的16S rRNA基因序列的相似性最高为96.44%,可能为新种。大部分菌株(95%)的温度和耐NaCl浓度的生长范围分别为0~30℃和0~6.0%,能利用多种碳源生长,并且具有产胞外水解酶的能力;利用简并引物从菌株Pseudomonas sp. C22-DN-54、Pseudomonas sp. P13-DN-7、Marinobacter sp. P12-DN-1和Pseudomonas sp. E24-DN-52克隆到了亚硝酸盐还原酶基因(nir S)。该研究将为北方寒冷地区的低温污水生物处理提供新的菌种资源。 展开更多
关键词 北极海洋沉积物 低温 反硝化细菌 系统发育分析
药食两用藠头叶绿体基因组解析、比较基因组学及系统发育研究
14
作者 杨俏俏 姜梅 +3 位作者 王立强 陈海梅 刘昶 黄林芳 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期173-181,共9页
藠头(Allium chinense)为百合科葱属常用药食两用植物。为探究部分葱属植物系统发育关系不明确及该属物种鉴别通用DNA条形码匮乏的问题,本研究应用高通量测序技术对藠头叶绿体全基因组进行测序、组装、注释及系统进化研究。结果显示藠... 藠头(Allium chinense)为百合科葱属常用药食两用植物。为探究部分葱属植物系统发育关系不明确及该属物种鉴别通用DNA条形码匮乏的问题,本研究应用高通量测序技术对藠头叶绿体全基因组进行测序、组装、注释及系统进化研究。结果显示藠头叶绿体基因组为152 525 bp,呈典型的四分状结构,共编码116个基因,其中蛋白质编码基因81个,转运RNA (transfer RNA)基因31个和核糖体RNA (ribosome RNA)基因4个。对6个葱属植物叶绿体基因组比较分析发现了7个变异较大的区间,包括基因编码区ndhA和ycf1,以及非编码区rps16-trnQ、trnT-trnF、ndhF-rpl32、rpl32-trnL和rpl16-rps3。利用葱属和非葱属53个物种的58个共有蛋白序列构建了进化树,发现除百合属、重楼属外其余各属物种所在分枝的支持率都达到66%~100%,有效地解决该类植物的系统进化与分类问题。此外,利用EcoPrimer软件成功发现了7个可用于葱属物种鉴定的候选DNA条形码序列并设计了引物。本研究首次获得了藠头叶绿体基因组序列,明确葱属物种间的亲缘关系,发现了一系列葱属物种特异的DNA条形码序列,为深入研究葱属植物的系统进化、分类及物种鉴定提供科学依据。 展开更多
关键词 藠头 叶绿体基因组 分子标记 系统发育 DNA条形码
乳腺癌致病基因BRCA1的生物信息学分析 预览
15
作者 辛艾玲 《当代化工研究》 2019年第1期186-188,共3页
BRCA1作为乳腺癌关键蛋白参与了乳腺癌和卵巢癌的发生,本文对BRCA1基本特性进行了初步的分析,通过分析其整体的亲疏水性,氨基酸组成,表明BRCA1倾向是核蛋白,整体呈亲水性。使用PSORT2分析工具对BRCA1亚细胞定位进行预测,表明BRCA1蛋白... BRCA1作为乳腺癌关键蛋白参与了乳腺癌和卵巢癌的发生,本文对BRCA1基本特性进行了初步的分析,通过分析其整体的亲疏水性,氨基酸组成,表明BRCA1倾向是核蛋白,整体呈亲水性。使用PSORT2分析工具对BRCA1亚细胞定位进行预测,表明BRCA1蛋白主要分布在细胞核中。利用MEGA软件进行BRCA1系统发育分析,结果表明人BRCA1与猿的BRCA1亲缘关系高度相近。最后,采用同源建模(比较建模)方法构建了BRCA1蛋白的三级结构,从建模质量评估显示预测结果准确。 展开更多
关键词 BRCA1蛋白 三级结构预测 亚细胞定位预测 系统发育分析
在线阅读 下载PDF
山东省部分地区猪伪狂犬病病毒分离鉴定及其gE基因遗传变异分析
16
作者 古金元 马梓承 +4 位作者 彭涛 刘照虎 孟凡亮 王玉超 刘思当 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期21-24,30共5页
自2011年下半年以来全国多个省份使用Bartha-K61疫苗(gE/gI双缺失)免疫的猪场陆续出现了母猪繁殖障碍、仔猪神经症状及死亡、伪狂犬gE抗体阴性猪群突然转阳的问题。同时有的猪场内出现犬、猫、鼠等死亡的现象,经检测都是由变异伪狂犬病... 自2011年下半年以来全国多个省份使用Bartha-K61疫苗(gE/gI双缺失)免疫的猪场陆续出现了母猪繁殖障碍、仔猪神经症状及死亡、伪狂犬gE抗体阴性猪群突然转阳的问题。同时有的猪场内出现犬、猫、鼠等死亡的现象,经检测都是由变异伪狂犬病病毒(vPRV)引起。为了解山东省猪伪狂犬病病毒(PRV)近期流行特征,本试验对2017年上半年来自山东省不同地区的12份伪狂犬疑似病料进行了PRV的分离鉴定,并对分离株的gE基因进行了序列测定及遗传变异分析。结果表明,共分离到9株PRV,其核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为97.5%~99.4%和97.2%~99.1%,与参考毒株其核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为97.5%~99.8%和96.8%~99.2%,并且9株分离株与国内报道的PRV变异株的核苷酸和氨基酸序列的同源性均高于欧美毒株。gE基因的遗传进化树分析表明,本试验中9株分离株相互之间遗传距离较近,与国内PRV变异株处在同一分支,而与欧美毒株遗传距离较远。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 变异毒株 GE基因 遗传变异分析
河南不同地区棉蚜种群共生菌Wolbachia的检测及系统发育分析 预览
17
作者 李绍建 高蒙 +4 位作者 王娜 崔小伟 桑素玲 范腕腕 王振宇 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期215-221,共7页
【目的】本研究旨在揭示河南省不同地区棉蚜 Aphis gossypii 种群共生菌 Wolbachia 的感染情况,明确 Wolbachia 的感染类型及分类地位。【方法】2016-2017年间采集河南省不同地区的13个棉蚜种群,通过扩增 COI 基因片段对其进行种类鉴定... 【目的】本研究旨在揭示河南省不同地区棉蚜 Aphis gossypii 种群共生菌 Wolbachia 的感染情况,明确 Wolbachia 的感染类型及分类地位。【方法】2016-2017年间采集河南省不同地区的13个棉蚜种群,通过扩增 COI 基因片段对其进行种类鉴定;通过扩增棉蚜种群中 Wolbachia 的 wsp 基因片段对其进行 Wolbachia 感染率的检测,应用neighbor-joining法构建系统进化树进行棉蚜种群中 Wolbachia 的系统发育分析。【结果】对河南省内不同地区采集的13个棉蚜种群的 Wolbachia 感染率而言,郑州(ZZ)种群最高(46.67%),信阳2(XY2)种群最低(6.67%),13个种群 Wolbachia 的感染率范围为6.67%~46.67%,平均感染率为28.35%。基于 wsp 基因构建的系统发育树表明,安阳和信阳的棉蚜种群感染的 Wolbachia 株系属于B大组,其余地区棉蚜种群感染的 Wolbachia 株系属于A大组。【结论】河南省不同地区的棉蚜种群 Wolbachia 感染率差别较大,且不同种群感染的 Wolbachia 株系分别属于A大组或B大组。 展开更多
关键词 棉蚜 WOLBACHIA WSP 基因 系统发育分析 感染率 株系
在线阅读 下载PDF
广西口岸出入境人员HIV毒株基因多态性研究 预览
18
作者 方晋 黎湘娟 樊幼珍 《口岸卫生控制》 2019年第1期23-27,共5页
目的 分析广西口岸出入境人员艾滋病感染者中HIV毒株遗传特征。方法 收集2017年广西各口岸出入境人员HIV感染者血液样本,提取病毒RNA,运用巢式PCR的方法对env区和pol区进行扩增,将扩增产物进行基因测序和进化树分析。结果 共获得C亚型2... 目的 分析广西口岸出入境人员艾滋病感染者中HIV毒株遗传特征。方法 收集2017年广西各口岸出入境人员HIV感染者血液样本,提取病毒RNA,运用巢式PCR的方法对env区和pol区进行扩增,将扩增产物进行基因测序和进化树分析。结果 共获得C亚型2例, AE亚型5例,BC亚型2例,AD亚型1例等10份样本的亚型,其中中国、越南与泰国的毒株聚集成一簇流行簇,具有较高的遗传同源性。结论 广西口岸出入境人员HIV毒株主要以CRF01-AE流行为主,传播途径以性接触传播为主。各口岸要加强出入境人员HIV的监测,防止HIV毒株亚型在国内进行传播及重组,引起国内HIV毒株亚型流行的复杂化。 展开更多
关键词 HIV-1 分子进化树 CRF01-AE 口岸
在线阅读 下载PDF
人结膜吸吮线虫病2例报告及Cox1基因分析 预览
19
作者 何丽 缪峰 +2 位作者 薛婷 张尔夫 安春丽 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期103-106,共4页
目的检测辽宁和山东两地人体结膜吸吮线虫(Thelaziacallipaeda)分离株的形态学及基因型,探讨两地分离株虫体基因差异及其系统发生亲缘关系。方法采集2例病人感染的虫体进行形态学鉴定,对其线粒体Cox1基因进行PCR扩增测序,将测序结果与... 目的检测辽宁和山东两地人体结膜吸吮线虫(Thelaziacallipaeda)分离株的形态学及基因型,探讨两地分离株虫体基因差异及其系统发生亲缘关系。方法采集2例病人感染的虫体进行形态学鉴定,对其线粒体Cox1基因进行PCR扩增测序,将测序结果与基因库中文献比对分析,结合GenBank上已发表的同源序列,对不同地域来源的11个个体进行系统发育分析。结果与结论经Cox1基因鉴定,2例病人均可确诊为人结膜吸吮线虫病且其感染的虫体均与欧洲种同源(99.1%及99.6%)。两条虫体扩增的Cox1基因碱基存在差异(8/689),但不同地理虫株之间未见明显遗传变异现象(98%~100%)。 展开更多
关键词 结膜吸吮线虫 Cox1基因 系统发育分析
在线阅读 下载PDF
细口杯环线虫形态学和分子特征分析 预览
20
作者 胡丽莉 孙彦 +2 位作者 刘莹莹 王晨 卜艳珍 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第1期271-278,共8页
为探讨细口杯环线虫(Cylicocyclus leptostomum)的分类地位和系统发育关系,本试验利用数码显微镜对细口杯环线虫进行了形态观察,运用PCR扩增其核糖体DNA内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,并从GenBank中下载12种圆线虫的ITS序列,以马圆形线... 为探讨细口杯环线虫(Cylicocyclus leptostomum)的分类地位和系统发育关系,本试验利用数码显微镜对细口杯环线虫进行了形态观察,运用PCR扩增其核糖体DNA内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,并从GenBank中下载12种圆线虫的ITS序列,以马圆形线虫(Strongylus equinus)为外群,运用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统发育树。结果显示,细口杯环线虫中等大小,口囊呈圆柱形,宽度大于深度,口囊底部有小齿;口囊壁前端薄,后端基部有明显的环箍形增厚;外叶冠由20~24个小叶组成,内叶冠由50~60个小叶组成;食道漏斗较小;雄虫生殖锥较长,呈圆锥形;雌虫尾部直,尾尖呈指形;所测ITS序列总长度为837bp,其中ITS1长366bp,5.8S长153bp,ITS2长318bp;ITS1的GC含量(46.0%)明显高于ITS2(39.8%);经BLAST同源性比对分析,本研究线虫ITS序列与GenBank上登录的同种线虫序列(登录号:AJ004849、Y08587)同源性达99.85%,与阿氏杯环线虫的同源性达99.0%,与杯环属内其他线虫的同源性仅为93.33%~98.45%;ITS序列种间差异远大于种内差异;系统进化分析显示,细口杯环线虫与阿氏杯环线虫的亲缘关系较近,而与杯环属内其他线虫的亲缘关系相对较远。综上所述,ITS序列可作为鉴定寄生线虫的分子遗传标记,证实所采标本是细口杯环线虫,并首次在国内报道了细口杯环线虫的ITS序列,为该线虫的进一步研究奠定基础。 展开更多
关键词 细口杯环线虫 形态描述 核糖体DNA内部转录间隔区(rDNA-ITS) 系统发育分析
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 104 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈