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葡萄着色期果皮蛋白质组分析
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作者 解振强 韩柏明 巫建华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期649-663,共15页
为了研究葡萄不同着色期果皮中蛋白质表达特征,以着色初期、中期和后期等3个着色时期的葡萄果皮为研究对象,运用2-DE、MALDI-TOF/TOF-MS质谱技术以及生物信息学方法对差异蛋白进行分析,结果表明:(1)双向凝胶电泳显示,果皮着色3个时期有1... 为了研究葡萄不同着色期果皮中蛋白质表达特征,以着色初期、中期和后期等3个着色时期的葡萄果皮为研究对象,运用2-DE、MALDI-TOF/TOF-MS质谱技术以及生物信息学方法对差异蛋白进行分析,结果表明:(1)双向凝胶电泳显示,果皮着色3个时期有1050个高度重复的蛋白点,差异显著的蛋白点有162个,其中108个蛋白得到鉴定,有87个蛋白映射到葡萄蛋白质组数据库中;3个时期均表达的差异蛋白有20个,且随着果皮颜色加深,差异蛋白数量呈上升趋势。(2)GO分析显示,ATP合成酶β亚基(ATPβ)极显著富集于磷酸核糖代谢过程,对着色初期果皮生理代谢的能量需求具有重要意义。(3)KEGG分析表明,碳代谢、生物固碳、磷酸戊糖、氨基酸生物合成等代谢通路在果皮着色的不同时期显著富集。(4)qRT-PCR分析显示,S–腺苷甲硫氨酸合成酶基因(VvMETK4)在果皮着色后期表达量最高。 展开更多
关键词 葡萄 果皮 蛋白质组 双向电泳
短密木霉降解咪唑乙烟酸候选基因的筛选 预览
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作者 刘晴 刘宇彤 +2 位作者 邓世林 鲍彤 董爱荣 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期63-70,共8页
为探明短密木霉(Trichoderma brevicom pactum)降解咪唑乙烟酸的分子机制,通过转录组学和蛋白质组学数据整合分析筛选降解咪唑乙烟酸的候选基因。结果显示:以500mg/kg咪唑乙烟酸驯化后的短密木霉为材料,分别在基础培养基和以咪唑乙烟酸... 为探明短密木霉(Trichoderma brevicom pactum)降解咪唑乙烟酸的分子机制,通过转录组学和蛋白质组学数据整合分析筛选降解咪唑乙烟酸的候选基因。结果显示:以500mg/kg咪唑乙烟酸驯化后的短密木霉为材料,分别在基础培养基和以咪唑乙烟酸为单一碳源的培养基中培养至降解效率最高的第7天,在转录组学中差异表达的基因1329个,其中上调703个,下调626个。用ITRAQ进行蛋白质组学分析,共鉴定到21883条肽段和4003个蛋白质。关联分析中,鉴定出24个在转录组和蛋白质组中均差异表达的基因,其中14个基因上调,10个基因下调。定量蛋白质和基因的表达关联系数为-0.0472,显著差异蛋白质和显著差异基因表达关联系数为-0.1420,蛋白质和表达变化趋势相同的基因关联系数为-0.7413,蛋白质和表达变化趋势相反的基因关联系数为-0.7916。关联分析鉴定的24个基因中,有2个基因具有功能注释,分别为TBU3981A(NCBInr:绿色木霉Gv29-8糖苷水解酶16家族部分mRNA)和TBU1425A(NCBInr:HEX-1),可作为降解咪唑乙烟酸的候选基因。 展开更多
关键词 短密木霉 咪唑乙烟酸 转录组 蛋白质组学 关联分析
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不同耐旱性甘薯柴根和块根的差异蛋白组分析 预览
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作者 汪宝卿 张海燕 +2 位作者 解备涛 段文学 张立明 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2133-2146,共14页
为从蛋白水平揭示不同耐旱性甘薯柴根和块根的差异,明确甘薯根系分化和耐旱性生理机制,以耐旱性强的济薯21(JS21)和耐旱性弱的济紫薯1(JZS1)为试验材料,在旱棚内人工控水模拟田间干旱,采用i TRAQ技术开展不同耐旱性甘薯柴根和块根的全... 为从蛋白水平揭示不同耐旱性甘薯柴根和块根的差异,明确甘薯根系分化和耐旱性生理机制,以耐旱性强的济薯21(JS21)和耐旱性弱的济紫薯1(JZS1)为试验材料,在旱棚内人工控水模拟田间干旱,采用i TRAQ技术开展不同耐旱性甘薯柴根和块根的全蛋白组差异蛋白分析。结果表明,共鉴定到甘薯根系差异蛋白2 003个,其中可信蛋白1 716个、动态表达蛋白819个。GO分析表明,干旱胁迫条件下,与柴根相比,JS21和JZS1块根差异蛋白分别集中于细胞质内碳水化合物合成、能量代谢等生物过程;与JZS1块根相比,JS21块根差异蛋白分子功能主要涉及过氧化物酶活性、氧化还原酶活性等。KEGG分析表明,木质素代谢在甘薯根系分化和响应干旱胁迫的过程中起到重要的调控作用。从淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷代谢途径富集的差异蛋白分析中探明,正常条件下,JS21主要通过ADPGase积累淀粉,JZS1不仅通过ADPGase还通过UDPGase积累淀粉;干旱胁迫条件下,JS21块根中淀粉的合成仍大于分解,而JZS1块根中蔗糖的分解大于合成。正常条件下,2个品种柴根中均含有丰富的抗氧化酶;但干旱诱导JS21块根产生过氧化物酶,导致JZS1块根中木质素合成关键酶上调表达。蔗糖合酶是干旱胁迫条件下耐旱性弱的JZS1根系中能量代谢重要蛋白。综上,干旱胁迫条件下,耐旱性强的JS21可通过柴根中已有的和块根中诱导产生的过氧化物酶协同抵御干旱胁迫,而耐旱性弱的JZS1则通过蔗糖合酶维持能量代谢,其块根木质化程度加剧。本研究为甘薯耐旱性品种生理鉴定和耐旱基因发掘提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 甘薯 干旱 柴根 块根 蛋白组学
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基于iTRAQ蛋白组学的植物乳杆菌镉吸附及耐受特征分析 预览
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作者 甘雨 肖越 +3 位作者 翟齐啸 赵建新 张灏 陈卫 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1-15,共15页
植物乳杆菌是在食品工业中广泛应用的一种益生菌,不同植物乳杆菌对重金属镉的吸附及耐受能力存在显著的菌株差异。为了探究植物乳杆菌的镉吸附机制,通过筛选得到两株镉吸附能力有显著差别的植物乳杆菌(强吸附菌株CCFM8610和弱吸附菌株CC... 植物乳杆菌是在食品工业中广泛应用的一种益生菌,不同植物乳杆菌对重金属镉的吸附及耐受能力存在显著的菌株差异。为了探究植物乳杆菌的镉吸附机制,通过筛选得到两株镉吸附能力有显著差别的植物乳杆菌(强吸附菌株CCFM8610和弱吸附菌株CCFM595),采用基于同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)方法的比较蛋白组学分析手段,研究两株菌间的差异表达蛋白。在两菌株中共鉴定得到1690个蛋白,其中有109个丰度差异表达蛋白,以及89个仅在强镉吸附菌株CCFM8610检测到的蛋白。通过对这些差异蛋白进行功能注释、代谢通路重构以及互作网络解析,阐明植物乳杆菌CCFM8610与CCFM595的镉吸附及耐受机制可能为:表达更多的参与细胞壁及胞外聚合物合成的蛋白,从而加强镉离子的隔离和吸附;CCFM8610一直处于低压力的状态,表现为压力应答相关蛋白在CCFM8610中低表达;CCFM8610具有独特的能量节省的代谢模式,表现为TCA循环通路蛋白的整体较低水平;CCFM8610具有更强的金属外排转运能力,表现为cadA等镉外排泵也在CCFM8610具有更高丰度;CCFM8610的疏水性氨基酸的表达增加,可增强细胞的表面疏水性,还能通过表达调节渗透压及胞内结合镉的氨基酸来应对镉毒性。 展开更多
关键词 吸附 蛋白组 植物乳杆菌
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斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究 预览
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作者 陈漪 胡瑞芹 +1 位作者 冉皓宇 陈良标 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期53-64,共12页
斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型... 斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用iTRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用iTRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。 展开更多
关键词 斑马鱼 早期胚胎发育 蛋白质组 ITRAQ
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高白鲑肌肉蛋白质组双向电泳技术体系的优化 预览
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作者 于亚文 朱新荣 张建 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第7期168-174,共7页
为建立高白鲑肌肉蛋白质双向电泳分析方法,通过固相pH梯度胶条等电聚焦和SDS-PAGE垂直电泳对蛋白质进行分离,分别考察了蛋白质样品制备方法、上样量、IPG胶条pH值、等电聚焦程序、助凝剂剂量、SDS-PAGE凝胶浓度及染色方法等影响的因素... 为建立高白鲑肌肉蛋白质双向电泳分析方法,通过固相pH梯度胶条等电聚焦和SDS-PAGE垂直电泳对蛋白质进行分离,分别考察了蛋白质样品制备方法、上样量、IPG胶条pH值、等电聚焦程序、助凝剂剂量、SDS-PAGE凝胶浓度及染色方法等影响的因素。结果显示,采用丙酮沉淀法制备蛋白质样品,上样量90μg,IPG胶条pH值5~8,一向胶聚焦时间400V16h+1000V2h,平衡时间15min,0.05mL过硫酸铵及2μLTEMED,10%(体积分数)二向分离胶和硝酸银染色时,获得蛋白质分离效果好,分辨率高及横纹少的高白鲑肌肉蛋白质二维电泳图谱,为高白鲑肌肉蛋白质组学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 高白鲑 肌肉蛋白质 双向电泳 蛋白质组学
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iTRAQ-based analysis of 17β-estradiol induced proteome in Chinese tongue sole Cynoglossus semilaevis 预览
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作者 ZHU Ying LI Yangzhen +12 位作者 LI Hailong WANG Lei ZHANG Ning LIU Yang MENG Liang XU Xiwen DONG Zhongdian WEI Min GUO Hua CUI Zhongkai LI Xihong SHAO Changwei XU Wenteng 《海洋湖沼学报(英文)》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期1659-1668,共10页
The phenomenon of sex dimorphism prevails among many fi sh species. It has attracted the general research interest due to its close relationship to fi sh growth and thus aquaculture productivity. In Chinese tongue sol... The phenomenon of sex dimorphism prevails among many fi sh species. It has attracted the general research interest due to its close relationship to fi sh growth and thus aquaculture productivity. In Chinese tongue sole ( Cynoglossus semilaevis ), 17β-estradiol (E2) can be used reportedly to induce the feminization of fi sh, although the detailed regulatory network remained elusive. We treated the tongue sole fry before sex diff erentiation with E2 (10 and 30 μg/L) to identify potential targets of E2 in Chinese tongue sole. The E2 treatment indeed induced genetic male fi sh sex-reversal to phenotypic female. Using an iTRAQ-based comparative proteomic analysis, 409 proteins that diff erentially expressed after E2 induction were identifi ed, including 259 up-regulated and 150 down-regulated proteins. Furthermore, 19 diff erentially expressed proteins identifi ed in the comparative proteomic analysis were selected to assess their transcription and eight of them exhibited the same tendency. Functions of the eight proteins included mainly nucleotide and protein binding. Interestingly, a far upstream element-binding protein 3-like isoform exhibited the signifi cant upregulation both at transcription and translation levels after E2 treatment. This work identifi ed a set of candidate proteins for E2 response and deepened our understanding of E2 regulatory mechanism. 展开更多
关键词 Cynoglossus SEMILAEVIS 17Β-ESTRADIOL sex reversal PROTEOME ITRAQ ANALYSIS
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应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析哈蟆油与伪品蛙油的差异蛋白质组
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作者 魏星华 王铭 +5 位作者 张玉尧 潘黛安 苏航 齐滨 张鹤 赵大庆 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第3期472-475,I0002共5页
采用iT RAQ结合2D LC-MS/MS技术对哈蟆油、青蛙油、蟾蜍油、牛蛙油的蛋白质组进行研究。采用Q Exactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所鉴定的蛋白质进行理化性质分析、层次聚类分析、Gene ontology(GO)功能注释和生物信息学分析。结... 采用iT RAQ结合2D LC-MS/MS技术对哈蟆油、青蛙油、蟾蜍油、牛蛙油的蛋白质组进行研究。采用Q Exactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所鉴定的蛋白质进行理化性质分析、层次聚类分析、Gene ontology(GO)功能注释和生物信息学分析。结果共获得2286个肽段,鉴定到1220个蛋白质,其中1212个蛋白质具有定量信息。鉴定得到的蛋白质分子量主要分布在4. 1~36. 9 kD a,占82. 79%,等电点主要分布在4. 41~9. 89,占94. 84%。对比青蛙油、蟾蜍油和牛蛙油与哈蟆油蛋白质数据库,筛选得到8个差异蛋白(比值> 1. 2或比值<0. 83,且P <0. 05),其中显著上调的蛋白质3个,显著下调的蛋白质5个。本结果在蛋白质组成上显示了哈蟆油与伪品蛙油的差异性,为进一步分析哈蟆油中蛋白质成分特点、功能奠定基础。 展开更多
关键词 哈蟆油 青蛙油 蟾蜍油 牛蛙油 ITRAQ 蛋白质组
Effects of Early Infection of Tobacco Mosaic Virus on Photosynthetic Proteins and Its Control 预览
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作者 Xiaojing XU Kunfeng SONG +3 位作者 Fengsheng HAO Jiajia ZHAO Hongxiang GUO Weiqun LIU 《农业生物技术:英文版》 CAS 2019年第2期5-9,共5页
[Objectives] This study was conducted to explore the optimal period of TMV control and the physiological sites that interfere with TMV infection.[Methods] Proteome analysis was performed on the host tissues (tobacco p... [Objectives] This study was conducted to explore the optimal period of TMV control and the physiological sites that interfere with TMV infection.[Methods] Proteome analysis was performed on the host tissues (tobacco plants) at different time periods of viral infection, to verify the changes in the expression of differential protein genes and N and PR1-a in the photosynthetic pathway and porphyrin metabolism and chlorophyll metabolism pathways in proteome;and the tobacco plants were treated with different preparations.[Results] The expression levels of N and PR1-a in the tobacco leaves treated with preparation B reached the highest level, and the effects on the expression levels of the differential protein genes were also the most significant. The control effects of the preparations were tested by the half-leaf method, and the results showed that preparation B had a significant control effect against the early infection of the virus.[Conclusions] This study lays a foundation for the prevention and control of tobacco mosaic virus on crops. 展开更多
关键词 TOBACCO MOSAIC virus PROTEOME PHOTOSYNTHETIC system CONTROL effect
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青稞分子生物学研究进展
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作者 张丽 陈志 +1 位作者 金兰 乔枫 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期3533-3541,共9页
青稞作为极端生态环境下进化的典型代表,其分子生物学方面的研究受到了广泛关注。本研究从四个方面综述了近年来有关青稞分子生物学方面的研究进展,包括青稞的遗传多样性分析、青稞的基因组和蛋白质组学研究、青稞次生代谢相关基因的分... 青稞作为极端生态环境下进化的典型代表,其分子生物学方面的研究受到了广泛关注。本研究从四个方面综述了近年来有关青稞分子生物学方面的研究进展,包括青稞的遗传多样性分析、青稞的基因组和蛋白质组学研究、青稞次生代谢相关基因的分析以及对青稞最主要的营养成分β-葡聚糖的分解和合成过程的探讨。最后讨论了目前青稞分子生物学研究的不足,并对未来研究工作应关注的方向进行了展望。 展开更多
关键词 青稞 遗传多样性 基因组 蛋白质组 次生代谢 Β-葡聚糖
瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析 被引量:1
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作者 史艳梅 黄笑含 +2 位作者 杨铁柱 许国绿 沈和定 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1463-1473,共11页
从蛋白质水平探讨瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异表达,为完善石磺科贝类从海洋到陆地进化的研究以及解释两种石磺不同的环境适应性提供蛋白质依据。应用Label-free非标定量蛋白质组学技术,结合软件Sequest HT和Proteome Disc... 从蛋白质水平探讨瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异表达,为完善石磺科贝类从海洋到陆地进化的研究以及解释两种石磺不同的环境适应性提供蛋白质依据。应用Label-free非标定量蛋白质组学技术,结合软件Sequest HT和Proteome Discoverer (Thermo),对瘤背石磺和里氏拟石磺的背部皮肤进行蛋白质组搜库鉴定及定量分析,其中瘤背石磺中鉴定到1 491个蛋白质,里氏拟石磺中鉴定到1 030个蛋白质;用Pfind软件对表达图谱进行同源序列的鉴定及定量分析,检测到928个同源蛋白表达量有差异,瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达406个(p<0.05, FC>1.5),下调表达339个(p<0.05, FC<0.5)。适应水下生活的里氏拟石磺背部皮肤角质化程度较低,差异同源蛋白序列分析显示与角质形成、细胞凋亡相关蛋白在里氏拟石磺背部皮肤中高表达,与皮肤保湿性能相关的神经酰胺类物质在瘤背石磺中高表达;KEGG分析显示,嘌呤代谢通路中存在的差异蛋白最多,共73个,其中瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达22个,下调表达21个。蛋白组差异分析显示关键酶尿素酶在陆栖性较强的瘤背石磺中高表达,与前人所做动物从水生到陆生进化过程中尿素酶基因完全丢失的研究结论有所出入,属于特殊物种。里氏拟石磺的皮肤辅助呼吸能力和血窦数目均高于瘤背石磺,且背部皮肤中肌纤维更加粗壮,此生理现象在蛋白质组上的表现为两种石磺能量代谢及氧离子运输相关蛋白的差别较大;瘤背石磺背部皮肤中对环境污染反应灵敏的谷胱甘肽S转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶的表达量高于里氏拟石磺,推测其与瘤背石磺较强的皮肤免疫能力和环境适应性相关。蛋白表达谱中928个差异表达同源序列为两种石磺表现差异和环境适应的分子机制研究提供了有意义的蛋白质组的基础数据。 展开更多
关键词 瘤背石磺 里氏拟石磺 蛋白质组 两栖性适应
挥发性抑芽物质对马铃薯块茎萌芽的影响及其作用机制 预览
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作者 邹雪 丁凡 +7 位作者 余金龙 彭洁 邓孟胜 王宇 刘丽芳 余韩开宗 陈年伟 王西瑶 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期235-247,共13页
马铃薯块茎过早萌芽会降低商品价值,本试验比较挥发性物质的抑芽效应,并从转录和蛋白水平分析其作用机制。结果表明,抑芽能力薄荷醇>樟脑>萘,萌芽受抑降低代谢消耗,薄荷醇处理180 d时的重量损失只有对照损失的36%。樟脑处理萌芽块... 马铃薯块茎过早萌芽会降低商品价值,本试验比较挥发性物质的抑芽效应,并从转录和蛋白水平分析其作用机制。结果表明,抑芽能力薄荷醇>樟脑>萘,萌芽受抑降低代谢消耗,薄荷醇处理180 d时的重量损失只有对照损失的36%。樟脑处理萌芽块茎3 d引起表达显著上调(或下调)的基因和蛋白分别有1227 (299)和296 (204)个,主要参与响应刺激、防御反应。贮藏期间,果胶代谢基因PEL、PME、PG,角质合成基因CYP77A6、HPFT、WES,乙烯合成基因ACO以及转录因子编码基因GATA4L的表达量随时间升高。樟脑早期不同程度地刺激这些基因表达,中后期则抑制,49d时只有对照的0.68%~23.35%。薄荷醇使上述基因表达保持低水平,但可提高细胞周期负控基因KRP4的表达,为对照的15.9倍。植物病原菌互作通路中的基因WRKY75、STH-2、RBOH表达受樟脑诱导并在后期高表达。樟脑和薄荷醇均能抑制生长发育基因的表达,造成芽死亡,降低贮藏损耗。前者早期能促进合成保护性物质,萌芽时有更强烈的抗菌反应;后者则阻碍细胞分裂。 展开更多
关键词 马铃薯 贮藏 抑芽物质 转录组 蛋白组
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高氧气调包装贮藏牛排肉色稳定性的蛋白质组学 预览
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作者 杨啸吟 张一敏 +3 位作者 朱立贤 毛衍伟 董鹏程 罗欣 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期231-237,共7页
为进一步了解高氧气调包装牛排贮藏过程中肉色稳定性变化的机理,本研究比较了腰背最长肌牛排在各贮藏时间点(0、5、10、15d)的肉色指标变化以及蛋白质组学变化。结果发现高氧气调包装牛排的肉色稳定性随贮藏时间延长不断降低,这可能是... 为进一步了解高氧气调包装牛排贮藏过程中肉色稳定性变化的机理,本研究比较了腰背最长肌牛排在各贮藏时间点(0、5、10、15d)的肉色指标变化以及蛋白质组学变化。结果发现高氧气调包装牛排的肉色稳定性随贮藏时间延长不断降低,这可能是贮藏期间牛排的高铁肌红蛋白还原能力和氧气消耗率显著下降所致;通过蛋白质组学分析,共发现了20个在贮藏过程中发生显著变化的差异蛋白,其中有15个蛋白与肉色密切相关,它们主要是一些参与糖酵解和能量代谢的酶类(丙酮酸激酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶、果糖-二磷酸醛缩酶、果糖-1,6-二磷酸酶同工酶2、苹果酸脱氢酶和黄素还原酶),这些代谢酶的表达量随贮藏时间延长发生了不同程度的下调,减少了烟酰胺腺嘌呤二核苷酸和还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸的产生,进而降低了肉色稳定性;另外,高氧气调包装贮藏过程中肉色稳定性的降低可能也与肌红蛋白的表达量下调有关;高氧环境还可能会促使抗氧化蛋白2、热休克蛋白以及DJ-1蛋白的表达量上调以抵御肉品的氧化应激反应,这些蛋白也都与肉色指标紧密相关。这些发现表明贮藏期间高氧气调包装对牛排蛋白质组的影响将直接决定其肉色稳定性的变化。 展开更多
关键词 肉色 高氧气调包装 贮藏过程 蛋白质组学
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Proteomic analysis reveals the differential proteins of endosperm between soft and hard wheat varieties 预览
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作者 Feng Jia Haicheng Yin +2 位作者 Qi Wang Yu Chen Jinshui Wang 《粮油科技:英文版》 2019年第2期27-32,共6页
In this study,we revealed the differential proteins from the wheat endosperms using proteomic analysis and investigated their surface properties.The pattern of the polypeptides obtained from the Yangmai-15 and Yangmai... In this study,we revealed the differential proteins from the wheat endosperms using proteomic analysis and investigated their surface properties.The pattern of the polypeptides obtained from the Yangmai-15 and Yangmai-16 wheat varieties were compared using two-dimensional polyacrylamide gels.In addition,we compared the characteristics of the grain such as grain hardness,protein content,wet gluten,dough development time,dough stability,gliadin and glutenin contents between Yangmai-15 and Yangmai-16,and the results were significantly different.Notably,216 and 197 protein spots were separated from Yangmai-15 and Yangmai-16,respectively.The isoelectric points of the identified proteins ranged from 4 to 10 and the molecular weights of proteins varied from 10 to 100 kDa.Further,21 and 8 specific differential protein spots were identified fromthe flour of Yangmai-15 and Yangmai-16,respectively.The surface properties of identified peptides consisted of hydrophobic or hydrophilic residues,as well as randomly scattered residues.The proteomic analysis of the wheat endosperms provides a novel insight into the biochemical basis for the differences in physicochemical properties between the soft and hard wheat varieties. 展开更多
关键词 SOFT and HARD wheat PROTEOME PEPTIDES surfaces ENDOSPERM proteins
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基于Label-free技术分析牛卵泡蛋白质组分及关键调控蛋白 预览
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作者 郝庆玲 景炅婕 +5 位作者 侯淑宁 许冬梅 赵成萍 朱芷葳 吕丽华 李鹏飞 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期983-992,共10页
旨在研究牛卵泡发育过程中蛋白质组表达变化并筛选卵泡发育关键调控蛋白,利用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术对牛卵泡颗粒细胞(granulesa cells,GCs)蛋白质组分进行比较分析。采集牛发情周期优势卵泡(dominant follicles,DF)和... 旨在研究牛卵泡发育过程中蛋白质组表达变化并筛选卵泡发育关键调控蛋白,利用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术对牛卵泡颗粒细胞(granulesa cells,GCs)蛋白质组分进行比较分析。采集牛发情周期优势卵泡(dominant follicles,DF)和从属卵泡(subordinate follicles,SF),分别分离GCs,并提取总蛋白,胰蛋白酶酶解,液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行蛋白质组分分析,数据库检索分析DF和SF中蛋白质表达情况,并应用生物信息学方法筛选牛卵泡发育关键调控蛋白。结果表明:本试验从30321个肽段中共成功鉴定出3409种蛋白质(FDR≤0.01),其中,DF中表达2895种蛋白质,SF中表达3102种蛋白质,获得差异表达蛋白质(差异倍数>2,P<0.05)259种,17种差异表达蛋白质可能与牛卵泡优势化过程相关,SERPINB2可能调控牛卵泡闭锁。该研究筛选获得的牛卵泡差异表达蛋白质和特异表达蛋白质,丰富了牛卵泡发育调控理论,为进一步研究卵泡闭锁及优势化奠定基础。 展开更多
关键词 优势卵泡 从属卵泡 LABEL-FREE 蛋白质组
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棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)蛋白质组学及相关肿瘤发生的研究 预览
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作者 郑梦湄 《汉江师范学院学报》 2019年第3期43-49,共7页
棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)是由ShopeRE.在1933发现的首个哺乳动物DNA肿瘤病毒.CRPV感染会引起棉尾兔头颈部腺瘤,使之成为欧美传说“勇士兔”的原型.本篇综述讨论了CRPV的蛋白质组学,以及相关蛋白在肿瘤发生中的作用.CRPV属于乳头瘤病毒家... 棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)是由ShopeRE.在1933发现的首个哺乳动物DNA肿瘤病毒.CRPV感染会引起棉尾兔头颈部腺瘤,使之成为欧美传说“勇士兔”的原型.本篇综述讨论了CRPV的蛋白质组学,以及相关蛋白在肿瘤发生中的作用.CRPV属于乳头瘤病毒家族,与人类乳头瘤病毒(HPV)存在同源性.CRPV不具封套,由7868个碱基对形成环状双股脱氧核糖核酸,并由衣壳包裹.蛋白质组由非结构性早期调节蛋白和结构性后期蛋白组成,其中早期调节蛋白E7和E2在肿瘤形成和发展中起到关键作用.由于其与HPV的同源性,CRPV在研究乳头瘤病毒感染以及病毒相关的肿瘤学中有广泛应用. 展开更多
关键词 棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV) 蛋白质组 肿瘤发生
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Comparative proteomic analysis of olfactory rosettes in anadromous Coilia nasus and resident Coilia nasus 预览
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作者 ZHENG Li TANG Wen-Qiao +1 位作者 ZHANG Ya GUO Hongyi 《海洋湖沼学报(英文)》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期1324-1332,共9页
The Japanese grenadier anchovy (Coilia nasus) undergoes upstream migration to spawning annually but can also be observed in freshwater resident populations. It has been hypothesized that anadromous adult C. nasus may ... The Japanese grenadier anchovy (Coilia nasus) undergoes upstream migration to spawning annually but can also be observed in freshwater resident populations. It has been hypothesized that anadromous adult C. nasus may utilize olfactory cues to locate spawning grounds. We firstly performed a comparative proteome analysis about olfactory rosettes in two populations to hunt for the proteomic changes. Among 5 408 identified proteins, 1 515 proteins (629 up-regulated and 886 down-regulated) were differentially expressed. Especially, several proteins and pathways associated with olfactory signaling were found to be significantly differential. Compared with resident C. nasus, the expressions of Golf protein and the sodium/calcium exchanger were significantly up-regulated in anadromous C. nasus. The expression of adenylate cyclase and regulator of G-protein signaling (RGS) were decreased. Our findings suggest a decrease in the expression of cGMP-dependent protein kinase (PKG) in anadromous C. nasus compared to resident C. nasus. The expression of Calmodulin (CaM) was increased and CaM-dependent protein kinase Ⅱ(CaMKⅡ) was decreased. In addition, KEGG pathway enrichment analysis of up-regulated proteins indicated statistically significant difference not only in olfactory transduction but also in the cGMP-PKG signal pathway. Furtherly, we sought out some proteins expressed in the same trend occurring in DEGs (differentially expressed genes) and DEPs (differentially expressed proteins) by doing the integrative analysis of proteome and transcriptome in olfactory rosettes of C. nasus. 展开更多
关键词 Coilia nasus OLFACTION SPAWNING migration PROTEOME
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水稻产量基因网络的初步研究 预览
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作者 王松文 程萌杰 +5 位作者 施利利 孙宁 张欣 丁得亮 崔晶 边嘉宾 《海南师范大学学报:自然科学版》 CAS 2019年第2期163-169,共7页
产量是作物育种的首要目标。采用多个品种、多个对照品种对其蛋白质组学进行了解析,iTRAQ分析表明,水稻叶片和幼穗中有数万个功能蛋白表达,按照表达强度和产量的关联程度,鉴定了33个对产量有重要贡献的蛋白质,其中淀粉合成酶、种子储藏... 产量是作物育种的首要目标。采用多个品种、多个对照品种对其蛋白质组学进行了解析,iTRAQ分析表明,水稻叶片和幼穗中有数万个功能蛋白表达,按照表达强度和产量的关联程度,鉴定了33个对产量有重要贡献的蛋白质,其中淀粉合成酶、种子储藏蛋白是产量构成的重要成分,采用酶活性、产量形成对糖苷合成酶及其基因调控网络进行了验证,对重要农艺性状基因克隆、基因网络重构等进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 产量 蛋白质组 基因网络
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水牛睾丸曲精细管蛋白质组双向电泳方法的建立及优化
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作者 张鹏飞 黄愉淋 +5 位作者 耿双双 陈富美 付强 黄凤玲 陆阳清 张明 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1474-1479,共6页
建立并优化了沼泽型水牛睾丸曲精细管蛋白质分离的双向电泳体系,为后续水牛睾丸曲精细管蛋白质表达谱的鉴定和研究奠定基础。比较不同IPG胶条(线性与非线性)、胶条pH范围和蛋白质上样量这三个参数对双向电泳结果的影响。结果显示,采用... 建立并优化了沼泽型水牛睾丸曲精细管蛋白质分离的双向电泳体系,为后续水牛睾丸曲精细管蛋白质表达谱的鉴定和研究奠定基础。比较不同IPG胶条(线性与非线性)、胶条pH范围和蛋白质上样量这三个参数对双向电泳结果的影响。结果显示,采用上样量350μg的曲精细管总蛋白、24 cm且pH值4~7的线性IPG胶条能够更好地分离水牛睾丸曲精细管蛋白质,获得质量较好且分辨率较高的双向电泳图谱,得到大约486个蛋白点。双向凝胶电泳技术能够对水牛睾丸曲精细管蛋白质进行有效分离,并通过对双向电泳体系的优化可获得蛋白质点清晰且分辨率更高的双向电泳图谱。 展开更多
关键词 水牛 睾丸曲精细管 蛋白质组 双向电泳
Integrating transcriptomic and proteomic analyses of photoperiodsensitive in near isogenic maize line under long-day conditions 预览
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作者 SONG Xiao-heng TIAN Lei +6 位作者 WANG Shun-xi ZHOU Jin-long ZHANG Jun CHEN Zan WU Liu-ji KU Li-xia CHEN Yan-hui 《农业科学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期1211-1221,共11页
As a short-day plant species, maize requires an optimal photoperiod for inducing reproductive growth. However, there is a lack of information regarding photoperiod-induced changes in maize mRNA and protein levels. In ... As a short-day plant species, maize requires an optimal photoperiod for inducing reproductive growth. However, there is a lack of information regarding photoperiod-induced changes in maize mRNA and protein levels. In this study, a photoperiod-insensitive maize inbred line and its near isogenic photoperiod-sensitive line were used. By integrating RNAbased transcriptomic and iTRAQ LC-MS/MS-based proteomic approaches, we generated a comprehensive inventory of the transcripts and proteins with altered abundances in response to a long photoperiod(LP) during growth stage transitions. We detected 22 000 transcripts in RNA-sequence runs and 5 259 proteins from an iTRAQ-based analysis. A weak correlation between mRNA-and protein-level changes was observed, suggesting the LP-induced transition between maize growth stages is largely regulated post-transcriptionally. Differentially expressed genes influenced by LP conditions were associated with several regulatory processes in both maize inbred lines, especially phosphate ion transport and the circadian rhythm. Additionally, 31 transcripts and six proteins related to photoperiodic flowering in maize were identified by comparing transcriptomic and proteomic data. This transcriptomic and proteomic analysis represents the first comprehensive and comparative study of gene/protein-level changes occurring in photoperiod-sensitive and-insensitive maize inbred lines during growth stage transitions under LP conditions. 展开更多
关键词 development transition long PHOTOPERIOD NEAR isogenic LINE PROTEOME transcriptome
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