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甘薯IbSSI基因启动子序列的克隆及瞬时表达分析
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作者 王雁楠 杨育峰 +6 位作者 杨国红 张莉 陈献功 徐心志 刘庆昌 翟红 何绍贞 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期6604-6610,共7页
植物可溶性淀粉合成酶(soluble starch synthase, SS)在植物支链淀粉的合成中起着关键作用,其主要负责支链的延伸。前期我们从甘薯中克隆到IbSSI基因并对其进行了表达分析及功能验证,发现该基因在甘薯中的表达受到外源蔗糖的诱导以及昼... 植物可溶性淀粉合成酶(soluble starch synthase, SS)在植物支链淀粉的合成中起着关键作用,其主要负责支链的延伸。前期我们从甘薯中克隆到IbSSI基因并对其进行了表达分析及功能验证,发现该基因在甘薯中的表达受到外源蔗糖的诱导以及昼夜节律的调控。本研究在此基础上利用染色体步移法克隆到IbSSI基因1 811 bp的启动子序列。PlantCARE在线分析表明IbSSI启动子序列富含TATA-box和CAAT-box两个基本元件,还含有与昼夜节律、光照、蔗糖、逆境响应及组织特异表达等相关的顺式作用元件。将IbSSI基因全长启动子及其6个启动子5’端缺失片段分别替换植物表达载体pBI121的CaMV 35S启动子并在本生烟草(Nicotiana benthamiana)叶片中进行瞬时表达。GUS染色结果表明不同长度片段的启动子驱动β-葡萄糖醛酸酶基因(GUS)表达的能力有所差异,其中-200 bp~-369 bp区段以及-1 015 bp~-1 304 bp区段可能存在着增强转录的重要顺式作用元件。本研究揭示了IbSSI基因受外源蔗糖诱导表达及昼夜节律调控的原因,并为进一步阐明IbSSI基因在甘薯淀粉生物合成中的作用提供了科学依据。 展开更多
关键词 甘薯(Ipomoea BATATAS (L.) Lam.) IbSSI基因 启动子 顺式作用元件 瞬时表达
In silico Analysis of osr40c1 Promoter Sequence Isolated from Indica Variety Pokkali 预览
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作者 W.S.I.deSILVA M.M.N.PERERA +2 位作者 K.L.N.S.PERERA A.M.WICKRAMASURIYA G.A.U.JAYASEKERA 《水稻科学:英文版》 CSCD 2017年第4期228-234,共7页
The promoter region of a drought and abscisic acid(ABA) inducible gene, osr40c1, was isolated from a salt-tolerant indica rice variety Pokkali, which is 670 bp upstream of the putative translation start codon. In sili... The promoter region of a drought and abscisic acid(ABA) inducible gene, osr40c1, was isolated from a salt-tolerant indica rice variety Pokkali, which is 670 bp upstream of the putative translation start codon. In silico promoter analysis of resulted sequence showed that at least 15 types of putative motifs were distributed within the sequence, including two types of common promoter elements, TATA and CAAT boxes. Additionally, several putative cis-acing regulatory elements which may be involved in regulation of osr40c1 expression under different conditions were found in the 5′-upstream region of osr40c1. These are ABA-responsive element, light-responsive elements(ATCT-motif, Box I, G-box, GT1-motif, Gap-box and Sp1), myeloblastosis oncogene response element(CCAAT-box), auxin responsive element(TGA-element), gibberellin-responsive element(GARE-motif) and fungal-elicitor responsive elements(Box E and Box-W1). A putative regulatory element, required for endosperm-specific pattern of gene expression designated as Skn-1 motif, was also detected in the Pokkali osr40c1 promoter region. In conclusion, the bioinformatic analysis of osr40c1 promoter region isolated from indica rice variety Pokkali led to the identification of several important stress-responsive cisacting regulatory elements, and therefore, the isolated promoter sequence could be employed in rice genetic transformation to mediate expression of abiotic stress induced genes. 展开更多
关键词 启动子序列 计算机分析 籼稻品种 分离 顺式调控元件 CAAT盒 真菌诱导子 水稻品种
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青蒿非分泌型腺毛特异TPS7基因启动子的克隆及功能分析 预览
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作者 陈俏 付雪晴 +3 位作者 颜廷祥 石璞 郝小龙 唐克轩 《上海交通大学学报:农业科学版》 2016年第6期21-28,共8页
研究运用基因组步移法克隆了长度为1 167bp的青蒿启动子proTPS7,经生物信息学分析发现了proTPS7中的多个顺式调控元件。构建启动子与GUS融合载体,稳定转化青蒿并对转基因植株进行GUS染色实验,结果表明该启动子能驱动报告基因在非分泌型... 研究运用基因组步移法克隆了长度为1 167bp的青蒿启动子proTPS7,经生物信息学分析发现了proTPS7中的多个顺式调控元件。构建启动子与GUS融合载体,稳定转化青蒿并对转基因植株进行GUS染色实验,结果表明该启动子能驱动报告基因在非分泌型腺毛中的特异表达。对转基因青蒿喷洒甲基茉莉酸和脱落酸,3h后GUS基因表达水平有所上调,说明proTPS7能受到上述2种激素的诱导。 展开更多
关键词 青蒿 萜类合成酶 非分泌型腺毛 GUS染色 顺式调控元件
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Cis-acting regulatory elements: from random screening to quantitative design
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《中国电气与电子工程前沿:英文版》 CSCD 2015年第3期107-114,共8页
关键词 顺式调控元件 定量设计 筛选 定量预测模型 随机 调节元件 蛋白质表达 结合位点
藤稔葡萄花发育相关基因启动子的克隆及功能分析 预览 被引量:3
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作者 张睿 陶建敏 +1 位作者 蔡斌华 章镇 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 2011年第4期 17-23,共7页
采用基于热不对称交错式PCR的基因组步移法,从藤稔葡萄(Vitis vinifera×V.labrusca‘Fujiminori’)的基因组总DNA中扩增花发育相关基因FT、FLC、AP3和AG的启动子上游序列片段,并通过序列分析及PlantCARE在线预测对FT、FLC和AP3... 采用基于热不对称交错式PCR的基因组步移法,从藤稔葡萄(Vitis vinifera×V.labrusca‘Fujiminori’)的基因组总DNA中扩增花发育相关基因FT、FLC、AP3和AG的启动子上游序列片段,并通过序列分析及PlantCARE在线预测对FT、FLC和AP3启动子片段的序列及顺式调控作用元件和功能进行了分析。扩增结果表明:AG的第1轮扩增产物无明显条带,第2轮扩增产物条带弥散,不能用于序列分析及顺式调控作用元件和功能分析;FT、FLC和AP3基因2轮扩增产物均有特异条带,FT、FLC和AP3启动子序列的实际长度分别为1 470、1 698和1 061 bp,GenBank登录号分别为HM192806、HM192805和HM192804。PlantCARE在线预测结果表明:FT、FLC和AP3启动子片段中均含有TATA-box、CAAT-box等启动子的特异表达元件及光响应元件、真菌刺激响应元件、MYB结合位点等多个顺式调控作用元件,共同受真菌刺激、MYB和光等因素的调控;FT、FLC和AP3均可能在花的分生组织中表达,且FT和AP3还可能在胚乳中表达。根据研究结果推测:FT、FLC和AP3基因的启动子序列片段中均存在多种诱导响应元件,可能均为诱导型启动子。 展开更多
关键词 藤稔葡萄 花发育相关基因 启动子 克隆 序列分析 顺式调控作用元件
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水稻稻瘟病抗病基因Pi63顺式作用元件的载体构建 预览 被引量:1
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作者 梁华兵 王晓婉 +5 位作者 胡晓岚 赵峰 张成国 韩淑慧 姚富城 徐鑫 《中国农学通报》 2015年第30期220-224,共5页
水稻稻瘟病抗性基因Pi63具有良好的田间抗性,且抗性与其表达量成正相关,但Pi63表达的调控机制尚未得到研究。为了研究Pi63的抗性机理,通过对Pi63启动子区域顺式作用元件的生物信息学分析,分段构建了4个含有不同顺式作用元件的缺失体,将... 水稻稻瘟病抗性基因Pi63具有良好的田间抗性,且抗性与其表达量成正相关,但Pi63表达的调控机制尚未得到研究。为了研究Pi63的抗性机理,通过对Pi63启动子区域顺式作用元件的生物信息学分析,分段构建了4个含有不同顺式作用元件的缺失体,将上述缺失体转入植物双元表达载体pCAMBIA1391Z中。菌落PCR以及质粒DNA酶切鉴定后,经测序进一步确认。结果表明:以上4个缺失体载体构建成功。本研究为进一步研究启动子中不同顺式作用元件对于Pi63基因稻瘟病抗性的影响以及Pi63基因的表达特性奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 Pi63基因 顺式作用元件 载体构建
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