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功能基因组学在非综合征型唇腭裂遗传结果功能研究中的应用
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作者 刘欢 《口腔医学研究》 北大核心 2018年第12期1265-1270,共6页
唇腭裂是口腔常见的先天性颅颌面缺损,部分患儿的发病与遗传背景有关。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)等研究揭示了多个与该疾病相关的易感基因位点在基因组非编码DNA区域,由于我们对于这些非编码DNA在人唇腭发... 唇腭裂是口腔常见的先天性颅颌面缺损,部分患儿的发病与遗传背景有关。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)等研究揭示了多个与该疾病相关的易感基因位点在基因组非编码DNA区域,由于我们对于这些非编码DNA在人唇腭发育过程中的功能缺乏了解,因此对有效的易感基因位点进行系统化生物学验证成为唇腭裂遗传学结果向临床转化中的难点。本文通过对人及小鼠颅颌面发育组织特异性功能基因组结果及机器学习可能的应用方式进行系统阐述,初步建立唇腭裂相关非编码DNA突变功能研究的完整体系。 展开更多
关键词 非综合征型唇腭裂 功能基因组 机器学习
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水稻分子设计育种发展与展望
2
作者 余泓 王冰 +2 位作者 陈明江 刘贵富 李家洋 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第10期1032-1037,共6页
中国是一个人多地少的大国,农业生产是永恒的主题。育种技术的发展与良种选育为保证粮食产量和安全做出了巨大贡献。近年来,随着主要作物全基因组测序的完成与功能基因组学的发展,一种新的育种理念——分子设计育种在世界范围内逐渐兴... 中国是一个人多地少的大国,农业生产是永恒的主题。育种技术的发展与良种选育为保证粮食产量和安全做出了巨大贡献。近年来,随着主要作物全基因组测序的完成与功能基因组学的发展,一种新的育种理念——分子设计育种在世界范围内逐渐兴起。我国科学家率先践行了分子设计育种理念,将在水稻功能基因组学上所获得的科学知识应用于生产实践,为解决水稻产量与品质互相制约的难题提供了有效策略。分子设计育种技术的全面推广,对于保障粮食安全、实现农业可持续发展具有重要意义。 展开更多
关键词 分子设计育种 水稻 功能基因组
植物突变体库的作用及构建研究进展
3
作者 高志勇 谢恒星 +1 位作者 王志平 刘史力 《作物杂志》 CAS 北大核心 2016年第6期16-19,共4页
发生突变的个体叫作突变体。突变体往往具有与野生型不同的表型,这样就为缺失组分的功能研究提供了有益的信息。主要介绍了植物突变体库的作用及构建方法,重点论述了自发突变体库、理化诱变突变体库及T-DNA插入突变体库的构建原理与特征... 发生突变的个体叫作突变体。突变体往往具有与野生型不同的表型,这样就为缺失组分的功能研究提供了有益的信息。主要介绍了植物突变体库的作用及构建方法,重点论述了自发突变体库、理化诱变突变体库及T-DNA插入突变体库的构建原理与特征,并对植物突变体库的研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 植物 突变体库 功能基因组 构建
酿酒酵母乙酸耐性分子机制的功能基因组进展 被引量:8
4
作者 赵心清 张明明 +2 位作者 徐桂红 许建韧 白凤武 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期368-380,共13页
提高工业酿酒酵母对高浓度代谢产物及原料中的毒性底物等环境胁迫因素的耐受性,对提高工业生产效率具有重要的意义。乙酸是纤维素原料水解产生的主要毒性副产物之一,其对酵母细胞的生长和代谢都具有较强的抑制作用,因此,对酿酒酵母... 提高工业酿酒酵母对高浓度代谢产物及原料中的毒性底物等环境胁迫因素的耐受性,对提高工业生产效率具有重要的意义。乙酸是纤维素原料水解产生的主要毒性副产物之一,其对酵母细胞的生长和代谢都具有较强的抑制作用,因此,对酿酒酵母乙酸耐性分子机制的研究可为选育优良菌种提供理论依据。近年来,通过细胞全局基因表达分析和代谢组分析,以及对单基因敲除的所有突变体的表型组研究,对酿酒酵母乙酸耐性的分子机制有了更多新的认识,揭示了很多新的与乙酸毒性适应性反应和乙酸耐性提高相关的基因。综述了近年来酿酒酵母乙酸耐性的基因组规模的研究进展,以及在此基础上构建乙酸耐性提高的工业酵母菌的代谢工程操作。结合本课题组的研究,对金属离子锌在酿酒酵母乙酸耐性中的作用进行了深入分析。未来对酿酒酵母乙酸耐性分子机理的认识及改造将深入到翻译后修饰和合成生物学等新的水平,所获得的认知,将为选育可高效进行纤维素原料生物转化、高效生产生物燃料和生物基化学品的工业酿酒酵母的菌株奠定理论基础。 展开更多
关键词 酿酒酵母 乙酸耐性 燃料乙醇 分子机制 功能基因组
Development of Studies on RNA Interference 预览
5
作者 Li ZHANG Yaqiong ZHANG +5 位作者 Lina SHE Wenting XU Yangying JIA Shiqing XIE WenliSUN Quan LIANG 《农业科学与技术:英文版》 CAS 2012年第9期1838-1842,共5页
关键词 RNA干扰技术 研究开发 后基因组时代 DSRNA 双链RNA 基础生物学 植物学 RNAi
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基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用 预览 被引量:2
6
作者 张振乾 谭太龙 +1 位作者 肖钢 官春云 《基因组学与应用生物学》 CAS 北大核心 2009年第6期1204-1210,共7页
基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录... 基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录本信息;对已知或未知基因表达进行定性和定量分析。目前,虽然在疾病、发育、细胞凋亡、药物筛选等多个领域已有利用SAGE方法进行的研究,但该方法在植物功能基因组研究中的应用相对较少。本文主要综述了该方法在RNA用量、PCR循环次数、SAGE效能和可靠性、标签长度和未知标签分析等方面的改进及其在植物中构建SAGE文库、筛选新基因、基因表达图谱分析等方面的应用,从而为其在植物功能基因组研究中的进一步应用提供理论参考。 展开更多
关键词 基因系列分析方法(SAGE) 功能基因组 基因表达图谱分析
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分子遗传技术在家畜遗传评定中的应用 预览
7
作者 狄江 王琼 拉扎提 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第7期 112-116,共5页
基于表型信息和谱系信息估计基因加性效应值的种畜遗传评定方法在家畜遗传改良中发挥了很大作用,但因其无法真正了解控制经济性状的遗传本质,影响了家畜遗传改良的进一步进展。分子标记辅助选择可在一定程度上提高种畜遗传评定准确性,... 基于表型信息和谱系信息估计基因加性效应值的种畜遗传评定方法在家畜遗传改良中发挥了很大作用,但因其无法真正了解控制经济性状的遗传本质,影响了家畜遗传改良的进一步进展。分子标记辅助选择可在一定程度上提高种畜遗传评定准确性,但在目前不能精确定位QTL或基因时,其效率受到很大影响。提高种畜遗传评定准确性的最有效途径应是直接利用控制经济性状的基因,后基因组时代的功能基因组研究的快速发展为实现这一目标提供了契机。同时,多个家畜品种基因组测序完成和大量SNP多态性的发现,使得利用覆盖全基因组多态性标记信息的基因组选择方法为家畜遗传评定开拓了又一条途径。 展开更多
关键词 分子遗传技术 MAS 功能基因组 基因组选择 遗传评定
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水稻T-DNA插入突变技术研究 预览 被引量:2
8
作者 吕亚慈 《衡水学院学报》 2009年第1期 45-47,共3页
随着水稻基因组全序列的测定完成,功能基因组学已成为重点研究内容.农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展起来的一种有效的分子生物学技术.它具有程序简便,转化效率高,大规模转化等特点.阐述了T-DNA标签法及其改进后的激活标签技术... 随着水稻基因组全序列的测定完成,功能基因组学已成为重点研究内容.农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展起来的一种有效的分子生物学技术.它具有程序简便,转化效率高,大规模转化等特点.阐述了T-DNA标签法及其改进后的激活标签技术和增强子技术的特点,并介绍了T-DNA插入突变在水稻突变体库的建立中所取得的研究进展,从而表明T-DNA插入突变技术是水稻功能基因组研究的一个有效途径. 展开更多
关键词 水稻 T-DNA标签 激活标签技术 捕获标签技术 功能基因组
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扩增T-DNA插入位点侧翼序列的方法及其应用进展 预览 被引量:6
9
作者 祁洋 李燕 +1 位作者 王永智 尉亚辉 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第17期 7907-7908,7927,共3页
T-DNA作为转化载体在植物分子生物学研究中得到广泛的应用。T-DNA插入位点侧翼序列的扩增方法有许多,常用的主要有热不对称交错PCR法(TAIL—PCR)、反向PCR法(I—PCR)和质粒挽救法(plasmid rescue)。笔者综述了这些方法的原理、... T-DNA作为转化载体在植物分子生物学研究中得到广泛的应用。T-DNA插入位点侧翼序列的扩增方法有许多,常用的主要有热不对称交错PCR法(TAIL—PCR)、反向PCR法(I—PCR)和质粒挽救法(plasmid rescue)。笔者综述了这些方法的原理、优缺点和应用,为以T-DNA建立突变库研究植物功能基因组学提供新的途径。 展开更多
关键词 T-DNA 侧翼序列 功能基因组
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花生EST研究进展 预览
10
作者 谢纯政 梁炫强 +1 位作者 李玲 刘海燕 《广东农业科学》 CAS 2008年第S1期39-42,共4页
EST技术是一种快速有效揭示基因组容量的方法,已成为基因发现、基因表达及重组蛋白表达等研究的强有力的分子生物学工具。花生是世界主要油料作物,花生基因组大而复杂,功能基因组的研究较晚,但发展迅速。概述了花生EST研究及其在花生... EST技术是一种快速有效揭示基因组容量的方法,已成为基因发现、基因表达及重组蛋白表达等研究的强有力的分子生物学工具。花生是世界主要油料作物,花生基因组大而复杂,功能基因组的研究较晚,但发展迅速。概述了花生EST研究及其在花生功能基因组研究中的应用进展。 展开更多
关键词 花生 表达序列标签(EST) 功能基因组
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谷子(Setaria italica)分子遗传研究进展 预览 被引量:9
11
作者 李国营 朱志华 李为喜 《植物遗传资源学报》 CAS 2008年第4期 556-560,共5页
近年来不断发展和完善的生物技术为谷子的研究开辟了新的思路,且提供了新的手段。本文概述了谷子在分子标记、遗传图谱的构建、基因定位、功能蛋白基因的克隆、转基因技术等方面的研究进展,提出了谷子分子遗传研究中存在的问题,并对... 近年来不断发展和完善的生物技术为谷子的研究开辟了新的思路,且提供了新的手段。本文概述了谷子在分子标记、遗传图谱的构建、基因定位、功能蛋白基因的克隆、转基因技术等方面的研究进展,提出了谷子分子遗传研究中存在的问题,并对今后的发展趋势作了初步探讨。 展开更多
关键词 谷子 分子标记 基因定位 功能基因纽
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RNA干扰研究进展 预览
12
作者 高建勇 王兴龙 《吉林畜牧兽医》 2007年第2期 9-12,共4页
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)引发的转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing,PTGS),它是沉默基因表达的一个十分有效的手段。目前,RNAi的作用机制已经基本明确... RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)引发的转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing,PTGS),它是沉默基因表达的一个十分有效的手段。目前,RNAi的作用机制已经基本明确,并显示出广阔的应用前景。本文对RNA干扰的分子机制、和RNA干扰技术的优势以及在功能基因组、抗病毒治疗、肿瘤治疗等方面的应用做一综述。 展开更多
关键词 RNA干扰 功能基因组 抗病毒治疗 肿瘤治疗
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真菌遗传转化系统的研究进展 预览 被引量:12
13
作者 黄亚丽 叶婧 +1 位作者 蒋细良 朱昌雄 《微生物学通报》 CAS 北大核心 2007年第6期 1213-1217,共5页
真菌遗传转化是功能基因研究的重要方法,就真菌遗传转化系统的最新研究进展进行了综述,主要包括真菌遗传转化的方法、各种方法的优缺点、选择标记的种类、标记基因的分离方法以及转化系统的应用等。
关键词 真菌 转化系统 选择性标记 功能基因组
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棉花纤维品质功能基因组学研究与分子改良研究进展 被引量:11
14
作者 喻树迅 《中国基础科学》 2007年第4期 18-21,共4页
本项目基于基因组学、功能基因组学、蛋白质组学和生物信息学等多学科交叉研究了棉花纤维品质发育的分子机制:利用辐射诱变、杂交、回交、系谱选择等技术培育、挖掘出优异纤维资源384份;利用徐州142棉纤维无长绒、无短绒突变体筛选出纤... 本项目基于基因组学、功能基因组学、蛋白质组学和生物信息学等多学科交叉研究了棉花纤维品质发育的分子机制:利用辐射诱变、杂交、回交、系谱选择等技术培育、挖掘出优异纤维资源384份;利用徐州142棉纤维无长绒、无短绒突变体筛选出纤维伸长相关基因;用体外培养方法验证了乙烯、油菜素(BR)的生物合成途径及部分次生物质在纤维生长过程中的作用;构建了海岛棉品种Pima90-53和陆地棉7235的BAC文库;利用蛋白质组学研究了棉纤维发育过程中的一些重要蛋白质的变化,构建了棉纤维细胞蛋白质表达谱;利用抑制扣除杂交方法、基因芯片技术或从纤维cDNA文库中筛选等共获得棉纤维发育相关基因199个,并用模式系统和棉花对基因的功能进行了分析和验证;建立了高效农杆菌介导、花粉管通道、基因枪轰击3种规模化的快速基因功能验证技术体系;开发了新标记,构建了陆海、陆陆高密度分子标记遗传连锁图谱,并选择有用分子标记和生化辅助育种相结合,初步建立了棉花纤维品质分子改良育种体系. 展开更多
关键词 棉花 纤维品质 功能基因组 分子改良 进展
RNAi在植物功能基因组中的应用 预览 被引量:4
15
作者 刁文一 蒋建雄 +3 位作者 熊兴华 张炎 彭昕琴 张志刚 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第2期 81-83,共3页
植物生物学后基因组时代的主要目标就是确定植物基因组中所有基因所具有的功能。解决这个问题的一个最直接的方法就是还原或者敲除某个在正常条件下其功能能表达出一定的可观察到的表型的特殊基因。对于这方面的研究,插入突变技术就是... 植物生物学后基因组时代的主要目标就是确定植物基因组中所有基因所具有的功能。解决这个问题的一个最直接的方法就是还原或者敲除某个在正常条件下其功能能表达出一定的可观察到的表型的特殊基因。对于这方面的研究,插入突变技术就是一个可用的工具,但是基因的随机性,致死敲除,无标记的突变体都大大地限制了这种技术的利用。RNm技术可以克服以上那些难题。它已经被广泛地应用在线虫的功能基因组上,并且所获得的有效资源还被广泛地用于植物功能基因组的分析。 展开更多
关键词 RNAI 转录后基因沉默 功能基因组
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非编码RNA——功能基因组研究的新热点 预览 被引量:4
16
作者 杨琳 柯杨 《北京大学学报:医学版》 CAS 北大核心 2006年第4期 444-446,共3页
多年来,研究者们对人类基因组的关注主要集中在编码蛋白质的基因和蛋白质本身。随着人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累,揭示出人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质,而超过97%的转录产物是功... 多年来,研究者们对人类基因组的关注主要集中在编码蛋白质的基因和蛋白质本身。随着人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累,揭示出人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质,而超过97%的转录产物是功能多样的RNA分子,即非编码RNA(non—coding RNA,ncRNA)。ncRNA是转录组的一个主要组成部分,其功能复杂多样,大大扩展了人们对基因转录调控复杂性的认识,回答了人们对基因组中非编码序列存在意义的部分困惑。这个领域的研究日益成为功能基因组研究的新焦点。 展开更多
关键词 RNA 肿瘤 基因组 综述文献
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RNAi技术及其在作物遗传育种中的应用 预览 被引量:2
17
作者 卢东长城 梁荣奇 《分子植物育种》 CAS 2006年第S2期83-90,共8页
Fire等(1998)发现在线虫中双链RNA可以有效地阻断同源基因的表达,并将这一现象称为RNA干扰(RNA interference,RNAi),从而获得了2006年的诺贝尔生理学/医学奖。RNA干扰是指由双链RNA引发的专一性沉默同源基因的现象,它可以专一性降解同... Fire等(1998)发现在线虫中双链RNA可以有效地阻断同源基因的表达,并将这一现象称为RNA干扰(RNA interference,RNAi),从而获得了2006年的诺贝尔生理学/医学奖。RNA干扰是指由双链RNA引发的专一性沉默同源基因的现象,它可以专一性降解同源基因的mRNA或修饰同源基因的启动子。目前有3种转基因方法可以引起植物内源基因的RNA沉默:产生双链RNA转录本的反向重复RNAi(IR-RNA)、反义RNA(anti-sense RNA)技术和正义过量表达外源基因(sense RNA)。RNAi技术作为一种下调表达技术,现在已经开始应用于许多作物的遗传改良以及外来病毒的基因沉默。本文综述了目前RNAi技术在作物重要功能基因的鉴定、抗病毒作物的培育、降低有害物质含量或提高有益物质含量以改良作物品质、增加工业原料的含量等方面的研究进展。随着人们对作物代谢调控和RNAi机制的进一步认识,RNAi技术必将在作物遗传育种中得到更为广泛地应用。 展开更多
关键词 RNA干扰 遗传育种 小干扰RNA 功能基因组
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谷子生物技术研究成果与未来方向 被引量:17
18
作者 刁现民 《河北农业科学》 2005年第4期 61-68,共8页
自1971年实现世界第一例组织培养再生谷子以来,世界各国科学家在谷子及狗尾草属植物组织培养、原生质体培养、体细胞无性系变异和利用、转基因技术、分子标记图谱与禾谷类比较遗传学、重要功能基因定位等相关领域做了大量工作,提升了谷... 自1971年实现世界第一例组织培养再生谷子以来,世界各国科学家在谷子及狗尾草属植物组织培养、原生质体培养、体细胞无性系变异和利用、转基因技术、分子标记图谱与禾谷类比较遗传学、重要功能基因定位等相关领域做了大量工作,提升了谷子遗传育种的发展,也对其它作物的遗传育种起到了促进作用.本文总结了30 a来谷子生物技术研究的成果,并对未来的研究方向和重点研究领域进行了讨论. 展开更多
关键词 谷子 组织培养 分子标记 功能基因组
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T-DNA标签法在水稻功能基因组研究中的应用 预览
19
作者 唐忠海 覃静萍 +2 位作者 储成才 彭国平 饶力群 《杂交水稻》 北大核心 2005年第6期 1-3,共3页
农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展的一种有效的分子生物学技术.综述了T-DNA标签法的特点及其在水稻功能基因组研究中应用的进展.
关键词 T—DNA标签 功能基因组 水稻
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虚拟筛选与新药发现 预览 被引量:30
20
作者 李洪林 沈建华 +5 位作者 罗小民 沈旭 朱维良 王希诚 陈凯先 蒋华良 《生命科学》 2005年第2期 125-131,共7页
虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中.本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的... 虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中.本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的研究进展,特别介绍了我国这方面研究的状况. 展开更多
关键词 虚拟筛选 分子对接 药物设计 功能基因组
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