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丙型肝炎病毒传播分子流行病学诊断技术研究进展
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作者 沈立萍 毕胜利 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期779-782,共4页
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染是导致肝硬化和肝癌发生的主要病原体之一。HCV的准种构成及病毒进化十分复杂,深入分析HCV准种构成是研究HCV传播机制的重要手段。HCV高变区(hypervariable region,HVR)是编码E1、E2/NS... 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染是导致肝硬化和肝癌发生的主要病原体之一。HCV的准种构成及病毒进化十分复杂,深入分析HCV准种构成是研究HCV传播机制的重要手段。HCV高变区(hypervariable region,HVR)是编码E1、E2/NS2的区域,该区域变异率很高,利用先进的测序技术和生物信息分析方法来分析HCV HVR准种构成,可深入了解HCV的传染来源、传播路径和进化程度。目前应用于HCV HVR准种分析的技术包括一代、二代和三代测序法及不同的生物学软件,国际上已广泛应用于HCV暴发调查溯源分析,尤其是医源性传播。当丙肝疫情发生时,通过新一代测序技术和生物学信息分析方法来进行病例溯源研究和传播路线分析,可为丙肝防控和治疗提供科学依据。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 传播 准种 高变区 分子流行病学
猫杯状病毒的分离鉴定及超变区基因序列分析 预览
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作者 刘春国 刘永相 +10 位作者 刘大飞 郭东春 田进 仇铮 刘鑫 蒋艳妹 刘家森 彭永刚 李岩 刘明 曲连东 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期885-887,共3页
为了解猫杯状病毒(FCV)的生物学特性,本研究对猫体内分离到的一株FCVHRB-SS株进行了病毒学、分子生物学鉴定和遗传学分析。结果显示该分离株能够在猫肾细胞系(CRFK)中产生明显的细胞病变,形成蚀斑。FCV的VP1基因超变区核苷酸序列... 为了解猫杯状病毒(FCV)的生物学特性,本研究对猫体内分离到的一株FCVHRB-SS株进行了病毒学、分子生物学鉴定和遗传学分析。结果显示该分离株能够在猫肾细胞系(CRFK)中产生明显的细胞病变,形成蚀斑。FCV的VP1基因超变区核苷酸序列分析结果显示,HRB-SS分离株与疫苗株CVXPOLYCAP同源性最高,为78.2%,而与中国分离株CH-JL和GD的同源性最低,仅为67.9%和68.8%;推导氨基酸序列分析结果显示,HRB-SS分离株与12Q087-5、UTCVM—NH12和FCLF4的同源性最高,为86.7%,而与中国分离株的同源性仅为73.9%。系统发育树分析结果显示,HRB-SS分离株与中国分离株亲缘关系较远。本研究结果表明,FCVHRB-SS与我国FCV具有不同的遗传起源。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 分离鉴定 超变区 序列分析
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1型登革病毒抗原表位嵌合人3型腺病毒六邻体重组病毒的构建及免疫学鉴定 被引量:1
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作者 招穗珊 周志超 +4 位作者 李潇 樊晔 廖小红 周荣 苏晓波 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期464-468,共5页
目的构建六邻体嵌入1型登革病毒(DENVI)抗坂表位的人3型重组腺病毒,鉴定其抗原性。方法以人3型腺病毒骨架质粒pBRAd△E3GFP为模板,overlap PCR在六邻体高变区HVR1插入DENV1的抗原表位,突变的六邻体片段克隆到穿梭载体,酶切后与线... 目的构建六邻体嵌入1型登革病毒(DENVI)抗坂表位的人3型重组腺病毒,鉴定其抗原性。方法以人3型腺病毒骨架质粒pBRAd△E3GFP为模板,overlap PCR在六邻体高变区HVR1插入DENV1的抗原表位,突变的六邻体片段克隆到穿梭载体,酶切后与线性化的3型腺病毒骨架质粒pBRAd△E3GFP在大肠杆菌BJ5183同源重组,获得阳性重组腺病毒质粒pBRAd△E3GFP-DENV1。线性化后转染AD293细胞拯救重组腺病毒rAd△E3GFP-DENV1并大量培养。纯化后腺病毒免疫BALB/c小鼠,通过ELISA和Western blot检测小鼠的体液免疫应答。结果在人3型腺病毒六邻体成功插入DENV1抗坂表位并包装出重组腺病毒,ELISA和Westernblot结果显示小鼠免疫后能产生血清识别DENV1。结论成功构建六邻体HVR1嵌入DENV1抗原表位的重组腺病毒,为多价登革病毒疫苗的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 腺病毒 六邻体 高变区 登革病毒 抗原表位
亚洲主要流行HIV-1 Gp120及其5个高变区多态性分析 预览 被引量:1
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作者 董万强 姚能 徐庆刚 《生物学杂志》 CAS CSCD 2013年第1期9-13,共5页
HIV-1Gp120及其5个高变区的多态性是HIV-1能够逃逸宿主免疫反应和耐药性的主要原因。下载了现有数据库中记载的包括B’、C、CRF01-AE、CRF07-BC和CRF08-BC5种亚洲主要流行亚型和重组型的所有Gp120及其5个高变区序列,分析了HIV—lGp 12... HIV-1Gp120及其5个高变区的多态性是HIV-1能够逃逸宿主免疫反应和耐药性的主要原因。下载了现有数据库中记载的包括B’、C、CRF01-AE、CRF07-BC和CRF08-BC5种亚洲主要流行亚型和重组型的所有Gp120及其5个高变区序列,分析了HIV—lGp 120及其5个高变区序列的长度多态性,糖基化位点数以及序列特征。结果显示,绝大部分的HIV-1Gp120序列长度为496~515个氨基酸之间,这提示Gp120长度为496~515个氨基酸的HIV-1毒株可能是疫苗研究的理想毒株。比较5个高变区,V3区表现出了最低的长度多态性,几乎没有糖基化位点,表明受到较强的功能限制。不同亚型和重组型的V3区一致序列比较发现,所有的HIV-1亚型均表现为R5型。这提示阻断HIV-1病毒结合CCR5受体是治疗艾滋病的有效途径,R5型毒株可以作为艾滋病疫苗研究的理想毒株。另外,V1和V4区展现了很高的长度多态性,糖基化位点也较多;而V2和V5区的长度多态性和糖基化位点都较低。这些结果表明降低这4个高变区的多态性和糖基化位点数目可能解决HIV-1病毒对疫苗的逃逸,从而研究出真正有效的疫苗。 展开更多
关键词 HIV-1 GP120 高变区 长度多态性 糖基化位点 序列特征
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人3型腺病毒六邻体高变区HVR1、HVR2、HVR5和HVR7的氨基酸修饰限制研究 被引量:3
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作者 周志超 梁焕喜 +4 位作者 李婷 钟田花 田新贵 周荣 李潇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期 372-381,共10页
传统腺病毒载体的局限性使得外源抗原以衣壳融合的方式在腺病毒载体上的应用越来越广泛,但是在3型腺病毒(Adenovirus serotype 3, Ad3)载体六邻体高变区(Hypervariable region,HVR)改造过程中经常出现无法成功拯救病毒的情况,本... 传统腺病毒载体的局限性使得外源抗原以衣壳融合的方式在腺病毒载体上的应用越来越广泛,但是在3型腺病毒(Adenovirus serotype 3, Ad3)载体六邻体高变区(Hypervariable region,HVR)改造过程中经常出现无法成功拯救病毒的情况,本研究主要根据对生物信息学预测的HVR1,HVR2,HVR5,HVR7中某些氨基酸进行删减或保留,通过构建重组Ad3载体pBRAdΔE3GFP-mHexon,转染AD293细胞,验证Ad3载体在六邻体高变区的这些氨基酸有所改动时对病毒拯救的影响。由此获得高变区HVR1、HVR2、HVR5和HVR7在基因工程改造中应该保留的氨基酸的数据,这一研究结果为人3型腺病毒六邻体融合表达策略提供了操作依据,也为人3型腺病毒六邻体表达外源抗原表位,作为多价疫苗载体展示平台的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 腺病毒 衣壳融合策略 六邻体 高变区
广西地区传染性囊病病毒超强毒株的分离鉴定及其VP2基因高变区的序列分析 预览 被引量:7
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作者 何秀苗 官丁明 +3 位作者 韦平 榻金彩 屈祖平 秦爱建 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期 7-9,共3页
研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、琼脂扩散试验、致细胞病变和RT-PCR等方法,成功从广西疑似病鸡的腔上囊组织中获得了8个传染性囊病病毒(IBDV)毒株,分离株可致攻毒鸡发病率100%,死亡率60%~90%;分子特征上,8个分离株VP2... 研究通过鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、琼脂扩散试验、致细胞病变和RT-PCR等方法,成功从广西疑似病鸡的腔上囊组织中获得了8个传染性囊病病毒(IBDV)毒株,分离株可致攻毒鸡发病率100%,死亡率60%~90%;分子特征上,8个分离株VP2高变区在酶切位点和特征性氨基酸上均属于vvIBDV的特征。同源性分析表明,8个分离株之间在核苷酸和氨基酸上的同源性分别为96.8%~99.1%和95.9%~99.3%,与其他参考vvIBDV毒株的同源性分别为94%~97.7%和92.5%~97.3%,而与常用疫苗株Bursine-2、B87(in),变异株GLS,经典强毒株的同源性仅有90%左右。遗传进化树上,8个分离株与国内外参考vvIBDV同处于一个大分支,与疫苗株和经典强毒株的距离较远,8个分离株与中国内地毒株SD1/97的亲缘关系最近。研究表明,广西仍然存在vvIBDV的流行。 展开更多
关键词 传染性囊病 超强毒株 RT—PCR VP2基因高变区
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Primary Analysis on mtDNA D-loop Hypervariable Region in Eutamias sibiricus 预览
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作者 LI Shipeng BAI Xiujuan 《东北农业大学学报:英文版》 CAS 2008年第1期 48-50,共3页
This study analyzed the mitochondrial DNA D-loop hypervariable region 601 bp sequence in 12 Eutamias sibiricus from Heilongjiang area.The result showed that the average contents of A,T,G and C were 33.2%,30.5%,11.8%an... This study analyzed the mitochondrial DNA D-loop hypervariable region 601 bp sequence in 12 Eutamias sibiricus from Heilongjiang area.The result showed that the average contents of A,T,G and C were 33.2%,30.5%,11.8%and 24.5%respectively,the A+T content(63.7%)was obviously higher than the G+C content(36.3%).Thirty-six mutation(approximately 6.0%)sites were found and 9 haplotypes were defined.The mutations types,including transition,transversion and deletion were all found in the detected mtDNA D-loop regions,most of which was transition.The average nucleotide mutational ratio was 1.22%.The nucleotide mutation sites affected the restriction site appearance or disappearance of the restriction site.The research on mtDNA D-loop is focused on the domestic animals and there is no report on Eutamias sibiricus.This study analyzed the mitochondrial DNA D-loop hypervariable in Eutamias sibiricus so as to provide some useful informations for related research in the future. 展开更多
关键词 DNA 脱氧核糖核酸 高变区 遗传多样性
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丙肝病毒高变区1相关基因免疫小鼠诱导细胞免疫反应的研究 预览 被引量:1
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作者 高蓉 舒翠莉 +5 位作者 李靖 迟淑萍 赵军 陈昊 李伯安 程云 《第二军医大学学报》 CAS 北大核心 2005年第4期 425-428,共4页
目的:以真核质粒pcDN3.1(+)为载体携带丙肝病毒高变区1(HVR1)相关模拟表位DNA序列对小鼠进行基因免疫,观察其诱导细胞免疫反应的效果.方法:根据HCV HVR1模拟表位多肽序列,合成DNA序列,并将其连接到pcDN3.1(+)上,构建为pcDN3.1-SP.免疫... 目的:以真核质粒pcDN3.1(+)为载体携带丙肝病毒高变区1(HVR1)相关模拟表位DNA序列对小鼠进行基因免疫,观察其诱导细胞免疫反应的效果.方法:根据HCV HVR1模拟表位多肽序列,合成DNA序列,并将其连接到pcDN3.1(+)上,构建为pcDN3.1-SP.免疫中分别采用2种剂量pcDN3.1-SP(10μg和100 μg),以及10μg质粒中混合了非甲基化CpG基序(-CpG),以其作为佐剂增强免疫原性,并比较其与100μg剂量的免疫效果.杀鼠、收集血清、分离脾细胞;ELISA法检测小鼠体液中的抗体;脾细胞经混合肽刺激后,用流式细胞仪检测CD8+IFN-γ+细胞;用非放射性MTS法检测细胞增殖反应;以非放射性LDH法检测CTL反应.结果:混合肽体外刺激100μg和10μg-CpG基因免疫小鼠脾淋巴细胞后,T细胞增殖反应明显;脾淋巴细胞中CD8+IFN-γ+细胞增多;并能检测到明显的CTL反应,同时伴有较弱体液免疫反应.结论:合成的模拟表位中可能含有T细胞和B细胞表位;非甲基化CpG基序增强了DNA免疫效果. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 高变区 模拟表位 细胞免疫 基因免疫
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IBDVvp2基因高变区序列测定与进化分析 预览 被引量:3
9
作者 闫笑 李天宪 +2 位作者 范兆军 寇铮 陈绳亮 《中国病毒学》 2004年第6期 620-623,共4页
本实验采用来源于江苏地区的六株不同鸡传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)毒株,应用RT-PCR法对vp2基因高变区进行了扩增,构建重组质粒pMD18T-vp2,测序.与有代表性的IBDV毒株VP2基因高变区序列进行比较分析,以Cl... 本实验采用来源于江苏地区的六株不同鸡传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)毒株,应用RT-PCR法对vp2基因高变区进行了扩增,构建重组质粒pMD18T-vp2,测序.与有代表性的IBDV毒株VP2基因高变区序列进行比较分析,以ClustalX软件进行序列比对,得到基因序列及氨基酸序列同源性,IBDVY3、P2G、P8G、SZ、Y5和W04(6株)IBDV与D6984(荷兰)的同源性达到99.0%以上,与其它一些超强毒株(very virulentIBDV,vvIBDV)的同源性也达到了97.8%以上,并在关键氨基酸位点符合vvIBDV特征,采用Phylip3.5软件分析作出进化树,其结果从分子水平说明六个毒株均为vvIBDV,与欧洲和日本的超强毒株有较近的亲缘关系,而与美洲株的较远,从而为IBDV分子流行病学研究和疫苗的研制提供了科学依据. 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV) VP2基因 高变区 超强毒株
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肺癌患者外周血白细胞线粒体DNA突变研究 预览 被引量:1
10
作者 胡义德 贾立明 +4 位作者 刘丽红 孙玉兰 孙恒文 钱桂生 房殿春 《重庆医学》 CAS 2004年第11期 1712-1714,共3页
目的分析mtDNA tRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在肺癌患者及健康成人外周血中的突变情况并探讨其意义.方法一步法制备外周血白细胞mtDNA,结合PCR产物直接测序,对比分析mtDNA tRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在17例... 目的分析mtDNA tRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在肺癌患者及健康成人外周血中的突变情况并探讨其意义.方法一步法制备外周血白细胞mtDNA,结合PCR产物直接测序,对比分析mtDNA tRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在17例肺癌患者和14例健康成人外周血白细胞中的突变情况.结果肺癌组和健康成人组中,仅1例健康成人mtDNA编码区tRNAThr基因中出现了1个碱基变异,碱基平均变异率为0.023 7%,而非编码HVRⅠ区共发现136个变异,碱基平均变异率为1.282 8%.肺癌组和健康成人组碱基平均变异率分别为1.238 4%和1.336 7%.肺癌组中腺癌、鳞癌、小细胞癌的碱基平均变异率分别为0.994 2%、1.202 1%和1.7544%.结论肺癌患者外周血白细胞mtDNA编码区序列趋于高度保守,主要碱基变异发生在非编码HVRⅠ区,与健康成人相应区域变异率总体上趋于一致,但肺癌组人均碱基变异随年龄增长有增高趋势,且小细胞肺癌外周血白细胞mtDNA非编码HVRⅠ区碱基平均变异率有增高趋势. 展开更多
关键词 肺肿瘤 线粒体DNA 非编码区 高变Ⅰ区 突变
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蒙古牛mtDNAD—loop高变区序列分析 预览 被引量:3
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作者 雷初朝 陈宏 +2 位作者 杨公社 宋林生 刘小林 《黄牛杂志》 2002年第3期 6-7,共2页
本文对蒙古牛线粒体DNA D-loop高变区的核苷酸序列进行了分析,结果发现,蒙古牛D-loop高变区的核苷酸变异率约为0.40 %,其核苷酸变异类型只有转换1种形式.
关键词 蒙古 序列分析 线粒体DNA D-LOOP 高变区
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秦川牛线粒体DNA高变区序列分析 预览 被引量:4
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作者 雷初朝 陈宏 +2 位作者 杨公社 宋林生 刘小林 《黄牛杂志》 2002年第2期 5-6,共2页
本文对秦川牛线粒体DNA D-loop高变区的核苷酸序列进行了分析,结果发现,秦川牛D-loop高变区的核苷酸变异率约为1.08 %,其核苷酸变异类型包括转换、颠换和插入3种形式,其中转换最常见.
关键词 秦川牛 线粒体DNA D-LOOP 高变区 遗传变异性
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丙型肝炎病毒高变区序列变化及其临床意义 预览
13
作者 张顺财 王唯 《上海医科大学学报》 2000年第6期 480-483,共4页
目的 了解HCV慢性感染过程中高变区序列变化及其临床意义。方法 对8例急性丙肝及20例性丙肝随访2年,相隔半年抽血,用逆转录多聚酶联反应及直接序列法分析不同时期HCV-HVR的序列变化。结果 28例丙肝的HVR序列均... 目的 了解HCV慢性感染过程中高变区序列变化及其临床意义。方法 对8例急性丙肝及20例性丙肝随访2年,相隔半年抽血,用逆转录多聚酶联反应及直接序列法分析不同时期HCV-HVR的序列变化。结果 28例丙肝的HVR序列均有不同程度的变化,92%变化的核苷酸导致相应氨基酸的变化,仅8%为同义替换,27个氨基酸的每年变化范围为1~20,平均8个(30%),HVR密码子中,以第一及第二变化最为常风,分别为6 展开更多
关键词 丙型肝炎 高变区 序列分析 HCV
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丙型肝炎病毒高变区多抗原肽设计及反应原性 预览 被引量:3
14
作者 王永刚 郝飞 《中华肝脏病杂志》 CAS 2000年第1期 48-50,共3页
目的 进一步认识丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)包膜糖蛋白高变区1(h6pernarible region 1,HVR1)序列的抗原表位。方法 设计并合成HCV-BJ株(1b型),HVR13... 目的 进一步认识丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)包膜糖蛋白高变区1(h6pernarible region 1,HVR1)序列的抗原表位。方法 设计并合成HCV-BJ株(1b型),HVR1390-411序列共22年氨基酸的线性表位多肽(LP0及多抗原肽(MAP),并比较与HCV感染者表中抗HCV1的反应性。结果 抗MAP的A450为0.461±0.590,抗LP为0.14 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 高变区 抗原肽 反应原性
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丙型肝炎病毒基因高变区变异的动力学研究 预览 被引量:6
15
作者 潘文胜 王海涛 +2 位作者 郭华章 汪涛 骆抗先 《病毒学报》 CAS 北大核心 1999年第1期 29-35,共7页
本文旨在对HCV的基因高变区的变异规律进行初步探索。根据随访的5年、分别检测3个两例的HCV持续感染者的高变区基因变异的资料分析,发现高变区的变异可能有两种不同的动态模式;一种为快速演变模式,表现为基因变异速度快、优... 本文旨在对HCV的基因高变区的变异规律进行初步探索。根据随访的5年、分别检测3个两例的HCV持续感染者的高变区基因变异的资料分析,发现高变区的变异可能有两种不同的动态模式;一种为快速演变模式,表现为基因变异速度快、优势克隆转化快和同一时间点各克隆的遗传距离近;另一种灯对缓慢演变模式,表现为基因变异速度缓慢,优势克隆转化不明显,同一时间点不同克隆间的遗传距离远。该研究结果显示,HCV高变区基因变划具 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 高变区 基因变异 演化动态
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丙型肝炎病毒高变区基因变异特点初探 预览 被引量:1
16
作者 潘文胜 骆抗先 《中国病毒学》 1998年第3期 214-221,共8页
对两例HCV RNA持续阳性者分三个时间点随访五年,测定了HCV的高变区基因序列,每个时间点平均测定28个克隆,总共测定了168个克隆。研究发现HCV高变区基因变异有五个明显特点:(1)变异程度大,高变区至少有89%... 对两例HCV RNA持续阳性者分三个时间点随访五年,测定了HCV的高变区基因序列,每个时间点平均测定28个克隆,总共测定了168个克隆。研究发现HCV高变区基因变异有五个明显特点:(1)变异程度大,高变区至少有89%的核苷酸位点都可能发生变异;(2)变异形式多样,除常见的替代突变外,缺失突变(缺失1、2或3个核苷酸)的克隆数占总克隆数的22.5%;(3)优势克隆明显,即有若干个克隆高变区的核苷酸和 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 高变区 基因变异
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DNA指纹的个体特异性和细胞稳定性研究 预览 被引量:1
17
作者 蓝翎 张小为 +1 位作者 段秉章 霍振义 《法医学杂志》 CAS 1990年第2期 8-11,共4页
人类基因组的许多高度可变区域能够与小卫星探针杂交,而同时被检测出来,小卫星探针由串联重复的“核心”顺序构成。采用Southern印迹杂交获得的DNA指纹图包含多条高度可变的DNA片段杂交带,这些带在体细胞和生殖细胞中都表现出稳定性... 人类基因组的许多高度可变区域能够与小卫星探针杂交,而同时被检测出来,小卫星探针由串联重复的“核心”顺序构成。采用Southern印迹杂交获得的DNA指纹图包含多条高度可变的DNA片段杂交带,这些带在体细胞和生殖细胞中都表现出稳定性,而且安全具有个体特异性。本文用小卫星探针33.15,调查了北京地区的60名无关个体。 展开更多
关键词 特异性 稳定性研究 个体 Southern印迹杂交 小卫星探针 DNA指纹图 人类基因组 DNA片段 探针杂交 生殖细胞 北京地区 可变区 体细胞 高度
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1株鸡传染性法氏囊病毒VP2基因的克隆及其分子流行病学分析 预览 被引量:1
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作者 冯金芳 何海汛 +1 位作者 孙国鹏 王选年 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第1期109-113,133共6页
为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡... 为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡某发病鸡场的IBDV野毒株XX511的VP2高变区进行克隆及分析,并将XX511毒株的VP2高变区中与毒力相关的2个亲水区及七肽区与国内外其他参考毒株进行序列比对,绘制进化树。结果显示,XX511毒株与超强毒株D49706、AJ878898的VP2基因高变区氨基酸序列的同源性均为96.8%,与广东地区JQ911703毒株具有100%的同源性。与参照的经典毒株相比,XX511毒株在第一亲水区发生了1个氨基酸位点的突变。通过与国内外(包括河南地区)其他流行毒株的比对及进化分析发现,XX511毒株与2012年广东流行JQ911703毒株处于同一分支。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 遗传进化 VP2高变区 七肽区 分子流行病学
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1例青年鸡患传染性法氏囊病的诊断
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作者 侯宏艳 侯绍璞 +2 位作者 张丹俊 赵瑞宏 戴银 《畜牧与饲料科学》 2015年第12期118-120,共3页
对100日龄的发病鸡,经临床诊断后,取法氏囊用IBDV抗原检测卡试剂盒进行检测,同时将法氏囊剪碎、研磨,进行RT-PCR试验。结果显示,IBDV抗原检测卡结果是阳性,获得序列的VP2基因高变区序列分析结果与IBDV的E-DEL毒株的同源性为94.9%,说明... 对100日龄的发病鸡,经临床诊断后,取法氏囊用IBDV抗原检测卡试剂盒进行检测,同时将法氏囊剪碎、研磨,进行RT-PCR试验。结果显示,IBDV抗原检测卡结果是阳性,获得序列的VP2基因高变区序列分析结果与IBDV的E-DEL毒株的同源性为94.9%,说明青年鸡感染了传染性法氏囊病(IBD)。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病 诊断 VP2基因高变区
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一株水貂阿留申病毒VP2基因的高变区测序分析 被引量:1
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作者 张蕾 胡博 +7 位作者 白雪 张海玲 赵建军 王振军 马凡舒 闫喜军 吴威 徐淑娟 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期226-230,共5页
为分析我国水貂阿留申病(Aleutian disease,AD)跨宿主传播的分子机制,扩增获得一株吉林地区水貂阿留申病毒(Aleutian disease virus,ADV)VP2基因高变区片段。序列分析表明,第235位存在与参考毒株不同的氨基酸位点,进化树分析结果表... 为分析我国水貂阿留申病(Aleutian disease,AD)跨宿主传播的分子机制,扩增获得一株吉林地区水貂阿留申病毒(Aleutian disease virus,ADV)VP2基因高变区片段。序列分析表明,第235位存在与参考毒株不同的氨基酸位点,进化树分析结果表明,该毒株与丹麦高致病毒株ADV-K亲缘关系较近。ADV第235位氨基酸位点可能与病毒的感染能力相关。 展开更多
关键词 水貂阿留申病毒 VP2高变区 跨宿主传播
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