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淀粉诱导奶牛乳脂下降后奶牛瘤胃细菌菌群变化 预览
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作者 徐晓锋 郭成 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1591-1598,共8页
旨在阐释奶牛日粮添加淀粉对奶牛乳脂及瘤胃细菌菌群变化的影响。选取4头体况相近、健康的泌乳期中国荷斯坦奶牛,试验开始前以基础日粮饲喂并作为对照,饲喂7d;试验期每头奶牛日粮中添加1.5kg·d-1玉米淀粉,饲喂15d。结果表明,日粮... 旨在阐释奶牛日粮添加淀粉对奶牛乳脂及瘤胃细菌菌群变化的影响。选取4头体况相近、健康的泌乳期中国荷斯坦奶牛,试验开始前以基础日粮饲喂并作为对照,饲喂7d;试验期每头奶牛日粮中添加1.5kg·d-1玉米淀粉,饲喂15d。结果表明,日粮中添加淀粉后,牛奶乳脂率极显著降低(P<0.01)。瘤胃细菌研究表明,在门水平上共检测到28个菌门,玉米淀粉导致瘤胃芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、软壁菌门(Tenericutes)丰度极显著降低(P<0.01),装甲菌门(Armatimonadetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)丰度显著降低(P<0.05),厚壁菌门(Firmicutes)丰度显著增加(P<0.05)。在属水平上共检测到383个菌属,其中90个菌属发生显著变化。玉米淀粉导致醋酸杆菌属(Acetobacter)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、小球菌属(Pediococcus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、毛螺旋菌属-1(Lachnoclostridium-1)、瘤胃球菌属-1(Ruminococcus-1)、普雷沃氏菌属-7(Prevotella-7)等丰度极显著增加(P<0.01),厌氧弧菌属(Anaerovibrio)、肠球菌属(Enterococcus)、栖水菌属(Enhydrobacter)等丰度极显著降低(P<0.01)。本试验结果表明,奶牛日粮中添加一定量的玉米淀粉对瘤胃细菌多样性和种类分布均匀度均无显著影响,但其促进了大部分产酸菌群的增殖。 展开更多
关键词 奶牛 瘤胃 16S高通量测序技术 瘤胃细菌
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β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响 预览
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作者 张帅 曲永利 +3 位作者 李伟 辛小月 王璐 殷术鑫 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第1期39-46,共8页
为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液... 为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液,构建犊牛瘤胃细菌宏基因组文库,并使用illumina MiSeq测序后通过NOG、KEGG和CAZy数据库进行生物信息学分析和功能注释。结果显示:①9个样品在eggNOG数据库中比对共有86 145条基因得到了相应的功能注释;CAZy数据库在9个功能类共获得33 980条注释;在KEGG通路注释得到1 905条。②T1-T2、T1-T3、B1-B2和B1-B3四组分别含有318、1 398、30和24个差异表达基因(DEGs)。T1-T2组和T1-T3组DEGs在细胞周期及氨基酸生物合成代谢途径中明显富集,其中细胞周期代谢主要的DEGs为糖原合酶激酶-3β基因(Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β);周期蛋白依赖性激酶2基因(Cyclin-dependent kinase 2,CDK2)和周期蛋白依赖性激酶7基因(Cyclin-dependent kinase 7,CDK7)。③试验共检测到6类抗生素抗性基因,共19种基因型。进一步分析抗生素耐药性产生机制,其中由外排泵(Efflux pump)引起的所占比例最大。说明牦牛随日龄的增加瘤胃菌群丰度提高,瘤胃菌群中的差异表达基因GSK-3β、CDK2和CDK7可能影响犊牛早期生长的乳脂代谢。 展开更多
关键词 犊牛 抗奶 瘤胃菌群 差异表达基因 抗性基因
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基于MiSeq技术的枯草期放牧蒙古羊瘤胃细菌多样性分析 预览 被引量:1
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作者 范文斌 李长青 +2 位作者 高仙灵 张金然 刘永斌 《河南农业科学》 北大核心 2019年第4期146-149,共4页
为了阐明枯草季节牧草对放牧蒙古羊瘤胃生理功能的影响,明确放牧蒙古羊瘤胃消化的限制性因素,随机选取终年放牧的6只蒙古羊,在枯草期通过口腔采取蒙古羊瘤胃液,利用MiSeq高通量测序技术分析了瘤胃细菌种群的结构和多样性。结果表明,共... 为了阐明枯草季节牧草对放牧蒙古羊瘤胃生理功能的影响,明确放牧蒙古羊瘤胃消化的限制性因素,随机选取终年放牧的6只蒙古羊,在枯草期通过口腔采取蒙古羊瘤胃液,利用MiSeq高通量测序技术分析了瘤胃细菌种群的结构和多样性。结果表明,共得到了2 774个操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU),平均每个样品OTU为462.30。放牧蒙古羊瘤胃细菌共有13个门、24个纲、30个目、59个科、85个属被鉴定。在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes,58.59%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.18%)为放牧蒙古羊瘤胃中的优势细菌种群;在科水平上,主要包括瘤胃菌科(Ruminococcaceae,15.43%)、毛螺菌科(Lachnospiraceae,14.86%)和克里斯蒂娜科(Christensenellaceae,11.90%);在属水平上,普雷沃氏菌属(Prevotella,2.89%)和Candidatus saccharimonas(2.89%)是放牧蒙古羊瘤胃中的优势种群。说明冬春季枯草期放牧蒙古羊瘤胃细菌表现出典型的纤维消化菌群特征,因此,为瘤胃菌科和毛螺菌科提供营养,能够有效改善蒙古羊瘤胃的发酵功能,提高其对牧草的消化率。 展开更多
关键词 放牧蒙古羊 瘤胃细菌 多样性 MiSeq
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和牛及其杂交牛瘤胃细菌多样性分析
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作者 张智慧 李伟 +3 位作者 韩永胜 赵金波 宋雪莹 郭春晖 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第23期44-49,共6页
为了揭示纯种和牛及杂交和牛瘤胃细菌组成及多样性,选取安装有永久性瘤胃瘘管的年龄、体重和体况接近的纯种和牛公牛(WW)、和牛♂×西门塔尔牛♀杂交F1代公牛(WS)及和牛♂×荷斯坦牛♀杂交F1代公牛(WH)各3头,采集试验牛瘤胃液,... 为了揭示纯种和牛及杂交和牛瘤胃细菌组成及多样性,选取安装有永久性瘤胃瘘管的年龄、体重和体况接近的纯种和牛公牛(WW)、和牛♂×西门塔尔牛♀杂交F1代公牛(WS)及和牛♂×荷斯坦牛♀杂交F1代公牛(WH)各3头,采集试验牛瘤胃液,提取细菌DNA,对细菌16S rDNA V4~V5区(515F~907R)进行PCR扩增,扩增产物用Illumina HiSeq PE250测序平台进行高通量测序。结果表明:9个瘤胃液样本共获得604 174条有效16S rDNA序列,19 912个分类操作单元(OTU),物种丰富度指数(Chao指数)WW组极显著高于WH组(P<0.01),WS组显著高于WH组(P<0.05),Ace指数WW组与WS组均显著高于WH组(P<0.05),但WW组与WS组相比差异不显著(P>0.05)。在门水平上,3组相对含量最多的菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes),其次是厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),分别占测序总数的56.08%~66.29%、21.20%~27.01%和2.09%~5.45%;在科水平上,3组相对含量最多的菌属为普雷沃氏菌科(Prevotellaceae),占测序总量的37.12%~44.23%;在属水平上,3组相对含量最多的菌属为普雷沃氏菌属-1(Prevotella-1),占测序总量的23.98%~35.95%。在97%相似性水平下,3组共享OTU数为1 969个,占瘤胃液细菌总OTU数的59.83%,3组间瘤胃菌群结构存在一定差异,同一品种牛的瘤胃菌群结构表现出明显的聚集趋势。说明纯种和牛及杂交和牛瘤胃中最优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes),其次为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria);最优势菌科为普雷沃氏菌科(Provotellaceae);最优势菌属均为普雷沃氏菌属-1(Prevotella-1),纯种和牛与杂交和牛在物种多样性指数上并无显著性差异。 展开更多
关键词 和牛 杂交和牛 高通量测序 瘤胃细菌 菌群结构 多样性
放牧与舍饲对彭波半细毛羊瘤胃细菌群落的生物学信息影响 预览
5
作者 田发益 武俊喜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2252-2263,共12页
旨在通过不同蛋白质、非纤维性碳水化合物(NFC)和纤维素含量对瘤胃微环境细菌群落结构的影响研究,阐明瘤胃优势菌群结构的消长情况,清晰地了解瘤胃微生物对养分的依赖程度,以期为西藏传统放牧补饲及规模化养殖营养配比奠定理论基础。本... 旨在通过不同蛋白质、非纤维性碳水化合物(NFC)和纤维素含量对瘤胃微环境细菌群落结构的影响研究,阐明瘤胃优势菌群结构的消长情况,清晰地了解瘤胃微生物对养分的依赖程度,以期为西藏传统放牧补饲及规模化养殖营养配比奠定理论基础。本研究选用年龄2岁左右,体重相近((23.77±2.34)kg)的健康彭波半细毛母羊20只,放牧组及舍饲组各10只(每组各2个重复,每个重复5只)。采用凯氏定氮法、范氏(van soest)法和差值法分别测定放牧组可饲用牧草混合样、舍饲组饲草的粗蛋白、纤维素、NFC含量。饲养半年后,抽取瘤胃液,提取总DNA,构建重组标准质粒对瘤胃细菌进行绝对荧光定量(qRT-PCR)研究。结果:1)在门水平上,发现优势菌群集中在拟杆菌门,其在放牧组的丰度((49.52±6.07)%)比舍饲组((55.52±12.18)%)低6.00%,但差异不显著(P>0.05);放牧组厚壁菌门的丰度((43.28±4.59)%)比舍饲组((36.68±9.78)%)高6.60%,两组差异显著(P<0.05);放牧组螺旋体门的丰度((1.99±1.75)%)比舍饲组((0.76±0.59)%)高1.23%,两组差异显著(P<0.05)。2)通过PLS-DA和LEfSe分析发现,两组间均差异显著的主要细菌有:纤维素或其代谢产物主要依赖菌(放牧组)为假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、月形单胞菌属(Selenomonas)、粪球菌属(Coprococcus)、梭菌属(Clostridium)、厌氧弧菌属(Anaerovibrio)、毛螺旋菌科下一属(Shuttleworthia)、类普雷沃氏菌科下一属(CF231)、丁酸弧菌属(Butyrivibrio)、类普雷沃氏菌科下一属(YRC22)、毛螺菌属(Lachnospira)、毛螺菌科下一属(Moryella);高蛋白和NFC或其代谢产物主要依赖菌(舍饲组)为脱硫叶菌属(Desulfobulbus)、奇异菌属(Atopobium)、韦荣球菌科下一属(p-75-a5)、普氏菌属(Prevotella)、布劳特氏菌属(Blautia)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)和链球菌属(Streptococcus)。结果说明,合理蛋白质能量水平的饲料,不仅利于蛋白、淀粉依赖菌的增殖,也有利 展开更多
关键词 彭波半细毛羊 TMR 丰度 瘤胃细菌 OTUs 放牧组和舍饲组
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不同精粗比日粮对绵羊瘤胃微生物蛋白浓度和细菌数的影响 预览
6
作者 永荣 姜向宏 《四川畜牧兽医》 2018年第11期28-30,共3页
为了研究不同精粗比日粮对绵羊瘤胃微生物蛋白浓度和细菌数的影响,本试验选用30只健康的安有永久性瘤胃瘘管和十二指肠进端瘘管的鄂尔多斯细毛羊,随机均分成1、2、3组,分别饲喂精粗比为1:9、3:7、5:5的日粮。结果显示:1、2、3组... 为了研究不同精粗比日粮对绵羊瘤胃微生物蛋白浓度和细菌数的影响,本试验选用30只健康的安有永久性瘤胃瘘管和十二指肠进端瘘管的鄂尔多斯细毛羊,随机均分成1、2、3组,分别饲喂精粗比为1:9、3:7、5:5的日粮。结果显示:1、2、3组绵羊的瘤胃微生物蛋白浓度分别为59.26、63.95、64.38mg/100mL.组间差异不显著(P〉0.05);细菌总数分别为8.73×10^9、9.22×10^9、11.00×10^9个/mL,组间差异不显著(P〉0.05):相关性分析表明,瘤胃细菌数量和瘤胃细菌浓度呈高度正相关(R2=0.9972),瘤胃细菌浓度与瘤胃微生物蛋白浓度间的相关性较低(R2=0.2271)。 展开更多
关键词 精粗比 瘤胃微生物蛋白 瘤胃细菌
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复合菌剂发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响 预览 被引量:3
7
作者 郭威 郭晓军 +2 位作者 周贤 李术娜 朱宝成 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期736-745,共10页
旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前... 旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前1天、饲喂第7、21天晨饲后6h取瘤胃液。同一时间所采取的同一处理的样品混合均匀,分别命名为青贮组(CS:YD0、YD7、YD21)和发酵组(FCS:YS0、YS7、YS21),之后通过高通量测序进行分析。结果显示:1)绵羊瘤胃内细菌群落包括29个门,74个纲,135个目,215个科和428个属。2)青贮组以拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群,其次为黏胶球形菌门(Lentisphaerae)、厚壁菌门(Firmicutes)和纤维杆菌门(Fibrobacteres),发酵组优势菌亦为拟杆菌门,其次为厚壁菌门、黏胶球形菌门和纤维杆菌门。通过21d的饲喂试验可知,青贮组拟杆菌门和厚壁菌门所占比例较发酵组降低,两组黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群数量都有所增加,但青贮组增加幅度更大。3)拟杆菌门的普雷沃氏菌属(Prevotella)在发酵组饲喂7d后成为最优势菌属(丰度达15.56%),而在青贮组明显降低(丰度从10.48%降至3.17%);纤维杆菌属(Fibrobacter)相对丰度在饲喂21d后青贮组增加量大于发酵组。4)在97%相似性水平下,饲喂21d后发酵组的Shannon和Simpson指数更高,表明它拥有更高的瘤胃细菌多样性。复合菌剂发酵玉米秸秆提高了绵羊瘤胃细菌多样性。饲喂发酵玉米秸秆的绵羊瘤胃内拟杆菌门和厚壁菌门菌群的比例降低,而黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群的数量增加。 展开更多
关键词 发酵玉米秸秆 绵羊 瘤胃细菌 多样性
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瘤胃原虫对细菌活性及代谢的影响 预览
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作者 董瑞兰 于光辉 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2018年第A01期278-284,共7页
瘤胃是反刍动物进行饲料消化的发酵罐,瘤胃中寄存的复杂微生物主要包括瘤胃细菌、原虫和真菌,其相互作用为饲料的消化吸收提供了可靠的保障。研究原虫对细菌活性的影响,以探讨原虫是否有助于促进或保持瘤胃细菌的活性。以2头安装有永久... 瘤胃是反刍动物进行饲料消化的发酵罐,瘤胃中寄存的复杂微生物主要包括瘤胃细菌、原虫和真菌,其相互作用为饲料的消化吸收提供了可靠的保障。研究原虫对细菌活性的影响,以探讨原虫是否有助于促进或保持瘤胃细菌的活性。以2头安装有永久性瘤胃瘘管的西门塔尔牛作为瘤胃液供体动物,同时以羊草为发酵底物,设置3个处理,分别包括细菌组、原虫组及原虫+细菌组。各处理羊草的发酵规律采用体外培养法连续测定24h。发酵结束后测定瘤胃液的pH值,各处理组羊草的总产气量和各气体成分(包括CH4、CO2和H2)含量以及各挥发性脂肪酸(VFA)的产量用气相色谱仪测定。结果表明,细菌+原虫组的总产气量显著高于细菌组(P<0.05),原虫组总产气量为零;细菌+原虫组的总挥发性脂肪酸及乙酸、丙酸和丁酸的产量极显著高于细菌组、原虫组(P<0.01)。结果提示,细菌+原虫组的发酵效率均高于细菌或原虫单独培养发酵的效果,说明原虫在羊草细胞壁的降解发酵过程中,提高了瘤胃细菌的活性。进一步揭示了植物细胞壁在瘤胃内的降解是在细菌和原虫的共同作用下完成的,瘤胃细菌和原虫在降解植物细胞壁的过程中存在协同效应。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 原虫 体外培养技术 挥发性脂肪酸
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不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性研究 预览 被引量:3
9
作者 李子健 李大彪 +2 位作者 高民 王典 兰儒冰 《动物营养学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期3017-3025,共9页
本试验旨在探究不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性。选取处于围产前期、泌乳前期、泌乳中期和泌乳后期的经产荷斯坦奶牛各4头,共16头,采集瘤胃液用于测定瘤胃发酵参数和提取微生物DNA,采用Illumina Miseq PE300平台测定瘤胃细菌... 本试验旨在探究不同生理阶段荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性。选取处于围产前期、泌乳前期、泌乳中期和泌乳后期的经产荷斯坦奶牛各4头,共16头,采集瘤胃液用于测定瘤胃发酵参数和提取微生物DNA,采用Illumina Miseq PE300平台测定瘤胃细菌组成。结果表明:1)围产前期奶牛瘤胃微生物蛋白、乙酸、丁酸、总挥发性脂肪酸浓度与乙酸/丙酸显著高于泌乳期( P < 0.05 )。围产前期奶牛瘤胃丙酸浓度显著低于泌乳期( P <0.05)。2)在门的水平上,围产前期奶牛瘤胃内的优势菌门为拟杆菌门和厚壁菌门,泌乳期奶牛瘤胃内的优势菌门则为拟杆菌门、变形菌门和厚壁菌门。围产前期奶牛瘤胃内的拟杆菌门、SR1细菌、蓝菌门、柔膜菌门、TM7细菌和纤维杆菌门的相对丰度显著高于泌乳期( P <0.05),而泌乳期各阶段之间差异不显著( P 〉 0.05 );围产前期奶牛瘤胃内的变形菌门的相对丰度显著低于泌乳期( P <0.05)。3)在科的水平上,围产前期奶牛瘤胃内的优势菌科为普雷沃氏菌科,而泌乳期奶牛瘤胃内的优势菌科为琥珀酸弧菌科和普雷沃氏菌科。围产前期奶牛瘤胃内的普雷沃氏菌科、瘤胃菌科、理研菌科、BS11细菌、RF16细菌、SR1细菌、Gastranaerophilales、克里斯滕森菌科、TM7细菌、RF9细菌和纤维杆菌科的相对丰度显著高于泌乳期( P <0.05);围产前期奶牛瘤胃内的琥珀酸弧菌科、毛螺菌科和韦荣球菌科则显著低于泌乳期( P <0.05)。综上得出,奶牛从围产前期进入到泌乳期,瘤胃细菌多样性显著降低;泌乳期各阶段瘤胃细菌组成差异较小。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 生理阶段 瘤胃细菌 多样性
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基于16SrRNA基因测序技术研究低聚异麦芽糖对奶牛瘤胃细菌菌群的影响 预览
10
作者 郭成 郭婷婷 +2 位作者 胡丹丹 张力莉 徐晓锋 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期815-821,共7页
【目的】本试验旨在利用 16SrRNA 基因测序技术研究低聚异麦芽糖对奶牛瘤胃菌群的影响。【方法】试验采用两阶段交叉设计方法,将 4 头泌乳中国荷斯坦泌乳奶牛随机分为两组,第一阶试验结束,经过恢复期后,再将试验组和对照组交叉,由之前... 【目的】本试验旨在利用 16SrRNA 基因测序技术研究低聚异麦芽糖对奶牛瘤胃菌群的影响。【方法】试验采用两阶段交叉设计方法,将 4 头泌乳中国荷斯坦泌乳奶牛随机分为两组,第一阶试验结束,经过恢复期后,再将试验组和对照组交叉,由之前对照组变为试验组。试验组添加 60 g/(d·头)的低聚异麦芽糖。【结果】结果表明日粮添加低聚异麦芽糖后,奶牛瘤胃细菌菌群多样性无显著影响。门水平上分析,疣微菌门丰度显著增加(P<0.05)。属水平上分析,饲喂低聚异麦芽糖,奶牛瘤胃液 Comamonadaceae_NA(未注释丛毛单胞菌属)丰度极显著提高(P<0.01),WCHB1-25_NA 丰度极显著增加(P<0.01),Ruminobacte(瘤胃杆菌属)丰度显著增加(P<0.05),Salinibacterium(盐细菌属)丰度显著增加(P<0.05),Lactobacillus(乳酸杆菌属)丰度显著降低(P<0.05)。Acidaminococcus(氨基酸球菌属)、Aeromicrobium(气微菌属)、Actinotalea、Adlercreutzia 菌属丰度有增加趋势(0.05<P<0.1),TMEG_NA 菌属丰度有降低的趋势(0.05<P<0.1)。【结论】在本试验条件下,日粮添加低聚异麦芽糖对奶牛瘤胃菌群多样性无显著影响,纤维分解菌丰度影响差异不显著,淀粉分解菌丰度增加、乳酸生成菌丰度降低。 展开更多
关键词 低聚异麦芽糖 16SrRNA基因测序技术 奶牛 瘤胃细菌
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蚕沙替代精料对黑山羊瘤胃细菌数量及多样性的影响 预览 被引量:1
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作者 王鼎 尹永志 +4 位作者 郭春华 彭忠利 柏雪 付锡三 朱万岭 《西南民族大学学报:自然科学版》 CAS 2017年第4期338-345,共8页
旨在研究蚕沙替代精料对黑山羊瘤胃细菌多样性及瘤胃产甲烷杆菌、产琥珀酸杆菌和黄色瘤胃球菌数量的影响.试验选用35只体重相近(20±1.3kg)且健康的3月龄乐至黑山羊阉公羊,随机分为5个处理组,每组7只山羊,单栏单饲,对照组... 旨在研究蚕沙替代精料对黑山羊瘤胃细菌多样性及瘤胃产甲烷杆菌、产琥珀酸杆菌和黄色瘤胃球菌数量的影响.试验选用35只体重相近(20±1.3kg)且健康的3月龄乐至黑山羊阉公羊,随机分为5个处理组,每组7只山羊,单栏单饲,对照组饲喂基础精料,试验组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组)分别以25%、50%、75%、100%蚕沙替代基础精料,粗料各组相同,预试期20d,试验期90d.试验结束时每个处理组选择4头接近组内平均体重的羔羊屠宰取瘤胃液用于检测瘤胃微生物;采用Real Time-PCR法检测产甲烷杆菌、产琥珀酸杆菌和黄色瘤胃球菌的数量,采用PCR/DGGE法检测瘤胃细菌的多样性.结果表明:(1)蚕沙替代不同水平精料影响瘤胃产甲烷杆菌、产琥珀酸杆菌和黄色瘤胃球菌数量,其中随着蚕沙替代水平增加,产甲烷杆菌有减少趋势,而产琥珀酸杆菌有先减少后增加趋势,黄色瘤胃球菌先增加,而后降低再增加;(2)蚕沙替代不同水平精料影响瘤胃细菌多样性,其中随着蚕沙替代水平增加,瘤胃细菌多样性有减少趋势,若继续增加,几乎无变化.综上,蚕沙替代精料影响黑山羊瘤胃细菌数量和多样性,其中产甲烷杆菌、产琥珀酸杆菌和黄色瘤胃球菌数量变化趋势不尽相同,而细菌多样性有减少趋势. 展开更多
关键词 蚕沙 瘤胃细菌 数量 多样性
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基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构 预览 被引量:4
12
作者 陈芸 刘旗 +3 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 《湖南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2017年第3期286-291,共6页
采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌... 采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16SrDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338830条,聚类后得3400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰度为拟杆菌门的(占总序列数的40.87%),其次为厚壁菌门的(27.19%),样品F最高相对丰度为拟杆菌门的(47.12%),其次为变形菌门的(19.99%),再次为厚壁菌门的(18.05%),样品A厚壁菌门的相对丰度极显著高于样品F的(P〈0.01);4)在属水平上,样品A与样品F的最高相对丰度均为普雷沃氏菌属的(样品A的为25.54%,样品F的为27.67%),样品A中月形单胞菌属、丁酸弧菌属、瘤胃球菌属、琥珀酸弧菌属、琥珀酸菌属等的相对丰度显著高于样品F的(P〈0.05)。试验结果表明,川中黑山羊瘤胃中相对丰度最高的菌门为拟杆菌门,相对丰度最高的菌属为普雷沃氏菌属,且两瘤胃样品中部分细菌相对丰度间的差异显著。 展开更多
关键词 川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 MiSeq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属
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苦瓜皂苷和硝酸钠对山羊瘤胃细菌多样性的影响
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作者 康劲翮 曾波 +2 位作者 谭支良 刘金福 汤少勋 《基因组学与应用生物学》 CSCD 北大核心 2017年第9期3819-3825,共7页
瘤胃细菌在反刍动物瘤胃发酵中发挥着重要作用。本研究采用末端限制性片段长度多态性分析和克隆文库技术,研究了苦瓜皂苷和硝酸钠对体外发酵山羊瘤胃液细菌多样性的影响。结果表明,苦瓜皂苷显著影响6 h发酵液中细菌的丰富度指数和24 h... 瘤胃细菌在反刍动物瘤胃发酵中发挥着重要作用。本研究采用末端限制性片段长度多态性分析和克隆文库技术,研究了苦瓜皂苷和硝酸钠对体外发酵山羊瘤胃液细菌多样性的影响。结果表明,苦瓜皂苷显著影响6 h发酵液中细菌的丰富度指数和24 h发酵液中细菌的香农指数与丰富度指数,并对Rumen bacterium R-7、丁酸弧菌属细菌影响较大。硝酸钠对细菌的多样性指数没有显著影响,但也一定程度的影响细菌的群落结构和促进24 h发酵液中的白色瘤胃球菌的生长。 展开更多
关键词 苦瓜皂苷 硝酸钠 瘤胃细菌 T-RFLP
复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响 预览 被引量:2
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作者 陈芸 刘旗 +4 位作者 邓俊良 杨颜铱 高爽 陈憧 姚淑华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第11期1800-1808,共9页
试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精... 试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精料300、300、600和600 g·d-1·只-1,C与E组饲喂3 g·d-1·只-1复合抗菌肽。于21 d晨饲前每组随机选取3只采集瘤胃液,提取样品总DNA,扩增16S rRNA V4区,扩增产物采用Miseq平台测序。结果表明:1)共获得高质量序列629 634条,97%相似度下聚类后共获得13227个OTU。2)所得OTU经物种注释后,门水平上,除D组最优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)(34.30%)外,其余各组最优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes)(38.52%~43.68%),且添加复合抗菌肽显著降低变形菌门(Proteobacteria)与螺旋菌门(Spirochaetes)含量(P〈0.05);增加精料量显著增加厚壁菌门与螺旋菌门含量(P〈0.05),显著降低拟杆菌门与变形菌门含量(P〈0.05)。3)属水平上,普雷沃菌属(Prevotella)为所有样品中最优势菌属(25.54%~33.88%),添加抗菌肽后,琥珀酸菌属(Succiniclasticum)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)显著或极显著增加(P〈0.05或P〈0.01),琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)极显著降低(P〈0.01),且不受精料量影响,但月形单胞菌属(Selenomonas)与密螺旋体(Treponema)的变化趋势与精料量相关,正常精料组显著降低(P〈0.05),而双倍精料组无显著变化(P〉0.05);增加精料量显著增加普雷沃菌属、密螺旋体等含量(P〈0.05),降低琥珀酸弧菌属等含量(P〈0.05)。4)各样品在alpha多样性Chao、ACE、Shannon和Simpson指数上,差异不显著(P〉0.05)。表明添加复合抗菌肽降低变形菌门和螺旋菌门的相对含量,提高部分降解纤维菌属的含� 展开更多
关键词 山羊 瘤胃细菌 菌群结构 高通量测序 复合抗菌肽 精料
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疯草毒素对瘤胃细菌发酵的影响 预览
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作者 白延琴 时国峰 辛亚平 《中国牛业科学》 2017年第4期30-33,共4页
[目的]为了探讨疯草毒素对瘤胃细菌的生长和发酵的影响;[方法]分别配制含有0.18mg/mL、0.36mg/mL、0.72mg/mL、1.44mg/mL、2.88mg/mL、5.76mg/mL疯草毒素的培养基对瘤胃混合细菌进行体外培养。用分光光度计实时测定培养物的OD值,培养结... [目的]为了探讨疯草毒素对瘤胃细菌的生长和发酵的影响;[方法]分别配制含有0.18mg/mL、0.36mg/mL、0.72mg/mL、1.44mg/mL、2.88mg/mL、5.76mg/mL疯草毒素的培养基对瘤胃混合细菌进行体外培养。用分光光度计实时测定培养物的OD值,培养结束后用pH计和凯氏定氮法测定了发酵终产物的pH值和氨氮浓度。在正常生长条件下,对瘤胃细菌的生长曲线进行了测定。[结果]发现,在培养过程中,不同浓度的疯草毒素对瘤胃细菌的生长无显著影响(P〉0.05)。培养后培养液的pH值、氨氮浓度无显著差异(P〉0.05)。[结论]研究表明,体外培养条件下疯草毒素对瘤胃细菌的发酵无显著影响。瘤胃细菌的生长曲线为:Y=0.79/(1+7.81*e-0.942*x)(X=t,Y=OD值)。 展开更多
关键词 疯草毒素 瘤胃细菌 生长 发酵
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瘤胃中乳酸的代谢及其调控机制 预览 被引量:2
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作者 陈连民 王洪荣 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期972-980,共9页
有关瘤胃酸中毒发生机制研究表明,瘤胃乳酸的累积可能对酸中毒诱导起重要作用,而高精料日粮下瘤胃乳酸累积主要取决于瘤胃乳酸产生菌和乳酸利用菌间的平衡程度。本文综述了瘤胃微生物对乳酸的代谢机制,包括主要乳酸产生菌[溶纤维丁酸弧... 有关瘤胃酸中毒发生机制研究表明,瘤胃乳酸的累积可能对酸中毒诱导起重要作用,而高精料日粮下瘤胃乳酸累积主要取决于瘤胃乳酸产生菌和乳酸利用菌间的平衡程度。本文综述了瘤胃微生物对乳酸的代谢机制,包括主要乳酸产生菌[溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)、牛链球菌(Streptococcus bovis)、乳酸杆菌(Lactobacillus)]和主要乳酸利用菌[反刍兽新月单胞菌(Selenomonus ruminantium)、埃氏巨型球菌(Megasphaera elsdenii)],并简要概述了酸中毒的调控方法,旨在为反刍动物瘤胃酸中毒的乳酸中毒机制深入解析提供参考。 展开更多
关键词 反刍动物 瘤胃酸中毒 瘤胃微生物 乳酸
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瘤胃细菌GH48家族糖苷水解酶基因多样性 被引量:2
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作者 李劲亭 苏小运 +4 位作者 田彦 董志扬 胡松年 黄力 戴欣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期53-61,共9页
【目的】了解瘤胃细菌第48家族糖苷水解酶基因(GH48)多样性,为木质纤维素高效降解提供新的基因资源。【方法】通过基因序列比对,设计gh48的简并引物;同时提取两个瘤胃样品的总DNA和总RNA,并将总RNA逆转录成cDNA。以总DNA和cDNA为模板... 【目的】了解瘤胃细菌第48家族糖苷水解酶基因(GH48)多样性,为木质纤维素高效降解提供新的基因资源。【方法】通过基因序列比对,设计gh48的简并引物;同时提取两个瘤胃样品的总DNA和总RNA,并将总RNA逆转录成cDNA。以总DNA和cDNA为模板,通过PCR扩增分别建立克隆文库并对克隆文库进行测序;对所得序列进行out种类划分和聚类分析。【结果】本研究共得到了455条编码GH48家族蛋白的基因序列,核苷酸序列之间的相似性为58.65%-100%。对序列的进一步分析表明,89%可以作为区分其种类的界定标准。以此为依据确定所得到的基因序列分别编码66种不同的GH48家族蛋白,分别聚为5个相对独立的类群,其中新类群C中OTU65所代表的序列是cDNA克隆文库中的优势序列,分别占两个cDNA克隆文库的36.4%和19.5%。我们的结果揭示瘤胃细菌gh48基因具有丰富的多样性,同时,其中也存在优势表达的GH48家族蛋白。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 木质纤维素降解 GH48 糖苷水解酶 多样性
1株来自瘤胃液菌株RB1在降解秸秆中的作用 预览
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作者 杨梅玉 徐立新 +2 位作者 王庆洲 佟金 陈玉香 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2013年第4期14-17,共4页
木质纤维素中木糖残基大量乙酰化,导致半纤维素的降解受阻。半纤维素支链水解断裂,可以解除其空间位阻效应,利于木质纤维素彻底降解。采用产乙酰酯酶活力较高的菌株RB1降解玉米秸秆和水稻秸秆。研究结果表明,菌株RB1对玉米秸秆和水... 木质纤维素中木糖残基大量乙酰化,导致半纤维素的降解受阻。半纤维素支链水解断裂,可以解除其空间位阻效应,利于木质纤维素彻底降解。采用产乙酰酯酶活力较高的菌株RB1降解玉米秸秆和水稻秸秆。研究结果表明,菌株RB1对玉米秸秆和水稻秸秆中半纤维素降解率分别高达53.87%和51.67%。同时该菌株对秸秆中木质素降解率分别达到35.50%和35.01%。该菌株与其他降解纤维素能力较强的菌株共同发酵,会对木质纤维素类物质有更高降解率。该菌株在生物转化木质纤维素类物质方面,具有一定的潜在应用价值。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 玉米秸秆 水稻秸秆
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不同瘤胃细菌培养物添加水平对奶牛瘤胃发酵及BCP含量的影响 预览 被引量:1
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作者 朱继红 孙满吉 张永根 《中国饲料》 北大核心 2012年第10期10-13,共4页
本文旨在研究不同剂量的瘤胃细菌培养物对荷斯坦奶牛瘤胃发酵及菌体蛋白(BCP)含量的影响。试验采用单因素试验设计,选用4头装有永久性瘤胃瘘管,体况相近的荷斯坦奶牛,取其瘤胃液混匀,添加不同剂量的瘤胃细菌培养物进行体外培养,... 本文旨在研究不同剂量的瘤胃细菌培养物对荷斯坦奶牛瘤胃发酵及菌体蛋白(BCP)含量的影响。试验采用单因素试验设计,选用4头装有永久性瘤胃瘘管,体况相近的荷斯坦奶牛,取其瘤胃液混匀,添加不同剂量的瘤胃细菌培养物进行体外培养,分别为:对照组(OCUF/g),试验I组(添加量为3%,4.4×10^8CUF/g),试验Ⅱ组(添加量为5%.7.8×10^8CUF/g),试验Ⅲ组(添加量为10%,1.2×10^8CUF/g),每组分别设2、4、8、12、24、36、48h7个指标测定时间点,每个时间点3个重复。结果表明:(1)添加瘤胃细菌培养物使瘤胃液pH有所降低,但始终在6.5—7.0,对瘤胃内环境无不良影响;(2)添加3%的瘤胃细菌培养物显著降低氨态氮(NH3-N)的含量(P〈0.05),显著增加了培养液BCP的浓度(P〈0.05);(3)添加3%的瘤胃细菌培养物可一定程度增加总挥发性脂肪酸(TVFA)和乙酸浓度,但对其他各挥发性脂肪酸及乙酸/丙酸比值无显著影响。由此可见,添加3%剂量的瘤胃细菌培养物可改变瘤胃的发酵环境.提高BCP浓度。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 奶牛 体外发酵 菌体蛋白
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饲粮不同NFC/NDF对奶山羊瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌含量变化的影响 预览 被引量:2
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作者 赵培厅 刘大程 +5 位作者 高民 胡红莲 韩昊奇 周向丽 邓维康 王鹏飞 《畜牧与饲料科学》 2011年第9期 49-53,58,共6页
试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关... 试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关中奶山羊为试验动物,采用动物自身前后对照法,试验分4期进行,每期10d,依次饲喂NFC/NDF比分别为1.02(Ⅰ期)、1.24(Ⅱ期)、1.63(Ⅲ期)、2.58(Ⅳ期)的4种饲粮,以逐渐增加饲粮精料含量的方式诱导奶山羊发生SARA,并采用实时定量PCR技术对瘤胃内溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌的数量变化进行定量分析。结果表明:①随着饲粮NFC/NDF比的逐步升高,溶纤维丁酸弧菌和埃氏巨型球菌的数量均增加,但当饲粮NFC/NDF比升至2.58时,与其他试验期相比,埃氏巨型球菌的数量极显著增加(P〈0.01),而溶纤维丁酸弧菌的数量却极显著降低(P〈0.01);②牛链球菌的数量随着饲粮NFC/NDF比的逐步增加呈显著下降趋势(P〈0.05),但到第Ⅳ期又恢复到第Ⅰ期的数量。结果提示,当奶山羊发生SARA时,瘤胃牛链球菌的数量无明显变化,对低pH值敏感的溶纤维丁酸弧菌数量急剧下降,而耐酸性的埃氏巨型球菌数量表现为大幅增加。 展开更多
关键词 饲粮NFC/NDF比 亚急性瘤胃酸中毒 实时定量PCR 瘤胃细菌
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