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转录因子NKX2-5分子结构与调控心血管前体细胞的生物学功能 认领
1
作者 王宏书 韩燊 +5 位作者 刘卒 李晓芳 钟崇斌 李立峰 李亚雄 蒋立虹 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2021年第1期108-115,共8页
背景:NKX2-5是哺乳动物心脏发育过程中极其重要的一个转录调节因子。来自于模式动物如大鼠、小鼠及斑马鱼的研究表明,NKX2-5的缺失或功能异常,影响心脏发育,出现类似于人类先天性心脏病的病理表现。然而,对于NKX2-5在心脏发育过程中的... 背景:NKX2-5是哺乳动物心脏发育过程中极其重要的一个转录调节因子。来自于模式动物如大鼠、小鼠及斑马鱼的研究表明,NKX2-5的缺失或功能异常,影响心脏发育,出现类似于人类先天性心脏病的病理表现。然而,对于NKX2-5在心脏发育过程中的调控作用及具体机制,目前依然不明确。目的:对NKX2-5的分子结构、功能作用、上下游调控分子进行综述。方法:以检索词"NKX2-5、congenital heart disease、CHD、heart development"在PubMed数据库(网址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)中进行检索,文献发表截止时间为2019-04-01。通过对检索到的文献进行下载、阅读,排除与NKX2-5无关的文献、观点重复、结论一致的文献,对剩余的97篇文献进行详细阅读,提取文献中的观点、结论进行综述。结果与结论:①NKX2-5在心脏发育调控中起关键作用,其功能异常或基因突变导致心脏发育异常与功能异常,与人类先天性心脏病的发生密切相关;②NKX2-5调控作用的发挥依赖于其自身的多个功能性结构域。NKX2-5经转录翻译后进入细胞核内,通过与CO-factors结合或单独结合于特定DNA序列,对下游调控分子起激活或抑制作用,从而对心肌前体细胞的增殖、迁移、分化、功能产生影响,维持正确的心脏发育过程及心脏传导系统的正常发育与功能;③NKX2-5的转录、翻译、入核过程、转录激活或抑制作用的发挥也受到多种方式的调控,主要从染色质构象、启动子与增强子功能、RNA解链、转录后修饰、细胞核定位层面对NKX2-5进行调控。 展开更多
关键词 前体细胞 因子 转录因子 先天性心脏病 心脏发育 心肌 基因 细胞
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文章速递TGF-β1-regulated miR-3691-3p targets E2F3 and PRDM1 to inhibit prostate cancer progression 认领
2
作者 Yue-Mei Hu Xiao-Li Lou +9 位作者 Bao-Zhu Liu Li Sun Shan Wan Lei Wu Xin Zhao Qing Zhou Mao-Min Sun Kun Tao Yong-Sheng Zhang Shou-Li Wang 《亚洲男性学杂志:英文版》 SCIE CAS CSCD 2021年第2期188-196,共9页
Transforming growth factor-β1(TGF-β1)acts as a tumor promoter in advanced prostate cancer(PCa).We speculated that microRNAs(miRNAs)that are inhibited by TGF-β1 might exert anti-tumor effects.To assess this,we ident... Transforming growth factor-β1(TGF-β1)acts as a tumor promoter in advanced prostate cancer(PCa).We speculated that microRNAs(miRNAs)that are inhibited by TGF-β1 might exert anti-tumor effects.To assess this,we identified several miRNAs downregulated by TGF-β1 in PCa cell lines and selected miR-3691-3p for detailed analysis as a candidate anti-oncogene miRNA.miR-3691-3p was expressed at significantly lower levels in human PCa tissue compared with paired benign prostatic hyperplasia tissue,and its expression level correlated inversely with aggressive clinical pathological features.Overexpression of miR-3691-3p in PCa cell lines inhibited proliferation,migration,and invasion,and promoted apoptosis.The miR-3691-3p target genes E2F transcription factor 3(E2F3)and PR domain containing 1,with ZNF domain(PRDM1)were upregulated in miR-3691-3p-overexpressing PCa cells,and silencing of E2F3 or PRDM1 suppressed PCa cell proliferation,migration,and invasion.Treatment of mice bearing PCa xenografts with a miR-3691-3p agomir inhibited tumor growth and promoted tumor cell apoptosis.Consistent with the negative regulation of E2F3 and PRDM1 by miR-3691-3p,both proteins were overexpressed in clinical PCa specimens compared with noncancerous prostate tissue.Our results indicate that TGF-β1-regulated miR-3691-3p acts as an anti-oncogene in PCa by downregulating E2F3 and PRDM1.These results provide novel insights into the mechanisms by which TGF-β1 contributes to the progression of PCa. 展开更多
关键词 E2F transcription factor 3 miR-3691-3p PR domain containing 1 with ZNF domain prostate cancer transforming growth factor-β1
小鼠肥胖不同阶段相关免疫器官恒定自然杀伤T细胞(iNKT)的频率和亚群变化 认领
3
作者 陈冬志 张景楠 +4 位作者 赵会娟 梁蕊 滕景芳 高翔 孟明 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS 北大核心 2021年第1期12-22,共11页
目的采用高脂饮食喂养构建小鼠肥胖模型,观察恒定自然杀伤T细胞(iNKT)在肥胖不同阶段脂肪及相关组织中的频率及亚群变化,探讨iNKT细胞在肥胖脂肪组织慢性炎症中的作用。方法记录小鼠体重和精神状态以及葡萄糖耐量和胰岛素耐量的变化;苏... 目的采用高脂饮食喂养构建小鼠肥胖模型,观察恒定自然杀伤T细胞(iNKT)在肥胖不同阶段脂肪及相关组织中的频率及亚群变化,探讨iNKT细胞在肥胖脂肪组织慢性炎症中的作用。方法记录小鼠体重和精神状态以及葡萄糖耐量和胰岛素耐量的变化;苏木精-伊红(HE)染色观察脂肪组织病理变化;流式细胞术检测iNKT细胞和巨噬细胞频率和亚群的变化;CBA检测血清和脂肪组织淋巴细胞培养上清中细胞因子水平;Western blot检测脂肪组织中相关蛋白质的表达量差异。结果(1)高脂喂养4周后,脂肪细胞体积明显增大,炎性细胞浸润不明显;高脂喂养12周后,炎细胞浸润明显增多。(2)高脂喂养可致脂肪组织中iNKT细胞频率下降,iNKT1亚群比例增高,iNKT10亚群比例下降;胸腺iNKT1亚群比例升高,iNKT2亚群比例下降;脂肪组织中巨噬细胞频率及M1亚群比例增高,M2亚群比例下降,上述变化在高脂喂养12周组更为明显。(3)高脂喂养造成脂肪组织中E4BP4、精氨酸酶1(Arg-1)表达下降,诱导型一氧化氮合酶(iNOS)表达增高。(4)高脂喂养使小鼠血清和脂肪组织淋巴细胞培养上清中促炎性细胞因子明显增高,抑炎性细胞因子显著下降,且12周组变化更为明显。结论肥胖小鼠脂肪组织中iNKT1细胞亚群升高和iNKT10细胞亚群降低与M1型极化的增强可能存在密切关系,iNKT细胞亚群的失衡可能参与了肥胖小鼠脂肪组织慢性炎症的进展。 展开更多
关键词 肥胖 iNKT1/iNKT2/iNKT10 M1/M2巨噬细胞 慢性炎症 细胞因子 转录因子
茄科植物转录因子MYB基因家族的研究进展 认领
4
作者 赵恩鹏 成玉富 杨旭 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第5期1522-1530,共9页
植物转录因子MYB是能与真核基因启动子区域特异性相互作用的DNA结合蛋白,在植物中普遍存在,同时也是植物中最大的转录因子家族之一,MYB转录因子通过彼此之间或与其他相关蛋白之间的相互作用,能够调控基因的表达。迄今为止的研究表明,其... 植物转录因子MYB是能与真核基因启动子区域特异性相互作用的DNA结合蛋白,在植物中普遍存在,同时也是植物中最大的转录因子家族之一,MYB转录因子通过彼此之间或与其他相关蛋白之间的相互作用,能够调控基因的表达。迄今为止的研究表明,其成员广泛参与了茄科(Solanaceae)植物的生长发育、次级代谢、逆境胁迫应答和激素信号转导等进程。本研究主要对MYB转录因子的结构特点、生物学特性以及调控机制等方面归纳总结前人的研究成果,详细阐述国内外相关研究进展,以期为茄科植物分子育种方面的研究提供新的思路与方法。 展开更多
关键词 茄科植物 MYB 转录因子
全基因组鉴定和表达模式分析玉米AP2转录因子 认领
5
作者 郭海滨 郝立冬 魏雅冬 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第5期1402-1408,共7页
AP2属于AP2/ERF转录因子家族中的一个亚族,其主要特征是具有2个独立的AP2/ERF结构域。本研究利用生物信息学的方法在玉米基因组中鉴定到22个玉米AP2转录因子,并对其理化性质、基因结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行了分析。... AP2属于AP2/ERF转录因子家族中的一个亚族,其主要特征是具有2个独立的AP2/ERF结构域。本研究利用生物信息学的方法在玉米基因组中鉴定到22个玉米AP2转录因子,并对其理化性质、基因结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行了分析。结果表明,玉米AP2家族成员的理化性质差异较大,且都属于亲水性蛋白。系统进化分析表明玉米AP2家族基因被分为euANT、baselANT、euAP2三个亚组,相同亚组的基因具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现玉米AP2家族基因中不存在基因串联重复事件,只存在两对片段复制事件,同时结果表明禾本科AP2家族基因之间具有很好的共线性关系。表达模式分析发现ZmAP2基因广泛参与植物的生长发育。转录组数据分析发现,在盐胁迫下一共鉴定到16个ZmAP2基因。本研究为进一步研究玉米AP2转录因子家族的生物学功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 AP2 玉米 盐胁迫 转录因子 表达分析
The role of pineal microRNA-325 in regulating circadian rhythms after neonatal hypoxic-ischemic brain damage 认领
6
作者 Ning Sha Hua-Wei Wang +13 位作者 Bin Sun Min Gong Po Miao Xiao-Lu Jiang Xiao-Feng Yang Mei Li Li-Xiao Xu Chen-Xi Feng Yuan-Yuan Yang Jie Zhang Wen-Jing Zhu Yuan-Yuan Gao Xing Feng Xin Ding 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第10期2071-2077,共7页
Circadian rhythm disorder is a common,but often neglected,consequence of neonatal hypoxic-ischemic brain damage(HIBD).However,the underlying molecular mechanisms remain largely unknown.We previously showed that,in a r... Circadian rhythm disorder is a common,but often neglected,consequence of neonatal hypoxic-ischemic brain damage(HIBD).However,the underlying molecular mechanisms remain largely unknown.We previously showed that,in a rat model of HIBD,up-regulation of microRNA-325(miR-325)in the pineal gland is responsible for the suppression of Aanat,a key enzyme involved in melatonin synthesis and circadian rhythm regulation.To better understand the mechanism by which miR-325 affects circadian rhythms in neonates with HIBD,we compared clinical samples from neonates with HIBD and samples from healthy neonates recruited from the First Affiliated Hospital of Soochow University(Dushuhu Branch)in 2019.We found that circulating miR-325 levels correlated positively with the severity of sleep and circadian rhythm disorders in neonates with HIBD.Furthermore,a luciferase reporter gene assay revealed that LIM homeobox 3(LHX3)is a novel downstream target of miR-325.In addition,in miR-325 knock-down mice,the transcription factor LHX3 exhibited an miR-325-dependent circadian pattern of expression in the pineal gland.We established a neonatal mouse model of HIBD by performing doublelayer ligation of the left common carotid artery and exposing the pups to a low-oxygen environment for 2 hours.Lhx3 mRNA expression was significantly down-regulated in these mice and partially rescued in miR-325 knockout mice subjected to the same conditions.Finally,we showed that improvement in circadian rhythm-related behaviors in animals with HIBD was dependent on both miR-325 and LHX3.Taken together,our findings suggest that the miR-325-LHX3 axis is responsible for regulating circadian rhythms and provide novel insights into the identification of potential therapeutic targets for circadian rhythm disorders in patients with neonatal HIBD.The clinical trial was approved by Institutional Review Board of Children’s Hospital of Soochow University(approval No.2015028)on July 20,2015.Animal experiments were approved by Animal Care and Use Committee,School of Medicine 展开更多
关键词 brain injury circadian rhythm hypoxic-ischemic brain damage miRNA NEONATE pineal gland SLEEP transcription factor
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Overexpression of Arabidopsis thaliana malonyl-CoA synthetase gene enhances cold stress tolerance by activating mitogen-activated protein kinases in plant cells 认领
7
作者 Wei Tang Anna Y.Tang 《林业研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第2期741-753,共13页
Malonyl-CoA synthetases may modulate cell responses to abiotic stress by regulating stress-related signaling transduction pathways or activating expression of transcription factors.However,the molecular mechanism of c... Malonyl-CoA synthetases may modulate cell responses to abiotic stress by regulating stress-related signaling transduction pathways or activating expression of transcription factors.However,the molecular mechanism of cold stress tolerance enhanced by malonyl-CoA synthetase is not fully understood.Here,we report that overexpression of the Arabidopsis thaliana malonyl-CoA synthetase gene AAE13.1 resulted in increased cell viability and growth rate and decreased thiobarbituric acid reactive substances under cold stress in rice(Oryza sativa L.),tobacco(Nicotiana tabacum),and slash pine(Pinus elliottii Engelm.).AAE13.1 was associated with cold stress tolerance by increasing the activity of ascorbate peroxidase,catalase,polyphenol oxidase,and peroxidase and the accumulation of acid phosphatase and alkaline phosphatase.Among six rice mitogenactivated protein kinase(MAPK)genes examined,AAE13.1 overexpression increased the expression of OsMAPK genes during cold stress.AAE13.1 activated expression of stressresponse genes OsMAPK1,OsMAPK2,and OsMAPK3,indicating that AAE13.1 enhances cold stress tolerance by regulating expression of MAPK genes in plant cells.These results increase our understanding of cold stress tolerance in species of monocotyledons,dicotyledons,and gymnosperms. 展开更多
关键词 Cold stress Malonyl-CoA synthetase gene MAPK transcription factor PHOSPHATASE PINUS
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小麦WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析 认领
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作者 武强强 张凤洁 +5 位作者 董浩欢 卢平 樊婕 李雪垠 王爱萍 董琦 《激光生物学报》 CAS 2021年第1期67-74,共8页
小麦是全球主要粮食作物之一。本研究运用生物信息学技术手段对普通小麦(Triticum aestivum L.)的WOX基因进行了全基因组鉴定、系统发育树构建、序列分析。结果显示:小麦基因组一共包含了26个WOX基因,其中在Phytozome数据库中收录有序... 小麦是全球主要粮食作物之一。本研究运用生物信息学技术手段对普通小麦(Triticum aestivum L.)的WOX基因进行了全基因组鉴定、系统发育树构建、序列分析。结果显示:小麦基因组一共包含了26个WOX基因,其中在Phytozome数据库中收录有序列信息的有20个,可分为3个亚族,各亚族内的WOX基因具有相似的基因结构,内含子相位为0或1;该家族基因的蛋白质基序Motif 1、Motif 2、Motif 5和Motif 9较为保守,其中Motif 1和Motif 2推测为核心基序;该家族基因启动子包含ABRE、CAT-box、CGTCA-motif、RY-element等元件,说明小麦WOX基因可能参与调控胚乳或种子的发育,或参与分生组织的形成;TaWOX6、TaWOX8、TaWOX10可能参与小麦穗和茎秆的发育过程;TaWOX15、TaWOX18、TaWOX20在小麦胚乳中的表达量非常高,而在别的部位的表达量几乎为零,说明这3个基因与小麦胚乳的形成发育密切相关。该研究结果为进一步探讨小麦WOX基因的功能与分子作用机理奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 WOX 转录因子 生物信息学 全基因组鉴定
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香蕉MaWRKY1转录因子在果实和幼苗诱导抗冷性中表达分析 认领
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作者 洪克前 谷会 陈丽 《热带作物学报》 北大核心 2021年第2期303-309,共7页
为了探究香蕉MaWRKY1转录因子在抗冷诱导过程中的作用,采用外源过氧化氢(H_(2)O_(2))、茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)和丙烯(propylene)等处理香蕉果实,同时采用外源H_(2)O_(2)、MeJA和脱落酸(ABA)等处理香蕉幼苗,处理结束后,将实验材... 为了探究香蕉MaWRKY1转录因子在抗冷诱导过程中的作用,采用外源过氧化氢(H_(2)O_(2))、茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)和丙烯(propylene)等处理香蕉果实,同时采用外源H_(2)O_(2)、MeJA和脱落酸(ABA)等处理香蕉幼苗,处理结束后,将实验材料放置于7℃下贮藏,通过Northern blot技术分析实验材料中MaWRKY1基因表达变化。H_(2)O_(2)、MeJA、SA和propylene等处理均使果实冷害症状推迟2 d出现;处理组果实中MaWRKY1 mRNA积累均早且高于对照组。H_(2)O_(2)、MeJA和ABA等处理也均使幼苗推迟18 h显现冷害症状;处理组幼苗中MaWRKY1基因表达提前且表达量相对较高。相比较这几种外源性调节剂,MeJA和H_(2)O_(2)处理的香蕉果实和幼苗所获得的抗冷效果优于其他生长调节剂,同时MaWRKY1基因表达水平也比其他处理组提前或表达量更高,推测MaWRKY1可能更加积极响应MeJA或H_(2)O_(2)诱导香蕉耐冷性。 展开更多
关键词 香蕉 WRKY1 转录因子 耐冷性
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过表达c-SKI抑制异丙肾上腺素诱导的小鼠心肌纤维化 认领
10
作者 张颖 向燕 +1 位作者 张岳 王娟 《基础医学与临床》 2021年第3期364-369,共6页
目的探讨原癌基因c-SKI在异丙肾上腺素(ISO)诱导的小鼠心肌纤维化中的作用及机制。方法将小鼠分为对照组(control组)、模型组(model组)、c-SKI基因感染模型组(LV-SKI组)及对照病毒感染模型组(LV-NC组),每组10只。模型组采用皮下注射ISO ... 目的探讨原癌基因c-SKI在异丙肾上腺素(ISO)诱导的小鼠心肌纤维化中的作用及机制。方法将小鼠分为对照组(control组)、模型组(model组)、c-SKI基因感染模型组(LV-SKI组)及对照病毒感染模型组(LV-NC组),每组10只。模型组采用皮下注射ISO 30 d,首次剂量为5 mg/kg,后续以2.5 mg/kg。2周后LV-SKI组和LV-NC组于18、21、24、27和30 d分别尾静脉注射c-SKI慢病毒和对照病毒,剂量均为100μL,滴度1×108 TU。HE染色和Masson染色观察心肌组织病理学;ELISA检测心肌组织中Ⅰ型和Ⅲ型胶原蛋白含量;Western blot检测c-SKI、间质细胞标志物波形蛋白(vimentin)、α-SMA、内皮细胞标志物CD31以及转录因子Snail、Twist及Slug的表达。结果与对照组相比,模型组小鼠心肌纤维组织中c-SKI的表达呈时间依赖性下降(P<0.01);模型组心肌细胞排列紊乱,间质显著增多,Ⅰ型和Ⅲ型胶原蛋白含量增加(P<0.01);心肌组织vimentin、α-SMA、Snail、Twist及Slug表达均上调,CD31蛋白表达下调(P<0.05)。过表达c-SKI后,与LV-NC组比较,小鼠心肌结构趋于整齐,间质胶原纤维减少,心肌组织中Ⅰ型和Ⅲ型胶原蛋白减少(P<0.01);Vimentin、α-SMA蛋白的表达下调(P<0.05);CD31蛋白的表达上调(P<0.05);同时转录因子Snail、Twist和Slug蛋白的表达也随之下调(P<0.01)。结论小鼠心肌纤维化进程中c-SKI表达下调,而过表达c-SKI能够通过抑制内皮-间充质转化(End-MT)改善ISO诱导的心肌纤维化。 展开更多
关键词 c-SKI 心肌纤维化 内皮-间充质转化(End-MT) 转录因子
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骨骼微环境中谁决定间充质干细胞的分化命运 认领
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作者 张纯希 李想 +3 位作者 周钰翔 刘禛 杨于权 贾浩 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2021年第25期4045-4052,共8页
背景:骨髓间充质干细胞是骨髓组织中的一群多能干细胞,是成骨细胞、脂肪细胞和软骨细胞的共同祖细胞,遗传信息和外界刺激共同参与骨髓间充质干细胞分化命运的调控,而其分化失调与多种病理生理过程相关,例如骨质疏松、肥胖和衰老等。中... 背景:骨髓间充质干细胞是骨髓组织中的一群多能干细胞,是成骨细胞、脂肪细胞和软骨细胞的共同祖细胞,遗传信息和外界刺激共同参与骨髓间充质干细胞分化命运的调控,而其分化失调与多种病理生理过程相关,例如骨质疏松、肥胖和衰老等。中国国家卫生健康委员会2018年调查显示,骨质疏松已经成为中国中老年人群的重要健康问题,50岁以上男性骨质疏松症患病率为6.0%,女性患病率则达到32.1%,65岁以上女性的骨质疏松症患病率更是达到51.6%。目的:总结骨髓间充质干细胞分化的调控机制,更好地理解骨质疏松等疾病的发生发展,从而为其治疗提供新思路。方法:检索中国知网全文数据库、PubMed数据库自1997年1月至2020年5月所发表的相关文献,以"BMSCs,cell differentiation,osteoblasts,chondrocytes,adipocytes"为英文检索词,"骨髓间充质干细胞,细胞分化,成骨细胞,软骨细胞,脂肪细胞"为中文检索词。根据纳入与排除标准对所有文章进行初筛后,保留相关性较高的文章进行综述。结果与结论:BMPs、Wnt和Notch等信号通路,Runx2、C/EBP和PPARγ等转录因子,非编码RNA,激素及线粒体等众多因素共同参与骨髓间充质干细胞分化的调控,任何环节的异常都可能导致病理状态的发生,骨髓间充质干细胞与新型材料的联合应用可能为骨质疏松等疾病提供新的治疗思路。 展开更多
关键词 干细胞 骨髓间充质干细胞 分化 命运决定 信号通路 转录因子 综述
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低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征 认领
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作者 杜文丽 陈中钐 +3 位作者 许端祥 徐同伟 高山 温庆放 《核农学报》 CAS 北大核心 2021年第2期338-348,共11页
苦瓜在生长季节遇到低温会影响其生长发育和产量,限制了种植分布区域。为了研究苦瓜耐寒性的分子机制,本研究以苦瓜自交系43为试验材料,在8℃低温胁迫处理后观察其表型并测定相关生理生化指标,再利用转录组测序技术从生理角度结合分子... 苦瓜在生长季节遇到低温会影响其生长发育和产量,限制了种植分布区域。为了研究苦瓜耐寒性的分子机制,本研究以苦瓜自交系43为试验材料,在8℃低温胁迫处理后观察其表型并测定相关生理生化指标,再利用转录组测序技术从生理角度结合分子水平对苦瓜低温胁迫机制进行生物信息学分析。结果表明,在8℃低温胁迫下,苦瓜表现出耐低温适应性,在低温胁迫下丙二醛(MDA)含量、脯氨酸含量及电解质渗透率均呈现显著变化。分析了低温胁迫0和12 h后的转录组变化,结果发现低温胁迫处理后有916个基因上调,369个基因下调。对差异表达基因进行通路注释分析,发现大量与低温胁迫相关的代谢途径。进一步筛选到10个在其他物种报道过可能与冷胁迫相关的基因,包括MYB、WRKY以及NAC转录因子等。对植物耐低温相关的候选基因进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)表达谱分析,结果与生理表型变化相吻合,同时进一步证实了RNA-seq数据的准确性。本研究基于全基因组水平分析苦瓜在低温胁迫下的转录组变化,以及耐低温相关基因动态变化和生理反应的分子机制,为揭示苦瓜中的耐寒性机理和筛选遗传改良候选基因提供了一定基础。 展开更多
关键词 苦瓜 低温胁迫 转录组 转录因子 表达分析
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Argon reduces microglial activation and inflammatory cytokine expression in retinal ischemia/reperfusion injury 认领 被引量：1
13
作者 Ulrich Goebel Stefanie Scheid +4 位作者 Sashko Spassov Nils Schallner Jakob Wollborn Hartmut Buerkle Felix Ulbrich 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第1期192-198,共7页
We previously found that argon exerts its neuroprotective effect in part by inhibition of the toll-like receptors(TLR)2 and 4.The downstream transcription factors signal transducer and activator of transcription 3(STA... We previously found that argon exerts its neuroprotective effect in part by inhibition of the toll-like receptors(TLR)2 and 4.The downstream transcription factors signal transducer and activator of transcription 3(STAT3)and nuclear factor kappa B(NF-κB)are also affected by argon and may play a role in neuroprotection.It also has been demonstrated that argon treatment could mitigate brain damage,reduce excessive microglial activation,and subsequently attenuate brain inflammation.Despite intensive research,the further exact mechanism remains unclear.In this study,human neuroblastoma cells were damaged in vitro with rotenone over a period of 4 hours(to mimic cerebral ischemia and reperfusion damage),followed by a 2-hour post-conditioning with argon(75%).In a separate in vivo experiment,retinal ischemia/reperfusion injury was induced in rats by increasing intraocular pressure for 1 hour.Upon reperfusion,argon was administered by inhalation for 2 hours.Argon reduced the binding of the transcription factors signal transducer and activator of transcription 3,nuclear factor kappa B,activator protein 1,and nuclear factor erythroid 2-related factor 2,which are involved in regulation of neuronal damage.Flow cytometry analysis showed that argon downregulated the Fas ligand.Some transcription factors were regulated by toll-like receptors;therefore,their effects could be eliminated,at least in part,by the TLR2 and TLR4 inhibitor oxidized phospholipid 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphorylcholine(OxPAPC).Argon treatment reduced microglial activation after retinal ischemia/reperfusion injury.Subsequent quantitative polymerase chain reaction analysis revealed a reduction in the pro-inflammatory cytokines interleukin(IL-1α),IL-1β,IL-6,tumor necrosis factorα,and inducible nitric oxide synthase.Our results suggest that argon reduced the extent of inflammation in retinal neurons after ischemia/reperfusion injury by suppression of transcription factors crucial for microglial activation.Argon has no known side effects o 展开更多
关键词 ARGON ischemia/reperfusion injury MICROGLIA NEUROINFLAMMATION NEUROPROTECTION noble gas SH-SY5Y toll-like receptor transcription factor
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氮响应转录因子Zm NLP5影响玉米根系生长的功能研究 认领
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作者 葛敏 王元琮 +3 位作者 宁丽华 胡梦梅 石习 赵涵 《作物学报》 CAS 北大核心 2021年第5期807-813,共7页
研究作物氮高效机制并挖掘利用其中重要的调控基因,对我国农业绿色发展具有重要意义。前期我们发现氮响应转录因子ZmNLP5调控亚硝酸还原酶基因的表达,对玉米氮素吸收利用具有促进作用,但其调控机制尚未明确。基于此,本研究以ZmNLP5基因... 研究作物氮高效机制并挖掘利用其中重要的调控基因,对我国农业绿色发展具有重要意义。前期我们发现氮响应转录因子ZmNLP5调控亚硝酸还原酶基因的表达,对玉米氮素吸收利用具有促进作用,但其调控机制尚未明确。基于此,本研究以ZmNLP5基因突变体(zmnlp5)和野生型(WT)植株为研究材料,深入解析ZmNLP5影响玉米氮素吸收利用的生理机制。足氮(sufficient nitrogen, SN)和低氮(deficient nitrogen, DN)条件下研究材料表型分析发现, DN条件下相对于WT植株, zmnlp5植株根长显著降低。根部不同区域ZmNLP5表达量分析发现, ZmNLP5主要在根尖区域表达。不同亚硝酸盐浓度处理下,研究材料的根长和根尖区域亚硝酸盐含量分析发现,当亚硝酸盐的浓度高于2mmol L~(-1)时,zmnlp5突变体根长相对于WT显著降低,zmnlp5植株根尖区域亚硝酸盐积累量显著高于WT。SN和DN条件下研究材料根部亚硝酸盐含量检测发现, DN条件zmnlp5植株根尖区域所积累的亚硝酸盐也显著高于WT。综上所述,转录因子ZmNLP5在玉米植株响应低氮环境根部伸长生长中发挥重要功能,该结果为玉米氮高效育种提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 玉米 氮素 转录因子 氮响应 根长
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矮牵牛BBX基因家族成员鉴定及对不同光质的表达响应 认领
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作者 符真珠 蒋卉 +8 位作者 王锐 王慧娟 李艳敏 徐梦岚 晁亚琮 董晓宇 高杰 王利民 张和臣 《植物生理学报》 CAS 北大核心 2021年第1期50-58,共9页
BBXs (B-box zinc finger genes)是植物中一类重要的编码转录因子的基因,它们在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究对两个矮牵牛野生种(Petunia inflata和P. axillaris)基因组中的BBXs基因家族成员进行了鉴定和分析... BBXs (B-box zinc finger genes)是植物中一类重要的编码转录因子的基因,它们在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究对两个矮牵牛野生种(Petunia inflata和P. axillaris)基因组中的BBXs基因家族成员进行了鉴定和分析;其中在P. axillaris基因组中共发现有29个成员,在P. inflata有32个成员。氨基酸序列比对和进化树分析表明,它们共分化形成了5个亚家族,其中含有2个B-box结构域的有3个亚家族,分别是G1、G2和G4;只有1个B-box结构域的有G3和G5。另外,在G1、G2和G3亚家族中的成员除了含有B-box结构域,在C端还有一个相对保守的CCT结构域。对不同光质条件下矮牵牛花瓣中的BBXs基因进行转录分析,发现共有9个成员出现了差异性表达;其中BBX18、BBX24和BBX25在红光条件下表达明显减弱,与矮牵牛花色积累的表型趋势一致,推测它们可能参与不同光质条件下花青苷的调控过程。 展开更多
关键词 转录因子 BBX基因 基因表达 矮牵牛 光质
Functional Characterization of SmbHLH13 in Anthocyanin Biosynthesis and Flowering in Eggplant 认领
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作者 Haochun Xi Yongjun He Huoying Chen 《Horticultural Plant Journal(园艺学报:英文版)》 SCIE 2021年第1期73-80,共8页
Anthocyanin is abundant in a few vegetables,including eggplant.It protects plants from abiotic stress and benefits human health,making the research of anthocyanin biosynthesis increasingly important.Flowering time is ... Anthocyanin is abundant in a few vegetables,including eggplant.It protects plants from abiotic stress and benefits human health,making the research of anthocyanin biosynthesis increasingly important.Flowering time is an important reference for judging reproduction and adaptability,which can guide plant production.In this study,SmbHLH13 from eggplant was identified.Yeast one-hybrid and dual-luciferase assays showed that SmbHLH13 binded and activated the expression of structural genes SmCHS and SmF3H in anthocyanin biosynthesis and it also was bound to the promoter of the key gene SmFT in flowering.Furthermore,genetic transformation of Arabidopsis revealed that overexpression of SmbHLH13 enhanced anthocyanin accumulation and delayed flowering.These results demonstrated that SmbHLH13 might promote anthocyanin accumulation through positive regulation of SmCHS and SmF3H.Moreover,SmbHLH13 might have a role in delaying eggplant flowering. 展开更多
关键词 EGGPLANT Solanum melongena transcription factor anthocyanin biosynthesis FLOWERING
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肺炎克雷伯菌CRP蛋白表达与纯化及生物学特征分析 认领
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作者 徐丽 邱雪梅 +3 位作者 骆海龙 杨靖 李蓓 汪静杰 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第4期98-102,127,共6页
目的:原核表达获得肺炎克雷伯菌KP1_RS23625基因(crp)编码的CRP蛋白,并解析CRP蛋白具体的生物学功能。方法:首先克隆肺炎克雷伯菌crp基因,并亚克隆至pET-28a(+)质粒构建重组蛋白表达载体;然后体外原核诱导表达、纯化目的蛋白并进行SDS-P... 目的:原核表达获得肺炎克雷伯菌KP1_RS23625基因(crp)编码的CRP蛋白,并解析CRP蛋白具体的生物学功能。方法:首先克隆肺炎克雷伯菌crp基因,并亚克隆至pET-28a(+)质粒构建重组蛋白表达载体;然后体外原核诱导表达、纯化目的蛋白并进行SDS-PAGE电泳分析。进一步通过生物学信息方法分析CRP蛋白的生物学功能:利用ProtParam、Protscale、SignalP4.1 Service、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL软件分别分析目的蛋白理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区域、二级与三级结构等一般生物学特征;并借助CDD数据库、Net Phos 3.1 Sever在线软件预测蛋白的功能结构域、磷酸化位点等功能特征;进一步利用ATRING 11.0交互式数据库进行蛋白质交联互作分析。结果:成功构建了重组目的蛋白表达载体pET-28a-crp,并通过原核诱导表达与镍柱亲和吸附法表达、纯化获得CRP目的蛋白;蛋白电泳结果显示CRP蛋白为水溶性蛋白,包括标签蛋白(约4 kDa)的重组目的蛋白分子质量约27 kDa。对CRP蛋白的生物信息学分析结果显示:CRP蛋白大小23.65 kDa、为亲水性蛋白;无跨膜结构域、无信号肽;蛋白二级结构主要由α螺旋与不规则卷曲构成,其中α-螺旋占比40%以上,结构较松散;同时成功构建了三级结构模型;CRP蛋白结构域分析表明含有1个功能结构域,属PRK11753超级家族;修饰位点及蛋白注释分析显示目的蛋白含20个磷酸化位点,与多个蛋白具有交互作用。结论:本研究利用基因工程方法成功获得了较高纯度肺炎克雷伯菌CRP蛋白,并通过生物信息学手段解析了其生物学特征,为肺炎克雷伯菌感染的临床治疗提供理论基础。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 CRP蛋白 转录因子 原核表达 生物信息学
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植物木质部次生细胞壁加厚调控的研究进展 认领
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作者 文静 王春涛 杨永平 《西南林业大学学报:自然科学》 CAS 北大核心 2021年第2期182-188,共7页
木质部是维管植物运输土壤水分和可溶性物质的复合组织,由管状分子、木薄壁细胞以及木纤维3部分组成,其中管状分子和木纤维细胞均能发生次生细胞壁加厚,为植物生长发育提供必要的支撑。对木质部次生细胞壁加厚转录因子的共同调控网络的... 木质部是维管植物运输土壤水分和可溶性物质的复合组织,由管状分子、木薄壁细胞以及木纤维3部分组成,其中管状分子和木纤维细胞均能发生次生细胞壁加厚,为植物生长发育提供必要的支撑。对木质部次生细胞壁加厚转录因子的共同调控网络的研究进展进行综述,其中以NAC-MYB为核心的转录调控网络在该过程中扮演着关键性的作用;NAC转录因子家族可根据其调控部位分为VND基因家族、NST1/NST3转录因子和NST1/NST2转录因子,并直接调控下游MYB转录因子家族的表达,影响次生细胞壁的加厚。并以拟南芥、水稻、杨树等模式植物为例梳理调控机制,以便能更好的加深对植物木质部次生细胞壁加厚过程中转录调控的理解。 展开更多
关键词 木质部 次生细胞壁 转录因子 调控网络
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烟草转录因子NtMYB4a响应干旱、低温和茉莉酸甲酯胁迫的功能分析 认领
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作者 蒋悦 罗倩 +2 位作者 姜超英 孙光军 聂琼 《作物研究》 2021年第1期43-49,共7页
MYB转录因子是植物体内最大的一类转录因子,在植物应对非生物胁迫中发挥重要作用。为探讨烟草NtMYB4a基因在响应干旱、低温和茉莉酸甲酯胁迫下的功能,以NtMYB4a基因的过表达和敲除突变体及野生型烟株为材料,采用RT-qPCR技术分析了干旱... MYB转录因子是植物体内最大的一类转录因子,在植物应对非生物胁迫中发挥重要作用。为探讨烟草NtMYB4a基因在响应干旱、低温和茉莉酸甲酯胁迫下的功能,以NtMYB4a基因的过表达和敲除突变体及野生型烟株为材料,采用RT-qPCR技术分析了干旱、低温和茉莉酸甲酯处理0、1、3、6、12、24和48 h后烟草叶片中NtMYB4a的表达变化以及脯氨酸和丙二醛含量差异。结果显示:过表达突变体中NtMYB4a的表达量极显著高于野生型烟株,且不易受干旱、低温和茉莉酸甲酯胁迫的影响,烟叶中的脯氨酸含量增高,丙二醛含量降低;而基因敲除突变体中NtMYB4a的表达量显著低于野生型烟株,且易受干旱、低温和茉莉酸甲酯胁迫的影响,烟叶中的脯氨酸含量降低,丙二醛含量增加。此外,利用Plant CARE软件分析了NtMYB4a启动子区域,结果显示该区域含有赤霉素、生长素、脱落酸、茉莉酸甲酯、光、干旱、低温等激素和非生物胁迫相关的顺式作用元件。这些结果表明,NtMYB4a基因的表达受干旱、低温胁迫和茉莉酸甲酯的诱导,可能与烟株的抗逆性相关。 展开更多
关键词 烟草 转录因子 NtMYB4a 非生物胁迫
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Comparative transcriptomic analysis of rat versus mouse cerebral cortex after traumatic brain injury 认领
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作者 Meng-Shi Yang Xiao-Jian Xu +2 位作者 Bin Zhang Fei Niu Bai-Yun Liu 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第7期1235-1243,共9页
The heterogeneity of traumatic brain injury(TBI)-induced secondary injury has greatly hampered the development of effective treatments for TBI patients.Targeting common processes across species may be an innovative st... The heterogeneity of traumatic brain injury(TBI)-induced secondary injury has greatly hampered the development of effective treatments for TBI patients.Targeting common processes across species may be an innovative strategy to combat debilitating TBI.In the present study, a cross-species transcriptome comparison was performed for the first time to determine the fundamental processes of secondary brain injury in Sprague-Dawley rat and C57/BL6 mouse models of TBI, caused by acute controlled cortical impact.The RNA sequencing data from the mouse model of TBI were downloaded from the Gene Expression Omnibus(ID: GSE79441) at the National Center for Biotechnology Information.For the rat data, peri-injury cerebral cortex samples were collected for transcriptomic analysis 24 hours after TBI.Differentially expressed gene-based functional analysis revealed that common features between the two species were mainly involved in the regulation and activation of the innate immune response, including complement cascades as well as Toll-like and nucleotide oligomerization domain-like receptor pathways.These findings were further corroborated by gene set enrichment analysis.Moreover, transcription factor analysis revealed that the families of signal transducers and activators of transcription(STAT), basic leucine zipper(BZIP), Rel homology domain(RHD), and interferon regulatory factor(IRF) transcription factors play vital regulatory roles in the pathophysiological processes of TBI, and are also largely associated with inflammation.These findings suggest that targeting the common innate immune response might be a promising therapeutic approach for TBI.The animal experimental procedures were approved by the Beijing Neurosurgical Institute Animal Care and Use Committee(approval No.201802001) on June 6, 2018. 展开更多
关键词 cognitive impairment cross-species comparison gene set enrichment analysis INFLAMMATION innate immune neurodegenerative disease secondary injury transcription factor TRANSCRIPTOME traumatic brain injury
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