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大鼠脊髓损伤后脊髓组织中上调差异基因的生物信息学分析 预览
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作者 钟占琼 薛清彩 +6 位作者 易晓红 黄聪 于海艳 刘伟伟 陈继兰 夏军 张晓 《中国康复理论与实践》 CSCD 北大核心 2019年第6期621-629,共9页
目的探究大鼠脊髓损伤后脊髓组织中差异表达的上调基因及功能。方法采用改良Allen法制备雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型,应用基因芯片技术检测在大鼠脊髓损伤后脊髓中差异基因的变达,运用基因本体论和基因组百科全书数据库分析差... 目的探究大鼠脊髓损伤后脊髓组织中差异表达的上调基因及功能。方法采用改良Allen法制备雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型,应用基因芯片技术检测在大鼠脊髓损伤后脊髓中差异基因的变达,运用基因本体论和基因组百科全书数据库分析差异上调基因、功能定位与通路。结果脊髓组织总核糖核酸质量检测结果合格;基因芯片检测结果显示上调差异基因1874个,下调差异基因2348个;生物信息学分析上调差异基因的生物学过程、细胞组分和分子功能,涉及凋亡、免疫反应、炎症等,通路分析主要涉及磷脂酰肌醇三激酶-蛋白激酶B信号通路和Toll样受体信号通路等。结论脊髓损伤后,上调差异表达基因可能参与脊髓损伤后的继发性反应,如炎症、免疫应答、缺氧等,继而影响脊髓损伤后的运动功能和感觉功能。 展开更多
关键词 脊髓损伤 上调基因 生物信息学
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黄绿卷毛菇开伞期上调基因的分析研究及验证 预览
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作者 郭璟 谢占玲 +1 位作者 秦日甜 卢玉丽 《青海大学学报:自然科学版》 2017年第5期27-34,共8页
为了解与黄绿卷毛菇生长发育相关基因的结构特征,探究其生长发育机制,完善其遗传背景。基于黄绿卷毛菇幼年期和开伞期的转录组测序结果,利用数据库对黄绿卷毛菇上调基因进行NR,NT注释,最后对测序结果进行荧光定量PCR验证。结果表明:经... 为了解与黄绿卷毛菇生长发育相关基因的结构特征,探究其生长发育机制,完善其遗传背景。基于黄绿卷毛菇幼年期和开伞期的转录组测序结果,利用数据库对黄绿卷毛菇上调基因进行NR,NT注释,最后对测序结果进行荧光定量PCR验证。结果表明:经转录组测序结果分析得到196个上调基因,将其通过NR,NT数据库的注释,编码蛋白,预测蛋白,假定蛋白和未知蛋白分别占30.10%,28.06%,24.48%和17.35%。其中,31.28%的编码蛋白和31.25%的假定蛋白其基因序列长度为1 500~2 000 bp,76.60%的未知蛋白其基因序列长度在1 500bp以下;分别有47.50%,25.40%,25%的编码蛋白、预测蛋白及假定蛋白其相似度在80%~90%,仅有1.70%,1.80%,4.20%的编码蛋白、预测蛋白及假定蛋白其相似度在40%~50%;经荧光定量PCR验证的两个基因r6351,r7850均存在。该研究结果为完善黄绿卷毛菇子实体的形成机制提供了基因方面的数据支持。 展开更多
关键词 黄绿卷毛菇 开伞期 上调基因 荧光定量PCR
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参与紫云英共生固氮的1个上调表达结瘤素基因AsB6的分离与鉴定 预览 被引量:6
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作者 吴梅 丑敏霞 +2 位作者 李一星 陈大松 李友国 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期 169-174,共6页
基于接种华癸中慢生根瘤菌(Mesorhizobiumhuakuii)7653R的紫云英(Astragalus sinicusL.)感染根与未接种对照根在转录水平上的差异,利用抑制差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH),建立了紫云英结瘤固氮过程中... 基于接种华癸中慢生根瘤菌(Mesorhizobiumhuakuii)7653R的紫云英(Astragalus sinicusL.)感染根与未接种对照根在转录水平上的差异,利用抑制差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH),建立了紫云英结瘤固氮过程中的差异表达cDNA文库,共获得527个有效克隆,其中增强或特异性表达的上调文库中包含341个克隆,抑制表达的下调文库包含186个克隆。对其中的1个上调表达cDNA克隆AsB6利用RACE(rapid amplification of cDNAends)方法获得了其基因全长序列,利用BLAST在线软件和GenBank,Gen-Bank EST和Tigr Porcine EST等数据库进行同源序列比较,表明AsB6与苜蓿的β-酮酯酰合成酶及依赖于SAM(S-adenosgl methiomine,S-腺苷蛋氨酸)的羧甲基转移酶具有66%的同源性,同时利用实时荧光定量PCR研究了该基因的时空表达特征。结果显示,接种根瘤菌7653R后,在紫云英感染根和根瘤中该基因的表达量显著增强,且在接种后根瘤形成早期和固氮中晚期表达量相对较高。推测其可能与根瘤菌前期感染和根瘤形成、根瘤代谢功能有关。 展开更多
关键词 抑制差减杂交 紫云英 上调基因 β-酮酯酰合成酶 共生固氮
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基因芯片技术在食管鳞癌转移相关基因表达谱筛选中的应用 预览 被引量:1
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作者 宋宝 高雪芹 +2 位作者 朱波 黄海燕 韩金祥 《山东医药》 CAS 北大核心 2005年第14期 4-6,共3页
目的研究人食管鳞癌转移相关基因表达谱,探讨食管鳞癌的转移机制.方法选取392个与肿瘤转移相关的基因克隆,制备成肿瘤转移基因芯片.提取食管鳞癌组织以及正常食管组织RNA,反转录后标记为cDNA探针,与cDNA芯片杂交,经扫描及Quantarray3.0... 目的研究人食管鳞癌转移相关基因表达谱,探讨食管鳞癌的转移机制.方法选取392个与肿瘤转移相关的基因克隆,制备成肿瘤转移基因芯片.提取食管鳞癌组织以及正常食管组织RNA,反转录后标记为cDNA探针,与cDNA芯片杂交,经扫描及Quantarray3.0软件分析后比较两种组织中的差异表达基因.结果共筛查出差异表达基因58条,其中表达上调基因36条、下调基因22条,包括癌基因、抑癌基因、黏附分子、基质金属蛋白酶、信号转导因子、细胞代谢和免疫相关基因等.结论基因芯片筛查食管鳞癌转移相关基因表达谱可为明确食管鳞癌转移机制提供重要参考. 展开更多
关键词 相关基因表达谱 癌转移 基因芯片技术 差异表达基因 基质金属蛋白酶 筛选 食管鳞癌组织 CDNA探针 cDNA芯片 免疫相关基因 转移机制 肿瘤转移 基因克隆 食管组织 上调基因 下调基因 抑癌基因 黏附分子 信号转导 细胞代谢
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食管癌表达上调基因NADH氧化还原酶MLRQ亚基的研究及临床意义
5
作者 王涛 刘芝华 +5 位作者 李泽坚 张立勇 刘煜 孙国斌 王秀琴 吴旻 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期 590-592,共3页
目的研究在食管癌中差异表达明显的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因在食管癌中的表达,并探讨它在食管癌发生发展过程中的可能机制.方法利用微陈列技术方法获得一个在食管癌中的表达显著上调的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因,用RT-PCR及Northern... 目的研究在食管癌中差异表达明显的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因在食管癌中的表达,并探讨它在食管癌发生发展过程中的可能机制.方法利用微陈列技术方法获得一个在食管癌中的表达显著上调的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因,用RT-PCR及Northern 印迹从mRNA水平检测其在38对食管癌、7对贲门癌、14对胃癌、11对结肠癌和7对肝癌等消化系统肿瘤中的表达情况.结果 (1)MLRQ基因在食管癌、贲门癌、胃癌、结肠癌和肝癌中显著上调者,分别为81.6%(31/38)、57.1%(4/7)、85.7%(12/14)、65.6%(7/11)、57.1%(4/7).用X2检验,各组之间差异无统计学意义(P>0.05).(2)在38对食管癌配对组织中,MLRQ基因上调与临床分期、肿瘤浸润程度、淋巴结转移及分化程度无相关性(均P>0.05).结论 MLRQ亚基基因在消化道肿瘤中表达上调. 展开更多
关键词 食管癌 NADH 表达 上调基因 上调 肝癌 胃癌 氧化还原酶 MRNA水平 印迹
以基因芯片技术研究黄芪多糖对NOD小鼠胰岛基因表达的影响 被引量:15
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作者 陈蔚 俞茂华 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期 545-548,共4页
目的深入探讨黄芪多糖(APS)对NOD小鼠1型糖尿病预防作用的分子机制.方法应用基因芯片技术比较APS处理组和生理盐水对照组NOD小鼠胰岛的基因表达谱差异.结果APS组中5.47%的检测基因(63/1152)表达明显差异;上调基因28条,下调基因35条;17... 目的深入探讨黄芪多糖(APS)对NOD小鼠1型糖尿病预防作用的分子机制.方法应用基因芯片技术比较APS处理组和生理盐水对照组NOD小鼠胰岛的基因表达谱差异.结果APS组中5.47%的检测基因(63/1152)表达明显差异;上调基因28条,下调基因35条;17条基因在功能上与免疫有关.结论黄芪多糖能预防或延缓NOD小鼠1型糖尿病的发生,可能与其纠正Th1/Th2型细胞/细胞因子的免疫失衡状态有关. 展开更多
关键词 NOD小鼠 胰岛 基因芯片技术 黄芪多糖 1型糖尿病 基因表达谱 APS 上调基因 分子机制
应用抑制性消减杂交技术克隆HCV NS3蛋白反式激活基因2的上调基因 预览 被引量:2
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作者 党晓燕 成军 +5 位作者 邓红 王建军 杨倩 刘妍 纪冬 王春花 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第4期847-850,共4页
目的:应用抑制性消减杂交(SSH)技术构建丙型肝炎病毒(HCV)NS3蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,克隆HCV NS3蛋白反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照:... 目的:应用抑制性消减杂交(SSH)技术构建丙型肝炎病毒(HCV)NS3蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,克隆HCV NS3蛋白反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照:制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cDNA,经RsaⅠ酶切后将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析。结果:成功构建人HCVNS3蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,文库扩增后得到61个白色克隆,进行菌落PCR分析,均得到100-1000bp插入片段,挑取30个插入片段测序分析,得到30个已知功能基因序列。结论:筛选到的cDNA全长序列,包括一些与细胞生长调节、物质代谢、免疫及细胞凋亡密切相关的蛋白编码基因,推测了NS3TP2可能存在的调控机制的线索。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交技术 克隆 HCV NS3蛋白 反式激活基因2 上调基因 细胞凋亡
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ATRA诱导上调基因RIG-C的cDNA克隆和序列分析及蛋白表达 预览
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作者 印彤 黄秋花 +2 位作者 张吉旺 熊慧 张庆华 《上海第二医科大学学报》 CSCD 2004年第2期 77-80,共4页
目的克隆和表达维甲酸诱导上调的新基因RIG-C.方法运用Blast、pfam等生物信息学手段对RIG-C的全长cDNA序列进行结构与功能预测;将RIG-C全长阅读框架插入原核表达载体pET22b中,在JM109(DE3)菌株中进行诱导表达;将全长RIG-C插入真核表达... 目的克隆和表达维甲酸诱导上调的新基因RIG-C.方法运用Blast、pfam等生物信息学手段对RIG-C的全长cDNA序列进行结构与功能预测;将RIG-C全长阅读框架插入原核表达载体pET22b中,在JM109(DE3)菌株中进行诱导表达;将全长RIG-C插入真核表达的绿荧光蛋白载体pEGFP-C1中,转染NIH3T3细胞以观察RIG-C的亚细胞定位.结果 RIG-C基因cDNA全长1266 bp,编码421个氨基酸,N端具有多个WD40结构域,C端有一个SOCS家族典型结构.原核表达的RIG-C蛋白大小约45kd,NIH 3T3细胞表达的RIG-C定位于细胞浆.结论克隆和表达了新基因RIG-C,为进一步研究其生物学功能和蛋白质的空间结构奠定了基础. 展开更多
关键词 ATRA 诱导 上调基因 RIG-C CDNA 克隆 序列分析 蛋白表达
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大鼠心肌缺血预适应诱导表达上调基因的筛选和鉴定 预览 被引量:7
9
作者 袁灿 吕青兰 +5 位作者 陈广文 刘瑛 王尧玲 刘海军 邹江 肖献忠 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第3期 390-394,共5页
采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉前降支构建大鼠心肌缺血预适应动物模型,运用抑制消减杂交技术建立大鼠心肌缺血预适应诱导表达上调基因的消减cDNA文库,通过反向RNA点杂交对部分文库基因进行差异表达初筛,选取表达差异最明显的85个... 采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉前降支构建大鼠心肌缺血预适应动物模型,运用抑制消减杂交技术建立大鼠心肌缺血预适应诱导表达上调基因的消减cDNA文库,通过反向RNA点杂交对部分文库基因进行差异表达初筛,选取表达差异最明显的85个基因进行测序,获得了31个核编码基因和18个新基因(EST),核编码基因中有相当一部分与细胞保护或信号转导有关,新基因已被GenBank收录.从已测序基因中任选5个进行RT-PCR检测,并任选2个进行RNA印迹检测,均证实在缺血预适应时表达增高.上述结果为进一步深入研究缺血预适应心肌保护作用的分子机制和克隆新的缺血预适应相关基因提供了重要信息. 展开更多
关键词 大鼠 心肌缺血预适应 诱导表达 上调基因 筛选 鉴定 抑制消减杂交
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鼻咽癌上皮细胞株HNE1 cDNA文库的构建及鼻咽癌表达上调基因的筛选 预览
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作者 张必成 李忠花 +4 位作者 朱诗国 曹利 余鹰 李伟芳 李桂源 《癌症:英文版》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第2期 220-222,共3页
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是我国南方常见的上皮源性恶性肿瘤,流行病学研究调查,鼻咽癌的发生与EB病毒感染、某些环境理化因素及遗传因素有关,但其分子机理仍不十分清楚.鼻咽癌的发生可能涉及到多个瘤基因的激活和抑瘤基因... 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是我国南方常见的上皮源性恶性肿瘤,流行病学研究调查,鼻咽癌的发生与EB病毒感染、某些环境理化因素及遗传因素有关,但其分子机理仍不十分清楚.鼻咽癌的发生可能涉及到多个瘤基因的激活和抑瘤基因的失活,但目前国际上仍未获得鼻咽癌特异相关基因.为了进一步筛选与克隆鼻咽癌特异相关基因,我们构建了鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA文库,以供进一步深入研究. 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 CDNA克隆 cDNA评议库 NPC HNE1细胞株 上调基因 筛选
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长链非编码RNA牛磺酸上调基因1在食管鳞状细胞癌中的表达和功能
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作者 郑妍妍 许有涛 +4 位作者 王洁 邱满堂 尹荣 许林 孟爱凤 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期3216-3216,共1页
长链非编码RNA(1ncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1),2005年被首次发现,长度为7.1kb。最近研究表明TUG1可以促进骨肉瘤细胞和膀胱癌增殖。相反,TUG1在非小细胞肺癌(NSCLC)中下调且抑制细胞增殖。本研究旨在观察ESCC中TUGl的表达及对... 长链非编码RNA(1ncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1),2005年被首次发现,长度为7.1kb。最近研究表明TUG1可以促进骨肉瘤细胞和膀胱癌增殖。相反,TUG1在非小细胞肺癌(NSCLC)中下调且抑制细胞增殖。本研究旨在观察ESCC中TUGl的表达及对ESCC细胞功能的影响。 展开更多
关键词 非编码RNA 上调基因 食管鳞状细胞癌 牛磺酸 长链 抑制细胞增殖 非小细胞肺癌 ESCC
上调基因11在恶性肿瘤中作用的研究进展 预览
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作者 崔翔 邢宇锋 +2 位作者 姜小艳 魏春山 童光东 《广西医学》 CAS 2019年第15期1955-1957,共3页
上调基因11(URG11)是一种可以被乙型肝炎X抗体反式激活的癌基因,其与HBV感染相关性肝癌、胃癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、前列腺癌等恶性肿瘤的发生发展及预后密切相关,对恶性肿瘤的早期预测和靶向治疗具有重要意义。本文就URG11基因在恶... 上调基因11(URG11)是一种可以被乙型肝炎X抗体反式激活的癌基因,其与HBV感染相关性肝癌、胃癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、前列腺癌等恶性肿瘤的发生发展及预后密切相关,对恶性肿瘤的早期预测和靶向治疗具有重要意义。本文就URG11基因在恶性肿瘤中的作用进行综述。 展开更多
关键词 上调基因11 恶性肿瘤 HBV感染 肝癌 胃癌 胰腺癌 非小细胞肺癌 前列腺癌 Β-连环蛋白 致癌机制 综述
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牛磺酸上调基因1对人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖及迁移和凋亡的影响 被引量:1
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作者 谢环 田洁 黄娅芬 《中华实用诊断与治疗杂志》 2019年第1期14-17,共4页
目的探讨牛磺酸上调基因1(taurine-upregulated gene 1,TUG1)在人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖、迁移和凋亡中的作用。方法采用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)技术构建TUG1慢病毒载体。将对数生长期人绒毛膜癌JEG-3细胞随机分为空白... 目的探讨牛磺酸上调基因1(taurine-upregulated gene 1,TUG1)在人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖、迁移和凋亡中的作用。方法采用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)技术构建TUG1慢病毒载体。将对数生长期人绒毛膜癌JEG-3细胞随机分为空白对照组(不作任何处理)、阴性对照组(转染阴性对照靶序列慢病毒载体)和转染组(转染siRNA-TUG1慢病毒载体)。采用实时荧光定量PCR法检测3组TUG1mRNA、caspase-3mRNA、caspase-9mRNA相对表达量,采用Western blot法检测3组TUG1、caspase-3、caspase-9蛋白相对表达量,采用Transwell小室试验检测3组培养24h细胞侵袭能力,采用CCK-8法检测3组细胞培养72h吸光度值,采用流式细胞术检测3组培养72h细胞凋亡率。结果构建siRNA-TUG1载体的慢病毒滴度为3×10^8 TU/mL;转染72 h,转染组TUG1 mRNA、caspase-3mRNA、caspase-9mRNA相对表达量(0.42±0.02、0.31±0.01、0.21±0.01)低于阴性对照组(1.09±0.03、1.29±0.03、1.02±0.01)和空白对照组(1.01±0.01、1.02±0.02、1.00±0.01)(P<0.05),TUG1、caspase-3、caspase-9蛋白相对表达量(0.24±0.07、0.49±0.23、0.11±0.02)低于阴性对照组(7.32±0.05、10.12±1.47、9.98±2.78)和空白对照组(6.08±0.19、9.88±0.93、9.91±1.44)(P<0.05);培养24h,转染组迁移细胞数[(52.11±4.09)个]较阴性对照组[(142.11±14.02)个]和空白对照组[(131.32±18.39)个]少(P<0.05);培养72h,转染组细胞吸光度值(24.27±3.11)较阴性对照组(51.12±2.47)和空白对照组(60.34±1.24)低(P<0.05),细胞凋亡率[(35.21±13.31)%]较阴性对照组[(3.09±1.13)%]和空白对照组[(4.21±1.24)%]高(P<0.05);阴性对照组各观察指标与空白对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 TUG1沉默表达慢病毒载体可明显抑制人绒毛膜癌JEG-3细胞增殖和侵袭,促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 绒毛膜癌 长链非编码RNA 牛磺酸上调基因1 增殖 凋亡 迁移
干扰牛磺酸上调基因1表达对结直肠癌细胞增殖、凋亡、侵袭迁移的影响及其机制 预览
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作者 黄少江 阎吕军 +1 位作者 牛凯 李青 《山东医药》 CAS 2019年第21期19-22,共4页
目的探讨干扰长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)表达对结直肠癌细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移的影响及机制。方法采用qRT-PCR方法从结直肠癌细胞SW480、HCT-116、SW620和Lo Vo中筛选高表达TUG1的结直肠癌细胞系。将SW620和Lo V... 目的探讨干扰长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)表达对结直肠癌细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移的影响及机制。方法采用qRT-PCR方法从结直肠癌细胞SW480、HCT-116、SW620和Lo Vo中筛选高表达TUG1的结直肠癌细胞系。将SW620和Lo Vo细胞分为siRNA-NC(转染siRNA-NC,阴性对照)和siRNA-TUG1组(转染siRNA-TUG1),采用CCK-8法检测细胞增殖活性,Transwell法观察细胞侵袭和迁移能力,流式细胞术检测细胞周期分布、测算细胞凋亡率,同时采用RT-PCR和Western blotting法检测结直肠癌细胞转化生长因子-β(TGF-β)、细胞内信号转导蛋白2(Smad2)和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA) mRNA及蛋白相对表达量。结果筛选出高表达TUG1的结直肠癌细胞系SW620和Lo Vo。siRNA-TUG1组SW620和Lo Vo细胞中TUG1的表达水平较siRNA-NC组低(P均<0. 05)。与siRNA-NC组比较,siRNA-TUG1组SW620和Lo Vo细胞增殖活性、侵袭和迁移能力均降低,G0/G1期细胞比例升高,S期细胞比例降低,细胞凋亡率升高(P均<0. 05),TGF-β、Smad2、α-SMA mRNA和蛋白的表达水平下降(P均<0. 05)。结论干扰TUG1表达可抑制结直肠细胞增殖、侵袭、迁移,阻滞细胞周期,促进细胞凋亡,其可能通过抑制TGF-β信号通路实现上述作用的。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 牛磺酸上调基因1 结直肠癌 细胞增殖 细胞凋亡 细胞侵袭 细胞迁移
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siRNA下调AEG-1基因表达对胶质瘤细胞血管拟态形成的影响 预览
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作者 梁晨 唐荣华 +2 位作者 上官健 廉民学 郭世文 《西安交通大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期87-91,共5页
目的探讨下调星型细胞上调基因-1(AEG-1)表达对胶质瘤细胞血管拟态(VM)形成的影响及其可能的机制。方法利用siRNA下调U87胶质瘤细胞中AEG-1表达,通过体外构建胶质瘤VM模型,研究下调AEG-1表达对胶质瘤VM形成的影响;Real-timePCR及Western... 目的探讨下调星型细胞上调基因-1(AEG-1)表达对胶质瘤细胞血管拟态(VM)形成的影响及其可能的机制。方法利用siRNA下调U87胶质瘤细胞中AEG-1表达,通过体外构建胶质瘤VM模型,研究下调AEG-1表达对胶质瘤VM形成的影响;Real-timePCR及Westernblot分别检测AEG-1表达下调对U87细胞中血管内皮生长因子(VEGF)、基质金属蛋白酶-2(MMP2)mRNA及蛋白表达的影响;免疫荧光法检测AEG-1表达下调对VM模型中VEGF及MMP2表达的影响。结果siRNA下调AEG-1表达能显著降低U87细胞体外VM的形成(P<0.01),同时下调AEG-1基因能够显著抑制U87细胞及其构成的VM中VEGF及MMP2的表达(P<0.01)。结论siRNA下调AEG-1表达能显著抑制胶质瘤细胞VM的形成,其部分机制可能是通过下调VEGF及MMP2表达实现。 展开更多
关键词 星型细胞上调基因-1 SIRNA 胶质瘤 血管拟态
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星形胶质细胞上调基因-1对胃癌干细胞增殖、凋亡及干性的影响 预览
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作者 李燕 柯希权 +4 位作者 邓敏 李大鹏 汪强武 汪建超 王启之 《蚌埠医学院学报》 CAS 2019年第5期570-577,共8页
目的:探讨星形胶质细胞上调基因-1 (AEG-1)在胃癌干细胞中的表达及其作用。方法:采用实时荧光定量技术(qRT-PCR)及Western blotting检测胃癌干细胞(HGC-27、MKN-45)及相应非干细胞mRNA及蛋白表达水平,采用瞬时转染法对AEG-1进行处理,使... 目的:探讨星形胶质细胞上调基因-1 (AEG-1)在胃癌干细胞中的表达及其作用。方法:采用实时荧光定量技术(qRT-PCR)及Western blotting检测胃癌干细胞(HGC-27、MKN-45)及相应非干细胞mRNA及蛋白表达水平,采用瞬时转染法对AEG-1进行处理,使用MTS、细胞周期检测细胞增殖情况及作用机制,AnnexinⅤ及Caspase-3/7活性检测细胞凋亡情况,干细胞成球实验评估AEG-1沉默对胃干细胞干性的影响,裸鼠体内成瘤实验评估AEG-1对裸鼠体内胃干细胞肿瘤发生的影响。Ⅴ结果:胃癌干细胞MKN-45中AEG-1表达水平高于非干细胞组(P<0.01);AEG-1-siRNA转染的癌干细胞导致癌干细胞周期停滞在G1期,明显抑制了细胞增殖(P<0.01);AnnexinⅤ及Caspase 3/7活性检测AEG-1敲低可诱导胃干细胞凋亡;AEG-1表达被敲低时显著抑制了胃癌干细胞的成球能力;AEG-1缺失抑制了肿瘤干细胞的体内成瘤能力。结论:AEG-1沉默抑制细胞增殖,诱导胃癌干细胞G1期细胞周期停滞和细胞凋亡,抑制肿瘤发生,在胃癌干细胞的肿瘤发生中起着积极作用。 展开更多
关键词 胃肿瘤 星形胶质细胞上调基因-1 肿瘤干细胞
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乳腺癌组织中长链非编码RNATUG1的表达及临床意义 预览
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作者 许文婷 刘婷婷 +5 位作者 吴涛 杨亮 李丹 李双健 迪力夏提·金斯汗 赵倩 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2019年第4期314-319,共6页
目的 探讨长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(TUG1)在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法 收集本院2013年1月至2015年12月女性乳腺癌患者手术切除的113对癌组织和癌旁组织,采用实时定量PCR(QPCR)检测以上组织中TUG1的表达并比较TUG1在癌组... 目的 探讨长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(TUG1)在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法 收集本院2013年1月至2015年12月女性乳腺癌患者手术切除的113对癌组织和癌旁组织,采用实时定量PCR(QPCR)检测以上组织中TUG1的表达并比较TUG1在癌组织和癌旁组织中的分布差异,采用受试者工作特征曲线(ROC)分析组织TUG1水平诊断乳腺癌的效能,进一步分析TUG1表达与乳腺癌临床病理特征(年龄、肿瘤大小、淋巴结转移、TNM分期、绝经、组织学分级、ER、PR、HER-2和Ki-67表达及Nottingham预后指数)的关系,采用Kaplan-Meier Plotter肿瘤预后评价数据库分析TUG1表达与乳腺癌预后的关系。结果 QPCR检测结果显示,乳腺癌组织的TUG1水平为2.529±0.967,高于癌旁组织的1.096±0.480( P < 0.05);ROC曲线分析显示组织TUG1水平诊断乳腺癌的曲线下面积为0.905(95%CI: 0.866~0.944),当取约登指数最大的2.002为截断值时,敏感度和特异度分别为70.80%和98.23%。乳腺癌患者TUG1水平与年龄、绝经、组织学分级、ER表达及PR表达均无关,而与淋巴结转移、肿瘤大小、TNM分期、HER-2表达、Ki-67表达及Nottingham预后指数有关( P < 0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库在线分析显示TUG1表达与无复发生存期、总生存期和进展后生存期均无关,而与无远处转移生存期有关,其中TUG1低表达者的优于高表达(HR=1.88,95%CI:1.30~2.72, P < 0.001)。结论 TUG1在乳腺癌中高表达且与肿瘤的发生发展和预后有一定关系,在乳腺癌筛查及预后预测上有一定的潜在价值。 展开更多
关键词 乳腺癌 长链非编码RNA 牛磺酸上调基因1(TUG1) 临床意义
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前列腺癌组织中lncRNA TUG1和HMGB1表达水平及临床意义 预览
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作者 董云益 黄健 吕根生 《武警后勤学院学报:医学版》 CAS 2019年第1期19-23,共5页
【目的】检测前列腺组织中长链非编码核糖核酸牛磺酸上调基因1(long non-coding ribonucleic acid taurine upregulation gene 1,lncRNA TUG1)和高迁移率族蛋白B1(high mobility group box 1 protein,HMGB1)的表达水平,并分析其临床意... 【目的】检测前列腺组织中长链非编码核糖核酸牛磺酸上调基因1(long non-coding ribonucleic acid taurine upregulation gene 1,lncRNA TUG1)和高迁移率族蛋白B1(high mobility group box 1 protein,HMGB1)的表达水平,并分析其临床意义。【方法】取62例前列腺癌患者的组织,分别利用实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法对癌症组织和癌旁正常组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平进行检测。对比癌症组织和癌旁组织二者的差异,并分析其与年龄、肿瘤直径、肿瘤分期、美国癌症联合会(American joint committee on cancer,AJCC)分期、分化程度和淋巴结转移情况的关系。对比近期有效和无效、术后3年复发和未复发、死亡和生存患者前列腺癌组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平。【结果】癌症组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均明显高于癌旁组织(P<0.05),且不同年龄下二者的表达水平相近(P>0.05),但是肿瘤直径≥3 cm、肿瘤分期T3~T4、AJCC分期Ⅲ~Ⅳ、未分化/低分化、淋巴结转移患者癌症组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均明显高于肿瘤直径<3 cm、肿瘤分期T1~T2、AJCC分期Ⅰ~Ⅱ、中分化/高分化、无淋巴结转移患者的癌症组织表达水平(P<0.05);本组患者近期有效率、复发率和死亡率分别为64.52%、72.58%、58.06%,近期有效者癌症组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均低于近期无效者(P<0.05);术后3年复发者癌症组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均高于术后3年未复发者(P<0.05);术后3年死亡者癌症组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均高于术后3年生存者(P<0.05)。【结论】在前列腺癌组织中lncRNA TUG1和HMGB1的表达水平均升高,且与临床特征、病理特征、近期疗效、远期复发和生存均有关。 展开更多
关键词 前列腺癌 长链非编码核糖核酸牛磺酸上调基因1 高迁移率族蛋白B1
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上调基因4与癌症
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作者 林昊龙 袁萍 孙军 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1030-1036,共7页
上调基因4(up-regulatedgene-4,URG4)是受乙肝病毒X蛋白(hepatitis B virus X protein,HBx)激活的下游基因之一,最初在转染HBx的HepG2细胞中被克隆,因其上调细胞增殖效应而得名。研究发现,URG4在HBx转染后的HepG2细胞中表达明... 上调基因4(up-regulatedgene-4,URG4)是受乙肝病毒X蛋白(hepatitis B virus X protein,HBx)激活的下游基因之一,最初在转染HBx的HepG2细胞中被克隆,因其上调细胞增殖效应而得名。研究发现,URG4在HBx转染后的HepG2细胞中表达明显增加,同时细胞生长加速,存活率提高,表明URG4与乙肝病毒相关的肝细胞癌发生可能相关。近年来,人们发现URG4不仅在肝癌细胞中高表达,还与胃癌、骨肉瘤、非小细胞肺癌、神经母细胞瘤等多种癌症相关。本文结合近年来对URG4的研究成果,包括uRG4基因及其蛋白质的结构与功能,URG4在癌症发生发展中的作用,以及在癌症早期诊断和预后中的意义进行综述,可望为后续深入地开展URG4与癌症的研究提供参考。 展开更多
关键词 上调基因4 癌症 分子结构 乙肝病毒X蛋白
上调基因-11与胃癌发生转移的关系及中医药研究进展
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作者 姜小艳 童光东 +3 位作者 李京伟 谢伟昌 郭绍举 黄彬 《中国中西医结合消化杂志》 CAS 2018年第6期550-552,共3页
胃癌的发病率居恶性肿瘤第4位,病死率位列恶性肿瘤第3位。全球每年新发胃癌病例数100余万,胃癌相关死亡病例约80万[1]。中国的胃癌发病例数和死亡例数分别占全球的42.6%和45.0%,在全球183个国家中发病率居第5位、病死率居第6位[2]。
关键词 上调基因-11 胃癌 中医药
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