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番茄2个ERF-B1亚族转录因子基因的克隆及其对生物和非生物胁迫响应 预览
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作者 王雅慧 李彤 +3 位作者 黄莹 刘洁霞 王枫 熊爱生 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1893-1904,共12页
为进一步研究番茄ERF转录因子调控植物抗逆的分子机理,本研究以番茄浙杂-301为试验材料,分别克隆获得2个乙烯反应元件结合蛋白基因SlERF83和SlERF109,并对其进行序列及表达分析。结果表明,番茄SlERF83和SlERF109基因分别含有678 bp和669... 为进一步研究番茄ERF转录因子调控植物抗逆的分子机理,本研究以番茄浙杂-301为试验材料,分别克隆获得2个乙烯反应元件结合蛋白基因SlERF83和SlERF109,并对其进行序列及表达分析。结果表明,番茄SlERF83和SlERF109基因分别含有678 bp和669 bp的开放阅读框,编码225和222个氨基酸,各含有1个保守的AP2结构域,属于亲水性蛋白。进化分析表明,这2个ERF转录因子均属于AP2/ERF家族中ERF亚族的B1组。SlERF83和SlERF109三级结构都含有1个α-螺旋和3个β-折叠。酵母单杂交及β-半乳糖苷酶活性测定结果证明SlERF83转录因子可以与GCC-box结合。番茄2个ERF蛋白启动子含有多种逆境相关的顺式作用元件。采用荧光定量PCR检测SlERF83和SlERF109在非生物和生物胁迫下的表达,结果表明,高盐和干旱胁迫下,SlERF83和SlERF109基因的表达均被抑制;水杨酸处理能够诱导SlERF83和SlERF109基因的表达;茉莉酸甲酯处理下SlERF83表达水平提高,SlERF109表达量降低;番茄黄化曲叶病毒侵染下,SlERF83和SlERF109基因的表达均被抑制。SlERF83和SlERF109转录因子可能参与了番茄对生物及非生物胁迫的响应过程。本研究结果为进一步深入开展ERF转录因子调控番茄抗逆分子机制研究提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 番茄 转录因子 乙烯反应元件结合蛋白 生物和非生物胁迫 酵母单杂交 响应
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芹菜AgERF4转录因子基因的克隆与表达分析 被引量:2
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作者 吴蓓 李梦瑶 +3 位作者 王广龙 黄蔚 王枫 熊爱生 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2193-2202,共10页
以‘六合黄心芹’芹菜为材料,克隆出编码乙烯反应元件结合蛋白基因AgERF4。序列分析表明,AgERF4含有1个长度为597 bp的开放阅读框,编码198个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为21.43 kD,等电点为8.51。进化分析表明,ERF4转录因子在植物... 以‘六合黄心芹’芹菜为材料,克隆出编码乙烯反应元件结合蛋白基因AgERF4。序列分析表明,AgERF4含有1个长度为597 bp的开放阅读框,编码198个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为21.43 kD,等电点为8.51。进化分析表明,ERF4转录因子在植物中高度保守。AgERF4属于亲水性蛋白。酵母单杂交和β–半乳糖苷酶活性测定结果确定AgERF4转录因子和乙烯应答元件GCC Box具有较高的结合活性。RT-qPCR分析表明,AgERF4在芹菜叶片中的表达水平较高,在根和叶柄中表达水平较低;高温和干旱条件下AgERF4的表达呈先上升后下降的趋势,在盐处理的24 h内AgERF4的表达始终高于对照。AgERF4转录因子在芹菜非生物逆境胁迫调控过程中起着重要作用。 展开更多
关键词 芹菜 乙烯反应元件结合蛋白 酵母单杂交 非生物胁迫 基因表达
超级杂交稻乙烯反应元件结合蛋白cDNA的生物信息学分析与克隆 预览
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作者 晏瑾 肖浪涛 《生物技术通讯》 CAS 2008年第1期 47-50,共4页
目的:从超级杂交稻中克隆乙烯反应元件结合蛋白(EREBP)的cDNA。方法:利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA,对现有的水稻基因组数据库进行搜索,获得一条高同源的未知序列。对这条未知序列的核酸序列蛋白质序列及... 目的:从超级杂交稻中克隆乙烯反应元件结合蛋白(EREBP)的cDNA。方法:利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA,对现有的水稻基因组数据库进行搜索,获得一条高同源的未知序列。对这条未知序列的核酸序列蛋白质序列及其结构、性质、功能等进行生物信息学分析后,以超级杂交稻为材料,用未知序列设计一对简并引物,用RTPCR技术扩增后进行T-A克隆。结果:生物信息学分析结果表明,这个未知序列应为水稻中编码EREBP的cDNA;克隆后经测序获得一条915bp的cDNA,BLAST表明这条cDNA序列与未知序列的部分核酸序列的同源性达到了99%;提NCBI的GenBank后被接受,登录号为EF507537。结论:以生物信息学分析为基础,结合RT-PCR和T-A克隆技术,成功地从超级杂交稻中克隆了EREBP cDNA。 展开更多
关键词 超级杂交稻 生物信息学 乙烯反应元件结合蛋白 基因克隆
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蒺藜状苜蓿中MtERF-6基因的克隆及序列分析 预览 被引量:5
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作者 连瑞丽 李宇伟 赵德刚 《草业科学》 CAS CSCD 2006年第9期 82-87,共6页
乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6)... 乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6),并测定了其核苷酸全序列。该基因完整的读码框包括654bp,编码218个氨基酸。用此片段的氨基酸序列通过GenBankBLAST分析表明,该基因属于EREBP(Ethylene responsive element binding proteins)家族,其核苷酸与已报道的ERF4[Gossypium hirsutum]、ATERF-9[Arabidopsis thaliana]、NtERF3[Nicotiana tabacum]、NsERF3[Nicotiana sylvestris]、CaEREBP-C1[Capsicum annuum]的相似性分别为45%、47%、4l%、40%和42%,是新的基因。MtERF-6的核酸序列在GenBank发表,登录号为DQ344024。 展开更多
关键词 蒺藜状苜蓿 乙烯反应元件结合蛋白 MtERF-6基因
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番茄果实中LeERF1、LeERF2基因的克隆及序列分析 预览 被引量:1
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作者 蔚变云 朱本忠 罗云波 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 2004年第2期 132-137,共6页
乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对番茄(Lycopersicon esculentum)和其它植物物种中EREBP基因家族的同源性比较,在保守区(ERF区域)设计合成一对简并引物,通过RT-PC... 乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对番茄(Lycopersicon esculentum)和其它植物物种中EREBP基因家族的同源性比较,在保守区(ERF区域)设计合成一对简并引物,通过RT-PCR扩增得到一个114bp的片段,用此片段作探针筛选番茄cDNA文库(粉红期),得到两个基因LeERF1和LeERF2。通过BLAST工具在GenBank中搜索表明,LeERF1和LeERF2基因属于EREBP家族,LeERF1与EREBP-4和DDTFR10/A在氨基酸水平上的序列相似性为35%,LeERF2与EREBP-3和p65在氨基酸水平上的序列相似性为46%,是新的基因。LeERF1和LeERF2的核酸序列在GenBank发表,登录号分别为AY077626和AY275554。 展开更多
关键词 番茄 果实 LeERF1 LeERF2 基因 克隆 序列分析 乙烯反应元件结合蛋白
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用cDNA微阵列分析水稻防卫反应及信号传导相关基因 预览 被引量:4
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作者 裴雁曦 李德葆 +1 位作者 骆红梅 董海涛 《浙江大学学报:农业与生命科学版》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期 399-401,共3页
应用cDNA微阵列技术分析了水稻受白叶枯菌侵染后一对近等基因系(中早14R、9S)的防卫信号传导途径.在mRNA 水平,对检测到的相关基因(如病程相关蛋白、信号传导、转录因子等)间相互作用及信号传导途径的分析结果表明:白叶枯菌侵染下,乙烯(... 应用cDNA微阵列技术分析了水稻受白叶枯菌侵染后一对近等基因系(中早14R、9S)的防卫信号传导途径.在mRNA 水平,对检测到的相关基因(如病程相关蛋白、信号传导、转录因子等)间相互作用及信号传导途径的分析结果表明:白叶枯菌侵染下,乙烯(ET)介导的信号传导途径在防卫反应中可能起着重要作用.核基因接受信号后改变了一些防卫反应相关基因的表达水平,来应答病原物的侵入.实验结果还提示,水稻的一些基因通过表达丰度的改变对乙烯信号途径产生反馈调节. 展开更多
关键词 cDNA微阵列技术 水稻 防卫反应 信号传导 基因 乙烯反应元件结合蛋白 白叶枯菌
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