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变应性鼻炎患者鼻黏膜微小RNA的表达谱及其意义 预览
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作者 冯娟 张秀利 +2 位作者 阳玉萍 王燕 张华 《新疆医科大学学报》 CAS 2019年第10期1284-1289,共6页
目的探讨变应性鼻炎(AR)患者鼻黏膜微小RNAs(miRNAs)的表达谱特点,阐明miRNAs在AR的发病、诊断及治疗中的作用。方法研究设AR组及非变应性鼻炎患者(对照组),对其鼻黏膜进行总RNA抽提,应用RNA-seq技术对鼻黏膜miRNA进行差异表达谱的分析... 目的探讨变应性鼻炎(AR)患者鼻黏膜微小RNAs(miRNAs)的表达谱特点,阐明miRNAs在AR的发病、诊断及治疗中的作用。方法研究设AR组及非变应性鼻炎患者(对照组),对其鼻黏膜进行总RNA抽提,应用RNA-seq技术对鼻黏膜miRNA进行差异表达谱的分析。利用芯片技术,对miRNA进行二级结构的预测,从而判断和预测新的miRNA。比较2组新预测的miRNA的异常表达,筛选其miRNA,构建AR的新预测miRNA异常表达谱。结果将所有序列与rfam数据库进行比对,得到其中miRNA的具体分布情况。通过miRNA芯片,检测共有172个新预测的miRNA在2组鼻黏膜组织中表达,而AR组标本中表达的miRNA共有351个,有84个预测的miRNA在AR组共同表达。在对照组样品中表达的有342个,有85个预测的miRNA在对照组共同表达。本研究数据得到的6个新预测的miRNA在样本间差异表达(P<0.05)。对于得到的新预测的miRNA,使用软件miRand、RNAhybrid预测其靶基因。以新预测的128883为例,其对应的miRNA靶基因为34个。差异表达miRNA靶基因富集,得到差异表达新的miRNA与8条通路有关,分别是轴突指导、突触小泡循环、急性髓性白血病、胞吞作用、ErbB信号通路、Ras信号通路、黑色素瘤和赖氨酸降解。结论变应性鼻炎患者涉及多个新预测的miRNA,以及不同的信号通路,可能为AR患者的发病机制的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 变应性鼻炎(AR) 微小RNA(miRNA) 表达谱 基因预测 京都基因基因组百科全书(KEGG)
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基于网络药理学的生脉散作用机制分析 被引量:9
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作者 刘鑫馗 吴嘉瑞 +1 位作者 张丹 张晓朦 《中国实验方剂学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第16期219-226,共8页
目的:探讨生脉散的作用机制。方法:本研究选取生脉散中3味中药人参、麦冬、五味子含有的33个活性成分,通过Pharm Mapper服务器预测其活性成分的潜在靶点,进而构建化合物-靶点网络、构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)... 目的:探讨生脉散的作用机制。方法:本研究选取生脉散中3味中药人参、麦冬、五味子含有的33个活性成分,通过Pharm Mapper服务器预测其活性成分的潜在靶点,进而构建化合物-靶点网络、构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络、进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析、进行基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的生物通路富集分析,研究生脉散作用机制。结果:化合物-靶点网络包含249个节点,关键靶点涉及转甲状腺素蛋白(TTR)等。PPI网络包含155个节点,关键靶点涉及酪氨酸蛋白激酶Src(SRC),蛋白激酶Bα(Akt1)等。GO条目95个,其中生物过程相关的条目67个,分子功能相关的条目22个,细胞组成相关的条目6个。KEGG通路8条,涉及肿瘤信号通路(pathways in cancer),前列腺癌(prostate cancer),胰岛素信号通路(insulin signaling pathway)等。结论:本研究结果初步验证了生脉散的基本药理作用及其机制,并为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。 展开更多
关键词 生脉散 网络药理学 蛋白互作(PPI) 基因本体(GO) 京都基因基因组百科全书(KEGG)
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