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子宫内膜透明细胞癌的分子特征研究进展
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作者 王婧元 戴一博 +1 位作者 王志启 王建六 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2019年第8期628-630,共3页
子宫内膜透明细胞癌(ECCC)是子宫内膜癌的特殊病理类型,被归为II型子宫内膜癌。选择治疗方案时,即使处于疾病早期,患者也需积极地接受辅助治疗。近些年来,ECCC的分子特征有了新的研究进展,只有小部分ECCC的免疫表型与典型的浆液性癌相似... 子宫内膜透明细胞癌(ECCC)是子宫内膜癌的特殊病理类型,被归为II型子宫内膜癌。选择治疗方案时,即使处于疾病早期,患者也需积极地接受辅助治疗。近些年来,ECCC的分子特征有了新的研究进展,只有小部分ECCC的免疫表型与典型的浆液性癌相似,部分病例的表现与I型子宫内膜癌相似,此外ECCC也具有一些特有的基因改变。ECCC分子分型的研究进展,为预测患者预后及精准治疗提供了重要信息,显示出良好的应用前景。本文重点综述ECCC分子特征的研究进展,探讨其发病机制,以指导临床治疗。 展开更多
关键词 子宫内膜透明细胞癌 分子特征
高侵袭性甲状腺乳头状癌亚型研究新进展
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作者 张萌 滕梁红 《诊断病理学杂志》 2019年第1期56-60,共5页
甲状腺乳头状癌(PTC)是最常见的甲状腺恶性肿瘤,且大部分经手术治疗后预后较好,但仍有一部分PTC病理学亚型存在相对不良的生物学行为,被称为高侵袭性PTC亚型。目前对该部分亚型的研究也已成为PTC的研究热点之一。本文回顾相关文献,对高... 甲状腺乳头状癌(PTC)是最常见的甲状腺恶性肿瘤,且大部分经手术治疗后预后较好,但仍有一部分PTC病理学亚型存在相对不良的生物学行为,被称为高侵袭性PTC亚型。目前对该部分亚型的研究也已成为PTC的研究热点之一。本文回顾相关文献,对高侵袭性PTC亚型的临床特征、病理学形态及共同的分子学特征等作一综述,以期在临床诊断工作中提高对该类亚型的正确认识。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 亚型 高侵袭性 分子特征 研究进展
部分地区奶牛腹泻粪便样中诺如病毒的检测和演化分析 预览
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作者 王玥琳 郭紫晶 +1 位作者 岳华 汤承 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1048-1055,共8页
牛诺如病毒(bovine norovirus,BNoV)是一种引起犊牛腹泻的病原,目前已在19个国家检出。本研究旨在调查该病毒在国内部分地区的流行情况及分子特征。采用RT-PCR方法检测了5个省12个奶牛场的93份腹泻粪便样本和54份健康粪便样本。结果显示... 牛诺如病毒(bovine norovirus,BNoV)是一种引起犊牛腹泻的病原,目前已在19个国家检出。本研究旨在调查该病毒在国内部分地区的流行情况及分子特征。采用RT-PCR方法检测了5个省12个奶牛场的93份腹泻粪便样本和54份健康粪便样本。结果显示:腹泻样本中BNoV检出率为25.81%,极显著高于健康粪便样本中9.26%的检出率(P<0.01),证明该病毒与犊牛腹泻具有相关性;基于29个RdRp序列的遗传进化分析显示,5份样本为GⅢ.1型,24份样本为GⅢ.2型。对获得的18个VP1和13个VP2基因片段的遗传进化分析发现,中国的BNoV毒株具有独特的演化趋势。本研究证明BNoV已在国内的奶牛中广泛流行,是国内犊牛腹泻的新发病原,且国内的BNoV毒株具有独特的演化趋势,为犊牛腹泻的防控提供了重要参考。 展开更多
关键词 牛诺如病毒 奶牛 腹泻 流行 分子特征
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一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征 预览
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作者 李鑫 葛菲菲 +5 位作者 刘健 李壮壮 吴杰 杨德全 鞠厚斌 周锦萍 《中国动物检疫》 CAS 2019年第6期80-87,共8页
2017年12月,上海市一养殖场饲养的猪出现咳嗽、呼吸困难、发热及迅速转归等病症。将猪鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离,对血凝试验阳性样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖,分离到1株猪流感病毒(A/swine/Shanghai/1205/2017)。采用RT-PCR对分... 2017年12月,上海市一养殖场饲养的猪出现咳嗽、呼吸困难、发热及迅速转归等病症。将猪鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离,对血凝试验阳性样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖,分离到1株猪流感病毒(A/swine/Shanghai/1205/2017)。采用RT-PCR对分离毒株进行全基因组扩增测序,利用DNAstar软件,对测序基因片段进行整个阅读框的核苷酸序列同源性比对分析,并用MEGA6绘制遗传进化树并分析氨基酸位点。结果显示:分离毒株为H1N1亚型,其8个基因片段均属于类禽型H1N1进化分支,没有出现不同基因型流感病毒片段之间的重组;分离株HA蛋白的裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征。本毒株的分离鉴定为分析我国大陆地区的猪流感流行状况和分子特征提供了参考。 展开更多
关键词 猪流感病毒 H1N1 类禽型 遗传进化树 分子特征
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一株新正黏病毒(龙川病毒)的鉴定及分子特征研究
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作者 张欣 刘哲 +7 位作者 谈琦琪 张欢 周惠琼 李柏生 吴德 曹玉玺 王环宇 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期599-605,共7页
2013年在中国广东省开展了虫媒病毒分布及其分子特征的研究,在广东省龙川县采集的致倦库蚊中分离到一株病毒,该病毒可以引起C6/36细胞的病理性效应。为了对该病毒进行鉴定,并对其分子特征进行研究,将病毒培养物用氯化铯进行梯度离心,负... 2013年在中国广东省开展了虫媒病毒分布及其分子特征的研究,在广东省龙川县采集的致倦库蚊中分离到一株病毒,该病毒可以引起C6/36细胞的病理性效应。为了对该病毒进行鉴定,并对其分子特征进行研究,将病毒培养物用氯化铯进行梯度离心,负染电镜观察病毒的形态,提取并单引物等温扩增(SPIA)病毒RNA,利用Ion Torrent平台进行深度测序,获得的序列用CLC Genomic Wokbench 9.0软件进行拼接,本地BLAST进行分类比对。用MEGA软件登录GenBank,下载正黏病毒科代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析。电镜观察结果显示该病毒呈球形,直径大小约100nm;深度测序共获得6个完整开放阅读框(Open reading fragment,ORF)的节段序列,5个节段(PB1、PB2、PA、NA、HA)的氨基酸序列与正黏病毒科的Quaranjavirus属病毒同源关系在26.38%~67.23%之间,其中PB1的同源性最高,PB2的同源性最低,未发现与其它病毒有同源关系。本研究在中国首次从蚊虫中分离并鉴定了一株新的虫媒病毒,属于正黏病毒科Quaranjavirus属的家族成员,命名为龙川病毒,这是中国国内首次报道从致倦库蚊中分离到龙川病毒。 展开更多
关键词 龙川病毒 致倦库蚊 正黏病毒 分子特征
2015—2018年广东省H3N2亚型流感病毒分子特征研究
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作者 景艺 宋颖超 +5 位作者 梁丽君 邹丽容 武婕 陆靖 张宝 柯昌文 《国际病毒学杂志》 2019年第3期145-148,共4页
目的了解广东省2015—2018年H3N2亚型流感病毒的抗原特性、基因变异情况和进化趋势。方法测定广东省2015—2018年分离的60株H3N2亚型流感毒株血凝素(hemaglutinin,HA)基因和神经氨酸酶(neuramindase,NA)基因序列,对HA和NA基因的分子特... 目的了解广东省2015—2018年H3N2亚型流感病毒的抗原特性、基因变异情况和进化趋势。方法测定广东省2015—2018年分离的60株H3N2亚型流感毒株血凝素(hemaglutinin,HA)基因和神经氨酸酶(neuramindase,NA)基因序列,对HA和NA基因的分子特征进行分析。结果与2015—2018年各年度疫苗株相比,分离的60株病毒中,HA基因的共同氨基酸变异位点为P194L(B区),其中,57株分离株均出现S138A突变。此外,所有分离株中多了4个氨基酸突变位点,即R140I、G142K、V186G和Y219S。分离株NA基因的共同氨基酸变异位点为I231V,比2016—2017年和2017—2018年疫苗株多了K148T突变。结论广东省2015—2018年优势流行株与我国整体优势流行株稍有差异。多株分离株发生关键氨基酸位点N121K和R142G/K突变,表明H3N2亚型流感病毒有持续突变的趋势,需要引起重视。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 H3N2亚型 血凝素 神经氨酸酶 分子特征
分泌性乳腺癌6例临床病理分析 预览
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作者 陈慧萍 胡桂明 +3 位作者 李新敏 任志敏 张瑶 古雅丽 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期278-281,共4页
目的 探讨分泌性乳腺癌(secretory breast carcinoma,SBC)的临床病理特点、诊断、鉴别诊断及预后。方法 收集6例SBC的临床病理资料及随访资料,光镜下观察HE切片,采用免疫组化、FISH技术检测ETV6基因,并复习相关文献。结果 6例患者中男性... 目的 探讨分泌性乳腺癌(secretory breast carcinoma,SBC)的临床病理特点、诊断、鉴别诊断及预后。方法 收集6例SBC的临床病理资料及随访资料,光镜下观察HE切片,采用免疫组化、FISH技术检测ETV6基因,并复习相关文献。结果 6例患者中男性1例,女性5例,发病年龄6~76岁,平均38. 7岁。左侧乳腺2例,右侧乳腺4例。5例表现为无痛性乳腺肿块,1例表现为乳头溢液。肿瘤直径1. 0~3. 1 cm,平均2. 0 cm,边界较清,但无包膜。镜下实性巢状、微囊状、腺管样或乳头状排列的肿瘤细胞被玻璃样变的纤维组织分隔,呈多结节状生长;胞质内含嗜酸性分泌物或分泌小泡。免疫表型:6例CK7、CEA、S-100均阳性,ER、PR、HER-2均阴性,Ki-67增殖指数10%~40%;1例分子检测存在ETV6基因易位。2例行肿块切除术;4例行乳腺癌改良根治术,其中2例有淋巴结转移(3/15、1/16)。5例随访6个月~20年,1例发生肺转移。结论 SBC属于临床经过相对惰性、预后较好的罕见乳腺肿瘤,依据典型的病理学形态及免疫表型可明确诊断,特征性的ETV6基因易位有重要的鉴别诊断价值。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 分泌性癌 免疫组织化学 分子特征 预后
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10株猪流行性腹泻病毒云南分离株的S基因克隆及分子特征 被引量:1
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作者 钱祁昇 朱丽 +6 位作者 苏琳琳 张天羽 赵翔玥 郑晓林 吕念词 柴俊 张以芳 《畜牧与兽医》 北大核心 2019年第5期101-107,共7页
自2013年来,猪流行性腹泻病(PED)的暴发给云南省养猪业带来严重的经济损失。本研究对2018年来自云南4个地区的42份病料中分离出的6株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的部分S基因进行扩增,并结合在2013年所分离到的来自云南4个地区的4株PEDV流行... 自2013年来,猪流行性腹泻病(PED)的暴发给云南省养猪业带来严重的经济损失。本研究对2018年来自云南4个地区的42份病料中分离出的6株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的部分S基因进行扩增,并结合在2013年所分离到的来自云南4个地区的4株PEDV流行株,进行分子特征和遗传进化分析。结果显示:这2年的分离株和CV777株相比,2018年分离株的核苷酸和氨基酸突变位点增加了12个和7个,且有3个丝氨酸突变都是在COE结构域(69、101和146)。系统发育分析表明,2018和2013年分离株的核苷酸和氨基酸的同源性为95.6%~98.8%,95%~98.8%;分别与CV777株相比,核苷酸和氨基酸的同源性差异较小(94.9%~95.5%和92.7%~95.4%;94.5%~95.2%和93.4%~94.2%),亲缘关系都较远。2013年的分离株主要分布在G2b亚群,而2018年的分离株主要分布在G2a和G2c亚群,具有遗传多样性。N-糖基化和磷酸化位点预测分析显示,在216位上预测的N-糖基化位点由NSSI→NSSF,尤其是COE结构域中的丝氨酸取代而导致其可预测磷酸化。这些变异很可能会影响其抗原性和疫苗效果,导致PEDV控制效果不好。本研究阐明了云南部分地区PEDV流行毒株的分子流行病学和遗传特征,为该地区PED的防控奠定理论基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 PEDV S基因 分子特征 系统发育分析
感染新生儿的表皮葡萄球菌临床分离株耐药及分子特征分析
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作者 杨爱娟 张华 +1 位作者 朱品俐 王艳维 《中国妇幼保健》 CAS 2019年第4期808-812,共5页
目的了解新生儿表皮葡萄球菌临床分离株的临床分布特征,研究其耐药性和分子分型特征等情况,为临床监控及抗生素的合理使用提供实验依据。方法收集2013-2016年感染表皮葡萄球菌的新生儿临床资料和临床分离株共50株,采用梅里埃VITEK2 Comp... 目的了解新生儿表皮葡萄球菌临床分离株的临床分布特征,研究其耐药性和分子分型特征等情况,为临床监控及抗生素的合理使用提供实验依据。方法收集2013-2016年感染表皮葡萄球菌的新生儿临床资料和临床分离株共50株,采用梅里埃VITEK2 Compact全自动细菌鉴定药敏分析仪和配套的药物敏感复合板/纸片扩散法进行药物敏感试验,对耐甲氧西林表皮葡萄球菌(MRSE)进行SCCmec分型;用PCR方法检测gse A/mec A/ica A/ica B/ica C基因。结果 50株表皮葡萄球菌主要以痰液来源为主(44%),检出耐甲氧西林的表皮葡萄球菌(MRSE,26株)中,SCCmec分型以混合型为主;4株MRSE携带gse A基因,占15.4%,1株MRSE携带ica B;所有菌株的多药耐药率为78%,对喹奴普汀/达福普汀、呋喃妥因、替加环素、利奈唑胺、万古霉素均敏感。结论本院分离的表皮葡萄球菌以MRSE为主,未发现耐万古霉素表皮葡萄球菌,gse A和ica B基因阳性率较低。 展开更多
关键词 表皮葡萄球菌 新生儿 分子特征 耐药性
二代测序法分析左、右半结肠癌分子特征 预览
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作者 李鹤 赵瑞华 +2 位作者 姜国忠 靳水玲 宗红 《河南医学研究》 CAS 2019年第8期1378-1381,共4页
目的探讨结直肠癌基因突变特征,分析左、右半结肠癌分子特征差异。方法回顾性分析2017年1月至2018年6月郑州大学第一附属医院行二代测序检测的结直肠癌患者168例的临床资料及肿瘤组织的二代测序结果,采用χ2检验比较KRAS、TP53、APC、SM... 目的探讨结直肠癌基因突变特征,分析左、右半结肠癌分子特征差异。方法回顾性分析2017年1月至2018年6月郑州大学第一附属医院行二代测序检测的结直肠癌患者168例的临床资料及肿瘤组织的二代测序结果,采用χ2检验比较KRAS、TP53、APC、SMAD4、PIK3CA、FBXW7在左、右半结肠癌患者中的突变率。结果右半结肠癌患者的基因突变位点多于左半结肠癌患者,PIK3CA、FBXW7在右半结肠癌患者的突变率高于左半(均P<0.05),KRAS、TP53、APC、SMAD4在左半结肠癌患者的突变率高于右半(均P<0.05)。结论右半结肠癌患者的基因突变较多,PIK3CA、FBXW7、KRAS、TP53、APC、SMAD4在左、右半结肠癌的基因突变率存在差异。 展开更多
关键词 二代测序 结肠癌 分子特征
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马氏珠母贝β2肾上腺素能受体(β2AR)分子特征和表达分析 预览
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作者 张雨婷 曾嫚玉 +3 位作者 马佳仪 李嘉欣 焦钰 杜晓东 《广东海洋大学学报》 CAS 2019年第4期108-115,共8页
【目的】研究马氏珠母贝(Pinctada martensii)β2肾上腺素能受体(Pmβ2AR)的生物学功能。【方法】利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆获得Pmβ2AR基因的cDNA的全长序列并对其序列特征进行分析,实时荧光定量技术(qRT-PCR)检测马氏珠母... 【目的】研究马氏珠母贝(Pinctada martensii)β2肾上腺素能受体(Pmβ2AR)的生物学功能。【方法】利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆获得Pmβ2AR基因的cDNA的全长序列并对其序列特征进行分析,实时荧光定量技术(qRT-PCR)检测马氏珠母贝不同组织中β2AR基因mRNA的表达水平。【结果与结论】Pmβ2AR的cDNA全长2426bp,包括开放阅读框(ORF)2091bp,编码696个氨基酸,5′UTR长144bp,3′UTR长191bp,预测分子质量79.0ku,理论等电点9.18,多重序列比对结果发现β2AR在不同物种间的保守性较高。软件分析结果显示Pmβ2AR的氨基酸序列具有7个典型的跨膜结构域。qRT-PCR结果表明,Pmβ2AR基因在各组织中均有表达,在鳃中表达量最高,在肝胰腺和性腺中表达量也较高。 展开更多
关键词 马氏珠母贝 Β2肾上腺素能受体 分子特征 表达分析
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北京市顺义区零售鸡胴体中弯曲菌分布与分子特征研究
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作者 李颖 梁昊 +4 位作者 王苗 张赫 张彦春 马红梅 张茂俊 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期351-355,共5页
目的研究北京市顺义区鸡胴体中弯曲菌分布和分子特征,为顺义区弯曲菌防控提供科学依据。方法采集批发市场和零售店鸡胴体60份,采用滤膜法分离培养弯曲菌,对分离菌株进行多位点序列分型分析并构建最小生成树。结果鸡胴体中弯曲菌检出率为... 目的研究北京市顺义区鸡胴体中弯曲菌分布和分子特征,为顺义区弯曲菌防控提供科学依据。方法采集批发市场和零售店鸡胴体60份,采用滤膜法分离培养弯曲菌,对分离菌株进行多位点序列分型分析并构建最小生成树。结果鸡胴体中弯曲菌检出率为75.0%(45/60),空肠弯曲菌与结肠弯曲菌占比分别为38.0%(19/50)和62.0%(31/50)。批发市场和零售店弯曲菌检出率分别为86.0%(37/43)和47.1%(8/17),差异有统计学意义(χ2=9.877,P<0.05);5~7月空肠弯曲菌检出率分别为10.0%(2/20)、40.0%(8/20)和45.0%(9/20),差异有统计学意义(χ2=6.624,P<0.05)。19株空肠弯曲菌共分为13个ST型;28株结肠弯曲菌共分为16个ST型。空肠弯曲菌耐药率前五位由高至低依次为四环素(100.0%,19/19)、萘啶酸(100.0%,19/19)、环丙沙星(94.7%,18/19)、氟苯尼考(57.9%,11/19)、庆大霉素(36.8%,7/19);结肠弯曲菌耐药率前五位由高至低依次为萘啶酸(100.0%,31/31)、环丙沙星(100.0%,31/31)、四环素(93.5%,29/31)、链霉素(93.5%,29/31)、庆大霉素(83.9%,26/31)。空肠弯曲菌和结肠弯曲菌多重耐药率分别为68.4%(13/19)和93.5%(29/31)。结论北京市顺义区市场零售鸡胴体中弯曲菌污染水平较高,结肠弯曲菌为污染的优势菌种。批发市场鸡胴体污染弯曲菌的情况比零售店严重。 展开更多
关键词 多位点序列分型 空肠弯曲菌 萘啶酸 批发市场 北京市顺义区 分子特征 结肠弯曲菌 最小生成树
1株赛鸽新城疫强毒株的致病特性及分子特征分析 预览
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作者 李珮瑶 高晶萍 +7 位作者 田勇 王存连 徐明举 利凯 李军 张瑞华 兰金苹 徐彤 《河南农业科学》 北大核心 2019年第10期140-146,共7页
为了解赛鸽群中新城疫流行毒株的分子遗传特征及变异情况,从河北省疑似赛鸽新城疫病例中采集病料,常规处理后接种SPF鸡胚,经血凝试验(HA)和血凝抑制试验(HI)鉴定病毒,并对分离毒株进行致病性试验、毒力测定,采用RT-PCR方法扩增F基因,并... 为了解赛鸽群中新城疫流行毒株的分子遗传特征及变异情况,从河北省疑似赛鸽新城疫病例中采集病料,常规处理后接种SPF鸡胚,经血凝试验(HA)和血凝抑制试验(HI)鉴定病毒,并对分离毒株进行致病性试验、毒力测定,采用RT-PCR方法扩增F基因,并与其他不同种属新城疫毒株进行遗传进化发育分析和氨基酸序列同源性分析。结果显示,从病料中分离到1株新城疫病毒(命名为HB株),致病性试验产生与发病鸽相似的临床症状和剖检变化;其鸡胚平均死亡时间(MDT)、1日龄雏鸡脑内致病指数(ICPI)和6周龄雏鸡静脉致病指数(IVPI)分别为52.8 h、1.78和2.59,表明HB株新城疫病毒为强毒株;HB株F基因碱基序列包含1个大小为1 662 bp的完整开放阅读框,基因分型结果显示,HB株属于基因型Ⅵ型。根据遗传进化发育关系和同源性分析结果发现,HB株与pi/CH/LGD/110208、dove/Italy/2736/00、Q-GB 506/97等毒株核苷酸序列相似性和氨基酸同源性较高,尤其与pigeon/Qinghai/1344/2017毒株亲缘关系最近,分别达98.45%和99.5%;与目前使用的传统新城疫疫苗毒株LaSota、B1、V4、Mukteswar株等遗传关系较远;F蛋白裂解位点氨基酸序列为112 R-R-Q-K-R-F 117,符合强毒株特征。以上结果表明,HB株为强毒株且与目前广泛使用的新城疫疫苗毒株遗传关系较远。 展开更多
关键词 赛鸽 新城疫 F基因 致病特性 分子特征
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2017-2018年江西地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分子流行特征 预览
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作者 曾凌 邓琼 +3 位作者 刘洋 张杰 曾婷 曹先伟 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期835-841,共7页
目的了解江西各地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子特征及主要流行克隆型别,探讨流行克隆可能的竞争优势,为后续的机制研究提供资料。方法收集2017年1月-2018年12月江西省11个地市11所三甲医院临床分离的MRSA,同时应用mecA+femB... 目的了解江西各地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子特征及主要流行克隆型别,探讨流行克隆可能的竞争优势,为后续的机制研究提供资料。方法收集2017年1月-2018年12月江西省11个地市11所三甲医院临床分离的MRSA,同时应用mecA+femB双重PCR法鉴定为MRSA菌株后纳入研究,应用spa分型、SCCmec分型、PFGE和MLST进行分子分型,采用PCR方法检测杀白细胞素(PVL)毒力基因。结果spa分型主要为t437(74株,占31.22%)、t030(32株,占13.50%);不同地区的spa型存在很大差异,南昌地区以t030为主,其余地区以t437为主。SCCmecIVa为优势型别(占66.67%),SCCmecⅢ占15.19%;除南昌地区以SCCmecⅢ为主要型别外(占59.38%),其余各地区均以SCCmecIVa为主要优势型别。经PFGE分型和MLST,优势克隆型别为ST239、ST59、ST1和ST338;优势克隆群为CC239、CC59和CC1。共检出32株(13.19%)PVL阳性菌,其中鹰潭地区PVL检出率最高(29.63%,8/27),其次为景德镇地区(26.32%,5/19)。结论ST59-MRSA-IVa-t437为江西地区的主要优势流行克隆型,且各地区之间存在一定程度的克隆播散。ST239-MRSA-Ⅲ-t30为次要优势流行克隆型,主要在南昌地区多见,其他地区散发。江西地区PVL阳性菌株的主要型别为ST59-MRSA-t437-IVa型。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 MRSA 分子特征 克隆群 毒力
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马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEXL基因的分子特征与表达分析
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作者 范闪闪 郑哲 +2 位作者 焦钰 黄荣莲 杜晓东 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期489-497,共9页
几丁质作为有机框架主要成分参与贝壳的形成。β-N-乙酰-己糖胺酶(Beta-hexosaminidase/Beta-N-acetylhexosaminidase, HEX)属于糖苷水解酶家族20,在几丁质水解过程发挥重要作用。为了探究Pm HEXL在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利... 几丁质作为有机框架主要成分参与贝壳的形成。β-N-乙酰-己糖胺酶(Beta-hexosaminidase/Beta-N-acetylhexosaminidase, HEX)属于糖苷水解酶家族20,在几丁质水解过程发挥重要作用。为了探究Pm HEXL在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获得Pm HEXL基因c DNA全长序列并检测其在不同组织的表达模式。研究显示,Pm HEXL基因序列全长2 760 bp,其中5’UTR为167 bp,3’UTR为268 bp,开放阅读框(ORF)为2 325 bp,编码774个氨基酸;预测其相对分子量为89.59 kD,理论等电点为5.93;SMART软件分析PmHEXL蛋白质序列,发现它具有典型的GH20、GH20b结构域和CHB-HEX结构域;多序列比对结果显示Pm HEXL与其它物种的HEX具有较高的保守性;qPCR表达分析显示Pm HEXL在外套膜套膜区表达量最高,边缘区次之。综上所述,Pm HEXL可能参与马氏珠母贝贝壳的形成过程。 展开更多
关键词 马氏珠母贝 β-N-乙酰-己糖胺酶 分子特征 表达分析
猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征的分析
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作者 尹彦文 施开创 +3 位作者 孙文超 莫胜兰 陆文俊 屈素洁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期484-492,共9页
猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因... 猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框(ORF)。同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH_2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016株、广东GD株核苷酸序列的同源性分别为98.2%、92.9%、83.4%、90.8%。GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国Bavaria_S5/9株、奥地利AUT-2016_C株、荷兰NL1株核苷酸序列的同源性分别为87.8%、90.7%、90.5%、90.7%。上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸序列的同源性分别为79.1%~97.2%、83.0%~98.4%、83.1%~96.8%。基于APPV全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图。来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支。表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异。 展开更多
关键词 猪非典型瘟病毒 基因组序列 遗传变异 遗传多样性 分子特征
贵州省威宁县2015年至2017年外环境H9N2禽流感病毒神经氨酸酶基因分子特征分析
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作者 万永虎 杨桃梅 +6 位作者 张德著 唐光鹏 孙洁 庄丽 付琳 蒋维佳 李世军 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2019年第1期32-37,共6页
目的了解贵州省威宁彝族回族苗族自治县(以下简称威宁县)H9N2禽流感病毒的遗传变异情况,为禽流感病毒的防控提供依据。方法随机选取2015至2017年贵州省威宁县城北活禽市场外环境实时PCR初筛H9N2禽流感病毒阳性标本13株,对13株H9N2禽流... 目的了解贵州省威宁彝族回族苗族自治县(以下简称威宁县)H9N2禽流感病毒的遗传变异情况,为禽流感病毒的防控提供依据。方法随机选取2015至2017年贵州省威宁县城北活禽市场外环境实时PCR初筛H9N2禽流感病毒阳性标本13株,对13株H9N2禽流感病毒进行基因组的提取、神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对NA基因的同源性、遗传进化、颈部缺失位点、糖基化位点、受体结合关键位点和耐药位点变异情况进行分析。结果13株H9N2禽流感病毒的NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为93.0%~100.0%和92.1%~100.0%,均属于DK/HK/Y280/97系,但遗传来源复杂多样。在NA蛋白颈部39~40位点有3株发生谷氨酰胺(Q)天冬酰胺(N)至Q赖氨酸(K)的突变,13株毒株在63~65位点均缺失苏氨酸(T)谷氨酸(E)异亮氨酸(I)3个氨基酸。13株毒株NA蛋白糖基化位点86、146、200和234较稳定,其余糖基化位点均存在数量和位点的变异。唾液酸结合位点的3个区域均有毒株发生突变,其中结合位点区域399~404变异最为活跃。NA蛋白酶活性位点和关键位点均未发生耐神经氨酸酶抑制剂药物的突变。结论贵州省威宁县2015至2017年H9N2禽流感病毒属于DK/HK/Y280/97系,遗传来源复杂多样,NA基因颈部区域位点、糖基化位点和唾液酸受体结合位点发生了不同程度的变异,需进一步加强对H9N2禽流感病毒的持续监测与防控。 展开更多
关键词 流感病毒A型 H9N2亚型 神经氨酸酶基因 分子特征
致肝脓肿高毒力肺炎克雷伯菌的表型及分子特征
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作者 叶璟 黄金伟 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2019年第6期638-641,646共5页
目的探究导致肝脓肿高毒力肺炎克雷伯菌的分子特征。方法用VITEK-2细菌鉴定仪鉴定2014年1月至2016年1月丽水市中心医院肝脓肿患者脓肿穿刺液中分离的细菌。应用拉丝试验鉴定菌株的高黏性,用多位点序列分型(MLST)和血清型分型(K分型)对... 目的探究导致肝脓肿高毒力肺炎克雷伯菌的分子特征。方法用VITEK-2细菌鉴定仪鉴定2014年1月至2016年1月丽水市中心医院肝脓肿患者脓肿穿刺液中分离的细菌。应用拉丝试验鉴定菌株的高黏性,用多位点序列分型(MLST)和血清型分型(K分型)对菌株进行分子分型,并用S1核酸酶脉冲场凝胶电泳(S1-PFGE)对菌株质粒谱进行分析。结果 57例肝脓肿患者接受肝脏脓肿穿刺引流并做脓液培养。44例患者的脓液培养到不同的致病菌,培养阳性率为77.2%。在培养到的44株病原菌中,其中2株为大肠埃希菌,产酸克雷伯菌、金黄色葡萄球菌各1株,而肺炎克雷伯菌为40株,占肝脓肿致病菌的90.9%。40株肺炎克雷伯菌中,拉丝阳性率为67.5%(27/40),K1为主要血清分型,占62.5%(25/40),其次为K2型,占17.5%(7/40)。ST23为主要ST分型,占47.5%(19/40),其次为ST86和ST65,各占7.5%(3/40)。同时发现一些未报道过的致肝脓肿肺炎克雷伯菌新ST分型,如ST218、ST1941、ST76、ST2159、ST660和ST485。40株致肝脓肿肺炎克雷伯菌中总共检测到12种质粒谱,包括带有一个质粒、多个质粒或不带质粒的谱型。其中带有一个近220 kb的质粒谱为主要谱型,共涉及19株菌,占47.5%,12株菌带有一个质粒,大小为140~250 kb。4株菌带有2个或3个质粒,5株菌不含有质粒。结论拉丝试验和血清学分型不能鉴定所有的高毒力肺炎克雷伯菌;高毒力肺炎克雷伯菌很多为ST23型,但其进化整体上较为分散;高毒力肺炎克雷伯菌菌株可以不携带质粒。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 高毒力 肝脓肿 分子特征
甘薯毁灭性病毒病害(SPVD)的研究进展 预览
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作者 张新新 王旭芳 +3 位作者 林坚淳 余竟成 黄立飞 董章勇 《中国农学通报》 2019年第1期118-126,共9页
甘薯病毒病害(Sweetpotato virus diseases,SPVD)是由甘薯羽状斑驳病毒(Sweetpotato feathery mottle virus, SPFMV)和甘薯褪绿矮化病毒(Sweetpotato chlorotic stunt virus, SPCSV)双重感染和协同互作引起的甘薯毁灭性病毒病。该病害自... 甘薯病毒病害(Sweetpotato virus diseases,SPVD)是由甘薯羽状斑驳病毒(Sweetpotato feathery mottle virus, SPFMV)和甘薯褪绿矮化病毒(Sweetpotato chlorotic stunt virus, SPCSV)双重感染和协同互作引起的甘薯毁灭性病毒病。该病害自2012年在中国发现以来扩展迅速,2015年给广东省湛江市甘薯生产造成了巨大的经济损失。为了加强甘薯病毒病的防控,降低其带来的损失,本研究归纳了SPVD分布范围及危害,分别总结了SPFMV和SPCSV的基因结构与功能、传播方式、主要的检测手段,认为发病严重地区可以从探明病毒株系种类切入、从SPCSV与SPFMV协生作用的分子机理深入,实现及时检测、及早预防和甘薯无毒化栽培。 展开更多
关键词 甘薯病毒病害(SPVD) 甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV) 甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV) 分子特征 检测手段
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靶向治疗在儿童神经母细胞瘤中的应用 预览
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作者 陈靖昀 何佳雪 +3 位作者 刘勇 胡欣桐 常健 姜艳芳 《中国小儿血液与肿瘤杂志》 CAS 2019年第1期1-4,12共5页
神经母细胞瘤是交感神经系统的胚胎肿瘤,由来自神经嵴的交感神经细胞产生,是儿童期最常见的实体瘤,也是婴儿最常见的恶性肿瘤^[1]。高通量基因组分析、外显子组和全基因组测序、全基因组关联研究、转录组学和药物筛选等技术使神经母细... 神经母细胞瘤是交感神经系统的胚胎肿瘤,由来自神经嵴的交感神经细胞产生,是儿童期最常见的实体瘤,也是婴儿最常见的恶性肿瘤^[1]。高通量基因组分析、外显子组和全基因组测序、全基因组关联研究、转录组学和药物筛选等技术使神经母细胞瘤生物学相关研究取得了重大进展。神经母细胞瘤的分子特征与疾病的发生发展及预后相关,以这些分子为靶点进行治疗,有望取得较好的治疗效果。虽然小儿癌症的基因组畸变和突变明显较成人肿瘤要少^[2],但已发现的一些最常见的神经母细胞瘤基因突变有望成为治疗的靶点。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 靶向治疗 儿童期 全基因组测序 交感神经系统 恶性肿瘤 分子特征 基因突变
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