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计算机辅助药物设计的研究进展 预览 被引量:1
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作者 刘轲 陈曦 +4 位作者 蔡如意 应沂岑 郭雪媛 赵清璇 初明 《转化医学电子杂志》 2018年第9期31-33,共3页
近年来,随着生物信息学和计算机技术的飞速发展,计算机辅助药物设计(CADD)取得了巨大的进展。CADD是通过计算配体与受体的相互作用进行合理药物设计,包括基于结构的药物设计(SBDD)、基于片段的药物设计(FBDD)和基于配体的药物... 近年来,随着生物信息学和计算机技术的飞速发展,计算机辅助药物设计(CADD)取得了巨大的进展。CADD是通过计算配体与受体的相互作用进行合理药物设计,包括基于结构的药物设计(SBDD)、基于片段的药物设计(FBDD)和基于配体的药物设计(LBDD)。本文对SBDD、FBDD和LBDD的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 合理药物设计 计算机辅助药物设计 基于配体药物设计 基于结构药物设计 基于片段药物设计
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先导化合物发现及优化新策略述评(一) 预览
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作者 展鹏 刘新泳 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2015年第24期2918-2928,共11页
模拟创新是当前我国重大新药创制中发现的作用机制明确、结构新颖的先导化合物或候选药物的一条切实有效策略。结合大量实例分析了模拟创新药物研究中先导化合物发现及优化的2种新途径,即基于蛋白/配体复合物晶体结构叠合的分子杂合和... 模拟创新是当前我国重大新药创制中发现的作用机制明确、结构新颖的先导化合物或候选药物的一条切实有效策略。结合大量实例分析了模拟创新药物研究中先导化合物发现及优化的2种新途径,即基于蛋白/配体复合物晶体结构叠合的分子杂合和"优势结构再定位"策略,以期为该领域的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 药物化学 模拟创新 分子杂合 优势结构 药物再定位 基于结构药物设计 生物信息学
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基于组蛋白乙酰化转移酶p300结构的小分子抑制剂设计
3
作者 曾凡奇 彭士明 +4 位作者 李礼 穆丽冰 张振华 张志远 黄牛 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期700-708,共9页
组蛋白乙酰化转移酶p300在肿瘤细胞的分化和增殖中起重要的作用。本文采用了基于蛋白结构多层次的虚拟筛选方法来寻找组蛋白乙酰化转移酶p300的全新先导化合物,从含有十万个类药化合物的筛选库中,筛选出33个打分较好的化合物进行活性... 组蛋白乙酰化转移酶p300在肿瘤细胞的分化和增殖中起重要的作用。本文采用了基于蛋白结构多层次的虚拟筛选方法来寻找组蛋白乙酰化转移酶p300的全新先导化合物,从含有十万个类药化合物的筛选库中,筛选出33个打分较好的化合物进行活性测试,其中1个化合物4-乙酰基-2-甲基-N-吗啉-3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]噻嗪-7-磺酰胺(17)的生物活性达到微摩尔水平。基于预测的该化合物与p300结合的模型,对该化合物进行了初步的结构修饰,通过构效关系研究所获得的结果与计算模拟预测的结合模式一致。所发现的全新结构的p300抑制剂将有助于发展更有效和更具选择性的组蛋白乙酰转移酶抑制剂。 展开更多
关键词 组蛋白乙酰化转移酶 基于结构药物设计 分子对接 先导化合物结构优化
拓扑异构酶I抑制剂类抗癌药物的研究进展
4
作者 侯宝龙 王翠玲 +1 位作者 刘建利 王学军 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2013年第1期63-71,76共10页
拓扑异构酶I(topoisomeraseI,TopoI)参与DNA复制、转录等过程,是抗癌药研究的重要靶点,其相关药物在临床肿瘤化疗中广泛应用,基于抑制拓扑异构酶I的药物设计是新型抗癌药研究的重要策略。喜树碱衍生物仍然是此类药物研究的重点,... 拓扑异构酶I(topoisomeraseI,TopoI)参与DNA复制、转录等过程,是抗癌药研究的重要靶点,其相关药物在临床肿瘤化疗中广泛应用,基于抑制拓扑异构酶I的药物设计是新型抗癌药研究的重要策略。喜树碱衍生物仍然是此类药物研究的重点,目前的研究显示,许多非喜树碱结构的化合物也表现出对TopoI的抑制作用,成为此类药物研究的新亮点。本文总结基于T0p0I作用靶点的抗癌药物的作用机制、合成设计及构效关系方面的研究进展,以期为促进相关药物研究提供参考。 展开更多
关键词 拓扑异构酶Ⅰ 抑制剂 基于结构药物设计 构效关系
基于果糖1,6-二磷酸酯酶结构设计的药物研究进展
5
作者 杨琼 王翠玲 +1 位作者 黄新炜 刘建利 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第15期1189-1193,共5页
目的果糖1,6-二磷酸酯酶是内源性葡萄糖产生过程中的限速酶,该酶在胰岛素缺乏和胰岛素抵抗的动物模型中体现出控制血糖的重要性,近年来基于果糖1,6-二磷酸酯酶的结构设计出了许多小分子抑制剂,笔者对该领域的研究进展和趋势进行归... 目的果糖1,6-二磷酸酯酶是内源性葡萄糖产生过程中的限速酶,该酶在胰岛素缺乏和胰岛素抵抗的动物模型中体现出控制血糖的重要性,近年来基于果糖1,6-二磷酸酯酶的结构设计出了许多小分子抑制剂,笔者对该领域的研究进展和趋势进行归纳和总结,为开展相关研究提供借鉴。方法通过检索和归纳文献,总结基于酶结构药物设计的思路并综述其抑制剂的设计合成进展。结果报道的小分子抑制剂有望成为2型糖尿病的有效治疗药物,相关研究方法科学、高效。结论基于酶结构的药物设计可以提高药物发现的效率,应用前景广阔。 展开更多
关键词 果糖1 6-二磷酸酯酶 基于结构药物设计 抑制剂 构效关系 限速酶 2型糖尿病
Hsp90抑制剂的研究进展 预览 被引量:22
6
作者 孟帅 山广志 李卓荣 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期 241-248,共8页
热休克蛋白90(Hsp90)是生物进化过程中高度保守的一类蛋白,作为分子伴侣对细胞中众多信号蛋白的构象成熟和功能稳定进行调控。近年来的研究证明,Hsp90与肿瘤发生、发展、生物学行为及其预后有密切的关系,已成为新兴的抗肿瘤药物作... 热休克蛋白90(Hsp90)是生物进化过程中高度保守的一类蛋白,作为分子伴侣对细胞中众多信号蛋白的构象成熟和功能稳定进行调控。近年来的研究证明,Hsp90与肿瘤发生、发展、生物学行为及其预后有密切的关系,已成为新兴的抗肿瘤药物作用靶点,众多Hsp90抑制剂应运而牛,同时基于结构的小分子抑制剂的设计也引起日益广泛的关注,本文就Hsp90的结构特点及其相关抑制剂进行综述,以期对Hsp90抑制剂的发现和优化提供依据。 展开更多
关键词 HSP90 抑制剂 基于结构药物设计
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流感病毒神经氨酸酶抑制剂的设计策略及研究进展 预览 被引量:1
7
作者 徐文方 谢元超 《国际药学研究杂志》 CAS 2010年第4期241-248,共8页
流感对人类的健康构成很大威胁,尤其在流感暴发期,能够造成大量人员死亡。神经氨酸酶(NA)为流感病毒表面蛋白,在病毒的生命过程中起着重要作用,是抗流感药物设计的重要靶点。自从1983年NA结构被解析出来后,基于结构的药物设计以及计... 流感对人类的健康构成很大威胁,尤其在流感暴发期,能够造成大量人员死亡。神经氨酸酶(NA)为流感病毒表面蛋白,在病毒的生命过程中起着重要作用,是抗流感药物设计的重要靶点。自从1983年NA结构被解析出来后,基于结构的药物设计以及计算化学的运用极大地促进了NA抑制剂(NAI)的发展,到目前为止,已有两种抗流感药物上市——扎那米韦和奥司他韦。本文将以这两种药物的开发为例,简要介绍NAI的设计策略及最近几年的研究进展。 展开更多
关键词 流感 流感病毒 神经氨酸酶 基于结构药物设计 神经氨酸酶 抑制剂
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SH2结构域:一个潜在的药靶 预览
8
作者 傅用增 来鲁华 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期 194-196,共3页
众多包含SH2结构域(Src homology 2 domain)的蛋白质在细胞内信号传导过程中起到重要作用,它们通过SH2结构域特异性结合包含磷酸化酪氨酸的蛋白质。SH2结构域保守的结构特征和重要的功能使它成为一种潜在的药物作用靶标。基于其结合... 众多包含SH2结构域(Src homology 2 domain)的蛋白质在细胞内信号传导过程中起到重要作用,它们通过SH2结构域特异性结合包含磷酸化酪氨酸的蛋白质。SH2结构域保守的结构特征和重要的功能使它成为一种潜在的药物作用靶标。基于其结合靶蛋白序列设计的SH2结构域的抑制剂为治疗胞内信号通路异常引起的疾病提供了很好的方向。本文简述了SH2结构域的结构特征,结合特异性和抑制剂设计的进展。 展开更多
关键词 SH2结构 磷酸化酪氨酸 多肤类似物 基于结构药物设计
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基于结构的虚拟筛选技术能更广泛应用于现代药物发现?
9
作者 V. Leroux and B. Maigret 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-10,共10页
总结了计算机辅助药物设计目前的状况,重点讨论了基于结构类的虚拟筛选方法,特别是分子对接方法。在药物发现过程中,这些方法除了在早期的从数据库到命中阶段可节省费用外,还能提供其他有用信息吗?本综述试图通过探究大量现有对接... 总结了计算机辅助药物设计目前的状况,重点讨论了基于结构类的虚拟筛选方法,特别是分子对接方法。在药物发现过程中,这些方法除了在早期的从数据库到命中阶段可节省费用外,还能提供其他有用信息吗?本综述试图通过探究大量现有对接方法的优缺点来回答这一问题。结果表明:基于结构的药物设计还没有实现其早期的所有目标,还需要广泛深入地进行研究,应用时也需谨慎。令人兴奋的是当与其他互补的药物设计途径,如基于配体的方法,相结合时基于结构的方法是最好的。从这一点上看,基于结构的药物设计方法在现代药物发现这一多学科的交叉领域中还应该发挥更多的作用。 展开更多
关键词 现代药物发现 基于结构药物设计 计算机辅助药物设计 虚拟筛选 对接
基于结构设计发现新型抗菌药物 预览
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作者 蒋兴凯(编译) 《国外医学:药学分册》 2006年第6期 438-440,458,共4页
细菌耐药性在不断发展,对人类健康构成的威胁也日趋严峻。近来随着结构基因组学的启动,人们发现了很多新靶标。根据这些靶标进行基于结构的药物设计可以加速新型抗菌药物的发现过程。
关键词 抗菌药物 基于结构药物设计
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计算化学方法在基于受体结构的药物分子设计中的基础理论及应用 被引量:3
11
作者 曹冉 李伟 +2 位作者 孙汉资 周宇 黄牛 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1041-1052,共12页
近年来生物学领域的研究进展极大地加深了对疾病密切相关的靶标分子的结构和功能的认识。然而,如何有效地利用生物大分子的结构信息,进而合理地设计出具有特异性结合活性的小分子药物,还需要进一步开发精确计算受体配体结合自由能的方... 近年来生物学领域的研究进展极大地加深了对疾病密切相关的靶标分子的结构和功能的认识。然而,如何有效地利用生物大分子的结构信息,进而合理地设计出具有特异性结合活性的小分子药物,还需要进一步开发精确计算受体配体结合自由能的方法。近年来计算能力迅猛增长及研究大分子体系的理论和算法日趋成熟,基于物理学原理的计算化学方法在药物分子设计中的重要作用日益凸显。本文就计算化学在基于受体结构的药物分子设计中的方法及典型应用实例进行了系统的综述,包括小分子结合位点的成药性评估、化合物数据库的虚拟筛选、先导化合物的结构优化等,同时对目前的应用方法存在的主要问题进行了探讨,提出了切实可行的处理策略。 展开更多
关键词 基于受体结构药物分子设计 计算化学 分子力学 分子动力学 结合自由能 分子对接
六氢嘧啶-5-醇类新型非肽类β-分泌酶抑制剂的基于结构的药物分子设计
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作者 周博 牛彦 +6 位作者 邹晓民 许凤荣 袁悦 王超 高海飞 刘鹏 徐萍 《中国药学:英文版》 CAS 2010年第5期341-345,共5页
本文由文献报道的己知小分子苗头化合物片段出发,基于其与β-分泌酶结合的晶体结构,通过结构修饰设计了全新的非肽类小分子β-分泌酶抑制剂:六氢嘧啶-5-醇系列及其两类类似物系列。计算机辅助药物设计的研究得到了良好的结果。我们... 本文由文献报道的己知小分子苗头化合物片段出发,基于其与β-分泌酶结合的晶体结构,通过结构修饰设计了全新的非肽类小分子β-分泌酶抑制剂:六氢嘧啶-5-醇系列及其两类类似物系列。计算机辅助药物设计的研究得到了良好的结果。我们测试了各类母核的β-分泌酶抑制活性,结果进一步支持了我们的设计思路。 展开更多
关键词 Β-分泌酶抑制剂 六氢嘧啶-5-醇类 基于结构药物分子设计 计算机辅助药物设计
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