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2016-2018年自贡市丙型肝炎感染者基因型分布
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作者 袁宗智 李科 +3 位作者 陈燕梅 周敏 宋阳菊 万晓宇 《寄生虫病与感染性疾病》 CAS 2019年第2期76-79,共4页
目的调查自贡市丙肝病毒基因型分布状况,为不同人群丙肝防治提供数据参考。方法对2016-2018年自贡市医院及美沙酮门诊HCV初筛为阳性的186份标本通过HCV-RNA检测,其结果大于1.0×10^3IU/ml的阳性138例标本再进行基因分型试验。结果18... 目的调查自贡市丙肝病毒基因型分布状况,为不同人群丙肝防治提供数据参考。方法对2016-2018年自贡市医院及美沙酮门诊HCV初筛为阳性的186份标本通过HCV-RNA检测,其结果大于1.0×10^3IU/ml的阳性138例标本再进行基因分型试验。结果186份抗-HCV阳性的标本中,HCV-RNA>1.0×10^3IU/ml核酸阳性标本为138份,共发现5种基因亚型,占比最多的为1b型(50例,36.23%),其次为6a型(41例,29.71%)和3b型(19.57%)。普通人群HCV感染以1b型(55.26%)为主,其次为6a型(23.68%),吸毒人群HCV感染以6a型(38.71%)为主,其次为3b型(25.81%)。结论自贡地区丙肝病毒基因型流行株普通人群为1b、6a型,尤以1b为主,吸毒人群为6a、3b型,尤以6a为主。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒(HCV)基因 基因亚型 普通人群 吸毒人群
广东省东莞市2017—2018年登革病毒E基因进化分析
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作者 陈仲威 张莉萍 +2 位作者 方昌勇 黄勇 李艳芬 《中国热带医学》 CAS 2019年第10期963-971,共9页
目的测定广东省东莞市2017—2018年Ⅰ~Ⅳ型登革病毒(DENV-1~DENV-4)的E基因序列,分析其系统进化情况及流行基因亚型,从分子水平探讨病毒来源。方法收集东莞市2017—2018年140例可疑登革热患者急性期血清,用实时荧光PCR方法检测病毒核酸... 目的测定广东省东莞市2017—2018年Ⅰ~Ⅳ型登革病毒(DENV-1~DENV-4)的E基因序列,分析其系统进化情况及流行基因亚型,从分子水平探讨病毒来源。方法收集东莞市2017—2018年140例可疑登革热患者急性期血清,用实时荧光PCR方法检测病毒核酸,阳性血清用C6/36细胞分离培养登革病毒,测定分离株E基因序列,绘制系统进化树,结合流行病学资料进行分子流行病学分析。结果140份急性期血清中DENV核酸阳性54份,阳性率38.6%,DENV-1阳性占53.7%。分离得到17株毒株。序列比对和系统进化分析显示,10株DENV-1分离株间核苷酸同源性为90.0%~99.9%,氨基酸同源性为96.6%~99.8%,分属基因Ⅰ型和基因Ⅴ型。7株基因Ⅰ型分离株与泰国2015年、缅甸2015年、中山2015年及越南2016年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.9%),其中2018年本地株D2018078与2017年输入株D2017008核苷酸同源性达99.8%;3株基因Ⅴ型分离株与印度2014年、2017年株及新加坡2014年流行株核苷酸同源性较高(97.7%~99.1%)。4株DENV-2分离株间核苷酸同源性为91.0%~98.6%,推导氨基酸同源性为97.6%~99.8%,分属混合型和亚洲Ⅰ型,2株混合型分离株与马来西亚2014年、台湾2015年流行株核苷酸同源性较高(99.6%~99.7%);2株亚洲Ⅰ型分离株分别与越南2015年、泰国2011年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.5%)。2株DENV-3分离株间核苷酸同源性为98.4%,氨基酸同源性为99.4%,均属基因Ⅰ型,与缅甸2017年、马来西亚2015年流行株核苷酸同源性较高(99.3%~99.7%)。1株DENV-4分离株与越南2013、2016年流行株同源性较高(99.3%~99.5%),属基因Ⅰ型。结论2017—2018年东莞市登革热的病原体主要为DENV-1,其次是DENV-2,各至少有2种基因亚型同时在流行;DENV-3和DENV-4各至少有1种基因亚型在流行。流行方式主要为南亚和东南亚国家及我国中山、台湾等地输入病例引起的本地暴发流行,存在输入引起本地感染的风险。 展开更多
关键词 Ⅰ~Ⅳ型登革病毒(DENV-1~DENV-4) E基因 基因亚型 序列同源性 进化分析
登革病毒1型Ⅰ~Ⅴ基因亚型的基因组差异分析
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作者 文送娇 陈曦 +8 位作者 洪珊 席珏敏 王晓丹 陈俊英 潘玥 叶超 管娇琼 林垚 孙强明 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第2期152-156,共5页
目的分析登革病毒1型(Dengue virus type 1,DENV-1)Ⅰ~Ⅴ基因亚型基因组全长核苷酸及氨基酸序列差异。方法通过GenBank搜索DENV-1 5个不同基因亚型的全长基因组序列,获得其相应的氨基酸序列。采用BIOEDIT软件,统计基因亚型间核苷酸突变... 目的分析登革病毒1型(Dengue virus type 1,DENV-1)Ⅰ~Ⅴ基因亚型基因组全长核苷酸及氨基酸序列差异。方法通过GenBank搜索DENV-1 5个不同基因亚型的全长基因组序列,获得其相应的氨基酸序列。采用BIOEDIT软件,统计基因亚型间核苷酸突变和氨基酸替代位点,分析其相似度,通过RNA二级结构在线预测网站预测DENV-1不同亚型间3′UTR的二级结构差异,蛋白结构在线预测网站预测主要流行于中国的Ⅰ及ⅤDENV-1基因亚型结构蛋白的二级结构,对其氨基酸组成及编码序列中可能存在的蛋白结合区域等进行差异分析。结果DENV-1 5个基因亚型核苷酸相似性为91. 40%~94. 50%,氨基酸序列相似性为97. 11%~98. 38%,5个基因亚型各自编码3 392个氨基酸,其中共有195个位点有氨基酸的变化。DENV-1不同亚型的3′UTR的二级结构各不相同。DENV-1基因型为Ⅰ、Ⅴ的775个氨基酸中占组成比例最多的均是苏氨酸(T),Ⅰ型可能的蛋白结合位点有26个,多聚核苷酸结合位点有9个。Ⅴ型可能的蛋白结合位点有24个,多聚核苷酸结合位点有7个。他们均有相同数量的螺旋和跨膜螺旋。结论通过对DENV-1 5个不同的基因亚型的全长核苷酸和氨基酸序列的比较分析,及Ⅰ、Ⅴ基因亚型结构蛋白二级结构的预测,为研究DENV-1不同基因型之间的生物学和致病性差异提供参考。 展开更多
关键词 登革病毒1型 基因亚型 基因 结构蛋白 二级结构
锦州女性人乳头瘤病毒基因分型检测结果分析 预览
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作者 王丹丹 黄丹 张蕴莉 《锦州医科大学学报》 CAS 2019年第1期66-68,共3页
目的探讨锦州地区女性高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染分布的特征。方法选取2016年8月至2018年8月锦州医科大学附属第一医院妇科门诊收治的4977例女性患者为研究对象,采集其宫颈脱落细胞,采用实时荧光PCR反应检测15种高危型HPV(16、18、31... 目的探讨锦州地区女性高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染分布的特征。方法选取2016年8月至2018年8月锦州医科大学附属第一医院妇科门诊收治的4977例女性患者为研究对象,采集其宫颈脱落细胞,采用实时荧光PCR反应检测15种高危型HPV(16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68、82型)感染情况。结果高危型HPV总感染率为24.93%,排前6位的亚型为HPV16、52、58、51、39、56型。高危型HPV感染率,<31岁与51~60岁妇女均高于31~50岁妇女(P<0.01),61~80岁妇女高于51~60岁妇女(P<0.01)。结论锦州地区妇科门诊妇女高危型HPV感染率与中国部分地区基本一致,年轻妇女与老年妇女高危型HPV感染率较高。 展开更多
关键词 高危型人乳头瘤病毒 感染 基因亚型
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郑州地区22708例女性HPV感染及基因亚型分布研究 预览 被引量:1
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作者 张亚丽 彭仁佳 +3 位作者 范毅凯 熊灵军 刘猛 马军 《检验医学与临床》 CAS 2019年第11期1537-1540,1543共5页
目的分析郑州地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染现状及基因亚型分布情况。方法选取2012年5月至2017年11月在该院进行HPV检测的门诊、住院患者及健康体检女性22708例,采用聚合酶链反应-反向点杂交技术进行HPV基因分型检测,可检测HPV16、18... 目的分析郑州地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染现状及基因亚型分布情况。方法选取2012年5月至2017年11月在该院进行HPV检测的门诊、住院患者及健康体检女性22708例,采用聚合酶链反应-反向点杂交技术进行HPV基因分型检测,可检测HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82共17种高危型,以及HPV6、11、42、43、81、83共6种低危型,并对检测结果进行统计分析。结果22708例研究对象中HPV感染阳性者7581例,检出率为33.38%。检出率位于前5位的高危型分别为HPV16(12.48%)、52(9.13%)、58(7.33%)、56(5.54%)、53(4.36%);低危型检出率位于前3位的分别为HPV6(8.52%)、43(7.61%)、11(5.44%)。HPV单一感染率为64.53%,多重感染率为35.47%,多重感染中以二重感染为主,占22.48%。2012-2017年每年HPV感染的基因亚型分布情况基本一致,感染亚型主要为HPV16、58、52,HPV感染类型也基本保持一致。结论该地区HPV亚型分布有其特点,以高危型和单一感染为主。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因亚型 郑州
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2012—2014年钦州市新发现报告HIV/AIDS患者病毒基因亚型研究 预览
6
作者 李梅 陈燕兰 +9 位作者 钟亨 陈峒碧 方宁烨 周信娟 唐凯玲 梁淑家 沈智勇 唐振柱 张鸿满 李剑军 《应用预防医学》 2019年第3期181-185,189共6页
目的了解钦州市近年新发现报告HIV/AIDS病例的病毒基因亚型及传播簇的特征。方法按方便抽样方法选取2012—2014年确证实验阳性患者剩余的血浆样本进行HIVpol区基因片段扩增和序列测定,对获得的核酸序列进行系统进化树构建并鉴定毒株的... 目的了解钦州市近年新发现报告HIV/AIDS病例的病毒基因亚型及传播簇的特征。方法按方便抽样方法选取2012—2014年确证实验阳性患者剩余的血浆样本进行HIVpol区基因片段扩增和序列测定,对获得的核酸序列进行系统进化树构建并鉴定毒株的基因亚型,分析基因亚型分布及传播簇特征。结果2012—2014年钦州市新发现报告1558例HIV/AIDS患者,纳入pol区基因扩增167例,扩增阳性147例,有139例获得pol区基因序列。亚型分析发现CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC等3种基因亚型和1种独特重组型(URF),分别占基因序列分析例数的72.66%、3.60%、23.02%和0.72%。在经异性传播途径传播的120例病例中,CRF01_AE所占的比例最高(76.67%),其次是CRF08_BC(18.33%)和CRF07_BC(3.60%)。在经注射吸毒途径传播的13例病例中,仅发现CRF01_AE(46.15%)和CRF08_BC(53.85%)两种基因亚型。101例主要流行CRF01_AE亚型毒株聚集成5个传播簇Cluster1、2、3、4、7,分别占23.76%、68.32%、5.94%、0.99%、和0.99%,以第2传播簇为主。结论钦州市近年流行的HIV-1以CRF01_AE为优势毒株,经异性途径感染的毒株以CRF01_AE为主要毒株且以第2传播簇为主,而在经注射吸毒感染的毒株中CRF08_BC占一半以上,提示钦州市HIV传播仍以本地流行的毒株为主。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 基因亚型 传播簇
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上海市闵行区未经抗病毒治疗的HIV-1感染者耐药突变研究
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作者 欧阳霖 汪静 +2 位作者 张颖华 王小光 陈国强 《中国卫生检验杂志》 CAS 2019年第12期1515-1518,共4页
目的研究上海市闵行区未经 HIV 抗病毒治疗的 HIV-1 感染者/获得性免疫缺陷综合征( AIDS)患者的原发耐药水平和闵行区现今 HIV 病毒的流行现状。方法收集 2016 年- 2018 年上海市闵行区首次确认为 HIV-1 阳性的HIV 感染者血浆,采用反转... 目的研究上海市闵行区未经 HIV 抗病毒治疗的 HIV-1 感染者/获得性免疫缺陷综合征( AIDS)患者的原发耐药水平和闵行区现今 HIV 病毒的流行现状。方法收集 2016 年- 2018 年上海市闵行区首次确认为 HIV-1 阳性的HIV 感染者血浆,采用反转录/巢式 PCR扩增 pol 基因,并进行序列测定和亚型分析。结果闵行区 HIV-1 感染者感染途径为异性性行为( 29 /27. 9),同性性行为( 70 /67. 3),注射毒品及输血( 5 /4. 8),基因亚型共 6 种: CRF01_AE、CRF07_BC、 CRF B、CRF D、CRF C、CRF08_BC,主要的基因亚型为 CRF01_AE( 57 例,54. 8%)和 CRF07_BC( 31 例,29. 8%);104 例中有 10 例( 9. 6%)分别产生了对非核苷类反转录酶抑制剂( NNRTIs)以及蛋白酶类抑制剂( PIs)的耐药突变,其中 9 例具有潜在低度耐药。结论闵行区未出现主要的耐药基因突变,传播耐药处于低度流行水平,应加强对 HIV-1 耐药情况的监测;闵行区艾滋病的防治重点为外来流动人员以及男男性行为人群。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒/获得性免疫缺陷综合征 抗病毒治疗 原发耐药 基因亚型
广西柳州1998-2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化
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作者 康瑞华 罗柳红 +12 位作者 陈欢欢 李剑军 梁淑家 朱秋映 蓝光华 沈智勇 唐振柱 杨文敏 廖玲洁 冯毅 邵一鸣 邢辉 阮玉华 《中国热带医学》 CAS 2019年第9期818-822,828共6页
目的了解广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化情况。方法选取HIV阳性者,采集全血标本进行DNA提取、pol基因区扩增、测序和判定亚型。采用趋势卡方检验分析不同时间段亚型亚簇变化情况。结果自2007年起检测发现CRF01AE... 目的了解广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化情况。方法选取HIV阳性者,采集全血标本进行DNA提取、pol基因区扩增、测序和判定亚型。采用趋势卡方检验分析不同时间段亚型亚簇变化情况。结果自2007年起检测发现CRF01AE的cluster 3和cluster 4两个亚簇,自2010年起检测发现CRF5501B亚型。广西柳州地区流行的亚型、亚簇种类在增加。1998—2006年、2007—2009年、2010—2014年和2015—2018年这四个时间段,CRF01AE亚型的构成比分别为95.3%(346/363)、96.7%(734/759)、94.8%(1 536/1 620)和88.0%(499/567);CRF01AE亚型cluster 1的构成比分别为93.4%(339/363)、91.8%(697/759)、89.3%(1 447/1 620)和79.5%(451/567),趋势卡方检验表明CRF01AE亚型和cluster 1感染者的构成比呈下降趋势(P<0.01)。CRF5501B亚型在2010—2014年和2015—2018年分别发现为7和12人。结论CRF01AE为广西柳州市的主要流行亚型,但该亚型感染者的构成比有下降趋势;该地区CRF01AE亚型中亚簇和HIV亚型种类的增加,提示可能存在新的HIV毒株传入。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 基因亚型 亚簇
孝感市丙型肝炎的流行病学调查分析 预览
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作者 杨叶子 魏威 《检验医学与临床》 CAS 2019年第22期3301-3303,3307,共4页
目的分析湖北省孝感市丙型肝炎的流行特征。方法选取中国疾病预防控制信息系统湖北省孝感市2015-2017年报告的10840例丙型肝炎患者为研究对象,对其年龄、性别、职业、所属地区和发病时间等信息进行统计分析。之后随机选取部分患者(720... 目的分析湖北省孝感市丙型肝炎的流行特征。方法选取中国疾病预防控制信息系统湖北省孝感市2015-2017年报告的10840例丙型肝炎患者为研究对象,对其年龄、性别、职业、所属地区和发病时间等信息进行统计分析。之后随机选取部分患者(720例),询问其感染方式并对患者所感染的病毒基因亚型进行检测。结果2015-2017年孝感市丙型肝炎发病率逐年递增,年平均发病率为25.37/10万;性别方面,男性患者数是女性的1.16倍;年龄方面,随年龄增长发病率大致呈先升后降的趋势,50~<60岁年龄段患者的发病率高于其他年龄段(P<0.05);地区分布方面,患者主要集中在云梦县和孝南区,两地的发病率均高于其他地区(P<0.05);发病时间方面,各月的构成比较为均匀,季节差异无统计学意义(P>0.05);职业方面,构成比较高的前3位依次为农民(29.18%)、商业服务人员(20.56%)和离退休人员(18.10%)。共720例患者参与调查,结果显示在所有感染途径中有偿献血占比最高(80.51%);病毒基因亚型方面,以1b和2a为主,分别占85.77%和13.82%。结论孝感市丙型肝炎防控形势严峻,相关部门应加强防控措施,有效降低发病率。 展开更多
关键词 丙型肝炎 流行病学 基因亚型 疫情分析
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徐州地区73株大肠杆菌O157:H7的遗传多样性分析 预览
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作者 顾玲 祖荣强 +2 位作者 周璐 杨华富 张雪峰 《江苏预防医学》 CAS 2019年第1期30-32,共3页
目的 了解不同来源大肠杆菌O157:H7菌株遗传标志物的分布频率。方法对1999年徐州地区O157:H7暴发疫情中分离到的73株O157:H7菌株,用PCR方法对stx1和stx2阳性菌株分别进行亚型分型;对stx2阳性菌株检测q933和q21基因;用RT-PCR进行tir等位... 目的 了解不同来源大肠杆菌O157:H7菌株遗传标志物的分布频率。方法对1999年徐州地区O157:H7暴发疫情中分离到的73株O157:H7菌株,用PCR方法对stx1和stx2阳性菌株分别进行亚型分型;对stx2阳性菌株检测q933和q21基因;用RT-PCR进行tir等位基因检测。结果73株菌中除1株tir(255A)和tir(255T)均为阴性外,其余菌株均携带tir(255T)基因;10株携带stx1,亚型分型检测显示均为stx1a;全部分离株均为stx2阳性,其中携带stx2a13株(17.81%),携带stx2c60株(82.19%)。食品中未检出stx2a;病人分离株中stx2a检出率高于动物分离株,差异有统计学意义(P<0.01),食品、动物分离株中stx2c检出率(100.00%、87.30%)较高。13株(17.81%)菌株为单q933阳性,60株(82.19%)为单q21阳性。食品中未检出q933,病人分离株中检出率高于动物分离株(P<0.01);q21在病人分离株中未检出,食品、动物分离株检出率较高(100.00%、87.30%)。结论不同来源的O157:H7分离菌株的遗传标志存在多样性,这可能有助于从外环境来源菌株中识别具有潜在人类疾病风险的基因型。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157:H7 志贺毒素 基因亚型 遗传标志物
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维吾尔族妇女型别特异性持续HPV感染状况及病毒学因素 预览
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作者 隋霜 玛依努尔·尼牙孜 +1 位作者 王琳 朱开春 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第4期643-646,共4页
目的:分析维吾尔族妇女型别特异性HPV持续感染的情况及转归。方法:以2012年9月至2013年9月在新疆自治区人民医院妇科门诊和病房自愿接受宫颈癌机会性筛查维吾尔族妇女为筛选对象,利用HC-ⅡHPV DNA检查和凯普HPV导流杂交分型技术确定HPV... 目的:分析维吾尔族妇女型别特异性HPV持续感染的情况及转归。方法:以2012年9月至2013年9月在新疆自治区人民医院妇科门诊和病房自愿接受宫颈癌机会性筛查维吾尔族妇女为筛选对象,利用HC-ⅡHPV DNA检查和凯普HPV导流杂交分型技术确定HPV感染和型别,对筛查结果为HPV感染慢性宫颈炎的妇女,通过问卷调查和36个月的随访,使用Logistic回归分析其持续感染影响因素。结果: HPV型别特异性持续感染率在12、24、36个月的复查时分别为25.5%(65/255),15.7%(40/255),11.0%(28/255);在随访12个月时HPV>1 000段相对于病毒载量1≤HPV≤100妇女型别特异性持续感染的风险增加2.40倍(95%CI:1.11~5.15);随访24个月、36个月,发现单一型别比多重感染更容易发现型别特异性HPV持续感染(OR:3.07,95%CI:1.23~7.68;OR:4.31,95%CI:1.10~16.90);随访12个月、24个月、36个月,发现HPV16阳性比非HPV16型发生型别特异持续感染的风险增加(OR:4.81,95%CI:2.63~8.18;OR:2.73,95%CI:1.08~6.88;OR:4.69,95%CI:1.10~19.97)。结论: HPV16阳性、极高病毒载量、单一感染是维吾尔族妇女HPV持续感染的危险因素,应加强该人群的随访检测。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 基因亚型 转归
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甘肃地区宫颈鳞癌和腺癌患者人乳头瘤病毒感染基因亚型分布研究 预览 被引量:1
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作者 周庆云 石清芳 +2 位作者 赵洁 王东存 唐兆瑞 《卫生职业教育》 2019年第1期142-144,共3页
目的研究甘肃地区宫颈鳞癌和宫颈腺癌患者感染人乳头瘤病毒(HPV)的基因亚型,为甘肃地区防治宫颈癌、研制适合本地区的HPV疫苗提供流行病学资料。方法采用医用核酸分子快速导流杂交基因芯片技术(Hybrimax),对甘肃省境内377例宫颈鳞癌及3... 目的研究甘肃地区宫颈鳞癌和宫颈腺癌患者感染人乳头瘤病毒(HPV)的基因亚型,为甘肃地区防治宫颈癌、研制适合本地区的HPV疫苗提供流行病学资料。方法采用医用核酸分子快速导流杂交基因芯片技术(Hybrimax),对甘肃省境内377例宫颈鳞癌及31例宫颈腺癌患者(均经我院病理确诊)的宫颈脱落细胞进行21种HPV亚型感染检测,对HPV基因亚型分布及HPV感染型别的分布情况进行统计学分析,研究人乳头瘤病毒感染亚型与宫颈鳞癌和宫颈腺癌的相关性。结果377例宫颈鳞癌患者HPV总感染率为95.5%(360/377),共检测到17种HPV亚型,其中高危型13种(16、58、18、33、31、52、39、68、51、53、45、56、59型),低危型4种(81、44、42、43型),未检测到6、11、35、66、型,HPV16型感染率最高,为76.7%,单一感染率为88.6%;39例宫颈腺癌患者HPV总感染率为48.7%(19/39),共检测到6种HPV亚型,均为高危型单一感染,依次为16型(47.4%)、18型(26.3%)、52型(10.5%)和58、51、45型(均为5.3%)。结论甘肃地区高危型HPV16、58、18、33、31型是宫颈鳞癌患者的主要感染亚型,高危型HPV16、18、52、58、51、45型是宫颈腺癌患者的主要感染亚型,而HPV16型单一感染可能更易导致宫颈鳞癌和腺癌。 展开更多
关键词 宫颈鳞癌 宫颈腺癌 人乳头瘤病毒 基因亚型
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HIV分子流行病学研究和实践进展 预览
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作者 钟平 《新发传染病电子杂志》 2019年第3期137-144,共8页
本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展... 本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展,包括全球HIV-1亚型多样性和分布地域性、我国HIV-1亚型此消彼长、新型重组病毒频繁发生和HIV分子传播网络研究进入实践阶段。本文明确指出了HIV-1亚型和重组病毒多样性是阻碍遏制HIV流行的关键因素,并强调了基于分子簇的精准干预在助力控制艾滋病流行中的重要意义。本文将为从事艾滋病防治事业的公共卫生专业人员、医生以及实验室工作人员提供较新的信息,供读者进一步学习和参考。 展开更多
关键词 HIV/AIDS 分子流行病学 基因亚型 重组病毒 分子传播网络
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福州地区体检女性HPV感染及基因亚型分析 预览
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作者 杨阳 陈良远 +5 位作者 曹鹏驹 陈少婷 张秋琴 黄春莉 吴秋妹 陈发林 《检验医学》 CAS 2019年第2期144-147,共4页
目的了解福州地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染情况及其基因亚型分布特点,为该地区宫颈癌的预防、诊治提供理论依据。方法收集2014年2月—2017年12月福建省立医院18542位体检女性宫颈脱落细胞样本,采用通用引物多重聚合酶链反应(PCR)及流... 目的了解福州地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染情况及其基因亚型分布特点,为该地区宫颈癌的预防、诊治提供理论依据。方法收集2014年2月—2017年12月福建省立医院18542位体检女性宫颈脱落细胞样本,采用通用引物多重聚合酶链反应(PCR)及流式荧光杂交分型法检测HPV的27个基因亚型。结果18542例样本中HPV阳性2902例,阳性检出率为15.7%。27个基因亚型均被检出,高危型居前4位的依次为52、58、53和16型,低危型居前4位的依次是61、81、44和55型;单一感染2267例(78.1%),二重感染493例(17.0%);不同年龄段女性HPV阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论福州地区体检女性HPV感染高危型别为52、58、53和16型,以单一感染和二重感染为主。加强对50岁以上女性的HPV筛查工作,对于宫颈癌的预防及早期治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因亚型 宫颈癌
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宁夏男男性行为人群HIV-1感染者基因亚型及耐药分析 预览
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作者 曹慜 杨东智 +2 位作者 吴忠兰 马学旻 詹军 《宁夏医学杂志》 CAS 2019年第1期12-14,共3页
目的了解宁夏男男性行为(MSM)人群HIV-1的流行亚型分布及耐药基因变异情况。方法采用方便抽样方法,抽取宁夏籍男男性行为人群HIV-1感染者共33份血浆标本,进行反转录/巢式PCR扩增HIV病毒的pol基因片段、DNA测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐... 目的了解宁夏男男性行为(MSM)人群HIV-1的流行亚型分布及耐药基因变异情况。方法采用方便抽样方法,抽取宁夏籍男男性行为人群HIV-1感染者共33份血浆标本,进行反转录/巢式PCR扩增HIV病毒的pol基因片段、DNA测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐药数据库进行比对分析。结果宁夏MSM人群HIV-1毒株总体上未见明显的区域聚集性,33例样本呈现4种基因亚型分布:CRF07BC、CRF01AE、B、CRF5501B,优势毒株为CRF07BC(66.67%)和CRF01AE(18.18%)亚型。CRF07BC亚型序列主要形成2个基因簇。发现7例耐药突变株,全部为原发耐药,5例产生NRTIs与NNRTIs交叉耐药。结论宁夏MSM人群HIV-1流行毒株亚型分布较复杂,重组型毒株已成为优势流行株。原发耐药发生率高,交叉耐药明显,暂未见传播耐药株。 展开更多
关键词 男男性行为人群 艾滋病 基因亚型 耐药性
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HIV-1基因亚型分布及流行现状
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作者 缪礼锋 苏斌 《安徽预防医学杂志》 2019年第1期46-52,共7页
自1981年首次文献报道艾滋病以来,三十五年来人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)在全球持续蔓延,根据联合国艾滋病规划署(UNAIDS)公布的数字显示[1],截止2015年底全球存活的HIV/AIDS高达3 600多万,当年新感染者180万,... 自1981年首次文献报道艾滋病以来,三十五年来人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)在全球持续蔓延,根据联合国艾滋病规划署(UNAIDS)公布的数字显示[1],截止2015年底全球存活的HIV/AIDS高达3 600多万,当年新感染者180万,死亡94万,艾滋病成为威胁人类健康的首要传染病。随着艾滋病的全球流行,HIV病毒亚型和亚亚型不断增加. 展开更多
关键词 HIV-1 基因亚型 分布 流行现状
柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化及HIV感染者首次CD4^+T淋巴细胞计数比较
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作者 曹志强 杨文敏 +11 位作者 朱秋映 蓝光华 沈智勇 梁淑家 李剑军 陈欢欢 冯毅 何翔 廖玲洁 邢辉 阮玉华 邵一鸣 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期580-584,共5页
目的分析柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化,比较HIV感染者首次CD4^+T淋巴细胞计数(CD4),为艾滋病防治提供参考依据。方法选取我国艾滋病综合防治信息系统中1998-2012年柳州市新发现HIV感染者,对其血浆进行RNA提取、扩增、测序和... 目的分析柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化,比较HIV感染者首次CD4^+T淋巴细胞计数(CD4),为艾滋病防治提供参考依据。方法选取我国艾滋病综合防治信息系统中1998-2012年柳州市新发现HIV感染者,对其血浆进行RNA提取、扩增、测序和分型。采用Coharan-Armitage趋势检验法分析HIV基因亚型变化的趋势,采用Wilcoxon秩和检验法分析比较HIV感染者的首次CD4。结果研究对象共有1877例HIV感染者。1998-2012年,CRF01_AE、CRF01_AE(Cluster1)和CRF07_BC亚型构成比分别从78.4%(76/97)上升至91.5%(1441/1574)、63.9%(62/97)上升至74.0%(1164/1574)和17.5%(17/97)下降至4.6%(72/1574),趋势性检验差异均有统计学意义(Z=4.632,P<0.001;Z=2.455,P=0.014;Z=-5.943,P<0.001)。CRF01_AE(Cluster1)、CRF01_AE(Cluster2)、CRF07_BC和CRF08_BC亚型HIV感染者首次CD4的中位数及四分位数间距分别是230(83~375)、215(48~351)、365(254~503)和334(206~479)个/μl。CRF01_AE(Cluster1)和CRF01_AE(Cluster2)亚型HIV感染者的首次CD4均<CRF07_BC亚型(Z=-4.795,P<0.001;Z=-4.238,P<0.001)。结论1998-2012年柳州市新发现HIV感染者以CRF01_AE亚型为主并呈上升趋势,其首次CD4较低,且新发现CRF01_AE亚簇的种类在增加,其亚簇构成比存在变化趋势。 展开更多
关键词 HIV-1 基因亚型 CD4^+T淋巴细胞计数
兔隐孢子虫基因亚型研究进展 预览
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作者 张向前 程如 +1 位作者 齐萌 董海聚 《动物医学进展》 北大核心 2019年第11期95-98,共4页
兔隐孢子虫是近年发现的重要人兽共患寄生原虫,主要引起人和动物腹泻。近年来,不断有人体感染兔隐孢子虫的暴发事件和散在病例,且人兽共患亚型日益增多,凸显出重要的公共卫生意义。论文对兔隐孢子虫基因亚型分布、致病性、人兽共患风险... 兔隐孢子虫是近年发现的重要人兽共患寄生原虫,主要引起人和动物腹泻。近年来,不断有人体感染兔隐孢子虫的暴发事件和散在病例,且人兽共患亚型日益增多,凸显出重要的公共卫生意义。论文对兔隐孢子虫基因亚型分布、致病性、人兽共患风险和地理隔离特征等方面进行综述,为隐孢子虫病的防治提供新视野。 展开更多
关键词 兔隐孢子虫 基因亚型 人兽共患病
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宫颈病变与高危型HPV基因亚型感染的相关性研究 预览
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作者 袁野 于雪娇 +1 位作者 艾清 袁宝山 《国际检验医学杂志》 CAS 2019年第20期2515-2517,2521共4页
目的分析高危型人类乳头瘤病毒(HR-HPV)在不同宫颈病变中的感染情况,为宫颈癌的防治提供依据。方法采用PCR-膜杂交法,对2017年12至2018年12月就诊的1 561例女性的宫颈脱落细胞标本进行HPV基因分型检测。结果1 561例受检者中检出HR-HPV阳... 目的分析高危型人类乳头瘤病毒(HR-HPV)在不同宫颈病变中的感染情况,为宫颈癌的防治提供依据。方法采用PCR-膜杂交法,对2017年12至2018年12月就诊的1 561例女性的宫颈脱落细胞标本进行HPV基因分型检测。结果1 561例受检者中检出HR-HPV阳性557例,HR-HPV感染率为35.86%。≤30岁感染率为53.66%。随着病变的加剧,HR-HPV感染阳性率增高。健康组、宫颈炎组、宫颈上皮内瘤变(CIN)Ⅰ级组、CINⅡ级组、CINⅢ级组、宫颈癌组的HPV感染率分别为10.49%、67.82%、78.22%、80.39%、85.94%、100.00%。单一型感染率为79.53%,其中以16、51、52、58型为主。结论HR-HPV感染呈年轻化,随着宫颈病变程度的增加,HR-HPV的阳性率随之升高。宫颈病变患者常见的HR-HPV亚型为16、51、52、58型,其中16型与宫颈病变程度呈正相关性。 展开更多
关键词 宫颈病变 高危型人乳头瘤病毒 基因亚型
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惠州地区女性体检人群中HPV感染情况调查 预览 被引量:1
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作者 杨育英 朱少美 +2 位作者 刘集鸿 周潇 张丽科 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第1期146-150,共5页
目的筛查广东省惠州地区女性体检人群人乳头瘤病毒(HPV)感染情况,分析其型别特征、年龄分布特点及宫颈病变程度。方法收集2016年8月-2017年6月共702例广东省惠州地区女性体检人群的宫颈脱落细胞标本,采用Luminex200的流式荧光技术检测2... 目的筛查广东省惠州地区女性体检人群人乳头瘤病毒(HPV)感染情况,分析其型别特征、年龄分布特点及宫颈病变程度。方法收集2016年8月-2017年6月共702例广东省惠州地区女性体检人群的宫颈脱落细胞标本,采用Luminex200的流式荧光技术检测27种人乳头瘤病毒(HPV)的基因型,包括高危型别(17种):16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68、26、53和82,低危亚型(10种):6、11、40、42、43、44、55、61、81和83。同时对HPV分型阳性的标本行液基细胞学检测(TCT)。分析HPV流行率、感染型别、年龄分布及宫颈病变程度。结果702例女性体检人群中HPV感染者人数为101例,感染率为14.4%。HPV单一感染型占82.2%(83例/101例),以高危亚型为主(83.1%,69例/83例),前3位感染亚型分别是52型(24.1%,20例/83例)、16型(10.8%,9例/83例)、58型(10.8%,9例/83例)。多重亚型感染占17.8%(18例/101例)。≤30岁、31~40岁、41~50岁、>50岁年龄组感染率分别为18.7%、14.4%、14.0%和11.7%,各年龄层感染率无统计学差异(P>0.05)。其中92例HPV分型阳性患者同时进行了TCT检测,25%人群宫颈有炎症细胞或出血,10.9%人群出现了非典型鳞状细胞不能排除高级别上皮内病变(ASC-H)和低度鳞状上皮内病变(LSIL)。结论广东省惠州地区女性体检人群中HPV感染主要以52型、16型、58型为主,且为单一感染,其中部分HPV感染体检人群宫颈已经出现了病变。流式荧光技术可以精确分出27种最见的HPV亚型,对HPV的筛查具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒(HPV) 流式荧光技术 女性体检人群 基因亚型
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