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江苏省麻疹流行病学分析 预览 被引量:31
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作者 陶红 许文波 +4 位作者 陆培善 姬奕昕 还锡萍 许松涛 马福宝 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期 1508-1510,共3页
目的了解江苏省2005~2007年麻疹疫情特征及麻疹野毒株的基因特征,为进一步控制和消除麻疹提供依据。方法对麻疹发病情况进行描述流行病学分析;对本省分离的116株麻疹病毒进行分子流行病学研究。结果2005--2007年麻疹疫情明显上升,... 目的了解江苏省2005~2007年麻疹疫情特征及麻疹野毒株的基因特征,为进一步控制和消除麻疹提供依据。方法对麻疹发病情况进行描述流行病学分析;对本省分离的116株麻疹病毒进行分子流行病学研究。结果2005--2007年麻疹疫情明显上升,发病率分别达11.13/10万,6.10/10万和7.23/10万。各省辖市中苏州市发病率一直居于首位,其次是经济较发达地区,一些经济欠发达地区也存在数年一次的麻疹高发现象。2005~2007年〈8月龄儿童病例分别占总病例数的10.83%,12.88%,10.98%;≥15岁成人病例分别占总病例数的46.12%。43.19%,44.52%;〈8月龄儿童和≥15岁成人麻疹病例合计占总病例数的55%以上。流动人口麻疹病例主要集中在苏州、常州、无锡市等经济发达地区。2003年至今分离116株麻疹野毒株,均为H1基因型的H1a基因亚型。结论麻疹发病年龄分布已全面呈现“双向移位”现象;流动人口已成为经济发达地区麻疹发病的主要人群;H1a基因亚型为江苏省广泛流行优势基因亚型。 展开更多
关键词 麻疹 疫情特征 基因型 消除策略
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257例肛门及肛管尖锐湿疣组织HPV感染的基因分析 预览 被引量:26
2
作者 张金浩 耿建祥 +6 位作者 樊志敏 王旭波 刘飞 吴崑岚 王小峰 赵雪 王宏景 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期520-523,共4页
目的探讨肛门及肛管尖锐湿疣病变中人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)感染的基因型别及临床意义。方法从257例肛门及肛管尖锐湿疣(condylomaacuminata,CA)石蜡组织标本中提取23种HPVDNA,采用基因扩增结合基因芯片技术对其... 目的探讨肛门及肛管尖锐湿疣病变中人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)感染的基因型别及临床意义。方法从257例肛门及肛管尖锐湿疣(condylomaacuminata,CA)石蜡组织标本中提取23种HPVDNA,采用基因扩增结合基因芯片技术对其组织的23种HPV基因型别进行检测,并对其患者进行临床病理资料分析。结果257例肛门及肛管CA病变组织中检出HPV阳性者183例,HPV感染率为71.21%(183/257)。其中一重HPV感染139例,阳性检出率为54.09%(139/257),多重HPV感染44例,阳性检出率为17.12%(44/257)。一重HPV感染中HPV6型66例,阳性检出率为25.68%(66/257),HPV6型是最主要的感染型别;其次是HPVll型,共有64例,其阳性检出率为24.90%(64/257)。多重HPV感染中,HPV6+11型23例,占多重感染的52.27%(23/44),是多重感染的主要型别;其次是HPV6+11+16型3例,占多重感染的6.82%(3/44)。结论HPV6型、11型、6+11型、6+11+16型感染是肛门及肛管CA的主要致病类型。基因扩增结合基因芯片技术是一种比较适合临床进行高、低危HPV分型检测的诊断方法,其敏感性高、特异性好。 展开更多
关键词 肛门 肛管 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 基因型 基因芯片技术
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浙江省2005年麻疹病毒流行株基因特性分析 预览 被引量:19
3
作者 冯燕 严菊英 +4 位作者 卢亦愚 史雯 茅海燕 周敏 余蓓蓓 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期 406-408,共3页
目的分析浙江省2005年麻疹病毒流行株的基因特性.方法对暴发疫情中分离的4株麻疹病毒采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)基因,纯化产物进行核苷酸序列测定.结果浙江省2005年分离到的4株麻疹病毒流行株... 目的分析浙江省2005年麻疹病毒流行株的基因特性.方法对暴发疫情中分离的4株麻疹病毒采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)基因,纯化产物进行核苷酸序列测定.结果浙江省2005年分离到的4株麻疹病毒流行株均为麻疹H1基因型,属于中国麻疹病毒优势基因型.各分离株之间H基因氨基酸同源性为99.2%~99.7%,N基因氨基酸同源性为99.8%;与中国疫苗株沪191株的H基因和N基因比较,其氨基酸水平上的同源性分别为95.2%~95.5%和95.5%.结论浙江省2005年分离到的麻疹病毒流行株属于同一性状毒株,均为H1基因型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异. 展开更多
关键词 麻疹病毒 基因型 核苷酸序列
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河南地区女性HPV感染及基因型分布研究 被引量:19
4
作者 智艳芳 李肖甫 +3 位作者 班振英 邱翠 荣守华 张新 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2014年第9期660-664,共5页
目的:研究河南地区女性人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)的感染状况及基因型别分布特点,为宫颈癌防治及HPV疫苗研制提供流行病学资料。方法:选取2012一02—2013—05郑州大学第三附属医院妇科门诊、生殖医学门诊、妇女保健... 目的:研究河南地区女性人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)的感染状况及基因型别分布特点,为宫颈癌防治及HPV疫苗研制提供流行病学资料。方法:选取2012一02—2013—05郑州大学第三附属医院妇科门诊、生殖医学门诊、妇女保健及健康体检的河南女性14873例,采用PCR-反向点杂交技术对14873例女性进行HPV基因分型检测,可检测HPVl6、18、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、83和MM4等18种高危亚型以及HPV6、ll、42、43和44等5种低危亚型,并对各亚型感染情况进行分析。结果:14873例女性中共检出HPv阳性者3566例,总阳性率为23.98%(3566/14873),其中高危型感染占69.01%(2461/3566),低危型感染占17.33%(618/3566),低、高危混合感染占13.66%(487/3566)。23种亚型共检出22种,低危型44未检出。高危型HPV基因型按检出频次由高到低排序依次为16(16.73%)、58(10.17%)、52(9.11%)、56(6.48%)、66(5.76%)、33(4.74%)、68(3.92%)、31(3.60%)、53(3.13%)、59(3.00%)、35(2.53%)、51(2.00%)、73(1.08%)、45(0.94%)、83(o.84%)、39(0.69%)、18(0.61%)和MM4(0.04%);低危型由高到低排序依次为43(u.34%)、6(5.17%)、42(4.76%)、11(3.35%)和44(0)。感染类型以单一感染为主,占71.17%(2538/3566),其中以高危型为主,占54.66%(1949/3566),低危型占16.52%(589/3566);多重感染占28.83%(1028/3566),其中以二重感染为主,占20.11%(717/3566)。按年龄将研究对象分为5组,年龄段与HPV感染率呈u型曲线关系,(25岁年龄组HPV感染率高达28.31%,显著高于其他年龄段,X2=22.747,P%O.001;≥55岁年龄组感染率也呈上升趋势。结论:河南地区HPV感染类� 展开更多
关键词 宫颈肿瘤 人乳头瘤病毒 基因型 河南
河南地区宫颈上皮内瘤变及宫颈癌患者HPV感染型别分析 预览 被引量:18
5
作者 智艳芳 徐雪峰 +4 位作者 李肖甫 班振英 邱翠 荣守华 张新 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 北大核心 2014年第2期142-146,共5页
目的探讨河南地区女性宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)及宫颈癌(squamous cells cancer,SCC)患者的人乳头瘤病毒(human papillomavims,HPV)主要感染型别。方法采用PCR-反向点杂交技术对444例CIN及SCC... 目的探讨河南地区女性宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)及宫颈癌(squamous cells cancer,SCC)患者的人乳头瘤病毒(human papillomavims,HPV)主要感染型别。方法采用PCR-反向点杂交技术对444例CIN及SCC患者进行HPV分型检测,并对各亚型感染情况进行分析。结果444例患者中,CINⅠ231例,CINⅡ100例,CINⅢ68例,SCC45例。感染均以高危型、单-HPV感染为主,占61.94%(275/444);其次为双重感染,占26.58%(118/444);双重以上感染仅占11.49%(51/444)。所有患者共检测出21种基因型,高危MM4型及低危44型未检出。CINⅠ组检出21种基因型;CINⅡ组检测出15种基因型;CINⅢ组检测出15种基因型;SCC组检测出15种高危基因型。结论河南地区CIN及SCC患者HPV感染以高危型、单一感染为主,主要感染型别依次为HPV16、58、52、33和66。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因型 宫颈上皮内瘤变 宫颈癌
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福州市人群乙型肝炎分子流行病学研究 预览 被引量:11
6
作者 郑能雄 王镜泉 +7 位作者 纪惠玲 姚栩 郑高 张宏 郭燕 陈智伟 陈杨伟 陈杨 《海峡预防医学杂志》 CAS 2007年第4期 4-6,共3页
[目的]研究福州市人群乙肝流行规律,探讨沿海地区HBV高发的原因,为制定防控策略提供科学依据.[方法]按整群抽样法,以家庭为单位随机抽样,用ELISA方法检测乙肝血清标志物,用荧光定量PCR检测HBV-DNA含量,用型特异性PCR进行乙肝病毒基因分... [目的]研究福州市人群乙肝流行规律,探讨沿海地区HBV高发的原因,为制定防控策略提供科学依据.[方法]按整群抽样法,以家庭为单位随机抽样,用ELISA方法检测乙肝血清标志物,用荧光定量PCR检测HBV-DNA含量,用型特异性PCR进行乙肝病毒基因分型.[结果]福州市检测结果,人群HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb、HBcAb阳性率分别是13.3%、53.3%、2.3%、17.0%、56.8%;沿海2 558份标本阳性率分别是16.8%、45.6%、4.9%、15.8%、53.9%;内陆1 635份标本阳性率分别是9.7%、47.2%、2.2%、15.0%、51.5%;沿海HBsAg、HBeAg阳性率高于内陆(P<0.05).随机抽取323份DNA阳性的样品进行基因分型,B型占49.2%、C型占43.4%、B+C型占7.4%,沿海B、C型比重相近,内陆以B型为主.[结论]福州市人群中HBsAg携带率为13.3%,高于全国平均水平.沿海HBsAg携带率高达16.8%,为福州市乙型肝炎高发人群,应加强乙肝的预防与控制. 展开更多
关键词 肝炎 分子流行病学 基因型
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大肠埃希菌新的氨基糖苷类修饰酶基因型别研究 预览 被引量:13
7
作者 俞莲花 潘春琴 +2 位作者 胡大康 刘池波 张瑾 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期 757-759,共3页
目的研究大肠埃希菌氨基糖苷类修饰酶基因aac(6’)-Ⅰb各亚型的流行情况。方法对氨基糖苷类修饰酶基因aac(6’)-Ⅰb阳性的菌株进行DNA序列测定,测得序列与已在美国国立生物信息中心(NCBI)登录的aac(6’)-Ⅰb基因家族序列比对... 目的研究大肠埃希菌氨基糖苷类修饰酶基因aac(6’)-Ⅰb各亚型的流行情况。方法对氨基糖苷类修饰酶基因aac(6’)-Ⅰb阳性的菌株进行DNA序列测定,测得序列与已在美国国立生物信息中心(NCBI)登录的aac(6’)-Ⅰb基因家族序列比对,确定型别。结果6株aac(6’)-Ⅰb阳性的大肠埃希菌,经DNA序列测定,其中4株为经典型,1株为aac(6’)-Ⅰb—Cr型,另外1株为aac(6’)-Ⅰb新亚型。结论大肠埃希菌氨基糖苷类修饰酶基因aac(6’)-Ⅰb至少存在3种型别,以经典型为主,同时存在aac(6’)-Ⅰb-Cr型和aac(6’)-Ⅰb新亚型。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 氨基糖苷类修饰酶 基因型
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多重耐药产PER-1型超广谱β内酰胺酶阴沟肠杆菌的研究 预览 被引量:8
8
作者 余方友 傅颖媛 +3 位作者 胡龙华 贾坤茹 韩立中 倪语星 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期 642-644,共3页
目的研究多重耐药阴沟肠杆菌017对β内酰胺类抗菌药物耐药的机制 .方法使用双纸片扩散法和改良三相试验对阴沟肠杆菌017进行β内酰胺酶的表型检测,并用聚合酶链反应(PCR)扩增β内酰胺酶基因,对PCR产物进行测序确定基因型别.结果阴沟肠杆... 目的研究多重耐药阴沟肠杆菌017对β内酰胺类抗菌药物耐药的机制 .方法使用双纸片扩散法和改良三相试验对阴沟肠杆菌017进行β内酰胺酶的表型检测,并用聚合酶链反应(PCR)扩增β内酰胺酶基因,对PCR产物进行测序确定基因型别.结果阴沟肠杆菌017经双纸片扩散法证实产超广谱β内酰胺酶(ESBLs),经三相试验证实该菌除了产ESBLs外,还同时产AmpC酶.PCR产物经测序长度为579 bp,与GENEBANK的PAPER1A基因序列100%符合,确定为PER-1基因.结论阴沟肠杆菌017耐β内酰胺类抗菌药物的主要原因是PER-1型 ESBLs和AmpC酶所致. 展开更多
关键词 PER-1超广谱β内酰胺酶 阴沟肠杆菌 多重耐药 聚合酶链反应(PCR) 产超广谱β内酰胺酶 双纸片扩散法 Β内酰胺类 PCR产物 ESBLs 抗菌药物耐药 内酰胺酶基因 产AmpC酶 检测 三相试验 基因型 基因序列 1基因 测序
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宫颈高危型HPV分型检测在宫颈癌筛查中的临床意义 预览 被引量:10
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作者 果海娜 何江耀 +1 位作者 李良 黄锦叶 《中国实验诊断学》 2016年第8期1340-1343,共4页
宫颈癌是常见的妇科恶性肿瘤之一,发病率在女性恶性肿瘤中居第二位,仅次于乳腺癌,据流行病学资料研究显示,在发展中国家,女性宫颈癌的发病率较高,占据宫颈癌发病率的80%,宫颈癌的早发现、早诊断、早治疗对降低宫颈癌发病率起到非常关键... 宫颈癌是常见的妇科恶性肿瘤之一,发病率在女性恶性肿瘤中居第二位,仅次于乳腺癌,据流行病学资料研究显示,在发展中国家,女性宫颈癌的发病率较高,占据宫颈癌发病率的80%,宫颈癌的早发现、早诊断、早治疗对降低宫颈癌发病率起到非常关键的作用。目前几乎所有的流行病学和实验室研究数据均显示,HPV感染是子宫颈癌的主要致病因素,尤其是HR-HPV持续感染与子宫颈癌高度相关,本研究通过宫颈脱落细胞HR-HPV分型检测, 展开更多
关键词 宫颈组织 高危 女性宫颈癌 主要致病因素 妇科恶性肿瘤 多重感染 基因型 阴道镜检查 阴性预告值 子宫颈病变
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深圳散发腹泻患者札如病毒的检测及型别分析 被引量:8
10
作者 王颜歌 何雅青 +4 位作者 向文龙 廖玉学 陈清 俞守义 胡贵方 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1017-1019,共3页
目的了解深圳地区札如病毒(sapovirus,SaV)的感染情况和流行病学特征。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对收集的852份腹泻患者粪便标本进行SaV检测,PCR产物测序进行核苷酸序列比对构建系统发生树并进行同源性比较。结果检... 目的了解深圳地区札如病毒(sapovirus,SaV)的感染情况和流行病学特征。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对收集的852份腹泻患者粪便标本进行SaV检测,PCR产物测序进行核苷酸序列比对构建系统发生树并进行同源性比较。结果检出SaV阳性株16例,阳性率为1.88%。同源性比较发现8例为SaVGI型,7例GIV型,1例GII型。结论深圳地区存在SaV感染,主要基因型为GI型;首次报道中国存在SaVGIV型,与先前检出的安徽株A141和北京株CHN99/BJ360均不同,说明SaV感染在中国存在基因多样性,为进一步研究SaV感染情况提供了流行病学及基因型别基本资料 展开更多
关键词 札如病毒 腹泻 流行病学 基因型
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女性肛门尖锐湿疣组织中HPV感染的回顾性研究 被引量:7
11
作者 徐建妹 张金浩 +6 位作者 耿建祥 夏林 王宏景 吴崑岚 邵馨 梅静 赵雪 《中国妇幼保健》 CAS 2015年第31期5329-5331,共3页
目的探讨女性肛门尖锐湿疣(CA)组织中人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因型及其临床意义。方法选取1985年1月-2015年5月江苏省苏州市吴江区中医院、南京市中医院、常州市中医院肛肠科手术切除的女性肛门及肛管CA石蜡组织标本150份,提取23... 目的探讨女性肛门尖锐湿疣(CA)组织中人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因型及其临床意义。方法选取1985年1月-2015年5月江苏省苏州市吴江区中医院、南京市中医院、常州市中医院肛肠科手术切除的女性肛门及肛管CA石蜡组织标本150份,提取23种HPVDNA,采用基因扩增结合基因芯片技术对其组织进行23种HPV分型的检测,并对患者临床病理资料进行分析。结果150例女性肛门CA组织标本中检出HPV阳性者111例,HPV感染率为74.00%(111/150)。其中单一型HPV感染72例,阳性检出率为48.00%(72/150),多型HPV感染39例,阳性检出率为26.00%(39/150)。单一型HPV感染中HPV11型34例,阳性检出率为22.67%(34/150),HPV11型是最主要的感染型别;HPV6型29例,阳性检出率为19.33%(29/150)。多型HPV感染中,HPV6+11型13例,占多型感染的33.33%(13/39),是多型感染的主要型别;HPV11+18型5例,占多型感染的12.82%(5/39)。结论HPV6型、11型、6+11型、11+18型感染是女性肛门CA最主要的型别。基因扩增结合基因芯片技术是适合临床应用于HPV分型检测的诊断方法,其敏感性和特异性较好,适合分子流行病学的研究。 展开更多
关键词 女性 肛门 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 基因型
杭州地区2009-2010年急性腹泻患者中杯状病毒的检测和分型 被引量:6
12
作者 诸葛小玲 崔大伟 +7 位作者 吴英萍 郑书发 靳淼 段招军 余斐 许世佳 陈凌晓 陈瑜 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1022-1025,共4页
目的了解2009--2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征。方法收集2009--2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,... 目的了解2009--2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征。方法收集2009--2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,并对序列进行系统进化分析。结果急性腹泻患者杯状病毒检出率为21.8%(201/920),其中诺如病毒(Nv)GI型25例、GⅡ型170例、札如病毒(SAV)11例,4例为NVI型和Ⅱ型混合感染、1例为NVⅡ型和SAV混合感染。NV基因型别包括:GI-1(3株)、GI-2(1株)、GⅡ-4/2006b变异株(7株)、GⅡ-2(1株)、GⅡ-7(1株)和GⅡ-4/2008变异株(2株);SAV基凶型别包括:GI-2(5株)、GI-1(4株)和GⅡ-1(1株)。杯状病毒的流行在不同季节、年龄组人群均有发病。结论杯状病毒是2009—2010年引起杭州地区急性腹泻的主要病原之一,其病原具有病毒多样性和基因型别多样性,NVGⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009--2010年杭州地区流行的优势株。 展开更多
关键词 杯状病毒 诺如病毒 札如病毒 基因型
IL-4可变串联重复序列区基因多态性在小儿激素敏感性肾病综合征复发中的意义 预览 被引量:4
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作者 刘海梅 沈茜 +1 位作者 徐虹 杨毅 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期 431-433,共3页
目的探讨IL-4基因VNTR区的基因多态性与小儿激素敏感性肾病综合征复发的关系.方法选择激素敏感性肾病综合征患儿55例,按发病后1年疾病复发情况分为频复发组28例和非频复发组27例(40例有肾活检资料).对照组115例,选自健康献血员.采用聚... 目的探讨IL-4基因VNTR区的基因多态性与小儿激素敏感性肾病综合征复发的关系.方法选择激素敏感性肾病综合征患儿55例,按发病后1年疾病复发情况分为频复发组28例和非频复发组27例(40例有肾活检资料).对照组115例,选自健康献血员.采用聚合酶链式反应(PCR)及PCR产物测序方法,检测患儿与对照组IL-4基因VNTR区的基因型别.对48例患儿于发病初(频复发组23例,非频复发组25例)检测其血清IgE水平.结果 (1)激素敏感性肾病综合征患儿和对照组IL-4基因VNTR区的基因型的分布差异无统计学意义(P>0.05).(2)频复发组B1B1分布频率(96.4%)明显高于非频复发组(66.7%)(P<0.05).(3)发病初期血清中IgE水平:频复发组为(1.98±0.23)g/L,非频复发组为(1.05±0.19)g/L(P<0.05).B1B1组IgE水平为(1.68±0.18)g/L,B1B2和B2B2组为(0.81±0.21)g/L(P<0.05).结论激素敏感性肾病综合征患儿携带IL-4 VNTR区的B1B1基因型者,容易表现为频复发. 展开更多
关键词 激素敏感性肾病综合征 基因多态性 可变串联重复序列 聚合酶链式反应(PCR) 小儿 VNTR区 IL-4基因 IgE水平 频复发 健康献血员 PCR产物 对照组 方法选择 复发情况 测序方法 基因型 分布差异 分布频率 发病初期 患儿 发病后
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九价HPV疫苗所针对的高危型HPV亚型在宫颈癌及其癌前病变中应用有效性的初步预测 预览 被引量:4
14
作者 万晓春 周晓燕 +6 位作者 平波 杨慧娟 杨文涛 郑雨薇 向礼兵 陆永明 朱晓丽 《中国癌症杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期552-558,共7页
背景与目的:宫颈癌是世界范围内女性第4常见的恶性肿瘤,在我国其发病率和死亡率都呈上升趋势,高危型人乳头状瘤病毒(high-risk human papillomavirus,hr HPV)持续感染与浸润宫颈癌(invasive cervical carcinoma,ICC)及其癌前病变... 背景与目的:宫颈癌是世界范围内女性第4常见的恶性肿瘤,在我国其发病率和死亡率都呈上升趋势,高危型人乳头状瘤病毒(high-risk human papillomavirus,hr HPV)持续感染与浸润宫颈癌(invasive cervical carcinoma,ICC)及其癌前病变的发生、发展关系密切,HPV预防性疫苗的研制应用成为宫颈癌一级预防的有效措施。该研究拟通过分析九价HPV疫苗所针对的7种HPV高危亚型(HPV16、18、31、33、45、52和58)在经组织学证实的宫颈癌及癌前病变中的分布,为九价疫苗在本地区人群的应用前景评估提供更多依据。方法:回顾性收集复旦大学附属肿瘤医院病理科行聚合酶链反应-反向点杂交法(polymerase chain reaction-reverse dot blot,PCR-RDB)进行HPV基因分型检测的患者,经计算HPV阳性患者中特定HPV亚型的阳性比例来评价HPV亚型对宫颈癌及其癌前病变的相对贡献。采用比例权重归因(proportional weighting attribution,PWA)方法将多重感染中亚型占比折算至相应的单型别感染。结果:符合入组条件者共计624例,分别为117例未见上皮内病变及恶性病变(negative for intraepithelial lesion or malignancy,NILM),45例低级别鳞状上皮内病变(low-grade squamous intraepithelial lesion,LSIL),268例高级别鳞状上皮内病变(high-grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)和194例ICC。HPV总感染率为84.29%(526/624),在LSIL、HSIL及ICC组中的感染率分别为71.11%,95.90%及91.75%。HPV16/18 PWA合计占比在LSIL、HSIL和ICC组中依次上升,分别为50.00%、70.44%和91.71%。九价疫苗针对的7种hr HPV的PWA合计占比均较HPV16/18提高,在LSIL、HSIL和ICC中分别为86.34%,98.61%和94.89%。额外增加的5种hr HPV(HPV31、33、45、52和58)的相对贡献在LSIL、HSIL和ICC组中依次下降,分别为36.34%、28.17%和3.18%。结论:九价疫苗额外增加的5种hr HPV型别在本地区有望令更高比例的ICC及癌前病变得到预防 展开更多
关键词 基因型 九价人乳头状瘤病毒疫苗 鳞状上皮内病变 宫颈恶性肿瘤
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2002-2007年福建省麻疹野病毒的分离与基因特性分析 被引量:5
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作者 杨秀惠 何爱华 +6 位作者 许江阳 陈雅红 张宏 陈前进 陈昌福 张红榕 周勇 《海峡预防医学杂志》 CAS 2010年第1期8-12,共5页
[目的]收集福建省流行的麻疹野毒株,分析麻疹野病毒的基因特征。[方法]应用B95a或Vero/slam细胞,从疑似病例的咽拭子或尿液标本分离麻疹病毒,用RT-PCR方法扩增分离株病毒的N基因3'端450个核苷酸片段,分析其基因型别及遗传特征。[结果]2... [目的]收集福建省流行的麻疹野毒株,分析麻疹野病毒的基因特征。[方法]应用B95a或Vero/slam细胞,从疑似病例的咽拭子或尿液标本分离麻疹病毒,用RT-PCR方法扩增分离株病毒的N基因3'端450个核苷酸片段,分析其基因型别及遗传特征。[结果]2002年、2006-2007年共从5个设区市分离了14株麻疹野病毒,均为H1a基因亚型。14株病毒核苷酸同源性为97.8%-100%,在遗传树图中分属于4个独立分支,具有不同的来源。福建省分离株与H1基因型中国代表株、H2基因型及疫苗株S191相比,与S191差异性最大(核苷酸同源性91.0%-92.0%,氨基酸同源性88.1%-90.1%)。MV06-32、MV07-30、MV07-39和MV07-46这4株间N基因3'端450个核苷酸间同源性为100%,显示不同地区和年份来源的病毒株具有高度同源性。[结论]福建省目前监测到的麻疹野病毒均为H1基因型、H1a基因亚型,未发现其它型别;不同地区或同一地区内存在多传播链同时循环,也存在同一野病毒株可在不同地区、不同年份间持续循环传播。 展开更多
关键词 麻疹病毒 基因型 福建省
江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征分析
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作者 付建光 施超 +3 位作者 沙丹 石平 鲍昌俊 艾静 《中华流行病学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期72-74,共3页
目的 分析江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征。方法 对2016年12月16-27日江苏省一起急性胃肠炎暴发疫情中病例的肛拭子标本进行核酸提取,利用诺如病毒特异性引物对部分RNA依赖的RNA聚合酶序列及完整衣壳蛋白序列(VP... 目的 分析江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征。方法 对2016年12月16-27日江苏省一起急性胃肠炎暴发疫情中病例的肛拭子标本进行核酸提取,利用诺如病毒特异性引物对部分RNA依赖的RNA聚合酶序列及完整衣壳蛋白序列(VP1)进行RT-PCR扩增,扩增产物测序后进行基因特征分析。结果 序列比对结果显示,PCR产物在诺如病毒RNA依赖的RNA聚合酶区与GⅡ.g型别的西班牙株及芬兰株处于同一分支,同源性为98.7%,在VP1区与GⅡ.1型别的美国株同源性更高(99.4%),初步推断为重组病毒。进一步通过重组分析软件Simplot分析,其可能重组位点在VP1的5 106位点,定位在ORF1/2交叠区。VP1氨基酸变异位点分析显示,其假定的抗原表位及受体结合表位均未出现变异,仅在132位氨基酸位点由N突变为S。结论 江苏省胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒为GⅡ.g-GⅡ.1重组变异株。 展开更多
关键词 诺如病毒 重组 基因型 暴发
我国西北地区蜱土拉弗菌感染的检测与基因分型研究 被引量:4
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作者 贾蕾 张芳 刘增加 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2011年第3期179-182,共4页
目的了解我国西北部分地区蜱土拉弗菌自然感染状况及基因型别特征。方法采用布旗法收集蜱标本,鉴定种属后采用巢式PCR检测土拉弗菌的fopA基因,阳性标本用型特异性引物鉴定细菌种,通过两短串联重复序列(SSTR9、SSTR16)位点扩增进行基... 目的了解我国西北部分地区蜱土拉弗菌自然感染状况及基因型别特征。方法采用布旗法收集蜱标本,鉴定种属后采用巢式PCR检测土拉弗菌的fopA基因,阳性标本用型特异性引物鉴定细菌种,通过两短串联重复序列(SSTR9、SSTR16)位点扩增进行基因型分析,用生物学软件对序列进行比较。结果共捕获11个蜱种、2 460只蜱标本,PCR扩增土拉弗菌fopA基因7个蜱种75只阳性,总阳性率为3.05%,不同蜱种阳性率差异有统计学意义(χ2=20.91,P〈0.01),以日本血蜱的阳性率最高,为17.39%。所有阳性标本均属于B亚种。75份阳性蜱标本在SSTR9区共有9种不同的基因型,其中拷贝数为9的基因型在阳性蜱标本中占40.00%(30/75);不同地区的阳性标本在SSTR9区基因型别存在明显交叉,而在SSTR16区有完全相同的序列及重复序列的拷贝数。结论我国西北部分地区存在蜱土拉弗菌感染,且细菌的基因型丰富、复杂。 展开更多
关键词 土拉弗菌 短串联重复序列 巢式PCR 基因型
2010—2014年卢龙县5岁以下婴幼儿腹泻星状病毒流行特征分析 被引量:3
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作者 于秋丽 刘莹莹 +3 位作者 赵文娜 谢赟 苏通 齐顺祥 《实用预防医学》 CAS 2017年第1期52-54,共3页
目的研究卢龙县婴幼儿腹泻患者星状病毒流行病学特点和基因型别。方法收集2010—2014年卢龙县儿童医院及妇幼保健院5岁以下腹泻住院患儿粪便标本,采用RT—PCR法检测星状病毒,并对部分PER阳性标本进行测序鉴定基因型。结果1880份粪便... 目的研究卢龙县婴幼儿腹泻患者星状病毒流行病学特点和基因型别。方法收集2010—2014年卢龙县儿童医院及妇幼保健院5岁以下腹泻住院患儿粪便标本,采用RT—PCR法检测星状病毒,并对部分PER阳性标本进行测序鉴定基因型。结果1880份粪便标本检测出星状病毒阳性标本47份,检出率为2.5%,年龄分布为0~47月龄,87.2%感染者的年龄在24月龄以下;发病以冬季多见,2—5月阳性检出率较高,在4.23%~5.61%之间,部分核酸阳性标本经序列分析鉴定为HastV-1。结论星状病毒是卢龙县婴幼儿腹泻的重要病原,呈现明显的寒冷季节高发的流行趋势,HAstV-1为该地区的流行毒株。 展开更多
关键词 星状病毒 病毒性腹泻 基因型
天津市2012年至2016年A组β型溶血性链球菌emm基因型别变化特征分析
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作者 阴杰莹 董杰 +2 位作者 李琳 张维 董晓春 《中华传染病杂志》 CSCD 2018年第1期42-44,共3页
猩红热是由A组B型溶血性链球菌(group A streptococcus,GAS)引起的急性呼吸道传染病,临床特点为起病急、发热、咽炎、弥漫性皮疹、继而脱皮.
关键词 溶血性链球菌 STREPTOCOCCUS 基因型 天津市 急性呼吸道传染病 β 弥漫性皮疹 临床特点
高原牧区藏族妇女宫颈鳞癌HPV感染型别分析
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作者 马淑娟 韩启福 +1 位作者 徐燕 刘显妮 《中国妇产科临床杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期54-55,共2页
目的探讨高原牧区藏族妇女宫颈鳞癌患者的人乳头瘤病毒(HPV)感染特点、常见型别及好发年龄。方法对75例高原牧区藏族宫颈癌鳞患者的临床资料进行分析,包括HPV感染率、好发年龄,不同HPV亚型感染率和HPV多重感染率,并与同期收治的50例... 目的探讨高原牧区藏族妇女宫颈鳞癌患者的人乳头瘤病毒(HPV)感染特点、常见型别及好发年龄。方法对75例高原牧区藏族宫颈癌鳞患者的临床资料进行分析,包括HPV感染率、好发年龄,不同HPV亚型感染率和HPV多重感染率,并与同期收治的50例汉族患者进行比较。结果两组HPV感染率均为100%,感染均为高危型,藏族组以HPV16、18、33亚型多见,汉族组以HPV16、33亚型多见,藏族组HPV16、18感染率分别为56.0%和36.0%,均高于汉族组的38.0%和10.0%(P〈0.05)。感染均以单一感染为主,藏族组的双重及以上感染比例为30.0%,明显高于汉族组的2.0%(P〈0.05)。结论高原牧区藏族宫颈癌患者HPV感染及型别分布与汉族患者存在差异。 展开更多
关键词 高原牧区 藏族 宫颈癌 HPV 基因型
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