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猪繁殖与呼吸综合征病毒CH—1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究 预览 被引量:28
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作者 刘光清 薛强 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期 81-87,共7页
对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析。结果表明,CH-1a株ORF1全长11882nt,其中ORF1a长7512nt、ORF1b长4374nt。它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV... 对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析。结果表明,CH-1a株ORF1全长11882nt,其中ORF1a长7512nt、ORF1b长4374nt。它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%。ORF1编码两个聚合蛋白,其中ORF1a编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白(Nsp1α、Nsp1β、Nsp2-5),以Nsp2的变异性最为显著,它与LV株的氨基酸同源性为41%。ORF1b编码的聚合蛋白经裂解后,产生4个成熟的非结构蛋白(RdRp,CP2-4),其中RdRp为病毒的复制酶,CP4表现出较大的变异性,与LV株的氨基酸同源性为48%。在ORF1a-ORF1b的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构,它们是核糖体移码翻译所必需的结构。在基因组末端存在非编码区,其中5'NCR长190nt,比LV株5'NCR短31nt,其核苷酸同源性为61%。3'NCR长151nt,比LV株3'NCR长37nt,保守性稍高,其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%。在3'NCR末端有一个poly(A)尾巴,长20nt。在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列,是复制酶识别并结合的区域。本研究进一步证实CH-1a株在基因型上属于北美洲型。 展开更多
关键词 繁殖 呼吸综合征病毒 CH-1A株 非结构基因 分子克隆 基因特征 序列分析 非结构蛋白编码区
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中国2006-2008年流行性腮腺炎病毒的基因特征分析 被引量:33
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作者 崔爱利 朱贞 +9 位作者 王常银 王艳 周剑惠 吴宏伟 王爽 常新 檀晓娟 张燕 毛乃颖 许文波 《中国疫苗和免疫》 CAS 2009年第1期8-13,共6页
目的分析中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2006~2008年流行性腮腺炎(腮腺炎)病毒(Mumps Virus,MuV)的基因特征。方法针对中国2007~2008年分离到的7株MuV小疏水蛋白(Small Hydro-phobic Protein,SH)基因31... 目的分析中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2006~2008年流行性腮腺炎(腮腺炎)病毒(Mumps Virus,MuV)的基因特征。方法针对中国2007~2008年分离到的7株MuV小疏水蛋白(Small Hydro-phobic Protein,SH)基因316个核苷酸片段进行逆转录一聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增,并对该PCR产物进行序列测定,结合从基因库下载的7株2006年中国MuV毒株序列以及世界卫生组织(WHO)MuV基因型参考株一起进行分子流行病学研究。结果通过比较核苷酸和氨基酸同源性和构建亲缘关系树发现,中国2006~2008年14株MuV分离株同属F基因型,但序列相互间存在差异。不同省份、不同年代的MuV毒株在亲缘关系树上呈分散交叉分布,无明显的时间和地理分布倾向。此外,通过分析2006~2008年MuV的组内和组间遗传距离发现,2006~2008年的MuV毒株序列无明显规律性变化。与序列同源性和亲缘关系树分析结果一致。结论中国2006~2008年流行的MuV同属F基因型,是由F基因型MuV的多个传播链引起的。并且1995年和2006~2008年的MuV毒株间序列差异较大,说明1995~2008年中国流行的MuV发生了一定程度的变异。另外,还发现F基因型MuV在SH基因上存在着特异性突变(CNr65、CNt105、GNt137、CNt192、CNt239),而其它基因型MuV在这些位点上均未发生改变。 展开更多
关键词 流行性腮腺炎病毒 基因特征 基因
2003-2007年中国风疹病毒基因特征分析 预览 被引量:29
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作者 朱贞 许文波 +17 位作者 毛乃颖 蒋小泓 许松涛 何吉兰 孙莉 凌华 张珍英 李聪勇 巴卓玛 詹军 陈慧 王飞霞 周淑洁 陈霞 郑蕾 戴德芳 张红 梁勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期 7-16,共10页
本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003~2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RTPCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分... 本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003~2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RTPCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分析。结果提示,在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因亲缘关系树上,其中55株风疹病毒株属于1E基因型,相对于其他国家的1E基因型,形成一个独立分支;另外2株风疹病毒属于2B基因型。57株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第212位氨基酸由Thr变为Ser,其他病毒株均无重要抗原位点的改变;所有我国已分离到的1E基因型风疹病毒在E1蛋白第338位氨基酸共享突变位点(Leu^338→Phe^338),而其他基因型以及其他国家的1E基因型风疹病毒在该位点均未发生突变,提示该氨基酸(Phe^338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有。2003~2007年在我国10个省均分离到1E基因型,而2B基因型只在2006年从四川省的越南输入病例中分离到,提示1E为绝对优势基因型,2B基因型为输入基因型。与1979~1984年和1999~2002年我国流行的风疹基因型不同,发生了基因型的更替,近年我国风疹的流行是由1E基因型为主的风疹野病毒的多个传播链引起。 展开更多
关键词 风疹病毒 基因特征 基因
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无菌性脑膜炎暴发中Echo30病毒的基因特征及分子进化分析 预览 被引量:19
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作者 王海岩 徐爱强 +5 位作者 朱贞 李岩 纪峰 张勇 张丽 许文波 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期 793-797,共5页
目的了解引起无菌性脑膜炎暴发的Echo30病毒的基因特征,分析其遗传变异规律及进化来源。方法对2003年济南章丘市无菌性脑膜炎暴发中分离到的Echo30病毒进行了VPI区全基因序列测定,与国内外报道的Echo30病毒VPU区序列进行同源性比较,... 目的了解引起无菌性脑膜炎暴发的Echo30病毒的基因特征,分析其遗传变异规律及进化来源。方法对2003年济南章丘市无菌性脑膜炎暴发中分离到的Echo30病毒进行了VPI区全基因序列测定,与国内外报道的Echo30病毒VPU区序列进行同源性比较,并通过构建进化树分析其遗传进化规律。结果济南章丘市Echo30分离株VPI区核苷酸同源性在98.9%~99.5%之间,与同年山东省泰安市Echo30分离株同源性最高(98.5%~990%),与浙江、江苏两省的Echo30分离株同源性在98.2%~98.9%,而与1997年法国分离株(89.1%~897%)和2001年台湾省分离株(87.4%~87.6%)的同源性相差较大,与原型株Bastianni株同源性最低,在82.4%~82.8%。进化树分析显示,中国大陆近几年无菌性脑膜炎Echo30分离株独处一支,呈单源性发生关系。结论2003年,Echo30病毒在山东省部分地区发生了一定程度的传播,并导致了无菌性脑膜炎的局部流行,进化树分析表明,中国大陆Echo30分离株与国外早期的分离株相比,其抗原性不完全相同,已形成新的基因亚型。 展开更多
关键词 无菌性脑膜炎 Echo30病毒 基因特征 分子进化
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济南市2009--2011年手足口病病原学及基因特征分析 被引量:20
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作者 刘岚铮 岑瑞琦 +5 位作者 王春荣 吕燕 赵红 杨国樑 张雯 关恒云 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期756-757,共2页
手足口病(HFMD)是由多种肠道病毒(EV)引起的一种急性传染病。2008年5月我国将其纳入法定报告丙类传染病管理,2009年卫生部进一步要求提高其病原学检测比例,2010年山东省开始进行全年监测。本研究采用RT-PCR对2009--2011年济南地... 手足口病(HFMD)是由多种肠道病毒(EV)引起的一种急性传染病。2008年5月我国将其纳入法定报告丙类传染病管理,2009年卫生部进一步要求提高其病原学检测比例,2010年山东省开始进行全年监测。本研究采用RT-PCR对2009--2011年济南地区发生的2066例HFMD患者标本进行分析,阐明重症病例其病原及基因特征。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A16型 基因特征
中国2005年流行麻疹野病毒H1a基因亚型血凝素基因和氨基酸特征分析 被引量:17
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作者 许松涛 姬奕昕 +11 位作者 朱贞 关蓉晖 蒋小泓 张燕 刘中华 崔爱利 毛乃颖 梁勇 周淑洁 张杰 李崇山 许文波 《中国计划免疫》 2006年第1期13-18,共6页
目的研究2005年引起中国麻疹流行的麻疹野病毒H1a基因亚型血凝素蛋白(HA)核苷酸和氨基酸特征及变异程度。方法从各省疾病预防控制中心麻疹实验室送检的2005年麻疹野病毒中选取4个H1a基因亚型代表株,并选取2004年河北省流行的1个Hh基... 目的研究2005年引起中国麻疹流行的麻疹野病毒H1a基因亚型血凝素蛋白(HA)核苷酸和氨基酸特征及变异程度。方法从各省疾病预防控制中心麻疹实验室送检的2005年麻疹野病毒中选取4个H1a基因亚型代表株,并选取2004年河北省流行的1个Hh基因亚型代表株做对比分析。提取麻疹病毒核糖核酸(RNA),用逆转录一聚合酶链反应(RT—PCR)扩增出核蛋白(N)羧基末端(450nt)和HA蛋白编码区基因片段(1854nt),并对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,与GenBank收录的1993~1994年中国优势基因型代表株、中国疫苗株沪191(S191)和长47(C47)HA蛋白和核蛋白羧基末端构建基因亲缘性关系树,分析HA蛋白基因的核苷酸/氨基酸的同源性。结果5株分离株全部为H1基因型的H1a亚型。5株H1a亚型毒株的HA与中国疫苗株S191相比有94~96个核苷酸差异,28~30个氨基酸差异;与C47有94~98个核苷酸差异,28~30个氨基酸差异。5株Hh亚型HA第719位核苷酸由G—A,导致第240位的丝氨酸(S)突变成天门酰胺(N),致使HA蛋白的1个N型糖基化位点丢失。结论该研究表明,麻疹野病毒H1a亚型株的HA蛋白的核苷酸/氨基酸,与1993~1994年流行株相比未发生明显变异。但与S191和C4,相比有较大基因变异,丢失了个别中和抗原位点,但大部分中和抗原位点未发生变异。中国使用的疫苗对现流行的麻疹野病毒仍然具有保护作用,但初免成功后是否绝大部分人具有终身保护还有待进一步病毒学和流行病学论证。2005年麻疹流行与病毒本身的基因突变无明显关联,而是由易感人群的积累和人口流动导致广泛的传播所致。 展开更多
关键词 麻疹病毒 血凝素蛋白 基因特征 H1a基因亚型
蜜蜂病毒学研究进展 被引量:18
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作者 张炫 陈彦平 和绍禹 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期1095-1116,共22页
蜜蜂是自然界最重要的授粉昆虫,对维护自然生态系统的生物多样性和保持农业生态系统的增产效应发挥着巨大的作用。作为世界第一养蜂大国,中国养蜂业健康发展的意义不仅在于获取大量高品质的蜂产品,更重要的是发挥蜜蜂授粉的农业增产... 蜜蜂是自然界最重要的授粉昆虫,对维护自然生态系统的生物多样性和保持农业生态系统的增产效应发挥着巨大的作用。作为世界第一养蜂大国,中国养蜂业健康发展的意义不仅在于获取大量高品质的蜂产品,更重要的是发挥蜜蜂授粉的农业增产效应,保证我国的粮食安全。和其他动物一样,蜜蜂健康也受到多种病害的威胁,近年来蜜蜂病毒病在世界范围内的广泛流行与传播,是导致世界蜂群持续下降的一个重要原因。蜜蜂病毒长期广泛的以无明显发病症状的低浓度隐性感染方式存在于蜜蜂蜂群中,但多数蜜蜂病毒在特定环境条件下可被激活,在寄主体细胞内快速复制,表现出强烈的致病性,引发致死性蜜蜂病毒病的流行与爆发。蜜蜂病毒病知识的缺乏,以及复杂的蜜蜂病毒鉴定技术使得蜜蜂病毒病难以及时确诊和防治,因此每年在养蜂生产上造成的巨大损失已严重阻碍了我国养蜂业的健康发展。本文将综述这一领域的研究成果和学科发展趋势,为在我国开展蜜蜂病毒学研究提供参考,并介绍国外的一些蜜蜂病毒病诊断方法与防治经验服务于我国养蜂生产实践。 展开更多
关键词 蜜蜂病毒 基因特征 传播途径 寄主范围 诊断 防治
OXA型β-内酰胺酶 预览 被引量:12
8
作者 蒋晓飞 洪秀华 倪语星 《国外医药:抗生素分册》 CAS 2003年第5期 232-237,共6页
OXA型β-内酰胺酶大多数出现在革兰氏阴性菌(主要为肠杆菌科菌和铜绿假单胞菌)中,通常介导耐氨基组和脲基组青霉素,强水解氯唑西林、苯唑西林和甲氧西林.克拉维酸仅能微弱抑制其活性,但它却被NaCl强烈抑制.OXA型酶相当于Ambler D类酶,和... OXA型β-内酰胺酶大多数出现在革兰氏阴性菌(主要为肠杆菌科菌和铜绿假单胞菌)中,通常介导耐氨基组和脲基组青霉素,强水解氯唑西林、苯唑西林和甲氧西林.克拉维酸仅能微弱抑制其活性,但它却被NaCl强烈抑制.OXA型酶相当于Ambler D类酶,和A、C类酶一样为活性一位点丝氨酸.OXA型酶的氨基酸序列与A、C类酶的一致性约为16%.至今已报道了33种OXA型酶,命名为OXA-1~31及Amps和LCR-1.大多数酶作了DNA序列分析,有的作了生化分析,对OXA-10和OXA-13还作了三维结构分析.根据氨基酸序列同源性可将OXA型酶分为6个群,群与群之间相关性很弱(约20%~30%).OXA型酶耐药谱通常很窄,但现已发现OXA-2或OXA-10突变衍生酶的耐药谱已扩散到第三代头孢菌素和/或亚胺培南.编码OXA型酶的基因常位于质粒和/或整合子中,具有很强的扩散能力. 展开更多
关键词 OXA型β-内酰胺酶 革兰氏阴性菌 表型特征 基因特征 生化特征
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麻疹病毒分离及现行疫苗免疫效果分析 被引量:14
9
作者 徐闻青 杨忠东 +6 位作者 陈蕾 熊珺 赵玉麟 王树巧 程鹏飞 陆培善 陶红 《中国疫苗和免疫》 CAS 2008年第3期198-202,共5页
目的 分离麻疹流行病毒,与现用麻疹减毒活疫苗(Measles Vaccine,Live;MV)株病毒进行基因比较和交叉中和试验,以分析现行MV的免疫保护性。方法由江苏省疾病预防控制中心提供2005年麻疹局部流行时急性期病人的咽拭子标本,用Vero/S... 目的 分离麻疹流行病毒,与现用麻疹减毒活疫苗(Measles Vaccine,Live;MV)株病毒进行基因比较和交叉中和试验,以分析现行MV的免疫保护性。方法由江苏省疾病预防控制中心提供2005年麻疹局部流行时急性期病人的咽拭子标本,用Vero/Slam细胞分离病毒,同时提取分离病毒和疫苗病毒核糖核酸,用逆转录-聚合酶链反应扩增血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)基因,并进行核苷酸测序分析;另用MV免疫者的血清和麻疹病人的恢复期血清与分离野毒株和疫苗株进行交叉中和试验。结果一次成功分离到4株麻疹野病毒,对其中1株(JS/26-05)作基因测序,N基因进化树分析为H。基因型;与疫苗株病毒基因比较,H基因核苷酸同源性为94.8%,氨基酸同源性为95.1%;N基因核苷酸同源性为94.4%,氨基酸同源性为96.2%,但碳末端150个氨基酸的同源性为90.0%。疫苗免疫者产生的中和抗体水平低于自然感染者,两者的抗体几何平均滴度分别为:针对野毒株1:9.56和1:22.40,针对疫苗株1:40.05和1:65.41,相差2.9~4.2倍;疫苗免疫产生的抗体中和野毒株的能力平均低于疫苗株4.2倍。结论2005年江苏省局部地区麻疹流行时分离的病毒为H1基因型,麻疹分离株与现用疫苗株在基因水平上的差异明显,现用MV的免疫保护作用有所减弱,可能已影响到MV的免疫持久性。 展开更多
关键词 麻疹病毒 沪191疫苗株 基因特征 麻疹减毒活疫苗 免疫效果
2013~2014年杭州地区手足口病柯萨奇病毒A6型和A10型VP1基因特征分析 被引量:15
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作者 谢国良 崔大伟 +3 位作者 郑书发 杨先知 余斐 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第12期938-941,共4页
目的了解2013-2014年杭州地区手足口病病原谱的分布,并对其病原基因特征进行分析。方法采集2013年3月至2014年4月手足口病患儿标本1 340例,提取病毒核酸,通过逆转录和PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对柯萨... 目的了解2013-2014年杭州地区手足口病病原谱的分布,并对其病原基因特征进行分析。方法采集2013年3月至2014年4月手足口病患儿标本1 340例,提取病毒核酸,通过逆转录和PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对柯萨奇病毒A6型(CA-A6)和A10型(CA-A10)VP1全长序列进行同源性比对分析,并构建系统进化树。结果1 340例手足口病患儿标本中,肠道病毒检出阳性率为81.43%(1 090/1 340)。其中,CV-A6阳性率为41.04%,取代EV-71(14.48%)成为杭州地区检出阳性率最高的肠道病毒;CV-A10检出率(8.51%)也高于CV-A16(3.81%),列于第三位。同源性比对及系统进化分析显示,2013-2014年的25株CV-A6病毒核苷酸同源性为89.0%-99.7%,主要分布于G、H基因亚型;15株CV-A10病毒核苷酸同源性为95.3%-99.9%,分布于F、G基因亚型。结论 2013-2014年杭州地区儿童手足口病的主要病原体发生重大变化,CV-A6病毒成为最主要病原,CV-A10病毒也存在潜在威胁,需加强对其他肠道病毒的持续监测和分子特征分析。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6型 柯萨奇病毒A10型 VP1基因 基因特征
两种金小蜂体内Wolbachia的wsp基因分子检测及序列分析 预览 被引量:9
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作者 王欢 李凯 +2 位作者 刘怀 胡萃 叶恭银 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期 235-240,共6页
采用Wolbachia的通用引物及A和B大组特异性引物对蝶蛹金小蜂Pteromalus puparum和丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,并对测定的序列进行了同源性比较和基因特征分析。结果表明:蝶蛹金... 采用Wolbachia的通用引物及A和B大组特异性引物对蝶蛹金小蜂Pteromalus puparum和丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,并对测定的序列进行了同源性比较和基因特征分析。结果表明:蝶蛹金小蜂和丽蝇蛹集金小蜂均被A和B两个大组的Wolbachia复合感染;同种寄生蜂的雌蜂和雄蜂的wsp基因片段序列完全一致。采用通用引物从蝶蛹金小蜂中扩增出Wolbachia的wsp基因片段序列的长度为540bp,属于B大组中Pip组,而从丽蝇蛹集金小蜂中扩增出Wolbachia的wsp基因片段序列的长度为558bp,属于A大组中Uni组。用A-Wolbachia引物从蝶蛹金小蜂和丽蝇蛹集金小蜂中扩增出的wsp基因片段序列长度为548bp,同源性达99.8%;而用B-Wolbachia引物从两者中扩增的两条wsp基因片段序列长度分别为424bp和439bp同源性达87.5%. 展开更多
关键词 蝶蛹金小蜂 丽蝇蛹集金小蜂 WOLBACHIA WSP 基因特征
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中国急性弛缓性麻痹病例脊髓灰质炎疫苗病毒分离株中优势株的基因特征及形成原因浅析 被引量:14
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作者 张勇 严冬梅 +7 位作者 赵蓉 刘桂艳 祝双利 李杰 王东艳 朱晖 安洪秋 许文波 《中国计划免疫》 2006年第3期173-179,共7页
目的研究从中国1996~2002年急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便标本中分离到的脊髓灰质炎(脊灰)疫苗病毒中优势株的基因特征,以及分析优势株形成的原因,从而为中国维持无脊灰状态、疫苗免疫策略的转变提供科学依据。方法对1996-2002... 目的研究从中国1996~2002年急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便标本中分离到的脊髓灰质炎(脊灰)疫苗病毒中优势株的基因特征,以及分析优势株形成的原因,从而为中国维持无脊灰状态、疫苗免疫策略的转变提供科学依据。方法对1996-2002年省级疾病预防控制中心(CDC)脊灰实验室送检的所有脊灰病毒分离株,通过统计学方法确定优势株,然后使用聚合酶链反应.限制性酶切片段长度多态性分析(PCR—RFLP)和酶联免疫吸附试验(ELISA)两种方法对优势株进行型内鉴定。型内鉴定显示与疫苗病毒有差异者,进行VP1区基因核苷酸序列的测定和分析。结果中国1996~2002年从AFP病例中分离的脊灰疫苗病毒Ⅱ型比Ⅰ型和Ⅲ型多,差异有显著的统计学意义,是优势病毒株。在Ⅱ型脊灰病毒中,PCR.RFLP型内鉴定方法检测出Ⅱ型疫苗变异脊灰病毒70株,ELISA型内鉴定方法检测出Ⅱ型双反应(DRV)株13株,全部排除脊灰野病毒。在总计82株Ⅱ型变异脊灰病毒中(1株病毒既是疫苗变异株、也是DRV株),nt2909位点是个突变热点(69/83,83.1%),其中14株变化形式为T2909A,54株变化形式为T2909C,1株变化形式为T2909G;4株Ⅱ型疫苗衍生脊灰病毒(VDPV)被鉴定出来,其在VP1区的抗原性与Sabin株相比并无大的差别。结论中国1996~2002年从AFP病例中分离的脊灰病毒中,Ⅱ型脊灰病毒一直是优势株,但Ⅱ型病毒在VP1区抗原性以及核苷酸序列上与Ⅱ型疫苗病毒相比,并无很大改变。因此,Ⅱ型病毒成为优势株的原因应该在于Ⅱ型病毒本身的一些特性,例如在Ⅱ型疫苗病毒基因组中决定减毒的位点比Ⅰ型疫苗病毒少,以及Ⅱ型脊灰疫苗病毒在人体肠道内复制的时间比Ⅰ型疫苗病毒长等。这是中国Ⅰ型脊灰疫苗病毒比Ⅱ型脊灰疫苗病毒少的两个重要原因。但Ⅱ型脊灰疫苗 展开更多
关键词 脊髓灰质炎疫苗病毒优势株 Ⅱ型脊髓灰质炎病毒 基因特征 形成原因
中国7株W135群脑膜炎奈瑟菌基因特征分析 预览 被引量:14
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作者 田国忠 邵祝军 +4 位作者 李马超 徐丽 任红宇 高源 朱兵清 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期 926-927,共2页
我国流行性脑脊髓膜炎(流脑)的暴发与流行主要由A群和C群引起,W135群脑膜炎奈瑟菌在本世纪初曾引起暴发与流行。目前我国仅从健康人群中分离到W135菌株。我们对健康人群分离的W135群菌株进行多位点序列基因型(MLST)、PorA基因亚型... 我国流行性脑脊髓膜炎(流脑)的暴发与流行主要由A群和C群引起,W135群脑膜炎奈瑟菌在本世纪初曾引起暴发与流行。目前我国仅从健康人群中分离到W135菌株。我们对健康人群分离的W135群菌株进行多位点序列基因型(MLST)、PorA基因亚型和多位点串联重复序列分析(MLVA)基因特征分析,并与致病性W135群菌株的基因特征进行比较,初步探讨我国W135群菌株是否具有致病性。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 W135群 基因特征
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芋螺毒素分子生物学研究进展 预览 被引量:11
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作者 王建华 黄培堂 《中国海洋药物》 CAS CSCD 1997年第4期 30-34,共5页
从海洋软体动物芋螺中分离纯化的芋螺毒素是一类具有特异生物活性的小肽神经毒素,目前芋螺毒素一方面作为神经生物学的重要分于探针正广泛应用于相关靶受体的基础研究中,另一方面则用于研制特异诊断试剂及疗效特异的新药,并作为分子... 从海洋软体动物芋螺中分离纯化的芋螺毒素是一类具有特异生物活性的小肽神经毒素,目前芋螺毒素一方面作为神经生物学的重要分于探针正广泛应用于相关靶受体的基础研究中,另一方面则用于研制特异诊断试剂及疗效特异的新药,并作为分子模型用新药设计,研究涉及蛋白质化学,化学,药理学,电生理及分子生物学等诸多领域,本文综述了近年芋螺毒素分子生物学研究的进展。 展开更多
关键词 芋螺毒素 基因特征 CDNA文库 分子生物学
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水稻硝酸盐转运蛋白基因OsTNrt2.1的编码蛋白特征和表达 被引量:9
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作者 徐海荣 谷俊涛 +3 位作者 路文静 邓若磊 曹云飞 肖凯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期 723-730,共8页
根据Nipponbare的OsNrt2.1 cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1602bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、... 根据Nipponbare的OsNrt2.1 cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1602bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、玉米、小麦、大麦和烟草的NRT基因高度同源。OsTNrt2.1的表达表现器官特异性,在根中高于在叶中。此外,OsTNrt2.1的表达受NH4^+的抑制和NO3^-的诱导,并具典型的昼夜节律特征。在不同NO3^-浓度下,OsTNrt2.1的表达水平相近,表明OsTNrt2.1可能是具有双亲和特征的NRT基因。在不同氮源及不同介质氮浓度条件下,OsTNrt2.1在根中的表达均高于在叶中,表明OsTNrt2.1对于根系吸收NO3^-可能具有重要作用。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) NRT基因 OsTNrt2.1 基因特征 基因表达
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辽宁省2008-2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析 被引量:12
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作者 王艳 马艳 +1 位作者 韩悦 郭军巧 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期506-510,共5页
本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2008-2011年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到13株流行性腮腺炎野病毒(Mumpsvirus,MuV),应用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)针对MuV分离株的SH基因的316个核苷酸片段进行扩增,并对该... 本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2008-2011年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到13株流行性腮腺炎野病毒(Mumpsvirus,MuV),应用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)针对MuV分离株的SH基因的316个核苷酸片段进行扩增,并对该产物进行序列测定。将这13株MuV与从GenBank下载的世界卫生组织(wHO)MuV基因型参考株一起进行分子流行病学研究。结果提示:除2011-015株外,辽宁省2008~2011年12株MuV分离株均属于F基因型,核苷酸和氨基酸同源性为94.9%~100%和83.3%~100%。与F基因型参考株序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4%~97.2%和96.5%~84.2%。表明2008~2011年辽宁省流行的F基因型MuV发生较大的型内变异。另外还发现F基因型MuV在SH基因上存在着特异性突变(CNt65,CNt105,GNt137,CNt192,CNt239,GNT262),而其它基因型MuV在这些位点上均未发生改变。F基因型MuV在sH基因编码的氨基酸保守位点也发生变化。如:第2位上由s—P,第6位上由P—L,第23位上由T—N,第48位上由L—P/R。与基因分型有关的氨基酸三联体,2008—01—007毒株也发生了改变,由IML变为TMP。2011—015株病毒与F基因型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为87.5%和79.8%,与G型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8%和97.4%,属于G基因型。该基因型为中国内地首次发现。 展开更多
关键词 流行性腮腺炎野病毒 SH蛋白 基因特征 基因
新一轮农业结构调整的基本思路 预览 被引量:6
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作者 叶兴庆 《作物杂志》 CSCD 2000年第1期 1-3,共3页
关键词 中国 农业结构调整 基因特征 品质结构 市场结构
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一起儿童病毒性脑炎暴发肠道病毒ECHO6型分离株VP1基因特征分析 预览 被引量:12
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作者 陈前进 曹春远 +4 位作者 吴水新 杨秀惠 罗招福 何云 廖亦红 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期523-526,共4页
目的对埃可病毒6型(ECHO6)福建龙岩分离株进行分子生物学分析,阐明ECHO6病毒福建龙岩分离株的分子生学特征及其与世界其它分离株的基因关系。方法采集暴发病例脑脊液标本,用RD细胞进行分离病毒,阳性分离物采用中和试验及PCR序列分... 目的对埃可病毒6型(ECHO6)福建龙岩分离株进行分子生物学分析,阐明ECHO6病毒福建龙岩分离株的分子生学特征及其与世界其它分离株的基因关系。方法采集暴发病例脑脊液标本,用RD细胞进行分离病毒,阳性分离物采用中和试验及PCR序列分析确定其血清型别;RT-PCR扩增VPl基因全长,测定序列进行同源性及亲缘进化树分析。结果13例细胞培养阳性分离物经中和试验及序列分析结果均为ECHO6。随机选取4株病毒株进行VPl全基因序列分析显示:4个病毒株之间同源性〉99%;与山东病毒株E6/SD/sewagej081226/2-2同源性高于其他参考株。在遗传进化树上,4株分离病毒株同属一个分支,为C2亚型。结论ECHO6是引起本次福建省龙岩市长汀县儿童病毒性脑炎暴发的病原体,其基因型为C2亚型。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 埃可病毒6型 序列分析 基因特征
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2011年郴州市手足口病病原学及EV71型分离株基因特性研究 被引量:12
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作者 谢群 谭徽 +5 位作者 刘爱平 付敏 陈白鹭 何清懿 陈柏塘 郑文 《实用预防医学》 CAS 2013年第3期287-291,共5页
目的了解2011年郴州市手足口病病原学特征及EV71型分离株基因特性,为郴州地区手足口病防治工作提供依据。方法收集郴州市手足口病临床诊断病例的咽拭子或肛拭子、粪便标本,采用实时荧光PCR法检测EV71、CA16和其他肠道病毒核酸。随机挑... 目的了解2011年郴州市手足口病病原学特征及EV71型分离株基因特性,为郴州地区手足口病防治工作提供依据。方法收集郴州市手足口病临床诊断病例的咽拭子或肛拭子、粪便标本,采用实时荧光PCR法检测EV71、CA16和其他肠道病毒核酸。随机挑选55份EV71阳性的标本进行RD细胞分离,10株分离株用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增EV71的VP1片段,并作基因测序和序列分子系统发生树分析。结果 2011年郴州市共报告手足口病例5 128例,发病有两个高峰,分别是5-7月和11-12月。病原学检测提示,2011年检测手足口病标本574例,发病年龄以1~3岁儿童为主,男性是女性的2.04倍,检出阳性标本461份,其中EV71占30.15%,CA16占31.89%,EV71和CA16同时阳性占0.65%,其他肠道病毒占37.31%;三种型别病毒分布在病例发病时间、发病年龄和地域上有所不同(P〈0.001);重症病例25例,18例检出EV71病毒核酸,死亡病例6例均为EV71病毒感染;采用实时荧光PCR法随机检测68份其他肠道病毒,其中23份CA6、8份CA10,CA6和CA10占其他EV的45.59%。10株EV71分离株基因测序均为C4a亚型,重症和普通病例EV71的VP1基因序列差异较小。结论手足口病的发病存在明显季节、地区、性别、年龄差异,EV71是2011年郴州市引起手足口病重症和死亡病例的主要毒株类型,要开展对EV71型病毒的深入研究,同时也要关注非EV71和非CA16病毒的流行趋势,以防范其快速传播。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组16型 基因特征
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的研究进展 预览 被引量:11
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作者 王占华 王晓红 +6 位作者 宋先锋 王云芹 黄树立 李林林 郑遵成 刘厚庆 孙秀丽 《社区医学杂志》 2006年第05S期 53-54,共2页
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methieillin-resistant staphylococus aureus,MRSA)具有多重耐药特征,给临床治疗带来困难,正确认识耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因特征、耐药机理及生物学表型对合理用药有重要意义。
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 AUREUS 生物学表型 耐药特征 临床治疗 基因特征 合理用药 耐药机理
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