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昆虫病原真菌基因组学及多组学研究进展 认领
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作者 宋晓兵 彭埃天 +2 位作者 凌金锋 陈霞 崔一平 《广东农业科学》 CAS 2021年第1期17-25,共9页
昆虫病原真菌是重要的生物防治资源,利用昆虫病原真菌防治农业害虫具有不易产生抗性、易造成昆虫病害流行、生态安全环保等优势,推广应用昆虫病原真菌控制害虫是今后生态农业的发展趋势。现代测序技术的飞速发展促进了真菌基因组学的研... 昆虫病原真菌是重要的生物防治资源,利用昆虫病原真菌防治农业害虫具有不易产生抗性、易造成昆虫病害流行、生态安全环保等优势,推广应用昆虫病原真菌控制害虫是今后生态农业的发展趋势。现代测序技术的飞速发展促进了真菌基因组学的研究,在全基因组测序、系统发育基因组学、比较基因组学以及多组学(转录组学、蛋白组学、代谢组学)联合分析等研究领域取得显著成果。文章就昆虫病原真菌白僵菌、绿僵菌、冬虫夏草菌、蛹虫草菌等基因组学的最新研究进展,结合本团队的研究工作进行综述,涉及利用基因组学及多组学联合揭示昆虫病原真菌的种内或物种间的进化、寄主范围改变、侵染过程效应蛋白鉴定、真菌代谢产物合成,以及真菌侵染机制、昆虫免疫机制、真菌-昆虫互作机制等方面,并探讨昆虫病原真菌基因组学研究的未来发展方向,为今后农业害虫生物控制的应用提供科学依据。 展开更多
关键词 昆虫病原真菌 基因组学 比较基因组学 转录 代谢 蛋白质
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Nanopore测序技术在临床中的应用进展 认领
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作者 黄丹 陈曦 刘燕 《生物化工》 2021年第1期153-156,159,共5页
基因测序技术是生命科学和生物科技的核心技术之一,目前正处于从主流的二代测序技术向三代技术升级的过渡阶段。纳米孔(Nanopore)测序技术已被应用于微生物种群鉴定、全基因组测序、新物种发现等方面,更以其超长读长、实时检测和可以直... 基因测序技术是生命科学和生物科技的核心技术之一,目前正处于从主流的二代测序技术向三代技术升级的过渡阶段。纳米孔(Nanopore)测序技术已被应用于微生物种群鉴定、全基因组测序、新物种发现等方面,更以其超长读长、实时检测和可以直接检测碱基甲基化修饰等优势在医学领域作出了较大贡献。本文描述了纳米孔测序仪(MinION)的技术特征,主要关注该技术在临床应用中的最新进展,并探讨了其发展前景。 展开更多
关键词 基因组学 NANOPORE 临床测序 MinION
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英国制定全国性基因组学医疗战略 认领
3
作者 王晓菲 《科技中国》 2021年第2期102-103,共2页
2020年9月,英国政府制定全国性基因组学医疗战略——《基因组英国:医疗的未来》,旨在扩大英国在基因组学研究与医疗上的领先优势,在未来十年构建出世界领先的基因组医疗体系。为此,战略明确了诊断与个性化医疗、预防、研究三大支柱领域... 2020年9月,英国政府制定全国性基因组学医疗战略——《基因组英国:医疗的未来》,旨在扩大英国在基因组学研究与医疗上的领先优势,在未来十年构建出世界领先的基因组医疗体系。为此,战略明确了诊断与个性化医疗、预防、研究三大支柱领域,以及推动公众参与和对话、培训劳动力、支持英国基因组学医疗产业成长、开发协调一致的数据与分析方法、建立互信五大跨支柱主题。 展开更多
关键词 领先优势 基因组学 医疗产业 三大支柱 医疗体系 个性化医疗 公众参与 建立互信
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《生物化学与生物物理进展》征稿简则 认领
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《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS 北大核心 2021年第2期227-232,共6页
(2020年12月修订)1征稿范围与栏目设置1.1征稿范围本刊为国内外公开发行的全国性学术期刊,月刊,每月20日发行.征稿的学科范围是生物化学、分子生物学、生物物理学、细胞生物学、神经科学、免疫学,以及基因组学、蛋白质组学、系统生物学... (2020年12月修订)1征稿范围与栏目设置1.1征稿范围本刊为国内外公开发行的全国性学术期刊,月刊,每月20日发行.征稿的学科范围是生物化学、分子生物学、生物物理学、细胞生物学、神经科学、免疫学,以及基因组学、蛋白质组学、系统生物学等相关学科领域. 展开更多
关键词 生物物理 术期刊 系统生物 神经科 细胞生物 栏目设置 科范围 基因组学
中药寒热药性研究方法综述 认领
5
作者 夏元枢 魏国辉 +1 位作者 王振国 付先军 《中华中医药杂志》 CAS 北大核心 2021年第2期990-992,共3页
以现代科技方法对中医药理论进行科学诠释,是中医药发展、发扬和标准化所亟需的重要一步,对药性的研究是其中的重要一环。中药四性理论是中药药性理论体系的核心,现代科技的不断发展为中药寒热药性研究提供了新的手段与途径,推动其进入... 以现代科技方法对中医药理论进行科学诠释,是中医药发展、发扬和标准化所亟需的重要一步,对药性的研究是其中的重要一环。中药四性理论是中药药性理论体系的核心,现代科技的不断发展为中药寒热药性研究提供了新的手段与途径,推动其进入分子水平,除对其属性表征与物质基础的研究外,还开始探寻其内在机制。文章着重从中药物象、基因组学、蛋白组学和代谢组学等角度对中药寒热药性研究进展进行综述,以展示近年来中药寒热药性研究的不同思路与方法。 展开更多
关键词 中药药性 寒热 研究方法 物象 基因组学 蛋白 代谢
辅助生殖领域中的精准医学 认领
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作者 郎鹏 时晓丹 张军强 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2021年第2期121-125,146,共6页
精准医学及其前沿技术促进了生殖医学的发展。高通量测序、全基因组关联研究(GWAS)、蛋白质组学技术成功用于不孕不育症的病因诊断、遗传病检测和胚胎植入前遗传学检测(PGT)的临床实践,单细胞全基因组扩增(eWGA)、生物大数据分析等近年... 精准医学及其前沿技术促进了生殖医学的发展。高通量测序、全基因组关联研究(GWAS)、蛋白质组学技术成功用于不孕不育症的病因诊断、遗传病检测和胚胎植入前遗传学检测(PGT)的临床实践,单细胞全基因组扩增(eWGA)、生物大数据分析等近年也应用于人类配子和胚胎早期发育的研究。例如通过GWAS确定了11个基因座、17个单核苷酸多态性(SNPs)与多囊卵巢综合征(PCOS)有很强的相关性;eWGA应用到PGT中,就可通过分析植入前胚胎中的单个细胞推断出卵子本身的全部基因组信息,从而减少先天性遗传缺陷婴儿的出生,降低辅助生殖的医源性风险;人工智能辅助(AI)方法在体外受精-胚胎移植过程中用于卵母细胞或胚胎选择,显示出越来越大的优势。本文综述精准医学在辅助生殖领域中的应用。 展开更多
关键词 精准医 生殖技术 辅助 高通量核苷酸序列分析 不育 基因组学 人工智能
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基于组学数据挖掘及共表达网络模型的小儿肝母细胞瘤核心基因筛选研究 认领
7
作者 魏选东 王爱莲 +5 位作者 仇君 贾佩君 屈芳 张冀莎 周晓宇 罗春香 《中国医师杂志》 CAS 2021年第2期240-244,共5页
目的基于基因芯片数据挖掘的方法,对小儿肝母细胞瘤预后差异基因进行筛选后,对差异基因的功能及通路进行分析,同时利用共表达网络筛选出决定小儿肝母细胞瘤预后的核心基因并对其预测能力进行评估。方法本研究中所使用的小儿肝母细胞瘤... 目的基于基因芯片数据挖掘的方法,对小儿肝母细胞瘤预后差异基因进行筛选后,对差异基因的功能及通路进行分析,同时利用共表达网络筛选出决定小儿肝母细胞瘤预后的核心基因并对其预测能力进行评估。方法本研究中所使用的小儿肝母细胞瘤基因芯片表达谱来自欧洲生物信息学研究所(http://www.ebi.ac.uk/embl/);数据收集的截止日期为2018年12月31日。先通过SAM法筛选得到差异表达基因(基因表达水平上升至原来的2倍或下降至原来的1/2),再基于降维原理通过共表达网络模型筛选得到核心基因,运用MCODE算法计算基因的调控评估能力评分,以评价其在整个网络模型中的调控能力。结果针对213个差异表达基因的细胞信号通路富集结果显示,富集度最高的信号通路为代谢途径通路,富集度为2122.529,信号通路富集结果误判率均<0.001,经SAM算法检验均具有统计学意义(P<0.001)。以213个在不同预后组发生差异表达的基因作为共表达网络的构建基础,本次构建得到的共表达网络共纳入12个发生差异表达的基因。以预后不良组为实验组,以预后较好组为对照组,采用MCODE算法计算基因调控能力评分的结果显示,决定小儿肝母细胞瘤预后调控能力评分最高基因为ADH1A基因,得分为19分。此外,HAO1、ADH1B、ALDOB以及DPYS基因的调控能力评分均高于或接近于5分,因此可认为它们是本次构建得到的共表达网络模块中的核心基因。结论从共表达网络模型结果来看,ADH1A基因与小儿肝母细胞瘤的发生发展存在较为密切的关联,其分子生物学证据对临床开展肿瘤靶向干预疗法的指导意义有待进一步挖掘。 展开更多
关键词 肝胚细胞瘤 基因组学 差异表达基因 共表达网络
多组学分析在炎症性肠病中的应用与研究进展 认领
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作者 张立兴 王丽娜 +1 位作者 康广博 黄鹤 《生物技术通报》 CAS 北大核心 2021年第1期155-167,共13页
炎症性肠病(IBD)是一种累及回肠、直肠和结肠的特发性慢性肠道炎症性疾病,主要包括溃疡性结肠炎和克罗恩病,在临床表现、病程和治疗反应等方面具有高度异质性。目前,关于IBD的发病机制尚未明确,治疗方法相对有限。由遗传、环境、肠道微... 炎症性肠病(IBD)是一种累及回肠、直肠和结肠的特发性慢性肠道炎症性疾病,主要包括溃疡性结肠炎和克罗恩病,在临床表现、病程和治疗反应等方面具有高度异质性。目前,关于IBD的发病机制尚未明确,治疗方法相对有限。由遗传、环境、肠道微生态以及宿主免疫失衡在内的多因素共同导致了过度活跃的炎症反应并最终引发患者的肠道粘膜屏障受损和管腔菌群紊乱。单一组学的分析无法全面揭示IBD发病过程中复杂的相互协同作用机制,更无法挖掘潜在的治疗靶点和开发有效的干预策略。因此需要运用多组学关联分析技术以帮助研究者从多个维度解析IBD的发病机制。回顾和分析了多组学技术在IBD相关研究领域中的应用,并且讨论了使用这些方法在IBD分型、早期诊断和个性化医疗等领域的潜力,以期为进一步研究IBD发病机制奠定良好基础。 展开更多
关键词 炎症性肠病 关联分析 基因组学 微生物 诊疗策略
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《生物化学与生物物理进展》征稿简则(2020年12月修订) 认领
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《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS 北大核心 2021年第1期111-116,共6页
(2020年12月修订)1征稿范围与栏目设置1.1征稿范围本刊为国内外公开发行的全国性学术期刊,月刊,每月20日发行.征稿的学科范围是生物化学、分子生物学、生物物理学、细胞生物学、神经科学、免疫学,以及基因组学、蛋白质组学、系统生物学... (2020年12月修订)1征稿范围与栏目设置1.1征稿范围本刊为国内外公开发行的全国性学术期刊,月刊,每月20日发行.征稿的学科范围是生物化学、分子生物学、生物物理学、细胞生物学、神经科学、免疫学,以及基因组学、蛋白质组学、系统生物学等相关学科领域. 展开更多
关键词 生物物理 术期刊 系统生物 神经科 细胞生物 栏目设置 科范围 基因组学
专题导读:加强麻类作物基因组学研究,推动优异等位基因发掘及种质创新 认领
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作者 张立武 《作物学报》 CAS 北大核心 2021年第6期993-996,共4页
麻类作物是指以收获茎秆韧皮纤维和叶纤维为主的作物,主要包括黄麻(Corchorus spp.)、红麻(Hibiscus cannabinus)、苎麻(Boehmeria spp.)、亚麻(Linum usitatissimum)、工业大麻(Cannabis sativa L.)与剑麻(Agave sisalana Perr.ex Enge... 麻类作物是指以收获茎秆韧皮纤维和叶纤维为主的作物,主要包括黄麻(Corchorus spp.)、红麻(Hibiscus cannabinus)、苎麻(Boehmeria spp.)、亚麻(Linum usitatissimum)、工业大麻(Cannabis sativa L.)与剑麻(Agave sisalana Perr.ex Engelm.),与粮、棉、油、菜并列为第五大作物群[1],其种植历史可追溯到远古新石器至尧舜时代。我国是麻类生产大国。2009年,作为50个农产品之一的麻产品被列入国家现代农业产业技术体系。2011—2020,以二代、三代测序技术为主体,以Hi-C等技术辅助,先后完成了主要麻类作物染色体级别的草图或参考基因组,这标志着麻类作物科学已经进入基因组时代。为加强主要麻类作物基因组学与遗传改良研究,《作物学报》以专栏形式集中刊发了8篇论文,方便相关研究工作者了解最新研究动态。 展开更多
关键词 麻类作物 叶纤维 《作物报》 韧皮纤维 尧舜时代 现代农业产业技术体系 麻产品 基因组学
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药用植物穿心莲研究进展 认领
11
作者 周芳 孙铭阳 +5 位作者 梅瑜 顾艳 徐世强 李静宇 蔡时可 王继华 《广东农业科学》 CAS 2021年第1期9-16,共8页
穿心莲为传统大宗中药材,爵床科,以地上部分入药,可抗菌和抗病毒,主要产自我国华南地区,是规模化种植水平较高的南药品种之一。穿心莲体内发挥主要药效的化合物为二萜类内酯和黄酮类物质,二者也是多种中成药的原料之一,可作为兽药的主... 穿心莲为传统大宗中药材,爵床科,以地上部分入药,可抗菌和抗病毒,主要产自我国华南地区,是规模化种植水平较高的南药品种之一。穿心莲体内发挥主要药效的化合物为二萜类内酯和黄酮类物质,二者也是多种中成药的原料之一,可作为兽药的主要成分。穿心莲的临床作用为保肝利胆、清热解毒和抗菌消炎等,有"中药抗生素"之称。学者对穿心莲的研究大多集中在其体内二萜类内酯的药理活性上。随基因组数据库的成功注释,其药用成分生成等内在分子机理的相关研究将得以顺利开展。穿心莲品质不稳定,体内有效活性成分含量受品种、产地、栽培技术、收获时间和加工技术等多方面因素影响。作为一类植物源抗生素,规范化种植穿心莲带来的应用前景将十分广阔。从穿心莲的药理活性、活性成分代谢、种质资源评价、创新与利用等方面进行总结,以期为后续有关穿心莲的开发利用提供参考。 展开更多
关键词 穿心莲 代谢成分 药理活性 种质创新 基因组学
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糖尿病大血管病变多组学研究进展 认领
12
作者 赵大可 胡大勇 《医学综述》 2021年第1期146-152,共7页
糖尿病血管病变作为糖尿病进展、全身多器官损伤和心脑血管疾病发生的基础原因之一,具有很强的破坏性,是糖尿病的主要并发症及死亡原因。糖尿病血管病变是多基因、多蛋白共同参与的一种全身系统性代谢性疾病,在基因组学、转录组学、蛋... 糖尿病血管病变作为糖尿病进展、全身多器官损伤和心脑血管疾病发生的基础原因之一,具有很强的破坏性,是糖尿病的主要并发症及死亡原因。糖尿病血管病变是多基因、多蛋白共同参与的一种全身系统性代谢性疾病,在基因组学、转录组学、蛋白质组学以及代谢组学层面均有特异性的表现特征。随着高通量组学检测技术的快速发展,可利用不同组学技术从不同层面探究糖尿病大血管病变的发生发展机制,也可通过联合分析各组学数据促进各组学互通,这为阐明糖尿病大血管病变的分子发病发展机制提供了新的研究思路。 展开更多
关键词 糖尿病血管病变 基因组学 转录 蛋白质 代谢
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基于TCGA数据库免疫基因表达谱构建253例宫颈鳞状细胞癌免疫亚组 认领
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作者 宋春红 甄娟 +1 位作者 吴莎 毕学杰 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2021年第2期137-143,共7页
目的采用美国肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库免疫基因表达谱构建宫颈鳞状细胞癌免疫亚型,并分析各免疫亚组特征,为宫颈鳞状细胞癌预后分析及治疗提供新指标。方法 TCGA数据库共下载253例宫颈鳞状细胞癌及3例癌旁正常组织的mRNA表达谱及临... 目的采用美国肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库免疫基因表达谱构建宫颈鳞状细胞癌免疫亚型,并分析各免疫亚组特征,为宫颈鳞状细胞癌预后分析及治疗提供新指标。方法 TCGA数据库共下载253例宫颈鳞状细胞癌及3例癌旁正常组织的mRNA表达谱及临床数据。根据单样本基因集富集分析(ssGSEA)得分情况,将宫颈鳞状细胞癌分为高免疫组、中等免疫组及低免疫组3个免疫亚组。采用Kolmogorov-Smirnov检验分析各免疫亚组肿瘤微环境和免疫细胞亚群比例,运用单因素方差分析比较各组人类白细胞抗原(HLA)相关基因及程序性死亡配体1(PD-L1)基因表达情况,采用Log-rank检验及多因素Cox回归分析进行生存分析。对免疫亚组做基因富集分析,确定基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集区域。结果 3个免疫亚组免疫评分(χ^(2)=144.87)、基质评分(χ^(2)=116.127)、总评分(χ^(2)=37.941)及肿瘤纯净度(χ^(2)=116.127)比较差异均有统计学意义,均P<0.001。高免疫组19个HLA相关基因表达高于中等免疫组及低免疫组,均P<0.001。PD-L1基因表达及CD8+T细胞比例在3个免疫亚组之间差异有统计学意义(F=39.048,P<0.001;χ^(2)=46.654,P<0.001)。3个免疫亚组5年生存率差异有统计学意义,χ^(2)=6.400,P=0.029。免疫分组是影响宫颈鳞状细胞癌患者预后的主要因素,P<0.05。高免疫组GO生物学过程富集区域及KEGG通路主要集中于免疫相关信号通路。低免疫组GO生物学过程富集区域和KEGG通路主要集中于癌症相关信号通路。结论基于TCGA数据库免疫基因表达谱将宫颈鳞状细胞癌分为3种免疫亚组,不同亚组具有不同的分子特征和临床预后,对分析宫颈鳞状细胞癌预后、指导宫颈鳞状细胞癌治疗具有临床意义。 展开更多
关键词 免疫 肿瘤 TCGA数据库 宫颈鳞状细胞癌 基因组学 免疫分
甜菜干旱胁迫响应研究进展 认领
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作者 邹利茹 张福顺 +1 位作者 刘乃新 黄平仙 《中国糖料》 2021年第1期36-44,共9页
由于全球变暖和水资源短缺日益加剧,干旱胁迫已经成为非生物胁迫中影响甜菜生长及产业发展的最主要因素。本文从干旱胁迫下甜菜生理生化、基因组学、转录组学、蛋白组学等方面的响应和采用叶面喷施L-鸟氨酸、脯氨酸、外源茉莉酸甲酯、... 由于全球变暖和水资源短缺日益加剧,干旱胁迫已经成为非生物胁迫中影响甜菜生长及产业发展的最主要因素。本文从干旱胁迫下甜菜生理生化、基因组学、转录组学、蛋白组学等方面的响应和采用叶面喷施L-鸟氨酸、脯氨酸、外源茉莉酸甲酯、富勒烯醇纳米颗粒及营养物质等外源物质缓解干旱胁迫等方面进行概述,重点论述了应用分子技术在甜菜干旱胁迫响应方面取得的最新研究进展。了解甜菜对干旱胁迫的应答机制,并探索缓解甜菜干旱胁迫的有效措施,对提高甜菜逆境条件下的生产力具有重要意义,可为培育高抗旱性的甜菜和其他作物的育种提供新的见解和策略。提出提高甜菜抗干旱胁迫策略:要在确保稳产、高产、优质的前提下,以培育抗旱性较强的甜菜品种为重点;进一步加强甜菜耐旱、抗旱响应机制研究及其甜菜抗旱型基因资源的发掘与利用;加强应用组学技术改良作物品质及转基因植物抗性育种的研究;应用外源物质改善作物干旱胁迫境况。 展开更多
关键词 甜菜 干旱胁迫 生理生化 转录 基因组学 蛋白 外源物质 响应
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绦虫基因组学研究进展 认领
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作者 李秀荣 闫鸿斌 +4 位作者 李立 付宝权 薄新文 朱兴全 贾万忠 《中国人兽共患病学报》 CAS 北大核心 2021年第2期152-158,共7页
绦虫是一类严重危害人类身体健康的寄生虫,每年给人类造成很大的经济负担。绦虫种类众多,生物学特性各异,目前绦虫病的防控和治疗措施尚不完善,对动物和人类的危害严重。随着生物信息学和基因测序技术的发展、绦虫基因组序列的测定和解... 绦虫是一类严重危害人类身体健康的寄生虫,每年给人类造成很大的经济负担。绦虫种类众多,生物学特性各异,目前绦虫病的防控和治疗措施尚不完善,对动物和人类的危害严重。随着生物信息学和基因测序技术的发展、绦虫基因组序列的测定和解析,通过对绦虫的生物学特征和调控基因进行深度研究有助于预防和控制绦虫病,特别是人和动物的棘球蚴病和囊虫病等重要的人兽共患寄生虫病。利用绦虫基因组学和蛋白质组学等组学技术,筛选绦虫感染关键的基因和蛋白质,提供绦虫病的诊断参考依据和绦虫病治疗的潜在药物靶标。本文就绦虫基因组测序完成情况和近年来绦虫基因组学研究进展进行综述。 展开更多
关键词 绦虫 基因组学 药物靶标
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精准医学带来的挑战与机遇 认领
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作者 陈润生 《科学世界》 2021年第1期124-125,共2页
20世纪90年代,包括中国在内的6个国家的众多科学家投身于一项伟大的工作:测定由30亿个碱基对组成的人类染色体的DNA序列,并破译其中的遗传信息。这就是人类基因组计划。2001年,该计划公布了人类基因组图谱及初步分析结果。从此,人类开... 20世纪90年代,包括中国在内的6个国家的众多科学家投身于一项伟大的工作:测定由30亿个碱基对组成的人类染色体的DNA序列,并破译其中的遗传信息。这就是人类基因组计划。2001年,该计划公布了人类基因组图谱及初步分析结果。从此,人类开始大量获得生物分子层面的数据,开辟了基因组学、蛋白质组学、转录组学等方向,生物学进入了组学※的时代。 展开更多
关键词 人类染色体 人类基因组计划 精准医 基因组学 转录 遗传信息 碱基对 蛋白质
2010~2019年动脉粥样硬化基因组学的研究现状与热点趋势分析 认领
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作者 浦冬青 刘政 +2 位作者 周超 梁佳玮 郝清智 《中国医学科学院学报》 CAS 北大核心 2021年第1期92-100,共9页
目的分析2010~2019年动脉粥样硬化基因组学的研究现状、热点及前沿趋势。方法采用CiteSpace软件,对2010~2019年Web of Science核心合集数据库发表的有关动脉粥样硬化基因组学相关文献中的国家、机构、作者、期刊、共被引文献、关键词等... 目的分析2010~2019年动脉粥样硬化基因组学的研究现状、热点及前沿趋势。方法采用CiteSpace软件,对2010~2019年Web of Science核心合集数据库发表的有关动脉粥样硬化基因组学相关文献中的国家、机构、作者、期刊、共被引文献、关键词等进行数据统计及可视化分析。结果共纳入1021篇英文文献,年发文量整体呈上升趋势,动脉粥样硬化研究领域的知识基础多集中在冠状动脉疾病,如冠心病、心肌梗死、血脂异常等基因风险位点研究及生物标志物的发现等。动脉粥样硬化研究热点围绕在全基因组关联分析、DNA甲基化、微小RNA、信使RNA等方面,研究前沿与趋势集中在长链非编码RNA、DNA甲基化及免疫代谢等方面研究。结论动脉粥样硬化基因组学领域研究的关注度近年来逐渐提升。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 基因组学 CiteSpace软件 研究热点 可视化分析
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非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因在脑胶质瘤中的表达及意义 认领
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作者 黄华 王宽宇 《中华神经外科杂志》 北大核心 2021年第1期75-80,共6页
目的基于中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库分析非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因(PTPN12)在脑胶质瘤中的表达和意义。方法回顾性分析CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中脑胶质瘤患者的临床资料和... 目的基于中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库分析非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因(PTPN12)在脑胶质瘤中的表达和意义。方法回顾性分析CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中脑胶质瘤患者的临床资料和RNA测序数据。分析不同世界卫生组织(WHO)肿瘤级别、四分型亚型、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态的患者PTPN12表达量的差异。根据PTPN12的表达量将患者分为PTPN12高表达组和PTPN12低表达组,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,比较两组患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法判断PTPN12对脑胶质瘤患者的预后作用。进一步通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获得基因相关的功能以及有关的通路。结果两数据库中,PTPN12的表达量均随脑胶质瘤病理级别的升高而升高(均P<0.01);与IDH突变型比较,IDH野生型中PTPN12表达量升高(均P<0.01);MGMT启动子非甲基化者PTPN12表达量高于MGMT启动子甲基化者(均P<0.01);PTPN12在经典型、间质型、神经元型以及前神经元型中表达量的差异均具有统计学意义,间质型中表达量最高(均P<0.01)。两数据库中,PTPN12高表达者均比低表达者的生存期短(均P<0.01)。两个数据库中,多因素Cox回归分析结果均显示,PTPN12表达量为脑胶质瘤患者生存期的独立影响因素(CGGA数据库中,HR=1.433,95%CI:1.094~1.876,P=0.009;TCGA数据库中,HR=1.588,95%CI:1.018~2.477,P=0.042)。GO分析结果显示,PTPN12表达量正相关的基因更多地富集在增殖、凋亡、黏附、蛋白水解、免疫反应、血管生成、药物反应、缺氧反应、肿瘤细胞G2/M期的转化、肿瘤细胞G1/S期的转化等多个与脑胶质瘤恶性进展相关的功能上。KEGG分析结果显示,与PTPN12表达量呈正相关的基因更多地富集在肿瘤� 展开更多
关键词 神经胶质瘤 基因组学 预后 非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12
“万能”的赤霉素 认领
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作者 刘学英 《生命世界》 2021年第2期8-9,共2页
在技术层面上,"绿色革命"的核心内容是矮秆高产农作物品种的应用和推广。那么,农作物是怎么变矮的呢?在那个时期,人们对于基因的本质刚开始有所认知,知道了基因是决定生物体存在方式的内在因素,生、长、衰、病、老、死等一切... 在技术层面上,"绿色革命"的核心内容是矮秆高产农作物品种的应用和推广。那么,农作物是怎么变矮的呢?在那个时期,人们对于基因的本质刚开始有所认知,知道了基因是决定生物体存在方式的内在因素,生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。直到20世纪90年代,随着植物分子生物学和基因组学的日益发展,科学家们才逐渐解锁了农作物矮化的"生命密码"。 展开更多
关键词 农作物品种 矮秆 生命密码 植物分子生物 绿色革命 基因组学 赤霉素 内在因素
冠心病痰瘀互结证的组学研究进展与思考 认领
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作者 杨光 何浩强 +3 位作者 董艳 段练 陈恒文 王阶 《中医杂志》 北大核心 2021年第3期189-194,共6页
借助高通量测序的组学技术探讨冠心病痰瘀互结证的证候实质,主要集中在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学4个方面。通过梳理目前冠心病痰瘀互结证组学研究文献,发现基因组学研究相对成熟,KDR等基因多态性位点、白细胞介素6等功... 借助高通量测序的组学技术探讨冠心病痰瘀互结证的证候实质,主要集中在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学4个方面。通过梳理目前冠心病痰瘀互结证组学研究文献,发现基因组学研究相对成熟,KDR等基因多态性位点、白细胞介素6等功能基因研究成果有利于揭示冠心病痰瘀互结证的内在遗传基础;转录组学研究以miRNA为机制研究的焦点,miRNA-107等分子的发现有助于揭示冠心病痰瘀互结证的内在调控机制;蛋白质组学与代谢组学目前处于筛选证候相关的差异蛋白质与代谢物阶段,对C4BP蛋白、6-去氢睾酮葡糖苷酸、磷脂酰胆碱等的深入研究有助于明确冠心病痰瘀互结证的表型物质基础。总体而言,组学研究为阐明冠心病痰瘀互结证的遗传调控机制和微观物质基础提供了可能,但相关研究目前仍存在方法学质量不高、研究结果不能共享、研究层面不能有效联系等问题需要解决。 展开更多
关键词 冠心病 痰瘀互结证 基因组学 转录 蛋白质 代谢
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