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家蝇三龄幼虫Mdctl基因原核表达及生物信息学分析 预览
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作者 常振策 李忠旬 +3 位作者 贾利娜 修江帆 国果 吴建伟 《贵州医科大学学报》 CAS 2020年第2期145-150,共6页
目的:构建家蝇C型凝集素基因(Mdctl)原核表达体系,对Mdctl基因及编码蛋白进行生物信息学分析。方法:采用生物信息学方法,分析Mdctl基因及编码蛋白;将构建的pET28a(+)/Mdctl重组表达质粒转化至大肠杆菌BL21-DE3中,以异丙基硫代半乳糖苷(I... 目的:构建家蝇C型凝集素基因(Mdctl)原核表达体系,对Mdctl基因及编码蛋白进行生物信息学分析。方法:采用生物信息学方法,分析Mdctl基因及编码蛋白;将构建的pET28a(+)/Mdctl重组表达质粒转化至大肠杆菌BL21-DE3中,以异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达重组蛋白并通过SDS-PAGE对表达产物进行分析;Ni-IDA法纯化重组蛋白,Western-Blot对其鉴定。结果:生物信息学分析显示,Mdctl基因开放阅读框全长333 bp,共编码110个氨基酸,理论分子量为13.13 kDa,等电点为4.49,信号肽位于1~22位氨基酸之间;Mdctl蛋白中存在Clect结构域,属于C型凝集素超家族;Mdctl重组蛋白在大肠杆菌BL21-DE3中主要以包涵体形式表达,重组蛋白的相对分子质量与Mdctl蛋白两端融合6×His标签后的总分子量相一致。结论:成功构建Mdctl原核表达系统,并获得重组蛋白。 展开更多
关键词 家蝇 Mdctl基因 原核表达 蛋白纯化 生物信息学 基因表达
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柳树NAC基因的克隆与表达模式分析
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作者 田雪瑶 周洁 +2 位作者 王保松 何开跃 何旭东 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期119-124,共6页
【目的】研究柳树重要抗逆转录因子基因家族,为揭示柳树抗逆分子机制提供理论依据。【方法】以‘苏柳2345'的转录组测序数据为基础,克隆了柳树NAC家族,并分析其序列结构、组织表达特异性以及不同胁迫条件下的表达模式。【结果】克... 【目的】研究柳树重要抗逆转录因子基因家族,为揭示柳树抗逆分子机制提供理论依据。【方法】以‘苏柳2345'的转录组测序数据为基础,克隆了柳树NAC家族,并分析其序列结构、组织表达特异性以及不同胁迫条件下的表达模式。【结果】克隆的两个柳树NAC转录因子基因分别命名为SlNAC1和SlNAC2。生物信息学分析表明:SlNAC1序列全长为1126 bp,编码产物含343个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于细胞核;SlNAC2序列全长为1139 bp,编码产物含291个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于叶绿体。两个基因均具有典型的NAM结构域及A、B、C、D、E 5个亚结构域,还包括共同的LPPG、YPNG和DEE保守基序及NAC抑制结构域。系统进化树分析显示,SlNAC1基因与木薯亲缘关系最近,SlNAC2基因与茄子亲缘关系最近。定量PCR结果显示SlNAC1和SlNAC2均在叶片表达,根中没有表达,为叶片特异性转录因子。定量PCR结果显示SlNAC1基因在脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)处理24 h后显著上调,SlNAC2基因在聚乙二醇(PEG)、ABA和GA胁迫后显著上调。【结论】柳树SlNAC1基因在非生物胁迫下表达较为稳定,受ABA和GA胁迫诱导;SlNAC2受干旱、ABA和GA胁迫诱导,受影响明显高于SlNAC1,不受乙烯剂(ETH)胁迫影响。推测SlNAC1和SlNAC2参与GA、ABA信号传导,可能不参与ETH的信号途径。 展开更多
关键词 柳树 NAC基因家族 基因克隆 基因表达
烟草BELL基因家族鉴定及其温室条件下的表达模式分析 预览
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作者 宋卫娜 赵森森 +6 位作者 武明珠 王根发 罗朝鹏 王晨 李泽锋 杨军 王中 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期1-11,共11页
BELL基因是植物中普遍存在的一类基因,其编码的同源异型结构域转录因子参与调控了植物叶片、花序等多个组织的发育过程。为明确烟草BELL基因的结构和功能,通过同源序列比对和功能域分析鉴定了普通烟草BELL基因,结合系统进化和基因表达... BELL基因是植物中普遍存在的一类基因,其编码的同源异型结构域转录因子参与调控了植物叶片、花序等多个组织的发育过程。为明确烟草BELL基因的结构和功能,通过同源序列比对和功能域分析鉴定了普通烟草BELL基因,结合系统进化和基因表达模式分析对烟草BELL基因的功能进行了初步预测。结果表明,从普通烟草基因组中共鉴定出28个NtBELLs基因,分布于15条不同的染色体上。系统进化分析表明,烟草NtBELLs基因可分为4组,每组参与调控烟草不同的发育过程。NtBELLs基因在6个烟草组织中呈现不同的表达模式,且具有明显的组织特异性。干旱和盐胁迫能显著诱导部分NtBELLs基因的表达,表明该基因家族可能参与了植物抵御非生物胁迫的过程。 展开更多
关键词 烟草 BEL1-like基因家族 基因结构 系统发育 基因表达
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柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析
4
作者 王福生 余洪 +4 位作者 胡洲 管德龙 张盼 朱世平 赵晓春 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期23-40,共18页
分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不... 分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子,含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明,CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。q RT-PCR分析结果显示,大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。 展开更多
关键词 柑橘属 SAUR基因家族 基因表达 基因组鉴定
茶叶CHS基因表达特性及其与儿茶素积累的关系 预览
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作者 施婧 张雪 +3 位作者 张媛媛 林晓蓉 李斌 陈忠正 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第5期101-106,112,共7页
本研究用高效液相色谱法(HPLC)测定两种茶叶的儿茶素含量,通过RT-PCR克隆英红9号(YH)和南昆山毛叶茶(MY)的CHS基因进行比对分析,借助烟草瞬时表达技术对基因表达蛋白进行亚细胞定位;结合生物信息学分析选取特定肽段经人工合成后作为抗... 本研究用高效液相色谱法(HPLC)测定两种茶叶的儿茶素含量,通过RT-PCR克隆英红9号(YH)和南昆山毛叶茶(MY)的CHS基因进行比对分析,借助烟草瞬时表达技术对基因表达蛋白进行亚细胞定位;结合生物信息学分析选取特定肽段经人工合成后作为抗原制备CHS基因特异抗体;用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术和Western blot技术测定比较两种茶叶CHS基因在转录、翻译水平的差异,并对比分析了两种茶叶间儿茶素含量差异与相应CHS基因表达的关系。结果表明:YH和MY中的儿茶素含量分别为181.51 mg/g和106.02 mg/g,前者显著高于后者并达到1.71倍;两种茶叶中所克隆的CHS基因具有单核苷酸差异但编码相同的氨基酸序列,其表达蛋白亚细胞定位于细胞质、细胞膜和细胞核;制备的CHS蛋白兔源抗体效价为1∶80000;CHS基因在YH中的表达无论在转录水平还是在翻译水平均显著高于MY,前者分别是后者的3.9倍和1.7倍,两种茶叶中CHS合成酶基因在转录、翻译水平的表达均与其对应的儿茶素积累水平一致。实验研究证明,茶叶儿茶素积累水平与其合成通路关键酶基因CHS的表达呈正相关。 展开更多
关键词 茶叶 儿茶素 查尔酮合成酶 基因表达 蛋白表达
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合浦珠母贝丝氨酸蛋白酶抑制因子基因pfser1克隆与表达 预览
6
作者 陈爽 梁健 张荣庆 《广东海洋大学学报》 CAS 2020年第1期1-7,共7页
【目的】克隆合浦珠母贝(Pinctada fucata)丝氨酸蛋白酶抑制因子pfser1基因,探讨该基因的组织表达及其在天然免疫过程中的作用,以及与生物矿化过程的关系。【方法】通过RACE技术获得pfser1基因的全长,通过生物信息学分析其序列结构特征... 【目的】克隆合浦珠母贝(Pinctada fucata)丝氨酸蛋白酶抑制因子pfser1基因,探讨该基因的组织表达及其在天然免疫过程中的作用,以及与生物矿化过程的关系。【方法】通过RACE技术获得pfser1基因的全长,通过生物信息学分析其序列结构特征,利用实时荧光定量PCR方法检测pfser1基因在不同组织中的表达,检测健康合浦珠母贝在被大肠杆菌(Escherichia coli)MG1655刺激后和在贝壳损伤修复实验中pfser1基因表达量的变化。【结果】合浦珠母贝pfser1基因cDNA全长为1240 bp,包含1035 bp的开放阅读框(ORF),编码344个氨基酸,氨基酸序列的功能结构域含有丝氨酸蛋白酶抑制因子Serpin家族保守结构域。pfser1基因在合浦珠母贝各个组织中均有表达,在外套膜边缘膜中表达量最高;大肠杆菌MG1655刺激后,该基因表达量显著升高;在贝壳损伤修复过程中,pfser1基因表达先升高后受到抑制。【结论】pfser1基因所表达的蛋白参与了合浦珠母贝的天然免疫应答过程,并与生物矿化过程有一定关系。 展开更多
关键词 合浦珠母贝 丝氨酸蛋白酶抑制因子 基因克隆 基因表达 天然免疫
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桂花OfFCA基因的克隆及在花芽分化时期的表达分析 预览
7
作者 吴琪 吴鸿飞 +4 位作者 周敏舒 徐倩霞 杨丽媛 赵宏波 董彬 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期195-200,共6页
【目的】桂花Osmanthus fragrans是著名的香化植物,其花芽分化受到环境温度影响。研究环境温度对桂花花芽分化的影响对桂花的花期调控具有重要的指导意义。【方法】以桂花品种‘堰虹桂’O.fragrans‘Yanhonggui’为材料,采用石蜡切片观... 【目的】桂花Osmanthus fragrans是著名的香化植物,其花芽分化受到环境温度影响。研究环境温度对桂花花芽分化的影响对桂花的花期调控具有重要的指导意义。【方法】以桂花品种‘堰虹桂’O.fragrans‘Yanhonggui’为材料,采用石蜡切片观察其花芽分化进程,运用聚合酶链式反应和实时荧光定量技术对影响温度FCA(FLOWERING LOCUS CA)基因分别进行克隆及表达特异性分析。【结果】克隆得到OfFCA cDNA序列长为1319 bp,其开放阅读框为864 bp,编码287个氨基酸。序列比对及进化分析发现:OfFCA与木犀科Oleaceae油橄榄Olea europaea和胡麻科Pedaliaceae芝麻Sesamum indicum的FCA相似度较高,同源性可达68%以上。在桂花花芽分化的不同时期,无论叶还是花芽中,19℃环境低温下OfFCA基因的表达水平均显著高于25℃常温生长条件下的表达水平。【结论】桂花OfFCA基因响应环境相对低温的变化,参与桂花的花芽分化,使桂花的花期提前。 展开更多
关键词 林木育种学 桂花 FCA基因 花芽分化 基因表达
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忽地笑ABCG5转运蛋白基因(LaABCG5)的克隆和表达分析 预览
8
作者 刘彦彤 王蓉 汪仁 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期8-15,27共9页
通过分析忽地笑〔Lycoris aurea(L'Hér.)Herb.〕比较转录组数据,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆到1个ABC转运蛋白基因LaABCG5。LaABCG5基因全长1896 bp,编码631个氨基酸。LaABCG5的理论相对分子质量为70451,理论等电点为p... 通过分析忽地笑〔Lycoris aurea(L'Hér.)Herb.〕比较转录组数据,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆到1个ABC转运蛋白基因LaABCG5。LaABCG5基因全长1896 bp,编码631个氨基酸。LaABCG5的理论相对分子质量为70451,理论等电点为pI 8.37。LaABCG5的二级结构中,α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲的氨基酸所占比例分别为48.81%、13.47%、5.07%和32.65%。聚类分析结果显示:LaABCG5与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕ABCG5转运蛋白的亲缘关系最近。LaABCG5与海枣(Phoenix dactylifera Linn.)、油棕(Elaeis guineensis Jacq.)、番木瓜(Carica papaya Linn.)、毛果杨(Populus trichocarpa Torr.et Gray)和银白杨(Populus alba Linn.)的ABCG5转运蛋白的同源性在62%~67%之间。qRT-PCR检测结果显示:LaABCG5基因在忽地笑的根、鳞茎、叶片、花瓣和雌蕊中均有表达,其中,在叶片和雌蕊中的相对表达量显著高于其他组织;100μmol·L^-1 MeJA处理后6 h,忽地笑叶片中LaABCG5基因的相对表达量显著高于对照(DMSO处理后6 h)。跨膜结构域和亚细胞定位结果显示:LaABCG5定位于细胞膜。研究结果显示:LaABCG5基因的表达具有组织特异性,且受MeJA调控;LaABCG5的定位与其功能相吻合。 展开更多
关键词 忽地笑 ABC转运蛋白 基因克隆 基因表达 亚细胞定位
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核桃TT1类转录因子的筛选及干旱响应分析 预览
9
作者 王艺 张尚昆 +4 位作者 赵翔 刘玉梅 赵焕元 杨桂燕 马凯恒 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期86-93,共8页
TT1基因(transparent testa1)在植物逆境响应中有重要作用。核桃是重要的经济树种,其产量和质量均受环境影响。为进一步探索核桃(Juglans regia)抗逆机制,以‘香玲’核桃为试验材料,克隆获得核桃JrTT1基因,并进行基因表达和生物信息学分... TT1基因(transparent testa1)在植物逆境响应中有重要作用。核桃是重要的经济树种,其产量和质量均受环境影响。为进一步探索核桃(Juglans regia)抗逆机制,以‘香玲’核桃为试验材料,克隆获得核桃JrTT1基因,并进行基因表达和生物信息学分析,预测该基因的基本生物功能。结果表明,JrTT1-1、JrTT1-2、JrTT1-3基因的开放阅读框(OFR)分别为1014、1023、1029 bp,蛋白分子量分别为37763.51、38492.94、38136.36 u,含有氨基酸数分别为337、340、342,理论等电点分别为7.88、7.19、8.89。与其他物种的同源TT1蛋白具有较近的进化关系。且其上游1200 bp启动子中含有多种与干旱逆境响应相关的顺式作用元件。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)发现,JrTT1-1、JrTT1-2、JrTT1-3基因在PEG 6000胁迫下能不同程度地被诱导表达,且在叶和根中的表达趋势不同。表明JrTT1基因可以响应干旱胁迫诱导,并具有组织表达特异性,推测其在核桃逆境响应中具有一定作用。 展开更多
关键词 核桃 TT1基因 基因表达 干旱胁迫
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SV2A基因真核表达质粒构建及其在HEK293T细胞中的表达 预览
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作者 张晓敏 王培昌 刘静 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第3期274-277,共4页
目的构建鼠突触囊泡蛋白2A(SV2A)基因的真核表达质粒,并瞬时转染至人胚肾细胞(HEK293T)中,对其表达进行鉴定。方法以APP/PS1双转基因小鼠海马组织的cDNA为模板,扩增得到长2239 bp的SV2A基因编码序列,将此序列插入到真核表达载体p3×... 目的构建鼠突触囊泡蛋白2A(SV2A)基因的真核表达质粒,并瞬时转染至人胚肾细胞(HEK293T)中,对其表达进行鉴定。方法以APP/PS1双转基因小鼠海马组织的cDNA为模板,扩增得到长2239 bp的SV2A基因编码序列,将此序列插入到真核表达载体p3×Flag-CMV-10多克隆位点区域中,得到真核表达质粒p3×Flag-CMV-10-SV2A,转化后挑取单克隆菌落经双酶切鉴定后送公司测序,将构建成功的重组质粒转染至HEK293T细胞中,利用蛋白质印迹法(Western blot)检测SV2A基因的表达情况。结果成功构建p3×Flag-CMV-10-SV2A重组质粒,并在转染至HEK293T细胞后,验证了相应蛋白表达。结论利用分子克隆技术成功构建了p3×Flag-CMV-10-SV2A真核表达质粒并在HEK293T细胞中正确表达,为后续实验奠定了基础。 展开更多
关键词 SV2A基因 分子克隆 重组质粒 基因表达
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水稻OsNCED4基因的克隆及功能初探
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作者 周丽 李梦婷 +6 位作者 朱骞 Sadia Nadir 李伟 郭效琼 冯天 陈丽娟 李东宣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期2087-2096,共10页
脱落酸(abscisic acid,ABA)是一种抑制植物生长的植物激素,因能促使叶子脱落而得名,在植物逆胁迫中发挥关键作用。由NCED基因编码的9-顺-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED),是ABA在高等植物中的关键酶。本研究已成功从水稻Ilmibyeo(O.sativa... 脱落酸(abscisic acid,ABA)是一种抑制植物生长的植物激素,因能促使叶子脱落而得名,在植物逆胁迫中发挥关键作用。由NCED基因编码的9-顺-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED),是ABA在高等植物中的关键酶。本研究已成功从水稻Ilmibyeo(O.sativa L.ssp.japonica)基因组中克隆得到Os NCED4,生物信息学分析表明,Os NCED4基因位于水稻第7号染色体上,ORF全长1749 bp,无内含子结构,编码582个氨基酸,具有NCED家族的RPE65保守结构;以该基因和其启动子序列构建组织表达载体pOsNCED4::GUS、pCaMV35S::OsNCED4:EGFP和RNAi干扰载体p Ca MV35S::OsNCED4:RNAi,用于基因表达和功能分析,并利用农杆菌介导的方法,成功获得了相应遗传载体的转基因植株;GUS染色结果表明,该基因在叶片、叶耳、小穗等组织部位均有表达;RT-PCR结果显示,Os NCED4在水稻不同生育期的根、茎、叶、叶鞘和穗子中均有不同程度的表达,但表达量具有明显的差异;亚细胞定位结果显示,OsNCED4基因编码的蛋白定位于细胞核;与野生型植株相比,RNAi植株的花粉育性无明显差异,而结实率显著下降。该研究结果为进一步研究水稻OsNCED4基因表达的调控,以及为水稻生长发育上的功能研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa L.) OsNCED4 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
转iaaM基因黄花蒿中基因表达量与其腺毛密度相关性分析 预览
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作者 钟烨冰 肖楠 +3 位作者 胡晴 黄妤 赵燕 张学文 《作物研究》 2020年第2期161-165,共5页
以转化腺毛中特异表达iaa M基因的13株黄花蒿单株为材料,用半定量RT-PCR法对转基因各单株中转基因的表达进行定量,并利用荧光显微镜对这些转基因个体叶片腺毛的密度进行观察。结果:iaa M基因在转基因黄花蒿植株中均有表达,基因表达量与... 以转化腺毛中特异表达iaa M基因的13株黄花蒿单株为材料,用半定量RT-PCR法对转基因各单株中转基因的表达进行定量,并利用荧光显微镜对这些转基因个体叶片腺毛的密度进行观察。结果:iaa M基因在转基因黄花蒿植株中均有表达,基因表达量与腺毛密度呈正相关,其中表达量最高的转基因植株个体iaa M-2腺毛密度达到59.9枚/mm^2,为对照的2倍以上,表明腺毛特异启动子调控的iaa M基因转化黄花蒿,能显著促进黄花蒿腺毛的发育,增加其腺毛密度。由于黄花蒿腺毛是其有效成分青蒿素的主要合成和贮存部位,可望通过这种特异的转基因手段有效提高黄花蒿中青蒿素的含量。 展开更多
关键词 黄花蒿 转iaa M基因 基因表达 腺毛密度
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甘蔗乙烯信号转导途径关键基因CTR1的克隆与表达分析
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作者 王凡伟 肖冬 +2 位作者 李杨瑞 何龙飞 王爱勤 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期827-833,共7页
为了研究CTR1基因与甘蔗糖分积累的关系,本研究利用同源克隆的方法,以甘蔗品种‘桂糖28’(GT28)幼嫩叶片的cDNA为模板,成功克隆得到2103 bp的甘蔗CTR1基因(ScCTR1;GenBank登录号为MK158246)。ScCTR1基因的开放阅读框(ORF)序列长1656 bp... 为了研究CTR1基因与甘蔗糖分积累的关系,本研究利用同源克隆的方法,以甘蔗品种‘桂糖28’(GT28)幼嫩叶片的cDNA为模板,成功克隆得到2103 bp的甘蔗CTR1基因(ScCTR1;GenBank登录号为MK158246)。ScCTR1基因的开放阅读框(ORF)序列长1656 bp,编码551个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为62.78 kD。ScCTR1蛋白具有CTR1同源蛋白典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域。实时荧光定量PCR结果表明,ScCTR1基因在茎和叶中都有表达,在茎中其表达量呈先增加后降低的趋势,在未成熟叶、成熟叶和老叶中,其基因表达呈降低的趋势。本研究结果对阐明乙烯调控甘蔗茎糖分积累和叶发育的机理提供了重要的参考依据。 展开更多
关键词 甘蔗(Saccharum ssp.Hybrids) CTR1 基因克隆 基因表达
VPS13A基因突变致舞蹈病-棘红细胞增多症的诊断及家系研究 预览
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作者 姚念廷 郑乾 +4 位作者 冯占辉 尹建红 徐子茜 焦玲 张春林 《贵州医科大学学报》 CAS 2020年第3期350-355,共6页
目的:探讨舞蹈病-棘红细胞增多症(Ch Ac)的诊断方法及家系特点,为Ch Ac的精准诊断提供可行合理的策略。方法:选取1例临床疑似Ch Ac患者(先证者)作为研究对象,收集其临床资料和家系资料并绘制遗传家系图;采用扫描电镜检测棘红细胞,利用... 目的:探讨舞蹈病-棘红细胞增多症(Ch Ac)的诊断方法及家系特点,为Ch Ac的精准诊断提供可行合理的策略。方法:选取1例临床疑似Ch Ac患者(先证者)作为研究对象,收集其临床资料和家系资料并绘制遗传家系图;采用扫描电镜检测棘红细胞,利用全外显子目标序列捕获2代测序技术筛查Ch Ac易患性基因及其突变类型。结果:先证者主要临床表现为不自主伸舌、磨牙、扮鬼脸、头部及四肢舞蹈动作及口唇自噬动作,外周血肌酶和转氨酶均增高,头颅MRI可见尾状核轻度萎缩;其兄生前具有与先证者同样的临床表现,其父母及姐姐均体健;先证者外周血检测到典型棘红细胞,检测出液泡蛋白分类同源物13A(VPS13A)基因,且VPS13A基因存在c. 9403C> T纯合突变,引起氨基酸改变p. R3135X,为无义突变;先证者的父亲和母亲均为c. 9403C> T杂合突变。结论:结合临床表现及扫描电镜检查可以高度怀疑Ch Ac,但全外显子目标序列捕获2代测序技术可准确检测VPS13A基因突变,并可结合遗传家系特点,作为Ch Ac首选确诊手段。 展开更多
关键词 诊断 棘红细胞 基因表达 舞蹈病-棘红细胞增多症 高通量2代测序技术 VPS13A基因
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飞蝗转录因子LmE74A的表达和调控
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作者 孙亚文 张学尧 +1 位作者 张敏 刘晓健 《山西大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2020年第1期158-163,共6页
蜕皮激素20E调控昆虫的蜕皮与变态,E74是昆虫蜕皮激素信号传导过程中关键转录因子之一。以飞蝗(Locusta migratoria)为研究对象,对LmE74A基因的表达、调控及功能进行了研究。搜索飞蝗转录组数据库获得E74A基因全长cDNA序列,命名为LmE74A... 蜕皮激素20E调控昆虫的蜕皮与变态,E74是昆虫蜕皮激素信号传导过程中关键转录因子之一。以飞蝗(Locusta migratoria)为研究对象,对LmE74A基因的表达、调控及功能进行了研究。搜索飞蝗转录组数据库获得E74A基因全长cDNA序列,命名为LmE74A(GenBank登录号:MK568625),其中开放阅读框(ORF)长度为1539bp,编码512个氨基酸。Reverse transcription-quantitative PCR(RT-qPCR)分析表明:LmE74A在飞蝗体壁中高表达,其次是前肠和后肠;LmE74A在五龄第5天表达量最高,蜕皮前后表达量较低。体内注射20E后,LmE74A的表达显著上升,说明LmE74A可以被20E诱导。在五龄期注射LmE74A的dsRNA后,注射dsLmE74A组的LmE74A基因的表达量较对照组显著降低,但该基因的表达下调并没有影响飞蝗正常羽化为成虫。 展开更多
关键词 飞蝗 E74A 基因表达 基因调控
综合护理干预对老年妇科肿瘤患者癌症相关基因表达的影响 预览
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作者 梁丽伟 《中国老年保健医学》 2020年第1期124-126,共3页
目的探讨综合护理干预对老年妇科肿瘤(乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌)患者癌症相关基因表达的影响,进一步探讨综合护理干预对老年妇科肿瘤的影响。方法选取2018年2月至2019年2月在我院接受治疗的180例妇科肿瘤患者为研究对象,其中乳腺癌、宫... 目的探讨综合护理干预对老年妇科肿瘤(乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌)患者癌症相关基因表达的影响,进一步探讨综合护理干预对老年妇科肿瘤的影响。方法选取2018年2月至2019年2月在我院接受治疗的180例妇科肿瘤患者为研究对象,其中乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌患者各60例,各种癌症患者分为对照组和试验组,各30例。妇科肿瘤患者入院后进行手术切除,对照组患者接受常规护理,试验组患者接受综合护理干预。收集患者血清,应用实时定量聚合酶链式反应检测患者血清癌症相关基因表达变化。结果与正常对照组乳腺癌患者(n=30)相比,试验组乳腺癌患者(n=30)血清中lncRNA PRNCR1、lncRNA LINC01787基因表达显著降低,而lncRNA XOXC-AS3、lncRNA LINC01614、miR-375、miR-210基因无变化,miR-3922和miR-101基因的表达显著上升;与正常对照组宫颈癌患者(n=30)相比,试验组宫颈癌患者(n=30)血清中lncRNA FTH1P3、lncRNA SNHG16等基因表达显著降低,而lncRNA GHET1、miR-574无变化,lncRNA WT1-AS、miR-145、miR-877、miR-140的表达显著上升;与正常对照组卵巢癌患者(n=30)相比,试验组卵巢癌患者(n=30)血清中lncRNA CACS15基因表达显著降低,lncRNA LINC00152、lncRNA KCNQ10T1、miR-124、miR-205无变化,lncRNA PCAT-1、miR-137、miR-6076的表达显著上升。结论综合护理干预对老年妇科肿瘤(乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌)患者癌症相关基因的表达具有一定的影响,能够调控癌症相关基因的表达。 展开更多
关键词 护理干预 妇科肿瘤 癌症基因 基因表达
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耳叶水苋对乙酰乳酸合成酶抑制剂的抗性及其分子机制初探
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作者 张建树 刘冰 +8 位作者 蔡新忠 周伟军 王会福 陆强 周国军 刘亚光 梁文 王硕 朱金文 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期60-67,共8页
近年来长江下游地区稻田耳叶水苋Ammannia arenaria H.B.K.危害十分严重。采用盆栽法首次测定了耳叶水苋对苄嘧磺隆等药剂的抗性水平,同时分析了其抗性和敏感种群间乙酰乳酸合成酶(ALS)基因的DNA序列及其RNA表达差异。结果表明:采自浙... 近年来长江下游地区稻田耳叶水苋Ammannia arenaria H.B.K.危害十分严重。采用盆栽法首次测定了耳叶水苋对苄嘧磺隆等药剂的抗性水平,同时分析了其抗性和敏感种群间乙酰乳酸合成酶(ALS)基因的DNA序列及其RNA表达差异。结果表明:采自浙江嘉兴(JX110)、江苏苏州(JS039)、浙江宁波(NB0143-05)和安徽广德(AH014)的耳叶水苋生物型对苄嘧磺隆的抗性指数(RI)分别为67.90、17.59、44.63和8.37,对苄嘧磺隆表现出中高水平抗性的生物型对五氟磺草胺、双草醚及咪唑乙烟酸也产生了低水平的抗性。获得了耳叶水苋ALS基因全长核苷酸序列2235 bp,编码667个氨基酸,仅发现NB0143-05等3种抗性生物型ALS酶的氨基酸序列非保守区第93位的亮氨酸被脯氨酸取代。然而,NB0143-05的ALS酶对ALS抑制剂的敏感性大幅度降低(RI 37.04),且在苄嘧磺隆处理后4 d的ALS基因表达量是敏感生物型(HZ001)的1.86倍。这表明,ALS酶对药剂的敏感性降低以及被苄嘧磺隆诱导后ALS基因表达量显著增加,很可能是耳叶水苋生物型NB0143-05对ALS抑制剂产生抗性的原因。 展开更多
关键词 耳叶水苋 乙酰乳酸合成酶(ALS)抑制剂 抗性 基因突变 基因表达
胆管癌中异柠檬酸脱氢酶基因突变潜在靶基因的鉴定 预览
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作者 王迪 李晴 +1 位作者 佟伟民 牛亚梅 《基础医学与临床》 CSCD 2020年第4期512-517,共6页
目的鉴定胆管癌中异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变的潜在靶基因。方法下载TCGA胆管癌项目的DNA甲基化、转录组数据。将IDH突变型肿瘤与IDH野生型肿瘤进行比较,分别通过limma和DESeq2进行差异甲基化位点和差异表达分析。对差异表达基因的表... 目的鉴定胆管癌中异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变的潜在靶基因。方法下载TCGA胆管癌项目的DNA甲基化、转录组数据。将IDH突变型肿瘤与IDH野生型肿瘤进行比较,分别通过limma和DESeq2进行差异甲基化位点和差异表达分析。对差异表达基因的表达量进行标准化处理并与相应差异甲基化位点的甲基化水平进行Spearman相关性分析。筛选出高甲基化、低表达且两者呈负相关的基因进行富集分析以探究其功能。构建蛋白质互作网络并通过MCODE筛选出核心模块。结果分析得到11605个差异甲基化位点,其中10427个位点高甲基化;而735个差异表达基因中有651个基因下调,其中的143个基因与328个高甲基化位点形成330对强负相关组合。上述143个基因富集于表皮生长因子受体信号通路、细胞外渗及细胞分裂的调控,通过构建蛋白质相互作用(PPI)网络筛选出核心模块的10个基因,分别参与了上皮细胞的分化发育、细胞蛋白质定位等生物学过程。结论本研究通过整合TCGA胆管癌DNA甲基化和转录组数据,得到了IDH突变所影响的潜在靶基因并确定其PPI网络核心模块,为阐明IDH突变在胆管癌发生发展中的作用提供了新的线索。 展开更多
关键词 胆管癌 异柠檬酸脱氢酶突变 基因 DNA甲基化 基因表达
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SMAD9基因在肺腺癌中的表达及临床意义
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作者 陈东姣 刘文斌 +3 位作者 陈洪强 刘晋祎 杨惠芳 曹佳 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期699-707,共9页
目的探讨SMAD9基因在肺腺癌中的表达变化与临床病理指标以及术后生存之间的关联,为肺腺癌的筛查及其预后提供参考依据。方法基于肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库收集的数据,分析SMAD9基因在肺腺癌患者肿瘤组织(510例... 目的探讨SMAD9基因在肺腺癌中的表达变化与临床病理指标以及术后生存之间的关联,为肺腺癌的筛查及其预后提供参考依据。方法基于肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库收集的数据,分析SMAD9基因在肺腺癌患者肿瘤组织(510例)和癌旁正常组织(59例)中的表达情况以及与临床病理指标和术后生存的关系。收集肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织、3-甲基胆蒽(3-MCA)诱导的HBE恶性转化细胞、肺腺癌细胞株,采用qRT-PCR以及Western blot方法检测SMAD9基因的mRNA及蛋白表达水平。采用CCK-8法检测SMAD9过表达和干扰对细胞增殖的影响。结果TCGA数据库分析结果显示,在肺腺癌患者中,肿瘤组织的SMAD9基因的mRNA表达显著低于癌旁正常组织(P<0.01)。qRT-PCR以及Western blot结果都显示,SMAD9基因在3-MCA诱导的HBE恶性转化细胞中呈下调趋势,且在恶转细胞中随着恶转代数增加下调越明显;该基因在肺腺癌组织、多株肺腺癌细胞中的表达均呈现显著下调(P<0.05)。SMAD9基因的表达与N分期及肿瘤分期高度相关(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,SMAD9基因mRNA的表达是一个灵敏度较好的肺腺癌分子筛查标志物(AUC=0.904,95%CI=0.869~0.938,P<0.001)。Kaplan-Meier分析结果显示,肺腺癌患者中,SMAD9基因低表达患者生存时间显著低于高表达患者的生存时间(P<0.05)。过表达SMAD9基因抑制肺腺癌细胞增殖(P<0.01),干扰SMAD9表达后HBE细胞增殖能力显著增强(P<0.01)。结论SMAD9基因在肺腺癌发生、发展过程中表达下调,该基因的表达对肺腺癌患者的筛查和术后生存具有较好的参考价值。 展开更多
关键词 SMAD9基因 肺腺癌 TCGA 基因表达 术后生存
苹果多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定与表达分析 预览
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作者 秦玲 张鑫 +5 位作者 荣春笑 莫传园 范露 闫婕 孟莹 张满让 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期262-273,共12页
从金冠基因组数据库中,利用BLAST网站在苹果中鉴定得到8个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为MdPAO1~8),对其进行理化性质、系统进化、蛋白结构、基因结构和启动子元件分析。结果表明,MdPAO蛋白的分子量为54.053~6... 从金冠基因组数据库中,利用BLAST网站在苹果中鉴定得到8个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为MdPAO1~8),对其进行理化性质、系统进化、蛋白结构、基因结构和启动子元件分析。结果表明,MdPAO蛋白的分子量为54.053~64.813 ku,等电点介于5.16~6.02。根据进化树分析,MdPAO被分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ),且同一亚家族的成员具有相似的蛋白结构、基因结构和蛋白保守基序分布。利用GEO数据库检测出8个MdPAO在不同组织器官中的表达具有明显差异。以苹果主栽品种长富2号为材料,利用实时荧光定量PCR检测分析得出8个MdPAO在不同组织中的表达情况,结果表明,MdPAO3、MdPAO4、MdPAO5/6和MdPAO8在花中有较高的表达水平;MdPAO1/2和MdPAO7在茎和果中有较高的表达水平。外源亚精胺处理后发现,除MdPAO3以外,其余MdPAO的转录水平显著提高,表明MdPAO在PA代谢途径中具有重要作用。 展开更多
关键词 苹果 多胺氧化酶(PAO)基因家族 生物信息学 基因表达
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