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MALDI-TOF-MS在儿童血流及尿路感染病原菌直接鉴定中的应用 认领
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作者 王林 王媚 王维 《山西医科大学学报》 CAS 2021年第1期113-118,共6页
目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)在快速准确鉴定儿童血流及尿路感染病原菌方面的临床应用优势及操作关键点。方法收集西安市儿童医院血培养报警阳性瓶382份,尿常规提示感染的尿培养标本314份。血培养阳性标本经... 目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)在快速准确鉴定儿童血流及尿路感染病原菌方面的临床应用优势及操作关键点。方法收集西安市儿童医院血培养报警阳性瓶382份,尿常规提示感染的尿培养标本314份。血培养阳性标本经过MALDI Sepsitype试剂盒处理后采用MALDI-TOF-MS直接鉴定,尿液标本行差速离心富集细菌后直接采用MALDI-TOF-MS鉴定病原菌。直接鉴定结果与标本接种后传统培养12-48 h后的菌落鉴定结果进行比较。结果血培养阳性标本中18份标本为两种及两种以上菌混合感染,364份标本为单一菌感染,革兰阳性菌两种鉴定方法符合率为84.3%(177/210),革兰阴性菌鉴定符合率为88.4%(114/129),真菌鉴定符合率为44.4%(4/9)。在鉴定结果一致情况下,质谱直接鉴定较菌落鉴定指纹图谱干扰杂峰多,评分稍低;尿液培养菌落计数>105cfu/ml标本共265份,细菌直接鉴定符合率83.3%(221/265),儿童常见尿路感染细菌菌液倍比稀释后发现可靠的直接鉴定结果最低检测限分别为大肠埃希菌(104 cfu/ml)、肺炎克雷伯菌(105 cfu/ml)、肠球菌(106 cfu/ml)。结论MALDI-TOF-MS直接鉴定血培养报阳及尿液标本病原菌时,单一菌及高浓度菌感染鉴定快速且符合率高,可有效缩短检测时间,及时为临床危重患儿提供诊治依据。 展开更多
关键词 血流感染 尿路感染 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 细菌鉴定 快速诊断
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PCR-核酸飞行时间质谱系统检测新型冠状病毒方法的建立及应用研究 认领
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作者 王俊 张栋 +4 位作者 陈晴晴 俞俊岭 杨奕 乔亮 孙永 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2020年第35期4430-4435,4442,共7页
背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在全球暴发,实验室检测结果是疾病诊断的重要依据,检测方法的灵敏度和特异度是影响实验结果的关键因素,现实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)核酸检测方法是COVID-19确诊的通用方法,但其检测灵敏度有方法局限... 背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在全球暴发,实验室检测结果是疾病诊断的重要依据,检测方法的灵敏度和特异度是影响实验结果的关键因素,现实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)核酸检测方法是COVID-19确诊的通用方法,但其检测灵敏度有方法局限性,依赖标本病毒含量。通过对PCR-核酸飞行时间质谱检测方法的优化,从而提高对低新型冠状病毒(SARS-CoV-2)含量病例检测的灵敏度,可为现有方法做有效补充。目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)原理,在Clin-ToFⅡ飞行时间质谱系统上,建立PCR-核酸飞行时间质谱(PCR-TOF MS)系统检测SARS-CoV-2的方法,并评估其实际应用价值。方法2020年2—3月于上海市临床检验中心室间质评阳性样本40份、阴性样本7份,国家卫生健康委员会室间质评阳性样本41份、阴性样本33份,本实验室购买阳性质粒及稀释样本32份,健康人样本28份,空白对照超纯水5份,共186份样本作为建立PCR-TOF MS系统数据。于2020年1—2月收集安徽省内临床送检到安徽省疾病预防控制中心的疑似COVID-19患者上呼吸道样本80份(咽拭子样本55份、痰液样本25份)及健康人群样本20份(均为咽拭子样本)作为评估PCR-TOF MS系统效果的数据。建立PCR-TOF MS系统试验体系步骤,包括PCR扩增、虾碱性磷酸酶(SAP)消化、单碱基延伸和质谱检测;并基于阳性质粒优化模版量,根据186份样本检测质谱峰的信噪比(SNP)确定该方法在SARS-CoV-2检测时的判读标准。对80份疑似SARS-CoV-2样本和20份健康人群样本进行检测分析,并与实时荧光定量PCR法进行对比。结果通过对PCR-TOF MS模板条件的优化,模版量6μl时,扩增产物可获得典型的质谱峰图。建立的PCR-TOF MS反应体系可以对SARS-CoV-2核酸的开放读码框1ab(ORF1ab)基因和核壳蛋白(N)基因进行有效扩增检测。本研究PCR-TOF MS方法对临床疑似病例样本的检出率为9 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 新型冠状病毒 PCR-飞行质谱系统 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 核酸检测
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海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库的建立 认领
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作者 李艳君 丁毅伟 +1 位作者 赵强元 马聪 《解放军医学院学报》 CAS 2020年第7期719-723,共5页
目的建立海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库,为海洋细菌引起各类感染的病原快速鉴定提供支持。方法本中心课题组2006-2016年收集国内外6个海域158个采样点海洋细菌530株,分离培养后进行细菌16srDNA扩增测序,应用FlexC... 目的建立海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库,为海洋细菌引起各类感染的病原快速鉴定提供支持。方法本中心课题组2006-2016年收集国内外6个海域158个采样点海洋细菌530株,分离培养后进行细菌16srDNA扩增测序,应用FlexControl软件收集蛋白谱图,Biotyper软件构建评价数据库。分别用仪器商品化数据库、自建数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,比较各数据库的鉴定差异。结果自建本地化海洋细菌鉴定数据库包含32个菌属,82个菌种,共计421株海洋细菌谱图。以16srDNA测序鉴定结果为金标准,验证菌株用商品化数据库鉴定时正确80株,鉴定正确率80.8%,用扩展数据库鉴定时正确97株,鉴定正确率98.0%,差异有统计学意义(P<0.001)。结论自建海洋细菌鉴定数据库菌株的鉴定能力较商品化数据库更强,有助于海洋细菌引起相关感染的诊断和治疗。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 海洋细菌 细菌鉴定数据库 病原菌 微生物
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MALDI-TOF MS自建库在红色毛癣菌感染中的临床快速诊断价值 认领
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作者 邓穗燕 易江华 +1 位作者 蔡文莹 夏勇 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第4期418-422,共5页
目的建立并评价实验室自建的红色毛癣菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)数据库的可行性。方法将红色毛癣菌标准菌株ATCC 28188用沙保罗葡萄糖琼脂(SDA)平板28℃培养5d,分别用双甲酸夹心法和甲酸提取法作为蛋白提取方法... 目的建立并评价实验室自建的红色毛癣菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)数据库的可行性。方法将红色毛癣菌标准菌株ATCC 28188用沙保罗葡萄糖琼脂(SDA)平板28℃培养5d,分别用双甲酸夹心法和甲酸提取法作为蛋白提取方法,利用MALDI-TOF MS对标准菌株进行质谱数据采集,建立2种不同蛋白提取方法的菌株数据库"双甲酸夹心法自建库"和"甲酸提取法自建库";并用2种蛋白提取方法对21株红色毛癣菌临床分离株进行蛋白提取后,分别选取"双甲酸夹心法自建库+Bruker商品库"、"甲酸提取法自建库+Bruker商品库"和"Bruker商品库"做质谱鉴定,从而对各数据库的鉴定效果进行评价。结果"甲酸提取法自建库+Bruker商品库"对21株红色毛癣菌临床分离株的鉴定得分显著高于其余两组,差异有统计学意义(P<0.05),匹配率为21/21;"Bruker商品数据库"与"Bruker商品数据库+双甲酸夹心法自建库"的鉴定得分比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论本实验室建立的"甲酸提取法自建库+Bruker库"对红色毛癣菌的鉴定能力好,适用于临床微生物实验室。与待测菌统一培养条件所建立的数据库丰富了原有的数据库信息,使待测菌的鉴定更为准确。双甲酸夹心法操作简便,但对红色毛癣菌蛋白提取的效果欠佳。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 自建库 红色毛癣菌 鉴定
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非整倍体胎儿羊水质谱多肽初步筛选 认领
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作者 宿进江 张春斌 +6 位作者 陈晓杭 李冬雪 罗小金 杨洁霞 尹爱华 高玉山 魏凤香 《广东药科大学学报》 CAS 2020年第5期724-728,共5页
目的利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪Clin-TOF-II研究非整倍体胎儿羊水多肽质谱变化规律。方法选取96例2015年6月-2016年6月来深圳市龙岗区妇幼保健院进行介入性产前诊断的羊水标本。依据染色体核型分析报告筛选得到21、18、XXY... 目的利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪Clin-TOF-II研究非整倍体胎儿羊水多肽质谱变化规律。方法选取96例2015年6月-2016年6月来深圳市龙岗区妇幼保健院进行介入性产前诊断的羊水标本。依据染色体核型分析报告筛选得到21、18、XXY、XYY、X 5种染色体非整倍体羊水标本46例,正常标本50例为对照,进一步进行多肽组学质谱分析。结果通过分析正常对照与非整倍体羊水多肽质谱数据,得到124个差异性多肽峰(P<0.05),其中显著性多肽峰95个(P<0.01),极显著性多肽峰29个(P<0.001)。其中2245.8 m/z和1025.7 m/z极显著性多肽峰标本重现性最好。根据2245.8 m/z和1025.7 m/z多肽峰建立羊水非整倍体诊断模型,评估其对鉴别胎儿非整倍体的临床价值。结论径向基函数网络RBF模型可作为区分正常对照组与非整倍体的理想模型。 展开更多
关键词 非整倍体 羊水 多肽标志物 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
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基于磁性纳米材料分离的肿瘤标志物HSP90α质谱分析方法 认领
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作者 余利星 翟睿 +7 位作者 龚晓云 谢洁 黄泽建 刘梅英 江游 戴新华 方向 俞晓平 《计量技术》 2020年第5期14-18,78,共6页
肿瘤标志物的准确测量对肿瘤的早期筛查和预后评判具有重要意义。然而,由于复杂基质中肿瘤标志物含量极低,且易受高丰度蛋白质的信号干扰,因此对其直接质谱分析存在极大困难。本文将一种固载了特异性抗体的磁性纳米材料应用于肿瘤标志... 肿瘤标志物的准确测量对肿瘤的早期筛查和预后评判具有重要意义。然而,由于复杂基质中肿瘤标志物含量极低,且易受高丰度蛋白质的信号干扰,因此对其直接质谱分析存在极大困难。本文将一种固载了特异性抗体的磁性纳米材料应用于肿瘤标志物热休克蛋白90α(Heat shock protein 90alpha,HSP90α)的分离富集,然后采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)分析HSP90α富集后的酶切肽段。并用实验验证该方法具有高效率、高特异性和高灵敏度的特点,该分析策略在临床肿瘤标志物的精准检测方面具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 血清 磁性纳米材料 富集 热休克蛋白90Α 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
MALDI-TOF MS检测非小细胞肺癌基因突变研究进展 认领
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作者 宋御繁 王娜娜 +2 位作者 张婷 陈英剑 胡成进 《临床检验杂志》 CAS 2020年第3期199-202,共4页
非小细胞肺癌基因突变靶点的精准检测是分子靶向药物治疗的基础,近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)作为基因突变检测的一种新技术... 非小细胞肺癌基因突变靶点的精准检测是分子靶向药物治疗的基础,近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)作为基因突变检测的一种新技术,临床应用前景十分广阔,但其尚在应用研究的起步阶段。该文对MALDI-TOF MS技术在非小细胞肺癌基因突变检测中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 非小细胞肺癌 基因突变
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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱检测实验动物病原菌效果初探 认领 被引量:1
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作者 邢进 刘娜 +5 位作者 冯育芳 张雪青 崔生辉 贺争鸣 赵德明 岳秉飞 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第3期83-88,97共7页
目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测实验动物病原菌的效果。方法使用德国Bruker Biotyper系统对40株标准菌株及384株实验动物分离菌进行鉴定。结果 Bruker Biotyper检测标准菌株和分离株的准确率分别为90. 0%... 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测实验动物病原菌的效果。方法使用德国Bruker Biotyper系统对40株标准菌株及384株实验动物分离菌进行鉴定。结果 Bruker Biotyper检测标准菌株和分离株的准确率分别为90. 0%和80. 0%。对鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis)、志贺菌(Shigella spp.)、肺炎克雷伯杆菌(Klebsiella pneumoniae)、嗜肺巴斯德杆菌Heyl生物型(Rodentibacter heylii)和支气管鲍特杆菌(Bordetella bronchiseptica)的鉴定存在偏差。结论MALDI-TOF MS方法高效、准确率高,可用于实验动物病原菌的快速鉴定。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 病原菌 细菌检测 实验动物
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婴幼儿配方乳粉菌落总数检测与细菌污染种属分析 认领
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作者 安琳 余文 +2 位作者 徐颖华 李景云 崔生辉 《食品安全质量检测学报》 CAS 2020年第17期5891-5896,共6页
目的考察婴幼儿配方乳粉的微生物污染情况,分析婴幼儿配方乳粉的菌相构成。方法采用国标方法测定30批次1段、2段、3段婴幼儿配方乳粉菌落总数,使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对检出的优势菌落进行鉴定。结果30批次婴幼儿配方乳... 目的考察婴幼儿配方乳粉的微生物污染情况,分析婴幼儿配方乳粉的菌相构成。方法采用国标方法测定30批次1段、2段、3段婴幼儿配方乳粉菌落总数,使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对检出的优势菌落进行鉴定。结果30批次婴幼儿配方乳粉的菌落总数均符合国家限量要求,其中1段乳粉菌落总数显著性低于2段和3段乳粉(P<0.05)。婴幼儿配方乳粉中检出的细菌主要为芽孢杆菌属、类芽孢杆菌属、球形芽孢杆菌属、肠球菌属、葡萄球菌属和链球菌属,其中芽孢杆菌属检出率最高。此外,9批次样品中检出蜡样芽胞杆菌。结论我国婴幼儿配方乳粉质量仍存在一定的风险,监管部门应加强日常监管工作。 展开更多
关键词 婴幼儿配方乳粉 菌落总数 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 芽孢杆菌
百日咳鲍特菌MALDI-TOF MS谱库的扩展及鉴定效果评价 认领
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作者 郄春花 刘亚敏 +3 位作者 李颖 王玥 吴红章 孟超 《临床检验杂志》 CAS 2020年第4期267-269,共3页
目的对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术鉴定百日咳鲍特菌谱库进行扩展。方法采用Microflex LT软件,用经全基因组测序确认的9株百日咳鲍特菌和1株副百日咳鲍特菌构建蛋白质指纹谱库,对布鲁克数据库进行扩展。对标准... 目的对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术鉴定百日咳鲍特菌谱库进行扩展。方法采用Microflex LT软件,用经全基因组测序确认的9株百日咳鲍特菌和1株副百日咳鲍特菌构建蛋白质指纹谱库,对布鲁克数据库进行扩展。对标准菌株ATCC 29213、ATCC 25922、ATCC 700603、ATCC 27853进行MALDI-TOF MS鉴定,评价扩展库的准确性。选取6株百日咳鲍特菌,每个菌株取3个菌落分别用MALDI-TOF MS鉴定,评价试验的精密度。采用36株临床分离株验证扩展谱库对百日咳鲍特菌的识别能力,并进行扩展库前后鉴定结果比较。结果成功构建9株百日咳鲍特菌和1株副百日咳鲍特菌参考谱库,并扩展现有布鲁克数据库Taxonomy(5989)数据库为Taxonomy(5989+)。扩展库准确鉴定4株标准菌株ATCC 29213、ATCC 25922、ATCC 700603、ATCC 27853,对鲍特菌鉴定无干扰;6株百日咳鲍特菌的重复鉴定符合率为100%,精密度良好。用于外部验证的36株菌经扩展后数据库鉴定,种水平鉴定率达86.1%。结论百日咳鲍特菌质谱库的扩展提升了地区性分离菌株鉴定能力。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 百日咳鲍特菌 鉴定 谱库
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质谱技术快速鉴定临床分离丝状真菌的应用 认领
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作者 曹敬荣 王岩 +6 位作者 谢威 李文军 陈典典 段园园 刘云屹 闵嵘 王培昌 《中华实验和临床感染病杂志:电子版》 CAS 2020年第5期374-379,共6页
目的探讨质谱(MALDI-TOF MS)在临床分离的丝状真菌快速鉴定中的应用。方法收集首都医科大学宣武医院2017年1月至2019年1月经形态学鉴定为丝状真菌的菌株,分别采用双甲酸夹心法和甲酸乙腈萃取法提取真菌蛋白并行MALDI-TOF MS鉴定,并与聚... 目的探讨质谱(MALDI-TOF MS)在临床分离的丝状真菌快速鉴定中的应用。方法收集首都医科大学宣武医院2017年1月至2019年1月经形态学鉴定为丝状真菌的菌株,分别采用双甲酸夹心法和甲酸乙腈萃取法提取真菌蛋白并行MALDI-TOF MS鉴定,并与聚合酶链反应(PCR)内转录间隔区(ITS)基因序列测定结果比较;分析丝状真菌菌种分布和标本来源。结果共收集临床分离的丝状真菌90株,其中曲霉菌属70株(77.78%),青霉菌属6株(6.67%),链格孢霉5株(5.56%),镰刀菌属4株(4.44%),赛多孢菌2株(2.22%),米根霉、根毛霉和哈茨木霉各1株(1.11%);其中曲霉菌以烟曲霉47株(52.22%)、黄曲霉13株(14.44%)和黑曲霉4株(4.44%)为主。标本主要来源于呼吸道标本(90.0%)(包括痰标本和肺泡灌洗液),其次为角膜和耳道分泌物(3.33%),痰标本中分离率最多的为曲霉菌(59株、65.56%)。MALDI-TOF MS鉴定到种水平82株,与基因测序结果一致率为91.11%(82/90),鉴定准确率显著高于形态学鉴定结果(68.89%,62/90),差异有统计学意义(χ2=12.02、P=0.01);质谱鉴定丝状真菌中的曲霉菌、镰刀菌、赛多孢菌和链格孢霉时准确率高(98.57%~100%);双甲酸夹心法和甲酸乙腈萃取法前处理的质谱鉴定丝状真菌到种水平的比率分别为91.11%(82/90)和90.00%(81/90),鉴定曲霉菌种水平分别为98.57%(69/70)和97.14%(68/70),但鉴定准确率差异无统计学意义(χ2=0.34、P=0.95);两种前处理方法均可100%鉴定烟曲霉、黄曲霉、赛多孢菌和链格孢霉到种水平,其中89.36%(42/47)烟曲霉和76.92%(10/13)黄曲霉鉴定得分≥2.0分。结论MALDI-TOF MS技术鉴定丝状真菌快速准确,双甲酸夹心法前处理操作更简便,适合实验室常规检测,可用于实验室常规鉴定曲霉菌等常见丝状真菌。 展开更多
关键词 丝状真菌 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 鉴定 双甲酸夹心 甲酸乙腈萃取
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血液及无菌体液阳性培养快速报告流程的探讨 认领
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作者 刘潇 杨荣敏 +1 位作者 卢宇 郑全辉 《中国社区医师》 2020年第31期119-120,共2页
目的:探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOP MS)联合全自动微生物鉴定仪在血液及无菌体液培养快速鉴定及药敏实验的应用,建立合适的血培养及无菌体液培养阳性标本的快速报告流程。方法:选取2019年5-10月唐山市工人医院单一... 目的:探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOP MS)联合全自动微生物鉴定仪在血液及无菌体液培养快速鉴定及药敏实验的应用,建立合适的血培养及无菌体液培养阳性标本的快速报告流程。方法:选取2019年5-10月唐山市工人医院单一细菌感染的血培养报阳瓶122例,转种后4 h菌膜进行MALDI-TOP MS鉴定和全自动微生物鉴定仪的药敏实验,与纯菌落的鉴定和药敏结果进行对比。结果:两次鉴定结果符合率达100%;药敏试验革兰阳性球菌总符合率达99%,革兰阴性杆菌总符合率为98%,药物符合率均在92%以上。结论:MALDI-TOF MS的快速鉴定和全自动微生物鉴定仪的药敏试验相结合,可用于血培养和无菌体液阳性标本的快速报告流程。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 全自动微生物鉴定仪 血液 无菌体液
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苏州地区耐左氧氟沙星无乳链球菌临床分离株分子及质谱学特征分析 认领
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作者 张宇蔺 苏宁 +5 位作者 陈海鹏 秦国英 陆文香 徐卫东 袁栎 钟桥 《临床检验杂志》 CAS 2020年第10期741-745,共5页
目的回顾分析苏州地区临床分离左氧氟沙星耐药无乳链球菌菌株分子及蛋白质谱学特征。方法收集2018年1月至2019年1月临床连续分离非重复耐左氧氟沙星无乳链球菌58株,用PCR法及Sanger基因测序方法检测gyrA、parC和parE基因突变、细菌血清... 目的回顾分析苏州地区临床分离左氧氟沙星耐药无乳链球菌菌株分子及蛋白质谱学特征。方法收集2018年1月至2019年1月临床连续分离非重复耐左氧氟沙星无乳链球菌58株,用PCR法及Sanger基因测序方法检测gyrA、parC和parE基因突变、细菌血清型以及多位点序列分型;用ClinPro Tools 3.0软件对左氧氟沙星耐药菌株蛋白质谱特征峰进行筛选并验证。结果测序检出耐左氧氟沙星菌株以携带gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变为主,占44.8%(26/58),以血清Ⅲ型和ST19型为主,并伴有血清Ⅰb型及ST23型流行;耐药菌株蛋白质谱峰分析显示6894、3445、5076、4544以及3721 m/z为主要特征峰。结论本地区耐左氧氟沙星无乳链球菌主要为gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变,且以血清Ⅲ型及ST19型为主,具有以6894 m/z为代表的质谱特征峰。 展开更多
关键词 无乳链球菌 左氧氟沙星 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
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克罗诺杆菌属食品分离株种水平鉴定方法比较研究 认领
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作者 张红芝 刘雪薇 +2 位作者 魏腾 鲁珺琰 张曦 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2020年第5期503-508,共6页
目的研究食品中分离克罗诺杆菌属种的鉴定方法,旨在建立稳定、可靠的种的鉴定方法。方法本研究选择三种鉴定方法,包括生化鉴定(VITEK 2 Compact)法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、全基因组测序,通过比较分析三种方... 目的研究食品中分离克罗诺杆菌属种的鉴定方法,旨在建立稳定、可靠的种的鉴定方法。方法本研究选择三种鉴定方法,包括生化鉴定(VITEK 2 Compact)法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、全基因组测序,通过比较分析三种方法对19株克罗诺杆菌属的鉴定结果,阐述三种鉴定方法的优缺点及其适用性。结果本研究中19株克罗诺杆菌属的鉴定结果显示,VITEK 2 Compact对阪崎克罗诺杆菌和丙二酸盐克罗诺杆菌的鉴定准确率只有67%和66%,而MALDI-TOF MS和全基因组测序的鉴定结果一致,因此可以判定MALDI-TOF MS能够快速、准确、高通量对克罗诺杆菌属进行种的鉴定。但是MALDI-TOF MS受限于数据库,不能鉴定到亚种的水平。结论本研究结果提示VITEK 2 Compact法不适用于克罗诺杆菌属种的鉴定;全基因组测序鉴定结果准确可靠;MALDI-TOF MS可以实现快速、高通量、准确的鉴定,仍需要进一步研究克罗诺杆菌属3个亚种的蛋白指纹图谱特点,丰富蛋白指纹图谱数据库,使其能够准确鉴定克罗诺杆菌属的7个种和3个亚种。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌属 生化鉴定 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 全基因组测序
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定丝状真菌的影响因素分析 认领 被引量:1
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作者 李颖 张戈 +3 位作者 杨洋 李冬雪 王贺 徐英春 《协和医学杂志》 CSCD 2020年第2期156-161,共6页
目的评估菌株培养条件、培养天数以及结果判定截断值(cut-off value,COV)3种因素对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定丝状真菌能力... 目的评估菌株培养条件、培养天数以及结果判定截断值(cut-off value,COV)3种因素对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定丝状真菌能力的影响。方法将78株受试丝状真菌分别接种到沙堡弱葡萄糖琼脂(sabouraud dextrose agar,SDA)、土豆葡萄糖琼脂(potato dextrose agar,PDA)两种培养基及28、35℃两种培养温度共4种组合的培养条件下进行培养,并于培养第2、3、4、5天以及第7天对其进行MALDI-TOF MS分析,根据鉴定率的差异筛选菌株MALDI-TOF MS鉴定用最佳培养条件和培养天数;下调MALDI-TOF MS结果判定COV,分析其对MALDI-TOF MS丝状真菌鉴定率的影响。结果受试菌株在SDA和PDA两种培养基间的MALDI-TOF MS鉴定率无显著性差异(χ^2=0.467,P=0.792),但28℃培养温度下的鉴定率高于35℃培养温度(χ^2=7.195,P=0.027);培养第2、3天种水平(40.3%和34.3%)和属水平(44.8%和46.3%)鉴定率均较高;将MALDI-TOF MS种水平判定COV由>2.0下调至>1.7后,受试菌株种水平判定率显著提升(85.9%比32.1%,χ^2=40.119,P<0.01)且不增加错误鉴定率。结论丝状真菌以SDA或PDA培养基28℃培养2~3 d,并以分值>1.7作为种水平判定COV,可有效提高MALDI-TOF MS对丝状真菌的鉴定能力。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 丝状真菌 鉴定 影响因素
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生鲜乳中单核细胞增生李斯特菌3种检测方法的比对 认领
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作者 陆东锋 李金磊 +5 位作者 高延玲 方忠意 董鹏 狄元冉 李红婵 吴志明 《中国动物检疫》 CAS 2020年第2期94-98,共5页
为确定生鲜乳中单核细胞增生李斯特菌的快速检测方法,以从河南省奶站及奶牛养殖场抽取的267批生鲜乳为检测对象,分别采用传统培养法、PCR检测法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法进行检测,并以传统培养法为参考标准,对检测结果进行... 为确定生鲜乳中单核细胞增生李斯特菌的快速检测方法,以从河南省奶站及奶牛养殖场抽取的267批生鲜乳为检测对象,分别采用传统培养法、PCR检测法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法进行检测,并以传统培养法为参考标准,对检测结果进行比对确认。结果显示:常规的传统培养法检出阳性3份;PCR法检出阳性5份,经传统培养法确认阳性3份,符合率为60%;基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法检出阳性3份,经传统培养法全部确认为阳性,符合率为100%。结果表明,同传统培养法相比,PCR法容易产生假阳性结果,而基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法能够快速、准确检测生鲜乳中单核细胞增生李斯特菌,适合于大批量样品的快速检测。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特氏菌 生鲜乳 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 PCR检测 分离鉴定
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梅里埃MALDI-TOF-MS系统与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性分析 认领 被引量:1
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作者 周淑燕 柳丽娟 +3 位作者 卓传尚 吴绍贵 李圣聪 冯惠娟 《现代检验医学杂志》 CAS 2020年第2期92-96,共5页
目的分析梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time offlight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性。方法收集福... 目的分析梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time offlight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性。方法收集福建医科大学孟超肝胆医院2018年6月~2019年3月来自临床不同标本分离的非重复菌株300株,分别采用梅里埃MALDI-TOF-MS系统和VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪对病原菌进行鉴定,结果不一致菌株采用16SrDNA基因测序予以确认,比较两种鉴定方法的准确性与一致性,评估两种方法在鉴定16株大肠埃希菌的时间和经济成本。结果 300株临床分离菌中,鉴定到种水平的菌株MALDI-TOF-MS有268株(89.33%),VITEK 2 Compact有266株(88.67%);鉴定到属水平的菌株MALDI-TOF-MS有297株(99.00%),VITEK 2 Compact有297株(99.00%);两种方法在种属鉴定的一致性分别为82.67%与98.33%,MALDI-TOF-MS的准确性略高于VITEK 2 Compact。两种方法鉴定不一致菌株有39株(13.00%),与16SrDNA测序鉴定结果相比,MALDI-TOF MS的准确率(79.49%)高于VITEK 2Compact(58.97%)。对16株大肠埃希菌的鉴定,MALDI-TOF-MS耗时较VITEK 2 Compact少3.5h,且成本仅为VITEK2 Compact的2/5。结论 MALDI-TOF MS与VITEK 2 Compact对于临床常见病原菌的鉴定结果较为一致,但MALDITOF MS准确率更高,且更快速与经济。 展开更多
关键词 病原菌鉴定 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 VITEK 2 COMPACT
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不同基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统对链球菌鉴定性能的比较 认领
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作者 胡靓 张旻 +1 位作者 刘冬梅 吴文娟 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第4期393-397,402共6页
目的了解基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对链球菌属临床菌株的鉴定能力。方法收集2015-2019年同济大学附属东方医院临床分离的链球菌,16SrRNA基因测序确定细菌种类。采用直接涂抹法平行使用Autof MS1000型质谱仪、VITE... 目的了解基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对链球菌属临床菌株的鉴定能力。方法收集2015-2019年同济大学附属东方医院临床分离的链球菌,16SrRNA基因测序确定细菌种类。采用直接涂抹法平行使用Autof MS1000型质谱仪、VITEK MS质谱鉴定系统及Bruker Biotyper系统对菌株进行质谱鉴定。结果134株链球菌属细菌中,3套质谱鉴定系统对无乳链球菌、化脓链球菌、解没食子酸链球菌、戈登链球菌及变异链球菌的准确鉴定率均为100%。Bruker Biotyper和Autof MS1000型质谱仪对21株停乳链球菌及14株星座链球菌未能鉴定到亚种,5株缓症链球菌鉴定为口腔链球菌,肺炎链球菌和咽峡炎链球菌各有1株鉴定错误;Autof MS1000型质谱仪鉴定链球菌种水平置信度高于Bruker Biotyper系统。VITEK MS质谱鉴定系统可鉴定停乳链球菌的部分亚种,但14株星座链球菌未能鉴定到亚种,7株缓症链球菌鉴定为缓症链球菌/口腔链球菌,2株咽峡炎链球菌分别鉴定为星座链球菌和肺炎链球菌。结论3套质谱鉴定系统对链球菌属中临床常见的无乳链球菌、化脓链球菌可准确鉴定、直接报告,但是对一些种类菌株鉴定结果有误或不能鉴别亚种,需要DNA序列分析或结合血清学或其他补充实验来准确鉴定。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 链球菌 16S RRNA
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应用MALDI-TOF MS快速鉴定骨折术后人型支原体血流感染1例报道 认领
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作者 段雪红 朱超 +1 位作者 范宁 袁亚迎 《检验医学与临床》 CAS 2020年第16期2429-2431,共3页
人型支原体(Mh)主要寄居于生殖道,21%~53%性成熟女性子宫颈或阴道内可分离出Mh,男性尿道携带率低[1]。主要通过性接触引起泌尿生殖道感染,本文介绍VITEK? MS全自动快速微生物质谱检测系统(简称VITEK? MS质谱仪)应用基质辅助激光解吸电... 人型支原体(Mh)主要寄居于生殖道,21%~53%性成熟女性子宫颈或阴道内可分离出Mh,男性尿道携带率低[1]。主要通过性接触引起泌尿生殖道感染,本文介绍VITEK? MS全自动快速微生物质谱检测系统(简称VITEK? MS质谱仪)应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速鉴定1例男性患者骨折术后Mh血流感染,现报道如下。 展开更多
关键词 人型支原体 骨折 血流感染 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
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MALDI-TOF-MS检测哈维弧菌前处理条件的探索及聚类分析 认领 被引量:1
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作者 武静 陈英剑 +1 位作者 李继霞 胡成进 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第1期14-17,共4页
目的 对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)检测哈维弧菌的前处理条件进行优化,并通过聚类分析初步探讨质谱对哈维弧菌溯源性的价值。方法 本研究首先利用rpoB测序对33株哈维弧菌进行确证,然后利用MALDI-TOF-MS采集哈维弧... 目的 对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)检测哈维弧菌的前处理条件进行优化,并通过聚类分析初步探讨质谱对哈维弧菌溯源性的价值。方法 本研究首先利用rpoB测序对33株哈维弧菌进行确证,然后利用MALDI-TOF-MS采集哈维弧菌蛋白指纹图谱。并通过培养基的选择、培养时间及样本处理方法对检验前操作程序进行优化。最后,利用MALDI-TOF-MS对33株哈维弧菌进行聚类分析,探讨质谱对细菌溯源性的价值。结果 本研究所用3种培养基的选择对哈维弧菌的鉴定结果差异无统计学意义(P>0.05)。培养时间18、24h哈维弧菌的鉴定结果优于48h的鉴定结果,差异有统计学意义(P<0.05)。但培养18、24h之间鉴定结果差异无统计学意义(P>0.05)。甲酸提取法的效果明显优于直接涂抹法,差异有统计学意义(P<0.05)。基于MALDI-TOF-MS法的聚类分析,能哈维弧菌病感染病原体的溯源提供理论依据。结论 MALDI-TOF-MS法操作简单、快速,可实现对哈维弧菌的准确鉴定和溯源性分析,在海洋渔业和海水养殖业将会发挥重要作用。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 哈维弧菌 快速检测 rpoB分析 聚类分析
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