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鸭瘟病毒TaqMan实时荧光定量PCR方法的建立 预览
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作者 万春和 刘荣昌 +6 位作者 陈翠腾 程龙飞 施少华 傅光华 陈红梅 傅秋玲 黄瑜 《福建农林大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2018年第6期722-728,共7页
根据鸭瘟病毒(DEV)gE基因的特征,设计特异性引物和探针,经条件优化后,建立检测DEV的TaqMan实时荧光定量PCR方法.结果表明:当gE基因含量为1.0×10^1-1.0×10^6拷贝·μL^-1时,建立的实时荧光定量PCR检测方法有良好的线性... 根据鸭瘟病毒(DEV)gE基因的特征,设计特异性引物和探针,经条件优化后,建立检测DEV的TaqMan实时荧光定量PCR方法.结果表明:当gE基因含量为1.0×10^1-1.0×10^6拷贝·μL^-1时,建立的实时荧光定量PCR检测方法有良好的线性扩增,其标准曲线方程为:y=-3.480x+37.955,扩增相关系数为0.999,敏感性强,最低检测限为10拷贝·μL^-1,特异性好,仅对DEV强毒株和弱毒活疫苗株检测到阳性扩增信号,对鸭源其他传染病病原(番鸭细小病毒、鹅细小病毒、鸭腺病毒A型、鸭甲肝病毒1型、鸭甲肝病毒3型、番鸭呼肠孤病毒、新型鸭呼肠孤病毒、H9N2亚型禽流感病毒、禽1型副粘病毒、鸭源大肠杆菌、鸭疫里默氏杆菌、鸭源禽多杀性巴氏杆菌)检测均为阴性,重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.62%-1.14%和0.69%-2.40%.对临床送检疑似DEV感染的14份样品进行检测,并与常规PCR方法、病毒分离鉴定进行比较,阳性率分别为85.71%(12/14)、71.43%(10/14)和57.14%(8/14),且与常规PCR方法、病毒分离鉴定的阳性符合率均为100%.本试验建立的TaqMan实时荧光定量PCR方法,可用于开发DEV快速诊断试剂盒,用于开展DEV流行病学调查. 展开更多
关键词 鸭瘟病毒 GE基因 TAQMAN探针 实时荧光定量PCR方法
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鸭腺病毒A型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立 预览 被引量:1
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作者 万春和 刘荣昌 +5 位作者 程龙飞 施少华 傅光华 陈红梅 傅秋玲 黄瑜 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第5期1341-1348,共8页
试验旨在建立鸭腺病毒A型(duck adenovirus A,DAdV-A)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。根据DAdV-A Hexon基因序列设计特异性引物和探针,建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、灵敏性、重复性进行检测... 试验旨在建立鸭腺病毒A型(duck adenovirus A,DAdV-A)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。根据DAdV-A Hexon基因序列设计特异性引物和探针,建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、灵敏性、重复性进行检测,用建立的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法和常规PCR方法同时对福建地区临床收集的85份番鸭源病料进行DAdV-A感染的检测,比较其符合率。结果表明,试验成功建立了检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,其扩增相关系数为0.996,扩增效率为99.9%;特异性强,对鸭常见病原(如鸭瘟病毒、鹅细小病毒、番鸭细小病毒、鸭圆环病毒、鸭源大肠杆菌、鸭疫里默氏杆菌和鸭源禽多杀性巴氏杆菌)检测均为阴性;灵敏度高,最低检测限为8.37拷贝/μL;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.54%~1.28%和0.61%~2.39%。对临床送检的85份病料,TaqMan实时荧光定量PCR方法的阳性率为7.06%(6/85),PCR方法的阳性率为5.88%(5/85),且PCR检测的阳性样品经TaqMan实时荧光定量PCR方法检测均为阳性,符合率为100%。本研究建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,为鸭群中开展DAdV-A的分子流行病学研究提供了有效技术手段。 展开更多
关键词 鸭腺病毒A型 Hexon基因 TAQMAN探针 实时荧光定量PCR方法
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鸭肠炎病毒疫苗株EvaGreen实时荧光定量PCR方法的建立 预览
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作者 万春和 刘荣昌 +5 位作者 程龙飞 傅光华 施少华 陈红梅 傅秋玲 黄瑜 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期1558-1566,共9页
鸭肠炎病毒(duck enteritis virus,DEV)疫苗株自1960年以来一直被用于防控DEV感染,该疫苗安全稳定、生产技术成熟、可快速诱导机体体液免疫和细胞免疫。DEV的基因组庞大,复制非必需区多,可容纳多个外源基因的插入,被广泛用来作为基因... 鸭肠炎病毒(duck enteritis virus,DEV)疫苗株自1960年以来一直被用于防控DEV感染,该疫苗安全稳定、生产技术成熟、可快速诱导机体体液免疫和细胞免疫。DEV的基因组庞大,复制非必需区多,可容纳多个外源基因的插入,被广泛用来作为基因工程载体来开发疫苗。当前,尚未见仅针对DEV疫苗株的实时荧光定量PCR检测方法相关研究报道。本研究通过分析DEV疫苗株和强毒株UL2基因特点,明确DEV疫苗株在UL2基因上存在528bp连续核苷酸缺失,设计针对该差异的实时荧光定量PCR引物,建立了EvaGreen实时荧光定量PCR检测DEV疫苗株的方法。结果表明,建立的检测DEV疫苗株实时荧光定量检测方法,当UL2基因含量为5.25×10^1~5.25×10^6拷贝·μL^-1时有良好的线性扩增,其标准曲线方程Y轴截距为34.95,斜率为-3.218,扩增相关系数为0.999,扩增效率为100%;敏感性强,最低检测限为52.5拷贝·μL^-1;特异性好,对DEV疫苗株扩增产物的熔解曲线分析,仅出现1个单特异峰值[Tm=(90.62±0.28)℃],无引物二聚体,对其他鸭源传染病病原(如鸭肠炎病毒强毒、番鸭细小病毒、鸭圆环病毒、番鸭源鹅细小病毒、新型基因重组型鸭细小病毒、鸭腺病毒A型、鸭源鹅多瘤病毒、鸭源大肠杆菌、鸭疫里默菌和鸭源禽多杀性巴氏杆菌)检测均为阴性;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.55%~1.72%和0.92%~2.49%。本研究建立了DEV疫苗株实时荧光定量检测方法,为评价DEV活载体基因工程疫苗免疫防控机制提供参考。 展开更多
关键词 鸭肠炎病毒 疫苗株 UL2基因 EvaGreen 实时荧光定量PCR方法
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猪细环病毒k2型SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR方法的建立 预览 被引量:1
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作者 陈如敬 黄秋宇 +4 位作者 修金生 吴学敏 严山 车勇良 周伦江 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2016年第5期10-15,共6页
为建立检测猪细环病毒k2型(Porcine Torque teno sus virus k2,PTTSu Vk2)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,本研究根据PTTSu Vk2 ORF2基因序列特征设计引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PTTSu Vk2的实时荧光定量PCR方法,该方法在PTTSu V... 为建立检测猪细环病毒k2型(Porcine Torque teno sus virus k2,PTTSu Vk2)SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,本研究根据PTTSu Vk2 ORF2基因序列特征设计引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PTTSu Vk2的实时荧光定量PCR方法,该方法在PTTSu Vk2 ORF2基因含量为1.92×102~1.92×107 copies/μL反应范围内有很好的线性关系。扩增产物溶解曲线分析仅出现单一特异峰,无引物二聚体,Tm值为(83.83±0.08)℃,对猪圆环病毒(Porcine circovirus type 1 and type 2,PCV1和PCV2)、猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)、猪博卡病毒5型(Porcine bovavirus type 5,Pbo V5)、猪细环病毒1a型(PTTSu V 1a)和1b型(PTTSu V 1b)核酸均无阳性信号扩增,可重复性好,组内变异系数为0.39%~1.69%,组间变异系数0.69%~2.19%。本方法的建立可用于定量分析PTTSu Vk2感染噬性组织器官和感染程度,为PTTSu Vk2的流行病学研究及临床诊断等提供了一种可靠的方法。 展开更多
关键词 猪细环病毒k2型 ORF2基因 SYBR Green 实时荧光定量PCR方法
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禽坦布苏病毒TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立 预览 被引量:3
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作者 万春和 陈翠腾 +5 位作者 傅秋玲 程龙飞 傅光华 陈红梅 施少华 黄瑜 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2016年第8期49-54,共6页
【目的】建立禽坦布苏病毒(Avian Tembusu virus,ATmV)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。【方法】根据ATmV非结构蛋白NS1的基因特征,设计特异性的引物和探针,建立基于TaqMan探针检测ATmV的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、重复性... 【目的】建立禽坦布苏病毒(Avian Tembusu virus,ATmV)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。【方法】根据ATmV非结构蛋白NS1的基因特征,设计特异性的引物和探针,建立基于TaqMan探针检测ATmV的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、重复性进行检测。用建立的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法和之前建立的RT-PCR方法同时对临床15份疑似ATmV感染的病料进行检测,计算其符合率。【结果】成功建立了检测ATmV的实时荧光定量PCR检测方法,当NS1基因含量为(2.67×10^2)-(2.67×10^7)拷贝/μL时有良好的线性扩增,其扩增相关系数为0.998,扩增效率为99.9%。建立的ATmV实时荧光定量PCR检测方法敏感度高,最低检测限为2.67×10^2拷贝/μL;特异性强,对水禽常见病毒(如Ⅰ型鸭肝炎病毒、新型鸭呼肠孤病毒、禽流感病毒、禽Ⅰ型副粘病毒与番鸭细小病毒等)检测均为阴性;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.39%-1.17%和0.51%-1.82%。对临床送检的15份病料,TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的阳性率为73.33%(11/15),RTPCR方法的阳性率为60.0%(9/15),2种方法的符合率为100.0%。【结论】建立了基于TaqMan探针的ATmV实时荧光定量PCR检测方法,该方法可应用于ATmV感染的早期检测。 展开更多
关键词 禽坦布苏病毒 NS1基因 TAQMAN 实时荧光定量PCR方法
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大鼠游泳运动后骨骼肌PGC-1α mRNA表达的时相性变化 预览 被引量:4
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作者 赵婷婷 丁树哲 《上海体育学院学报》 CSSCI 北大核心 2006年第3期 41-44,共4页
采用实验法。检测一次长时游泳运动对大鼠骨骼肌PGC—1α mRNA表达水平的影响。以及运动后骨骼肌PGC-1α mRNA表达的时相性变化规律。将SD雄性大鼠随机分为对照组、运动后3h组、运动后6h组、12h组、18h组和24h组、运动4d后18h蛆。采用SY... 采用实验法。检测一次长时游泳运动对大鼠骨骼肌PGC—1α mRNA表达水平的影响。以及运动后骨骼肌PGC-1α mRNA表达的时相性变化规律。将SD雄性大鼠随机分为对照组、运动后3h组、运动后6h组、12h组、18h组和24h组、运动4d后18h蛆。采用SYBRGreenⅠ逆转录实时荧光定量PCR方法,测定备组失鼠骨骼肌PGC-1αmRNA表达水平。姑果;PGC-1α基因在运动后6h组、运动4d后18h组的表达水平高于对照组厦其他组。结论:PGC-1α mRNA在游泳运动后表达的改变是有时相性的;游泳运动可以刺激骨骼肌线粒体生物发生相关因子的表达,从而调节线粒体的功能。 展开更多
关键词 大鼠 游泳运动 骨骼肌 PGC-1αmRNA表达 时相性变化 实时荧光定量PCR方法 线粒体
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实时荧光定量PCR方法检测人癌组织中RFP蛋白的表达 预览
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作者 张静敏 金宁一 +4 位作者 连海 管国芳 李宵 安汝国 高桥雅英 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2005年第6期 520-522,共3页
目的检测RFP(Ret finger protein)蛋白在人正常组织及人癌组织中的分布.方法采用实时荧光定量PCR方法,以18SrRNA为内对照,检测RFP在人正常组织及人癌组织中的表达水平.结果 RFP表达水平子宫颈鳞状细胞癌组织高于正常子宫颈组织,子宫内... 目的检测RFP(Ret finger protein)蛋白在人正常组织及人癌组织中的分布.方法采用实时荧光定量PCR方法,以18SrRNA为内对照,检测RFP在人正常组织及人癌组织中的表达水平.结果 RFP表达水平子宫颈鳞状细胞癌组织高于正常子宫颈组织,子宫内膜腺癌组织高于正常子宫内膜组织,胃腺癌组织高于正常胃组织,食管鳞状细胞癌组织高于正常食管组织,而子宫内膜腺癌组织高于子宫颈鳞状细胞癌组织,胃腺癌组织高于食管鳞状细胞癌组织,脑癌组织高于正常脑组织.结论RFP可能成为治疗恶性肿瘤的一个潜在的分子靶点. 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR方法 含量检测 人癌组织 RFP蛋白 基因表达
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鹅多瘤病毒VP1基因的克隆及EvaGreen实时荧光定量PCR方法的建立
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作者 万春和 刘荣昌 +6 位作者 程龙飞 施少华 傅光华 陈红梅 傅秋玲 陈翠腾 黄瑜 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2289-2295,共7页
针对鹅多瘤病毒(goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)VP1基因核苷酸序列设计并合成1对特异性引物,从1株樱桃谷鸭源GHPV(命名为FJ201601株)扩增获得VP1基因核苷酸序列全长,并进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其VP1基因分子特... 针对鹅多瘤病毒(goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)VP1基因核苷酸序列设计并合成1对特异性引物,从1株樱桃谷鸭源GHPV(命名为FJ201601株)扩增获得VP1基因核苷酸序列全长,并进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其VP1基因分子特征。基于GHPV各分离株VP1基因特点,设计特异性的实时荧光定量PCR引物,建立基于EvaGreen实时荧光定量PCR检测GHPV方法。结果显示,克隆的FJ201601株VP1基因全长为1 062bp,与GHPV各参考分离株核苷酸同源性为99.7%~100.0%;在遗传进化上可将GHPV分为2个大的遗传进化分支(Clade 1和Clade 2),FJ201601株属于Clade 2分支。建立的EvaGreen检测GHPV实时荧光定量PCR检测方法,其标准曲线方程y轴截距为39.12,斜率为-3.489,扩增相关系数为0.996,扩增效率为99.7%;敏感性强,最低检测限为88.0拷贝/μL;特异性好,扩增产物的溶解曲线分析只出现单一的特异峰,Tm值为(82.18±0.22)℃,无引物二聚体,对水禽常见病原检测均为阴性;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.62%~1.76%和0.92%~2.44%。用建立的检测方法对80份多品种生长不良鸭进行检测发现4份阳性(樱桃谷鸭2份、麻鸭2份),阳性率为5%(4/80)。本研究证实麻鸭中存在GHPV感染,为丰富GHPV感染宿主谱和开展GHPV感染流行病学调查和致病机理研究提供检测手段。 展开更多
关键词 鹅多瘤病毒 VP1基因 EvaGreen实时荧光定量PCR方法 樱桃谷鸭 麻鸭
入境旅客携带苹果中粉红聚端孢菌的检测与鉴定 预览
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作者 许萍萍 粟寒 +4 位作者 王振华 刘中慧 李甜甜 李彬 吴翠萍 《湖北农业科学》 2018年第2期67-72,共6页
首次建立了粉红聚端孢菌(Trichothecium roseum)实时荧光定量PCR检测方法,该检测方法扩增效率高、特异性好,灵敏度可达0.1 pg菌丝体DNA量;结合形态学观察及致病性测定,对从机场入境旅客携带的苹果中分离到的1株疑似菌株Tr-1685进行检... 首次建立了粉红聚端孢菌(Trichothecium roseum)实时荧光定量PCR检测方法,该检测方法扩增效率高、特异性好,灵敏度可达0.1 pg菌丝体DNA量;结合形态学观察及致病性测定,对从机场入境旅客携带的苹果中分离到的1株疑似菌株Tr-1685进行检测和鉴定。Tr-1685实时荧光PCR检测结果为阳性。该菌株在PDA培养基上生长较快,菌落平展,边缘不规则,表面形成淡粉红色的霉层,产孢量丰富。分生孢子梗直立,长短不一,顶端着生分生孢子。分生孢子双细胞、光滑、棍棒状,平均大小为17.5μm×8.7μm,基部细胞弯曲状。该病原菌接种苹果4 d后,出现褐色腐烂,8 d后出现淡粉色霉层及分生孢子。分离获得的菌株Tr-1685鉴定为粉红聚端孢菌,与实时荧光PCR结果一致。 展开更多
关键词 粉红聚端孢菌(Trichothecium roseum) 入境旅客 苹果 鉴定 实时荧光定量PCR检测方法
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牛副流感病毒3型实时荧光定量PCR检测方法的建立及在牛源样本检测中的应用
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作者 王吉 付瑞 +7 位作者 李晓波 王淑菁 王莎莎 李威 秦骁 巩薇 岳秉飞 贺争鸣 《中国病毒病杂志》 CAS 2018年第5期393-399,共7页
目的建立用于牛源性样本牛副流感病毒3型(BPIV3)实时荧光定量PCR (Q-PCR)快速检测方法。方法选择已发表的BPIV3 HN基因高度保守区域作为靶基因,设计合成引物和探针,建立BPIV3Q-PCR方法。并对方法的线性、特异性、敏感性、重复性、... 目的建立用于牛源性样本牛副流感病毒3型(BPIV3)实时荧光定量PCR (Q-PCR)快速检测方法。方法选择已发表的BPIV3 HN基因高度保守区域作为靶基因,设计合成引物和探针,建立BPIV3Q-PCR方法。并对方法的线性、特异性、敏感性、重复性、稳定性等进行方法学评价。同时用建立的Q-PCR方法检测105批次牛源性样本。结果建立的BPIV3Q-PCR方法线性范围为1×10^1拷贝/μl-1×108拷贝/μl;与牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛鼻气管炎病毒(BHV-1)、仙台病毒(SV)均无交叉反应;检测敏感度可以达到1.0×10^1拷贝/μl;3个不同浓度梯度标准品3次不同实验平均变异系数均小于5%。应用建立的方法检测105批次牛源性样本,BPIV3核酸阳性率为12.4%。结论建立的BPIV3QPCR检测方法线性关系良好,具有快速、特异、敏感及稳定的特点,可用于牛源性样本BPIV3的快速定量检测。 展开更多
关键词 牛副流感病毒3型(BPIV3) 实时荧光定量PCR检测方法 牛源性样本
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