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玉米扩展蛋白Expansin基因家族定位及基因表达模式分析 预览
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作者 姜志磊 周琳 +1 位作者 武奉慈 宋新元 《生物技术进展》 2018年第1期34-40,F0003共8页
扩展蛋白(Expansin)是一类能够使植物细胞壁松弛的活性蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。利用PLAZA、NCBI、Maize GDB、Uniprot、PLEXdb等基因组数据库,获得玉米Expansin家族的基因序列、染色体基因座位、蛋白质序列以及长度,... 扩展蛋白(Expansin)是一类能够使植物细胞壁松弛的活性蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。利用PLAZA、NCBI、Maize GDB、Uniprot、PLEXdb等基因组数据库,获得玉米Expansin家族的基因序列、染色体基因座位、蛋白质序列以及长度,构建玉米Expansin基因家族系统进化树,进行基因组织表达谱的分析。结果表明,玉米基因组中含有93个Expansin基因,分布于玉米的9条染色体上;多数Expansin具有250~300个氨基酸;玉米Expansin基因家族有40个Expansin A(EXPA)、47个Expansin B(EXPB)、6个Expansin-like A(EXLA),未发现Expansin-like B(EXLB);44个玉米Expansin基因在不同玉米组织中特异表达。该研究结果不仅为玉米扩展蛋白的深入研究奠定了基础,而且为其他研究人员对基因信息的获取提供了参考。 展开更多
关键词 玉米 扩展蛋白 生物信息学
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扩展蛋白在纤维素降解中作用的研究进展
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作者 由林鹭(综述) 张贺朋(综述) +1 位作者 李宪臻(审校) 李蓉(审校) 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2018年第12期1409-1411,1416共4页
扩展蛋白(expansins)又称为膨胀素,是来源于植物界普遍存在的一类可以使植物细胞壁松动的蛋白。当其作用于纤维素时,可以破坏纤维素链间氢键而使纤维素以非溶解方式(形态发生)降解,因而其在生物燃料生产的纤维素生物质转化中具有重要的... 扩展蛋白(expansins)又称为膨胀素,是来源于植物界普遍存在的一类可以使植物细胞壁松动的蛋白。当其作用于纤维素时,可以破坏纤维素链间氢键而使纤维素以非溶解方式(形态发生)降解,因而其在生物燃料生产的纤维素生物质转化中具有重要的潜在应用价值。本文对扩展蛋白的来源及分类,其结构与纤维素降解功能关系及其促纤维素降解作用的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 扩展蛋白 纤维素 降解 协同作用
番木瓜果实软化相关CpEXPA2基因的克隆与表达分析 预览
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作者 赵湾湾 冯力 +7 位作者 胡绍彬 代亚兰 李春侠 赵秋月 郑小华 吴迪 王平 申艳红 《果树学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期785-793,共9页
【目的】克隆一个与番木瓜果实软化相关的扩展蛋白基因,分析其功能,明确其在不同组织器官和不同成熟时期果实的表达模式。【方法】基于对番木瓜果实转录组学的研究,筛选并克隆了一个与果实软化相关的扩展蛋白基因Cp EXPA2。采用同源序... 【目的】克隆一个与番木瓜果实软化相关的扩展蛋白基因,分析其功能,明确其在不同组织器官和不同成熟时期果实的表达模式。【方法】基于对番木瓜果实转录组学的研究,筛选并克隆了一个与果实软化相关的扩展蛋白基因Cp EXPA2。采用同源序列对比和系统进化树分析对该基因进行序列分析;运用生物信息学的方法对该基因编码的蛋白进行结构分析;使用RT-q PCR方法分析Cp EXPA2基因在不同组织器官、不同成熟时期果实中的表达量;采用GY-4硬度计测定不同成熟时期番木瓜果实的硬度。【结果】Cp EXPA2基因的开放阅读框(ORF)为780 bp(Gene Bank登录号为MF662209),编码259个氨基酸。该基因编码的氨基酸序列具有典型的扩展蛋白保守结构:N端富含8个半胱氨酸、C端富含4个色氨酸和中间1个组氨酸功能域(His-Phe-Asp,HFD)。同源序列比对分析发现该扩展蛋白与山木瓜(ABF48653.1)、番茄(AAC64201.1)、草莓(AAF21101.1)、拟南芥(AAB38073.1)等扩展蛋白氨基酸序列有较高的同源性,分别为66.15%、64.86%、66.80%、65.00%。进化树分析表明,Cp EXPA2蛋白与拟南芥At EXPA6(U30480)、At EXPA16(NM_115407)关系最近。Cp EXPA2在不同组织器官中的表达量依次为成熟果实〉叶〉花〉茎〉根;在不同发育时期的果实中,Cp EXPA2在果皮的表达量相对高于果肉,且随着果实成熟软化程度提高,其表达量也相应提高。番木瓜果实的硬度随着果实的成熟呈逐渐下降趋势,在破色期开始硬度急剧下降,果实迅速软化。【结论】Cp EXPA2基因的扩展蛋白家族高度保守,且该基因编码的蛋白与山木瓜、番茄、草莓、拟南芥等扩展蛋白的氨基酸序列有较高的同源性。系统进化树分析发现番木瓜Cp EXPA2与拟南芥At EXPA6和At EXPA16亲缘关系较近。Cp EXPA2受乙烯诱导,且与果实发育进程有关,因此推测该基因可能在番木瓜果实成� 展开更多
关键词 番木瓜 扩展蛋白 表达模式 果实成熟软化
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大豆孢囊线虫扩展蛋白新基因(Hg-exp-1、Hg-exp-2)的鉴定及功能分析 预览
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作者 张瀛东 孔详超 +4 位作者 黄文坤 孔令安 李红梅 彭焕 彭德良 《中国农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第17期3302-3314,共13页
【目的】大豆孢囊线虫(Heterodera glycines)是大豆上最重要的土传病原物之一,由孢囊线虫口针分泌的扩展蛋白(expansin)在线虫侵染过程中发挥了重要作用。本研究旨在鉴定大豆孢囊线虫扩展蛋白基因,并对其结构、组织定位和发育表达... 【目的】大豆孢囊线虫(Heterodera glycines)是大豆上最重要的土传病原物之一,由孢囊线虫口针分泌的扩展蛋白(expansin)在线虫侵染过程中发挥了重要作用。本研究旨在鉴定大豆孢囊线虫扩展蛋白基因,并对其结构、组织定位和发育表达特性进行研究,为进一步明确大豆孢囊线虫的寄生、致病机制打下基础。【方法】利用同源基因克隆技术,根据已报道的线虫expansin基因的保守序列设计上下游简并引物,从大豆孢囊线虫2龄幼虫cNDA中克隆expansin基因的EST片段,根据EST片段序列设计RACE特异性引物,通过RACE技术扩增测序后采用DNAstar 7.1和DNAman软件对序列进行比对和拼接,得到大豆孢囊线虫expansin基因c DNA全长;采用CLC sequence viewer 6进行开放阅读框查找、蛋白质翻译和序列比对;使用EBI在线软件Signal P 3.0 Server和TMHMM软件进行预测蛋白质前体信号肽和跨膜结构域预测,GSDS在线软件进行基因组结构分析;使用PHYML软件和MEGA5.0软件最大似然法对获得的基因与其他线虫expansin基因进行比对与系统进化树构建;采用Southern杂交技术分析Hg-exp-1在大豆孢囊线虫基因组中的拷贝数;通过原位杂交技术确定2个expansin基因的表达部位;提取卵、侵染前2龄幼虫、侵染后2龄幼虫、3龄幼虫、4龄幼虫与白雌虫的c DNA作为模板,通过半定量PCR技术分析expansin基因在线虫不同龄期的发育表达特性;根据Hg-exp-1基因序列设计引物扩增并合成dsRNA,对大豆孢囊线虫2龄幼虫浸泡处理24 h后接种大豆植株,分析Hg-exp-1 RNA干扰后对线虫侵染的影响。【结果】从大豆孢囊线虫2龄幼虫中成功克隆出2个扩展蛋白基因全序列,命名为Hg-exp-1和Hg-exp-2,长度分别为1 047和1 037 bp,分别编码长度为288和295个氨基酸的多肽,2个预测蛋白N端均含有信号肽,无跨膜结构域,表明其为分泌型蛋白。序列比对发现大豆孢囊线虫HG-EXP-1序列与马 展开更多
关键词 大豆孢囊线虫 扩展蛋白 发育表达 RNA干扰
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马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析 预览
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作者 理向阳 代丹丹 +1 位作者 杨铁钢 郝西 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期37-44,共8页
为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃... 为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度为194-488 aa,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明,马铃薯扩展蛋白家族有23个基因(69.7%)含有2-3个内含子。基因表达分析发现,该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实及块茎发育过程中表达丰度较高,并且其表达受到高温、盐、激素及病害等逆境的调控。 展开更多
关键词 马铃薯 扩展蛋白 生物信息学 基因家族
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桂花扩展蛋白基因家族的鉴定和表达分析 被引量:2
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作者 罗云 张超 +3 位作者 付建新 董彬 胡绍庆 赵宏波 《农业生物技术学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1289-1299,共11页
扩展蛋白(expansin,EXP)是一类引起植物细胞壁松弛的蛋白质,在花开放过程花瓣细胞扩展中发挥重要作用。为了探究桂花(Osmanthusfragrans)中扩展蛋白基因在花开放中的表达特征,本研究从己构建的桂花品种‘堰虹桂’花芽转录组数据... 扩展蛋白(expansin,EXP)是一类引起植物细胞壁松弛的蛋白质,在花开放过程花瓣细胞扩展中发挥重要作用。为了探究桂花(Osmanthusfragrans)中扩展蛋白基因在花开放中的表达特征,本研究从己构建的桂花品种‘堰虹桂’花芽转录组数据库中筛选得到12个与植物EXP基因同源性较高的Unigene序列,以盛开期花瓣为材料克隆得到其cDNA序列。通过NCBI数据库中的比对结果,将12个Unigene序列分别命名为OfEXPA1-OfEXPA8,OfEXPB1~OfEXPB2,OfEXLA1,OfEXLB1(GenBank登录号:KY968700~KY968711)。BLASTX查找比对结合ORFFinder工具分析发现,除了OfEXPA1、OfEXPA5和OfEXLBJ基因的cDNA序列5’端有少量缺失外,另外9个EXP基因具有cDNA全长序列。序列分析结果表明,9个全长cDNA推导的蛋白氨基酸残基数为240~274个,预测的分子量为26.06—29.7kD,理论等电点为4.77~9.74。桂花OfEXPA1~OfEXPA8和OfEXPBl-OfEXPB2蛋白具有典型的扩展蛋白结构特征,N端含有8个保守的半胱氨酸结构域,C端含有4个保守的色氨酸结构域,其中大部分EXPA和EXPB蛋白含有组氨酸功能域HFD基序序列。OfEXLA1具有特征基序CDQC,OfEXLB1特征基序尚未见报道。qRT-PCR分析结果发现桂花12个EXP基因在‘堰虹桂’花芽不同发育过程中均有表达,其中OfEXPA1、OfEXPA3、OfEXPA5、OfEXPA6、OfEXPA7、OfEXPA8、OfEXPBi、OfEXPB2和OfEXLB1整体表达模式较为类似,花芽发育前期(B1~B6)表达量显著高于花瓣扩展期(B7~FF),在花瓣扩展期表达量逐渐下降;而OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1在花芽发育前期表达量较低,而随着花瓣显著伸展表达量急剧增加,在花瓣扩展期呈现较高的表达。结合系统进化树分析发现OfEXPA4和OfEXPA2分别与唐菖蒲(Gladiolus grandifLORUS)GgEXPA1和月季Rosa chinensis)RhEXPA1亲缘关系较近,且OfEXPA2和OfEXPA4这两个基因与GgEXPA1和RhEXPA1基因的表达模式相似� 展开更多
关键词 桂花 扩展蛋白 花开放 表达分析
雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族的鉴定和特征分析 预览 被引量:2
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作者 雷忠萍 贺道华 +3 位作者 海江波 邢宏宜 赵俊兴 程雪妮 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第6期44-55,共12页
扩展蛋白具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的功能。为了弄清该基因家族在雷蒙德氏棉中的特征,利用隐马尔科夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉基因组中进行扩展蛋白家族基因成员的鉴定,获得了39个扩展蛋白基因家族成员,分布在12条染色体上。系... 扩展蛋白具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的功能。为了弄清该基因家族在雷蒙德氏棉中的特征,利用隐马尔科夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉基因组中进行扩展蛋白家族基因成员的鉴定,获得了39个扩展蛋白基因家族成员,分布在12条染色体上。系统发育分析将其归入EXPA、EXPB、EXLA和EXLB共4个亚家族,分别含有26,4,3,6个基因。各亚家族中扩展蛋白基因具有相对多样化的基因结构;扩展蛋白基因家族在进化中经历了3次扩张;染色体片段重复是该基因家族扩张的主要方式;扩张后纯化选择占主导地位。比较棉纤维发育不同时期及叶片、花瓣的深度测序和基因芯片表达谱,发现大部分扩展蛋白基因参与了雷蒙德氏棉纤维、叶片和花瓣的生长发育,在不同的时空范围均表现出表达多样性。Gr EXLA1、Gr EXLA2和Gr EXPA16在花瓣中优势表达,Gr EXPA23和Gr EXPA24在叶片中表达水平较高,推测这些基因的表达分别参与了花瓣和叶片的发育进程;其余的基因,在纤维的不同发育阶段,表现出不同的表达丰度。研究结果有助于了解棉属扩展蛋白基因家族的特征及功能,为深入剖析棉纤维发育过程中的分子调控机理提供了基础。 展开更多
关键词 雷蒙德氏棉 扩展蛋白 基因结构 系统发育分析 进化分析 表达模式
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扩展蛋白在果实成熟过程中的作用研究进展 预览 被引量:2
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作者 赵美荣 李永春 黄文婕 《赤峰学院学报:自然科学版》 2016年第11期11-13,共3页
扩展蛋白是一种调节细胞壁伸展和结构松弛的细胞壁蛋白,存在于各种植物的果实中,在果实成熟过程中发挥着重要作用.不同的扩展蛋白作用不同,其表达具有时空效应,有些扩展蛋白基因仅在果实膨大期表达,而有的扩展蛋白基因是果实软化特异的... 扩展蛋白是一种调节细胞壁伸展和结构松弛的细胞壁蛋白,存在于各种植物的果实中,在果实成熟过程中发挥着重要作用.不同的扩展蛋白作用不同,其表达具有时空效应,有些扩展蛋白基因仅在果实膨大期表达,而有的扩展蛋白基因是果实软化特异的.不同的扩展蛋白作用机制不同,这与其在果实成熟过程中的作用密切相关. 展开更多
关键词 扩展蛋白 果实 膨大 成熟
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响应葡萄根瘤蚜侵染的扩展蛋白基因筛选及其多克隆抗体的制备 被引量:4
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作者 季兴龙 韩宁 +1 位作者 翟衡 杜远鹏 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期15-24,共10页
以对葡萄根瘤蚜敏感的‘克瑞森无核’葡萄(Vitis vinifera ‘Crimson Seedless’)组培苗和抗性砧木‘1103P’组培苗为试材,通过荧光定量PCR技术从扩展蛋白基因家族中筛选到经根瘤蚜侵染后表达上调的扩展蛋白基因家族成员VvEXPA1。采用... 以对葡萄根瘤蚜敏感的‘克瑞森无核’葡萄(Vitis vinifera ‘Crimson Seedless’)组培苗和抗性砧木‘1103P’组培苗为试材,通过荧光定量PCR技术从扩展蛋白基因家族中筛选到经根瘤蚜侵染后表达上调的扩展蛋白基因家族成员VvEXPA1。采用RT-PCR方法克隆到VvEXPA1基因片段,连接至原核表达载体pET-32a中,转化大肠杆菌DE3菌株,测序确定构建的重组载体pET32a-VvEXPA1开放阅读框正确,并经IPTG诱导表达了融合蛋白。该蛋白以包涵体的形式存在,纯化后免疫新西兰兔,制备扩展蛋白多克隆抗体,通过Western-blot和ELISA检测抗体的特异性及效价。结果显示制备的抗体具有较高的特异性,ELISA显示效价为1:51 200。 展开更多
关键词 葡萄 根瘤蚜 扩展蛋白 VvEXPA1 多克隆抗体制备
谷子扩展蛋白与品种抗旱性关系的研究 预览 被引量:1
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作者 苏彦冰 马芳芳 +5 位作者 温思钰 刘锐 禾璐 刘龙龙 李红英 韩渊怀 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 2016年第10期685-690,756共7页
[目的]扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,普遍存在于植物中,除了具有增加细胞壁柔韧性的作用外,在植物的生长发育及抵御生物和非生物胁迫等方面都起着重要的作用。为发掘谷子抗旱基因。[方法]本文采用生物信息学手段结合表达验证,分... [目的]扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,普遍存在于植物中,除了具有增加细胞壁柔韧性的作用外,在植物的生长发育及抵御生物和非生物胁迫等方面都起着重要的作用。为发掘谷子抗旱基因。[方法]本文采用生物信息学手段结合表达验证,分析了谷子扩展蛋白基因家族中的16个成员。[结果]发现它们分属于EXPA、EXPB、EXPLA和EXPLB 4个亚家族;对谷子扩展蛋白基因进行启动子分析,发现了与干旱胁迫相关的响应元件,包括干旱响应MYB结合位点MBS、脱落酸响应元件ABRE等;通过对两个谷子品种勾勾母鸡咀(GG,耐干旱品种)和晋汾16(JF16,干旱敏感品种)扩展蛋白基因表达的分析比较,发现干旱胁迫下不同谷子品种中同一基因的表达水平存在显著差异。[结论]结合亲缘关系图及启动子顺式调控元件的预测结果,并未发现基因亲缘关系与扩展蛋白基因表达间的规律;也未发现胁迫相关的调控元件与扩展蛋白表达之间的关联,初步了解了扩展蛋白基因与谷子抗旱的关系,为发掘谷子抗旱基因提供基础。 展开更多
关键词 谷子 扩展蛋白 干旱胁迫 抗旱性
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白桦扩展蛋白基因的克隆分析及植物表达载体构建 预览 被引量:3
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作者 王子剑 孙丹 +2 位作者 于颖 张岩 王超 《西南林业大学学报》 CAS 北大核心 2016年第1期1-8,共8页
从白桦中分离了4条扩展蛋白家族基因全长eDNA序列和2条大于400 bp的部分eDNA序列,命名为BpEXPl~BpEXP5和BpEXPL,其中4个全长eDNA推导蛋白氨基酸残基数为186~258个,编码蛋白的分子量为20.07~27.80 kDa,理论等电点为5.57~9.2... 从白桦中分离了4条扩展蛋白家族基因全长eDNA序列和2条大于400 bp的部分eDNA序列,命名为BpEXPl~BpEXP5和BpEXPL,其中4个全长eDNA推导蛋白氨基酸残基数为186~258个,编码蛋白的分子量为20.07~27.80 kDa,理论等电点为5.57~9.20。氨基酸序列分析结果表明:5个alpha-expansin序列有共同的结构特征,即在N一末端有8个保守的半胱氨酸残基的丰富域,c-末端有4个保守的色氨酸残基的丰富域,中间有1个组氨酸功能域。利用Real time RT-PCR分析EXP家族基因在白桦不同器官和组织内的表达模式,结果表明:6个EXP基因在白桦的不同器官和组织中有着不同的表达水平,其中BpEXP!在分生木质部中表达量最高,推测其与木材形成过程的细胞壁修饰相关;BpEXP3在发育的蒴果中表达量最高,推测其与果实和种子发育过程中的细胞壁修饰相关。最后选择BpEXPl和BpEXPL基因,构建了pROK 11-BpEXPl和pROKⅡ-BpEXPL植物表达载体。 展开更多
关键词 白桦 扩展蛋白 序列分析 RealtimeRT-PCR 载体构建
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抗旱性不同的小麦扩展蛋白活性及基因表达分析 预览 被引量:4
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作者 赵美荣 李永春 +1 位作者 刘辉 秦海强 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第1期108-110,共3页
以5个抗旱性不同的小麦品种为试验材料,分析了干旱胁迫下小麦扩展蛋白活性与其抗旱性之间的相关性,同时检测了6个不同的扩展蛋白基因在干旱胁迫下的表达情况。结果表明,扩展蛋白活性与小麦抗旱性之间的相关性达98.7%,且基因Ta EXPA3的... 以5个抗旱性不同的小麦品种为试验材料,分析了干旱胁迫下小麦扩展蛋白活性与其抗旱性之间的相关性,同时检测了6个不同的扩展蛋白基因在干旱胁迫下的表达情况。结果表明,扩展蛋白活性与小麦抗旱性之间的相关性达98.7%,且基因Ta EXPA3的表达受干旱胁迫调节,与小麦抗旱性密切相关。 展开更多
关键词 小麦 扩展蛋白 活性 基因表达 抗旱性
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根毛的生长发育及其遗传基础 被引量:2
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作者 张德健 夏仁学 曹秀 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期9-20,共12页
根毛是根系特异化表皮细胞外伸形成的管状凸起物,是植物吸收矿质养分和水分的重要器官。根毛的发育可分为根毛细胞命运决定、根毛起始、根毛顶端生长和根毛成熟等阶段。本文对根毛发育生长过程中的细胞形态及其生理生化变化进行了综述,... 根毛是根系特异化表皮细胞外伸形成的管状凸起物,是植物吸收矿质养分和水分的重要器官。根毛的发育可分为根毛细胞命运决定、根毛起始、根毛顶端生长和根毛成熟等阶段。本文对根毛发育生长过程中的细胞形态及其生理生化变化进行了综述,并从根表皮细胞命运决定分子机理,EXPANSIN、b HLH和MYB等转录因子以及小G蛋白和生长素/乙烯等方面简要说明了根毛生长发育的遗传基础。 展开更多
关键词 根毛 发育 表皮细胞 扩展蛋白 转录因子 小G蛋白 生长素/乙烯
扩展蛋白与激素调控的生长发育
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作者 韩阳阳 王天晓 王玮 《生命的化学》 CAS CSCD 2015年第6期778-784,共7页
扩展蛋白是一类具有细胞壁松弛功能的蛋白质,它不仅能调节细胞壁的松弛和伸张,而且在调控植物的生长发育以及逆境响应过程中具有重要的作用。扩展蛋白作为激素调节因子能够对多种激素产生响应,从而调节植物的生长发育:扩展蛋白参与了... 扩展蛋白是一类具有细胞壁松弛功能的蛋白质,它不仅能调节细胞壁的松弛和伸张,而且在调控植物的生长发育以及逆境响应过程中具有重要的作用。扩展蛋白作为激素调节因子能够对多种激素产生响应,从而调节植物的生长发育:扩展蛋白参与了乙烯调节的植物生长发育过程;改变植物内源的生长素水平或用外源生长素进行处理同样影响扩展蛋白基因的表达;扩展蛋白可能参与赤霉素和脱落酸调节的生长发育和逆境响应过程;此外,施加外源的茉莉酸甲酯、油菜素内酯和细胞分裂素也会影响扩展蛋白基因的表达水平。本文综述了扩展蛋白在激素介导的植物生长发育方面的最新研究进展,以期为研究者更直观便捷的了解该方面现状提供依据。 展开更多
关键词 扩展蛋白 激素 细胞壁 生长发育
黄瓜扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:3
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作者 郝西 理向阳 +2 位作者 腊贵晓 代丹丹 杨铁钢 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期2280-2289,共10页
扩展蛋白(expansins)是植物细胞壁的重要组成部分,能够引起细胞壁组分间松驰和细胞壁柔韧性增加,在植物的许多生长发育过程中发挥作用。为了揭示黄瓜扩展蛋白基因家族的功能,本研究利用全基因组测序数据鉴定黄瓜扩展蛋白基因家族,分析... 扩展蛋白(expansins)是植物细胞壁的重要组成部分,能够引起细胞壁组分间松驰和细胞壁柔韧性增加,在植物的许多生长发育过程中发挥作用。为了揭示黄瓜扩展蛋白基因家族的功能,本研究利用全基因组测序数据鉴定黄瓜扩展蛋白基因家族,分析其结构特征及系统发育关系。黄瓜基因组测序数据分析显示,黄瓜扩展蛋白基因家族包含35个成员,包括A(21)、B(3)、LA(9)和LB(2)4个亚家族,分布在黄瓜7条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度范围为206-295,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明,黄瓜扩展蛋白四个亚家族的平均内含子数目分别为A类1.8个,B类2.7个,LA类3.8个和LB类3.5个。基因表达分析发现,该家族基因在黄瓜雌雄花蕾及果实发育过程中表达丰度较高。本研究分析了黄瓜扩展蛋白基因家族的基本信息,可为深入研究其扩展蛋白基因的分子进化与生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 黄瓜 扩展蛋白 生物信息学 基因家族
地黄扩展蛋白基因RgEXPA10的克隆与表达分析 被引量:4
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作者 王丰青 周艳 +5 位作者 黄勇 李明杰 田云鹤 冯法节 陈新建 张重义 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期233-240,共8页
以地黄(Rehmannia glutinosa)叶片c DNA为模板,克隆地黄扩展蛋白基因,获得一条972 bp的c DNA序列,包含了762 bp的开放阅读框(ORF),命名为Rg EXPA10,Gen Bank登录号为KF011918,编码253个氨基酸。以基因组DNA为模板,扩增出一条1 207 b... 以地黄(Rehmannia glutinosa)叶片c DNA为模板,克隆地黄扩展蛋白基因,获得一条972 bp的c DNA序列,包含了762 bp的开放阅读框(ORF),命名为Rg EXPA10,Gen Bank登录号为KF011918,编码253个氨基酸。以基因组DNA为模板,扩增出一条1 207 bp的序列,测序结果显示包含3个外显子和2个内含子,Gen Bank登录号为KF011919。应用生物信息学方法分析其氨基酸序列结构特征,结果显示,Rg EXPA10包含DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域,有26氨基酸的核定位序列和19氨基酸的跨膜结构域。进化分析发现在拟南芥26个α扩展蛋白中,Rg EXPA10与At EXPA8的同源性最高。在22个植物的同源蛋白中,地黄Rg EXPA10与番茄扩展蛋白的亲缘关系最近。以实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测Rg EXPA10基因的表达量,发现Rg EXPA10在地黄未展开的幼嫩叶片里表达最强,其次为膨大中的块根,在衰老的叶片中表达最弱。出苗后60和90天时,在地黄块根中的表达较强。在连作、盐和渍水3种逆境胁迫下,地黄叶片内Rg EXPA10的表达量均显著降低。为研究Rg EXPA10在地黄发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础。 展开更多
关键词 地黄 扩展蛋白 克隆 表达分析
水稻扩展蛋白家族的生物信息学分析 预览 被引量:3
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作者 施杨 徐筱 +2 位作者 李昊阳 徐倩 徐吉臣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期809-820,共12页
扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等方面起到重要的作用.水稻的全基因组序列统计分析显示,水稻扩展蛋白基因家族包含58个成员,分属于A(34)、B(19)、LA(4)和LB... 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等方面起到重要的作用.水稻的全基因组序列统计分析显示,水稻扩展蛋白基因家族包含58个成员,分属于A(34)、B(19)、LA(4)和LB(1)4个亚家族,分布在水稻10条染色体上的58个位点,且同一亚家族成员有成簇存在的现象.扩展蛋白基因长度范围为687~1128 bp,编码蛋白质具有保守的结构域,以及保守的半胱氨酸和色氨酸残基.多数情况下,亚家族成员之间的氨基酸一致率小于35%,而同一亚家族成员之间的氨基酸一致率大于35%.在内含子、外显子组成模式上,水稻扩展蛋白呈现明显的亚家族特异性,除个别基因以外,A类基因含有1或2个内含子,B类含有3个内含子,LA和LB类含有4个内含子.密码子使用统计显示,与其他物种相比,水稻中的扩展蛋白具有更多的密码子使用偏好性,有26个高频密码子存在.研究结果展示了水稻扩展蛋白基因家族的基本信息,为深入研究扩展蛋白基因的功能、探讨物种间的进化关系奠定基础. 展开更多
关键词 水稻 扩展蛋白 细胞壁 基因家族 生物信息学
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杨树扩展蛋白基因家族的生物信息学分析 被引量:3
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作者 李昊阳 施杨 +1 位作者 丁亚娜 徐吉臣 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期59-67,共9页
扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用。全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属... 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用。全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属于EXPA、EXPB、EXLB和EXLA4个亚家族。系统生物信息学分析表明,杨树扩展蛋白基因具有保守的序列特征和稳定的蛋白结构,包括9种不同的内含子起源模式以及6个高频密码子。基因表达分析显示,该家族基因在杨树木材形成相关的组织/器官中表达丰度较高,对林木生殖发育也起着重要的作用。研究结果展示了杨树扩展蛋白基因家族的基本信息和特点,为深入研究杨树扩展蛋白基因的功能搭建平台。 展开更多
关键词 杨树 扩展蛋白 细胞壁 基因家族 生物信息学
PwEXP1在青杄种子萌发及逆境响应中的表达特征 预览 被引量:3
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作者 张通 李巧玲 张凌云 《林业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期56-62,共7页
采用RACE-PCR技术,从青杄c DNA文库中克隆得到1个青杄Pw EXP1基因,其c DNA全长为1 186 bp,含777 bp的完整开放阅读框,编码259个氨基酸。生物信息学分析发现其理论分子量为27.90 k Da,等电点(p I)为8.07,N端有8个半胱氨酸残基,C端4个... 采用RACE-PCR技术,从青杄c DNA文库中克隆得到1个青杄Pw EXP1基因,其c DNA全长为1 186 bp,含777 bp的完整开放阅读框,编码259个氨基酸。生物信息学分析发现其理论分子量为27.90 k Da,等电点(p I)为8.07,N端有8个半胱氨酸残基,C端4个色氨酸残基,中部1个HFD结构域,具有扩展蛋白的典型结构。RT-q PCR试验显示Pw EXP1在青杄针叶中相对表达量较高。在种子萌发过程中,未开始萌发的种子表达量较低,萌发第2天和第4天表达量开始升高,萌发6天后达到较高水平。在逆境胁迫下,Pw EXP1在青杄根和叶中的表达模式不同。Na Cl和低温、高温胁迫均能增加Pw EXP1在根中的表达水平;PEG处理的渗透胁迫下,Pw EXP1在根中表达特征呈现前期下调、6 h后上调,而在叶中则在胁迫3 h和6 h时上调、9 h和12 h时下调、24 h时重新上调;在ABA处理后,Pw EXP1在根和叶中均表现下调。推测Pw EXP1在青杄种子萌发和逆境响应中发挥作用。 展开更多
关键词 青杄 扩展蛋白 胁迫响应 基因表达
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植物扩展蛋白基因及其表达调控的研究进展 预览 被引量:3
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作者 赵美荣 《赤峰学院学报:自然科学版》 2014年第14期1-5,共5页
作为一种细胞壁蛋白,扩展蛋白调节细胞的伸展性。许多研究表明,扩展蛋白基因表达在植物生长发育过程中起着重要作用,还与多种抗性反应有关。本文就扩展蛋白的基因家族、蛋白结构及基因表达调控等方面的研究进展作一简单综述。
关键词 扩展蛋白 基因表达 研究进展
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