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酶解大豆分离蛋白的抗原活性变化及其抗原表位分析 预览
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作者 王章存 袁路阳 +3 位作者 张露 胡金强 安广杰 赵学伟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第10期64-69,共6页
研究酶解过程中大豆蛋白分子成分和抗原性变化规律及酶解物中是否存在抗原表位序列。用碱性蛋白酶水解大豆分离蛋白后,首先分别用电泳和酶联免疫法分析蛋白质分子组分和抗原活性变化,结果发现,酶解过程中新生成23 ku和21 ku抗酶解肽链... 研究酶解过程中大豆蛋白分子成分和抗原性变化规律及酶解物中是否存在抗原表位序列。用碱性蛋白酶水解大豆分离蛋白后,首先分别用电泳和酶联免疫法分析蛋白质分子组分和抗原活性变化,结果发现,酶解过程中新生成23 ku和21 ku抗酶解肽链直到酶解120min时仍未消失,同时酶解物中剩余28%抗原活性。进一步通过胰蛋白酶对这两个肽链胶内酶解并用基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪分析后,将所得肽段氨基酸序列分别与抗原数据库中抗原表位序列和大豆分离蛋白氨基酸序列进行匹配解析,结果发现,在21 ku组分中含有两个完整的序列抗原表位(LQRFNQRSPQLQNLR和SEDKPFNLRSRDPIYSNKLGKFFEITPEKN),且均来自β-伴大豆球蛋白中的α-亚基,21 ku组分抗原剩余率为15.7%;在23 ku肽链中含有抗原表位的部分氨基酸序列,但未发现含有完整的抗原表位序列,23 ku组分抗原剩余率为2.1%,该组分中是否含有新的未知抗原表位或是否与糖链有关尚待深入研究。上述研究结果揭示了大豆蛋白酶解物中仍残留抗原性的部分原因。 展开更多
关键词 大豆分离蛋白 酶解 抗原活性 抗原表位
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对虾白斑病毒多抗原决定簇重组蛋白的抗原性分析 预览
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作者 董慧芹 刘金宝 张国华 《科学技术与工程》 北大核心 2019年第10期26-31,共6页
为研究重组多表位蛋白制备疫苗的方法的可行性,研究通过利用目前有研究证实与对虾白斑综合征病毒(WSSV)感染与致病力相关的重要决定因子囊膜蛋白VP28、VP19和被膜蛋白VP26,从这三种蛋白基因中筛选表位基因,将这些筛选到的抗原表位通过... 为研究重组多表位蛋白制备疫苗的方法的可行性,研究通过利用目前有研究证实与对虾白斑综合征病毒(WSSV)感染与致病力相关的重要决定因子囊膜蛋白VP28、VP19和被膜蛋白VP26,从这三种蛋白基因中筛选表位基因,将这些筛选到的抗原表位通过最优化的方式组合以及密码子优化,组成新的表位基因序列,命名为Y1798G,长度为509 bp。将该基因克隆到p ET-32a原核表达载体,生产抗原表位蛋白。将纯化的抗原蛋白注射到小白鼠体内,获得抗体;并通过蛋白免疫印迹(western blot)实验验证获得的抗体能否识别结合WSSV。结果表明所构建的抗原表位重组蛋白对WSSV具有特异抗原性,可见此种制备对虾白斑病毒疫苗的策略具有可行性。 展开更多
关键词 对虾白斑综合征病毒 抗原表位 重组蛋白 抗原
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RHAG血型抗原研究进展
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作者 王鹤 李树中(审校) +1 位作者 李中华 李凌波 《临床血液学杂志:输血与检验》 2019年第3期479-482,共4页
RHAG血型抗原是系统抗原,国际输血协会(ISBT)的命名RHAG,系统编号030,已确认该系统有4个抗原。RHAG抗原过去被称为RH50,是一个与RHD/CE相关的抗原(RHD/CE被称为RH30)。本文就RHAG抗原的最新研究进展,做一简略介绍。
关键词 RHAG血型抗原 CD241 抗原表位 膜骨架构成 引导RHD/CE多肽穿膜 胺转运蛋白
产气荚膜梭菌β毒素蛋白抗原表位预测及CPB-N蛋白免疫原性分析 预览
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作者 王玉建 商红旗 +3 位作者 朱琳 徐煜琳 胡莉萍 朱瑞良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期188-191,共4页
为获得具有与β毒素蛋白相同免疫原性的新蛋白,本研究对产气荚膜梭菌β毒素蛋白的氨基酸序列进行综合分析,预测其抗原表位并筛选出有效的新蛋白。采用生物信息学方法综合分析β毒素蛋白二级结构、亲水性、可塑性、抗原性、跨膜区域以及... 为获得具有与β毒素蛋白相同免疫原性的新蛋白,本研究对产气荚膜梭菌β毒素蛋白的氨基酸序列进行综合分析,预测其抗原表位并筛选出有效的新蛋白。采用生物信息学方法综合分析β毒素蛋白二级结构、亲水性、可塑性、抗原性、跨膜区域以及信号肽,同时参考ElliPro服务器在线预测。最终预测aa108~aa320区段为优势抗原表位,在此基础上建立β毒素蛋白三维结构模型,标记特殊位点并筛选出B型产气荚膜梭菌新蛋白(CPB-N)。诱导表达CPB-N后通过SDS-PAGE和western blot鉴定,结果显示在约24 ku处有明显条带。采用间接ELISA方法对免疫小鼠的血清和肠道灌洗液样品进行检测,结果表明CPB-N与β毒素蛋白的免疫原性基本相同。CPB-N蛋白的筛选及预防产气荚膜梭菌引起的疾病奠定了重要的研究基础。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 β毒素蛋白 抗原表位 免疫原性
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禽白血病病毒p27基因的原核表达及生物信息学分析
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作者 徐明国 杨宁宁 +6 位作者 刘志科 张桂枝 吴鹏 易继海 吴文星 王震 陈创夫 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第13期21-26,172-174共9页
为了进一步研究禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)p27蛋白的结构与功能,并获得具有反应原性的重组蛋白p27,试验通过PCR技术克隆p27基因,构建克隆载体pMD19-T-p27,并应用生物信息学软件对获得的p27基因序列进行分析,构建重组表达载... 为了进一步研究禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)p27蛋白的结构与功能,并获得具有反应原性的重组蛋白p27,试验通过PCR技术克隆p27基因,构建克隆载体pMD19-T-p27,并应用生物信息学软件对获得的p27基因序列进行分析,构建重组表达载体pET-28a-p27,并将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中诱导表达,通过SDS-PAGE和Western-blot对获得的重组蛋白p27进行分析。结果表明:通过PCR技术克隆获得ALV p27基因,并成功构建了克隆载体pMD19-T-p27;生物信息学分析发现,p27蛋白由239个氨基酸组成,分子式为C(1140)H(1853)N(323)O(339)S6,理论等电点为6.23,无信号肽和跨膜区,含有8个丝氨酸磷酸化位点和13个苏氨酸磷酸化位点,无糖基化位点,共有9个抗原表位,二级结构和三级结构中以α-螺旋为主;成功构建了重组表达载体pET-28a-p27,并在大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中高效表达;诱导6小时时蛋白质表达量最大,分子质量约为27 ku,且以可溶性为主;重组蛋白p27具有较好的反应原性和特异性。说明试验获得了具有反应原性的重组蛋白p27,为建立禽白血病快速诊断方法和新型疫苗的研发提供了理论基础。 展开更多
关键词 禽白血病 P27基因 反应原性 抗原表位 生物信息学分析
病毒样颗粒作为口蹄疫病毒抗原表位载体的研究进展 预览
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作者 李茜 代军飞 +5 位作者 王俊 丁耀忠 马炳 刘永生 张永光 张杰 《江西农业学报》 CAS 2019年第6期95-101,共7页
病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)不含有病毒核酸,不具有自我复制的能力,但拥有与完整病毒粒子相似的空间结构和免疫原性,可以作为口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV)抗原表位的载体,将其展示在它的表面。主要介绍了... 病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)不含有病毒核酸,不具有自我复制的能力,但拥有与完整病毒粒子相似的空间结构和免疫原性,可以作为口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV)抗原表位的载体,将其展示在它的表面。主要介绍了作为FMDV抗原表位的VLPs载体:FMDV-VLPs、HBc-VLPs、PCV2-VLPs和PPV-VLPs,并阐述了VLPs在几种表达系统中的组装现状,以期为今后有关FMD的VLPs研究提供参考。 展开更多
关键词 病毒样颗粒 口蹄疫病毒 抗原表位 疫苗
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利用E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白的研究 预览
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作者 王幸 张建楼 +2 位作者 霍珊珊 仲飞 张辉 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期90-95,共6页
为通过E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白,本试验利用DNAstar软件确定含有抗原表位的NS1蛋白片段,然后运用PCR方法从含有NS1基因的载体中扩增NS1抗原表位区基因片段,并将该基因片段插入到原核表达载体pGEX4T1中,构建成与GS... 为通过E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白,本试验利用DNAstar软件确定含有抗原表位的NS1蛋白片段,然后运用PCR方法从含有NS1基因的载体中扩增NS1抗原表位区基因片段,并将该基因片段插入到原核表达载体pGEX4T1中,构建成与GST标签融合的NS1抗原表位基因的表达载体pGEXGSTNS1,将表达载体转化BL21大肠杆菌筛选出工程菌。经IPTG诱导表达NS1融合蛋白,经GST琼脂糖凝胶磁珠分离纯化,制备出与GST融合的NS1抗原表位蛋白。经SDSPAGE以及Westernblot鉴定,制备的NS1融合蛋白分子量和预期一致,并且可以和抗GST标签抗体进行特异反应,表明NS1抗原蛋白已成功制备,为下一步NS1抗体的研制提供了必要的条件。 展开更多
关键词 猪细小病毒 NS1蛋白 抗原表位 分离纯化
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多房棘球蚴四跨膜蛋白的生物信息学分析
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作者 杨宇 张耀刚 +2 位作者 张灵强 任利 樊海宁 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期165-170,177共7页
目的采用生物信息学方法分析多房棘球蚴四跨膜蛋白(EmTspan)的结构与抗原表位。方法从NCBI数据库中下载EmTspan蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam、ProtScale、SOSUI、DNASTAR、SignalP、Cell-PLoc、SOMPA、NetPhos、Motif Scan、Phyre 2... 目的采用生物信息学方法分析多房棘球蚴四跨膜蛋白(EmTspan)的结构与抗原表位。方法从NCBI数据库中下载EmTspan蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam、ProtScale、SOSUI、DNASTAR、SignalP、Cell-PLoc、SOMPA、NetPhos、Motif Scan、Phyre 2、TMHMM等生物信息学软件分析蛋白质的理化性质、亚细胞定位、跨膜区域、磷酸化和翻译后修饰位点及二、三级结构,利用ABCpred、IEDB、SYFPEITHI软件分析并预测B细胞、T细胞的抗原表位,通过MEGA-X软件构建Tspan的分子进化树。结果 EmTspan蛋白是由236个氨基酸序列组成,分子式为C1163H1853N291O315S21,不稳定指数为32.77,为稳定蛋白;有4个跨膜区,定位于细胞膜;二级结构中,α螺旋占46.19%,β折叠占20.34%,β转角占8.05%,无规则卷曲占25.42%;EmTspan蛋白含有的B细胞、TCL细胞及Th细胞的抗原表位分别为7、15、8个;分子进化分析多房棘球蚴的Tspan和小口膜壳绦虫的Tspan亲缘关系较近。结论生物信息学预测EmTspan蛋白存在多个潜在的B细胞及T细胞表位,抗原性好,可为多房棘球蚴疫苗的研制、免疫诊断等提供理论依据。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 四跨膜蛋白 生物信息学 抗原表位
A型口蹄疫病毒多肽抗原表位的原核表达及多克隆抗体的制备 预览
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作者 程凯慧 沈付娆 +5 位作者 邹积振 苗自利 解晓莉 张亮 杨宏军 何洪彬 《江苏农业科学》 2019年第8期184-187,共4页
为构建A型口蹄疫病毒多肽抗原表位的原核表达载体,并制备多克隆抗体,利用基因合成技术将不同株的A型口蹄疫病毒抗原表位A-A10-61-VP1(第141~160位氨基酸)、A-A10-61-VP1(第200~212位氨基酸)、A22Iraq-VP1(第136~164位氨基酸)串联,在其... 为构建A型口蹄疫病毒多肽抗原表位的原核表达载体,并制备多克隆抗体,利用基因合成技术将不同株的A型口蹄疫病毒抗原表位A-A10-61-VP1(第141~160位氨基酸)、A-A10-61-VP1(第200~212位氨基酸)、A22Iraq-VP1(第136~164位氨基酸)串联,在其间引入合适的linker序列,重组得到pET-28a(+)质粒中,转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,诱导表达重组蛋白,免疫新西兰兔制备多克隆抗体。成功构建了A型口蹄疫病毒抗原表位原核表达载体,获得高纯度重组蛋白和含A型口蹄疫病毒抗体的兔抗血清,为A型口蹄疫病毒诊断试剂盒的研发和A型口蹄疫病毒表位多肽疫苗的研究奠定基础。 展开更多
关键词 A型口蹄疫病毒 抗原表位 重组蛋白 多肽疫苗
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β-伴大豆球蛋白及其主要抗原表位与大鼠小肠上皮黏膜蛋白结合的比较 预览
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作者 张琦玉 赵元 +2 位作者 秦贵信 强嘉楠 鲍男 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期3235-3241,共7页
本试验旨在比较β-伴大豆球蛋白及其主要抗原表位与大鼠小肠上皮黏膜蛋白的结合情况。试验选取12只SD大鼠,随机分为2组(对照组和致敏组),每组6个重复,每个重复1只。对照组和致敏组均饲喂不含任何豆科成分来源的饲粮,致敏组以β-伴大豆... 本试验旨在比较β-伴大豆球蛋白及其主要抗原表位与大鼠小肠上皮黏膜蛋白的结合情况。试验选取12只SD大鼠,随机分为2组(对照组和致敏组),每组6个重复,每个重复1只。对照组和致敏组均饲喂不含任何豆科成分来源的饲粮,致敏组以β-伴大豆球蛋白为致敏源进行攻击和激发,并采用免疫组织化学法对β-伴大豆球蛋白及其主要抗原表位与小肠上皮黏膜蛋白的结合蛋白进行检测。结果表明:1)对照组的空肠前段β-伴大豆球蛋白结合蛋白的含量与致敏组存在显著性差异(P<0.05)。对照组的十二指肠和空肠前段β-伴大豆球蛋白结合蛋白的含量显著高于空肠中段、空肠后段和回肠(P<0.05),致敏组的十二指肠β-伴大豆球蛋白结合蛋白的含量显著高于空肠前段、空肠中段、空肠后段和回肠(P<0.05)。2)对照组的空肠后段和回肠α2抗原表位结合蛋白的含量与致敏组存在显著性差异(P<0.05)。对照组的十二指肠和空肠前段α2抗原表位结合蛋白的含量显著高于空肠中段、空肠后段和回肠(P<0.05);致敏组的十二指肠α2抗原表位结合蛋白的含量显著高于空肠前段、空肠中段、空肠后段和回肠(P<0.05)。3)对照组的十二指肠和空肠后段β4抗原表位结合蛋白的含量与对照组存在显著性差异(P<0.05)。对照组和致敏组的十二指肠、空肠前段和空肠中段β4抗原表位结合蛋白的含量显著高于空肠后段和回肠(P<0.05)。由此可见,十二指肠β-伴大豆球蛋白、α2和β4抗原表位结合蛋白的含量最多,空肠后段和回肠较少。致敏组β-伴大豆球蛋白、α2和β4抗原表位结合蛋白的含量普遍低于对照组。 展开更多
关键词 大鼠 Β-伴大豆球蛋白 抗原表位
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分枝杆菌Rv2450c T细胞表位预测及分析 预览
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作者 王培东 何俊才 +4 位作者 周放 张露 郑辉 余晓丽 《武汉轻工大学学报》 2019年第1期33-36,共4页
对Rv2450c进行T细胞表位预测分析。在NCBI上获取Rv2450c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性分析,NetMHC在线基本软件预测并分析Rv2450c的CD4^+T细胞表位... 对Rv2450c进行T细胞表位预测分析。在NCBI上获取Rv2450c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性分析,NetMHC在线基本软件预测并分析Rv2450c的CD4^+T细胞表位的分布情况;Bimas、NetMHC、和NetCTL软件预测并分析Rv2450c的CD8^+T细胞表位的分布情况。经筛选得出CD4^+T细胞的优势表位5个,CD8^+T细胞优势表位2个;综合CD^+T细胞表位与CD8^+T细胞表位分析结果,最终筛选出T细胞表位预测为:SQGIRAWP159—166。预测出的T细胞候选表位可为结核病疫苗开发提供参考。 展开更多
关键词 Rv2450c 生物信息学 抗原表位
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MMP-9蛋白的抗原表位分析及单克隆抗体制备 预览
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作者 许映雪 尹焕才 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期134-140,共7页
利用生物信息学方法分析并预测MMP-9蛋白的抗原表位区,命名为Δmmp9。通过对Δmmp9的核苷酸序列进行分析,设计引物扩增目的片段,构建重组表达载体pET28α(+)-Δmmp9,并将其转化到BL21(DE3)中,诱导表达重组蛋白Δmmp9。纯化重组蛋白后,免... 利用生物信息学方法分析并预测MMP-9蛋白的抗原表位区,命名为Δmmp9。通过对Δmmp9的核苷酸序列进行分析,设计引物扩增目的片段,构建重组表达载体pET28α(+)-Δmmp9,并将其转化到BL21(DE3)中,诱导表达重组蛋白Δmmp9。纯化重组蛋白后,免疫BALB/c小鼠,筛选获得7株稳定分泌单克隆抗体的杂交瘤细胞株,检测抗体效价均达1:240 000。利用生物信息学筛选抗原表位区,成功制备单克隆抗体,通过抗体配对实验,证明其有良好特异性,并筛选出3株捕获抗体及对应标记抗体。 展开更多
关键词 MMP-9 生物信息学 抗原表位 单克隆抗体
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丙型肝炎病毒E2蛋白的生物信息学分析
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作者 李滚 张甜甜 +2 位作者 李蓓 张涛 卢香香 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第5期511-514,共4页
目的探讨研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物学特征。方法从NCBI数据库中获取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在线分析软件分析其生物学特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜区、信号肽,磷酸化位点、二级结构特征等,通过综合分析丙型肝... 目的探讨研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物学特征。方法从NCBI数据库中获取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在线分析软件分析其生物学特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜区、信号肽,磷酸化位点、二级结构特征等,通过综合分析丙型肝炎病毒E2蛋白的各类性质,得到最佳抗原表位区域,并对丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列预测结果进行了比对分析。结果丙肝病毒E2蛋白由344个氨基酸组成,分子式为C1696H2543N463O490S21,不稳定系数为35.6,理论等电点为7.2,总体平均亲水性为-0.131,为稳定性亲水蛋白质,E2蛋白二级结构中主要成分为无规则卷曲(占比43.6%)。该蛋白无信号肽且无跨膜区,约存在50个磷酸化位点,最佳抗原区域位于95-100氨基酸位置。结论生物信息学方法预测丙型肝炎病毒E2蛋白属于稳定性亲水蛋白,含有抗原表位区域,可为丙型肝炎表位疫苗的研制提供参考依据。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 E2蛋白 抗原表位 生物信息学
IDH1单克隆抗体的制备及表位鉴定和双抗体夹心ELISA的建立 预览
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作者 杜晓娟 孟麟 +1 位作者 孙天一 寿成超(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1482-1486,共5页
目的:制备抗异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)单克隆抗体,并确定其识别IDH1的表位区域,在此基础上建立双抗体夹心ELISA法,为检测人外周血IDH1蛋白奠定基础。方法:用原核表达的IDH1-GST蛋白免疫Balb/c小鼠,经常规细胞融合技术和ELISA筛选获得抗IDH... 目的:制备抗异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)单克隆抗体,并确定其识别IDH1的表位区域,在此基础上建立双抗体夹心ELISA法,为检测人外周血IDH1蛋白奠定基础。方法:用原核表达的IDH1-GST蛋白免疫Balb/c小鼠,经常规细胞融合技术和ELISA筛选获得抗IDH1的单抗克隆。构建并表达IDH1的不同截短体融合蛋白,用Western blot和ELISA检测不同单抗与不同截短体蛋白的反应。通过双抗体夹心ELISA进行两两配对,获得有较好检测效果的配对抗体。结果:通过GSTIDH1和GST蛋白的ELISA双筛和Western blot的进一步鉴定,获得了8株抗IDH1的单克隆抗体,分别命名为1H8、4H7、5C8、7C3、7E12、13F6、16B11和16H7;5C8和7C3抗体识别的抗原表位位于IDH1 119~197位氨基酸;4H7的识别表位位于197~211位氨基酸,7E12和16B11的识别表位位于211~314位氨基酸,1H8和16H7的识别表位位于314~329位氨基酸,13F6的识别表位位于314~415位氨基酸。在双抗体夹心配对实验中,1H8包被抗体,4H7作为检测抗体,可获得相对较高的检测敏感性。结论:制备获得了8株抗IDH1特异性单克隆并鉴定了各自的抗原表位识别区域,初步建立了ELISA双抗体夹心检测法,为后续外周血中IDH1的检测奠定了基础。 展开更多
关键词 IDH1 单克隆抗体 抗原表位 双抗体夹心ELISA
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中国莱姆病螺旋体DnaK基因的人T细胞表位研究
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作者 张琳 侯学霞 +1 位作者 苗广青 郝琴 《热带医学杂志》 CAS 2019年第2期154-161,共8页
目的了解我国引起莱姆病的伯氏疏螺旋体重要抗原之一DnaK基因及其表位区的多样性,理解伯氏疏螺旋体与宿主之间的相互作用机制和伯氏疏螺旋体抗原分子引起的免疫应答反应。方法比对分析我国68株具有代表性的伯氏疏螺旋体菌株,包含了4个... 目的了解我国引起莱姆病的伯氏疏螺旋体重要抗原之一DnaK基因及其表位区的多样性,理解伯氏疏螺旋体与宿主之间的相互作用机制和伯氏疏螺旋体抗原分子引起的免疫应答反应。方法比对分析我国68株具有代表性的伯氏疏螺旋体菌株,包含了4个重要基因型。使用国际参考株B31(Borrelia burgdorferi sensu stricto,B.B.s.s)作为参考菌株。结果结果表明DnaK基因的T细胞抗原表位区有单核苷酸变异(SNP),但氨基酸序列与参考菌株没有差异。该基因序列90~1 838 bp的dN/dS值为0.03。同时,我国伯氏疏螺旋体主要致病基因型B.garinii的核酸变异较大。结论 DnaK基因的T抗原表位高度保守,可能是感染之后直接刺激免疫系统引起炎性反应的原因之一。此外在不改变蛋白功能的前提下,基因的多样性可能与其适应环境有关。 展开更多
关键词 伯氏疏螺旋体 DNAK T抗原表位 高度保守
斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析
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作者 赵学亮 王姝懿 +3 位作者 呼和巴特尔 冯陈晨 孙柯 王文龙 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期116-123,共8页
为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行... 为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原。 展开更多
关键词 原核表达载体 SHR基因 抗原表位 生物信息学
HIV/HBV合并感染者HBV Pre-S/S区抗原表位变异分析
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作者 聂源 廖宝林 +7 位作者 胡凤玉 邓西子 兰芸 唐小平 蔡卫平 李凌华 高鸣 李锋 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2019年第2期131-135,共5页
目的分析HIV/HBV合并感染者外周血中HBV Pre-S/S区抗原表位变异特征,为研究合并感染致病机制提供实验依据。方法收集广州市第八人民医院感染病中心2009年1月份至2011年12月份收治慢性HBV感染者的基本信息和实验室检查资料,按治疗前HIV... 目的分析HIV/HBV合并感染者外周血中HBV Pre-S/S区抗原表位变异特征,为研究合并感染致病机制提供实验依据。方法收集广州市第八人民医院感染病中心2009年1月份至2011年12月份收治慢性HBV感染者的基本信息和实验室检查资料,按治疗前HIV抗体检测结果分为HIV/HBV合并感染组、HBV单一感染组,采集患者外周血,提取血清中HBV DNA,采用巢式PCR法扩增HBV DNA的Pre-S/S基因,将获得的PCR产物进行序列测定(直接测序法)后,采用ContigExpress软件进行序列拼接、BioEdit软件进行序列比对,参照相应基因型HBV的标准序列,分析比较HIV/HBV合并感染和HBV单一感染两组的HBV Pre-S/S区抗原表位变异。统计学处理采用χ^2检验,软件为SPSS19.0。结果成功扩增HBV Pre-S/S基因的患者共150例,其中HIV/HBV合并感染者90例,HBV单一感染者60例,两组患者性别、年龄、基因型、HBeAg状态、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)比较无统计学差异;HBV Pre-S/S各表位变异分析结果:HIV/HBV合并感染组所有的细胞毒性T细胞(CTL细胞)表位变异发生率均偏高,其中Pre-S2 aa1-15表位变异发生率比较有统计学意义(χ^2=6.964,P=0.008);PreS2 aa1-15表位变异中缺失发生率合并感染组(11.1%)高于HBV单一感染组(3.3%)(χ^2=2.959,P=0.085)。B细胞表位中,Pre-S2 aa1-26 HIV/HBV合并感染组的变异发生率显著高于HBV单一感染组,差异有统计学意义(χ^2=6.924,P=0.010),其余B细胞表位在两组间比较无统计学意义(P值均>0.05);两组间辅助性T细胞(Th细胞)表位变异发生率比较均无统计学意义(P值均>0.05)。结论合并HIV感染可增加HBV Pre-S/S区CTL细胞表位变异,尤其是Pre-S2区5′端表位变异,提示HBV变异与宿主免疫状态相关,为进一步研究HIV/HBV合并感染的致病机制提供了可靠资料。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 肝炎病毒 乙型 Pre-S/S基因 抗原表位 变异
细粒棘球绦虫磷酸丙糖异构酶抗原表位预测与分析
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作者 彭文军 李超群 +3 位作者 张耀刚 姜博璠 刘佳 曹得萍 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期180-183,共4页
目的利用生物信息学的方法对细粒棘球绦虫EgTPI B、T细胞表位进行预测,为细粒棘球绦虫诊断抗原的筛选提供分子生物学依据。方法采用Expasy中的protparam数据库推测EgTPI的理化性质;利用IEDB、ABCpred软件分析B细胞抗原表位。AMPHI法预... 目的利用生物信息学的方法对细粒棘球绦虫EgTPI B、T细胞表位进行预测,为细粒棘球绦虫诊断抗原的筛选提供分子生物学依据。方法采用Expasy中的protparam数据库推测EgTPI的理化性质;利用IEDB、ABCpred软件分析B细胞抗原表位。AMPHI法预测Th细胞的抗原表位;使用Jpred 4软件和SWISS-MODEL构建TPI的二、三级结构;应用MEGA 4.0软件比对细粒棘球绦虫TPI和人类TPI、日本血吸虫TPI、肝片吸虫TPI等7种生物的序列。结果通过分析得出EgTPI二级结构中直链结构占15.6%、α螺旋占38.9%、转角结构占12.0%、其他结构占42.2%;经多序列比对,人类TPI与细粒棘球绦虫TPI-致度仅为40.08%,较大的差异更有利于形成抗原表位。预测可能的T细胞表位有16-30、71-85、98-119、142-154、178-200;可能的B细胞表位有28-39、50-60、70-80、131-139、150-159、213-231。结论 EgTPI可能形成T细胞表位区域有5个,B细胞表位的区域有6个,EgTPI抗原表位预测分析为疾病诊断的候选分子筛选奠定分子生物学理论依据。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 磷酸丙糖异构酶(TPI) 抗原表位 生物信息学
结核分枝杆菌Rv0674的抗原表位预测
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作者 杨延辉 董利军 +5 位作者 梁忠喆 刘通 崔烨挺 林源 张炜 杨玉荣 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期394-396,400共4页
目的预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)H37Rv的Rv0674蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar Lasergene软件中的Protean程序分析MTB Rv0674蛋白的二级结构,包括表面可能性、可变性、亲疏水性、抗原性等,预测Rv0674的B、T细... 目的预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)H37Rv的Rv0674蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar Lasergene软件中的Protean程序分析MTB Rv0674蛋白的二级结构,包括表面可能性、可变性、亲疏水性、抗原性等,预测Rv0674的B、T细胞表位。结果MTB Rv0674蛋白的二级结构多样化,预测得到9个亲水区,含有的B细胞表位分布在24-30、46-63、87-88、114-118、154-157、161-185、192-196、207-209和222-225位氨基酸残基及其附近,表位抗原性较好,均含有β转角和不规则卷曲结构,表面可能性和可变区较多;含有T细胞表位可能分布在26-29、38-42、47-50、53-56、66-70、76-79、83-86、104-108、122-126、137-141、154-157、164-167、171-174、195-199、217-221和232-235位氨基酸残基及其附近。结论生物信息学方法预测Rv0674蛋白为亲水性蛋白,且含有丰富的B、T细胞抗原表位,为研究Rv0674蛋白的免疫学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 Rv0674 抗原表位 预测
埃博拉病毒包膜糖蛋白变异及抗原表位研究进展
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作者 刘硕 张黎 +2 位作者 王玉琳 黄维金 王佑春 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期801-812,共12页
埃博拉病毒在人类和非人灵长类中引起严重出血热疾病,死亡率高。包膜糖蛋白为埃博拉病毒唯一与病毒吸附宿主细胞、融合和进入等功能相关的蛋白。包膜糖蛋白突变会影响病毒感染力、细胞嗜性和与抗血清的中和敏感性。本文系统分析了埃博... 埃博拉病毒在人类和非人灵长类中引起严重出血热疾病,死亡率高。包膜糖蛋白为埃博拉病毒唯一与病毒吸附宿主细胞、融合和进入等功能相关的蛋白。包膜糖蛋白突变会影响病毒感染力、细胞嗜性和与抗血清的中和敏感性。本文系统分析了埃博拉病毒包膜糖蛋白的氨基酸突变,结合抗体结合位点和T细胞表位分析其对于埃博拉病毒感染和疫苗保护效果的影响。 展开更多
关键词 出血热 埃博拉病毒 抗原表位 基因突变
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