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福建省鲜食玉米小型叶斑病的病原菌鉴定 预览 被引量:2
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作者 代玉立 甘林 +4 位作者 阮宏椿 石妞妞 杜宜新 陈福如 杨秀娟 《福建农业学报》 北大核心 2017年第12期1341-1349,共9页
鲜食玉米是福建省重要的经济作物。由丝状真菌引起的玉米叶斑病是玉米生产上的重要病害,严重影响了玉米的产量和品质。明确叶斑病的病原菌种类,可以为鲜食玉米病害的综合防控提供理论依据。本研究采用组织分离法对福州、莆田、漳州、南... 鲜食玉米是福建省重要的经济作物。由丝状真菌引起的玉米叶斑病是玉米生产上的重要病害,严重影响了玉米的产量和品质。明确叶斑病的病原菌种类,可以为鲜食玉米病害的综合防控提供理论依据。本研究采用组织分离法对福州、莆田、漳州、南平和宁德5个地区采集的玉米病叶上典型的小型病斑(病斑长度〈5mm)进行病菌分离和纯化,结果共获得103株单孢分离菌株。初步形态学观察后选取其中的8株代表性菌株进行鉴定,发现有5个菌株的形态特征与玉米小斑病菌的形态特征相似;而另3个菌株的形态特征与玉米弯孢叶斑病菌的形态特征极其相似。8个菌株接种感病玉米品种后出现了与田间相似的叶斑病症状。rDNA-ITS序列分析结果表明,8个供试菌株中有5个菌株鉴定为玉米小斑病菌Bipolaris maydis,2个菌株为玉米新月弯孢叶斑病菌Curvularia lunata,1个菌株为画眉草弯孢叶斑病菌Curvularia eragrostidis。上述研究结果表明,引起福建省鲜食玉米叶斑病的病原菌为B.maydis、C.lunata和C.eragrostidis。其中C.eragrostidis引起玉米叶斑病在福建省属首次报道。毒力测定结果表明,供试的8个菌株对8个不同玉米品种的毒力表现出多样性。 展开更多
关键词 玉米小斑病菌 玉米弯孢叶斑病菌 形态学特征 致病性 核糖体DNA转录间隔
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基于rDNA-ITS序列的天门冬拟茎点霉与相似种的系统发育关系 预览 被引量:4
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作者 卢松茂 陈振东 +2 位作者 林秀香 郑少缘 余智城 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期62-67,共6页
芦笋茎枯病由天门冬拟茎点霉(Phomopsis asparagi)引起,为明确P.asparagi与寄生在其他蔬菜、水果和经济林木等植物上的拟茎点霉不同种之间的系统发育关系,对分离至福建漳州的P.asparagi菌株及从Gen Bank下载的相关菌株的35条ITS序列... 芦笋茎枯病由天门冬拟茎点霉(Phomopsis asparagi)引起,为明确P.asparagi与寄生在其他蔬菜、水果和经济林木等植物上的拟茎点霉不同种之间的系统发育关系,对分离至福建漳州的P.asparagi菌株及从Gen Bank下载的相关菌株的35条ITS序列进行多序列比对分析,并用Neighbor-Joining法构建系统发育树。系统发育分析结果显示:35个菌株被划分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ组群;P.asparagi与葡萄拟茎点霉(P.viticola)、叶下朱生拟茎点霉(P.phyllanthicola)、杨桃拟茎点霉(P.averrhoae)、大豆茎溃疡病菌(Diaporthe phaseolorum)聚在I组群的A亚群,它们的系统学关系最近;大豆拟茎点霉(P.longicolla)、大豆间座壳菌(Diaporthe sojae)、褐纹拟茎点霉(P.vexans)、光叶子花拟茎点霉(P.glabrae)、柑橘间座壳菌(Diaporthe citri)、黄瓜间座壳菌(Diaporthe sclerotioides)聚在Ⅱ组群,它们与P.asparagi的系统学关系较远;昏暗拟茎点霉(P.obscurans)单独聚在最远的分支上(Ⅲ组群),其与P.asparagi的系统学关系最远。 展开更多
关键词 天门冬拟茎点霉 拟茎点霉属 核糖体DNA转录间隔 分子系统学
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不同产地蒺藜种质鉴定和化学成分聚类分析 预览 被引量:1
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作者 张素军 《现代中药研究与实践》 CAS 2012年第2期 21-25,共5页
目的测定不同产地的蒺藜的种质遗传,和药效物质基础上的一致性。方法利用PCR产物直接测序,测定不同产地蒺藜的核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS)的基因序列;对蒺藜的化学成分进行HPLC分析,以相关系数法对色谱结果进行模糊聚类。结果测... 目的测定不同产地的蒺藜的种质遗传,和药效物质基础上的一致性。方法利用PCR产物直接测序,测定不同产地蒺藜的核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS)的基因序列;对蒺藜的化学成分进行HPLC分析,以相关系数法对色谱结果进行模糊聚类。结果测得ITS碱基序列742 bp,其中,ITS1全部序列267 bp,5.8 S全部序列167 bp,ITS2全部序列209 bp,六个产地的蒺藜样品的ITS的碱基序列完全相同;在0.90的置信水平上,六个产地的蒺藜样品聚为一类。结论不同地区的蒺藜在种质上是一致的,在药效物质基础上没有太大的差异。 展开更多
关键词 蒺藜 核糖体DNA转录间隔 种质鉴定 模糊聚类
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基于ITS分析云南光叶桑和钦州长果桑在桑属中的亲缘关系及分化时间 被引量:3
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作者 陈仁芳 陈祥平 +3 位作者 范小敏 陈家元 刘泽听 虞志伟 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期 2-7,共6页
云南光叶桑、钦州长果桑在形态分类学上均属同一桑种Morus macroura。通过PCR扩增2份地方品种资源材料的ITS序列并分析序列差异及构建系统进化树,阐明各自在桑属中的遗传分化关系。2份材料的ITS序列长度均为576 bp,其中:云南光叶桑的G... 云南光叶桑、钦州长果桑在形态分类学上均属同一桑种Morus macroura。通过PCR扩增2份地方品种资源材料的ITS序列并分析序列差异及构建系统进化树,阐明各自在桑属中的遗传分化关系。2份材料的ITS序列长度均为576 bp,其中:云南光叶桑的G+C含量为59.90%,碱基序列45位A变G,560位T变G,与昆明奶桑(Morus macroura)、荥经川桑(Morus notabilis)、云南毛叶奶桑(Morus macroura var.mawa)、云南长穗桑(Morus wittiorum)、云南奶桑(Morus macroura)、雅安华桑(Morus cathayana)同在第Ⅰ类群,有较近的亲缘关系;钦州长果桑的G+C含量为59.72%,碱基序列45位为A,560位T变G,与云南华桑(Morus cathayana)同在第Ⅱ类群,有较近的亲缘关系。应用松散分子钟方法估算云南光叶桑与荥经川桑、雅安华桑、云南长穗桑的分化时间为8.23 Ma,钦州长果桑与云南华桑的分化时间为9.67 Ma,二者起源的地质年代是新第三纪中新世与上新世之交,是为了抵御地球寒冷、旱化,向南、向山地迁移形成的物种。 展开更多
关键词 核糖体DNA转录间隔 桑属 云南光叶桑 钦州长果桑 亲缘关系 分歧年代
5种乳白蚁ITS序列及系统发育关系分析 预览 被引量:2
5
作者 张卫东 廖力 +4 位作者 王岚 许彩芸 权永兵 徐淼锋 迟远丽 《广东农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第19期138-141,150共5页
对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序.进行序列分析和构建系统发育树.探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA—ITS基因序列长度约900bp,CG碱基含量为62-3%.明显高于AT含量(37.7%)。... 对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序.进行序列分析和构建系统发育树.探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA—ITS基因序列长度约900bp,CG碱基含量为62-3%.明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不同品级的乳白蚁(工蚁、兵蚁、有翅成虫)ITS序列没有遗传分歧。乳白蚁属内不同种间的同源性为94.3%-98.7%,同种不同地理种群之间的同源性均大于99%。大家白蚁C.curvignathus和塞庞乳白蚁C.sepangensis关系最近,婆罗乳白蚁C.travians与其他种进化距离最远。 展开更多
关键词 乳白蚁 核糖体DNA转录间隔 系统发育
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不同产地蒺藜核糖体DNA内转录间隔区序列分析 预览 被引量:2
6
作者 张素军 张学春 《实用药物与临床》 CAS 2011年第2期 129-131,共3页
目的通过测定核糖体DNA内转录间隔区(Ribosomal DNA internal transcribed spacer,rDNA-ITS)基因序列,确定不同产地的蒺藜在种质遗传上是否存在差异。方法利用PCR产物直接测序,测定不同产地蒺藜的rDNA-ITS基因序列。结果测得ITS碱基序... 目的通过测定核糖体DNA内转录间隔区(Ribosomal DNA internal transcribed spacer,rDNA-ITS)基因序列,确定不同产地的蒺藜在种质遗传上是否存在差异。方法利用PCR产物直接测序,测定不同产地蒺藜的rDNA-ITS基因序列。结果测得ITS碱基序列742 bp,其中ITS1全部序列267 bp,5.8 S全部序列167bp,ITS2全部序列209 bp。6个产地的蒺藜样品的ITS的碱基序列完全相同。结论不同地区的蒺藜在种质上没有发生变异。 展开更多
关键词 蒺藜 核糖体DNA转录间隔 种质鉴定 产地
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美洲狮和亚洲黑熊蛔虫ITS序列扩增及序列分析 预览 被引量:5
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作者 贺现辉 陈武 +3 位作者 何乐天 王培园 袁子国 林瑞庆 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第8期 41-45,共5页
以采自广州动物园美洲狮和亚洲黑熊体内的蛔虫样品为研究对象,提取样品的总DNA,以保守引物对核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序及网上比对。结果表明,美洲狮体内样品获得与GenBankTM公布的狮弓首蛔虫相似性很高的ITS-1... 以采自广州动物园美洲狮和亚洲黑熊体内的蛔虫样品为研究对象,提取样品的总DNA,以保守引物对核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序及网上比对。结果表明,美洲狮体内样品获得与GenBankTM公布的狮弓首蛔虫相似性很高的ITS-1、ITS-2和5.8S序列,亚洲黑熊体内样品获得与GenBankTM公布的转移拜林蛔虫相似性很高的ITS-2序列,并首次获得样品的ITS-1与5.8S序列。序列分析结果表明,美洲狮体内蛔虫样品为狮弓首蛔虫,亚洲黑熊体内蛔虫样品为转移拜林蛔虫。 展开更多
关键词 美洲狮 亚洲黑熊 蛔虫 核糖体DNA转录间隔 序列分析
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高良姜及其混淆品rDNA ITS序列的分析与鉴别 预览 被引量:5
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作者 庞启华 严萍 赵树进 《华南理工大学学报:自然科学版》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期 63-68,共6页
用聚合酶链式反应(PCR)直接测序法测定和分析不同产地野生和农家品种的高良姜及其3种混淆品(山姜、华山姜和大高良姜)的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)序列,为高良姜种质资源研究和真伪鉴别提供分子数据.ITS序列分析结果表明... 用聚合酶链式反应(PCR)直接测序法测定和分析不同产地野生和农家品种的高良姜及其3种混淆品(山姜、华山姜和大高良姜)的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)序列,为高良姜种质资源研究和真伪鉴别提供分子数据.ITS序列分析结果表明:高良姜种内序列同源性达100%,测序结果中发现杂合位点,且广西样品杂合位点的两个碱基所占的比例与其它地方样品的不同.高良姜及其混淆品经测序、比对、排序得到的812bp序列中有61个变异位点,60个是信息位点,同源性达96.32%,其中ITS1和ITS2区中的11个位点在高良姜及其混淆品中差别明显,可以鉴别高良姜及其混淆品.同时发现,基于DNA序列的高良姜及其混淆品的系统分类结果与形态学的分类结果不完全一致,有待进一步研究探讨. 展开更多
关键词 高良姜 混淆品 核糖体DNA转录间隔 序列分析 鉴别
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基于rDNAITS序列的何首乌PCR—RFLP分子鉴别 预览 被引量:6
9
作者 郑传进 赵树进 +1 位作者 赵振华 呙军 《华南理工大学学报:自然科学版》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期 74-78,83,共6页
对何首乌及其常见混淆品的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)序列进行了测序分析.结果表明:何首乌与其混淆品毛脉蓼、翼蓼及耳叶牛皮消ITSI区的差异率分别为6.91%、18.10%和42.20%,ITS2区的差异率分别为10.00%、19.40%和43... 对何首乌及其常见混淆品的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)序列进行了测序分析.结果表明:何首乌与其混淆品毛脉蓼、翼蓼及耳叶牛皮消ITSI区的差异率分别为6.91%、18.10%和42.20%,ITS2区的差异率分别为10.00%、19.40%和43.90%;而何首乌种内各居群间ITS1和ITS2区的差异率分别为0.00%~2.13%和0.00%~1.03%.基于何首乌及其混淆品的rDNAITS序列的差异,找出一个位于ITS2间隔区的何首乌特征性M6I酶切位点,用M6I酶对何首乌rDNAITS序列扩增产物酶切后得到含约531bp和109bp的两片段的聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)图谱,而其混淆品的rDNAITS序列扩增产物不能被NsbI酶切,故图谱呈单一条带.利用建立的PCR.RFLP方法可以很好地区分何首乌及其混淆品. 展开更多
关键词 何首乌 分子鉴别 核糖体DNA转录间隔 PCR—RFLP
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蕺菜rDNA ITS序列分析的正交试验条件的初步研究 被引量:1
10
作者 赵欢 吴卫 《药物生物技术》 CAS CSCD 2009年第6期535-539,共5页
以蕺菜DNA为模板,采用正交试验设计,对影响蕺菜rDNA ITS区扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立蕺菜rDNA ITS扩增反应的优化体系。结果表明,最优蕺菜ITS—PCR的反应体系为25μl反应体系中含Taq酶0.75U、Mg^2+(1mmol/L)1.0μ... 以蕺菜DNA为模板,采用正交试验设计,对影响蕺菜rDNA ITS区扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立蕺菜rDNA ITS扩增反应的优化体系。结果表明,最优蕺菜ITS—PCR的反应体系为25μl反应体系中含Taq酶0.75U、Mg^2+(1mmol/L)1.0μl、dNTP(0.15mmol/L)1.5μl、引物对(0.6μmol/L)1.2μl、模板DNA(10ng/μl)2.0μl、10×buffer(不含Mg^2+)2.5μl。这一体系的建立为利用蕺菜rDNAITS区研究蕺菜种质资源的系统进化提供了标准化程序。 展开更多
关键词 蕺菜 聚合酶链式反应 核糖体DNA转录间隔 正交试验
硬软蒺藜rDNA-ITS基因序列的测定和比较 预览 被引量:2
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作者 张素军 瞿伟菁 李进 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2006年第5期 792-795,共4页
用CTAB法提取总DNA,合成位于18 S rDNA和26S rDNA上的两条各20bp的引物,通过PCR扩增ITS的全序列,对PCR产物直接测序,分别获得了硬蒺藜(Tribulus terrestris L.)和软蒺藜(Atriples centralasiatica Iljin)的核糖体RNA基因-rDNA内转录间隔... 用CTAB法提取总DNA,合成位于18 S rDNA和26S rDNA上的两条各20bp的引物,通过PCR扩增ITS的全序列,对PCR产物直接测序,分别获得了硬蒺藜(Tribulus terrestris L.)和软蒺藜(Atriples centralasiatica Iljin)的核糖体RNA基因-rDNA内转录间隔区(ribosomal DNA internal transcribed spacer,rDNA-ITS)的序列643 bp和607bp,其碱基总差异率为36.16%,其中,ITS1的碱基差异率为55.81%;5.8 S的碱基差异率为6.59%;ITS2的碱基差异率为56.77%.这种差异,以及基因序列本身,为硬软蒺藜的区别和种质资源鉴定提供了分子依据. 展开更多
关键词 硬蒺藜 软蒺藜 核糖体DNA转录间隔 PCR扩增 种质鉴定
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艾叶及其常见混伪品的分子鉴定 被引量:4
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作者 李恩波 孙稚颖 《中国药房》 CAS CSCD 2013年第43期4037-4039,共3页
目的:对艾叶及其几种常见混伪品进行分子鉴定。方法:通过聚合酶链式反应(PCR)法直接测序,对艾及其8种混伪品进行核糖体DNA内转录间隔区片段2(ITS2)扩增并双向测序,所得序列经CodonCodeAligner拼接后,用系统发育软件MEGA4.0进... 目的:对艾叶及其几种常见混伪品进行分子鉴定。方法:通过聚合酶链式反应(PCR)法直接测序,对艾及其8种混伪品进行核糖体DNA内转录间隔区片段2(ITS2)扩增并双向测序,所得序列经CodonCodeAligner拼接后,用系统发育软件MEGA4.0进行相关数据分析,同时利用邻接(NJ)法构建系统聚类树。结果:艾叶基原植物艾ITS2序列长度为225bp,种内平均Kimura.双参数(K2P)遗传距离(0.000)小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离(0.022);由所构建的系统聚类树图可以看出,艾具有单系性,同时又与其他混伪品明显分开。结论:ITS2序列作为DNA条形码可以方便快捷地鉴别中药材艾叶及其混伪品,可为其质量评价及临床安全用药提供重要的分子鉴别依据。 展开更多
关键词 艾叶 蒿属 DNA条形码 核糖体DNA转录间隔片段2 分子鉴定
阴道毛滴虫ITS序列多态性与甲硝唑耐药性 被引量:3
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作者 吴家红 衣凤芸 包怀恩 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1345-1347,共3页
目的探讨临床不同分离株阴道毛滴虫核糖体DNA基因转录间隔区(rDNA ITS)序列多态性与甲硝唑抗性表型之间的相关性。方法采用微孔板法检测39株达到纯培养的阴道毛滴虫虫株对甲硝唑敏感性,同时设计rDNA-ITS区特异引物进行PCR扩增并测序... 目的探讨临床不同分离株阴道毛滴虫核糖体DNA基因转录间隔区(rDNA ITS)序列多态性与甲硝唑抗性表型之间的相关性。方法采用微孔板法检测39株达到纯培养的阴道毛滴虫虫株对甲硝唑敏感性,同时设计rDNA-ITS区特异引物进行PCR扩增并测序。结果39个虫株中,甲硝唑敏感虫株20株,耐药虫株19株;PCR扩增获得ITS区和5.8 S特异片段长度为285 bp。经DNAStarM egA lign比对显示,仅在ITS1区存在唯一点突变,即C66T突变。39个虫株中有8株具C66T突变,其中6株来自甲硝唑敏感虫株,2株来自甲硝唑耐药虫株。经F isher确切概率检验,χ^2=0.108,P>0.05。结论阴道毛滴虫临床分离株ITS区C66T突变与甲硝唑抗性表型无明显相关性。 展开更多
关键词 核糖体DNA基因转录间隔(rDNA-ITS) 多态性 甲硝唑耐药性 阴道毛滴虫
拟悬铃木根结线虫及其相似种的rDNA-ITS-RFLP分析 预览
14
作者 李君实 赵洪海 +2 位作者 陈长法 赖凡 余冬冬 《植物检疫》 2006年第4期 204-206,共3页
本文用特异性引物F195和V5367,对拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS)进行了PCR扩增,扩增产物用5种限制性内切酶Taq Ⅰ、Rsa Ⅰ、Msp Ⅰ、Cla Ⅰ、HaeⅢ进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析.Taq Ⅰ、R... 本文用特异性引物F195和V5367,对拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS)进行了PCR扩增,扩增产物用5种限制性内切酶Taq Ⅰ、Rsa Ⅰ、Msp Ⅰ、Cla Ⅰ、HaeⅢ进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析.Taq Ⅰ、Rsa Ⅰ、Msp Ⅰ、Cla Ⅰ酶切拟悬铃木根结线虫的rDNA-ITS扩增产物所获得限制性酶谱与花生根结线虫的限制性酶谱一致,只有HaeⅢ酶切拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的rDNA-ITS产物所得酶谱不同.rDNA-ITS扩增产物的HaeⅢ酶切图谱可以区分拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫. 展开更多
关键词 拟悬铃木根结线虫 限制性切酶HaeⅢ 核糖体DNA转录间隔(rDNA-ITS) 限制性 片段长度多态性(RFLP)
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基于核糖体DNA第二内转录间隔区基因的9种蚊虫分子鉴定 预览
15
作者 郭秀霞 程鹏 +3 位作者 刘丽娟 王海防 王怀位 张崇星 《热带病与寄生虫学》 2020年第1期12-16,共5页
目的分析常见9种蚊虫核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因序列特征,为蚊虫种类分子鉴定方法探讨提供依据。方法在山东省济宁市采集淡色库蚊、三带喙库蚊、二带喙库蚊、白纹伊蚊、刺扰伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊、常型曼蚊和黄色柯... 目的分析常见9种蚊虫核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因序列特征,为蚊虫种类分子鉴定方法探讨提供依据。方法在山东省济宁市采集淡色库蚊、三带喙库蚊、二带喙库蚊、白纹伊蚊、刺扰伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊、常型曼蚊和黄色柯蚊成蚊,形态学种类鉴定后,提取上述9种蚊虫DNA,PCR扩增rDNA-ITS2基因并测序;在GenBank中进行同源性比对,采用Bioedit 7.0软件及DNAMAN软件对测序结果进行比对分析,通过DNASTAR、ClustalX 1.81和Mega6软件分析列特征并构建系统进化树探讨系统发生关系。结果9种蚊虫的rDNA-ITS2长度在343 bp与577 bp之间,共有59个保守位点、449个变异位点、235个简约信息位点和191个单态位点,9种蚊虫种间序列同源性为28.21%~53.76%;所有蚊虫的rDNA-ITS2基因分子鉴定与形态学鉴定吻合率100%,库蚊属的淡色库蚊、三带喙库蚊和二带喙库蚊聚成一类,伊纹属的白纹伊蚊和刺扰伊蚊聚成一类,不同种蚊虫为独立分支。结论核糖体DNA第二内转录间隔(rDNA-ITS2)基因可用于蚊虫属和种的鉴定。 展开更多
关键词 蚊虫 核糖体DNA第二转录间隔 分子鉴定
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藏红花腐烂病病原真菌的分离鉴定及药剂防治 预览 被引量:1
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作者 周双 白洁 陈放 《四川大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期911-916,共6页
为明确藏红花腐烂病的病原真菌种类,对感病藏红花球茎进行发病组织培养、病原菌分离与单孢纯化.将获得的菌株进行病原菌致病性检测验证后,结合真菌形态学及rDNA—ITS序列BLAST比较分析,发现尖孢镰刀菌株是藏红花腐烂病的主要致病菌... 为明确藏红花腐烂病的病原真菌种类,对感病藏红花球茎进行发病组织培养、病原菌分离与单孢纯化.将获得的菌株进行病原菌致病性检测验证后,结合真菌形态学及rDNA—ITS序列BLAST比较分析,发现尖孢镰刀菌株是藏红花腐烂病的主要致病菌.采用常用抑菌菌剂对病原菌进行抑菌测定,结果表明:759,6代森锰锌可湿性粉剂等4种抑菌剂对病原菌抑菌率达60%以上. 展开更多
关键词 藏红花 腐烂病 核糖体DNA转录间隔 抑菌药剂
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山东省淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区基因多态性分析 被引量:2
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作者 刘飞 郭秀霞 +6 位作者 程鹏 王海防 刘丽娟 杨培培 赵玉强 王怀位 公茂庆 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2015年第6期550-554,共5页
目的探讨山东省不同地区淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因序列特征,分析其遗传变异。方法在山东省的济南、济宁、青岛、聊城、临沂、淄博市以及江苏省南京市采集淡色库蚊成蚊,并取实验室选育的抗氯氰菊酯与抗敌敌畏... 目的探讨山东省不同地区淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因序列特征,分析其遗传变异。方法在山东省的济南、济宁、青岛、聊城、临沂、淄博市以及江苏省南京市采集淡色库蚊成蚊,并取实验室选育的抗氯氰菊酯与抗敌敌畏品系成蚊,提取蚊虫DNA,PCR扩增淡色库蚊的r DNA-ITS2,PCR产物纯化后连接至p MD19-T载体进行基因测序,生物信息学分析r DNA-ITS2基因多态性。结果 PCR特异扩增山东省6个不同地理株及南京市和实验室2个不同品系的淡色库蚊r DNA-ITS2区域,获得460 bp左右的扩增片段。测序结果显示淡色库蚊r DNA-ITS2出现36个变异位点,表现出基因的多态性,其r DNA-ITS2基因单核苷酸存在转换、颠换和缺失。结论山东省不同地理区域和不同抗性的淡色库蚊在r DNA-ITS2区出现遗传多态性,可能与蚊虫生态环境有一定的关系。 展开更多
关键词 淡色库蚊 核糖体DNA第二转录间隔 基因多态性
基于rDNA-ITS2序列的中国按蚊属按蚊亚属部分种类的系统发育关系研究(双翅目:蚊科) 被引量:2
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作者 马颖 马雅军 +1 位作者 林琳 王琰 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2013年第5期382-388,共7页
目的阐明中国按蚊属按蚊亚属蚊种的亲缘关系。方法根据核糖体DNA第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)和最大似然法(ML),对采自中国的按蚊亚属22种(分子型)蚊虫进行系统发育关... 目的阐明中国按蚊属按蚊亚属蚊种的亲缘关系。方法根据核糖体DNA第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)和最大似然法(ML),对采自中国的按蚊亚属22种(分子型)蚊虫进行系统发育关系重建。结果rDNA-ITS2序列的长度范围为340~1754 bp,种内的p遗传距离均小于0.004,种间为0.009~0.420,平均值为0.224。各种方法重建的系统发育树均显示分为3大支,分别对应赫坎按蚊种团和须喙按蚊种团各一支,以及林氏按蚊与五斑按蚊种团聚为的一支,三者为并系关系;赫坎按蚊种团成员种分为主要的4支,其种间关系与形态分类结果一致,但分子型spLL1和spLL2的聚类位置不稳定。结论重建的分子系统发育树客观地阐明了中国按蚊属按蚊亚属各种团及蚊种之间的亲缘关系,序列具有足够的信息贡献量。 展开更多
关键词 按蚊属 按蚊亚属 核糖体DNA第2转录间隔 系统发育
基于ITS2序列的藁本与常见混伪品的分子鉴定 预览 被引量:8
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作者 高婷 姚辉 陈士林 《世界科学技术:中医药现代化》 2011年第2期418-423,共6页
本文对药材藁本及其常见混伪品的rDNA ITS2进行了PCR扩增、测序,并运用MEGA软件对该区进行序列分析,比较了ITS2碱基序列的差异及其规律,同时为药材藁本及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记。结果显示辽藁本的种内差异较小,而与其主... 本文对药材藁本及其常见混伪品的rDNA ITS2进行了PCR扩增、测序,并运用MEGA软件对该区进行序列分析,比较了ITS2碱基序列的差异及其规律,同时为药材藁本及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记。结果显示辽藁本的种内差异较小,而与其主要混伪品间存在较大的变异,差异性范围为5.7%~35.3%。根据ITS2序列特征构建的系统树,药材藁本的样品紧密的聚在一起,和其混伪品可以明确区分,支持率为100%。此外,ITS2的二级结构可作为鉴定药材藁本及混伪品种的一个方法,具有一定的系统学及分类学意义。本研究表明rDNA ITS2序列分析可作为药材藁本与混伪品的一种有效的分子鉴定方法,具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 藁本 混伪品 核糖体DNA第二转录间隔(rDNA ITS2)
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砀山梨炭疽病病原鉴定及其抑菌药剂筛选 预览 被引量:41
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作者 吴良庆 朱立武 +3 位作者 衡伟 叶振风 刘刚 史苏湘 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期3750-3758,共9页
【目的】明确近年来严重危害砀山梨的炭疽病病原菌种类,研究常用杀菌剂对致病菌菌丝生长、分生孢子萌发的抑制作用。【方法】对6个取自不同梨品种上的病果、病叶样本分别进行发病组织培养、单孢分离纯化,根据病原菌的形态特征和致病性,... 【目的】明确近年来严重危害砀山梨的炭疽病病原菌种类,研究常用杀菌剂对致病菌菌丝生长、分生孢子萌发的抑制作用。【方法】对6个取自不同梨品种上的病果、病叶样本分别进行发病组织培养、单孢分离纯化,根据病原菌的形态特征和致病性,并结合其rDNA-ITS序列分析,进行病原菌种类鉴定。采用常用杀菌剂分别对病原菌菌丝和分生孢子进行处理,观测其化学抑制效果。【结果】从不同病斑上分离出了6个纯化菌株,其形态特征相同,且与已报道的炭疽病菌(Colletotrichum spp.)形态特征相似;用上述纯培养菌株接种于健康果实和叶片上,又引起与田间原标本相同的病害症状;通过病原菌rDNA-ITS克隆测序、BLASTn比对分析,6个菌株为同一致病菌,且该致病菌与台湾枣(Taiwan jujube)炭疽菌株(Colletotrichum sp.EXMQ-1;登录号FJ233185)、日本超市水果(Japanese fruit)炭疽菌株(Glomerella cingulata;登录号AB219012)和凤梨草莓(Fragaria ananassa)炭疽菌株(C.gloeosporioides;登录号EU200455)的rDNA-ITS序列一致;430g·L-1戊唑醇水悬浮剂等7种杀菌剂对病原菌菌丝生长抑制率达100%;70%代森锰锌可湿性粉剂等8种药剂处理,病原菌分生孢子萌发率为0。【结论】危害砀山梨的炭疽病病原菌为半知菌亚门刺盘孢属的胶胞炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides),其有性阶段为围小丛壳(Glomerella cingulata)。常用药剂对该菌菌丝和分生孢子的抑制作用存在着显著的差异。 展开更多
关键词 砀山梨 炭疽病 核糖体DNA转录间隔 抑菌药剂
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