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龙胆族(龙胆科)分类与进化研究进展 预览
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作者 孙姗姗 付鹏程 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期363-370,共8页
龙胆是著名的高山植物,广布世界温带地区,不仅可作药用,也可用于园艺观赏。龙胆科分为6个族,其中龙胆族占龙胆科物种数的一半以上;龙胆族包括龙胆亚族和獐牙菜亚族,分类与进化方面的相关研究众多。随着分子生物学在龙胆族研究中的应用,... 龙胆是著名的高山植物,广布世界温带地区,不仅可作药用,也可用于园艺观赏。龙胆科分为6个族,其中龙胆族占龙胆科物种数的一半以上;龙胆族包括龙胆亚族和獐牙菜亚族,分类与进化方面的相关研究众多。随着分子生物学在龙胆族研究中的应用,近些年对多个类群进行了研究并发表了多个新属和新种。该文从属间和属内两个层次梳理了龙胆族近年来在分类和进化研究中的最新进展,总结了新发表的类群。并分析了现存的问题,重点强调在今后的研究中用特别注意以下几点:(1)形态性状的准确掌握对龙胆族的研究至关重要;(2)发表新类群应当谨慎;(3)单拷贝核基因有助于解析龙胆族复杂的系统发育关系;(4)关注杂交和多倍化等在龙胆族进化中的作用。 展开更多
关键词 龙胆 龙胆 分类学
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基于RAD-seq技术的异型花SSR信息分析 预览 被引量:2
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作者 王久利 朱明星 +2 位作者 徐明行 陈世龙 张发起 《植物研究》 CSCD 北大核心 2017年第3期447-452,460共7页
用RAD-seq(restriction-siteassociatedDNAsequencing)对异型花(Sinoswertiatetraptera(Maxiowicz)T.N.Ho,S.W.Liu&J.Q.Liu)进行简化基因组测序,并借此分析异型花的SSR(simplesequencerepeats)信息。利用sRsearch软件... 用RAD-seq(restriction-siteassociatedDNAsequencing)对异型花(Sinoswertiatetraptera(Maxiowicz)T.N.Ho,S.W.Liu&J.Q.Liu)进行简化基因组测序,并借此分析异型花的SSR(simplesequencerepeats)信息。利用sRsearch软件甄别所得序列中的SSR,得到了双端各有至少100bp的SSR位点5844个,其中5339个(91.38%)成功设计引物,而三核苷酸SSR位点最多(3323个);在能成功设计引物的SSR位点中,重复序列长度包括17种(12~36bp);重复序列的基序共277种,其中五核苷酸基序种类最多(106种);随机挑选10对SSR引物,用4个异型花居群的32个个体检测检测其可用性和多态性,经PCR和聚丙烯酰氨凝胶电泳检测,有4对(ST2、ST3、ST6和ST10)成功扩增并表现出多态性;经GENEPOP4.4对4个位点分析,显示其等位基因数量均值为6,多态性较高且不连锁(P〈0.01);4个位点在多数居群中偏离哈迪温伯格平衡(P〈0.01)且存在较高的纯合子数量(观测杂合度均值0.023),该结果归因于异型花主要进行自花授粉,在自然界中很难形成进行自由交配的居群;此外,ST2和ST6可在椭圆叶花锚(HaleniaellipticaD.Don)中成功扩增,具有潜在通用性。本研究将为日后基于异型花SSR标记的相关研究提供数据库支持。 展开更多
关键词 RAD-seq 简化基因组测序 异型花 SSR
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基于ITS和matK序列的獐牙菜亚族(龙胆科龙胆族)分子系统学 被引量:3
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作者 郗厚诚 孙瑶 薛春迎 《植物分类与资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期145-156,共12页
为探讨獐牙菜亚族(subtribeSwertiinae)各属之间和一些属内的系统关系,本研究选取了该亚族14属68种1变种,采用最大简约法(maximumparsimony)和贝叶斯法(Bayesianinference)对样品核基因ITS和叶绿体基因m叫K的两个片段进行独立... 为探讨獐牙菜亚族(subtribeSwertiinae)各属之间和一些属内的系统关系,本研究选取了该亚族14属68种1变种,采用最大简约法(maximumparsimony)和贝叶斯法(Bayesianinference)对样品核基因ITS和叶绿体基因m叫K的两个片段进行独立和联合分析。结果显示:Bartonia位于亚族的最基部;喉毛花属(Comastom0)、肋柱花属(Lomatogonium)和假龙胆属(Gentianella)都非单系,处于同一个较为进化的分支中;獐牙菜属折皱组(Swertiasect,Rugosa)和獐牙菜组(S.sect.Swertia)亲缘关系最近,宽丝组(S.sect.P/atynemⅡ)和藏獐牙菜组(S.seat.Kingdon—Wardia)亲缘关系最近;口药花属(Jaeschkea)与獐牙菜属多枝组(S.sect.Ophelia)的大籽獐牙菜(S.macrosperma)亲缘关系最近。同时讨论了獐牙菜亚族形态分类与分子数据不一致的原因。 展开更多
关键词 系统学 ITS MATK 龙胆科
獐牙菜亚族植物DNA条形码研究 预览 被引量:7
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作者 孙瑶 郗厚诚 薛春迎 《华中师范大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2013年第4期551-557,共7页
为准确鉴定獐牙菜亚族植物(包含常用藏药"蒂达"(藏茵陈))的基原植物,实现对贮藏药材的标准化鉴别.本研究利用核基因ITS片段和叶绿体rbcL、mat K和trnH-psbA片段对獐牙菜亚族25种50个个体进行DNA条形码研究,结合4个候选条形码及其... 为准确鉴定獐牙菜亚族植物(包含常用藏药"蒂达"(藏茵陈))的基原植物,实现对贮藏药材的标准化鉴别.本研究利用核基因ITS片段和叶绿体rbcL、mat K和trnH-psbA片段对獐牙菜亚族25种50个个体进行DNA条形码研究,结合4个候选条形码及其组合的种内、种间距离分布及物种鉴别率评价其在獐牙菜亚族植物中的应用效果.结果表明:核基因ITS片段不仅在单片段中鉴别率最高(80%),包含ITS片段的候选条形码组合的物种鉴别率均为100%,考虑mat K+ITS组合对种子植物的物种鉴别效果更好,推荐双条形码组合mat K+ITS为獐牙菜亚族植物的标准条形码. 展开更多
关键词 DNA条形码 TRNH-PSBA ITS MATK RBCL
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