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烟草BELL基因家族鉴定及其温室条件下的表达模式分析 认领
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作者 宋卫娜 赵森森 +6 位作者 武明珠 王根发 罗朝鹏 王晨 李泽锋 杨军 王中 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期1-11,共11页
BELL基因是植物中普遍存在的一类基因,其编码的同源异型结构域转录因子参与调控了植物叶片、花序等多个组织的发育过程。为明确烟草BELL基因的结构和功能,通过同源序列比对和功能域分析鉴定了普通烟草BELL基因,结合系统进化和基因表达... BELL基因是植物中普遍存在的一类基因,其编码的同源异型结构域转录因子参与调控了植物叶片、花序等多个组织的发育过程。为明确烟草BELL基因的结构和功能,通过同源序列比对和功能域分析鉴定了普通烟草BELL基因,结合系统进化和基因表达模式分析对烟草BELL基因的功能进行了初步预测。结果表明,从普通烟草基因组中共鉴定出28个NtBELLs基因,分布于15条不同的染色体上。系统进化分析表明,烟草NtBELLs基因可分为4组,每组参与调控烟草不同的发育过程。NtBELLs基因在6个烟草组织中呈现不同的表达模式,且具有明显的组织特异性。干旱和盐胁迫能显著诱导部分NtBELLs基因的表达,表明该基因家族可能参与了植物抵御非生物胁迫的过程。 展开更多
关键词 烟草 BEL1-like基因家族 基因结构 系统发育 基因表达
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中国卫氏并殖吸虫线粒体基因组及多地域株的系统发育分析 认领
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作者 顾梦杰 黄文铃 +2 位作者 李友松 董惠芬 赵琴平 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期28-35,53共9页
目的对福建省大、小囊蚴来源的两型卫氏并殖吸虫线粒体基因组序列进行比较和系统发育分析,探寻其可能存在的与表型相关的遗传特征。方法以在福建省南平市延平区太平镇溪蟹中分离出的两种大小不同的囊蚴(直径分别为380~420μm和320~340... 目的对福建省大、小囊蚴来源的两型卫氏并殖吸虫线粒体基因组序列进行比较和系统发育分析,探寻其可能存在的与表型相关的遗传特征。方法以在福建省南平市延平区太平镇溪蟹中分离出的两种大小不同的囊蚴(直径分别为380~420μm和320~340μm)分别感染犬,收集犬粪及肺部虫卵及成虫。比较两种来源虫卵大小及外形差异;抽提两型并殖吸虫成虫基因组DNA,扩增并获得线粒体全基因组序列,进行序列结构及系统发育关系分析。结果大、小囊蚴分别感染犬后,所获得的成虫体肥厚,具口、腹吸盘,腹吸盘位于体中线稍前,可见睾丸、卵巢和卵黄腺等结构,固定后呈椭圆形,长宽比约为1.7∶1。两组卵在长、宽上均有显著性差异,大囊蚴感染后所获虫卵亦较大。两组成虫和卵形态特征及ITS2基因序列符合卫氏并殖吸虫特征。成虫线粒体基因组序列分析显示,大、小囊蚴来源的成虫线粒体基因组蛋白编码区序列基本一致,主要差异区域位于前非编码区。滑动窗口分析显示,不同地域来源的卫氏并殖吸虫线粒体基因组间,多态性最大区域位于ND4基因内。系统发育分析表明,两型并殖吸虫均聚入卫氏并殖吸虫中国地域分支,与韩国/日本株关系较近,与(东)南亚株遗传距离较远。结论中国福建大、小囊蚴来源的两型卫氏并殖吸虫在线粒体基因组水平上遗传距离较近,未表现出明显分化,但非编码区突变和结构变化可能影响了两者在表型上的差异。此外,线粒体各编码基因的进化速率存在明显差异,提示在进行系统发育等相关研究时,应注意选择合适的分子标记。 展开更多
关键词 卫氏并殖吸虫 线粒体基因组 表型 遗传分化 系统发育
真菌化石研究进展 认领
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作者 陶欣 陈双林 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期211-222,共12页
随着真菌化石被不断发现,利用化石中的真菌研究真菌类群的起源和进化历程逐渐成为真菌进化生物学研究的一个热点。真菌化石还是研究古生态中真菌与其他生物之间相互作用的重要材料,而这种相互作用既能用于研究古生物间的协同进化,也能... 随着真菌化石被不断发现,利用化石中的真菌研究真菌类群的起源和进化历程逐渐成为真菌进化生物学研究的一个热点。真菌化石还是研究古生态中真菌与其他生物之间相互作用的重要材料,而这种相互作用既能用于研究古生物间的协同进化,也能成为判断古生态、古气候的重要依据。本文综述了国内外真菌化石的研究进展,旨在为更加系统准确地确定不同真菌类群的分化时间,重建真菌的系统发育树提供参考,同时也为研究生物间相互作用以及推断古生态环境提供帮助。 展开更多
关键词 真菌化石 进化 系统发育 古生态
多脉铁木叶绿体基因组的序列特征和系统发育 认领
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作者 蒋明 柯世省 王军峰 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期60-68,共9页
【目的】多脉铁木是中国特有种,为浙江省珍稀濒危野生植物和极小种群保护对象。在浙江,多脉铁木的野生植株数量极其稀少,低龄个体极少,种群面临衰退。叶绿体基因组在进化过程中相对保守,可为亲缘关系分析和系统发育研究提供有用信息。... 【目的】多脉铁木是中国特有种,为浙江省珍稀濒危野生植物和极小种群保护对象。在浙江,多脉铁木的野生植株数量极其稀少,低龄个体极少,种群面临衰退。叶绿体基因组在进化过程中相对保守,可为亲缘关系分析和系统发育研究提供有用信息。本研究在组装叶绿体基因组的基础上,对序列特征进行分析,以明确多脉铁木叶绿体基因组的大小、结构和基因组成等信息;通过系统发育分析,明确其与近缘种的关系和分类地位。【方法】利用CTAB法提取多脉铁木的基因组DNA,并构建测序文库,用HiSeq X Ten进行高通量测序,策略为双端测序;借助NovoPlasty组装叶绿体基因组;用PCR方法克隆边界序列并进行测序验证;SSR的检测采用MISA软件;利用PhyML 3.0构建系统发育树。【结果】去除接头和低质量的序列,共得到19869412条clean reads。序列组装结果表明,多脉铁木叶绿体基因组的全长为159583 bp,具一个典型的四分体结构,大单拷贝区、小单拷贝区及反向重复序列的长度分别为88514、18953、26058 bp。多脉铁木叶绿体基因组中共有131个基因,其中蛋白编码基因85个、tRNA基因36个、rRNA基因8个,其中的ycf1和ycf15为假基因,它们的序列长度均短于正常基因。多脉铁木叶绿体基因组上共有58个SSR,其中单碱基重复有53个。序列比对结果表明,多脉铁木与天目铁木的相似性最高,达99.1%,与铁木的相似性最低,为98.7%。构建系统发育树的最佳模型为GTR+G+I,其中的AIC(赤池信息标准)和BIC(贝叶斯信息标准)分别为556643.62964和556954.64207。系统发育分析结果表明,12种植物在发育树上可分为两大组,桦木族的日本桤木和红桤木聚为一组,榛族的10种植物聚于另一组;多脉铁木与铁木属其他3个种聚于同一分支,支持率均为100%。【结论】在高通量测序的基础上,组装完成多脉铁木的叶绿体基因组,它与天目铁木、毛果铁木和 展开更多
关键词 多脉铁木 叶绿体基因组 组装 系统发育
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系统基因组学解码反刍动物的演化 认领
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作者 陈垒 王文 《科学》 2020年第2期1-4,共4页
诸如水牛、牦牛、绵羊、山羊等反刍动物不但与人类生活密切相关,也是进化生物字研究的重要对象.其丰富多彩的物种之间有何亲缘关系.它们适应不同环境的能力背后有着什么祥的遗传物质基础.最新的系统基因组学技朮将从分子层面解开其神秘... 诸如水牛、牦牛、绵羊、山羊等反刍动物不但与人类生活密切相关,也是进化生物字研究的重要对象.其丰富多彩的物种之间有何亲缘关系.它们适应不同环境的能力背后有着什么祥的遗传物质基础.最新的系统基因组学技朮将从分子层面解开其神秘的面纱。 展开更多
关键词 反刍动物 基因组 演化 测序 系统发育
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基于叶绿体基因组探讨地黄属及其近缘类群的系统发育关系 认领
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作者 肖建加 王雪芹 +2 位作者 李超琼 刘红占 陈粉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期2527-2533,共7页
利用叶绿体基因组序列对地黄属及其近缘类群的系统发育关系进行研究。基于GenBank公共数据库,下载地黄属及相关类群的叶绿体全基因组序列52条(50个物种),包括广义玄参科物种23种、近缘类群17种和外类群8种(木犀科和苦苣苔科),分别采用... 利用叶绿体基因组序列对地黄属及其近缘类群的系统发育关系进行研究。基于GenBank公共数据库,下载地黄属及相关类群的叶绿体全基因组序列52条(50个物种),包括广义玄参科物种23种、近缘类群17种和外类群8种(木犀科和苦苣苔科),分别采用最大似然法及贝叶斯推断进行系统发育分析。结果表明,叶绿体全基因组数据能够显著提高系统发育分析的支持率;广义玄参科不是一个单系;除外类群外,我们共得到5个分支,分别为列当科、泡桐属、肉果草属、玄参属、车前科。地黄属形成一个单系,为列当科其它属的基部类群。列当科内物种间叶绿体基因组大小及所包含的基因数目均差异显著。本研究结果支持APG系统对相关科属的处理,包括将婆婆纳属、腹水草属、毛地黄属从广义玄参科移出至车前科;火焰草属、钟萼草属、马先蒿属、地黄属移出至列当科;泡桐属独立为泡桐科。 展开更多
关键词 地黄属 叶绿体基因组 系统发育
鸟类SLC2A4基因及其编码蛋白GLUT4分子进化分析 认领
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作者 刘刚 李清月 +1 位作者 汪冲 刘晓颖 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期29-32,共4页
鸟类需要高效的血糖调节机制来维持飞翔时所需要的大量能量,SLC2A4基因及其表达产物GLUT4是细胞吸收葡萄糖的重要转运蛋白,该基因对鸟类飞翔中的能量利用具有重要意义。从GenBank中下载了17种鸟类SLC2A4基因序列进行分析,发现该基因的... 鸟类需要高效的血糖调节机制来维持飞翔时所需要的大量能量,SLC2A4基因及其表达产物GLUT4是细胞吸收葡萄糖的重要转运蛋白,该基因对鸟类飞翔中的能量利用具有重要意义。从GenBank中下载了17种鸟类SLC2A4基因序列进行分析,发现该基因的长度、碱基组成均具有较高的变异性;生物信息学分析显示GLUT4的信号肽剪切位点在氨基酸序列的第11位与57位之间,蛋白质分子具有亲水性,不存在跨膜结构且具有较多的O-糖基化位点;对基因的选择压力分析表明,突胸总目鸟类具有明显的正选择效应,而平胸总目鸟类具有纯化选择作用。采用最大似然法和贝叶斯法进行分析,系统发育分析结果显示系统发育树分为两枝:平胸总目分为第一枝,包括Struthioniformes、Apterygiformes和Tinamiformes 3个目;突胸总目构成第二枝,即Galliformes、Anseriformes、Columbiformes和Passeriformes,结果与形态学分类类似且获得了较高的支持率。研究结果将为鸟类的GLUT4进化研究提供有用的信息。 展开更多
关键词 SLC2A4基因 GLUT4 序列特征 进化速率 系统发育
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中国叶蝉寄生蜂的研究进展 认领
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作者 苑晓伟 袁周伟 +1 位作者 谭超 宋月华 《贵州农业科学》 CAS 2020年第1期63-68,共6页
叶蝉类害虫是最重要的农业害虫之一,可传播植物病毒病,危害多种经济作物,对农业生产造成严重经济损失;寄生蜂种类和数量极多,已报道的种类超过12万种,寄主范围广,可寄生某一虫态或几个虫态害虫,利用寄生蜂特别是卵寄生蜂防治叶蝉类害虫... 叶蝉类害虫是最重要的农业害虫之一,可传播植物病毒病,危害多种经济作物,对农业生产造成严重经济损失;寄生蜂种类和数量极多,已报道的种类超过12万种,寄主范围广,可寄生某一虫态或几个虫态害虫,利用寄生蜂特别是卵寄生蜂防治叶蝉类害虫,具有较好的绿色防控效果。为寄生蜂资源的开发利用及同类研究奠定理论基础与提供借鉴参考,从叶蝉寄生蜂的多样性、分子鉴定、遗传多样性和多样性的影响因素等方面对中国叶蝉寄生蜂的研究进展进行了概述,并对今后的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 寄生蜂 叶蝉 生物多样性 系统发育 分子鉴定 绿色防控
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杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析 认领
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作者 路东晔 张磊 +1 位作者 张国盛 郝蕾 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2020年第2期87-94,101共9页
【目的】获取杨柳科叶绿体基因组的结构及序列特征,揭示杨柳科植物的系统发育关系。【方法】利用Excel和本地Blast,分析统计杨柳科已公布的23种植物叶绿体基因组大小、结构组成、基因数量、排列顺序及内含子等信息;同时基于55个共有单... 【目的】获取杨柳科叶绿体基因组的结构及序列特征,揭示杨柳科植物的系统发育关系。【方法】利用Excel和本地Blast,分析统计杨柳科已公布的23种植物叶绿体基因组大小、结构组成、基因数量、排列顺序及内含子等信息;同时基于55个共有单拷贝蛋白编码基因,采用NJ法进行系统发育分析。【结果】杨柳科23种植物叶绿体基因组大小在155~159 kb,主要由大单拷贝区(LSC)长度差异引起。各物种基因排列顺序基本一致,均为2个IRs和2个SCs的典型四元组合结构,4个边界主要位于rpl22、ycf1、rps19基因处。psbZ、ycf15、lhbA、infA、trnK、trnG、trnL、trnV、trnI、trnA等基因存在缺失现象,引起基因数量差异。内含子在细胞色素复合物(petB)基因、RNA聚合酶(rpoC2)基因和核糖体蛋白(rpl2)基因等内发生结构变异,引起基因长度差异。系统进化分析结果表明,杨树聚类为4个高支持率进化支,钻天柳等7种柳树分为2个进化支。【结论】叶绿体基因组支持杨属、柳属独立进化,为杨柳科系统分类和系统发育提供了分子证据。 展开更多
关键词 杨柳科 叶绿体基因组 基因组结构变异 系统发育
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苏铁属植物的研究与保护 认领
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《云南林业》 2020年第1期36-41,共6页
苏铁类植物自二叠纪晚期以来在地球植被更替和演化过程中扮演了重要的角色,在历史上经历了漫长的兴衰过程。经过系列的气候变化和地质变迁,大部分苏铁类植物已经灭绝,仅剩少部分类群残存分布在热带和亚热带的一些区域(Osborne,2002)o在... 苏铁类植物自二叠纪晚期以来在地球植被更替和演化过程中扮演了重要的角色,在历史上经历了漫长的兴衰过程。经过系列的气候变化和地质变迁,大部分苏铁类植物已经灭绝,仅剩少部分类群残存分布在热带和亚热带的一些区域(Osborne,2002)o在系统发育上,现存苏铁类植物与银杏互为姐妹群,是整个裸子植物的最早分支(Wu et al.,2013;Li et al.,2017),对研究种子植物的起源与早期演化具有极为重要的价值。 展开更多
关键词 苏铁类植物 地质变迁 种子植物 起源与早期演化 系统发育 姐妹群 裸子植物 气候变化
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基于18S rDNA、rbcL和atpB序列的轮藻科植物的系统发育研究 认领
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作者 任玲萱 方琰 +3 位作者 孙双 白欢 卿人韦 兰利琼 《四川大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期605-611,共7页
为找到适宜用于轮藻科植物系统发育研究的分子片段,对本研究所选轮藻进行18S rDNA、rbcL、atpB及18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合序列的多样性分析,并通过构建系统进化树的方法,开展系统发育研究.结果表明,18S rDNA序列较适宜用于研究轮... 为找到适宜用于轮藻科植物系统发育研究的分子片段,对本研究所选轮藻进行18S rDNA、rbcL、atpB及18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合序列的多样性分析,并通过构建系统进化树的方法,开展系统发育研究.结果表明,18S rDNA序列较适宜用于研究轮藻科下两个族和各属间的分类问题,但进一步对属内轮藻进行分类需要借助变异程度更高的序列;rbcL、atpB序列变异程度高于18S rDNA序列,但两者不适宜单独用于轮藻科植物的系统发育研究;三基因联合序列的种间、种内遗传距离有一定差异,种间遗传距离(0.002~0.097)大于种内遗传距离(0~0.001),且所得进化树的拓扑结构与传统形态学分类结构一致,属内轮藻分类不再混乱,进化树呈现良好的拓扑结构.综上所述,18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合分析后可将形态近似的轮藻分开,解决本研究选取的轮藻科植物的分类问题. 展开更多
关键词 轮藻科 系统发育 18S RDNA RBCL ATPB
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高原上的精灵 认领
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作者 金牛 《绿色天府》 2020年第3期62-63,共2页
在遥远的内蒙高原上,生活着一群别致的植物群落,虽然没有玫瑰的芳香,没有杜鹃的美丽,也没有青松白桦的高大,但它们却不畏艰险、困苦,在茫茫荒漠之中傲然挺立着,冲击在我国荒漠化治理的第一线。那就是高原上的精灵——革苞菊。革苞菊是... 在遥远的内蒙高原上,生活着一群别致的植物群落,虽然没有玫瑰的芳香,没有杜鹃的美丽,也没有青松白桦的高大,但它们却不畏艰险、困苦,在茫茫荒漠之中傲然挺立着,冲击在我国荒漠化治理的第一线。那就是高原上的精灵——革苞菊。革苞菊是独属于内蒙高原植物区的特有种,仅分布于内蒙海拔1000m~1200m的荒漠地带,形成小群聚;伴生种为小针茅Stipa klemenzii Rooshev.,为强旱生植物。不仅为我国荒漠化的治理做出杰出贡献还对研究亚洲中部植物区系和菊科植物的系统发育有一定的科学意义。 展开更多
关键词 革苞菊 系统发育 植物区系 旱生植物 菊科植物 高原植物 特有种 荒漠化治理
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青海省樱桃叶斑病病原菌的分离与鉴定 认领
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作者 刘俏 宁楠楠 +1 位作者 马永强 郭青云 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期48-55,71共9页
为明确引起青海省樱桃叶斑病病原菌的种类,本研究从西宁市城北区、海东市乐都区和贵德县的樱桃上采集有叶斑症状的叶片,采用组织分离法分离出病原菌,通过观察病原菌的形态特征,结合rDNA-ITS、EF-1α和Alt a 1基因序列分析对病原菌的种... 为明确引起青海省樱桃叶斑病病原菌的种类,本研究从西宁市城北区、海东市乐都区和贵德县的樱桃上采集有叶斑症状的叶片,采用组织分离法分离出病原菌,通过观察病原菌的形态特征,结合rDNA-ITS、EF-1α和Alt a 1基因序列分析对病原菌的种类进行了鉴定,并用柯赫氏法则进行验证。结果表明,共获得279株病原菌菌株,分属链格孢Alternaria alternata、细极链格孢A.tenuissima和刺盘孢属Colletotrichum spp.,分离频率分别为84.95%、5.02%和10.03%。采用柯赫氏法则进行离体叶片致病性测定,接种叶片100%发病,说明引起青海省樱桃叶斑病的病原菌为链格孢、细极链格孢和刺盘孢属真菌,且链格孢为主要病原菌。该研究结果可为青海省樱桃叶斑病的综合防治提供理论依据。 展开更多
关键词 樱桃 叶斑病 链格孢属 刺盘孢属 ALT a 1基因 系统发育
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贵州威宁红花油茶的叶绿体基因组特征分析 认领
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作者 李倩 郭其强 +1 位作者 高超 李慧娥 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期779-787,共9页
对威宁红花油茶(Camellia weiningensis)的叶片高通量测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析。其叶绿体全基因组长为156490 bp,包含典型的四分体结构,序列已登录GenBank(MK820035)。叶绿体全基因组比较分析表明,与其他山茶属物种... 对威宁红花油茶(Camellia weiningensis)的叶片高通量测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析。其叶绿体全基因组长为156490 bp,包含典型的四分体结构,序列已登录GenBank(MK820035)。叶绿体全基因组比较分析表明,与其他山茶属物种一样,其结构与基因排序均保守,但在基因组的反向重复区边界处表现出明显区别。简单重复序列(SSR)分析表明,全基因组仅包含51个单核苷酸重复的SSR,且仅为A/T重复类型。系统发育分析表明,威宁红花油茶与腾冲红花油茶亲缘关系最近,但其所处分支包含的4个山茶属物种的分组与传统分类不一致。 展开更多
关键词 威宁红花油茶 叶绿体基因组 系统发育
鸡蛔虫黄山市分离株的形态学和分子特征分析 认领
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作者 饶天宇 申夕 +2 位作者 朱志伟 许薇 赵金红 《热带病与寄生虫学》 2020年第2期87-92,共6页
目的通过对鸡蛔虫的形态学和分子特征分析,进一步明确鸡蛔虫的分类地位。方法对分离自安徽省黄山市的鸡蛔虫分离株在光学显微镜和扫描电子显微镜下分别进行形态学上的观察;PCR扩增鸡蛔虫COⅠ、ITS基因,分别利用其核苷酸序列构建鸡蛔虫... 目的通过对鸡蛔虫的形态学和分子特征分析,进一步明确鸡蛔虫的分类地位。方法对分离自安徽省黄山市的鸡蛔虫分离株在光学显微镜和扫描电子显微镜下分别进行形态学上的观察;PCR扩增鸡蛔虫COⅠ、ITS基因,分别利用其核苷酸序列构建鸡蛔虫与其他线虫的系统发育分析树。结果形态学观察鸡蛔虫死后固定虫体呈乳白色,雌虫的尾部尖直而雄虫的尾部卷曲。虫体头部唇瓣3个,大小几乎相等;雄虫尾部具有乳突10对;所获得的鸡蛔虫COⅠ和ITS基因序列长度分别为655 bp和1034 bp;鸡蛔虫黄山市分离株与其他国家/地区的鸡蛔虫参考株同源性很高,COⅠ最高达100%,ITS最高达99.9%,并与其他鸡蛔虫在系统发育树上聚集在同一支系。结论鸡蛔虫的形态学和分子特征分析可为鸡蛔虫的鉴定以及鸡蛔虫病的防控奠定理论基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 形态特征 分子特征 系统发育
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河北省葡萄座腔菌科菌物系统分类研究 认领
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作者 王庆灵 于贵朋 +2 位作者 邢军超 崔建州 赵嘉平 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期17-28,共12页
【目的】葡萄座腔菌科菌物是引起众多经济及生态造林树种枝干溃疡、枝枯类病害的病原生物,在世界各地均有广泛的分布。本研究对河北省内,与经济林木病害相关的葡萄座腔菌科菌物进行系统分类研究,目的在于揭示该科菌物在特定地区的地理... 【目的】葡萄座腔菌科菌物是引起众多经济及生态造林树种枝干溃疡、枝枯类病害的病原生物,在世界各地均有广泛的分布。本研究对河北省内,与经济林木病害相关的葡萄座腔菌科菌物进行系统分类研究,目的在于揭示该科菌物在特定地区的地理分布特征,明确该类菌物所致树木枝干溃疡、枝枯类病害的寄主植物范围,为河北省树木溃疡、枝枯类病害的控制提供理论依据。【方法】在对河北省树木溃疡类病害系统调查的基础上,本研究根据菌物无性型及有性型的形态学特征、rDNA-ITS序列特征对包括河北省石家庄在内的8个市(县、区)25个不同地点的葡萄座腔菌科菌物进行分类鉴定和系统分类。【结果】共获得葡萄座腔菌科菌物5种73株,分别属于Botryosphaeria dothidea、B.stevensii、B.obtusa、B.sarmentorum和Phyllosticta citrichinaensis。其中B.dothidea为河北省葡萄座腔菌科优势菌物种,占全部检出菌物菌株总数的77%。葡萄座腔菌科菌物侵染杨树、柳树、苹果、核桃等28种植物,其中包括大叶黄杨、构树、火炬树、连翘、花椒和刺梅等6种新寄主植物。【结论】B.dothidea不仅危害杨树等传统寄主,而且危害花椒等新寄主植物以及入侵树种火炬树,是危害河北省树木健康生长的最为重要、分布最为广泛的枝干病原菌物,有必要对其溃疡致病性分化和种群遗传分化进行深入分析。来自柿树、花椒等寄主的10个具有Dothiorella型分生孢子的菌株形成单系类群,提示这些菌株可能是与B.sarmentorum和B.iberica不同的一个系统发育学新种。 展开更多
关键词 树木溃疡病 分类学 系统发育 葡萄座腔菌 葡萄座腔菌科
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依据COI基因及形态特征鉴定蛀害红松和樟子松的梢斑螟 认领
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作者 卢孟 解丹 +1 位作者 宋效惠 迟德富 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期83-87,共5页
为确定危害黑龙江地区红松(Pinus koraiensis)、樟子松(P.sylvestris var.mongolica)树干及侧枝的梢斑螟属(Dioryctria)昆虫种类,通过比对幼虫毛序、成虫外部形态及外生殖器特征对其进行鉴定。同时,利用分子生物学技术辅助鉴定,依据线粒... 为确定危害黑龙江地区红松(Pinus koraiensis)、樟子松(P.sylvestris var.mongolica)树干及侧枝的梢斑螟属(Dioryctria)昆虫种类,通过比对幼虫毛序、成虫外部形态及外生殖器特征对其进行鉴定。同时,利用分子生物学技术辅助鉴定,依据线粒体COI基因计算样本与其他梢斑螟种类间的遗传距离,分别构建ML树和NJ树,以确定其系统发育关系。结果显示:样本的形态特征与赤松梢斑螟(D.sylvestrella)相同;样本的COI基因序列相似度较高,且种群间存在共享单倍型(Hap3);样本与在GenBank记载的赤松梢斑螟间的遗传距离(0.004)处于种内遗传距离范围(0~0.005),且在系统发育树中与赤松梢斑螟聚为一支。因此,可以确定所鉴定的样本均为赤松梢斑螟。依据COI基因序列的分析结果,能够有效确定物种及分类地位,并且与传统划分结果相吻合,说明COI基因适用于梢斑螟属昆虫的鉴定和系统发育的研究。 展开更多
关键词 赤松梢斑螟 形态特征 COI基因 系统发育
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海参核糖体基因间隔区2(ITS2)的克隆及序列分析 认领
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作者 曾玲 文菁 孙玉林 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期1054-1061,共8页
为探讨刺参科海参和海参科海参的系统进化关系,本研究通过PCR技术获取19种刺参科和海参科海参的ITS2序列,从NCBI上获取瓜参(C. salma)的ITS2序列。结果表明ITS2序列具有长度多态性,从318 bp (绿刺参)到591 bp (白尼参属)。海参属的ITS2... 为探讨刺参科海参和海参科海参的系统进化关系,本研究通过PCR技术获取19种刺参科和海参科海参的ITS2序列,从NCBI上获取瓜参(C. salma)的ITS2序列。结果表明ITS2序列具有长度多态性,从318 bp (绿刺参)到591 bp (白尼参属)。海参属的ITS2序列长度多态性高,ITS2的GC含量从56.7%(糙海参)到70.6%(瓜参)。海参ITS2序列保守性不高,仅有48个保守位点,其余均为变异位点。基于ITS2的系统进化树结果显示进化树主要分成两支,一支包括海参科的4个属:海参属、白尼参属、辐肛参属和格皮氏海参属。辐肛参属和格皮氏海参属为姐妹关系,二者聚在一起后与白尼参属聚为一支,随后再与海参属聚在一起。白尼参属和辐肛参属为单系,海参属为复系。另一支为C. salma和刺参科。梅花参属与刺参属聚为一支后,再与仿刺参属聚在一起,3个属都是单系。在20种海参中,S. naso与B. argus的遗传距离最大(6.415)。刺参属中,S. monotuberculatus和S. horrens遗传距离最近(0.012),海参属中,糙海参与H. fuscopunctata的遗传距离最大(3.24)。本研究为从分子水平上研究海参科和刺参科之间的系统进化关系奠定了基础。 展开更多
关键词 海参 ITS2 遗传距离 系统发育
中国西沙群岛底栖甲藻热带库里亚藻(Coolia tropicalis)的形态学、系统发育及毒性研究 认领
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作者 黄丽芬 李群 +2 位作者 吕颂辉 张亮 谢学东 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期86-97,共12页
库里亚藻(Coolia)是一类广泛分布且具有生物毒性的海洋底栖甲藻。本研究对近年来在中国南海西沙群岛海域采集分离的4株库里亚藻,通过光镜及电镜下的形态学观察,并结合基于核糖体大亚基(large subunit,LSU)rDNA(D1-D3)和内部转录间隔区(i... 库里亚藻(Coolia)是一类广泛分布且具有生物毒性的海洋底栖甲藻。本研究对近年来在中国南海西沙群岛海域采集分离的4株库里亚藻,通过光镜及电镜下的形态学观察,并结合基于核糖体大亚基(large subunit,LSU)rDNA(D1-D3)和内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)的序列进行系统发育分析,鉴定该4个株系为热带库里亚藻(Coolia tropicalis)。在卤虫(Artemia salina)生物毒性试验中,热带库里亚藻不同株系毒素提取液对卤虫幼虫表现出了毒性差异,XS554株系的48h半致死浓度(LC50)为1.42mg·mL^–1(约相当于1.1×10^5cells·mL^–1),5XS15株系的LC50为1.92mg·mL^–1(约相当于1×10^5cells·mL^–1)。 展开更多
关键词 热带库里亚藻 形态学 系统发育 毒性 卤虫
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广西涠洲岛底栖甲藻前沟藻属(Amphidinium)种类的形态学和系统发育学研究 认领
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作者 江丽春 李群 吕颂辉 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期106-115,共10页
本文对采集自我国广西涠洲岛海域潮下带大型海藻及死珊瑚上的附着底栖甲藻样品进行了分析。利用毛细管单细胞分离方法成功分离并培养了多株前沟藻属种类,运用光学显微镜、扫描电镜和分子生物学等技术,对所获得的前沟藻株系进行形态学和... 本文对采集自我国广西涠洲岛海域潮下带大型海藻及死珊瑚上的附着底栖甲藻样品进行了分析。利用毛细管单细胞分离方法成功分离并培养了多株前沟藻属种类,运用光学显微镜、扫描电镜和分子生物学等技术,对所获得的前沟藻株系进行形态学和系统发育分析,鉴定出前沟藻属3个种,分别为具盖前沟藻(Amphidinium operculatum)、玛氏前沟藻(Amphidinium massertii)和强壮前沟藻(Amphidinium caeterae),其中具盖前沟藻和玛氏前沟藻为我国新纪录种。分析比较了不同种类间形态和系统发育的差异,发现3种前沟藻的形态特征大体与相应模式种报道的一致。本研究丰富了我国前沟藻种类多样性和系统发育进化信息,同时将两个新记录种具盖前沟藻和玛氏前沟藻的已知分布范围拓展到了我国南部沿海水域。 展开更多
关键词 涠洲岛 前沟藻 形态学 系统发育
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