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蛋白质组学及其应用研究 预览
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作者 魏东阳 《现代商贸工业》 2019年第16期79-81,共3页
蛋白质组学的概念最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出,细胞、组织或者机体的基因组所表达的全部蛋白就称为蛋白质组学。蛋白质组学是一个研究蛋白质组及大范围蛋白质的分离、分析、应用的学科。它不同于传统的利用生物... 蛋白质组学的概念最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出,细胞、组织或者机体的基因组所表达的全部蛋白就称为蛋白质组学。蛋白质组学是一个研究蛋白质组及大范围蛋白质的分离、分析、应用的学科。它不同于传统的利用生物化学的方法研究单个蛋白质或某一类蛋白,而是在大规模水平上研究体系内全部蛋白质及其动态变化规律。随着学科的发展,蛋白质组学的研究范围也在不断完善和补充,通过查阅大量文献,总结蛋白质组学技术,并研究蛋白组学在生物医学、转基因技术、生物制药技术等领域的。 展开更多
关键词 蛋白质 蛋白质 蛋白质学应用
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用于蛋白质组分析的两种马铃薯块茎蛋白质提取方法的比较 预览
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作者 王润润 王东霞 +4 位作者 张小微 杨巧玲 崔丹丹 张俊莲 程李香 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期89-95,共7页
【目的】进行两种提取方法下马铃薯块茎蛋白质组结果差异分析,并确定最佳马铃薯块茎蛋白质提取方法.【方法】采用酚提取法和三氯乙酸/丙酮沉淀与乙酸铵/甲醇沉淀相结合的两步沉淀法提取马铃薯块茎蛋白质,进行2-DE分离,对差异表达蛋白质... 【目的】进行两种提取方法下马铃薯块茎蛋白质组结果差异分析,并确定最佳马铃薯块茎蛋白质提取方法.【方法】采用酚提取法和三氯乙酸/丙酮沉淀与乙酸铵/甲醇沉淀相结合的两步沉淀法提取马铃薯块茎蛋白质,进行2-DE分离,对差异表达蛋白质进行MALDI-TOF-MS质谱鉴定.【结果】两步沉淀法提取的马铃薯块茎蛋白质较酚提取法获得蛋白质纯度和浓度及蛋白质点数目均明显增加,双向电泳凝胶图谱分辨率较高.质谱鉴定结果表明,两步沉淀法中鉴定的差异表达蛋白质丰度均显著高于酚提取法,并鉴定到一些新出现的蛋白质包括假定的线粒体NAD依赖的苹果酸脱氢酶、酸性磷酸酶类似物和蛋白酶抑制剂II前体类型B.【结论】提取马铃薯块茎蛋白质时两步沉淀法优于酚提取法. 展开更多
关键词 马铃薯 蛋白质提取 蛋白质 双向凝胶电泳 差异表达蛋白质
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适用于蛋白质组分析的粉红单端孢菌蛋白提取方法的建立 预览
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作者 王鹏 王军节 李贞彪 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期209-216,共8页
为了优化一种适用于粉红单端孢菌双向电泳的蛋白质提取方法,以期为蛋白质组学水平研究粉红单端孢菌的致病机制奠定基础。以分离纯化后的粉红单端孢菌为试验材料,分别采用超声-TCA-丙酮、超声-磷酸-TCA-丙酮、超声-SDS、超声-TCA/丙酮-酚... 为了优化一种适用于粉红单端孢菌双向电泳的蛋白质提取方法,以期为蛋白质组学水平研究粉红单端孢菌的致病机制奠定基础。以分离纯化后的粉红单端孢菌为试验材料,分别采用超声-TCA-丙酮、超声-磷酸-TCA-丙酮、超声-SDS、超声-TCA/丙酮-酚/SDS联合抽提和TCA/丙酮-酚/SDS联合抽提等5种方法提取菌体蛋白质,通过对比分析蛋白质含量以及纯度筛选出2种较好的提取方法。在筛选聚丙烯酰胺电泳凝胶浓度的基础上,再通过双向电泳对比分析,得出最佳的蛋白质提取方法。结果表明,12%的聚丙烯酰胺凝胶浓度获得的单向电泳图谱背景清晰且无严重的拖尾现象,超声-TCA/丙酮-酚/SDS联合抽提法获得蛋白样品的质量浓度和含量分别为6.650mg/mL和2.993mg/g,该法提取蛋白通过SDS-PAGE分析条带清晰,双向电泳分析可获得1238个独立清晰的蛋白点。由此可知,超声-TCA/丙酮-酚/SDS联合抽提法获得的粉红单端孢菌体蛋白适合于双向电泳分析及蛋白质组学研究。 展开更多
关键词 粉红单端孢 蛋白质 蛋白质提取 双向电泳
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肺癌患者血浆外泌体蛋白质组分析 预览
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作者 钟荣斌 李捷 +9 位作者 易绍琼 王帅 吴晓洁 靳海荣 王领会 王启伟 郗永义 朱力 林艳丽 王友亮 《生物技术通讯》 CAS 2019年第1期58-62,133共6页
目的:探究肺癌患者与肺部良性结节病人血浆外泌体中蛋白质组的差异。方法:收集肺癌与肺部良性结节病人的术前血浆,随机选取肺腺癌病人血浆15例、肺鳞癌病人血浆10例作为实验组,肺部良性结节病人血浆5例作为对照组,采用超速离心法分离得... 目的:探究肺癌患者与肺部良性结节病人血浆外泌体中蛋白质组的差异。方法:收集肺癌与肺部良性结节病人的术前血浆,随机选取肺腺癌病人血浆15例、肺鳞癌病人血浆10例作为实验组,肺部良性结节病人血浆5例作为对照组,采用超速离心法分离得到外泌体,定量质谱鉴定分析肺癌病人与肺部良性结节病人血浆外泌体蛋白质表达的差异性,SDS-PAGE和蛋白质免疫印迹法检验提取到的蛋白质。结果:共检测到血浆外泌体蛋白质253个,并初步确定其中18个在肺癌病人血浆外泌体中表达上调,8个在肺癌病人血浆外泌体中表达下调,免疫印迹法验证了上调蛋白质中的补体蛋白C4a。结论:鉴定出26个外泌体差异表达蛋白质,为肺癌早期诊断提供了新的候选分子。 展开更多
关键词 肺癌 血浆外泌体 蛋白质 质谱 蛋白质免疫印迹法
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米氏凯伦藻细胞表面膜蛋白质组及其对温度变化的响应研究 预览
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作者 王坤 王沛 +2 位作者 张浩 张树峰 王大志 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期652-663,共12页
米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)近年在我国福建、浙江和广东沿海经常形成赤潮,其赤潮不仅影响到海洋生态系统的稳定,也严重威胁到水产养殖以及人类生命健康安全。本论文以米氏凯伦藻为研究对象,建立了米氏凯伦藻细胞表面膜蛋白质荧光标... 米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)近年在我国福建、浙江和广东沿海经常形成赤潮,其赤潮不仅影响到海洋生态系统的稳定,也严重威胁到水产养殖以及人类生命健康安全。本论文以米氏凯伦藻为研究对象,建立了米氏凯伦藻细胞表面膜蛋白质荧光标记技术和细胞膜蛋白质提取方法,运用荧光差异凝胶电泳技术(2-DDIGE)对膜蛋白质进行了分析,并研究了米氏凯伦藻的膜蛋白质组及其对环境温度变动的响应。实验共鉴定到44个细胞表面膜蛋白,其中有效注释27个,主要为转运蛋白、HSP70蛋白家族和捕光蛋白等。米氏凯伦藻在20℃条件下的细胞生长和光合作用要明显好于16℃和12℃,但16℃和12℃条件下的差别不大,表明低温限制了米氏凯伦藻的生长。当米氏凯伦藻从12℃快速转移至16℃和20℃时,藻细胞密度和光合作用效率短时间迅速降低,但细胞很快即适应温度变化。细胞膜上的转运蛋白和光合作用蛋白在其适应温度变化中起着重要作用。 展开更多
关键词 米氏凯伦藻 温度 蛋白质 蛋白质 差异荧光凝胶电泳技术
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灰盖鬼伞原基发育过程中的蛋白质组变化 预览
6
作者 MAJCHERCZYK Andrzej DORNTE Bastian +2 位作者 SUBBA Shanta ZOMORRODI Mojtaba KUES Ursula 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期37-50,共14页
灰盖鬼伞在25℃以及12 h光照/12h黑暗的环境下形成子实体。子实体最初在黑暗环境下通过大量生产菌丝分支形成初级菌丝结。光照信号触发初级菌丝结开始形成紧密的二级菌丝结。在随后原基发育的5 d中,菌盖和菌柄开始按照不同的光调控模式... 灰盖鬼伞在25℃以及12 h光照/12h黑暗的环境下形成子实体。子实体最初在黑暗环境下通过大量生产菌丝分支形成初级菌丝结。光照信号触发初级菌丝结开始形成紧密的二级菌丝结。在随后原基发育的5 d中,菌盖和菌柄开始按照不同的光调控模式从这些菌丝结中分化,然后在第6天成熟。为了了解菌盖和菌柄组织形成时复杂的细胞过程,提取了原基各期的蛋白质组进行MS/MS质谱分析。结果显示,在不同的样本中检测到大约1672~2663个至少具有2个肽的蛋白,其中1401个蛋白是所有样本共有的,其中包含已知的涉及原基发育的蛋白。 展开更多
关键词 菌丝结 原基 子实体 蛋白质功能 蛋白质 质谱
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基于组学技术的鹿茸生物学研究进展
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作者 刘文媛 巴恒星 李春义 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期3024-3029,共6页
鹿茸是唯一可周期性再生的哺乳动物器官,由软骨、骨、血管、神经及皮肤组织构成。鹿茸再生过程是基于干细胞的增殖和分化,且生长速度极快而不发生癌变。其不仅可作为一种肢体再生的生物医学模型,而且也作为一种研究骨组织生长发育的模... 鹿茸是唯一可周期性再生的哺乳动物器官,由软骨、骨、血管、神经及皮肤组织构成。鹿茸再生过程是基于干细胞的增殖和分化,且生长速度极快而不发生癌变。其不仅可作为一种肢体再生的生物医学模型,而且也作为一种研究骨组织生长发育的模型。现代组学技术快速发展,已普遍应用于生物学的各种领域。利用组学技术,在转录和蛋白质水平上,有力地推动了在分子水平上研究鹿茸生物学的进程。本综述拟对组学技术在鹿茸生物学研究中的应用进行总结回顾,并对未来的发展趋势做进一步展望,为鹿茸生物学的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 鹿茸 转录 MICRORNA 蛋白质
植物质膜蛋白质组学研究进展 预览
8
作者 陈亚琳 谢成建 杨星勇 《江苏农业科学》 2019年第8期7-12,共6页
植物质膜(plasmamembrane,简称PM)是连接细胞内外的活性屏障,而PM蛋白作为PM的重要组成成分之一,对植物细胞膜功能有着重要的作用。植物PM蛋白质组学的研究有利于对PM的功能进行更加深入的探索。本文主要对近几年来在植物PM蛋白质组学... 植物质膜(plasmamembrane,简称PM)是连接细胞内外的活性屏障,而PM蛋白作为PM的重要组成成分之一,对植物细胞膜功能有着重要的作用。植物PM蛋白质组学的研究有利于对PM的功能进行更加深入的探索。本文主要对近几年来在植物PM蛋白质组学的相关研究进行综合性论述,包括其研究方法、功能及其面临的问题等,以期为植物PM蛋白质组学的后续研究以及PM功能的深入探讨提供参考。 展开更多
关键词 PM蛋白 蛋白质 PM蛋白功能 微结构域
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葡萄着色期果皮蛋白质组分析
9
作者 解振强 韩柏明 巫建华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期649-663,共15页
为了研究葡萄不同着色期果皮中蛋白质表达特征,以着色初期、中期和后期等3个着色时期的葡萄果皮为研究对象,运用2-DE、MALDI-TOF/TOF-MS质谱技术以及生物信息学方法对差异蛋白进行分析,结果表明:(1)双向凝胶电泳显示,果皮着色3个时期有1... 为了研究葡萄不同着色期果皮中蛋白质表达特征,以着色初期、中期和后期等3个着色时期的葡萄果皮为研究对象,运用2-DE、MALDI-TOF/TOF-MS质谱技术以及生物信息学方法对差异蛋白进行分析,结果表明:(1)双向凝胶电泳显示,果皮着色3个时期有1050个高度重复的蛋白点,差异显著的蛋白点有162个,其中108个蛋白得到鉴定,有87个蛋白映射到葡萄蛋白质组数据库中;3个时期均表达的差异蛋白有20个,且随着果皮颜色加深,差异蛋白数量呈上升趋势。(2)GO分析显示,ATP合成酶β亚基(ATPβ)极显著富集于磷酸核糖代谢过程,对着色初期果皮生理代谢的能量需求具有重要意义。(3)KEGG分析表明,碳代谢、生物固碳、磷酸戊糖、氨基酸生物合成等代谢通路在果皮着色的不同时期显著富集。(4)qRT-PCR分析显示,S–腺苷甲硫氨酸合成酶基因(VvMETK4)在果皮着色后期表达量最高。 展开更多
关键词 葡萄 果皮 蛋白质 双向电泳
基于Label-free技术分析牛卵泡蛋白质组分及关键调控蛋白 预览
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作者 郝庆玲 景炅婕 +5 位作者 侯淑宁 许冬梅 赵成萍 朱芷葳 吕丽华 李鹏飞 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期983-992,共10页
旨在研究牛卵泡发育过程中蛋白质组表达变化并筛选卵泡发育关键调控蛋白,利用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术对牛卵泡颗粒细胞(granulesa cells,GCs)蛋白质组分进行比较分析。采集牛发情周期优势卵泡(dominant follicles,DF)和... 旨在研究牛卵泡发育过程中蛋白质组表达变化并筛选卵泡发育关键调控蛋白,利用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术对牛卵泡颗粒细胞(granulesa cells,GCs)蛋白质组分进行比较分析。采集牛发情周期优势卵泡(dominant follicles,DF)和从属卵泡(subordinate follicles,SF),分别分离GCs,并提取总蛋白,胰蛋白酶酶解,液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行蛋白质组分分析,数据库检索分析DF和SF中蛋白质表达情况,并应用生物信息学方法筛选牛卵泡发育关键调控蛋白。结果表明:本试验从30321个肽段中共成功鉴定出3409种蛋白质(FDR≤0.01),其中,DF中表达2895种蛋白质,SF中表达3102种蛋白质,获得差异表达蛋白质(差异倍数>2,P<0.05)259种,17种差异表达蛋白质可能与牛卵泡优势化过程相关,SERPINB2可能调控牛卵泡闭锁。该研究筛选获得的牛卵泡差异表达蛋白质和特异表达蛋白质,丰富了牛卵泡发育调控理论,为进一步研究卵泡闭锁及优势化奠定基础。 展开更多
关键词 优势卵泡 从属卵泡 LABEL-FREE 蛋白质
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棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)蛋白质组学及相关肿瘤发生的研究 预览
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作者 郑梦湄 《汉江师范学院学报》 2019年第3期43-49,共7页
棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)是由ShopeRE.在1933发现的首个哺乳动物DNA肿瘤病毒.CRPV感染会引起棉尾兔头颈部腺瘤,使之成为欧美传说“勇士兔”的原型.本篇综述讨论了CRPV的蛋白质组学,以及相关蛋白在肿瘤发生中的作用.CRPV属于乳头瘤病毒家... 棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV)是由ShopeRE.在1933发现的首个哺乳动物DNA肿瘤病毒.CRPV感染会引起棉尾兔头颈部腺瘤,使之成为欧美传说“勇士兔”的原型.本篇综述讨论了CRPV的蛋白质组学,以及相关蛋白在肿瘤发生中的作用.CRPV属于乳头瘤病毒家族,与人类乳头瘤病毒(HPV)存在同源性.CRPV不具封套,由7868个碱基对形成环状双股脱氧核糖核酸,并由衣壳包裹.蛋白质组由非结构性早期调节蛋白和结构性后期蛋白组成,其中早期调节蛋白E7和E2在肿瘤形成和发展中起到关键作用.由于其与HPV的同源性,CRPV在研究乳头瘤病毒感染以及病毒相关的肿瘤学中有广泛应用. 展开更多
关键词 棉尾兔乳头瘤病毒(CRPV) 蛋白质 肿瘤发生
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水稻产量基因网络的初步研究 预览
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作者 王松文 程萌杰 +5 位作者 施利利 孙宁 张欣 丁得亮 崔晶 边嘉宾 《海南师范大学学报:自然科学版》 CAS 2019年第2期163-169,共7页
产量是作物育种的首要目标。采用多个品种、多个对照品种对其蛋白质组学进行了解析,iTRAQ分析表明,水稻叶片和幼穗中有数万个功能蛋白表达,按照表达强度和产量的关联程度,鉴定了33个对产量有重要贡献的蛋白质,其中淀粉合成酶、种子储藏... 产量是作物育种的首要目标。采用多个品种、多个对照品种对其蛋白质组学进行了解析,iTRAQ分析表明,水稻叶片和幼穗中有数万个功能蛋白表达,按照表达强度和产量的关联程度,鉴定了33个对产量有重要贡献的蛋白质,其中淀粉合成酶、种子储藏蛋白是产量构成的重要成分,采用酶活性、产量形成对糖苷合成酶及其基因调控网络进行了验证,对重要农艺性状基因克隆、基因网络重构等进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 产量 蛋白质 基因网络
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水牛睾丸曲精细管蛋白质组双向电泳方法的建立及优化
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作者 张鹏飞 黄愉淋 +5 位作者 耿双双 陈富美 付强 黄凤玲 陆阳清 张明 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1474-1479,共6页
建立并优化了沼泽型水牛睾丸曲精细管蛋白质分离的双向电泳体系,为后续水牛睾丸曲精细管蛋白质表达谱的鉴定和研究奠定基础。比较不同IPG胶条(线性与非线性)、胶条pH范围和蛋白质上样量这三个参数对双向电泳结果的影响。结果显示,采用... 建立并优化了沼泽型水牛睾丸曲精细管蛋白质分离的双向电泳体系,为后续水牛睾丸曲精细管蛋白质表达谱的鉴定和研究奠定基础。比较不同IPG胶条(线性与非线性)、胶条pH范围和蛋白质上样量这三个参数对双向电泳结果的影响。结果显示,采用上样量350μg的曲精细管总蛋白、24 cm且pH值4~7的线性IPG胶条能够更好地分离水牛睾丸曲精细管蛋白质,获得质量较好且分辨率较高的双向电泳图谱,得到大约486个蛋白点。双向凝胶电泳技术能够对水牛睾丸曲精细管蛋白质进行有效分离,并通过对双向电泳体系的优化可获得蛋白质点清晰且分辨率更高的双向电泳图谱。 展开更多
关键词 水牛 睾丸曲精细管 蛋白质 双向电泳
青海高原耐旱蚕豆品种青海13号响应干旱胁迫蛋白质组学分析 预览
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作者 李萍 侯万伟 刘玉皎 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期267-275,共9页
蛋白质组学研究在功能基因组时代发挥着越来越重要的作用,利用双向电泳技术和质谱鉴定技术,可大量研究作物逆境胁迫后蛋白质组的变化,增加作物响应干旱胁迫机制的认识和理解。为探讨一种抗旱性蚕豆青海13号品种的耐旱机制,本研究对其幼... 蛋白质组学研究在功能基因组时代发挥着越来越重要的作用,利用双向电泳技术和质谱鉴定技术,可大量研究作物逆境胁迫后蛋白质组的变化,增加作物响应干旱胁迫机制的认识和理解。为探讨一种抗旱性蚕豆青海13号品种的耐旱机制,本研究对其幼苗期进行干旱胁迫处理,应用上述技术进行差异蛋白质组分析,经t检验发现32个差异表达蛋白点,部分呈现上调表达,部分呈现下调表达,还有7个消失蛋白点和1个新增蛋白点。采用MALDI-TOF/TOF鉴定和生物信息学分析发现,成功鉴定的21个蛋白点按其所参与的代谢途径和生化功能可分为七大类,参与信号转导的2个,参与自由基清除的1个,参与防卫反应的1个,参与代谢的8个,参与蛋白加工的1个,参与光合的5个,未知功能蛋白3个。22kD干旱诱导蛋白、应激诱导蛋白、17.5kD一级热激蛋白、超氧化物歧化酶是与抗旱性有直接关联的蛋白点,其相对表达量的上调可能是青海13号蚕豆具有较强抗旱性的重要原因。 展开更多
关键词 蚕豆 干旱胁迫 蛋白质 差异表达 功能分类
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结直肠癌组织中泛素化修饰蛋白的蛋白质组学分析 预览
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作者 杨照微 王晶莹 +3 位作者 李时孟 李晓鸥 谢风 何成彦 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期355-362,共8页
蛋白质泛素化修饰在结直肠癌的发生、发展和转移等过程中,发挥着重要作用。本研究提取结直肠癌组织中总蛋白,经胰酶水解得到多肽混合物,利用免疫沉淀技术对其中含-GG标签的肽段富集纯化,最后利用液相色谱-质谱联用技术对富集肽段进行分... 蛋白质泛素化修饰在结直肠癌的发生、发展和转移等过程中,发挥着重要作用。本研究提取结直肠癌组织中总蛋白,经胰酶水解得到多肽混合物,利用免疫沉淀技术对其中含-GG标签的肽段富集纯化,最后利用液相色谱-质谱联用技术对富集肽段进行分析,经数据库检索鉴定蛋白。结果表明,在结直肠癌组织中,鉴定得到归属为328种蛋白的2036个肽段。其中,含-GG标签的修饰肽段数为1497个,归属287种蛋白。在鉴定得到的含有-GG标签的肽段中,除了大部分含有1个-GG标签的肽段外,还包括31个含有2个-GG标签的肽段以及3个含有3个-GG标签的肽段。在鉴定得到的泛素化修饰的蛋白中,发现许多与结直肠癌密切相关的蛋白,包括胸腺素α原(Prothymosin alpha)、转化酸性含卷曲螺旋蛋白3(Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3)、中性氨基酸转运蛋白B(0)(Neutral amino acid transporter B(0))等。对所鉴定的泛素化修饰蛋白的生物信息学分析表明,结直肠癌组织中泛素化修饰蛋白涵盖了多种基本的生物学过程和分子功能,在细胞内的各个亚细胞器及胞外基质成分中均有分布。本研究对结直肠癌组织中的泛素修饰蛋白的种类、分布等情况提供了一种特异、有效的研究方法,研究结果为深入研究结直肠癌中泛素化修饰调控分子机制提供了基础数据。 展开更多
关键词 结直肠癌 泛素化修饰 蛋白质
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‘鸭梨’及其自交亲和性芽变‘金坠梨’花粉ABC转运蛋白家族分析 预览
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作者 吕换男 马聚泽 +4 位作者 郝艳 左波 黄佳 王海静 武军凯 《河北科技师范学院学报》 CAS 2019年第2期1-11,共11页
自交亲和性的‘金坠梨’是由自交不亲和性的‘鸭梨’芽变而来,为探究‘金坠梨’突变机理,综合分析了二者花粉蛋白质组差异表达蛋白质。在489个差异表达蛋白质中,发现了参与自交不亲和识别机制的ABC转运家族蛋白;KEGG富集分析发现,ABC转... 自交亲和性的‘金坠梨’是由自交不亲和性的‘鸭梨’芽变而来,为探究‘金坠梨’突变机理,综合分析了二者花粉蛋白质组差异表达蛋白质。在489个差异表达蛋白质中,发现了参与自交不亲和识别机制的ABC转运家族蛋白;KEGG富集分析发现,ABC转运蛋白被显著富集,其中PyABCB9-1,PyABCB9-2,PyABCC2,PyABCC3,PyABCD1,PyABCG31等6个蛋白显著下调;生物信息学分析表明,6个ABC转运蛋白不同家族在物种间具有很高的保守性;这6个显著下调蛋白可能影响了‘金坠梨’花柱S-RNase进入‘自己’花粉管的运输过程而导致其亲和性突变。 展开更多
关键词 ABC转运蛋白 自交不亲和性 自交亲和性 蛋白质
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基于蛋白质组学技术的羚羊角的研究与分析 预览
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作者 王玉团 石峰 +3 位作者 杭宝建 梁翠荣 咸瑞卿 巩丽萍 《中国现代中药》 CAS 2019年第8期1045-1048,共4页
目的:基于蛋白质组学技术对羚羊角进行研究,为合理使用羚羊角提供参考。方法:将酶解后的羚羊角角壳和骨塞样品,通过Nano-LC-Orbitrap液质联用仪进行多肽分离及质谱数据采集,结合UniPortKB收录的CapraHircus蛋白质组数据库,采用PEAKSStu... 目的:基于蛋白质组学技术对羚羊角进行研究,为合理使用羚羊角提供参考。方法:将酶解后的羚羊角角壳和骨塞样品,通过Nano-LC-Orbitrap液质联用仪进行多肽分离及质谱数据采集,结合UniPortKB收录的CapraHircus蛋白质组数据库,采用PEAKSStudio软件进行数据处理。结果:发现两者主要功能蛋白质及多肽无论在数量上还是种类方面既有某些相似性也具有明显的差异性。结论:骨塞及角壳一起磨成羚羊角粉使用具有一定的合理性,但必须将角壳和骨塞的用量比例控制在合理范围内,以确保羚羊角临床用药的安全性和有效性。 展开更多
关键词 羚羊角 蛋白质 角壳 骨塞 多肽
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基于蛋白质组学的中等强度有氧运动对大鼠心房肌物质能量代谢蛋白差异表达的研究 预览
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作者 彭勇 史绍蓉 +2 位作者 黄思敏 徐哲 郭远盘 《中国康复医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期521-526,共6页
目的:基于蛋白质组学的研究技术与方法,研究4周中等强度有氧运动对大鼠心房肌蛋白质组差异表达的影响,揭示中等强度有氧运动对心房肌物质能量代谢影响的规律。方法:建立速度24m/min、持续时间40min(负荷强度相当于60%—70%VO2max),持续... 目的:基于蛋白质组学的研究技术与方法,研究4周中等强度有氧运动对大鼠心房肌蛋白质组差异表达的影响,揭示中等强度有氧运动对心房肌物质能量代谢影响的规律。方法:建立速度24m/min、持续时间40min(负荷强度相当于60%—70%VO2max),持续训练4周的中等强度有氧运动实验动物模型。应用双向凝胶电泳技术(2-DE)分离心房肌蛋白质点,串联飞行时间质谱仪技术鉴定电泳结果中表达量上调≥5倍以上,下调至1/5以下的13个备选目标蛋白质点。结果:鉴定结果有7个与心房肌细胞物质能量代谢相关的蛋白或酶,其中线粒体乌头酸水合酶上调5.7倍,丙酮酸脱氢酶E1α1表达量上调6.4倍,线粒体琥珀酸脱氢酶黄素蛋白亚基下调6.9倍,甲基丙二酸半醛脱氢酶[酰基]上调 6.3倍,异戊酰辅酶A脱氢酶下调6.9倍,线粒体二氢硫辛酸脱氢酶下调5.7倍,细胞质苹果酸脱氢酶表达量下调7.3倍。结论:①中等强度有氧运动诱导心房肌蛋白质组表达量与强度出现显著变化,同时诱发心脏出现生理性肥大。②筛选出甲基丙二酸半醛脱氢酶[酰基],该蛋白在运动生物医学领域尚未展开深入研究,为运动改善心房肌物质能量代谢的研究带来新的研究内容。③中等强度有氧运动可能改善心房肌物质氧化代谢水平,上述差异蛋白是否具有运动依赖性和蛋白之间的联系还需进一步验证。 展开更多
关键词 蛋白质 有氧运动 心肌能量代谢 质谱鉴定 双向凝胶电泳
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差异网络分析方法在组学数据变量筛选中的应用 预览
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作者 蔡雨晴 宋微 +1 位作者 徐欢 李康 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2019年第4期635-637,共3页
组学数据(omics data),如基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等数据能够反映疾病的发生、发展和预后的情况。对于组学数据的分析,主要是筛选有用的生物标志物、分析调控网络和建立预测模型。一般是通过变量差异表达量分析不同类别之间的... 组学数据(omics data),如基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等数据能够反映疾病的发生、发展和预后的情况。对于组学数据的分析,主要是筛选有用的生物标志物、分析调控网络和建立预测模型。一般是通过变量差异表达量分析不同类别之间的差别。 展开更多
关键词 变量筛选 网络分析 生物标志物 蛋白质 预测模型 调控网络 基因
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斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究 预览
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作者 陈漪 胡瑞芹 +1 位作者 冉皓宇 陈良标 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期53-64,共12页
斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型... 斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用iTRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用iTRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。 展开更多
关键词 斑马鱼 早期胚胎发育 蛋白质 ITRAQ
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