期刊文献+
共找到1,504篇文章
< 1 2 76 >
每页显示 20 50 100
基于TRIZ理论的电饭煲防虫设计 认领 被引量:2
1
作者 于娜 陈文鑫 +3 位作者 强峰 陈志芳 高塬贵 曾国豪 《包装工程》 CAS 北大核心 2020年第2期225-230,共6页
目的结合TRIZ创新理论,围绕目前电饭煲产品中防虫这一难题进行课题攻关,探索家电领域中,工程师在有限时间内突破惯性思维得到解决方案。方法运用TRIZ中的功能分析和因果链分析对设计过程中的问题进行规范化描述;运用矛盾求解和物场分析... 目的结合TRIZ创新理论,围绕目前电饭煲产品中防虫这一难题进行课题攻关,探索家电领域中,工程师在有限时间内突破惯性思维得到解决方案。方法运用TRIZ中的功能分析和因果链分析对设计过程中的问题进行规范化描述;运用矛盾求解和物场分析等工具得到创新方案。结论通过将上述方法作为技术突破手段,一方面,在课题攻关过程中产生可行方案,另一方面将方案纳入点子库作为创新指引为其他产品研发提供参考。 展开更多
关键词 TRIZ 电饭煲 防虫 矛盾分析 科学效应库 物场分析 进化分析
在线阅读 下载PDF
水稻YABBY家族的全基因组鉴定与表达分析 认领
2
作者 董皓 李懿星 +6 位作者 王天抗 宋书锋 邱牡丹 张志槊 张立成 傅岳峰 李莉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第15期4845-4854,共10页
YABBY转录因子家族广泛参与植物的生长发育,但在单子叶植物的作用机理有待进一步研究。本研究利用生物信息学方法系统分析了水稻YABBY家族成员。保守性分析表明,水稻基因组中共有8个YABBY成员,不均匀地分布在2、3、7、10和12染色体上,... YABBY转录因子家族广泛参与植物的生长发育,但在单子叶植物的作用机理有待进一步研究。本研究利用生物信息学方法系统分析了水稻YABBY家族成员。保守性分析表明,水稻基因组中共有8个YABBY成员,不均匀地分布在2、3、7、10和12染色体上,成员之间相对保守,分为四个亚族。进化分析表明,片段复制或全基因组复制是YABBY基因在进化过程中的主要扩张方式,且YABBY家族的分化可能晚于单双子叶植物的分化。启动子和表达分析表明,水稻YABBY家族成员可能在水稻的花器官的发育、多中激素的响应中具有重要的作用。本研究为水稻YABBY基因的功能鉴定提供了理论支持和参考依据。 展开更多
关键词 水稻 YABBY基因家族 保守性分析 进化分析 表达分析
水稻直立短穗突变体esp的转录组研究 认领
3
作者 周坤能 夏加发 +4 位作者 云鹏 王元垒 马廷臣 张彩娟 李泽福 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1081-1094,共14页
【目的】克隆水稻直立短穗基因Erect and Short Panicle(ESP),分析其参与的基因调控途径,解析ESP控制株型、穗长等农艺性状的分子机理。【方法】以直立短穗突变体esp及其野生型为材料,成熟期进行株高、穗长、粒长等表型测定;构建籼粳杂... 【目的】克隆水稻直立短穗基因Erect and Short Panicle(ESP),分析其参与的基因调控途径,解析ESP控制株型、穗长等农艺性状的分子机理。【方法】以直立短穗突变体esp及其野生型为材料,成熟期进行株高、穗长、粒长等表型测定;构建籼粳杂交F2定位群体,挑选与突变表型一致的F2单株,利用与突变性状连锁的分子标记对目的基因进行定位;对野生型和突变体进行基因组测序,结合定位结果,找到突变位点,克隆ESP;利用生物信息学软件进行进化树和基因表达分析;提取野生型和突变体幼穗中的RNA并建库,GO(gene ontology)聚类分析表达差异基因,同时根据KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库,分析野生型和突变体中植物激素信号转导和内质网蛋白加工相关基因的表达变化,并通过qRT-PCR验证。【结果】通过表型观察和农艺性状调查,与野生型相比,直立短穗突变体esp株高降低,穗长变短,穗型由弯曲变为直立,每穗粒数减少,粒长变短,粒宽和千粒重增加;有效穗数无显著差异。利用突变体esp与PA64构建籼粳F2定位群体,将目的基因定位于水稻第7染色体长臂标记C7-11和C7-14之间7.58 Mb区间内,基因组测序发现LOC_Os07g42410第6内含子与第7外显子连接位点由碱基G变异为A,导致第6内含子不能被剪切,蛋白翻译提前终止;该基因与已报道的OsDEP2/OsEP2为等位基因。进化分析显示该基因广泛存在于单子叶和双子叶植物中;表达分析表明ESP在茎秆、花序、雌蕊、内外稃和子房中高度表达,其表达水平随着子房变大而逐渐降低。利用转录组分析突变体和野生型幼穗中的基因表达,结果表明,与野生型相比,esp突变体中表达差异显著(差异>1.5倍)的基因630个,其中235个表达上调,395个表达下调。GO分析显示植物激素信号转导和内质网蛋白加工相关基因受到不同程度地调控,利用qRT-PCR进行验证,结果与转录组数据 展开更多
关键词 水稻 直立短穗突变体 基因克隆 进化分析 转录组分析
在线阅读 下载PDF
石榴WRKY基因家族全基因组鉴定与表达分析 认领
4
作者 任媛 赵玉洁 +2 位作者 张心慧 招雪晴 苑兆和 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期218-231,共14页
WRKY蛋白是一类在植物生长发育过程及生物与非生物胁迫过程中起重要调控作用的转录因子。该研究利用石榴全基因组数据,采用生物信息学的方法,对石榴WRKY转录因子家族成员蛋白理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋... WRKY蛋白是一类在植物生长发育过程及生物与非生物胁迫过程中起重要调控作用的转录因子。该研究利用石榴全基因组数据,采用生物信息学的方法,对石榴WRKY转录因子家族成员蛋白理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作及基因共表达和转录组表达模式进行系统分析。结果共鉴定出69个PgWRKY基因;分组鉴定和进化分析显示WRKY蛋白可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ共三大类型。顺式作用元件分析表明,PgWRKY基因广泛参与到非生物胁迫中;蛋白互作网络与共表达分析暗示PgWRKY基因在同一胁迫应答中可能作用一致并同时诱导表达;RNA-Seq数据分析表明,PgWRKY基因有一定的组织表达特异性,广泛参与植物营养、生殖生长以及根部逆境胁迫应答过程。 展开更多
关键词 石榴 WRKY基因家族 进化分析 表达分析
在线阅读 下载PDF
云南省楚雄市2015-2018年肾综合征出血热流行特征及宿主动物调查 认领
5
作者 胡挺松 胡秋凌 +8 位作者 李绍雄 黄勇 胡海梅 高丽芬 罗琼梅 何永芝 周永存 张海林 张富强 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2020年第2期152-157,163共7页
目的调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征。方法收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析。用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度。鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-... 目的调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征。方法收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析。用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度。鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测HV核酸及L基因部分片段,并进行序列测定,使用ClastalX 1.83和MEGA 6.0等生物信息学软件进行HV同源性分析和构建系统进化树。结果2015-2018年楚雄市共报告HFRS病例186例,年平均发病率为7.74/10万。楚雄市14个乡镇均有HFRS病例报告,其中鹿城和东瓜镇发病数占发病总数的75.27%(140/186),为主要流行区。全年各月均有病例发生,男女性别比例为2.1∶1,以青壮年和农民居多。2015-2018年的5-10月在楚雄市居住区共捕获鼠类3种1053只,其中褐家鼠、黄胸鼠和斯氏家鼠的构成比依次为97.06%、1.80%和1.14%,鼠密度依次为2.57%、0.05%和0.03%,以鹿城和东瓜镇褐家鼠密度最高(3.09%)。2016年在楚雄市采获的50只褐家鼠肺脏组织标本经RT-PCR检测,HV核酸阳性2份(CX04-06和CX07-09),带病毒率为4.00%。L基因部分序列同源性分析表明,CX04-06和CX07-09病毒株与8株HV汉城型病毒(SEOV)的核苷酸同源性为72.34%~93.52%,其中,与云南省祥云县DLR2株和老挝L0199株同源性最高(92.39%~93.52%),但仍存在明显差异;与汉滩型病毒和普马拉病毒的核苷酸同源性分别仅为69.54%~71.76%和51.19%~54.44%。系统进化分析表明,CX04-06和CX07-09株与来自云南省祥云县和老挝等地的SEOV参考株具有较近的亲缘关系。结论楚雄市HFRS高发,褐家鼠为居民区室内优势鼠种并携带SEOV,流行株具有地域特征。楚雄市HFRS疫情上升与褐家鼠广泛分布及其种群密度增高密切相关。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 流行特征 啮齿动物 汉坦病毒 同源性分析 进化分析
茶树CsGME1基因的克隆与逆境胁迫响应分析 认领
6
作者 杨雅焯 李辉 +3 位作者 林士佳 刘婧愉 滕瑞敏 庄静 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期232-239,共8页
该研究基于茶树转录组和基因组信息,以茶树‘龙井43’为实验材料,从其cDNA中克隆获得茶树CsGME1基因,并对其蛋白序列特征、基因表达模式及其在不同非生物胁迫下的表达水平进行实时荧光定量分析。结果显示:(1)茶树CsGME1开放阅读框长度为... 该研究基于茶树转录组和基因组信息,以茶树‘龙井43’为实验材料,从其cDNA中克隆获得茶树CsGME1基因,并对其蛋白序列特征、基因表达模式及其在不同非生物胁迫下的表达水平进行实时荧光定量分析。结果显示:(1)茶树CsGME1开放阅读框长度为1131 bp,编码376个氨基酸;该序列与多个相关物种的GME氨基酸序列一致性为94.25%,均含有NAD结合域。(2)进化树分析表明,茶树CsGME1基因与番茄SlGME1亲缘关系较近,与水稻OsGME2亲缘关系最远。(3)CsGME1蛋白属于亲水性蛋白,理论相对分子量为42046.84 Da,理论等电点为5.73,具有4个无序化区域,无序化程度较低;CsGME1蛋白二级结构由39.25%α-螺旋,13.26%延伸主链,5.84%β-转角和41.38%随机卷曲组成;三级结构分析结果显示,CsGME1包含螺旋和随机卷曲,与二级结构吻合。(4)荧光定量分析结果显示,在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(20%PEG)和高盐(200 mmol·L-1 NaCl)4种非生物胁迫处理下,茶树CsGME1基因均有响应,且表达存在差异,推测CsGME1参与了茶树的逆境胁迫响应过程。 展开更多
关键词 茶树 CsGME1 多序列比对 进化分析 非生物胁迫 表达分析
在线阅读 下载PDF
柑橘亲环蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析 认领
7
作者 李悦 李雨婷 罗峰 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期2799-2813,共15页
亲环蛋白(CYP)基因家族是一类含有CLD保守结构域的蛋白质,参与多种生物过程,在蛋白质运输、受体信号转导、mRNA剪接、细胞凋亡及生物与非生物胁迫的应激反应中发挥重要作用。目前,已在多种植物中对亲环蛋白基因家族进行了鉴定和分析,但... 亲环蛋白(CYP)基因家族是一类含有CLD保守结构域的蛋白质,参与多种生物过程,在蛋白质运输、受体信号转导、mRNA剪接、细胞凋亡及生物与非生物胁迫的应激反应中发挥重要作用。目前,已在多种植物中对亲环蛋白基因家族进行了鉴定和分析,但未见柑橘CYP基因家族筛选和鉴定的报道。本研究从美国柑橘和中国甜橙中分别筛选出30个和32个亲环蛋白基因家族成员,根据结构域的不同,将62个成员分成7个亚家族。进化分析结果表明,具有相似结构域的基因聚在一起,表明亲环蛋白基因家族可能在物种分化前已经分化。在美国柑橘和中国甜橙CYP中均含有2个基因簇并筛选出26对同源基因。这些CYP基因在不同的组织中表达谱不同,7种组织中表达量最高的基因可能与免疫抑制、蛋白质运输、根系的生长及光调控功能相关,表明这些亲环蛋白可能在生物过程中起重要作用,本研究结果为进一步研究柑橘基因功能和进化提供科学依据。 展开更多
关键词 柑橘 CYP 进化分析 表达谱分析
二穗短柄草GRFs基因家族的鉴定及表达模式分析 认领
8
作者 马超 宋鹏 +5 位作者 尚申申 杨夏夏 杨金华 韩群威 李记民 冯雅岚 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1152-1162,共11页
GRFs基因家族在植物生长发育及逆境响应中起着重要的调控作用。为了探明二穗短柄草GRFs基因家族的基本特征及其进化关系,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对二穗短柄草GRFs基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明,二穗短柄草GRF... GRFs基因家族在植物生长发育及逆境响应中起着重要的调控作用。为了探明二穗短柄草GRFs基因家族的基本特征及其进化关系,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对二穗短柄草GRFs基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明,二穗短柄草GRFs基因家族包括12个家族成员,蛋白质序列长度在238~577个氨基酸之间;序列比对发现二穗短柄草GRFs家族基因包括2个保守的QLQ和WRC结构域及广泛的保守基序;染色体定位发现,12个家族成员在二穗短柄草的5条染色体上呈不均匀分布,bd03号染色体分布最多;系统发育关系比较分析表明,这些GRFs基因家族成员存在4对直系同源基因。RT-qPCR分析表明,全部GRFs基因家族成员在二穗短柄草幼嫩组织中表达量较高,而在根系和衰老组织中表达量较低,外源激素特别是GA3诱导了二穗短柄草大部分GRFs基因家族成员的上调表达,表明GRFs基因家族广泛地参与了二穗短柄草分生组织功能和器官形成的生命进程。本研究结果为二穗短柄草GRFs家族蛋白功能的研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 二穗短柄草 GRFs基因家族 基因结构 进化分析 表达模式分析
在线阅读 免费下载
千里光苯丙氨酸解氨酶基因克隆与系统进化分析 认领
9
作者 李林 左青青 +4 位作者 谢欣 刘朝波 陈立 张俊 钱刚 《遵义医科大学学报》 2020年第3期305-309,共5页
目的对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位。方法以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行... 目的对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位。方法以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行核酸序列信息、氨基酸结构特征与系统进化分析。结果克隆获得长度为2159 bp的核酸序列,ORF分析表明该基因编码708个氨基酸,无信号肽,是非跨膜蛋白。与近缘物种pal基因blast分析表明其氨基酸序列与黑心菊、雪莲等相似度达92.22%,具有相同的活性位点和保守结构域。系统进化树分析表明,千里光与菊科植物青蒿、雪莲归于一个亚支,表明3种植物pal在进化上具有较近的亲缘关系。结论千里光pal基因序列结构与其他14种PAL酶家族成员相似度高,在进化上与菊科植物较近。 展开更多
关键词 千里光 生物信息学分析 苯丙氨酸裂解酶(PAL) 进化分析
在线阅读 免费下载
鸭体内一种绦虫的分子生物学鉴定 认领
10
作者 张弘弢 李春林 +1 位作者 陈媛媛 常巧呈 《黑龙江八一农垦大学学报》 2020年第5期29-35,共7页
实验为了鉴定鸭体内一种未知绦虫的种类,通过线粒体DNA(mtDNA)中细胞色素c氧化酶部分第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)与核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)作为遗传标记对虫体进行PCR扩增及序列分析。实验结果显示该绦虫的pcox1序列长... 实验为了鉴定鸭体内一种未知绦虫的种类,通过线粒体DNA(mtDNA)中细胞色素c氧化酶部分第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)与核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)作为遗传标记对虫体进行PCR扩增及序列分析。实验结果显示该绦虫的pcox1序列长698 bp,ITS序列长1449 bp。进化分析结果显示获得的序列与片形褶皱绦虫亲缘关系最相近。经分子生物学鉴定,该鸭体内采集的绦虫归属于圆叶目、膜壳科、片形褶皱绦虫。 展开更多
关键词 鸭绦虫 片形褶皱绦虫 PCR鉴定 进化分析
在线阅读 免费下载
基于GenBank数据库的不同基因型细粒棘球绦虫系统进化分析 认领
11
作者 吴世乐 朱文君 +5 位作者 范得艳 石兵强 安永德 王春亮 韩秀敏 郭亚民 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期36-46,59共12页
目的分析GenBank数据库中公布的细粒棘球绦虫各基因型细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(Cox1)基因序列,探索细粒棘球绦虫各基因型在全球不同地区的遗传变异及分化情况。方法收集GenBank数据库中公布的不同基因型细粒棘球绦虫Cox1基因序列,排除同... 目的分析GenBank数据库中公布的细粒棘球绦虫各基因型细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(Cox1)基因序列,探索细粒棘球绦虫各基因型在全球不同地区的遗传变异及分化情况。方法收集GenBank数据库中公布的不同基因型细粒棘球绦虫Cox1基因序列,排除同一地区内相同基因序列,寻找收集的基因序列间的变异位点并构建进化树,观察不同地区细粒棘球绦虫各基因型的地域聚集性及原始基因序列。结果通过对Cox1基因序列变异位点统计,发现细粒棘球绦虫Cox1基因突变类型以颠换为主,G1、G6、G7基因型在其分布的各地区均有相同Cox1基因序列,基因序列相对应的GenBank登录号分别为KY766891、MH300971、MH301007。系统进化分析发现G10基因型存在明显地域聚集性。结论细粒棘球绦虫G1、G6、G7基因型存在原始Cox1基因序列;G10基因型进化树中出现地域聚集性,存在生殖隔离趋势。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 基因型 进化分析 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ
水稻编码光系统Ⅱ相关捕光色素蛋白Lhcb2基因的克隆与表达分析 认领
12
作者 胡志航 金伟刚 +5 位作者 宋丽双 章静静 邵少波 周勇 梁国华 裔传灯 《扬州大学学报:农业与生命科学版》 CAS 北大核心 2020年第4期1-8,共8页
捕光复合物蛋白(LHCP)在植物光合作用过程中发挥重要的作用。基于水稻基因组信息,以亚洲栽培稻籼稻品种黄华占、长雄蕊野生稻及其杂种F1为试验材料,克隆了水稻Lhcb2基因,并对其基因内含子信息、蛋白序列特征、进化树、蛋白结构、基因表... 捕光复合物蛋白(LHCP)在植物光合作用过程中发挥重要的作用。基于水稻基因组信息,以亚洲栽培稻籼稻品种黄华占、长雄蕊野生稻及其杂种F1为试验材料,克隆了水稻Lhcb2基因,并对其基因内含子信息、蛋白序列特征、进化树、蛋白结构、基因表达进行分析。结果表明:水稻Lhcb2基因全长880 bp,含有1个长98 bp的内含子。开放阅读框长度为792 bp,编码263个氨基酸;水稻LHCB2与13个其他植物的LHCB氨基酸序列一致性为68.78%。进化树分析显示,水稻LHCB2蛋白与同属禾本科的毛竹和麻竹亲缘关系最近,与低等植物团藻亲缘关系最远。水稻LHCB2蛋白属于亲水性蛋白,其理论分子量为28 495.40,理论等电点为5.62,具有2个无序化区域,无序化比例为30.04%;水稻LHCB2蛋白三级结构有2个β折叠和3个α螺旋组成。Lhcb2基因荧光定量分析结果显示,长雄蕊野生稻和杂交F1代植株叶片中表达量分别为黄华占的1.22和1.96倍。长雄蕊野生稻中的叶绿素a和b、色素、类胡萝卜素等均高于黄华占及其杂交F1代。长雄蕊野生稻叶绿素a的含量分别为另2份水稻材料的1.13和1.75倍,叶绿素b含量为1.10和1.60倍,色素含量则为1.13和1.72倍。 展开更多
关键词 水稻 捕光复合物蛋白 多序列比对 进化分析 基因表达 叶绿体色素
在线阅读 免费下载
小麦RCAR基因家族的鉴定、进化与逆境响应 认领
13
作者 史梦梦 温思钰 +4 位作者 赵佳佳 乔玲 武棒棒 郑兴卫 郑军 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期14-24,共11页
研究小麦RCAR基因家族的进化与逆境响应,有助于阐明RCAR基因抵御逆境胁迫的调控机制。根据保守结构域在小麦基因组中鉴定出27个RCARs,除了第5和6同源群外,其余同源群均有分布。根据进化关系可分为6个亚组;GroupA和GroupB中12个TaRCARs... 研究小麦RCAR基因家族的进化与逆境响应,有助于阐明RCAR基因抵御逆境胁迫的调控机制。根据保守结构域在小麦基因组中鉴定出27个RCARs,除了第5和6同源群外,其余同源群均有分布。根据进化关系可分为6个亚组;GroupA和GroupB中12个TaRCARs均检测到快速进化,ω值分别为0.349和0.321,GroupA中3个位点经历了正选择,后验概率P>0.99;TaRCARs启动子顺式元件主要有4类,分别参与非生物胁迫应答、光响应、激素响应和生长发育过程。比较RNA-seq表达谱发现TaRCAR1、TaRCAR2、TaRCAR4和TaRCAR7是组成型表达,其余基因的表达具有组织特异性;在干旱和热胁迫下RCARs响应模式不同,除TaRCAR3和TaRCAR6在热胁迫后12 h内表达提高外,TaRCAR1、TaRCAR3和TaRCAR6均在干旱胁迫和热胁迫后6 h内提高,TaRCAR5在干旱胁迫后表达上调,TaRCAR7在热胁迫时表达下调。 展开更多
关键词 小麦 RCAR基因家族 正选择 进化分析 逆境响应
在线阅读 下载PDF
9个玉米DOF基因对逆境胁迫的响应模式分析 认领
14
作者 贾利强 赵秋芳 陈曙 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1347-1355,共9页
植物DOF(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育及代谢途径中发挥着重要作用。该研究采用qRT-PCR方法分析了玉米应答逆境(盐、干旱、硝态氮缺乏和铵态氮缺乏)胁迫条件下9个ZmDOFs基因的表... 植物DOF(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育及代谢途径中发挥着重要作用。该研究采用qRT-PCR方法分析了玉米应答逆境(盐、干旱、硝态氮缺乏和铵态氮缺乏)胁迫条件下9个ZmDOFs基因的表达模式。结果表明:(1)生物信息学分析显示,9个ZmDOF基因散布于5个染色体上,聚类为一个基因亚家族,且9个基因还可以细分为4个小亚家族。(2)9个ZmDOFs基因的表达具有组织特异性,且主要在玉米的穗和雄花中表达,其中ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12在穗部的表达量分别是根部的18倍、60倍、11倍和75倍以上,ZmDOF19、ZmDOF26、ZmDOF27和ZmDOF42在雄花中的表达量分别是根部的360倍、28倍、13倍和44倍以上,推测这些基因在玉米的雄花和穗的生长发育进程中具有重要的作用。(3)实时定量qRT-PCR方法显示,在硝态氮胁迫下有7个ZmDOFs基因强烈诱导表达(>5倍),其中ZmDOF12、ZmDOF27和ZmDOF42基因的表达超过10倍,表明这些基因参与调控硝态氮胁迫的响应途径;有7个ZmDOFs基因受铵态氮胁迫的强烈诱导表达(>2倍),表明这7个基因在玉米应答铵态氮胁迫中起作用;有5个ZmDOFs基因受PEG6000胁迫的强烈诱导表达(>2倍),其中ZmDOF34的表达上调超过10倍;有8个ZmDOFs基因受NaCl胁迫的强烈诱导表达(>2倍),其中ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12的表达上调在10倍以上,表明这些基因在玉米抵御干旱或盐胁迫中起重要作用。 展开更多
关键词 DOF 玉米 基因表达 进化分析
在线阅读 下载PDF
一株猪高致病性蓝耳病病毒的分离鉴定与遗传变异分析 认领
15
作者 张维达 杨康 李自力 《中国兽药杂志》 2020年第2期7-15,共9页
为研究猪蓝耳病病毒(PRRSV)的遗传进化规律,于2018年从新疆某猪场采集的病猪血液中分离了一株PRRSV,命名为XJ-b。对临床样品采用RT-PCR扩增鉴定,将阳性样品过滤处理之后接种在Marc-145细胞系进行培养,将盲传3代之后出现病变(CPE)的Marc-... 为研究猪蓝耳病病毒(PRRSV)的遗传进化规律,于2018年从新疆某猪场采集的病猪血液中分离了一株PRRSV,命名为XJ-b。对临床样品采用RT-PCR扩增鉴定,将阳性样品过滤处理之后接种在Marc-145细胞系进行培养,将盲传3代之后出现病变(CPE)的Marc-145样品进行间接免疫荧光鉴定。通过噬斑纯化后,利用RT-PCR对分离株的全基因组进行扩增,使用SeqMan软件对测序结果进行拼接,并根据NCBI上已公布的PRRSV全基因组及Nsp2基因核苷酸序列进行遗传进化与同源性比对分析。结果表明,临床病料RT-PCR检测呈PRRSV核酸阳性,处理后的病料接种至Marc-145细胞72 h之后产生CPE,间接免疫荧光鉴定为PRRSV抗原阳性;序列拼接显示分离株全基因组开放阅读框大小为15119 bp;全基因组和Nsp2基因核苷酸序列分析和同源性比对显示该分离毒株属于中国的高致病性PRRSV亚群。研究结果可为近年来新疆地区PRRSV的毒株差异分析提供参考。 展开更多
关键词 猪高致病性蓝耳病病毒 分离 MARC-145细胞 基因组 进化分析
在线阅读 免费下载
杨树GABA支路3个基因家族的鉴定和表达分析 认领
16
作者 陈炜 成铁龙 +4 位作者 纪敬 武妍妍 谢田田 江泽平 史胜青 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期67-77,共11页
【目的】γ-氨基丁酸(GABA)与植物的生长发育有着密切的联系。结合前期对GABA抑制杨树不定根发育的研究,对GABA支路基因家族的特征和表达模式进行研究,为进一步解释其在不定根发育中的作用奠定基础。【方法】从银白杨(Populus alba)... 【目的】γ-氨基丁酸(GABA)与植物的生长发育有着密切的联系。结合前期对GABA抑制杨树不定根发育的研究,对GABA支路基因家族的特征和表达模式进行研究,为进一步解释其在不定根发育中的作用奠定基础。【方法】从银白杨(Populus alba)×P. glandulosa ‘84K’(‘84K’杨)基因组中鉴定出GABA支路的PopGAD、PopGABA-T和PopSSADH3个基因家族成员,并利用生物信息学方法分析其特征,以及与其他物种相关基因家族的亲缘关系;利用qRT-PCR研究外源GABA及其降解抑制剂vigabatrin(VGB)对各基因表达的影响。【结果】①PopGAD、PopGABA-T和PopSSADH3个基因家族成员数量依次为6、2和2个,启动子序列中主要包含与光、激素和环境等响应相关元件。②系统进化分析表明,PopGAD家族中PopGAD6与家族其他成员亲缘关系较远;PopGABA-T和PopSSADH家族中的两个基因成员亲缘关系较近。③基因表达分析表明,不定根生长过程中GABA支路基因总体上在根中表达量高于茎和叶。外源GABA或VGB处理对PopGAD和PopGABA-T两个基因家族成员在根、茎和叶中的表达量影响程度不同,但对PopSSADH基因家族的表达则无明显影响。【结论】GABA支路3个基因家族在‘84K’杨树响应光、激素和环境胁迫等方面具有重要作用。外源GABA和VGB处理对PopGAD和PopGABA-T家族成员的影响较大,并且均在根中表达量最高,表明这两个基因家族在不定根生长过程中发挥着重要调控功能。这为深入解析GABA在树木不定根发生中的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 基因家族 GABA支路 γ-氨基丁酸(GABA) 进化分析 组织特异性表达 杨树
1株犬源PCV3的全基因克隆与序列分析 认领
17
作者 辛佳亮 汪伟 +9 位作者 杜倩 韩知晓 闭璟珊 孔子荣 张书祥 孙文超 曹亮 鲁会军 郑敏 金宁一 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期504-509,共6页
根据GenBank上已发表的PCV3毒株序列设计1对检测引物和2对扩增全长引物。应用检测引物对广西地区的犬血清样品进行PCR检测,应用扩增全长引物对检测阳性样品进行PCR扩增、克隆和测序,并对其全基因序列进行分析,绘制遗传进化树。结果显示... 根据GenBank上已发表的PCV3毒株序列设计1对检测引物和2对扩增全长引物。应用检测引物对广西地区的犬血清样品进行PCR检测,应用扩增全长引物对检测阳性样品进行PCR扩增、克隆和测序,并对其全基因序列进行分析,绘制遗传进化树。结果显示,广西地区147份犬血清样品中,阳性样品为36份,感染率为24.3%。本试验成功扩增1株2000bp的PCV3毒株的全基因核苷酸序列,并命名为PCV3/Guangxi-5。将PCV3/Guangxi-5序列与NCBI公布的PCV3的参考序列进行同源性比对,结果显示PCV3/Guangxi-5与参考序列的全基因序列同源性为98.9%~100.0%,其中与DE27.16同源性最低,与PCV3/CN/Chongqing-148/2016同源性最高。应用MEGA7.0对PCV3进行ORF2基因的氨基酸序列进行比对发现,第24位至第27位氨基酸存在6种形式,分别为VRRK、ARRR、ARKR、LRRK、VRRR和ARRK。利用MEGA7.0软件中Maximum Likelihood(ML)法p-distance模式构建基于ORF2基因和PCV3全基因的系统发育分析表明,PCV3可分为PCV3a和PCV3b等2种基因型,本试验获得的PCV3/Guangxi-5为PCV3a亚型,其ORF2基因与PCV3/CN/Liaoning-23/2016亲缘关系最近,与NWHEB21、毒株亲缘关系相距最远;其全基因组与CN/Jiangxi-62/2016毒株亲缘关系最近,与CNFJ-1毒株亲缘性最远。结果表明,广西地区犬群普遍存在感染PCV3的情况,理论上丰富了广西地区PCV3的流行病学资料,为PCV3的防治措施的制定和流行病学研究提供一定的参考依据。 展开更多
关键词 PCV3 进化分析
基于叶绿体matK基因序列的两份安康野生桑遗传特征分析 认领
18
作者 王瑞娴 楚渠 +3 位作者 彭云武 孟刚 梁嘉俊 周晓帆 《湖北农业科学》 2020年第15期151-154,158,共5页
对陕西省安康市黄石滩、八仙镇2份野生桑叶绿体基因组进行PCR扩增,获得matK编码基因及其侧翼序列,扩增长度为1715 bp,ORF长度为1518 bp,2份序列仅存在1处单碱基差异。利用matK序列分析7份桑树(Morus alba L.)之间的遗传多样性,结果表明... 对陕西省安康市黄石滩、八仙镇2份野生桑叶绿体基因组进行PCR扩增,获得matK编码基因及其侧翼序列,扩增长度为1715 bp,ORF长度为1518 bp,2份序列仅存在1处单碱基差异。利用matK序列分析7份桑树(Morus alba L.)之间的遗传多样性,结果表明,不同品种桑树matK序列相似度较高,仅存在6个单位点碱基差异,定义3种单倍体,单倍型多样度为0.714,核苷酸多样度为0.00132,平均核苷酸差异为2.000。遗传距离分析表明,八仙镇桑树与印度桑(M.indica)、鲁桑(M.multicaulis)的遗传距离最近,黄石滩桑树与蒙桑(M.mongolica)、华桑(M.cathayana)的遗传距离最近。聚类分析将7份桑树聚为1支,且桑树品种之间的进化支长要明显短于其他科属之间的长度,表明桑树品种间的遗传多样性较低,经历较少进化事件。 展开更多
关键词 桑树(Morus alba L.) 进化分析 遗传多样性 叶绿体 MATK
在线阅读 下载PDF
广东地区副猪嗜血杆菌的耐药表型和基因及其进化分析 认领
19
作者 万锈琳 李春玲 +2 位作者 刘宗保 王国霞 闫鹤 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2020年第8期23-30,共8页
本研究探讨了广东地区副猪嗜血杆菌的亲缘关系、药物敏感性及耐药基因的携带现况,对分离自广东不同区域的53株副猪嗜血杆菌进行了16S rRNA进化分析,使用K-B琼脂扩散法针对21种抗菌药物进行敏感性检测,并通过全基因组测序分析其耐药基因... 本研究探讨了广东地区副猪嗜血杆菌的亲缘关系、药物敏感性及耐药基因的携带现况,对分离自广东不同区域的53株副猪嗜血杆菌进行了16S rRNA进化分析,使用K-B琼脂扩散法针对21种抗菌药物进行敏感性检测,并通过全基因组测序分析其耐药基因携带情况。结果表明,菌株对苯唑西林、复方新诺明、链霉素和四环素耐药率较高,且多重耐药菌株占比较高(84.91%)。通过与耐药基因数据库对比共检测到21种耐药基因,介导9大类抗生素的耐药,其中春日霉素耐药基因ksg A和杆菌肽耐药基因bac A首次在副猪嗜血杆菌被发现。氨基糖苷类和林可霉素类耐药基因携带情况与耐药表型之间符合率可达100%。16S rRNA分析结果显示,不同区域来源的副猪嗜血杆菌亲缘关系较近,且耐药基因携带情况与16S rRNA进化关系以及分离时间存在一定的关联性。本研究结果可对广东地区养猪业副猪嗜血杆菌疾病的防御和治疗起到指导作用。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 进化分析 药敏试验 全基因组测序 耐药基因
在线阅读 下载PDF
山东部分地区新型鹅星状病毒ORF2基因克隆及遗传进化分析 认领
20
作者 姜胜男 邱杨 +5 位作者 赵君 张慧 杨玉栋 李宝全 刘思当 李宁 《山东畜牧兽医》 2020年第7期11-14,共4页
为了解新型鹅星状病毒(NGAstV)在山东部分地区的流行和变异情况,试验采用临床剖检、组织病理学观察和PCR方法对近期来自山东部分地区的32份病鹅样品进行NGAstV检测,并扩增ORF2基因进行遗传进化分析。结果表明:发病雏鹅心脏、肝脏、肾脏... 为了解新型鹅星状病毒(NGAstV)在山东部分地区的流行和变异情况,试验采用临床剖检、组织病理学观察和PCR方法对近期来自山东部分地区的32份病鹅样品进行NGAstV检测,并扩增ORF2基因进行遗传进化分析。结果表明:发病雏鹅心脏、肝脏、肾脏等组织有明显尿酸盐沉积,肾小管上皮细胞变性、坏死,脾脏部分淋巴细胞坏死,淋巴细胞数量减少。PCR检测发现被检样品中共有8份NGAstV阳性,阳性率为25%,扩增并测定其ORF2基因序列后进行遗传进化分析,显示获得的8份毒株与近年来鹅场流行的NGAstV遗传关系最近,氨基酸同源性在98.6%~99.6%之间。说明目前山东部分地区有NGAstv的流行但流行毒株尚未发生明显变异。 展开更多
关键词 雏鹅通风 新型鹅星状病毒 ORF2基因 克隆 进化分析
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 76 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈