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西瓜全基因组SSR位点的特征及其在比较遗传作图和遗传多样分析中的应用 预览
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作者 朱华玉 杨路明(编译) +5 位作者 宋芃垚 Dal-Hoe Koo 郭禄芹 李严曼 孙守如 Yiqun Weng 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期180-181,共2页
目的与意义:随着新一代全基因组测序技术的快速发展,越来越多的物种开发了大量的覆盖全基因组的SSR标记.虽然在西瓜上也开发了一些SSR标记,并已经在连锁图谱和遗传多样性研究中得到应用,但仍存在多态性低、基因组覆盖率低等问题.本研究... 目的与意义:随着新一代全基因组测序技术的快速发展,越来越多的物种开发了大量的覆盖全基因组的SSR标记.虽然在西瓜上也开发了一些SSR标记,并已经在连锁图谱和遗传多样性研究中得到应用,但仍存在多态性低、基因组覆盖率低等问题.本研究从西瓜全基因组水平分析了不同类型SSR序列的分布及频率.并开发了覆盖全基因组的SSR标记,同时通过电子PCR的方法确定了在甜瓜、黄瓜中通用的SSR分子标记,并利用这些通用SSR标记进一步明确了西瓜与黄瓜以及甜瓜3个物种之间的染色体共线性关系.本研究同时筛选了32对高多态性SSR标记对134份西瓜材料进行了遗传多样性及群体结构分析. 展开更多
关键词 全基因组 SSR位点 遗传作图 西瓜 应用 SSR标记 SSR分子标记 遗传多样性
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茶树分子标记辅助育种研究进展 预览 被引量:1
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作者 王让剑 杨军 +2 位作者 孔祥瑞 陈常颂 余文权 《茶叶学报》 2017年第4期157-163,共7页
茶树是多年生异花授粉作物,育种效率低。分子标记辅助选择技术可以显著提高育种效率,已成为作物遗传育种领域的研究重点。发掘与目标性状紧密连锁的功能性分子标记是开展分子标记辅助选择育种的前提,目前主要依靠QTL作图与关联作图... 茶树是多年生异花授粉作物,育种效率低。分子标记辅助选择技术可以显著提高育种效率,已成为作物遗传育种领域的研究重点。发掘与目标性状紧密连锁的功能性分子标记是开展分子标记辅助选择育种的前提,目前主要依靠QTL作图与关联作图两种方法。简述了QTL作图和关联作图在茶树分子标记辅助育种研究中的进展及存在的问题,并对其发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 茶树 分子标记辅助育种 数量性状位点 遗传作图 关联作图
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Rice molecular markers and genetic mapping: Current status and prospects 预览
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作者 Ghulam Shabir Kashif Aslam +8 位作者 Abdul Rehman Khan Muhammad Shahid Hamid Manzoor Sibgha Noreen Mueen Alam Khan Muhammad Baber Muhammad Sabar Shahid Masood Shah Muhammad Arif 《农业科学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2017年第9期1879-1891,共13页
Dramatic changes in climatic conditions that supplement the biotic and abiotic stresses pose severe threat to the sustainable rice production and have made it a difficult task for rice molecular breeders to enhance pr... Dramatic changes in climatic conditions that supplement the biotic and abiotic stresses pose severe threat to the sustainable rice production and have made it a difficult task for rice molecular breeders to enhance production and productivity under these stress factors. The main focus of rice molecular breeders is to understand the fundamentals of molecular pathways involved in complex agronomic traits to increase the yield. The availability of complete rice genome sequence and recent improvements in rice genomics research has made it possible to detect and map accurately a large number of genes by using linkage to DNA markers. Linkage mapping is an effective approach to identify the genetic markers which are co-segregating with target traits within the family. The ideas of genetic diversity, quantitative trait locus(QTL) mapping, and marker-assisted selection(MAS) are evolving into more efficient concepts of linkage disequilibrium(LD) also called association mapping and genomic selection(GS), respectively. The use of cost-effective DNA markers derived from the fine mapped position of the genes for important agronomic traits will provide opportunities for breeders to develop high-yielding, stress-resistant, and better quality rice cultivars. Here we focus on the progress of molecular marker technologies, their application in genetic mapping and evolution of association mapping techniques in rice. 展开更多
关键词 分子标记技术 遗传作图 农艺性状基因 水稻品种 非生物胁迫 展望 分子育种 基因组学
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北京林业大学发布两个京产牡丹新品种 预览
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《园林科技》 2016年第2期47-48,共2页
<正>5月15日,在首届北京牡丹科技文化节上,北京林业大学专家发布了2个牡丹新品种,改写了北京没有自己培育的牡丹品种的历史。据称,这2个新品种均已获得自主知识产权,是土生土长的"北京牡丹"。新品种"京龙望月"... <正>5月15日,在首届北京牡丹科技文化节上,北京林业大学专家发布了2个牡丹新品种,改写了北京没有自己培育的牡丹品种的历史。据称,这2个新品种均已获得自主知识产权,是土生土长的"北京牡丹"。新品种"京龙望月"紫黑色,荷花型,花头直立。它花期早,花浓香,结实多,长势强,既可观赏,又可油用栽培;另一个新品种"京醉美"是花粉红色、皇冠型、绣球型、花头直立的大花品种。花期适中,开花过程中花色变化迷人,花香浓郁,植株直立,长势强,是 展开更多
关键词 自主知识产权 花型 文化节 球型 大学专家 博园 遗传作图 栽培技术 遗传图谱 切花生产
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PCR-SSCP技术与比较基因组学结合定位棉花Li1基因
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作者 杨芬 曹跃芬 +1 位作者 代华琴 蒋玉蓉 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期613-624,共12页
聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)作为一种能检测基因组间DNA碱基微小差异的技术手段,具有操作简便、快捷且灵敏度高等优点。比较基因组学近年来已经成... 聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)作为一种能检测基因组间DNA碱基微小差异的技术手段,具有操作简便、快捷且灵敏度高等优点。比较基因组学近年来已经成为研究生物基因组的最主要手段之一;大量基因组序列的产生为通过比较基因组学开发新标记和定位目标基因提供了大量的DNA序列资源。本研究以李氏超短纤维突变体(Ligon lintless-1,Li1)为材料,定位Li1基因,针对PCR扩增产物片段较大的样品(〉400bp)进行PCR-SSCP技术的优化,用已发表的拟南芥(Arabidopsis thaliana)和棉花(Gossypium spp.)D基因组DNA序列为参考,探索PCR-SSCP技术与比较基因组学结合开发新标记应用于棉花基因定位的可能性。结果表明,电压为150 V,胶浓度为10%,电泳温度为4℃时电泳结果最好;上样缓冲液与PCR扩增目的片段比例为5∶1为最佳比例。利用上述优化的PCR-SSCP技术将根据棉花与拟南芥同线性区段开发的分子标记构建了一个由28个标记组成的长度为149.6 c M的遗传图,该区域包含4个功能上与Li1位点密切相关的基因。此外,利用D基因组序列开发的标记构建了一个由17个SSCP标记和Li1位点组成,跨越40.3c M的遗传图谱,距其最近的两端标记W058和P095分别为0.6和0.3 c M。本研究为棉花Li1基因的精细定位及其候选基因的克隆提供了理论基础。 展开更多
关键词 棉花 PCR-SSCP 李氏超短纤维突变体(Li1) 比较基因组学 遗传作图
大豆育种中常用的遗传标记概述 预览 被引量:1
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作者 毛向红 王梦飞 +2 位作者 陈燕妮 刘冠男 王彧超 《农业开发与装备》 2015年第4期53 145-,共2页
<正>遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征。在经典遗传学中,遗传多态性是指等位基因的变异。在现代遗传学中,遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异。遗传标记可以帮助人们更好地研究生物的变异规律。在遗传学研... <正>遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征。在经典遗传学中,遗传多态性是指等位基因的变异。在现代遗传学中,遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异。遗传标记可以帮助人们更好地研究生物的变异规律。在遗传学研究中遗传标记主要应用于连锁分析、基因定位、遗传作图及基因转移等;在作物育种中通常将与育种目标性状紧密连锁的遗传标记用来对目标性状进行追踪选择;在现代分子育种研究中,遗传标记的应用已成为基因定位和 展开更多
关键词 遗传标记 遗传多态性 基因定位 大豆育种 现代遗传 经典遗传 遗传作图 基因转移 紧密连锁 遗传
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小麦河农6251苗期抗叶锈病基因的鉴定 预览 被引量:1
7
作者 任晓娣 杜冬冬 +4 位作者 张河山 姚宏鹏 赵赛 杨文香 刘大群 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第3期192-199,共8页
为明确河农6251含有的抗叶锈基因并对其进行分子定位,以抗病品种河农6251与感病品种Thatcher的杂种F1、F2、F3群体为材料,对河农6251的苗期抗叶锈基因进行定位。分子标记辅助鉴定结果表明,河农6251中含有抗叶锈基因Lr26和Lr ZH84,可能含... 为明确河农6251含有的抗叶锈基因并对其进行分子定位,以抗病品种河农6251与感病品种Thatcher的杂种F1、F2、F3群体为材料,对河农6251的苗期抗叶锈基因进行定位。分子标记辅助鉴定结果表明,河农6251中含有抗叶锈基因Lr26和Lr ZH84,可能含有Lr2c和Lr17a;遗传分析表明,河农6251对叶锈菌PBGP的抗性由1对显性抗病基因决定,暂命名为Lr H6;用SSR技术和分离群体分组法(BSA)分析河农6251 F2群体和F3家系,结果位于1B染色体的3个SSR标记wmc419、wms582和barc120与Lr H6连锁,遗传距离分别为21.6,25.8,27.9 c M。河农6251中含有Lr26、Lr ZH84等多个抗叶锈基因,其对PBGP的抗性由一对位于1BL染色体上的显性抗叶锈基因决定。 展开更多
关键词 小麦叶锈病 抗病基因 SSR标记 遗传分析 遗传作图
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金叶弯刺蔷薇×山刺玫遗传连锁图谱的初步构建 被引量:1
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作者 杨树华 李世超 +4 位作者 贾瑞冬 赵鑫 金茂勇 李凤杰 葛红 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2526-2534,共9页
以金叶弯刺蔷薇(Rosa beggeriana‘Aurea’,叶色突变材料)和山刺玫(R.davurica)为杂交亲本建立F1群体,利用AFLP和SSR分子标记进行遗传连锁图谱构建。结果表明:124个AFLP标记、25个SSR标记及1个形态标记定位于父、母本遗传连锁图谱... 以金叶弯刺蔷薇(Rosa beggeriana‘Aurea’,叶色突变材料)和山刺玫(R.davurica)为杂交亲本建立F1群体,利用AFLP和SSR分子标记进行遗传连锁图谱构建。结果表明:124个AFLP标记、25个SSR标记及1个形态标记定位于父、母本遗传连锁图谱的13个连锁群上,其中92个分子标记定位于金叶弯刺蔷薇7个连锁群,遗传距离覆盖度为607.2 c M,金叶突变性状被定位于第4连锁群;57个分子标记定位于山刺玫6个连锁群,遗传距离覆盖度为437.1 c M。两类分子标记的总作图效率达到69.6%。发生偏分离的分子标记数量为44个,偏分离率为29.5%。 展开更多
关键词 金叶弯刺蔷薇 山刺玫 遗传作图 AFLP标记 SSR标记
A statistical method for genetic mapping of sterility genes that exhibit epistasis in remote hybridization of plants using molecular markers in an F2 population
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作者 XIE ShangQian CHEN JianGuo 《中国科学通报:英文版》 SCIE CAS 2012年第21期 2681-2687,共7页
位置的评价和绝育基因的效果是要解决在植物在遥远的杂交理解绝育机制的一个重要问题。在这研究,一个最大的可能性的(ML ) 方法被用于位置的评价和用标记的弄歪的分离在一张 F2 人口展出 epistasis 的绝育基因的效果。再结合部分和生... 位置的评价和绝育基因的效果是要解决在植物在遥远的杂交理解绝育机制的一个重要问题。在这研究,一个最大的可能性的(ML ) 方法被用于位置的评价和用标记的弄歪的分离在一张 F2 人口展出 epistasis 的绝育基因的效果。再结合部分和生存能力的 ML 解决方案经由一个期望最大化算法被获得。蒙特卡罗模拟的结果证明再结合部分和生存能力的估计与他们的真价值一致。参数的偏爱和标准差显示一种更大的样品尺寸,更靠近的连接和无菌的基因的更低的生存能力导致了包含的参数的更好的估计。F2 人口的标记数据的一个子集源于在米饭装饰用的梨树栽培变种 Nipponbare 之间的一个单个十字, indica 栽培变种 Kasalath 用这个方法被分析。八绝育基因在染色体上被识别 1, 3, 6, 8 和 10,并且重要 epistasis 在四绝育基因之中被检测。 展开更多
关键词 不育基因 分子标记 杂交不育 统计方法 遗传作图 F2群体 植物 期望最大化算法
小麦转录因子基因W16的功能标记作图和关联分析 预览 被引量:5
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作者 雷梦林 李昂 +4 位作者 昌小平 徐兆师 马有志 刘惠民 景蕊莲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期 1667-1675,共9页
【目的】开发小麦DREB转录因子基因W16的功能标记,进行遗传作图,并结合表型性状关联分析,为利用分子标记进行小麦遗传改良提供依据。【方法】以六倍体普通小麦及其野生近缘种的二倍体和四倍体为材料,克隆W16的DNA序列;根据序列多... 【目的】开发小麦DREB转录因子基因W16的功能标记,进行遗传作图,并结合表型性状关联分析,为利用分子标记进行小麦遗传改良提供依据。【方法】以六倍体普通小麦及其野生近缘种的二倍体和四倍体为材料,克隆W16的DNA序列;根据序列多态性设计分子标记;利用中国春缺四体材料对基因进行染色体定位,用DH群体(旱选10号×鲁麦14)进行精细定位并作图;以154份六倍体普通小麦材料构成的自然群体分析表型性状与基因单倍型的关联特性。【结果】利用中国春缺四体材料先将W16定位在1A染色体上。后利用DH群体将W16定位于染色体1A的CWM517和聊彩护标记之间,距左、右标记的遗传距离分别为7.8cM和19.4cM。在小麦自然群体中共检测到胛石的3种单倍型,分别与单株穗数、穗粒数、每穗小穗数和籽粒饱满度关联。【结论】确定了胛纠开在的染色体位置,鉴定出HapII为增加单株穗数和籽粒饱满度的优良单倍型,HapIII为提高穗粒数的优良单倍型,该基因的功能标记和关联分析结果为小麦分子育种提供了重要信息。 展开更多
关键词 普通小麦 W16 功能标记 遗传作图 关联分析
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烤烟6个农艺性状的QTL定位 预览 被引量:3
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作者 童治军 焦芳婵 +7 位作者 吴兴富 王丰青 陈学军 李绪英 高玉龙 张谊寒 肖炳光 吴为人 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1407-1415,共9页
由于烟草的分子标记开发和遗传图谱构建十分困难,迄今烟草中有关数量性状基因座(QTL)的定位研究仍非常有限。本研究利用一个由207个株系组成的烤烟DH群体及基于该群体所构建的含有24个连锁群、611个SSR标记,总长为1882.1cM的遗传图谱... 由于烟草的分子标记开发和遗传图谱构建十分困难,迄今烟草中有关数量性状基因座(QTL)的定位研究仍非常有限。本研究利用一个由207个株系组成的烤烟DH群体及基于该群体所构建的含有24个连锁群、611个SSR标记,总长为1882.1cM的遗传图谱,采用复合区间作图方法,对株高(PH)、茎围(SG)、节距(IL)、叶片数(LN)、最大腰叶长(LWL)和最大腰叶宽(WWL)6个与叶片产量有关的农艺性状进行QTL定位分析。共检测到69个QTL,大部分QTL的效应值较小,仅有4个具有较大的效应值,可解释大约15%~20%的表型变异。6个性状之间大多彼此相关。与此相符,在基因组中发现存在许多小区域,每个区域包含2个或2个以上紧密连锁的不同性状的QTL。 展开更多
关键词 烤烟 数量性状基因座 遗传作图 加倍单倍体 产量
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小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单核苷酸多态性分析及其定位 预览 被引量:7
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作者 岳爱琴 李昂 +4 位作者 毛新国 昌小平 李润植 贾继增 景蕊莲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2216-2224,共9页
【目的】小麦果聚糖合成酶基因6-SFT是果聚糖合成过程中的关键酶基因,研究6-SFT-A的多态性,分析其与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位。【方法】以苗期抗旱性不同的30份六倍体小麦和4份小麦A基因组供体种乌拉尔图小麦为材料,通过直... 【目的】小麦果聚糖合成酶基因6-SFT是果聚糖合成过程中的关键酶基因,研究6-SFT-A的多态性,分析其与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位。【方法】以苗期抗旱性不同的30份六倍体小麦和4份小麦A基因组供体种乌拉尔图小麦为材料,通过直接测序分析6-SFT-A的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系;开发基因分子标记,利用RIL群体(偃展1号×内乡188)对该基因进行遗传定位。【结果】在30份六倍体小麦材料中检测到14个核苷酸多态性位点,包括13个SNP和1个InDel,平均234 bp检测到一个多态性位点,仅在1 727和1 781 bp 2个位点检测到非同义突变;在4份乌拉尔图小麦中检测到28个SNP和4个InDel,其频率明显高于普通小麦。该基因的内含子1、2、3和外显子3为变异富集区,其它区域变异较小,外显子2变异最小,π值为0。34份材料分为3种单倍型,HaplⅠ主要包括中等抗旱材料和水敏感材料,HaplⅢ中主要包括强抗旱材料和中等抗旱材料。利用RIL群体将该基因定位于染色体4A的标记Xcwm-27与Xwpt688之间,遗传距离分别为5.3和7.9 cM。【结论】单倍型分析表明,小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单倍型与小麦苗期抗旱性有一定的相关性。 展开更多
关键词 小麦 6-SFT-A 单核苷酸多态性 抗旱性 单倍型 遗传作图
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小麦蛋白磷酸酶2A结构亚基基因TaPP2Aa的功能标记作图 预览 被引量:2
13
作者 王智兰 毛新国 +3 位作者 李昂 昌小平 刘惠民 景蕊莲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期2411-2421,共11页
【目的】开发小麦抗旱相关蛋白磷酸酶结构亚基基因TaPP2Aa的功能标记并作图,为分子标记辅助选择抗逆育种提供依据。【方法】测序得到普通小麦及其野生近缘种TaPP2Aa的基因序列,分析其SNP位点差异,设计3对基因组特异引物和6对基因组内等... 【目的】开发小麦抗旱相关蛋白磷酸酶结构亚基基因TaPP2Aa的功能标记并作图,为分子标记辅助选择抗逆育种提供依据。【方法】测序得到普通小麦及其野生近缘种TaPP2Aa的基因序列,分析其SNP位点差异,设计3对基因组特异引物和6对基因组内等位基因特异引物,利用中国春缺四体对TaPP2Aa进行染色体定位,利用RIL群体(Opata 85×W7984)和DH群体(旱选10号×鲁麦14)进行该基因的功能标记作图。【结果】TaPP2Aa定位于小麦第5同源染色体群上;TaPP2Aa-B位于RIL群体5B的标记区间Xwg909—Xgwm67,与2个标记的遗传距离分别为4.0 cM和3.6 cM,在DH群体5B染色体的标记区间Xgwm234—WMC363,与WMC363的遗传距离为7.5 cM;在2个遗传群体中与标记Xgwm67的距离分别为3.6 cM和11.4 cM。TaPP2Aa-D位于RIL群体染色体5D的标记区间Xcmwg770—Xbarc205,遗传距离分别为9.8 cM和10.0 cM。【结论】确定了TaPP2Aa所在的染色体位置,通过与DH和RIL 2个遗传作图群体中已有的抗逆主效QTL进行对比分析,明确了TaPP2Aa与小麦抗逆性状QTL具有遗传连锁关系,开发的功能标记可用于小麦抗逆性状的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 普通小麦 TaPP2Aa 功能标记 遗传作图
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三点测验遗传特点的原因 预览
14
作者 邢德智 《生物学通报》 北大核心 2009年第2期 21-22,共2页
利用图解,阐述了“三点测验”中,为什么F1能产生8种配子;进而阐述了为什么F1产生的配子中“亲组合型”配子多,而“重组合型”配子少、特别是“双交换重组合型”配子比例极小,并指出双交换值的最大值和基因的位置是如何影响交换值... 利用图解,阐述了“三点测验”中,为什么F1能产生8种配子;进而阐述了为什么F1产生的配子中“亲组合型”配子多,而“重组合型”配子少、特别是“双交换重组合型”配子比例极小,并指出双交换值的最大值和基因的位置是如何影响交换值大小的。 展开更多
关键词 三点测验 遗传作图 最大双交换值
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小麦TaGA20ox2基因的克隆及分析 预览 被引量:8
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作者 武晶 孔秀英 +2 位作者 高丽峰 任正隆 贾继增 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期3405-3412,共8页
【目的】克隆小麦中的GA20-氧化酶基因并进行遗传定位,为深入研究小麦中的GA20-氧化酶基因作用机理奠定基础,同时为改良小麦的重要农艺性状提供理论依据。【方法】采用同源克隆结合BAC文库筛选的方法克隆基因,利用中国春缺失体以及国际... 【目的】克隆小麦中的GA20-氧化酶基因并进行遗传定位,为深入研究小麦中的GA20-氧化酶基因作用机理奠定基础,同时为改良小麦的重要农艺性状提供理论依据。【方法】采用同源克隆结合BAC文库筛选的方法克隆基因,利用中国春缺失体以及国际作图群体对该基因进行遗传定位。【结果】从普通小麦中国春中分离得到TaGA20ox2的gDNA与cDNA序列,利用中国春缺失体材料将TaGA20ox2定位于3A、3B、3D染色体上,序列分析表明分别位于3A、3B、3D染色体上的TaGA20ox2-A1、TaGA20ox2-B1和TaGA20ox2-D1与水稻GA20ox2为直向同源基因,具有GA20ox2家族保守结构域;利用国际作图群体W7984×Opata85将位于3D上的基因TaGA20ox2-3定位于xfba330与xgwm664标记之间。【结论】分离获得小麦中分布于第三同源群的GA20ox2;分子标记结果结合QTL作图信息可以初步推测TaGA20ox2-3在小麦中可能是控制株高的基因。 展开更多
关键词 小麦 GA20-氧化酶 基因克隆 遗传作图
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柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进 预览
16
作者 向旭 邓占鳌 +2 位作者 郑启发 陈存贤 Frederick G. Gmitter Jr. 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第3期 497-504,共8页
本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克... 本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插入序列设计引物,对柑桔抗线虫材料和感线虫材料开展以PCR扩增为基础的集群分离分析,发现一部分克隆序列与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1紧密连锁;再通过染色体步行测序,分别从3个克隆(7A4,4L17和29F20)获得3个完整的NBS-LRR类候选抗病基因序列。从此类序列开发更高特异性的分子标记,并在利用原有分子标记的基础上,对柑桔线虫抗性杂交后代群体(9145 family)构建较高密度的遗传图谱;同时,将新开发的分子标记应用于柑桔衰退病抗性杂交后代群体(9401 family),以初步估算柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr]与柑桔衰退病抗性基因Ctv的遗传距离。 展开更多
关键词 柑桔 线虫 抗性基因 分子标记 遗传作图
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河南省农科院小麦抗白粉病基因研究进展 预览 被引量:8
17
作者 刘红彦 王俊美 +6 位作者 高素霞 伊艳杰 王瑞 柴春月 许红星 徐红明 唐自阔 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第9期 109-113,共5页
总结了河南省农科院植保所近10年来在小麦抗白粉病基因分子标记鉴定、遗传图谱构建和抗白粉病相关基因克隆方面的研究进展,并分析了存在的问题。
关键词 小麦 白粉病 抗病基因 遗传作图 克隆 河南
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小麦EST—SSRs分子标记的特性及其遗传作图 预览 被引量:1
18
作者 张立异 Leroy Philip +2 位作者 Bernard Michel 张庆勤 Sourdille Pierre 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期 11-20,共10页
为了解普通小麦EST来源的微卫星的多样性,从大约1000个包含微卫星的ESTs中设计了300对引物,研究和评估了它们的多态性水平,并且将多态性标记加入到现有的遗传图谱中。在五种不同类型的重复单元中,三个碱基的重复单元出现最多,占到7... 为了解普通小麦EST来源的微卫星的多样性,从大约1000个包含微卫星的ESTs中设计了300对引物,研究和评估了它们的多态性水平,并且将多态性标记加入到现有的遗传图谱中。在五种不同类型的重复单元中,三个碱基的重复单元出现最多,占到77%。几乎所有的EST—SSRs标记(99.3%)的重复单元都含有G-C碱基对。37.4%的微卫星都是四次重复。对于扩增和多态性,300对引物中有60对没有扩增,21.3%的扩增引物没能产生预期的扩增片断。58%的标记至少在所用8个材料的一个中显示出多态性。W7984和Opata组合表现出最高的多态性水平。大多数普通小麦EST—SSRs标记的重复次数小于10,并且4次重复是最为普遍的。81个新的EST—SSR位点被添加到两个已有的参照遗传图谱中(62个加到ITMI,19个加到CTCS)。研究结果表明小麦EST-SSRs标记展示了一些不同于基因组微卫星的特异特征,在标记发展和其他遗传应用中,这就使得它们能够成为一种非常有价值的资源。 展开更多
关键词 普通小麦 EST-SSRS 多态性 遗传作图
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利用四交群体构建陆地棉栽培品种间的SSR标记遗传图谱 预览 被引量:1
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作者 秦鸿德 张天真 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期 13-19,共7页
作物遗传作图与QTL定位常应用在源于两自交系的单交群体上,是利用2个亲本之间的遗传多态信息;而育种实践中经常用到的四交群体却很少用于遗传作图。本研究将异交物种中F1分离群体的作图方法应用于常异花授粉作物棉花上,以4个陆地棉栽培... 作物遗传作图与QTL定位常应用在源于两自交系的单交群体上,是利用2个亲本之间的遗传多态信息;而育种实践中经常用到的四交群体却很少用于遗传作图。本研究将异交物种中F1分离群体的作图方法应用于常异花授粉作物棉花上,以4个陆地棉栽培品种泗棉3号、苏棉12、中4133和8891为亲本,构建陆地棉品种间四交作图群体泗棉3号/苏棉12//中4133/8891,利用JoinMap3.0构建了1张陆地棉栽培品种间的SSR标记遗传图谱。该图谱由56个连锁群组成,总长为2113.3cM,含有286个SSR多态位点,覆盖率达42.3%;单个连锁群的标记数2-24个,平均5.2个;长度为0.37-125cM,平均38.4cM;标记间的平均距离为7.4cM。这是目前报道的第1张覆盖率达40%的陆地棉栽培品种间的分子标记遗传图谱。 展开更多
关键词 陆地棉 四交群体 遗传作图
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草棉EST-SSRs的遗传评价 预览 被引量:7
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作者 余渝 王志伟 +3 位作者 冯常辉 张艳欣 林忠旭 张献龙 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期 2085-2091,共7页
根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR,1~6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST—SSR引物,其... 根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR,1~6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST—SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49~0.91之间,平均为0.81。6对引物在BC.种间作图群体[(鄂棉22×Pima3—79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性。除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例,其余引物表现正常分离。6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱上的6条染色体:有4个位于A亚基因组的4条染色体上(Chr.6、10、11和12),2个位于D亚基因组的2条染色体(Chr.19和20)。 展开更多
关键词 草棉 表达序列标签 简单序列重复 多态性信息含量 遗传作图
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