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不同花型滇山茶遗传多样性与遗传关系的AFLP分析
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作者 甘沛华 沈德周 +3 位作者 纵丹 谢忠利 李旦 何承忠 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1222-1230,共9页
利用7对扩增片段长度多态性(AFLP)标记引物组合对16种花型325份样本的滇山茶(Camellia reticulata)开展遗传多样性与遗传关系分析。研究结果显示,7对引物组合共扩增得到713条带,多态性条带百分率(PPB)为100%,Nei's基因多样性指数(H)... 利用7对扩增片段长度多态性(AFLP)标记引物组合对16种花型325份样本的滇山茶(Camellia reticulata)开展遗传多样性与遗传关系分析。研究结果显示,7对引物组合共扩增得到713条带,多态性条带百分率(PPB)为100%,Nei's基因多样性指数(H)为0.2471,Shannon's信息指数(I)为0.3965。在3种自然类型(nfp)之间,多态性条带百分率(PPBnfp)为90.46%~99.86%,基因多样性指数(Hnfp)变幅为0.2356~0.2478,Shannon's信息指数(Infp)在0.3786~0.3971之间,遗传多样性水平为重瓣类型>单瓣类型>半重瓣类型。半重瓣类型(sdp)的5个品种类群间,PPBsdp变幅在83.45%~91.16%之间,Hsdp和Isdp的变化范围分别在0.2052~0.2487和0.3292~0.3880之间,5个品种类群的遗传多样性水平为凤凰屏群>杜鹃群>芙蓉群>金穗茶群>彩蝶群。重瓣类型(dp)的10个品种类群间,PPBdp介于76.16%~96.91%之间,Hdp在0.2213~0.2565之间,Idp的变化范围在0.3467~0.4026之间,10个品种类群的遗传多样性水平为星群>蝶翅群>牡丹群>松子鳞群>玫瑰群>雪花群>梅花群>无蕊群>莲花群>双冠群。不同自然类型或不同品种类群间的基因流值均大于1,自然类型内或品种类群内不同个体遗传差异是滇山茶遗传多样性的主要来源。非加权算术平均法(UPGMA)聚类结果能够将16个品种类群鉴别区分,表明基于表型性状的滇山茶品种类群划分具有合理性和科学性。在遗传距离为0.0088处,将16个品种类群划分为5个大组,揭示出半重瓣类型是单瓣类型和重瓣类型的中间过渡类型。本研究结果拟为滇山茶品种类群的划分提供分子水平证据。 展开更多
关键词 滇山茶 花型 遗传多样性 遗传关系 AFLP分子标记
贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体STR基因座的遗传多态性及遗传关系分析 预览
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作者 刘亚举 李瑾 +2 位作者 岳俊涛 李学博 石美森 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期682-689,共8页
目的调查贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨其群体遗传关系。方法应用SureID■PanGlobal试剂盒对贵州399名仡佬族和333名苗族无关个体进行DNA扩增,采用3500XL遗传分析仪进行电泳分析,GeneMap... 目的调查贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨其群体遗传关系。方法应用SureID■PanGlobal试剂盒对贵州399名仡佬族和333名苗族无关个体进行DNA扩增,采用3500XL遗传分析仪进行电泳分析,GeneMapperID-Xv1.5软件分析等位基因片段大小。统计分析24个STR基因座的频率数据和法医遗传学参数,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果贵州仡佬族和苗族各基因座个体识别率(DP)值分别为0.7833~0.9909和0.8010~0.9909,多态信息含量(PIC)值分别为0.5608~0.9385和0.5677~0.9414。累积个体识别率(TDP)分别为1-7.6036×10^-30和1-6.8630×10^-30,累积非父排除率(CPE)分别为1-1.9608×10^-11和1-1.9738×10^-11。Nei'sDA遗传距离矩阵分析发现,贵州仡佬族与湖北汉族遗传距离最小(0.0205),与云南苗族的遗传距离最大(0.0449);贵州苗族与湖南汉族的遗传距离最小(0.0033),与云南苗族的遗传距离最大(0.0363)。结论24个STR基因座在贵州仡佬族和苗族人群中具有丰富的遗传多态性。研究不同民族群体的遗传多样性对了解其起源、迁移以及相互关系有重要意义。 展开更多
关键词 常染色体短串联重复序列 遗传多态性 Neighbor-Joining系统发育树 遗传关系
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山东省玉米穗腐病病原菌的分离鉴定及优势种的系统发育分析 预览
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作者 丁梦军 杨扬 +3 位作者 孙华 马红霞 刘树森 石洁 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期216-223,共8页
旨在明确山东省玉米穗腐病病原菌组成及优势病原菌的流行趋势。对2015-2017年在山东省采集的138份玉米穗腐病样品进行了病原菌的分离,采用形态学和分子生物学方法对分离物进行鉴定,并对优势病原菌进行系统发育分析,明确其发生发展规律... 旨在明确山东省玉米穗腐病病原菌组成及优势病原菌的流行趋势。对2015-2017年在山东省采集的138份玉米穗腐病样品进行了病原菌的分离,采用形态学和分子生物学方法对分离物进行鉴定,并对优势病原菌进行系统发育分析,明确其发生发展规律。分离鉴定结果表明,分离到的真菌共有18种,其中镰孢属的拟轮枝镰孢菌分离频率为67.39%,为山东省优势病原菌;其次为层出镰孢菌,分离频率为10.87%;禾谷镰孢复合种、木贼镰孢菌和尖孢镰孢菌的分离频率分别为7.97%,5.80%,0.72%;木霉属的哈茨木霉分离频率为7.91%;青霉属的草酸青霉分离频率为6.52%;曲霉属黄曲霉和黑曲霉的分离频率分别为2.17%和5.07%。基于EF-1α基因序列构建了山东省2015-2017年拟轮枝镰孢菌的系统发育树,并分析了山东省菌株与河北省菌株的遗传进化关系。系统发育分析结果发现,89个拟轮枝镰孢菌菌株可以分为2个大群,其遗传距离较小,为0.002~0.016,表明山东省2015-2017年的菌株之间遗传关系较近;河北省和山东省拟轮枝镰孢菌菌株的遗传距离较小,相似性较高,亲缘关系较近,存在较为频繁的基因交流。研究结果为深入开展拟轮枝镰孢菌穗腐病的抗性育种、发生发展规律以及综合防治提供科学依据。 展开更多
关键词 玉米穗腐病 拟轮枝镰孢菌 分离频率 遗传关系
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基于ITS2序列的苍术属植物遗传关系
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作者 姜宇珺 张北雪 +2 位作者 马善鹏 孙建之 才谦 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第23期171-175,共5页
目的:应用内部转录间隔区2(ITS2)序列鉴定东北产栽培和野生苍术及其近缘种药材,明确其种间遗传关系远近,并对东北产朝鲜苍术的栽培起源进行初步探索。方法:提取不同栽培区包括北苍术、朝鲜苍术在内的五种苍术属40份样本以及朝鲜苍术7份... 目的:应用内部转录间隔区2(ITS2)序列鉴定东北产栽培和野生苍术及其近缘种药材,明确其种间遗传关系远近,并对东北产朝鲜苍术的栽培起源进行初步探索。方法:提取不同栽培区包括北苍术、朝鲜苍术在内的五种苍术属40份样本以及朝鲜苍术7份野生种质样本的基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,所得所有序列用MEGA5. 0软件进行比对分析(clustal W),去除两端5. 8S和28S序列,获得完整的ITS2序列,构建系统聚类树(NJ树)。结果:苍术属5种药材ITS2序列长度均为232 bp。根据NJ树和ITS2二级结构结果,除北苍术和朝鲜苍术未被区分开,其余几种药材均可明显区分,表现出良好的单系性。根据NJ树结果可知,朝鲜苍术的栽培品系和野生种质也能很好的聚在一起。结论:ITS2序列能稳定、准确鉴别苍术属5种药材。朝鲜苍术与北苍术亲缘关系很近,可认为是苍术北方分支中的一种变种,建议将朝鲜苍术并入北苍术。且在辽宁有大规模栽培的朝鲜苍术可能起源于辽宁本地的野生群体,种源可能来自于辽宁岫岩等地的野生种。 展开更多
关键词 苍术属 关苍术 朝鲜苍术 内部转录间隔区2(ITS2) 遗传关系 二级结构
秦黑杨1号等美洲黑杨指纹图谱构建及遗传关系分析 预览
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作者 巫明会 樊军锋 +1 位作者 高建设 周永学 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期91-95,共5页
以西北农林科技大学渭河试验站的12个美洲黑杨无性系为材料,从国际杨树基因组委员会官方网站中提供的引物中选取25对引物对美洲黑杨进行指纹图谱构建,最终筛选出5对多态性丰富、扩增效率高、条带清晰的引物。5对引物共扩增条带24条,其... 以西北农林科技大学渭河试验站的12个美洲黑杨无性系为材料,从国际杨树基因组委员会官方网站中提供的引物中选取25对引物对美洲黑杨进行指纹图谱构建,最终筛选出5对多态性丰富、扩增效率高、条带清晰的引物。5对引物共扩增条带24条,其中多态性条带23条,占95.8%,SSR引物多态性条带数4~8条,平均4.8条。对12份种质进行UPGMA聚类分析,品种遗传相似性系数在0.4583~0.9583,平均相似系数为0.6660。研究利用5对引物(PMGC_2217、PMGC_2675、PMGC_2866、WPMS_14、WPMS_17)可将12份美洲黑杨种质完全区分开。研究结果可为美洲黑杨品种鉴定和知识产权保护提供理论依据。 展开更多
关键词 秦黑杨 SSR 指纹图谱 遗传关系
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新疆哈萨克族人群23个常染色体STR基因座的遗传多态性及与其他民族的遗传相关性 预览
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作者 刘亚举 李效阳 +2 位作者 郭利红 李学博 石美森 《基础医学与临床》 CSCD 2019年第2期157-164,共8页
目的调查新疆哈萨克族人群23个常染色体STR基因座遗传多态性,探讨其群体遗传关系及法医学应用价值。方法用华夏^TM白金试剂盒,对新疆地区550名哈萨克族无关个体DNA进行扩增,3500XL遗传分析仪电泳分析,GeneMapper ID-X v1.4软件分析等位... 目的调查新疆哈萨克族人群23个常染色体STR基因座遗传多态性,探讨其群体遗传关系及法医学应用价值。方法用华夏^TM白金试剂盒,对新疆地区550名哈萨克族无关个体DNA进行扩增,3500XL遗传分析仪电泳分析,GeneMapper ID-X v1.4软件分析等位基因片段大小。统计分析23个STR基因座的频率数据和法医遗传学参数,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果新疆哈萨克族各基因座个体识别率DP值在0.8206~0.9879,多态信息含量PIC值在0.5888~0.9200。累积个体识别率(CDP)和累积非父排除率(CPE)分别为1~9.2942×10^-29和1~6.9503×10^-11。本研究根据Nei's DA遗传距离计算,新疆哈萨克族与数据库中的新疆和田哈萨克族的遗传距离最近(0.0044),与西藏藏族的遗传距离相对最远(0.0333)。结论这23个STR基因座在新疆哈萨克族人群中具有丰富的遗传多态性。研究不同民族群体的遗传多态性对了解他们的起源、迁移以及相互关系有重要的意义。 展开更多
关键词 常染色体短串联重复序列 新疆哈萨克族 Neighbor-Joining系统发育树 遗传关系
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94个茶树种质资源遗传多样性与亲缘关系分析 预览
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作者 杨军 王让剑 +2 位作者 孔祥瑞 郑国华 邱陈华 《茶叶学报》 2018年第4期186-192,共7页
为实现茶树种质资源的系统分类,利用17对SSR对94个茶树种质资源进行亲缘关系、遗传多样性与群体结构分析。结果表明:6个自然杂交后代群体的亲缘关系分为3种类型,第1种茗科1号(金观音)、金牡丹、悦茗香和白鸡冠的自然杂交后代群体与其亲... 为实现茶树种质资源的系统分类,利用17对SSR对94个茶树种质资源进行亲缘关系、遗传多样性与群体结构分析。结果表明:6个自然杂交后代群体的亲缘关系分为3种类型,第1种茗科1号(金观音)、金牡丹、悦茗香和白鸡冠的自然杂交后代群体与其亲本关系密切;第2种福云6号自然杂交后代群体分别与福云6号和乌龙茶资源亲缘关系较近;第3种紫玫瑰自然杂交后代群体未与紫玫瑰聚类在一起;武夷山茶树种质资源群体遗传多态性最高,分别与肉桂和矮脚乌龙亲缘关系较近。群体结构分析表明,94个茶树种质资源分为3类群,分别为闽南高香资源类群属性、闽北乌龙茶种质资源类群属性、乌龙茶与绿茶种质资源混合类群属性。 展开更多
关键词 自然杂交种 EST-SSR 遗传关系 遗传多样性
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罗非鱼"粤闽1号"及其繁育群体的遗传多样性和遗传关系分析 预览
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作者 刘志刚 卢迈新 +1 位作者 曹建萌 高风英 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2018年第6期31-41,共11页
罗非鱼“粤闽1号”是用尼罗罗非鱼(Oreochromisniloticus)和奥利亚罗非鱼(0.aureus)培育的全雄罗非鱼新品种。采用同工酶电泳技术和线粒体DNA控制区序列分析方法,对罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体的遗传多样性、遗传结构及群体之间的遗... 罗非鱼“粤闽1号”是用尼罗罗非鱼(Oreochromisniloticus)和奥利亚罗非鱼(0.aureus)培育的全雄罗非鱼新品种。采用同工酶电泳技术和线粒体DNA控制区序列分析方法,对罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体的遗传多样性、遗传结构及群体之间的遗传关系进行研究。同工酶电泳结果显示,酯酶(EsT)和乳酸脱氢酶(LDH)的酶谱具有组织和群体特异性。肌肉和脾脏中的EST表达量极低,而肝脏中的EST表达量较高,LDH在3种组织中均有较高表达,但酶谱存在差异。在罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体中,共检测到10条EST酶带和5条LDH酶带,多态性位点比例(P)为12.50%~71.43%,平均观测杂合度(H0)为0.0417~0.6143,Hardy—Weinberg遗传偏离指数(D)为一0.2347~0.9072。线粒体DNA控制区序列分析结果显示,mtDNAD.100p区的碱基组成无显著差异,均呈现出‘A+T碱基偏向性(63.39%)。在罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体中,共发现20种单倍型,核苷酸多样性指数(Pi)为0-0.0519,奥尼罗非鱼雌鱼(WYl)、尼罗罗非鱼雌鱼(XX)、尼罗罗非鱼雄鱼(XY)和罗非鱼“粤闽1号”(XY2)群体的只值(0.0440~0.0519)明显高于超雄尼罗罗非鱼(YYl)、超雄奥尼罗非(YY2)和奥利亚罗非鱼雌鱼(WZ)群体的Pi值(0~0.0009)。各群体之间的遗传分化指数(FST)为一0.0115-0.9963,XY2与WYl群体之间、XX与XY群体之间以及WZ和YY2群体之间的遗传分化不显著(FST<0.05,P>0.05)。XY2群体与尼罗罗非鱼群体(XX群体和XY群体)和奥利亚罗非鱼群体(WZ群体)之间的平均遗传距离分别为0.0639和0.0695。在NJ系统进化树中,XX、XY、YYl和XY2群体聚为一支,WYl、WZ和YY2群体聚为另一支。本研究揭示了罗非鱼“粤闽1号”的生化和分子遗传特征,为其种质鉴定、繁育群体的构建和优良性状的稳定遗传提供理论基础。 展开更多
关键词 罗非鱼“粤闽1号” 同工酶 线粒体DNA控制区 遗传多样性 遗传关系
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枣庄石榴种质资源遗传多样性的ISSR分析
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作者 马丽 王庆军 +3 位作者 罗华 郝兆祥 周玉亮 赵丽娜 《北方园艺》 北大核心 2018年第24期35-40,共6页
以39份枣庄石榴品种为试材,采用ISSR标记方法,研究了石榴品种间的遗传多样性及遗传关系,以期为枣庄石榴种质资源保存、杂交育种奠定基础。结果表明:9条ISSR引物对39个品种进行扩增,共检测到168个DNA位点,平均每条引物扩增出18.67个DNA位... 以39份枣庄石榴品种为试材,采用ISSR标记方法,研究了石榴品种间的遗传多样性及遗传关系,以期为枣庄石榴种质资源保存、杂交育种奠定基础。结果表明:9条ISSR引物对39个品种进行扩增,共检测到168个DNA位点,平均每条引物扩增出18.67个DNA位点,其中多态性位点156个,多态性位点比率(PPB)为92.86%。供试样品平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s 基因多样性指数(He)及Shannon信息指数(I)分别为1.928 6、1.690 9、0.384 7、0.557 3;品种的遗传相似系数(GS)在0.410 7~0.958 3,采用UPGMA 构建遗传关系聚类图,以遗传相似性系数(GS)0.656为阈值,供试的39份石榴品种可分为5类,根据ISSR标记的品种分类结果与根据形态性状分类结果不一致。 展开更多
关键词 枣庄 石榴 遗传多样性 遗传关系 ISSR
不同茯苓菌株的质量评价及遗传关系鉴定 预览 被引量:1
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作者 吴胜莲 唐少军 +3 位作者 靳磊 邵晨霞 杨祎 贺月林 《南方农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期8-13,共6页
【目的】评价不同茯苓菌株质量并鉴定其遗传关系,为茯苓菌株资源合理利用及优良菌株选育提供参考。【方法】以11株不同来源的茯苓菌株为研究对象,分别采用平面培养法测定其菌丝生长速率,松树兜栽培法测定其菌核产量,反复转接法测定其遗... 【目的】评价不同茯苓菌株质量并鉴定其遗传关系,为茯苓菌株资源合理利用及优良菌株选育提供参考。【方法】以11株不同来源的茯苓菌株为研究对象,分别采用平面培养法测定其菌丝生长速率,松树兜栽培法测定其菌核产量,反复转接法测定其遗传稳定性。提取不同茯苓菌株的总DNA,PCR扩增ITS序列,进行ITS序列分析,并构建系统发育进化树。同时检测菌株间的菌丝拮抗性,结合ITS序列分析结果进一步鉴定茯苓菌株遗传关系。【结果】11个供试菌株中,8、9和12号菌株的菌丝生长速率、菌核产量和遗传稳定性均较高,1、7和13号菌株较低。茯苓ITS序列长度为1600 bp,其序列分析结果显示,1、2、3、4、7和10号菌株与Wolfporia cocos intemal transcribed spacer 1的同源性高达100%,8、9、11、12和13号菌株与W.cocos strain LP-13的同源性达99%,表明供试茯苓菌株属于两个不同的亚种。系统发育进化树分析结果显示,1、2、3、4、7和10号菌株聚为一类,菌株间的遗传关系非常接近,存在同种异名的可能;8、9、11、12和13号菌株聚为另一类,菌株间的遗传距离较大,存在种内差异。【结论】通过测定菌丝生长速度、菌核产量和遗传稳定性评价茯苓菌株质量切实可行,ITS序列分析可有效将茯苓菌株鉴定到种级分类单元,并明确茯苓菌株间的遗传关系。 展开更多
关键词 茯苓 菌株 质量评价 ITS序列 遗传关系
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枯草芽孢杆菌XF-1的碳水化合物活性酶类(CAZymes)蛋白预测与遗传关系分析 预览 被引量:3
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作者 韩长志 祝友朋 许僖 《河南师范大学学报:自然科学版》 北大核心 2018年第3期95-100,共6页
枯草芽孢杆菌XF-1对多种植物病原菌具有较好的抑制作用,是农业生产上非常重要的生防菌之一.碳水化合物活性酶类蛋白(CAZymes)作为植物病原真菌、细菌中重要的蛋白,在其生长和发育过程中发挥着重要作用.基于前期获得的枯草芽孢杆菌XF-1中... 枯草芽孢杆菌XF-1对多种植物病原菌具有较好的抑制作用,是农业生产上非常重要的生防菌之一.碳水化合物活性酶类蛋白(CAZymes)作为植物病原真菌、细菌中重要的蛋白,在其生长和发育过程中发挥着重要作用.基于前期获得的枯草芽孢杆菌XF-1中104个分泌蛋白基本序列信息,利用CAT预测程序对该菌中的CAZymes蛋白进行预测分析,明确其含有CAZymes蛋白的数量是58个,上述蛋白可以分为主要类别和复合类别两大类,前者包括26个GHs、21个CBMs以及2个CEs、3个PLs、2个GTs;后者则包括4个复合蛋白类型GH/CBM.该研究有效地实现了枯草芽孢杆菌XF-1中CAZymes的预测,为进一步开展其功能研究打下坚实的理论基础. 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌XF-1 碳水化合物活性酶蛋白 预测程序 遗传关系
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楠木树种种质资源的ISSR分析
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作者 李娟 董利军 +2 位作者 林建勇 刘雄盛 梁瑞龙 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2018年第19期6428-6435,共8页
楠木指楠属(Phoebe Nees)乔木树种,包括桢楠、闽楠、细叶楠、紫楠等树种。为了研究楠木种质资源的遗传多样性,理清种质资源间的亲缘关系,本研究通过ISSR通用引物利用ISSR-PCR技术对7个树种/群体的35份楠木品种进行DNA检测,并用POPGENE... 楠木指楠属(Phoebe Nees)乔木树种,包括桢楠、闽楠、细叶楠、紫楠等树种。为了研究楠木种质资源的遗传多样性,理清种质资源间的亲缘关系,本研究通过ISSR通用引物利用ISSR-PCR技术对7个树种/群体的35份楠木品种进行DNA检测,并用POPGENE 32软件进行多态性分析,同时以NTsys 2.10e软件进行聚类分析。结果表明,35份楠木样品用10条多态性的通用引物,共扩增出DNA条带128条,多态性条带126条,多态百分比为98.44%;35份楠木样种的遗传相似系数在0.636 8以上,最高为0.850 1,平均值为0.733 9;遗传距离范围在0.162 4-0.451 3之间,平均遗传距离为0.312 0。聚类分析显示,这7个树种/群体35份楠木样品中,当相似系数为0.68时,广西资源紫楠单独归为第一类群,其他6个树种/群体归为第二类群,表明紫楠与其他6个树种/群体楠木间存在着较大的遗传分化;相似系数在0.70时,第二类群可细分为细叶楠、桢楠+闽楠两个亚类群。闽楠与桢楠遗传距离较小,遗传相似系数较高,结合外观形态,应予合并。本研究结果为后续开展楠木遗传育种提供了理论依据。 展开更多
关键词 楠木 ISSR 遗传关系 聚类分析
野生甘蓝的研究进展及展望
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作者 张小丽 单晓政 +5 位作者 江汉民 文正华 刘莉莉 姚星伟 牛国保 孙德岭 《园艺学报》 CSCD 北大核心 2018年第9期1715-1726,共12页
甘蓝近缘野生种又称野生甘蓝,与栽培甘蓝携带相同的C基因组(2n=18,CC),具有丰富的遗传变异和优良的抗逆性。野生甘蓝的挖掘与利用对于栽培甘蓝的遗传改良具有重要意义。就野生甘蓝的种类、分布、与栽培甘蓝的关系及优良性状等进行了... 甘蓝近缘野生种又称野生甘蓝,与栽培甘蓝携带相同的C基因组(2n=18,CC),具有丰富的遗传变异和优良的抗逆性。野生甘蓝的挖掘与利用对于栽培甘蓝的遗传改良具有重要意义。就野生甘蓝的种类、分布、与栽培甘蓝的关系及优良性状等进行了综述。 展开更多
关键词 野生甘蓝 分类 分布 遗传关系 优良性状
西藏玉米地方品种与国内骨干自交系间的遗传关系分析 预览
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作者 蒙祖庆 宋丰萍 刘婷 《核农学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期1298-1308,共11页
为揭示西藏玉米地方品种与我国常用玉米优势群间的遗传关系,挖掘西藏玉米地方品种的遗传潜能,以69份西藏玉米地方代表品种和代表我国常用玉米优势群体的10个骨干自交系为试验材料,选用均匀覆盖玉米染色体组的40对核心SSR引物,采用多重荧... 为揭示西藏玉米地方品种与我国常用玉米优势群间的遗传关系,挖掘西藏玉米地方品种的遗传潜能,以69份西藏玉米地方代表品种和代表我国常用玉米优势群体的10个骨干自交系为试验材料,选用均匀覆盖玉米染色体组的40对核心SSR引物,采用多重荧光PCR技术与毛细管电泳荧光检测相结合的方法,检测西藏玉米地方品种的遗传多样性及其与骨干自交系间的遗传关系.结果表明,69份西藏玉米地方品种中共检测到364个等位基因变异,每对引物检测出3-23个等位基因,平均9.1个,平均多态性信息量为0. 693,遗传多态性高于我国西南区玉米地方品种的多样性水平,支持我国玉米由印度经西藏传入四川的论点.依据79份参试材料的Roger遗传距离采用类平均法将参试材料划分为5个类群,各类群中西藏玉米地方品种与骨干自交系间的遗传相似系数变化介于0.09-0.58之间,平均值为0.26,表明西藏玉米地方品种与国内玉米现代品种及核心地方品种间的亲缘关系较远. 本试验初步推断西藏玉米地方品种可能具有独立的遗传演化系统,且基于SSR分析结果,确定了西藏玉米地方品种多态性及其与骨干自交系间的亲缘关系,为我国优势玉米种群的发掘和改良提供了理论参考. 展开更多
关键词 西藏 玉米地方品种 骨干自交系 SSR 遗传关系
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中国大陆尼罗罗非鱼引进群体间遗传关系分析 预览
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作者 唐首杰 杨洁 +2 位作者 王成辉 李思发 赵金良 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期65-78,共14页
为了从分子水平上评价中国大陆尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)主要引进群体间遗传关系、遗传分化及基因流状况,研究利用12对多态性微卫星引物,以埃及土著群体为对照组,分析中国大陆尼罗罗非鱼9个代表性引进群体的遗传关系。结果... 为了从分子水平上评价中国大陆尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)主要引进群体间遗传关系、遗传分化及基因流状况,研究利用12对多态性微卫星引物,以埃及土著群体为对照组,分析中国大陆尼罗罗非鱼9个代表性引进群体的遗传关系。结果显示:①群体间四种遗传距离[DA、DC、DSW和(δμ)2]同时表明, USA群体和EGY群体间的遗传距离最小[DA=0.2174, DC=0.4140, DSW=0.8769,(δμ)2=22.6904];DA和DC表明GD群体和XJF群体间遗传距离最大(DA=0.5851, DC=0.6789); DSW和(δμ)2表明USA群体与XJF群体间遗传距离最大[DSW=4.0907,(δμ)2=138.18]。②EGY群体和GD群体间遗传分化最小(FST=0.0326, RST=0.0337), XJF群体和LY群体间遗传分化最大(FST=0.2098, RST=0.2655)。所有成对群体间均存在显著的遗传分化(P〈0.05)。③群体间系统树显示, WY群体、GD群体、EGY群体和USA群体被聚为一类, BL群体、LY群体和EW群体被聚为一类, JNM群体和GLD群体被聚为一类, XJF群体位于独立的分支;贝叶斯聚类分析将10个群体划分为2类, XJF、BL、LY、EW群体被归入第一类, WY、GD、EGY、USA、GLD和JNM群体被归入第二类。分子方差分析和主成分分析支持了系统树和贝叶斯聚类分析的结果。④根据成对FST值和RST值估算的群体间历史基因流平均值分别为2.4427和2.1983。群体间近期基因流检测结果显示,各群体中发生第一代迁移的个体数在0—7个,占样本数的0—23.3%。总体而言,我国尼罗罗非鱼引进群体间遗传分化显著,群体间存在一定程度的历史基因流和近期基因流。研究结果为开展我国尼罗罗非鱼引进群体的种质资源保护和综合利用提供了科学依据。 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 引进群体 遗传关系 遗传分化
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基于微卫星分子标记的云南松及其近缘种遗传关系分析 预览 被引量:5
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作者 许玉兰 蔡年辉 +4 位作者 白青松 何承忠 王大玮 段安安 康向阳 《西南林业大学学报》 CAS 北大核心 2017年第1期1-9,共9页
采用SSR分子标记技术,对云南松分布区内或相邻地区的松属双维管束亚属3种、3变种及扭曲的云南松共7个种或变种(变型)进行遗传分析。利用9对SSR引物,从7个种或变种(变型)100份材料中检测出31个等位基因,单个位点的等位基因数为2~... 采用SSR分子标记技术,对云南松分布区内或相邻地区的松属双维管束亚属3种、3变种及扭曲的云南松共7个种或变种(变型)进行遗传分析。利用9对SSR引物,从7个种或变种(变型)100份材料中检测出31个等位基因,单个位点的等位基因数为2~6个,平均3.4个;思茅松群体遗传多样性较高,而细叶云南松较低。基于Nei′s遗传距离利用非加权配对算术平均数法(UPGMA)聚类,云南松等7个种、变种(变型)可以分成3大类,其中马尾松和思茅松各自独立成为一类,其余5个种、变种(变型)聚为一类,以云南松与扭松的遗传关系最近,无明显的遗传分化,它们的表型变异可能由人为生产活动的负向选择或环境恶化引起。 展开更多
关键词 云南松 SSR 遗传多样性 遗传关系
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五个红罗非鱼群体的遗传多样性分析 预览 被引量:3
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作者 何金钊 陈诏 +3 位作者 陈子桂 徐鸿飞 赵何勇 吕业坚 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期326-333,共8页
实验采用微卫星标记技术,选用22对微卫星引物对5个红罗非鱼群体进行遗传多样性分析。经PCR扩增,16个微卫星位点扩增产物在关岛红罗非鱼(GD)、珍珠白红罗非鱼(ZZ)、佛罗里达红罗非鱼(FL)、明月红罗非鱼(MY)、马来西亚红罗非鱼(M... 实验采用微卫星标记技术,选用22对微卫星引物对5个红罗非鱼群体进行遗传多样性分析。经PCR扩增,16个微卫星位点扩增产物在关岛红罗非鱼(GD)、珍珠白红罗非鱼(ZZ)、佛罗里达红罗非鱼(FL)、明月红罗非鱼(MY)、马来西亚红罗非鱼(ML)中均获得了清晰稳定的条带。分析结果显示:16个微卫星标记共检测到146个等位基因。5个群体的平均等位基因数(Na)在6.5625—8.5625,平均有效等位基因数(N_e)在4.1495—6.1330,平均杂合度(H_e)在0.7491—0.8247,平均多态信息含量(PIC)在0.6939—0.7840,说明它们的遗传多态性丰富。卡方检验表明5个红罗非鱼群体的大部分位点偏离Hardy-Weinberg平衡。在5个群体中,关岛红罗非鱼(GD)与珍珠白红罗非鱼(ZZ)遗传相似系数(0.6171)最小,遗传距离(0.4827)最大,说明两者亲缘关系最远;佛罗里达红罗非鱼(FL)与马来西亚红罗非鱼(ML)遗传相似系数(0.9069)最大,遗传距离(0.0977)最小,可推断两者亲缘关系最近。采用UPGMA进行聚类分析,结果表明:佛罗里达与马来西亚先聚成一支,二者再与珍珠白聚在一起,接着三者与明月聚在一起,最后,四者与关岛聚到一起。聚类结果说明关岛群体与其他4个群体亲缘关系最远;佛罗里达与马来西亚亲缘关系最近,珍珠白群体次之,明月群体再次之。以上结果可推断5个红罗非鱼群体遗传多态性丰富,具有较大的选育潜力。 展开更多
关键词 红罗非鱼 微卫星DNA 遗传多样性 遗传关系
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16种平菇遗传关系的SRAP分析 被引量:1
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作者 常艳 金青 +3 位作者 凌磊 蔡永萍 聂凡 林毅 《安徽农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期834-838,共5页
摘要:为了确定不同来源的平菇遗传差异.利用相关序列扩增多态性(sequence-relatedamplifiedpolymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平... 摘要:为了确定不同来源的平菇遗传差异.利用相关序列扩增多态性(sequence-relatedamplifiedpolymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产生26.1条。多态性条带共189条,占总条带数的30.1%,平均每对引物组合得到7.88条多态性条带。依据SRAP标记聚类,在遗传相似系数O.65的水平上,供试的16个平菇品种分为2个大类:I和II。I类分为2个亚类:A类和B类。II类也分为2个亚类:C类和D类。其中A类和D类各包括4个品种,B类申有3个品种,C类中有5个品种,从而在DNA水平上证明了所研究的平菇种质资源的遗传多样性。 展开更多
关键词 平菇 遗传关系 SRAP 聚类分析
粘绿木霉Gv29-8的碳水化合物活性酶类蛋白预测及遗传关系分析 预览 被引量:1
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作者 韩长志 许僖 《华中农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期39-44,共6页
利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在线分析程序对Trichoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶类蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亚家族的分布情况进行分析,结果表明:粘绿木霉Gv29-8中含有185个CAZymes蛋白,分为主要... 利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在线分析程序对Trichoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶类蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亚家族的分布情况进行分析,结果表明:粘绿木霉Gv29-8中含有185个CAZymes蛋白,分为主要类别和复合类别两种类型;其中,主要类别含有71个GH蛋白、54个CBM蛋白及12个AA蛋白、25个CE蛋白、3个PL蛋白、3个GT蛋白;复合类型含有17个蛋白。遗传关系分析表明,CAZymes分类应进一步细化到更小的类别。 展开更多
关键词 碳水化合物活性酶类蛋白 粘绿木霉 遗传关系 预测程序
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29个蔷薇属植物的孢粉学研究 预览 被引量:2
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作者 罗乐 张启翔 +1 位作者 于超 潘会堂 《西北植物学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期885-894,共10页
采用扫描电镜技术对蔷薇属25个种及4个月季品种的花粉形态进行观察分析,探讨单叶亚属及蔷薇亚属中的芹叶组、合柱组、桂味组、月季组及月季品种之间的亲缘关系。研究表明:(1)所有被测样品的花粉都为具三孔沟的N3P4C5型单粒花粉,形状... 采用扫描电镜技术对蔷薇属25个种及4个月季品种的花粉形态进行观察分析,探讨单叶亚属及蔷薇亚属中的芹叶组、合柱组、桂味组、月季组及月季品种之间的亲缘关系。研究表明:(1)所有被测样品的花粉都为具三孔沟的N3P4C5型单粒花粉,形状包括近球形、长球形及超长球形,其中大部分都为极轴较长的超长球形,以小檗叶蔷薇(P/E=2.29)最长。(2)在疏花蔷薇、托木尔蔷薇以及重瓣黄刺玫中发现有花粉二型现象。(3)被测样品外壁纹饰主要包括条纹、孔穴-条纹及近孔网纹3类,条纹类型主要出现在芹叶组中,而孔穴-条纹类型则为蔷薇属植物较普遍的纹饰。(4)聚类分析表明,小檗叶蔷薇与其它种亲缘较远,被测月季品种与月季组关系较近,芹叶组与合柱组关系较近,桂味组中的弯刺蔷薇与其他蔷薇的纹饰有明显区别,被单独分开。 展开更多
关键词 蔷薇 月季品种 孢粉学 遗传关系
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