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基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析 预览
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作者 加依娜·吾永巴衣 胡文明 +1 位作者 阿迪里·托乎尼亚孜 徐翠莲 《江苏农业科学》 2019年第2期73-76,共4页
为了解高粱种质资源的遗传多样性,以56份来自不同国家和地区的高粱种质为研究对象,分别对其叶脉色、穗型、穗形、芽鞘色、颖壳色、粒色、颖壳包被度7个质量性状和生育期、株高、穗长、穗粒质量、千粒质量5个数量性状进行鉴定,分析各性... 为了解高粱种质资源的遗传多样性,以56份来自不同国家和地区的高粱种质为研究对象,分别对其叶脉色、穗型、穗形、芽鞘色、颖壳色、粒色、颖壳包被度7个质量性状和生育期、株高、穗长、穗粒质量、千粒质量5个数量性状进行鉴定,分析各性状的多样性指数,并利用质量性状和数量性状进行混合数据系统聚类。结果表明,2类性状均具有广泛的遗传变异,数量性状遗传多样性指数高于质量性状,其多样性指数的变异范围为1.639~2.012,而质量性状的多样性指数变异范围为0.879~1.498。系统聚类结果表明,在估计节点AU=95时,所有种质聚为28类,其中38份种质聚为10类,平均每类包含3.8份种质,其余18份种质分别单独归类;在AU=90时,所有种质聚为2类,分别包含13、43份种质。说明收集的56份种质具有丰富的遗传多样性,是进行性状改良和遗传研究理想的原始材料。 展开更多
关键词 高粱 质量性状 数量性状 遗传多样性 估计节点 系统聚类
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新疆海岛棉联合试验品系表型性状遗传多样性分析 预览
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作者 李小童 白玉林 +3 位作者 杜斌 王承强 刘绍欢 刘霞 《中国棉花》 2019年第2期24-29,共6页
对63份品系进行表型性状遗传多样性发现:16个表型性状中株高的遗传多样指数最高为2.069,衣分最低为1.094。10个农艺性状中,脱落率的变异系数最大为29.2%,衣分最小为5.1%;6个纤维品质性状中断裂伸长率的变异系数最大为14.4%,长度整齐度... 对63份品系进行表型性状遗传多样性发现:16个表型性状中株高的遗传多样指数最高为2.069,衣分最低为1.094。10个农艺性状中,脱落率的变异系数最大为29.2%,衣分最小为5.1%;6个纤维品质性状中断裂伸长率的变异系数最大为14.4%,长度整齐度的最小为1.3%。不同参试品系的欧式距离变幅为1.531~45.664,平均遗传距离为5.373。参试的63个长绒棉品系可份为Ⅰ类(9份)、Ⅱ(23份)、Ⅲ类(31份)3个类群。与34份新疆长绒棉品种比较发现:参试品系铃重略高,除断裂伸长率低于审定品种外,其他主要品质性状多优于审定品种。 展开更多
关键词 长绒棉 新品系 遗传多样性 聚类分析
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基于重测序的陆地棉InDel标记开发与评价
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作者 吴迷 汪念 +3 位作者 沈超 黄聪 温天旺 林忠旭 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期196-203,共8页
碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布... 碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布的320个标记进行验证。320个标记筛选出87个多态性标记,多态性率为26.88%。利用多态性标记对不同地理来源的262份陆地棉种质资源进行基因分型,共检测到160个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.0836~0.3750,平均值为0.3073;基因多样性指数变异范围为0.0874~0.5000,平均值为0.3876,表明我国陆地棉遗传基础相对狭窄。群体结构分析将262份陆地棉品系大致划分为2个亚群,聚类分析和主成分分析的结果与之基本一致。采用混合线性模型(Mixed linear model)对6个纤维品质性状的关联分析检测到65个关联位点(P<0.01),各位点对表型变异贡献率为2.57%~8.12%。本研究旨在利用重测序数据开发全基因组范围的可用于凝胶检测的InDel标记,为棉花种质资源研究和分子标记辅助选择育种提供便捷工具。 展开更多
关键词 陆地棉 INDEL标记 遗传多样性 群体结构 关联分析
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糯玉米自交系SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析
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作者 卢媛 艾为大 +5 位作者 韩晴 王义发 李宏杨 瞿玉玑 施标 沈雪芳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期214-224,共11页
为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过... 为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过聚类分析UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)方法在遗传相似系数0.64处将87份糯玉米自交系划分为4个类群,分别包含9、66、10和2份材料。此外,利用Structure群体遗传结构分析也将87份糯玉米自交系分为4个类群,分别包含24、25、19和19份材料;进一步分析表明,供试群体中大部分糯玉米自交系的遗传变异较单一。本研究为糯玉米新品种选育和遗传进化分析提供了种质基础和理论依据。 展开更多
关键词 糯玉米 遗传多样性 群体遗传结构
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冬虫夏草生物学及生态学研究中的关键科学问题研究进展 预览
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作者 徐梦 徐明 李仁强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1853-1862,共10页
冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体... 冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体形成及生长过程中的关键调控因子、冬虫夏草菌遗传多样性及基因组学研究、天然冬虫夏草及其微环境中的微生物群落组成、全球变暖背景下未来青藏高原地区的气候变化对冬虫夏草资源的影响等的研究进展,并分析了现有研究中尚未明确和不足之处。未来在冬虫夏草生物学及生态学的研究中,需要利用和研发更加先进的观测设备及试验方法,以实现天然冬虫夏草发生发育的原位观测和机理研究;充分利用冬虫夏草人工培植技术,结合分子生物学研究,从基因水平上揭示冬虫夏草菌生态适应性及侵染蝙蝠蛾幼虫的机理;建立冬虫夏草科学研究基地,开展长期定位观测试验并结合生态学模型构建明确未来气候变化对冬虫夏草资源的影响,以期进一步深入冬虫夏草生物学和生态学研究、推进我国冬虫夏草资源的合理利用及可持续发展的政策制定。 展开更多
关键词 冬虫夏草菌 发生发育 遗传多样性 基因组学 微生物群落 气候变化 可持续利用
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不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析 预览
6
作者 杨峰 冉茂林 +3 位作者 李晓梅 陈琳 雍小平 冉科 《江苏农业科学》 2019年第4期123-127,共5页
为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95... 为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95条,多态性条带百分率为93.14%。POPGENE分析结果表明,平均观测等位基因数为2.9674,平均有效等位基因数为2.4191,有效等位基因比例为81.52%;平均Nei基因多样性指数为0.3555,平均Shannon多态性指数为0.5289。UPGMA法聚类结果把供试萝卜材料分为3个类群,5个亚类:第Ⅰ类为来源于德国的极耐抽薹材料,第Ⅱ类为来源于韩国和日本的耐抽薹材料,第Ⅲ类为来源于我国的材料,其中第3亚类共有45份,占材料总数的78.95%,第4亚类为5份极易抽薹材料,第5亚类仅有1份。各材料间平均遗传相似系数为0.6381,变幅范围0.3478~0.9348,>0.7的仅22.87%,遗传差异较大。不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。 展开更多
关键词 萝卜 抽薹 SSR标记 遗传多样性
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基于ISSR和SRAP标记的栀子种质遗传多样性研究
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作者 姜武 吴志刚 +1 位作者 陶正明 蔡胡敏 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期510-516,共7页
目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物... 目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物和SRAP引物分别扩增出125和80条带数,多态性条带数分别为100和74,多态性比率(PPB)分别为80.00%和92.50%,栀子居群的总体物种水平的等位基因观察数(Na)分别为1.461 3和1.579 2,有效等位基因数(Ne)分别为1.307 7和1.342 1,Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.173 1和0.197 4,Shannon’s指数(I)分别为0.254 5和0.295 9;遗传多样性分析结果表明,ISSR和SRAP标记中3个居群之间的遗传多样性(Ht)分别为0.239 1和0.289 9,种间遗传多样性(Hs)分别为0.173 1和0.197 4,基因分化系数(Gst)分别为0.276 2和0.318 9,即72.38%和68.11%的遗传变异在种群内进行,居群间基因流(Nm)分别为1.310 3和1.068 0,证明居群间存在一定的基因流动(Nm>1);UPGMA聚类分析表明,ISSR和SRAP标记将栀子资源分为2个类群,且以SRAP分析的聚类结果更符合实际居群。结论取样栀子种质有丰富的遗传多样性,遗传分化主要发生在居群内,SRAP标记更适合用于栀子遗传多样性分析,对栀子资源的保护和育种提供了参考。 展开更多
关键词 栀子 分子标记 遗传多样性 育种 ISSR SRAP
甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性分析
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作者 李文斌 魏胜利 +5 位作者 罗琳 闫滨滨 侯俊玲 于福来 崔洁 王文全 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期517-525,共9页
目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分... 目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分析。结果 5种化学成分中,甘草苷含量的遗传多样性指数最高为2.05,异甘草苷含量的变异系数最大为99.50%,甘草苷含量与异甘草苷含量呈中度相关关系;在12个形态性状中,株高的遗传多样性指数最高为2.08,实际果序长的变异系数最大为37.09%,果型和株型性状的变异大于叶型性状;聚类分析将42份种质分为3类,第II类群种质品质较优;主成分分析将17个指标简化为6个因子,累积贡献率为72.96%,因子6为代表甘草酸、甘草苷、异甘草苷的因子。结论甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性较为丰富,筛选出V08、V10、V17、V34、V36、V38共6个品质优异的甘草种质。 展开更多
关键词 甘草 种质 形态 甘草酸 甘草苷 异甘草苷 遗传多样性
基于表型性状和CDDP分子标记延安万花山牡丹遗传多样性分析 预览
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作者 翟立娟 史倩倩 +3 位作者 李想 罗小宁 牛立新 张延龙 《江苏农业科学》 2019年第2期95-101,共7页
利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差... 利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差异极显著,变异系数变化范围为12.10%~69.23%,其中花瓣数、雄蕊数的变异系数较大。CDDP分子标记分析结果表明,万花山牡丹有效等位基因数为1.5994,Neis基因多样性指数和香农多样性指数分别为0.3335和0.4861,表明延安万花山牡丹具有较高的遗传多样性。2种分析方法结果具有一致性,均可将延安万花山牡丹分为三大类,根据与紫斑牡丹和矮牡丹亲缘关系可划分为3个类型,即接近矮牡丹的类型、接近紫斑牡丹的类型和中间类型。 展开更多
关键词 牡丹 遗传多样性 表型性状 CDDP分子标记
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达氏鳇亲鱼群体mtDNA Cyt b基因和D-loop区的序列特征及遗传多样性分析 预览
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作者 孔杰 周洲 +2 位作者 刘伟 赵凤 王金乐 《江苏农业科学》 2019年第3期40-42,共3页
通过对线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(D-loop)进行序列特征和遗传多样性检测,分析达氏鳇(Huso dauricus)亲鱼群体30个个体的序列特征及遗传多样性。结果表明,Cyt b基因长1 138 bp,G+C含量为47.03%,共定义单倍型5个、多态性位点(S)... 通过对线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(D-loop)进行序列特征和遗传多样性检测,分析达氏鳇(Huso dauricus)亲鱼群体30个个体的序列特征及遗传多样性。结果表明,Cyt b基因长1 138 bp,G+C含量为47.03%,共定义单倍型5个、多态性位点(S)2个,简约信息位点1个,单倍型多样性指数(H_d)为0.372,平均核苷酸差异数(K)为0.384,核苷酸多样性指数(π)为0.000 34;D-loop区序列全长845 bp,G+C含量为37.41%,共定义单倍型6个,多态性位点8个,简约信息位点3个,单倍型多样性指数为0.424,平均核苷酸差异数为1.069,核苷酸多样性指数为0.001 27。基于线粒体D-loop与Cyt b序列的研究结果表明,养殖达氏鳇亲鱼群体的遗传多样性偏低,在利用达氏鳇亲鱼进行繁殖育苗时要注意近交的影响。 展开更多
关键词 达氏鳇 MTDNA D-LOOP CYT b 遗传多样性
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哈尼梯田传统稻种遗传多样性影响因素 预览
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作者 王红崧 毕振佳 +2 位作者 王云月 单祖朋 李享 《江苏农业科学》 2019年第1期60-66,共7页
云南元阳哈尼梯田有着优异的水稻种质资源和丰富的稻种遗传多样性,当地传统稻种蕴含了极高的生态、人文和经济价值。高度异质的生态环境、社会环境、多元的传统民族文化习俗和丰富的农耕土著知识共同作用,使得哈尼梯田高度的稻种多样性... 云南元阳哈尼梯田有着优异的水稻种质资源和丰富的稻种遗传多样性,当地传统稻种蕴含了极高的生态、人文和经济价值。高度异质的生态环境、社会环境、多元的传统民族文化习俗和丰富的农耕土著知识共同作用,使得哈尼梯田高度的稻种多样性依然存在。本研究主要分析当地传统稻种遗传多样性现状,分析传统稻种遗传多样性对抗病稳产的影响,分析农民种子系统对传统稻种遗传多样性的影响,以及它与自然、社区、文化的共生关系;从自然生态、社会环境、传统文化等方面来分析农民种子系统的保护和丧失,构建哈尼梯田传统稻种多样性影响指标体系,识别出对地方稻种多样性维持和管理有特殊解释意义的因素,对传统稻种可持续保护策略进行讨论。 展开更多
关键词 哈尼梯田 传统稻种 遗传多样性 抗病稳产 共生种子系统 生态环境
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基于线粒体COⅠ序列的中国前鳞鮻遗传多样性分析
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作者 黄镇宇 章群 +2 位作者 卢丽锋 周琪 唐楚林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第1期46-52,共7页
前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.001... 前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.0010±0.0002)较低。根据群体所属的地区、海域、海峡进行分组,通过AMOVA分析,得出组间的Fst值皆小于0.05,P值皆大于0.05,组间变异的比例极低(–0.6%~0.46%),表明中国前鳞鮻群体间无明显分化,其原因可能是:1)频繁的基因交流。前鳞鮻的洄游范围较大,且受海流影响,导致不同地区的群体间有着密切的基因交流;2)近期种群扩张事件。中国前鳞鮻整体的Fu’s F_s值为显著性负值(F_S=–20.3900,P=0),核苷酸错配峰图为明显单峰,单倍型网络图呈星状结构,均表明中国前鳞鮻群体经历过种群扩张,估算扩张大约发生在13.4199~1.4911万年前,可能是冰期和间冰期的交替中海平面的变化所致。此外,洞头群体的遗传多样性(H_d=0.8080±0.1130,π=0.0021±0.0006)明显高于其他地理群体,建议将其作为优先保护的对象。 展开更多
关键词 前鳞鮻 遗传多样性 COⅠ基因 中国沿海
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茄子种质遗传多样性及群体结构的SRAP分析
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作者 谢立峰 李宁 +1 位作者 李烨 姚明华 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期58-63,共6页
采用SRAP标记法对183份茄子(Solanum melongena)种质资源的遗传关系和群体结构进行分析。结果表明, 33对多态性SRAP引物组合共扩增出215条清晰稳定的多态性条带,平均每对引物组合产生7条多态性条带。183份茄子种质的遗传相似系数介于0.... 采用SRAP标记法对183份茄子(Solanum melongena)种质资源的遗传关系和群体结构进行分析。结果表明, 33对多态性SRAP引物组合共扩增出215条清晰稳定的多态性条带,平均每对引物组合产生7条多态性条带。183份茄子种质的遗传相似系数介于0.276–0.813之间,平均值为0.623,表明茄子种质资源间遗传背景存在一定的差异。在遗传距离为0.345 6处可将183份茄子种质分为4组。通过群体结构分析可将种质划分为4个群体,不同群体间的界限十分明显,且群体间的基因渗透较高。 展开更多
关键词 茄子 遗传多样性 群体结构 SRAP分析
基于线粒体D-loop序列的长江口中华鲟幼鱼遗传多样性分析 预览
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作者 孙丽婷 赵峰 +2 位作者 张涛 纪严 庄平 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期9-15,共7页
采用线粒体DNA控制区(D-loop)序列对2015年和2017年长江口中华鲟(Acipenser sinensis)幼鱼样本进行了遗传多样性分析。2015年的682个样本共检测出11个单倍型,2017年的158个样本共检测出8个单倍型。2015年和2017年长江口中华鲟幼鱼的平... 采用线粒体DNA控制区(D-loop)序列对2015年和2017年长江口中华鲟(Acipenser sinensis)幼鱼样本进行了遗传多样性分析。2015年的682个样本共检测出11个单倍型,2017年的158个样本共检测出8个单倍型。2015年和2017年长江口中华鲟幼鱼的平均单倍型多样性(h)为0.857±0.006,核苷酸多样性(π)为0.010 2±0.005 5,均低于截流前数据(h=0.949±0.010;π=0.011±0.006)。分子变异方差分析(AMOVA)显示,中华鲟幼鱼的遗传变异主要来自于群体内,但其年度样本之间出现了中等程度的遗传分化。 展开更多
关键词 中华鲟 遗传多样性 线粒体控制区 长江口
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广东省鼎湖山国家级自然保护区球孢白僵菌遗传多样性研究 预览
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作者 蔡悦 聂勇 +1 位作者 吴茜茜 黄勃 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期92-100,共9页
【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下... 【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下简称“DHS”)采集的81株球孢白僵菌进行遗传结构和多样性分析。【结果】使用8对SSR引物扩增81个菌株产生多态位点数为58个,多态位点比率为100%,其中,引物Ba12多态位点数最多(10个)。通过Popgene32软件包分析发现,DHS球孢白僵菌种群Nei’s基因多样性指数(h)为0.2126,Shannon信息指数(Is)为0.3487,可见其遗传多样性水平较高,群体异质性较强。将群体分别按照寄主和土壤、不同寄主目划分为不同亚群进一步分析,发现土壤亚群遗传多样性水平(h=0.1925,Is=0.3099)略高于寄主亚群(h=0.1769,Is=0.2783),种群间遗传分化程度较弱(Nm=1.6629,Gst=0.1307);不同寄主目群体间的遗传分化较小且基因流明显。基于UPGMA聚类分析发现,各分支菌株的分布趋势与分离基质、不同寄主目均没有相关性。【结论】DHS球孢白僵菌遗传谱系与分离基质和寄主来源均无明显相关性,不同生态环境和寄主类型的影响共同维持了DHS球孢白僵菌种群内遗传变异的多样性。 展开更多
关键词 球孢白僵菌 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 鼎湖山国家级自然保护区
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濒危植物五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)天然种群遗传多样性的ISSR标记分析
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作者 郝云庆 罗晓波 王晓玲 《四川大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期161-166,共6页
五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)是中国四川特有野生珍稀濒危植物,仅分布于雅砻江中上游干旱河谷地带;探索其遗传多样性特征可以为其遗传资源的保护和利用提供理论依据.本文采用ISSR技术对五小叶槭的5个野生种群的44份材料进行遗传... 五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)是中国四川特有野生珍稀濒危植物,仅分布于雅砻江中上游干旱河谷地带;探索其遗传多样性特征可以为其遗传资源的保护和利用提供理论依据.本文采用ISSR技术对五小叶槭的5个野生种群的44份材料进行遗传多样性分析,8条引物总共检测到38个位点,其中多态性位点35个,多态位点百分率(PPL)平均为90.21%.应用分析软件Popgen32分析得出:在物种水平上,五小叶槭的香农多样性指数(I)为0.3924,Nei氏基因多样性指数(H e)为0.2498;种群间基因分化系数(G st)为0.3722,种群间的基因流(N m)为0.8433,这表明五小叶槭的遗传变异主要存在于种群内.在种群水平上,香农多样性指数(I)为0.2125,Nei氏基因多样性指数(H e)为0.1456.结果表明木里、九龙三垭宫和康定这3个种群的遗传多样性水平较高,而雅江和九龙洛莫种群遗传多样性较低.通过Mantel检测,种群间遗传距离和地理距离之间没有显著相关性. 展开更多
关键词 五小叶槭 ISSR 遗传多样性 种群
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基于线粒体Cytb序列的伯氏肩孔南极鱼群体遗传结构初步分析 预览
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作者 赵娜 马春艳 +6 位作者 宋炜 冯春雷 王鲁民 张凤英 蒋科技 赵宪勇 马凌波 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期16-24,共9页
选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍... 选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍型。与其它分布于南大洋的鱼类相比,伯氏肩孔南极鱼有着相似的遗传多样性特征,即较高的单倍型多样性(haplotype diversity,h=0.685 90±0.002 36)和较低的核苷酸多样性(nucleotide diversity,P i=0.002 59±0.013 43)。伯氏肩孔南极鱼种群间的平均遗传距离为0.39%,分子变异分析(AMOVA)结果显示,组群间的变异为4.42%(P<0.05),群体内的为95.58%(P<0.05),基于单倍型构建的进化树的结果均表明伯氏肩孔南极鱼群体不具有明显的地理谱系结构。中性进化分析表明伯氏肩孔南极鱼群体在10万年前(大约中更新世时期)经历过快速扩张时期。分子方差分析和F st表明伯氏肩孔南极鱼的遗传变异主要来自种群内的个体之间,极少数遗传变异来自于群体之间。研究结果显示南极地区的伯氏肩孔南极鱼5个采样点之间具有一定的基因交流,是一个随机交配的群体。 展开更多
关键词 伯氏肩孔南极鱼 CYTB 遗传结构 遗传多样性
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江苏省6个翘嘴鳜群体的遗传多样性分析 预览
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作者 颜元杰 曹哲明 +1 位作者 丁炜东 邴旭文 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期25-33,共9页
利用20对微卫星引物对江苏省5个内陆湖(太湖、滆湖、洪泽湖、高邮湖和骆马湖)和长江的翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)野生种群进行遗传多样性分析,研究江苏省不同水域翘嘴鳜的遗传多样性差异和亲缘关系。结果表明,6个水域的翘嘴鳜群体遗传... 利用20对微卫星引物对江苏省5个内陆湖(太湖、滆湖、洪泽湖、高邮湖和骆马湖)和长江的翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)野生种群进行遗传多样性分析,研究江苏省不同水域翘嘴鳜的遗传多样性差异和亲缘关系。结果表明,6个水域的翘嘴鳜群体遗传多样性丰富,其中长江翘嘴鳜群体的平均有效等位基因数为6.524 8,平均期望杂合度为0.922,平均多态信息含量为0.827 3,均高于其它5个翘嘴鳜群体,说明长江翘嘴鳜群体的遗传多样性高于其它5湖的翘嘴鳜群体。哈迪温伯格平衡显示,只有2个位点上存在不平衡,其余都满足哈迪温伯格平衡。从6个水域翘嘴鳜群体之间的遗传相似系数和遗传距离来看,太湖翘嘴鳜群体和滆湖翘嘴鳜群体的亲缘关系最近,骆马湖翘嘴鳜群体和太湖翘嘴鳜群体的亲缘关系最远。研究结果可为江苏省翘嘴鳜种质资源的保护、监测和遗传育种提供分子基础资料。 展开更多
关键词 翘嘴鳜 微卫星 遗传多样性
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ISTR标记在榧树种质资源遗传多样性分析中的应用 预览
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作者 俞飞飞 周军永 +2 位作者 陆丽娟 孙其宝 仇鹏辉 《江苏农业科学》 2019年第2期38-41,共4页
利用反向序列标签重复技术(inverse sequence-tagged repeat,ISTR)对43份安徽省榧树种质资源及3份浙江省榧树资源进行了遗传多样性分析。ISTR能很好地用于榧树种质资源遗传多样性分析,多态性比例为87.09%,46份榧树种质遗传相似系数为0.5... 利用反向序列标签重复技术(inverse sequence-tagged repeat,ISTR)对43份安徽省榧树种质资源及3份浙江省榧树资源进行了遗传多样性分析。ISTR能很好地用于榧树种质资源遗传多样性分析,多态性比例为87.09%,46份榧树种质遗传相似系数为0.5484~1.0000,表明安徽省榧树种质资源遗传多样性较为丰富。采用UPGMA(非加权组平均算法)对46份种质的ISTR数据进行聚类分析,结果显示可分为3个类群,来自同一地方的种质基本上都独立聚成类群,表明种质间亲缘关系与地理来源关系较为密切;相似的种质类型聚为一类,可能与实生繁殖方式有关。ISTR标记可在榧树种质资源遗传多样性分析中被广泛地应用。 展开更多
关键词 香榧 反向序列标签重复技术 遗传多样性
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南沙群岛密斑马面鲀群体遗传多样性分析 预览
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作者 高天翔 王志杨 +1 位作者 宋娜 宋林 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期159-165,共7页
密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,8... 密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,86尾个体序列的变异位点数为38个,共定义了28个单倍型;3个密斑马面鲀群体的单倍型多样度和核苷酸多样度均较高,且相差不大;密斑马面鲀群体间未检测到显著的群体遗传结构,分子方差分析表明,99.67%的遗传差异来自于群体内,群体间遗传差异仅为0.33%。贝叶斯树和最大似然树均显示出密斑马面鲀单倍型间松散的分布,未检测到显著的谱系结构。群体历史动态分析结果表明密斑马面鲀的群体经历了更新世的群体扩张事件。 展开更多
关键词 密斑马面鲀 南沙群岛 控制区 遗传多样性 群体遗传结构
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