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2017年广东省H1N1亚型SIV复制及感染能力的研究
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作者 冯亚玲 孙海亮 +7 位作者 刘杨 于亚南 林嘉特 吴梅花 李硕 张文轩 叶小苌 廖明 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期887-894,共8页
为了解2017年广东省H1N1亚型猪流感病毒基因型特征、体外复制能力和体内感染能力,挑选以A/swine/Guangdong/S182/2017(H1N1)为代表的4株病毒进行遗传演化分析、细胞生长曲线测定和动物感染试验。病毒遗传演化结果表明,4株病毒均属于欧... 为了解2017年广东省H1N1亚型猪流感病毒基因型特征、体外复制能力和体内感染能力,挑选以A/swine/Guangdong/S182/2017(H1N1)为代表的4株病毒进行遗传演化分析、细胞生长曲线测定和动物感染试验。病毒遗传演化结果表明,4株病毒均属于欧亚类禽分支,其内部基因为来自其他不同分支基因片段的重组;病毒在细胞上的生长曲线结果显示,MDCK、PK15、ST和IPEC-1这4种细胞系都能被病毒感染,病毒在细胞上复制滴度范围分别为(2.50~8.50)lgTCID50/mL、(3.33~6.33)lgTCID50/mL、(4.50~6.50)lgTCID50/mL、(0.67~3.00)lgTCID50/mL;病毒动物感染试验结果表明,S182毒株能够引起感染组和同居组猪产生体外排毒、肺内病毒复制和血清抗体转阳,两组猪鼻洗液滴度范围分别为(1.70~2.37)lgTCID50/mL、(1.37~3.37)lgTCID50/mL,肺载毒量滴度范围分别为(1.37~2.37)lgTCID50/(g·mL^-1)、(1.37~2.20)lgTCID50/(g·mL^-1),抗体滴度范围分别为1∶10~1∶20、1∶10~1∶160。本研究结果将为H1N1亚型猪流感病毒的监测防控、公共卫生学安全、适用于分离猪流感病毒猪源细胞的遴选以及近年主要流行H1N1猪流感病毒对猪的致病能力的研究提供理论依据和数据支持。 展开更多
关键词 H1N1亚型 猪流感病毒 遗传演化分析 病毒生长曲线 致病性
江苏省2017年禽流感流行病学调查及分析 预览
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作者 杨婧 袁朗 +10 位作者 韩凯凯 刘青涛 刘宇卓 赵冬敏 黄欣梅 章丽娇 姜波 姜亮亮 宇善广 崔国玉 李银 《江西农业学报》 CAS 2019年第4期87-92,共6页
为了解2017年江苏省禽流感的流行变异情况,共采集鸡、鸭、鹅拭子2760份,均过滤接种SPF鸡胚用以分离病毒。另选取4株宿主来源和分离地点不同的H9N2阳性样品,对其HA和PB2基因进行测序,以分析H9N2的变异情况。结果表明:禽流感病毒的分离有... 为了解2017年江苏省禽流感的流行变异情况,共采集鸡、鸭、鹅拭子2760份,均过滤接种SPF鸡胚用以分离病毒。另选取4株宿主来源和分离地点不同的H9N2阳性样品,对其HA和PB2基因进行测序,以分析H9N2的变异情况。结果表明:禽流感病毒的分离有两个高峰期,即4~6月、9~11月;H5、H7亚型禽流感病毒的感染率较低。4株H9N2禽流感病毒呈现出典型的人流感受体结合特性,但尚未具有突破种间屏障感染哺乳动物的能力。 展开更多
关键词 禽流感 江苏省 H9N2 遗传演化分析
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一株H10N1亚型禽流感病毒的遗传演化及其对小鼠的感染性研究 预览
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作者 王昌建 彭志 +5 位作者 王卫国 唐小明 鲁杏华 林源 邓国华 何世成 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期305-308,共4页
为了解从湖南省某活禽市场分离的一株鸭源H10N1亚型禽流感病毒(AIV) A/duck/Hunan/S10078/2015(H10N1)(简称Hu N/78/15)的生物学特性,本研究对其进行全基因组序列的测定及遗传演化分析,并对其进行BALB/c小鼠的感染试验。序列分析结果显... 为了解从湖南省某活禽市场分离的一株鸭源H10N1亚型禽流感病毒(AIV) A/duck/Hunan/S10078/2015(H10N1)(简称Hu N/78/15)的生物学特性,本研究对其进行全基因组序列的测定及遗传演化分析,并对其进行BALB/c小鼠的感染试验。序列分析结果显示,该病毒HA基因的裂解位点只含有一个碱性氨基酸,为低致病性AIV (LPAIV)的分子特征。遗传演化分析结果表明该病毒的HA基因与NA基因分别来源于H10N7与H5N1亚型AIV,内部基因来源于H7N9、H4N6、H3N2、H11N7亚型AIV,呈现明显的遗传多样性。小鼠感染试验结果显示,Hu N/78/15能够在小鼠的鼻甲和肺脏中有效复制,但仅引起小鼠轻微的体重变化,表明其对小鼠呈低致病性。本研究结果为H10亚型AIV的持续监测和生物学特性研究提供相应的参考依据。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H10N1亚型 遗传演化分析 感染性
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广西某市屠宰猪淋巴结猪圆环病毒3型的病原检测及遗传演化分析 预览 被引量:1
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作者 季程远 王蔚怡 +9 位作者 冯选榕 姚静 黄欣 冯园青 覃一峰 方庆励 陈樱 欧阳康 韦祖樟 黄伟坚 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期1265-1273,共9页
为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在广西地区健康猪群中的遗传变异情况,对广西某市屠宰场健康猪的181份淋巴结进行PCV3的病原检测,结果 PCV3阳性率为24.31%。这说明在健康屠宰猪群中PCV3的感染率较高,带毒情况较为严重。对其中的阳性样品进... 为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在广西地区健康猪群中的遗传变异情况,对广西某市屠宰场健康猪的181份淋巴结进行PCV3的病原检测,结果 PCV3阳性率为24.31%。这说明在健康屠宰猪群中PCV3的感染率较高,带毒情况较为严重。对其中的阳性样品进行全序列扩增,最终得到6条PCV3全基因组序列。将试验所得PCV3全基因组序列与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组序列相比较,结果发现PCV3全基因组相似性为98.6%~99.9%,变异程度低,较为保守;对PCV3ORF2基因进行遗传演化分析,发现PCV3毒株可分为两大型。通过对PCVs(PCV1、PCV2和PCV3)Cap蛋白相似性进行比对分析,推测PCV2与PCV3不具有交叉保护性。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 全基因 序列分析 遗传演化分析
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2015年、2016年我国部分地区猪群猪繁殖与呼吸综合征的分子流行病学研究
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作者 赵蕾 吴发兴 +3 位作者 张锋 董雅琴 杨增岐 李晓成 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2018年第10期96-100,244共6页
为了解我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和流行趋势,试验利用RT-PCR方法对2015年、2016年全国超过20个省份的3 078份疑似PRRS病料进行检测,并扩增部分阳性病料的ORF5基因进行测序和遗传变异分析。结... 为了解我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和流行趋势,试验利用RT-PCR方法对2015年、2016年全国超过20个省份的3 078份疑似PRRS病料进行检测,并扩增部分阳性病料的ORF5基因进行测序和遗传变异分析。结果表明:PRRSV阳性样本共889份,阳性率为28.88%。扩增得到177个ORF5的基因序列,通过序列分析发现,我国流行的PRRSV主要为美洲型,其中90份与高致病性PRRSV(HP-PRRSV)高度同源,53份与经典PRRSV高度同源,34份与NADC30-like PRRSV高度同源,其中14份流行毒株的GP5蛋白糖基化位点N34发生缺失。说明监测地区主要流行HP-PRRSV,同时NADC30-like PRRSV已经形成一个相对独立的分支在我国流行,提示有必要加强PRRSV变异毒株的流行和变异的监测,同时对其致病性等生物学特性进行深入研究。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) NADC30-like株 流行病学 RT-PCR ORF5基因 遗传演化分析
一株鸽子源的H4N8亚型禽流感病毒的部分生物学特性
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作者 刘驰煌 谷文丽 +2 位作者 崔鹏飞 邓国华 熊涛 《公共卫生与预防医学》 2018年第3期13-17,共5页
目的实验室2017年对我国四川省遂宁船山区蜀中食品城进行流行病学调查时从鸽子体内分离鉴定出的一株H4N8亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)(A/Pigeon/Sichuan/S1185/2017(H4N8)(缩写为PG/SC/S1185/2017)。方法为了解此... 目的实验室2017年对我国四川省遂宁船山区蜀中食品城进行流行病学调查时从鸽子体内分离鉴定出的一株H4N8亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)(A/Pigeon/Sichuan/S1185/2017(H4N8)(缩写为PG/SC/S1185/2017)。方法为了解此株从鸽子体内分离到的H4N8亚型AIV的遗传进化特点,对此株病毒进行了全基因组的测序并画出基因进化树来探索其毒株来源,还探究了该株病毒对哺乳动物的感染能力。结果遗传演化分析数据表明,这株病毒株的各个基因节段分别来自于不同亚型流感病毒,基因来源复杂,是一株重组病毒,其具有明显的遗传多样性。小鼠感染性实验结果表明,该毒株仅能够在小鼠肺脏和鼻甲中产生微弱复制,在小鼠感染病毒3d后并未出现明显临床症状,小鼠活力没有明显的下降,与对照组相比体重变化其实基本相同。结论为今后的流行病学调查中对H4亚型流感病毒的全面监测和综合预防防控提供了数据支持。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H4N8 感染性 遗传演化分析
河南省2016-2017年致病性猪圆环病毒遗传演化分析 被引量:1
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作者 时庆贺 石昂 +4 位作者 李新果 王玉国 史志斌 张磊 陈陆 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期857-862,共6页
采集了2016—2017年间不同地区临床疑似圆环病毒病病例样本65份,提取病毒核酸后,分别用PCV2和PCV3特异性引物进行PCR扩增,鉴定出PCV2阳性样品43份,阳性率为66.15%;PCV3阳性样品3份,阳性率为4.61%。选取其中13份PCV2阳性样品和... 采集了2016—2017年间不同地区临床疑似圆环病毒病病例样本65份,提取病毒核酸后,分别用PCV2和PCV3特异性引物进行PCR扩增,鉴定出PCV2阳性样品43份,阳性率为66.15%;PCV3阳性样品3份,阳性率为4.61%。选取其中13份PCV2阳性样品和3份PCV3阳性样品进行ORF2基因克隆、测序和进化分析。结果显示:河南省PCV2和PCV3流行毒株ORF2基因序列主要存在是单个碱基突变,没有缺失或插入。进化树分析显示,PCV2流行毒株均处于2b和2d2个基因群,其中7份属于2b型,6份属于2d型,2016年和2017年PCV2基因型并没有明显差别;3份PCV3阳性样品中KF-PCV3、AY—PCV3处于一个分支,SX-PCV3与MF589108形成一个分支。结果表明:2016—2017年间河南省感染和流行的PCV2主要为2b和2d2个基因群,表现出遗传进化稳定性,部分地区出现PCV3感染的情况。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 PCV3 PCV2 ORF2基因 遗传演化分析
2006-2016年中国羊口疮病毒的遗传演化分析 预览 被引量:4
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作者 葛士坤 张凯照 +2 位作者 鲁荣 刘健新 宁章勇 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第2期439-447,共9页
羊口疮(Orf disease)是由羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)引起的人兽共患传染病,该病广泛分布于世界各地,对公共卫生造成了严重的影响。为了解中国ORFV毒株的起源、分子流行病学及病毒系统研究的信息,本研究对中国2006-2016年分离到82株... 羊口疮(Orf disease)是由羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)引起的人兽共患传染病,该病广泛分布于世界各地,对公共卫生造成了严重的影响。为了解中国ORFV毒株的起源、分子流行病学及病毒系统研究的信息,本研究对中国2006-2016年分离到82株ORFV毒株进行了系统的遗传演化分析,利用DNAStar和Mega 5.0软件对ORFV011(B2L)、ORFV020(VIR)、ORFV059(FIL)和ORFV127(vIL-10)基因序列进行核苷酸和氨基酸同源性比对,并在此基础上构建系统发育树。结果显示,82株病毒B2L基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为95.9%~100%和86.5%~100%,F1L基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为94.5%~100%和94.0%~100%;系统进化分析显示,中国不同地方分离的ORFV毒株处于不同分支上,甚至同一个省内的毒株也分布在不同分支上。表明中国ORFV毒株进化特殊,处于不同的进化分支上,且有发生突变的可能性,世界各地流行的代表性毒株在中国均有变种分布,这增加了中国防控ORFV的难度。本研究结果为中国防控羊口疮的流行和研制高效疫苗提供了基础数据。 展开更多
关键词 中国 羊口疮病毒(ORFV) 遗传演化分析
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2016年山东地区10株H9N2亚型禽流感病毒HA基因的遗传演化分析 预览
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作者 邵明辰 王友令 《家禽科学》 2018年第9期13-16,共4页
为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取2016年所分离的10个H9N2亚型禽流感病毒株,对其HA基因进行测序,并应用DNAStar和Mega5.0生物软件拼接序列和建立进化树。结果表明,10 株H9N2分离毒的HA 裂解位点氨基酸均为-RS... 为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取2016年所分离的10个H9N2亚型禽流感病毒株,对其HA基因进行测序,并应用DNAStar和Mega5.0生物软件拼接序列和建立进化树。结果表明,10 株H9N2分离毒的HA 裂解位点氨基酸均为-RSSR/GLF-,有6-8个潜在的糖基化位点,具有典型低致病性禽流感病毒HA基因的特征,但其226位氨基酸均为亮氨酸(L),呈现出人流感受体结合特性。进化树分析表明,2016年山东地区 H9N2流行毒株 HA 基因属于A/Duck/Hong-Kong/Y280/97亚群,同属于近几年在中国鸡群中流行的以A/chicken/Zhejiang/HJ/2007为代表的G57分支。 展开更多
关键词 H9N2 HA 遗传演化分析
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2016年辽宁规模化猪场病毒性腹泻流行状况调查分析 预览
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作者 关淼 赵晓彤 +10 位作者 周晨阳 顾贵波 杨本勇 李井春 赵凤菊 杨洺阳 申贯男 李蓉 王宏燕 张健 梁乔 《动物医学进展》 北大核心 2018年第12期204-210,共7页
为了解辽宁地区规模化养猪场PEDV、TGEV、PRV-A的流行特征以及PEDVS1基因的遗传演化情况,2016年从辽宁地区14个地市采集700份仔猪粪便样品,通过问卷调查及荧光定量RT-PCR方法对这3种引起猪腹泻的病毒进行流行病学调查。使用特异性引物对... 为了解辽宁地区规模化养猪场PEDV、TGEV、PRV-A的流行特征以及PEDVS1基因的遗传演化情况,2016年从辽宁地区14个地市采集700份仔猪粪便样品,通过问卷调查及荧光定量RT-PCR方法对这3种引起猪腹泻的病毒进行流行病学调查。使用特异性引物对PEDVS1基因进行RT-PCR扩增并测序,应用DNAStar软件对该基因序列进行比对和遗传演化分析。结果显示,问卷调查中发生腹泻的场阳性率为58.6%,哺乳仔猪更易发病,发病率为12.2%,死亡率为4.5%。实验室检测结果显示,腹泻的发生主要集中在冬春交接的第一季度,PRV-A样品阳性率(41.3%,31/75)高于PEDV样品阳性率为(36%,27/75),未检出TGEV。遗传演化分析显示12株2016年PEDV辽宁分离株之间的同源性为92.6%~100%,主要属于第3亚群。以上结果表明,在辽宁地区引起猪腹泻的病毒主要为PEDV和PRV-A,且PRV-A更为流行。PEDV在辽宁地区存在不同分支的病毒株流行,且在发展过程中核酸发生了一定的变化。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 猪传染性胃肠炎 猪轮状病毒 遗传演化分析
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14株H3亚型禽流感病毒全基因组序列分析 预览
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作者 程善菊 李金平 +4 位作者 侯广宇 彭程 王素春 蒋文明 温建新 《中国兽医杂志》 北大核心 2018年第10期30-35,共6页
为了解2016年至2017年在我国部分省市活禽市场的家禽体内分离得到的14株H3亚型禽流感病毒的流行情况和遗传特点。采用RT-PCR技术对这14株H3亚型禽流感毒株的全基因进行扩增,并对所得序列进行遗传演化分析。14株分离株中有5株H3N8,7株H3N... 为了解2016年至2017年在我国部分省市活禽市场的家禽体内分离得到的14株H3亚型禽流感病毒的流行情况和遗传特点。采用RT-PCR技术对这14株H3亚型禽流感毒株的全基因进行扩增,并对所得序列进行遗传演化分析。14株分离株中有5株H3N8,7株H3N2,2株H3N3。结果表明,14株毒株中AIV的HA蛋白的裂解位点氨基酸序列均为PEKQTR↓GLF,只有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感的分子特征。HA基因的受体结合位点为226(Q)、228(G)具有典型的禽源特征。遗传进化分析表明,除了毒株A/Duck/Fujian/F1142/2016(H3N8)的NS基因属于北美分支外,其余毒株全部基因均属于欧亚分支。通过对H3亚型AIV的遗传进化关系和流行情况进行分析,以期对H3亚型AIV的进化研究提供一些参考依据。 展开更多
关键词 H3亚型禽流感病毒 全基因测序 同源性 遗传演化分析
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辽宁地区猪伪狂犬病毒病原学检测与遗传演化分析 预览
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作者 杨洺扬 杨本勇 +7 位作者 申贯男 关淼 李井春 梁乔 张健 李蓉 王宏燕 杨国丽 《现代畜牧兽医》 2018年第10期51-56,共6页
本研究利用实时荧光定量PCR方法筛选伪狂犬病毒阳性样品,建立PCR方法特异性扩增阳性毒株LNP-1株gD、gE基因,并进行测序及遗传演化分析。结果表明LNP-1株gD、gE基因与近年来我国流行毒株遗传关系接近。通过基因序列比对发现,LNP-1株gD基... 本研究利用实时荧光定量PCR方法筛选伪狂犬病毒阳性样品,建立PCR方法特异性扩增阳性毒株LNP-1株gD、gE基因,并进行测序及遗传演化分析。结果表明LNP-1株gD、gE基因与近年来我国流行毒株遗传关系接近。通过基因序列比对发现,LNP-1株gD基因与经典疫苗毒株Bartha株gD基因相比在831-836位之间存在连续6个碱基插入,并有多个A-G替换,gE基因在第142~144位和1 488~1 490位分别存在GAC和CGA碱基插入,符合近年国内伪狂犬变异毒株gE基因突变特征,推断其为伪狂犬变异毒株。从而为判断辽宁地区流行伪狂犬毒株类型,伪狂犬净化和疫苗选择提供参考。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒 GD基因 GE基因 检测 遗传演化分析
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山东地区10株H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因的遗传演化分析 预览
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作者 王友令 袁小远 +6 位作者 孟凯 张玉霞 徐怀英 李莉 亓丽红 宋敏训 艾武 《中国动物传染病学报》 北大核心 2018年第4期35-39,共5页
为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取分离鉴定的10株H9N2亚型禽流感病毒分离毒株,分别对其HA和NA基因进行序列测定和分子特性分析,并应用Mega 5.0软件绘制相应的基因氨基酸进化树,进行遗传进化分析。结果表明:10株H... 为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取分离鉴定的10株H9N2亚型禽流感病毒分离毒株,分别对其HA和NA基因进行序列测定和分子特性分析,并应用Mega 5.0软件绘制相应的基因氨基酸进化树,进行遗传进化分析。结果表明:10株H9N2分离毒的HA裂解位点氨基酸均为RSSR/GLF,具有典型低致病性AIV HA基因的特征;其第226位氨基酸均为亮氨酸(L),因此具有结合人流感受体的分子特性。同时这10株病毒的NA基因颈部均有9个核苷酸的缺失,且NA的潜在糖基化位点均不超过8个。进化树分析表明,2016年山东地区H9N2流行毒株HA和NA基因均属A/Chicken/Beijing/1/1994亚群,并且同属于近几年在中国鸡群中流行的G57分支。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H9N2亚型 HA基因 NA基因 遗传演化分析
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2011--2016年云南新城疫病毒感染状况调查 预览 被引量:2
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作者 段博芳 王静静 +10 位作者 赵云玲 张凤安 吕嵘 吕艳 郑东霞 曾邦权 赵焕云 相德才 刘华雷 张应国 王志亮 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2017年第9期1711-1717,共7页
为了解云南地区新城疫流行现状,于2011—2016年在云南部分地区开展了基于风险的新城疫流行病学调查。调查范围涉及昆明、玉溪、大理、丽江、普洱和曲靖六市共48个采样点,共采集不同种类家禽棉拭子样品2565份。结果显示:共分离到新城... 为了解云南地区新城疫流行现状,于2011—2016年在云南部分地区开展了基于风险的新城疫流行病学调查。调查范围涉及昆明、玉溪、大理、丽江、普洱和曲靖六市共48个采样点,共采集不同种类家禽棉拭子样品2565份。结果显示:共分离到新城疫病毒52株,来源于17个活禽交易市场,新城疫病毒个体阳性率为2.03%,场点阳性率为35.41%。52株新城疫病毒中17株为强毒株,来源于7个农贸市场,新城疫强毒株个体阳性率为0.66%,强毒株场点阳性率为14.58%。遗传演化分析表明:52株新城疫病毒可分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,其中ClassⅠ 17株,均属于基因3型;ClassⅡ共35株,可分为4种基因型,其中基因Ⅰ型2株,Ⅱ型16株,Ⅵ型13株,Ⅶ型4株。分析表明近年来云南地区流行的新城疫病毒具有多样性,其中基因Ⅵ型主要在鸽群流行,而Ⅶb和Ⅶh亚型则主要在鸡和鹅群中流行。值得关注的是在云南地区首次分离到2株Ⅶh新城疫病毒,而这种基因Ⅶh型的病毒一直在越南等东南亚地区呈地方流行。因此,在该地区应该进一步加强主动监测,分析这种新传人基因型新城疫病毒的分布,防止病原进一步扩散。 展开更多
关键词 新城疫病毒 流行病学调查 遗传演化分析
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狐狸源伪狂犬病毒HB1变异株的分离鉴定及遗传演化分析 预览
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作者 贾文亮 刘大飞 +2 位作者 刘春国 刘鑫 曲连东 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期107-110,共4页
本实验室于2012年在河北地区某狐狸场的疑似感染伪狂犬病死亡狐狸中分离到一株伪狂犬病毒(PRV),命名为HB1株,并对其进行了PCR鉴定和特异性血清的间接免疫荧光鉴定。扩增及测序得到的PRV的g C和g E基因序列。与欧美参考株相比,该分离株... 本实验室于2012年在河北地区某狐狸场的疑似感染伪狂犬病死亡狐狸中分离到一株伪狂犬病毒(PRV),命名为HB1株,并对其进行了PCR鉴定和特异性血清的间接免疫荧光鉴定。扩增及测序得到的PRV的g C和g E基因序列。与欧美参考株相比,该分离株g E基因编码的氨基酸序列共存在19个替换和2个插入;其g C基因编码的氨基酸序列共存在27个替换,及在第63-69位存在一个GAAASTPA的连续8个氨基酸插入,这与国内近5年来猪群流行的变异株一致。本研究表明PRV变异株也在狐狸群内流行。 展开更多
关键词 狐狸 伪狂犬病毒 遗传演化分析
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禽腺病毒血清4型的分离鉴定及遗传演化分析 被引量:5
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作者 王娟 刘亮亮 +2 位作者 李慧昕 韩宗玺 刘胜旺 《中国兽医科学》 CSCD 北大核心 2017年第6期755-761,共7页
本研究从辽宁发病鸡群采集的病料经SPF鸡胚接种传代分离病毒,并其进行了PCR和测序分析鉴定。结果,从病料中经SPF鸡胚接种传代分离出一株禽腺病毒,经PCR和测序分析鉴定确定该分离株为禽腺病毒C种、血清4型,命名为LN160130;通过对52 k和he... 本研究从辽宁发病鸡群采集的病料经SPF鸡胚接种传代分离病毒,并其进行了PCR和测序分析鉴定。结果,从病料中经SPF鸡胚接种传代分离出一株禽腺病毒,经PCR和测序分析鉴定确定该分离株为禽腺病毒C种、血清4型,命名为LN160130;通过对52 k和hexon基因同源性比对,LN160130与我国近年报道的禽腺病毒血清4型同源性最高,52 k和hexon基因的同源性均为100%;与国外流行的血清4型毒株相比,LN160130的52k基因同源性99.3%~100%,hexon基因同源性98.7%~99.8%。遗传演化分析结果表明,LN160130分离株与我国禽腺病毒血清4型流行毒株在同一分支内,而与国外禽腺病毒血清4型毒株不在同一分支,存在遗传差异,说明中国流行的血清4型禽腺病毒有自身地域特点。 展开更多
关键词 禽腺病毒血清4型 病毒分离鉴定 分子特征 遗传演化分析
羊口疮病毒广东大浦株的分离鉴定及其遗传进化分析 预览 被引量:1
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作者 郭璐璐 崔言顺 《中国兽医杂志》 北大核心 2017年第12期20-23,I0002共5页
对广东大浦发生的羊口疮病例进行了病毒的分离、鉴定及011基因和059基因的遗传演化分析。结果表明,利用胚胎羊鼻甲细胞成功的分离到了羊口疮病毒GDDP株,扩增了GDDP株ORFV的011基因和059基因,该毒株的011基因和059基因与福建和新疆流行... 对广东大浦发生的羊口疮病例进行了病毒的分离、鉴定及011基因和059基因的遗传演化分析。结果表明,利用胚胎羊鼻甲细胞成功的分离到了羊口疮病毒GDDP株,扩增了GDDP株ORFV的011基因和059基因,该毒株的011基因和059基因与福建和新疆流行的毒株具有密切的亲缘关系,可能为这些流行毒株的重组毒株,这也进一步证明了广东省羊口疮流行的复杂性。鉴于广东养羊业发展迅速,因此有必要开展更为深入的流行病学调查,为防控广东省的羊口疮奠定基础。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 大浦株 遗传演化分析
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2014年—2015年天津地区PRRSV分子流行病学调查及流行毒株的分离鉴定 预览 被引量:6
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作者 孙英峰 李志 +11 位作者 路超 韩伟 任卫科 李富强 田向学 张莉 李秀丽 付永利 于海霞 张立新 张超 杨汉春 《动物医学进展》 北大核心 2016年第10期11-15,共5页
为了解天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和流行趋势,用RT-PCR对2014年—2015年在天津地区采集的疑似PRRS病料检测,并扩增阳性病料PRRSV NPS2部分基因片段和进行PRRSV分离鉴定。结果显示,237份疑似PRRSV... 为了解天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和流行趋势,用RT-PCR对2014年—2015年在天津地区采集的疑似PRRS病料检测,并扩增阳性病料PRRSV NPS2部分基因片段和进行PRRSV分离鉴定。结果显示,237份疑似PRRSV感染病料中64份为阳性,阳性率为27%,分离获得33株PRRSV;Nsp2序列分析发现,天津地区流行的PRRSV主要为美洲型,其中54份与高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)高度同源,8份与经典PRRSV高度同源,2份与NADC30-like高度同源。结果表明,2014年—2015年天津地区主要流行HP-PRRSV,并出现了NADC30-like变异毒株,说明PRRSV流行种类的多样化,提示加强PRRSV流行及变异监测十分必要。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 分离 分子流行病学 遗传演化分析
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2013年苏皖地区4株H9N2亚型禽流感病毒HA,NA基因的遗传演化分析 预览 被引量:4
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作者 杨婧 刘宇卓 +3 位作者 赵冬敏 黄欣梅 韩凯凯 李银 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第11期1896-1902,共7页
为了解2013年苏皖地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取2013年所分离的4个H9N2亚型禽流感病毒株,对其HA和NA基因进行测序,并应用DNAStar和Mega生物软件拼接序列和建立进化树。结果表明,4株H9N2的HA裂解位点氨基酸均为-R(K)SSR/GL-,... 为了解2013年苏皖地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取2013年所分离的4个H9N2亚型禽流感病毒株,对其HA和NA基因进行测序,并应用DNAStar和Mega生物软件拼接序列和建立进化树。结果表明,4株H9N2的HA裂解位点氨基酸均为-R(K)SSR/GL-,具有典型低致病性禽流感病毒HA基因的特征;但其226位氨基酸均为亮氨酸(L),呈现出人流感受体结合特性。4株病毒NA基因颈部均有9个核苷酸的缺失,且NA潜在糖基化位点数量不超过8个。进化树分析表明,2013年苏皖地区H9N2流行毒株HA和NA基因发生变异,且变异与时间呈现一定的相关性,与地域无关。 展开更多
关键词 H9N2 HA NA 遗传演化分析
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一株类禽H1N1亚型猪流感病毒的进化研究
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作者 唐续 贺东生 +5 位作者 裴仉福 李琳 刘好朋 张显浩 李冰 陈瑞爱 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第11期142-145,共4页
为了解猪流感病毒(SIV)的变异情况,2013年1月份从山西某养殖场采集呈流感症状的猪鼻拭子10份,采用常规方法接种10日龄SPF鸡胚,进行RT-PCR鉴定及全基因序列分析。结果表明:分离到1株类禽H1N1亚型猪流感病毒,命名为A/swine/Shanxi/02/2... 为了解猪流感病毒(SIV)的变异情况,2013年1月份从山西某养殖场采集呈流感症状的猪鼻拭子10份,采用常规方法接种10日龄SPF鸡胚,进行RT-PCR鉴定及全基因序列分析。结果表明:分离到1株类禽H1N1亚型猪流感病毒,命名为A/swine/Shanxi/02/2013(H1N1);全基因序列测定及同源性分析发现,8个基因片段均与2011年江苏地区流行的类禽型H1N1亚型猪流感病毒有较高的同源性;系统遗传演化发现,该病毒株是由2011年类禽型H1N1流感病毒A/swine/Jiangsu/40/2011(H1N1)进化而来的;HA1氨基酸位点差异分析发现,该病毒株与2009年人群中流行的甲型H1N1流感和经典H1N1毒株抗原性差异较大,其HA裂解位点基序为PSIQSRGLF,呈低致病性特征。 展开更多
关键词 猪流感病毒(SIV) 类禽H1N1亚型 遗传演化分析 抗原性分析
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