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犬副流感病毒D121004株的分离鉴定及其F基因遗传进化分析 预览
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作者 李超 马帅 徐守振 《中国动物检疫》 CAS 2019年第2期77-81,共5页
为了给犬副流感病毒(CPIV)疫苗研制提供支持,无菌采集有呼吸道症状病死犬的脑和肺脏样品,处理后接种Marc-145细胞,通过RT-PCR、红细胞吸附试验,对盲传3代的细胞培养液进行鉴定,成功分离到1株CPIV。该病毒能使Marc-145细胞出现细胞病变,... 为了给犬副流感病毒(CPIV)疫苗研制提供支持,无菌采集有呼吸道症状病死犬的脑和肺脏样品,处理后接种Marc-145细胞,通过RT-PCR、红细胞吸附试验,对盲传3代的细胞培养液进行鉴定,成功分离到1株CPIV。该病毒能使Marc-145细胞出现细胞病变,且具有吸附鸡红细胞的能力,将其命名为CPIV-D121004株。对该毒株的F糖蛋白全基因进行克隆及核苷酸同源性分析并构建遗传进化树,发现分离株的F基因较为保守,未出现大的遗传变异。今后需要对分离株的免疫原性进行研究,以探究其作为候选疫苗株的潜力。 展开更多
关键词 犬副流感病毒 分离鉴定 遗传进化分析
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猪瘟病例的综合诊断及感染毒株遗传进化分析 预览
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作者 王宏宇 李超 +7 位作者 孟凡亮 刘照虎 马梓承 焦秋林 李焱 曹龙 肖一红 刘思当 《中国动物检疫》 CAS 2019年第1期65-69,79共6页
2018年5月,山东省菏泽市某育肥猪场新进仔猪突然出现急性发病死亡,死亡率高达30%以上。为确诊病原,分析病原的遗传演化规律,对病死猪进行了病理组织学诊断和病毒分离鉴定,并对分离株的E2基因进行了序列测定及遗传变异分析。结果显示,组... 2018年5月,山东省菏泽市某育肥猪场新进仔猪突然出现急性发病死亡,死亡率高达30%以上。为确诊病原,分析病原的遗传演化规律,对病死猪进行了病理组织学诊断和病毒分离鉴定,并对分离株的E2基因进行了序列测定及遗传变异分析。结果显示,组织学病变符合猪瘟的病变特征,与参考毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为83.4%~97.9%和88.7%~98.7%,与本实验室从山东分离的流行毒株的核苷酸和氨基酸同源性均高于其他参考毒株。E2基因遗传进化分析表明,该分离株与本实验室分离的流行毒株遗传距离较近,同属于猪瘟病毒2.1d亚型分支。E2基因推导氨基酸突变位点分析表明,分离株的糖基化位点(T806A)与所有参考株均不相同,其具体生物学意义有待研究。上述结果表明,该猪场仔猪的急性发病死亡是由猪瘟病毒感染所致,致病毒株属于猪瘟病毒2.1d亚型。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 E2基因 遗传进化分析 病理组织学诊断 病毒分离鉴定
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广西部分地区猪群PEDV N基因克隆及序列分析 预览
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作者 许瑞胜 何奇松 +8 位作者 李春英 冯淑萍 易春华 韦达有 胡丽萍 黄胜斌 胡巧云 熊毅 马琳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期409-414,共6页
【目的】了解广西区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的感染及病毒的遗传变异特点,为更好防控猪流行性腹泻提供科学依据。【方法】应用RT-PCR方法从2012-2016年广西地区25个猪场收集的PEDV病料中扩增出86株PEDV的N基因,并进行序列比对及遗传进... 【目的】了解广西区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的感染及病毒的遗传变异特点,为更好防控猪流行性腹泻提供科学依据。【方法】应用RT-PCR方法从2012-2016年广西地区25个猪场收集的PEDV病料中扩增出86株PEDV的N基因,并进行序列比对及遗传进化分析。【结果】86株PEDV的N基因核苷酸同源性为94.2%~100.0%,与参考毒株核苷酸同源性为94.1%~100.0%。N基因遗传进化分析显示广西的PEDV可分为2个群,Cluster2由韩国株DR13、日本株83P-5、中国株CH/S以及本研究的GP35-8、LC37-22、LC107-5、LC107-19和LC107-16毒株组成,其他81株毒株属于Cluster 3,包括中国株DX、LJB-03、Hu N、JS-2004-2;Cluster 1和Cluster 4则由其它参考毒株组成。【结论】PEDV是引起广西规模化猪场新生仔猪腹泻的主要病原,广西地区的PEDV流行毒株可分为2个群且其N基因仍然保守。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 N基因 序列分析 遗传进化分析
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两株田间重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定、进化分析及其致病性研究 被引量:1
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作者 王新港 王傲杰 +4 位作者 周峰 崔丹丹 常洪涛 陈陆 王川庆 《病毒学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期362-371,共10页
为了解2型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV2)田间毒株重组特征,本研究对两株分离物(HENXX-8、HENJY-2)进行全基因测序、进化分析及毒力测定,并对其全基因序列进行重组分析。结果显示,两个毒株均属于PRRSV 2,两者与其代表株VR-2332的... 为了解2型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV2)田间毒株重组特征,本研究对两株分离物(HENXX-8、HENJY-2)进行全基因测序、进化分析及毒力测定,并对其全基因序列进行重组分析。结果显示,两个毒株均属于PRRSV 2,两者与其代表株VR-2332的核苷酸相似性分别为85.6%、85.7%;与高致病性PRRSV(HPPRRSV)毒株JXA1、TJ和WUH4株分别为85.7%-85.8%、85.4%-85.5%;与经典毒株CH-1a、HB-2(sh)分别为84.7%-85.7%、84.5%-85.7%;而与所有NADC30类毒株均在90.0%以上。全基因、ORF5及Nsp2序列进化分析结果均显示两个分离物与国内报道的类NADC30毒株遗传距离较近,同处于一个分支。全基因组重组分析结果表明,两个分离毒株存在明显重组现象,且重组模式均以类NADC30毒株为骨架病毒,与HP-PRRSV毒株发生重组。但重组对象不同:HENJY-2是由类NADC30毒株与TJ株发生重组;而HENXX-8则是由类NADC30毒株与WUH4、TJ株发生3毒株间重组。由于重组部位序列缺乏特异性分子标志,因此无法确定与类NADC30发生重组的是HP-PRRSV还是其减毒的疫苗毒株。两株分离物的重组部位与早期分离毒株HENANHEB、JL580等有所不同,均未涉及到ORF5基因,而是集中在Nsp1-Nsp2以及ORF2a-ORF3区域,主要发生在病毒基因组的靠5#端(30-7 000bp)和3#端(11 000-13 000bp)处。对部分重要基因的核苷酸相似性分析结果显示,两个分离株的ORF2a、ORF3基因与HP-PRRSV毒株相似性最高,表明重组病毒的这两个基因可能来自HPPRRSV毒株。致病性试验结果表明,参考毒株HENXC-4的毒力略高于分离毒株HENXX-8,主要表现在体温升高、日均增重降低和肺部病变上。但两个分离物均未引起发病猪死亡。以上结果表明,目前PRRSV2在田间的基因重组事件存在随机性,提示不同毒株在田间的存在会加剧PRRSV重组事件的发生和流行、毒株类型更加复杂,从而增加了临床防控难度。因此,慎重使用活疫苗� 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) 病毒分离鉴定 NADC30 HP-PRRSV 全序列 遗传进化分析 重组分析 致病性
2015-2016年广州市部分活禽市场H9N2亚型禽流感病毒的流行病学调查 被引量:1
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作者 钟如婷 孙淑鹏 +2 位作者 丁洁 张远远 张桂红 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期631-636,共6页
为了解广州市活禽市场禽流感病毒(AIV)的流行和变异情况,本研究于2015年5月至2016年6月从广州市部分活禽市场采集禽咽喉拭子1579份,对样品处理之后进行分离和RT—PCR鉴定,通过对HA、NA基因进行遗传进化分析后,共检测到9株H9N2亚... 为了解广州市活禽市场禽流感病毒(AIV)的流行和变异情况,本研究于2015年5月至2016年6月从广州市部分活禽市场采集禽咽喉拭子1579份,对样品处理之后进行分离和RT—PCR鉴定,通过对HA、NA基因进行遗传进化分析后,共检测到9株H9N2亚型禽源流感病毒。9株分离株的HA基因属于BJ/94-like分支,核苷酸相似性为93.2%~99.7%;有8株分离株的HA基因裂解位点的序列为P—S—R—S—S-R,1株的HA基因裂解位点的序列发生了P/L—S-R—S-S-R的替换。HA蛋白第226受体结合位点的氨基酸均为亮氨酸(Leu),具有人流感受体结合的特征。6株分离株的NA基因属于BJ/94like分支,3株属于HK/G9一like分支,说明不同分支的病毒开始出现重组。本研究通过对广州市部分活禽市场分离到的禽流感病毒序列分析,掌握活禽市场流感病毒的流行变异趋势,为流感病毒的综合防控及保障公共卫生健康提供参考。 展开更多
关键词 广州市 活禽市场 禽流感病毒 分离鉴定 遗传进化分析
4株新出现的Ⅰ类新城疫病毒F基因的变异分析
6
作者 魏润宇 罗瑶瑶 +6 位作者 吕艳 王静静 郑东霞 赵云玲 刘文博 刘华雷 王志亮 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1781-1788,共8页
为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%... 为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~100%。4株分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成均为112 ERQERL117,符合新城疫病毒弱毒株的分子特征。F基因高变区(47—420nt)遗传进化分析结果显示这4株病毒为国内新出现的基因型,利用F基因编码区全长序列构建系统进化树显示4株病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源,而与国内基因1c亚型分离株(Duck/Guangxi/1261/2015)相似性仅为95.5%~97%。监测数据表明这种新出现的Ⅰ类新城疫病毒具有在国内进一步流行和扩散的风险。 展开更多
关键词 Ⅰ类新城疫病毒 分子特征 遗传进化分析
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我国Ⅰ群禽腺病毒主要流行血清型间交叉中和作用的初步研究
7
作者 邹开宇 高倩文 +5 位作者 江之瑶 孙举 王守春 王建琳 徐守振 尹燕博 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2018年第11期150-153,共4页
为了解我国Ⅰ群禽腺病毒(FAdV-Ⅰ)主要流行血清型FAdV-4、FAdV-8a、FAdV-8b和FAdV-11之间的交叉中和情况,试验选取4种流行血清型的代表株,制备其对应的血清型单因子血清并进行细胞交叉中和试验。结果表明:4种血清型都能对自身病毒产... 为了解我国Ⅰ群禽腺病毒(FAdV-Ⅰ)主要流行血清型FAdV-4、FAdV-8a、FAdV-8b和FAdV-11之间的交叉中和情况,试验选取4种流行血清型的代表株,制备其对应的血清型单因子血清并进行细胞交叉中和试验。结果表明:4种血清型都能对自身病毒产生中和作用,其中RZ140718(FAdV-4)血清还能中和YT160809(FAdV-11),JL150226(FAdV-8b)和YT160809(FAdV-11)之间还能互相中和。说明FAdV-Ⅰ不同流行血清型间交叉中和情况复杂。 展开更多
关键词 Ⅰ群禽腺病毒 流行血清型 遗传进化分析 单因子血清 交叉中和试验 疫苗
Ⅰ亚群禽腺病毒的分离鉴定及遗传进化分析
8
作者 程小果 王慧 +2 位作者 凌云志 赵英娜 陈申秒 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2018年第22期89-92,共4页
为了确定吉林市某蛋鸡养殖场所送检育成期病死鸡的病因,试验采用PCR方法检测结合病毒分离鉴定并对分离株进行遗传进化分析。结果表明:确诊病死鸡所患疾病为鸡心包积水综合征,并分离到1株Ⅰ亚群禽腺病毒(FAdV-Ⅰ),将其命名为JLJL/1703... 为了确定吉林市某蛋鸡养殖场所送检育成期病死鸡的病因,试验采用PCR方法检测结合病毒分离鉴定并对分离株进行遗传进化分析。结果表明:确诊病死鸡所患疾病为鸡心包积水综合征,并分离到1株Ⅰ亚群禽腺病毒(FAdV-Ⅰ),将其命名为JLJL/1703株;测定其Hexon基因序列,与公开发表的其他血清型FAdV-Ⅰ代表株进行遗传进化分析,JLJL/1703株与FAdV-4型代表株处于同一分支上,遗传进化距离最近,归属于同一个血清型。说明分离株JLJL/1703株属于FAdV-4型。 展开更多
关键词 Ⅰ亚群禽腺病毒 心包积水综合征 包涵体肝炎 PCR Hexon基因 遗传进化分析
新疆南疆地区羊口疮病毒的分离鉴定及其遗传进化分析 预览 被引量:1
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作者 沙娜瓦尔·塔希 买买提艾力·斯迪克 +7 位作者 比力克孜·阿不都热依木 马伟 盛卓君 依布拉依木·阿布力米提 居马别克·夏拉巴依 薛文 王文 阿依吐拉·肉孜 《草食家畜》 2018年第1期26-32,共7页
为确定新疆喀什等地区羊场发生的疑似羊口疮(ORF)的病原,利用GSFs细胞从送检的羊口鼻痂皮中分离获得的毒株,通过PCR鉴定确定该病原为羊口疮病毒(ORFV),命名为ORFV/XJ-NJ/2017/China株。然后对该分离株的B2L基因和ORFV121基因进行克隆,测... 为确定新疆喀什等地区羊场发生的疑似羊口疮(ORF)的病原,利用GSFs细胞从送检的羊口鼻痂皮中分离获得的毒株,通过PCR鉴定确定该病原为羊口疮病毒(ORFV),命名为ORFV/XJ-NJ/2017/China株。然后对该分离株的B2L基因和ORFV121基因进行克隆,测序,并与其它ORFV序列进行遗传进化分析。结果表明:ORFV/XJ-NJ/2017/China的B2L基因全长为1097bp,编码365个氨基酸,ORFV121基因长889bp,编码296个氨基酸,与GenBank中收录的其他ORFV流行株相比,B2L基因核苷酸的同源性为94.7%~98.5%,与疫苗株的核苷酸同源性为97%,推导的氨基酸同源性为95%~97%,;ORFV121基因核苷酸的同源性为93.6%~99.1%,推导的氨基酸同源性87.7~98%。利用软件构建系统进化树分析,根据B2L基因遗传进化树分析结果表明,该分离株与印度分离株亲缘关系最近;由ORFV121基因遗传进化分析结果表明,该分离株与我国NA1/11分离株亲缘关系最近.根据B2L基因和ORFV121基因的遗传进化分析,其分离得到的病毒株可能是国内外流行重组后产生的一个变异株,为羊口疮病毒的后续研究提供依据。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 分离鉴定 遗传进化分析 新疆
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东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析 预览
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作者 张涵 解长占 +8 位作者 李太元 哈卓 李卓昕 李成辉 李金凤 赵冠宇 郭影成 鲁会军 金宁一 《中国动物检疫》 CAS 2018年第11期71-74,共4页
从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对... 从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析。结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%~95.2%、94.1%~95.1%和93.5%~94.3%;CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%~91.8%、89.8%~92.0%和89.6%~91.7%。通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型。通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高。该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据。 展开更多
关键词 猪细小病毒7型(PPV7) 基因组测定 遗传进化分析
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2016—2017年广西4种野生鸟类新城疫病原学检测与遗传进化分析 预览
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作者 谢丽基 谢芝勋 +8 位作者 罗思思 邓显文 谢志勤 王盛 黄娇玲 曾婷婷 张艳芳 范晴 张民秀 《中国动物检疫》 CAS 2018年第5期21-24,50共5页
为研究广西野生鸟类中的新城疫病毒(NDV)感染状况,从4种临床健康鸟类中,采集口咽/泄殖腔棉拭子650份,通过病毒分离、RT-PCR和F基因序列测定,进行NDV感染状况调查和分子特征分析。结果显示:共分离到10株NDV,分离率为1.54%;10株分离株F基... 为研究广西野生鸟类中的新城疫病毒(NDV)感染状况,从4种临床健康鸟类中,采集口咽/泄殖腔棉拭子650份,通过病毒分离、RT-PCR和F基因序列测定,进行NDV感染状况调查和分子特征分析。结果显示:共分离到10株NDV,分离率为1.54%;10株分离株F基因的氨基酸裂解位点基序均为112R-R-Q-K-R-F117,符合NDV强毒株的典型特征;分离的10株毒株中,5株来源于斑鸠,3株来源于鸽子,2株来源于鹧鸪,8株为II类NDV基因VI型,2株为XII型。结果表明,我国野鸟中流行的NDV以II类基因VI型强毒株为主,但已出现了新基因型(基因XII型)。因此,应加大对野鸟NDV监测的力度,防止其将病毒传染给家禽,同时应开展当前疫苗对NDVXII型的免疫效果评估。 展开更多
关键词 新城疫病毒 野生鸟类 病原学检测 遗传进化分析
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2015-2016年深圳市龙华区手足口病病原谱分析 被引量:1
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作者 任燕 许少坚 +4 位作者 赖晓玲 赵琼 全德甫 王金明 林启辉 《热带医学杂志》 CAS 2018年第3期392-395,共4页
目的分析深圳市龙华区2015-2016年手足口病(HFMD)病原谱,为辖区内HFMD预防和控制策略的制订提供参考。方法采用荧光定量RT-PCR方法对2015-2016年辖区内447例HFMD病例样本及2016年辖区内疫情监测的75例HFMD病例样本进行肠道病毒(Ev... 目的分析深圳市龙华区2015-2016年手足口病(HFMD)病原谱,为辖区内HFMD预防和控制策略的制订提供参考。方法采用荧光定量RT-PCR方法对2015-2016年辖区内447例HFMD病例样本及2016年辖区内疫情监测的75例HFMD病例样本进行肠道病毒(Ev)、肠道病毒71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A16型(CV-A16)核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒进行VP1区序列测定、亚型鉴定及进化分析。结果2015-2016年辖区内447例HFMD病例样本实验室检测阳性率为81.21%(363/447),主要优势病原体为EV-A71、CV-A16和柯萨奇病毒A6型(CV-A6),总构成比为82.92%(301/363);2016年辖区内75例HFMD病例样本实验室检测阳性率为52.00%(39/75);EV-A71检出高峰集中在4-6月份,CV-A16的检出高峰集中在4-8月份,CV-A6检出集中在9-10月份;2015-2016辖区内HFMD中CV-A6呈多支分布。结论深圳市龙华区应进一步加强HFMD的病原谱监测及遗传分析,为进一步完善HFMD防控策略提供科学数据。 展开更多
关键词 手足口病 病原谱 遗传进化分析
云南地方鸡种肠炎沙门菌分离株的生物学特性研究
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作者 和春林 鲍晓伟 +2 位作者 李富祥 严红亚 王传禹 《中国家禽》 北大核心 2018年第17期61-63,共3页
本研究从云南地方鸡种(武定鸡、茶花鸡、云龙矮脚鸡)养殖场中分离到5株自编号w-1、w-2、c-1、c-2、y-1肠炎沙门菌,其分离率27.8%(5/18),表明云南省武定鸡、茶花鸡、云龙矮脚鸡这三个云南地方品种鸡均有肠炎沙门菌感染,首次对... 本研究从云南地方鸡种(武定鸡、茶花鸡、云龙矮脚鸡)养殖场中分离到5株自编号w-1、w-2、c-1、c-2、y-1肠炎沙门菌,其分离率27.8%(5/18),表明云南省武定鸡、茶花鸡、云龙矮脚鸡这三个云南地方品种鸡均有肠炎沙门菌感染,首次对其分离株的生物学特性进行了初步研究。c-1、c-2分离株有强的致病性,人工感染可使80%(8/10)以上的7日龄雏公鸡死亡;遗传进化分析,本研究中的5株分离株位于进化树的第1和第2进化分支中,表明肠炎沙门菌16S rDNA遗传进化关系与不同地理来源、不同动物品种来源均不存在相关性。药敏试验结果显示分离株对恩诺沙星、庆大霉素、氟甲砜霉素、阿米卡星等抗生素敏感,而对罗红霉素、克林霉素等抗生素具有耐药性。 展开更多
关键词 肠炎沙门菌 地方鸡种 分离鉴定 药敏试验 遗传进化分析
PRRSV YN-LQ株的全基因序列测定及遗传进化分析
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作者 张涵 解长占 +8 位作者 张世亨 李卓昕 李成辉 赵冠宇 马彬尧 尹革芬 鲁会军 金宁一 李太元 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期1272-1275,1281共5页
从云南省某发病猪场分离到1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),将该毒株命名为YN—LQ株。为了研究该毒株的遗传变异及分子生物学特征,根据PRRSV标准毒株NCBI登录号KC422728设计10对引物,对YNI。Q株全基因进行扩增及测序,将测序结... 从云南省某发病猪场分离到1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),将该毒株命名为YN—LQ株。为了研究该毒株的遗传变异及分子生物学特征,根据PRRSV标准毒株NCBI登录号KC422728设计10对引物,对YNI。Q株全基因进行扩增及测序,将测序结果依次拼接获得YN—LQ株的全基因序列,并进行序列的比对分析。结果显示:PRRsVYN—LQ株基因组全长为15320bp;将YN—LQ株与经典PRRSV病毒株Nsp2、GP5及全基因进行比对分析,发现YN—LQ株与JXAl的同源性最高。Nsp2基因序列同源性为99.0%,其氨基酸序列有15个位点发生了改变;GP5基因序列同源性为97.7%,其氨基酸序列有9个位点发生了改变;全基因的同源性为98.7%。证实该毒株为JXA1变异株,为深入研究该病毒株的遗传与变异及其与生物学特性的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 序列测定 遗传进化分析
南宁地区犬细小病毒VP2基因的克隆及遗传进化分析 预览
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作者 徐闰 黄华旭 +4 位作者 徐小明 李政泰 马麟 劳小香 吴显实 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第12期3346-3354,共9页
为了解广西南宁地区犬细小病毒(CPV)的流行现状与病毒变异情况,本试验对初步确诊为犬细小病毒病的12份阳性病料提取基因组DNA,以提取的基因组DNA为模板,通过PCR扩增VP2基因序列并测序,将12个阳性毒株样本VP2基因测序结果与GenBank中登录... 为了解广西南宁地区犬细小病毒(CPV)的流行现状与病毒变异情况,本试验对初步确诊为犬细小病毒病的12份阳性病料提取基因组DNA,以提取的基因组DNA为模板,通过PCR扩增VP2基因序列并测序,将12个阳性毒株样本VP2基因测序结果与GenBank中登录的17株国内外CPV分离株VP2基因进行同源性比对,采用Mega 7.0软件绘制遗传进化树,分析其病毒亚型和遗传进化情况。结果显示,成功扩增得到12个毒株样本的VP2基因片段,大小约1 755bp,12株阳性样本毒株的VP2基因同源性在99.2%~100.0%之间,其中NN01与NN07、NN02与NN06同源性最高,为100.0%;阳性样本毒株与国内其他分离株VP2基因的同源性为97.6%~100.0%,其中NN08、NN10及NN04与CPV-ZJ1579同源性最高,均为100.0%,属于CPV-2a亚型;阳性样本毒株与国外代表性毒株同源性在98.1%~99.8%之间。遗传进化树分析表明,12个样本毒株中有3株属于CPV-2a亚型,3株属于CPV-2b亚型,6株属于CPV-2c亚型。这是继2018年初广西分离到CPV-2c型CPV后,首次发现南宁地区大规模流行CPV-2c亚型病毒,预示着CPV-2c亚型CPV在国内的流行正在增加。综上所述,广西南宁地区CPV-2a、CPV-2b与CPV-2c亚型并存,但CPV-2c亚型的比重比其他地区大,这也给该地区提供了新的防治信息,在实际CPV防控工作中除了对CPV-2a、CPV-2b等传统流行亚型的关注之外,更应该重视CPV-2c亚型CPV的防控。 展开更多
关键词 犬细小病毒(CPV) CPV-2c VP2基因 遗传进化分析
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猪圆环病毒2型天津及周边地区分离株的遗传演化分析 预览
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作者 王利丽 郑丽 +4 位作者 路超 任卫科 张莉 李富强 鄢明华 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第5期1331-1340,共10页
为了解天津及周边地区猪圆环病毒2型(porcine circovirus 2,PCV2)的流行毒株遗传变异情况,本研究应用基因克隆技术和生物信息学分析软件对24株PCV2分离株全基因及ORF2基因分别进行克隆、测序、同源性比对和遗传进化分析。全基因组序... 为了解天津及周边地区猪圆环病毒2型(porcine circovirus 2,PCV2)的流行毒株遗传变异情况,本研究应用基因克隆技术和生物信息学分析软件对24株PCV2分离株全基因及ORF2基因分别进行克隆、测序、同源性比对和遗传进化分析。全基因组序列分析结果显示,24株PCV2分离株全基因组序列有14株为1 767bp,10株为1 768bp。用DNAStar软件对全基因组序列同源性比对表明,24株PCV2分离株与NCBI上的PCV2参考株的全基因序列同源性为93.6%~99.8%,24株分离株之间的全基因组序列差异很小,同源性为94.0%~99.9%。同时,用DNAStar对PCV2分离株的ORF2基因序列同源性分析表明,其与NCBI上的PCV2 ORF2基因参考序列的核苷酸序列同源性为87.3%~99.3%,24株分离株ORF2基因核苷酸序列同源性为89.0%~100.0%,3株分离株(10084F4、R14040及R14086)的核苷酸序列同源性为100.0%。对全基因和ORF2基因的遗传进化分析表明,24株分离株的系统进化树被分为2个大分支,其中23株分离毒株属于PCV2b亚型,1株属于PCV2a亚型,未分离出PCV2c亚型。综上所述,天津及周边地区PCV2的流行模式仍以PCV 2b亚型为主,本研究为该地区PCV2的流行变异情况研究提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型(PCV2) 克隆 遗传进化分析
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2株H1N1猪流感病毒的遗传进化分析及其生物致病性
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作者 黄俊明 蔡孟楷 +4 位作者 李琪 卜德新 方博 冀池海 张桂红 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1833-1839,共7页
对挑选的2株猪流感病毒A/swine/Guangdong/BRT15/2016(H1N1,BRT15)和A/swine/Guangdong/YJ4/2014(H1N1,YJ4)进行遗传进化分析与小鼠致病性试验。全基因组序列的遗传进化分析结果显示,BRT15与YJ4的HA、NA、M基因属于欧亚类禽猪源流... 对挑选的2株猪流感病毒A/swine/Guangdong/BRT15/2016(H1N1,BRT15)和A/swine/Guangdong/YJ4/2014(H1N1,YJ4)进行遗传进化分析与小鼠致病性试验。全基因组序列的遗传进化分析结果显示,BRT15与YJ4的HA、NA、M基因属于欧亚类禽猪源流感病毒分支,NP、PA、PB1和PB2基因属于pdm/09分支,NS基因属于北美三元重组分支。分别将BRT15与YJ4感染BALB/c小鼠进而比较分离株对小鼠的致病力,结果显示BRT15与YJ4毒株对小鼠具有不同的致病力,YJ4攻毒组小鼠死亡率高于BRT15组。肺部滴度检测显示,感染病毒后3d,YJ4组病毒滴度显著高于BRT15(P〈0.01),感染病毒后6d,YJ4和BRT15组病毒滴度无明显差异(P〉0.05);脑部滴度检测显示,感染病毒后3,6d,YJ4组和BRT15组病毒滴度均无明显差异(P〉0.05)。 展开更多
关键词 H1N1猪流感病毒 遗传进化分析 重组 致病性
广东省鼠形动物携带巴尔通体的调查和基因特征分析 预览
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作者 李雪云 陈经雕 +4 位作者 黎聪荣 柯碧霞 林文青 彭志强 柯昌文 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期482-486,491共6页
目的了解巴尔通体在广东省鼠形动物中的流行分布情况及其基因型特征,为巴尔通体的研究和自然疫源性疾病的防控提供科学依据。方法在广东省惠来县、惠东县、潮安县、罗定县和高州市5个地区进行捕鼠,采集鼠肝脏标本提取总核酸,利用聚合酶... 目的了解巴尔通体在广东省鼠形动物中的流行分布情况及其基因型特征,为巴尔通体的研究和自然疫源性疾病的防控提供科学依据。方法在广东省惠来县、惠东县、潮安县、罗定县和高州市5个地区进行捕鼠,采集鼠肝脏标本提取总核酸,利用聚合酶连反应(PCR)检测巴尔通体病原,并对其进行分离培养,阳性产物进行测序,并根据序列进行系统进化分析,统计分析巴尔通体的分布情况和特征。结果在广东省5个地区共捕鼠375只,检出巴尔通体阳性标本73份,阳性率为19.47%。不同鼠种(χ^2=6.361)、不同地区(χ^2=7.778)、不同性别(χ^2=0.292)、不同生境间(χ^2=0.621),阳性率差异均没有统计学意义(P〉0.05)。73份样本中,10份成功分离培养出巴尔通体。系统进化分析表明广东鼠形动物携带的巴尔通体存在6种基因型:Bartonella elizabethae、B.phoceensis、B.japonica、B.henselae、B.rochalimae、B.tribocorum。结论巴尔通体在广东省鼠形动物中广泛存在,且基因型呈多样性,其中4种基因型对人类有致病性,对人类健康具有潜在威胁。 展开更多
关键词 巴尔通体 鼠形动物 调查 遗传进化分析
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2014-2017年我国部分地区10株鸽副黏病毒的分布及其分子特征
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作者 罗瑶瑶 王静静 +9 位作者 王云平 魏润宇 吕艳 赵云玲 郑东霞 于松梅 张乐萃 刘华雷 王志亮 单虎 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1883-1886,1931共5页
为了解我国鸽群新城疫病毒的感染情况,于2014-2017年在国内部分地区开展了基于风险的新城疫主动监测,结果从部分地区活禽市场的鸽群及环境样本中成功分离到10株新城疫病毒,并对其F基因全长进行扩增和遗传进化分析。结果显示,10株新城疫... 为了解我国鸽群新城疫病毒的感染情况,于2014-2017年在国内部分地区开展了基于风险的新城疫主动监测,结果从部分地区活禽市场的鸽群及环境样本中成功分离到10株新城疫病毒,并对其F基因全长进行扩增和遗传进化分析。结果显示,10株新城疫病毒F基因编码区长度均为1 662bp,共编码553个氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.7%~99.9%、95.7%~99.6%,表明不同地区分离株之间具有较高的同源性。所有分离株F蛋白裂解位点均为112R-R-Q-K-R-F117,具有新城疫病毒强毒株典型的分子特征。遗传进化分析结果显示,10株病毒均属于ClassⅡ基因Ⅵb亚型,表明基因VIb亚型为近年来我国鸽群中流行的新城疫病毒优势基因型。 展开更多
关键词 鸽副黏病毒 基因VIb亚型 遗传进化分析 新城疫病毒
平顶山地区奶牛隐孢子虫种类鉴定及遗传进化分析 预览
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作者 李华松 《中国奶牛》 2018年第8期36-39,共4页
为了阐明河南省平顶山地区奶牛隐孢子虫的流行情况、种类分布与遗传进化分析情况,应用饱和蔗糖漂浮法对平顶山地区233份奶牛粪便进行隐孢子虫病流行情况调查,同时应用分子生物学技术分析隐孢子虫分离株的种类及遗传进化关系。结果显示,... 为了阐明河南省平顶山地区奶牛隐孢子虫的流行情况、种类分布与遗传进化分析情况,应用饱和蔗糖漂浮法对平顶山地区233份奶牛粪便进行隐孢子虫病流行情况调查,同时应用分子生物学技术分析隐孢子虫分离株的种类及遗传进化关系。结果显示,223份奶牛粪便中有12份为隐孢子虫阳性,阳性率为5.38%,不同年龄阶段和奶牛场的奶牛隐孢子虫阳性率具有显著差异(P<0.05)。序列比对与遗传进化分析结果显示,平顶山地区12株奶牛隐孢子虫分离株的18SrRNA基因与Genbank中收录的牛隐孢子虫(Cryptosporidium bovis)同源性最高,且两者在系统进化树上为同一大分支,说明此次分离的奶牛隐孢子虫分离株均为牛隐孢子虫。本次研究结果为河南平顶山地区奶牛隐孢子虫的分子流行病学与防治研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 奶牛 隐孢子虫 种类鉴定 遗传进化分析
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