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降解组测序技术对人参miRNA靶基因的分析鉴定
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作者 王颖芳 王文娟 +8 位作者 彭朦媛 陈艳琳 何枝华 曹晶晶 戴王强 林志云 杨泽民 龚梦鹃 尹永芹 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期945-950,共6页
目的分析鉴定人参miRNA靶基因。方法采用降解组测序技术对石柱参(Shizhu ginseng)、园参(Yuan ginseng)的miRNA及靶基因进行检测;利用公共数据库KEGG/NR/GO数据库对降解组基因进行功能注释;通过荧光实时定量PCR(q RT-PCR)技术验证石柱... 目的分析鉴定人参miRNA靶基因。方法采用降解组测序技术对石柱参(Shizhu ginseng)、园参(Yuan ginseng)的miRNA及靶基因进行检测;利用公共数据库KEGG/NR/GO数据库对降解组基因进行功能注释;通过荧光实时定量PCR(q RT-PCR)技术验证石柱参、园参的miRNA及靶基因表达量。结果共得到8个miRNA家族的13个靶基因;利用KEGG/NR/GO数据库分析发现该miRNA的靶基因类型主要是转录因子、应答因子及信号转导通路等。对5个差异表达mi RNAs:aqc-miR-159、bdi-miR162、cpa-miR319、pgi-miR4376、smo-mi R396及其靶基因进行的q RT-PCR验证结果与降解组测序结果一致。结论明确了部分人参miRNA的靶基因,为进一步研究人参miRNA的可能功能奠定基础。 展开更多
关键词 人参 石柱参 园参 miRNA 靶基因 降解组测序
miR-199a家族与肿瘤关系的研究进展 预览
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作者 胡文佳 陈晨 +3 位作者 黄辉 唐旭东 罗海清 李祥勇 《医学综述》 2019年第2期280-285,共6页
微RNA(miRNA)是一类天然存在的、进化上高度保守的非编码小分子RNA,可特异性抑制或降解靶信使RNA的翻译,调控靶基因的表达。肿瘤严重威胁人类健康,迄今为止其发病机制尚未完全明确。其中,miRNA在肿瘤的生物学过程中扮演重要的角色。miR-... 微RNA(miRNA)是一类天然存在的、进化上高度保守的非编码小分子RNA,可特异性抑制或降解靶信使RNA的翻译,调控靶基因的表达。肿瘤严重威胁人类健康,迄今为止其发病机制尚未完全明确。其中,miRNA在肿瘤的生物学过程中扮演重要的角色。miR-199a在多种肿瘤组织中呈异常表达,并通过调控多个信号通路参与肿瘤细胞生长增殖、凋亡、侵袭与转移和耐药等生物学过程,与肿瘤的发生、发展及治疗密切相关。了解miRNA在肿瘤中的复杂网络调控作用可为肿瘤研究提供指导。 展开更多
关键词 肿瘤 miR-199a 靶基因
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马立克病病毒编码的miR-M11-5p宿主靶基因的筛选与鉴定 预览
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作者 刘豪丽 滕蔓 +5 位作者 李会珍 余祖华 刘金玲 丁轲 张改平 罗俊 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1026-1038,共13页
作为α疱疹病毒的重要成员,马立克病病毒(MDV)感染鸡可引起免疫抑制及快速发作的T细胞淋巴瘤,即马立克病(MD)。此前发现MDV基因组编码大量病毒miRNA,可能在病毒复制、潜伏感染及肿瘤发生中起重要作用。基因敲除miR-M11-5p可显著增强MDV... 作为α疱疹病毒的重要成员,马立克病病毒(MDV)感染鸡可引起免疫抑制及快速发作的T细胞淋巴瘤,即马立克病(MD)。此前发现MDV基因组编码大量病毒miRNA,可能在病毒复制、潜伏感染及肿瘤发生中起重要作用。基因敲除miR-M11-5p可显著增强MDV致病性及致瘤性,表明其可能是MD肿瘤抑制因子。为进一步揭示miR-M11-5p介导的调控机制,本研究利用鸡胚成纤维细胞(CEF)总RNA的cDNA为模板,通过hybrid-PCR扩增miR-M11-5p的候选宿主靶基因片段,然后连接至pMD19-T载体、转化至E.coliJM109中构建cDNA文库。对文库菌落进行PCR鉴定、测序分析以及Blast序列对比,共获得77个候选宿主靶基因,其中37个miRNA结合靶点位于候选靶基因的3'-UTR中。进一步通过双荧光素酶报告试验、miR-M11-5p过表达以及RT-qPCR分析,最终鉴定鸡MAFB、LOC776816和RFX7为miR-M11-5p的宿主靶基因。本研究为进一步阐明miR-M11-5p在MDV肿瘤发生中的调控机制奠定了重要基础。 展开更多
关键词 马立克病病毒 微小RNA miR-M11-5p hybrid-PCR 靶基因 实时荧光定量PCR
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敲除小RNA gcvB后沙门菌的转录组分析 预览
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作者 刘丽娟 董然然 +6 位作者 王开功 程振涛 文明 温贵兰 李晨 杨琦 周碧君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期840-850,共11页
为筛选与沙门菌小RNAgcvB相关的靶基因,采用高通量的转录组测序(RNA-seq)技术对野生型沙门菌和敲除小RNAgcvB沙门菌的mRNA进行对比分析,全面地预测GcvB的靶基因的数量与种类,通过GO和KEGG数据库对筛选基因进行比对注释,进一步分析筛选... 为筛选与沙门菌小RNAgcvB相关的靶基因,采用高通量的转录组测序(RNA-seq)技术对野生型沙门菌和敲除小RNAgcvB沙门菌的mRNA进行对比分析,全面地预测GcvB的靶基因的数量与种类,通过GO和KEGG数据库对筛选基因进行比对注释,进一步分析筛选基因的主要功能及涉及的生物过程。并利用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果显示:差异表达基因共1244个,其中基因表达上调678个,基因表达下调566个。GO富集分析显示,差异表达基因主要涉及氧化还原活性、铁离子结合、运动活性等分子功能,细菌鞭毛的细胞成分,细胞呼吸、钴胺素代谢过程和钴胺素生物合成过程等生物过程。KEGG数据库分析显示,差异表达基因主要参与细菌趋化性、卟啉和叶绿素代谢、不同环境中的微生物代谢、双组分系统、甲烷代谢等14个信号通路。对筛选出的10个差异表达基因进行荧光定量PCR验证,结果显示:差异表达基因相对表达量与RNA-seq测序结果基本一致。本研究为进一步探明小RNAgcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制,以及沙门菌致病机制奠定了基础。 展开更多
关键词 沙门菌 小RNAgcvB 转录组测序 靶基因
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miR-126多基因靶向调控血管再生的研究 预览
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作者 王璐 张洲铭 +3 位作者 金诺 蔡卜磊 董广毅 李德超 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期340-344,共5页
目的:探讨microRNA miR-126多基因靶向调控血管再生的作用。方法:该实验将miR-126转染人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)后,随机分成A,B两组(A实验组:miRNA+HUVEC;B对照组:negative-miRNA control+HUVEC),荧光标记法和Western bolt检测2组细... 目的:探讨microRNA miR-126多基因靶向调控血管再生的作用。方法:该实验将miR-126转染人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)后,随机分成A,B两组(A实验组:miRNA+HUVEC;B对照组:negative-miRNA control+HUVEC),荧光标记法和Western bolt检测2组细胞中VEGF和ANG-1 mRNA和蛋白表达, Matrigel实验检测2组细胞成管能力。裸鼠体内实验验证miR-126促进血管再生的能力。结果:A组细胞miRNA-126高表达,VEGF和ANG-1 mRNA和蛋白的表达增强(P<0.05),体外成管腔能力增强(P<0.05);在裸鼠体内异位再生血管环境中血管形成率增强(P<0.05)。结论:miR-126可促进血管化形成,其机制与增强相关靶基因表达升高有关。 展开更多
关键词 MIR-126 血管再生 靶基因
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褪黑激素对内蒙古绒山羊皮肤中let-7家族及其靶基因的影响 预览
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作者 王建蒙 付绍印 +5 位作者 丽春 白雪 刘斌 季小阳 刘永斌 张文广 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1367-1379,共13页
旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材... 旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材料,利用qRT-PCR技术检测皮肤组织中11个let-7家族成员的表达变化,结合RNA-Seq技术分析let-7家族靶基因的表达变化。结果表明:1)在整个皮肤毛囊周期内,MT上调let-7b、let-7e、let-7a-3p的表达,下调let-7f、let-7g、let-7c、let-7a-5p、let-7d、miR-98的表达。2)在4月份,MT上调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,下调PTGS2、PLCG1等靶基因的表达;下调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,上调TGIF2、RBL1等靶基因的表达。3)在6月份,MT下调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,上调PTGS2、PLCG1、SRC等靶基因的表达;上调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,下调GDF5、TGIF2、RBL1等靶基因的表达。4)let-7家族成员的靶基因主要参与VEGF、TGF-β、Oxytocin和NF-kappa B信号通路,在细胞过程、激素调节和转录因子调控方面发挥重要作用。综上表明,MT可能通过改变let-7家族重要成员的表达水平,影响相应靶基因的表达,进而在皮肤毛囊的周期性生长过程中发挥重要作用,研究结果为进一步揭示MT介导miRNAs影响羊绒生长的分子机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 内蒙古绒山羊 皮肤 褪黑激素 let-7家族 靶基因
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羊绒细度候选基因靶标miRNAs筛选和鉴定 预览
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作者 惠太宇 郑圆媛 +10 位作者 岳畅 孙家明 郭丹 郭素玲 王意如 刘宇浩 王梓橙 王英轩 黄丽飞 白文林 王泽英 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期19-27,共9页
为筛选和验证辽宁绒山羊粗型和细型个体羊绒细度相关候选基因ALX4、NT-3、POLD2和AKT1表达调控潜在靶标miRNAs及其表达差异,提取辽宁绒山羊细型和粗型皮肤组织DNA和RNA,先采集辽宁绒山羊粗型和细型肩胛部皮肤组织,根据NCBI上的序列克隆... 为筛选和验证辽宁绒山羊粗型和细型个体羊绒细度相关候选基因ALX4、NT-3、POLD2和AKT1表达调控潜在靶标miRNAs及其表达差异,提取辽宁绒山羊细型和粗型皮肤组织DNA和RNA,先采集辽宁绒山羊粗型和细型肩胛部皮肤组织,根据NCBI上的序列克隆获得ALX4、NT-3、POLD2和AKT1基因的3'UTR,利用Primer5.0设计并合成功能引物,通过常规PCR扩增ALX4、NT-3、POLD2和AKT1基因的3'UTR序列,在miRBase数据库中,筛选羊绒细度候选靶基因3'UTR靶标miRNAs,然后与辽宁绒山羊(LCG)和内蒙古绒山羊(MCG)品种间皮肤miRNAs高通量测序结果共聚焦,筛选和验证羊绒细度相关候选基因表达调控潜在靶标miRNAs,在NCBI中检索到miRNAs的前体序列,应用RNAfold获得二级结构图及势能图,通过qPCR验证细型辽宁绒山羊(FinetypeLCG)和粗型辽宁绒山羊(CoarsetypeLCG)皮肤组织中羊绒细度候选基因ALX4、NT-3、POLD2和AKT1靶标miRNAs的表达量。结果表明:通过miRBase数据库预测,羊绒细度候选基因ALX4、NT-3、POLD2和AKT1分别获得104,27,19和32个靶标miRNAs,与绒山羊品种间皮肤miRNAs高通量测序结果聚焦分析,ALX4基因聚焦到3个靶标miR-m13,miR-433-5p和miR-671,其表达量是56,2和27;NT-3基因聚焦到1个靶标miR-1296,表达量是41;POLD2基因聚焦到1个靶标miR-130b,表达量是177;AKT1基因聚焦到2个靶标miR-345-3p和miR-2331-3p,其表达量是52和5。其中前体序列的二级结构表明miR-2331-3p的结构最不稳定,miR-1296最小自由能的绝对值最大,结构最为稳定。用qPCR验证miR-m13,miR-433-5p,miR-671,miR-1296,miR-345-3p和miR-2331-3p在辽宁绒山羊细型皮肤中的表达量都显著高于粗型皮肤中的表达量,可能对羊绒细度候选基因发挥重要的正调控作用,而miR-130b在LCG粗型的表达量高于LCG细型表达量,可能miR-130b对羊绒细度相关候选基因起负调控作用。 展开更多
关键词 绒山羊 羊绒细度 靶基因 MIRNAS 荧光定量PCR
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植物重金属胁迫相关miRNA的研究进展
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作者 秦耀旭 张关元 +2 位作者 刘司奇 刘洋 许志茹 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2855-2861,共7页
重金属胁迫是植物面临的一种重要的非生物胁迫。重金属会破坏细胞中的蛋白质结构,它产生的活性氧等有害物质也会对植物的生长发育造成危害。植物在进化过程中形成了多种应对重金属胁迫的分子机制,而miRNA在其中发挥了重要的调控作用。... 重金属胁迫是植物面临的一种重要的非生物胁迫。重金属会破坏细胞中的蛋白质结构,它产生的活性氧等有害物质也会对植物的生长发育造成危害。植物在进化过程中形成了多种应对重金属胁迫的分子机制,而miRNA在其中发挥了重要的调控作用。本综述概括总结了重金属对植物的危害作用、植物解除重金属胁迫的机制、miRNA的形成过程和作用机理,具体分析了在铜、镉、砷、汞等不同重金属胁迫条件下miRNA及其靶基因的应答情况,并对国内外相关研究内容和研究重点进行了总结和展望。本综述内容为更深入地研究植物应答重金属胁迫的调控机制及植物的抗性育种提供一定的参考。 展开更多
关键词 重金属胁迫 MIRNA 靶基因 调控机制
基于生物信息学方法预测野葛中的miRNA及其靶基因 预览
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作者 姚怡玮 徐静 +4 位作者 杨萌 李燕呢 何美军 郭坤元 吴斌 《中国现代中药》 CAS 2019年第4期429-437,共9页
目的:基于GitHub上释放的野葛转录组序列和miRBase中的microRNAs(miRNA)数据,通过生物信息学方法预测野葛中保守的miRNA,为研究其在野葛中的生物学作用奠定基础。方法:根据miRNA在植物中的保守性,利用psRobot软件的前体预测模块“psRobo... 目的:基于GitHub上释放的野葛转录组序列和miRBase中的microRNAs(miRNA)数据,通过生物信息学方法预测野葛中保守的miRNA,为研究其在野葛中的生物学作用奠定基础。方法:根据miRNA在植物中的保守性,利用psRobot软件的前体预测模块“psRobot-mir”将miRBase数据库中已知的miRNA序列与野葛转录组序列进行比对,按照miRNA的判定标准进行筛选,并随机选取了7条miRNA进行茎-环PCR验证,随后利用psRNATarget软件对这些miRNA进行了靶基因预测。结果:在野葛中共预测出34条潜在的miRNA序列,它们属于18个基因家族,miRNA茎-环PCR验证的成功率是100%。基于罚分≤3,预测出235个靶基因,其中66个具有明确的功能,涉及野葛抗病、生长发育、转录调节、胁迫应答等,其中28个为抗病蛋白。结论:预测出的野葛保守miRNA及其靶基因,为今后解析miRNA在野葛抗病和次生代谢产物合成中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 野葛 生物信息学 MICRORNA 靶基因
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miR-149与肿瘤关系的研究进展 预览
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作者 张兵 李恒 +6 位作者 吴安皓 申燕 刘欢 范胜亮 张飞越 陈楠 李高峰 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第15期2776-2779,共4页
miRNAs是一类长度约为20~25个核苷酸,参与基因调控表达的内源性非编码RNA。miR-149作为miRNAs的重要成员,在多种肿瘤中表达异常,其表达水平与肿瘤细胞增殖、转移、凋亡、耐药、患者的早期诊断及预后密切相关。因此,miR-149有望成为新一... miRNAs是一类长度约为20~25个核苷酸,参与基因调控表达的内源性非编码RNA。miR-149作为miRNAs的重要成员,在多种肿瘤中表达异常,其表达水平与肿瘤细胞增殖、转移、凋亡、耐药、患者的早期诊断及预后密切相关。因此,miR-149有望成为新一类抗肿瘤治疗的靶点。 展开更多
关键词 miR-149 靶基因 肿瘤
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丹苘软胶囊干预大鼠非酒精性脂肪肝细胞模型基因芯片的组学分析
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作者 刘锐 刘秀芳 +3 位作者 何嘉 李劲平 张玲 伍娟娟 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2019年第5期1046-1050,I0002-I0004共6页
目的:通过筛选mRNA(Clariom^TM S Assay)芯片及miRNA芯片的显著差异性基因,预测microRNA相关靶基因,探究丹苘软胶囊改善肝细胞脂肪代谢的调控机制。方法:提取丹苘软胶囊灌胃SD大鼠的含药血清,并对BRL大鼠肝细胞取对数生长期细胞进行实验... 目的:通过筛选mRNA(Clariom^TM S Assay)芯片及miRNA芯片的显著差异性基因,预测microRNA相关靶基因,探究丹苘软胶囊改善肝细胞脂肪代谢的调控机制。方法:提取丹苘软胶囊灌胃SD大鼠的含药血清,并对BRL大鼠肝细胞取对数生长期细胞进行实验,以阴性对照血清做对照,提取细胞总RNAs,采用Clariom S表达谱芯片及microRNA芯片检测细胞mRNA及miRNA的表达水平。运用生物信息学方法预测miRNA的靶基因,对脂肪代谢相关基因进行富集分析和通路分析。结果:经筛选和预测得到5629个预测靶基因参与20种生物学过程,7种细胞成分,有20种分子作用,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路被富集;rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p为调控网络中心;IPA数据库共检出31个与实验有关的脂肪代谢基因。结论:丹苘软胶囊在治疗非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的机制可能与rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路相关性较高。 展开更多
关键词 丹苘软胶囊 非酒精性脂肪肝 mRNA MIRNA 靶基因 生物信息学分析
肝细胞癌患者生存预后相关长链非编码RNA(LncRNA)的生物信息学分析 预览
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作者 吴良银 李文丽 刘俊 《现代检验医学杂志》 CAS 2019年第4期18-21,共4页
目的通过癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,利用生物信息学方法构建与肝细胞癌患者生存预后相关的长链非编码RNA (LncRNA)筛选模型,建立肝细胞癌诊断和预后相关的LncRNA,为研究肝细胞癌的发生发展及预后提供新的研究思... 目的通过癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,利用生物信息学方法构建与肝细胞癌患者生存预后相关的长链非编码RNA (LncRNA)筛选模型,建立肝细胞癌诊断和预后相关的LncRNA,为研究肝细胞癌的发生发展及预后提供新的研究思路,有望成为新的治疗靶点。方法从癌症基因图谱(TCGA)数据库中下载424例肝细胞癌患者的RNA表达谱数据和相应的临床资料,其中包括374例肿瘤组织和50例正常对照。通过R语言的edgeR包,获取在正常组织和肝细胞癌组织中差异表达的LncRNA,并使用单因素Cox回归分析筛选出与预后相关的LncRNA。用lasso回归和多因素回归分析建立与肝细胞癌预后相关LncRNA模型,绘制受试者工作特征曲线,验证其模型的可靠性。结果在TCGA数据库中用单因素生存分析筛选出899个与生存预后相关的LncRNA,进一步用多因素Cox回归,筛选出5个与生存预后最显著相关的LncRNA,并构建肝细胞癌预后模型,其受试者工作特征曲线的曲线下面积表明该模型对肝细胞癌的三年和五年生存率的评估有很好地准确性,可能是肝细胞癌发生发展中的关键基因,为后期临床及动物实验提供研究方向和依据。结论研究确定了肝细胞癌中与生存预后显著相关的5个LncRNA,包括B3GALT5-AS,KC877982.1,MIR7-3JG,PGM5P3-AS1和TBX5-AS1(P<0.01)。其表达特征与患者的存活风险具有较高的关联性,联合检测这5个LncRNA能较准确地预测肝细胞癌患者的三年和五年生存率。 展开更多
关键词 肝细胞癌 长链非编码RNA(LncRNA) 靶基因 生物信息学
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与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测 预览
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作者 薛巨坤 王博 +3 位作者 王莲萍 杨春雨 国会艳 郝爱平 《湖北农业科学》 2019年第14期141-147,共7页
通过生物信息学方法对miR-398-3p基因家族进行序列分析和靶基因预测。结果表明,大部分miR-398-3p基因分布在不同的染色体上,miR-398-3p序列在不同物种间具有高度的保守性。进化分析结果表明,miR-398-3p基因家族的成员呈现为7个分支,个... 通过生物信息学方法对miR-398-3p基因家族进行序列分析和靶基因预测。结果表明,大部分miR-398-3p基因分布在不同的染色体上,miR-398-3p序列在不同物种间具有高度的保守性。进化分析结果表明,miR-398-3p基因家族的成员呈现为7个分支,个别物种miR-398-3p的不同成员具有较远的亲缘关系;miR-398-3p的靶基因具有超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、花粉特异性蛋白质SF3、锌指蛋白WIP2、C2H2型锌指家族蛋白等功能,参与植物的生物和非生物胁迫及生长发育调控过程。 展开更多
关键词 miR-398-3p 生物信息学 靶基因 植物抗逆
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微小RNA-21在哮喘小鼠气道重塑中的作用
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作者 徐雅琴 郁志伟 钱俊 《国际儿科学杂志》 2019年第3期214-218,共5页
目的研究微小RNA-21(microRNA-21,miR-21)在哮喘小鼠气道重塑中的作用。方法雌性BALB/c小鼠16只随机分为正常对照组和哮喘模型组,每组8只。通过卵蛋白致敏和激发建立哮喘小鼠模型,对照组小鼠腹腔注射磷酸盐缓冲液进行致敏和雾化吸入磷... 目的研究微小RNA-21(microRNA-21,miR-21)在哮喘小鼠气道重塑中的作用。方法雌性BALB/c小鼠16只随机分为正常对照组和哮喘模型组,每组8只。通过卵蛋白致敏和激发建立哮喘小鼠模型,对照组小鼠腹腔注射磷酸盐缓冲液进行致敏和雾化吸入磷酸盐缓冲液激发。末次雾化吸入24 h后取小鼠肺组织,Western blot检测各组小鼠肺组织TGF-β受体Ⅱ、Smad7、Ⅰ型胶原(collagen type Ⅰ,COL Ⅰ)蛋白的表达,实时定量PCR检测各组小鼠肺组织miR-21的表达。采用靶基因预测软件(TargetScan)预测miR-21的靶基因,采用293T细胞进行双荧光素酶报告基因实验验证miR-21的靶基因。结果哮喘组小鼠较对照组小鼠肺组织COL Ⅰ蛋白和miR-21表达增多(t=11.94,P<0.05;t=23.05,P<0.05),Smad7、TGF-β受体Ⅱ为miR-21的靶基因。结论miR-21可下调其靶基因Smad7的表达,活化TGFβ/Smad信号传导通路,促进气道重塑,提示miR-21可以作为治疗哮喘气道重塑的作用靶点。 展开更多
关键词 微小RNA-21 靶基因 哮喘 气道重塑 小鼠
miR-214靶向RASSF5基因调节口腔癌细胞CAL27生长活力的实验研究 预览
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作者 尹克 李天客 +2 位作者 张素欣 陈中 包阳 《临床和实验医学杂志》 2019年第7期692-695,共4页
目的研究miR-214靶向Ras相关区域家族5(RASSF5)基因对口腔癌细胞CAL27生长活力的调节作用。方法收集邢台市人民医院手术切除的口腔癌组织和癌旁组织,检测miR-214、RASSF5的表达水平;培养口腔癌细胞CAL27,分为转染阴性对照(NC)模拟物的N... 目的研究miR-214靶向Ras相关区域家族5(RASSF5)基因对口腔癌细胞CAL27生长活力的调节作用。方法收集邢台市人民医院手术切除的口腔癌组织和癌旁组织,检测miR-214、RASSF5的表达水平;培养口腔癌细胞CAL27,分为转染阴性对照(NC)模拟物的NC模拟物组、转染miR-214模拟物的miR-214模拟物组,检测细胞生长活力、细胞周期分布及细胞周期基因的表达水平。结果口腔癌组织中miR-214的表达水平明显高于癌旁组织,RASSF5的mRNA表达水平明显低于癌旁组织(P<0.05),且口腔癌组织中miR-214的表达水平与RASSF5的mRNA表达水平呈负相关(P<0.05);miR-214模拟物组口腔癌细胞CAL27细胞的生长活力值及S期、G2/M期比率均明显高于NC模拟物组,G0/G1期比率明显低于NC模拟物组且细胞中RASSF5、p53、p21的mRNA表达水平明显低于NC模拟物组,CyclinD1、CyclinE的mRNA表达水平明显高于NC模拟物组(P<0.05)。结论miR-214通过靶向抑制RASSF5基因的表达能够增强口腔癌细胞CAL27的生长活力。 展开更多
关键词 口腔癌 miR-214 靶基因 Ras相关区域家族5 生长活力 细胞周期
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hsa-miR-367-3p靶基因预测及功能分析 预览
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作者 张新生 郭琳琳 +4 位作者 刘超群 许何丽 窦文静 刘梦瑶 张越 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期393-397,共5页
目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase 在线数据库、 miRGator v3.0在线数据库TargetScan、 miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有... 目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase 在线数据库、 miRGator v3.0在线数据库TargetScan、 miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高度保守性;在干细胞中表达丰富度较高;功能富集分析发现, hsa-miR-367-3p的靶基因涉及心室发育、转录调节等38个生物过程(P < 0.05),富集在神经元等21个细胞组分( P < 0.05)。结论 hsa-miR-367-3p个别预测出来的靶基因与通路已经被证实,更多的预测结果需要进一步的研究加以验证。本研究为将来验证hsa-miR-367-3p的靶基因和可能调控的通路指明了方向。 展开更多
关键词 hsa-miR-367-3p 靶基因 功能富集分析
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FOXL2基因在卵巢颗粒细胞瘤中的研究现状 预览
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作者 黄梅梅 尹如铁 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2019年第3期349-352,共4页
翼状螺旋/叉头转录因子2(FOXL2),是参与多个靶基因转录调控的重要转录因子。FOXL2基因参与脊椎动物卵巢发育、分化及其功能维持。笔者拟从FOXL2基因结构、蛋白质生物学功能、基因突变等方面,阐述FOXL2基因与卵巢颗粒细胞瘤(GCT)发生、... 翼状螺旋/叉头转录因子2(FOXL2),是参与多个靶基因转录调控的重要转录因子。FOXL2基因参与脊椎动物卵巢发育、分化及其功能维持。笔者拟从FOXL2基因结构、蛋白质生物学功能、基因突变等方面,阐述FOXL2基因与卵巢颗粒细胞瘤(GCT)发生、发展关系的最新研究现状,为卵巢GCT的临床诊治、新型靶向药物研发提供新思路。 展开更多
关键词 颗粒细胞瘤 翼螺旋转录因子类 叉头转录因子类 翼螺旋/叉头转录因子2 卵巢囊肿 DNA错配修复 DNA突变分析 靶基因 女(雌)性
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miR-181a靶向作用CARF基因抑制胰腺癌细胞凋亡 预览
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作者 李军建 陈钢 +1 位作者 朱千东 余正平 《温州医科大学学报》 CAS 2019年第3期167-171,共5页
目的:探讨miR-181a与CARF基因是否存在靶向关系,并研究其在调节胰腺癌细胞增殖凋亡过程中的作用。方法:利用Real-timePCR检测胰腺癌组织细胞中miR-181a的表达水平,通过miR-181a拮抗剂下调胰腺癌细胞中miR-181a浓度,并用MTT检测其细胞增... 目的:探讨miR-181a与CARF基因是否存在靶向关系,并研究其在调节胰腺癌细胞增殖凋亡过程中的作用。方法:利用Real-timePCR检测胰腺癌组织细胞中miR-181a的表达水平,通过miR-181a拮抗剂下调胰腺癌细胞中miR-181a浓度,并用MTT检测其细胞增殖能力变化。建立包含CARF基因3’-UTR序列的PGL-3载体,结合双荧光素酶报告基因系统验证CARF基因是否存在miR-181a的作用靶点,然后通过激动剂及拮抗剂调节胰腺癌细胞中miR-181a浓度,用Westernblot检测相应细胞CARF基因蛋白表达情况。结果:miR-181a在胰腺癌组织/细胞中的表达水平明显高于正常胰腺组织/细胞(P<0.05)。转染miR-181a拮抗剂可显著下调胰腺癌细胞中miR-181a的表达,并使其增殖能力明显下降(P<0.05)。双荧光素酶报告基因系统提示miR-181a与包含CARF基因3’-UTR序列的载体共转染,可明显下调荧光素酶活性,且下调水平与miR-181a剂量呈负相关(P<0.05);CARF蛋白表达情况和胰腺癌细胞中miR-181a水平呈显著负相关(P<0.05)。结论:miR-181a在胰腺癌细胞中存在高表达,通过下调CARF靶基因促进细胞增殖而推动胰腺癌的发展。 展开更多
关键词 miR-181a CARF 胰腺癌 靶基因 生物治疗 微小RNA
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microRNA靶基因鉴定方法研究进展
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作者 姜雪 张栩涵 +2 位作者 隋举证 苏怡仁 梁洋 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第7期40-43,共4页
microRNA( miRNA)是由 21 ~ 23 个核苷酸组成的小单链非编码RNA 分子,通过结合到靶基因上降解靶 mRNA 或抑制其翻译,在转录后水平调控基因表达,是许多生理学和病理学过程的主要参与者。miRNA 靶标通常通过 miRNA 种子序列和靶标 mRNA ... microRNA( miRNA)是由 21 ~ 23 个核苷酸组成的小单链非编码RNA 分子,通过结合到靶基因上降解靶 mRNA 或抑制其翻译,在转录后水平调控基因表达,是许多生理学和病理学过程的主要参与者。miRNA 靶标通常通过 miRNA 种子序列和靶标 mRNA 内的互补位点之间的配对来识别,但并不是所有的结合位点都是起作用的关键位点。因此,miRNA 靶标相互作用的识别和验证对于研究生物过程的调控网络至关重要。文章综述了传统的 miRNA 鉴定方法,及近年来新发现的 miRNA 与其靶基因鉴定方法,并对各种方法的优劣进行了分析,为促进对 miRNA 作用机制的认识,进一步利用miRNA 进行发育、生理、病理等研究提供参考。 展开更多
关键词 MICRORNA ARGONAUTE 蛋白 靶基因 鉴定方法 发展情况
血清miR-375及血液中靶基因在过敏性鼻炎患者治疗前后的表达变化及意义 预览
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作者 许戈 谢枪 周红宇 《中南大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期767-774,共8页
目的:探讨血清miR-375及其靶基因在过敏性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者治疗前后的表达变化及其意义。方法:选取在武汉市第四医院接受治疗的120例AR患者作为观察组(AR组),同时选取120名健康志愿者作为对照组。通过real-time PCR检测mi... 目的:探讨血清miR-375及其靶基因在过敏性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者治疗前后的表达变化及其意义。方法:选取在武汉市第四医院接受治疗的120例AR患者作为观察组(AR组),同时选取120名健康志愿者作为对照组。通过real-time PCR检测miR-375及其靶基因3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1(3-phosphoinositide-dependent proteinkinase-1,PDK1)、蛋白激酶B(protein kinase B,AKT1)、Janus激酶2(Janus kinase 2,JAK2)和信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3),以及肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白介素-6(IL-6)、白介素-10(IL-10)和白介素-13(IL-13)等炎症因子在AR患者治疗前后的表达变化。并根据miR-375和靶基因的相对表达量将AR患者划分为高表达组和低表达组进行对比分析。结果:治疗前AR组血清miR-375的表达量高于对照组(P<0.01);血液中PDK1,AKT1,JAK2和STAT3的表达量均低于对照组(均P<0.01);TNF-α,IL-6,IL-10和IL-13的表达量均高于对照组(均P<0.05)。与对照组相比,治疗后AR组血清miR-375的表达下调(P<0.01);血液中靶基因PDK1,AKT1,JAK2和STAT3的表达均上调(均P<0.05);炎症因子TNF-α,IL-6,IL-10和IL-13的表达均下调(均P<0.05)。并且,治疗前血清miR-375高表达组和靶基因低表达组患者治疗的总有效率、鼻炎症状评分标准、症状改善时间和不良反应发生率等均优于对应的miR-375低表达组和靶基因高表达组患者(均P<0.05)。结论:MiR-375可能通过与PDK1,AKT1,JAK2和STAT3等靶基因的负调控作用而抑制TNF-α,IL-6,IL-10和IL-13等炎症因子的表达。 展开更多
关键词 miR-375 过敏性鼻炎 靶基因 炎症因子 血液
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