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伴N-RAS及CBL突变的幼年型粒单核细胞白血病快速急变后单倍体移植1例报告并文献复习 预览
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作者 廖婵 赵芬英 +4 位作者 宋华 王迪 沈笛颖 梁娟 汤永民 《中国小儿血液与肿瘤杂志》 CAS 2019年第1期32-37,共6页
目的 减少对幼年型粒单核细胞白血病(JMML)的误诊,探讨单倍体造血干细胞移植治疗急变后未获得完全缓解JMML的可行性,并分析JMML快速急变的原因。方法 3岁患儿历经误诊为免疫性血小板减少症(ITP)和传染性单核细胞增多症后确诊为JMML,伴有... 目的 减少对幼年型粒单核细胞白血病(JMML)的误诊,探讨单倍体造血干细胞移植治疗急变后未获得完全缓解JMML的可行性,并分析JMML快速急变的原因。方法 3岁患儿历经误诊为免疫性血小板减少症(ITP)和传染性单核细胞增多症后确诊为JMML,伴有N-RAS及CBL基因突变,但快速急变为急性髓细胞性白血病AML-M4型,伴有EVI1阳性表达。患儿接受母亲单倍体(HLA 7/10相合)造血干细胞移植,预处理方案为阿糖胞苷+白舒非+猪抗人T细胞免疫球蛋白+环磷酰胺,移植后采用环孢素A+霉酚酸酯(MMF)+短程甲氨蝶呤+甲基强的松龙方案预防移植物抗宿主病(GVHD)。结果 移植后+14d白细胞植活,+18d血小板植活,未发生重度GVHD。移植后2个月减停全部免疫抑制剂,随访至2018年8月1日,患儿无病存活。结论 JMML急变后未获得完全缓解行单倍体造血干细胞移植治疗是可行的,同时存在N-RAS及CBL基因突变且有EVI1阳性可能是患儿快速急变的原因。 展开更多
关键词 幼年型粒单核细胞白血病 单倍体移植 N-RAS基因 CBL基因 EVI 1基因
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我国猪流行性腹泻病毒分子遗传变异研究浅析 预览
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作者 张智刚 魏启超 范学伟 《中国猪业》 2019年第5期55-57,共3页
猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒引起猪的一种急性、 高度传播的肠道疾病.近年来PEDV基因变异毒株不断出现,造成了猪流行性腹泻防疫失败现象不断增多,导致其流行趋势增强.阐述了近年来国内有关PEDV的S1、M和ORF3基因的研究进展,从分... 猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒引起猪的一种急性、 高度传播的肠道疾病.近年来PEDV基因变异毒株不断出现,造成了猪流行性腹泻防疫失败现象不断增多,导致其流行趋势增强.阐述了近年来国内有关PEDV的S1、M和ORF3基因的研究进展,从分子生物学角度对PEDV进行遗传进化分析总结,为该病的防控以及流行病学研究提供参考. 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 PEDV S1基因 M基因 ORF3基因
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交泰丸对睡眠剥夺小鼠视交叉上核生物钟基因Clock及Bmal 1表达的影响
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作者 肖迪 刘俊 郑桃云 《湖北中医药大学学报》 2019年第4期25-29,共5页
目的观察交泰丸对睡眠剥夺小鼠视交叉上核(SCN)中生物钟基因Clock和Bmal 1表达的影响,探讨交泰丸改善睡眠的可能机制。方法将小鼠随机分为空白组、模型组、百乐眠组和交泰丸组。除空白组外,其他各组腹腔注射氯苯丙氨酸(PCPA)以制备睡眠... 目的观察交泰丸对睡眠剥夺小鼠视交叉上核(SCN)中生物钟基因Clock和Bmal 1表达的影响,探讨交泰丸改善睡眠的可能机制。方法将小鼠随机分为空白组、模型组、百乐眠组和交泰丸组。除空白组外,其他各组腹腔注射氯苯丙氨酸(PCPA)以制备睡眠剥夺模型。用自主活动测试仪记录小鼠自主活动时间,ELISA检测血清中5-HT、Glu、DA、GABA的表达水平,Real time-PCR和免疫组化检测SCN中Clock和Bmal 1的表达。结果与空白组比较,模型组小鼠活动时间显著增加(<0.01);与模型组比较,百乐眠组和交泰丸组小鼠活动时间有不同程度减少(<0.05)。与空白组比较,模型组小鼠血清中GABA、5-HT含量降低(<0.01),Glu含量升高(<0.01);与模型组比较,百乐眠组和交泰丸组小鼠血清中GABA、5-HT含量升高(<0.01,<0.05),Glu含量降低(<0.05);各组小鼠血清中DA含量变化不明显,差异没有统计学意义(>0.05)。与空白组比较,模型组小鼠SCN中Clock、Bmal1的基因和蛋白表达水平升高(<0.01);与模型组比较,百乐眠组和交泰丸组小鼠SCN中Clock、Bmal1的基因和蛋白表达下降(<0.01,<0.05)。结论交泰丸具有改善睡眠的作用,其机制可能与交泰丸调节小鼠SCN中Clock和Bmal 1的表达有关。 展开更多
关键词 睡眠剥夺 交泰丸 视交叉上核 CLOCK基因 Bmal 1基因
Beclin 1在乳腺浸润性导管癌中的表达及其与Ki67的关系 预览
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作者 宦宇 蔡徐山 +4 位作者 焦家军 吴军录 权文强 张春利 席芳 《检验医学》 CAS 2019年第7期595-599,共5页
目的探讨自噬相关基因Beclin 1和增殖相关基因Ki67编码的蛋白在乳腺浸润性导管癌中的表达情况。方法选取乳腺浸润性导管癌患者64例。采用免疫组化法检测癌组织及对应的癌旁组织中Beclin 1和Ki67蛋白的表达,同时采用免疫荧光法和免疫印... 目的探讨自噬相关基因Beclin 1和增殖相关基因Ki67编码的蛋白在乳腺浸润性导管癌中的表达情况。方法选取乳腺浸润性导管癌患者64例。采用免疫组化法检测癌组织及对应的癌旁组织中Beclin 1和Ki67蛋白的表达,同时采用免疫荧光法和免疫印迹法检测癌组织及对应癌旁组织中Beclin 1蛋白的表达。结果癌组织中Beclin 1的阳性表达率(43.8%)明显低于癌旁组织(98.5%)(P<0.05),而Ki67的阳性表达率(76.6%)则高于癌旁组织(0.00%)(P<0.05)。癌组织中Beclin 1蛋白表达与Ki67蛋白表达呈负相关(r=-0.256,P<0.05)。Beclin 1蛋白表达与乳腺浸润性导管癌病理分级、有无淋巴结转移有关(P<0.05),与肿瘤直径、年龄、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人类表皮生长因子受体2(HER-2)均无关(P>0.05)。Ki67蛋白表达与乳腺浸润性导管癌病理分级、肿瘤直径有关(P<0.05),与有无淋巴结转移、年龄、ER、PR、HER-2均无关(P>0.05)。免疫荧光法检测结果显示癌组织中Beclin 1蛋白的阳性表达率(30.0%)明显低于癌旁组织(100.0%)(P<0.05)。免疫印迹法检测结果显示癌旁组织中Beclin l蛋白的相对表达量为0.43±0.12,明显高于癌组织(0.20±0.18)(P<0.05)。结论乳腺浸润性导管癌组织中Beclin 1蛋白表达明显降低,Ki67蛋白表达明显升高。 展开更多
关键词 BECLIN 1基因 KI67基因 细胞自噬 细胞增殖 乳腺浸润性导管癌
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棉属D基因组3个野生棉种Bet v 1基因鉴定及功能分析 预览
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作者 董琪 Magwanga Richard Odongo +10 位作者 路普 蔡小彦 周忠丽 王省芬 王星星 许艳超 侯宇清 王艳情 王坤波 刘方 马峙英 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期361-380,共20页
【目的】对棉花D基因组中Bet v 1基因家族进行分析,比较其在不同抗性棉种间的表达模式差异,为深入研究Bet v 1基因在棉花抗黄萎病中的作用提供理论依据。【方法】通过生物信息学方法对D基因组中Bet v 1基因进行鉴定。通过雷蒙德氏棉(Gos... 【目的】对棉花D基因组中Bet v 1基因家族进行分析,比较其在不同抗性棉种间的表达模式差异,为深入研究Bet v 1基因在棉花抗黄萎病中的作用提供理论依据。【方法】通过生物信息学方法对D基因组中Bet v 1基因进行鉴定。通过雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii,D5)、三裂棉(G.trilobum,D8)和瑟伯氏棉(G.thurberi,D1)转录组和实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析Bet v 1基因在黄萎病菌处理下的表达模式。利用病毒诱导的基因沉默技术(VIGS)对Bet v 1基因进行功能鉴定。【结果】[棉花D基因组中包含59个成员,其中57个基因带有内含子,分布于8条染色体上,多数为亲水性蛋白并定位于细胞质。]黄萎病菌胁迫条件下3个野生棉种的Bet v 1基因表达量与其抗病水平一致。将不同表达水平的基因分为3组,其中第3组基因响应黄萎病菌侵染并在抗病棉种瑟伯氏棉中高表达,表明该组基因可能与黄萎病胁迫应答反应有关。从中筛选出高水平表达的Bet v 1基因,在陆地棉中沉默相应的同源基因,棉株感病加重,揭示该基因在棉花抵御黄萎病菌侵染过程中起正调控作用。【结论】响应黄萎病菌胁迫的Bet v 1基因在棉花抗黄萎病复杂的生物过程中至关重要。本研究结果为棉花Bet v 1家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析棉花Bet v 1基因的功能奠定基础。 展开更多
关键词 野生棉 黄萎病 Bet v 1基因 转录组 实时荧光定量聚合酶链式反应 病毒诱导的基因沉默
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3株传染性支气管炎病毒蛋鸡源河南株的S1基因序列分析 预览
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作者 吴倩倩 许鑫 +4 位作者 陈钦玺 阚云超 姚伦广 王新卫 冀君 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期123-130,共8页
为了解河南省致蛋鸡产蛋量下降的传染性支气管炎病毒(IBV)的流行特征,从河南南阳、信阳和安阳等市的发病鸡场中鉴定出3株IBV,分别命名为CK/CH/HN/NY1206/2017、CK/CH/HN/XY911/2017和CK/CH/HN/AY119/2018,并应用RT-PCR技术对3个IBV分离... 为了解河南省致蛋鸡产蛋量下降的传染性支气管炎病毒(IBV)的流行特征,从河南南阳、信阳和安阳等市的发病鸡场中鉴定出3株IBV,分别命名为CK/CH/HN/NY1206/2017、CK/CH/HN/XY911/2017和CK/CH/HN/AY119/2018,并应用RT-PCR技术对3个IBV分离株的S1基因进行扩增与序列分析。结果显示,3个IBV分离株S1基因全长都为1617nt,编码539aa,并且都属于基因型4/91(CHⅡ);CK/CH/HN/NY1206/2017株S1基因裂解位点为RRSRR,CK/CH/HN/XY911/2017株S1基因裂解位点为RRSRR,CK/CH/HN/AY119/2018株S1基因裂解位点为RRFRR;3个分离株间核苷酸序列及其推导的氨基酸序列具有较高同源性,与位于同一基因型的参考毒株间同源性较高,与我国使用的Mass型常规疫苗H120和H52株的核苷酸和氨基酸同源性最低,分别仅为78.3%~78.4%和74.8%~75.4%,与4/91(CHⅡ)型疫苗4/91株的核苷酸和氨基酸同源性较高,分别达到94.7%~99.3%和93.9%~98.1%。综上,河南省致蛋鸡产蛋量下降的IBV流行株基因型相对统一,使用4/91(CHⅡ)型疫苗应可提高蛋鸡抗IBV的效率。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因 序列分析 基因 河南省
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2016~2017年广西鸡传染性支气管炎病毒S1基因进化分析
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作者 陈彤 刘金 +5 位作者 封柯宇 王占新 鲁俊鹏 覃健萍 蔺文成 谢青梅 《中国家禽》 北大核心 2019年第12期22-25,共4页
为了解2016~2017年广西鸡传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因的流行变异情况,研究对广西分离的22株IBV的S1基因进行遗传进化分析。结果表明:除1株变异株外,其他分离毒株分为8个基因型,QX型和TW型为主流基因型,其中QX型分离毒株占36.3%,TW型... 为了解2016~2017年广西鸡传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因的流行变异情况,研究对广西分离的22株IBV的S1基因进行遗传进化分析。结果表明:除1株变异株外,其他分离毒株分为8个基因型,QX型和TW型为主流基因型,其中QX型分离毒株占36.3%,TW型分离株全部为TWⅠ型分离株,占22.7%。22株IBV毒株间核苷酸序列和氨基酸序列一致性分别为62.7%~99.7%和57.1%~99.5%,HRRTR与LRFRR为新发现的S蛋白裂解位点。CK/CH/GX/LC17-1为假定亲本Ark型ArkDPI毒株与Mass型Ma5毒株S1基因的重组毒株。通过对广西BV分离株与参考株的遗传进化分析,发现了主流基因型且22个分离株S1基因较大程度的变异以及疫苗株间S1基因重组,为筛选各地区对型疫苗和新疫苗的研发提供方向。 展开更多
关键词 IBV S1基因 进化分析 基因 重组
IN1基因表达与儿童肝母细胞瘤临床特点及预后的相关性研究
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作者 张谊 黄东生 +8 位作者 张伟令 王一卓 易优 韩思雨 张晶伟 高亚楠 孟雪 高淇然 刘婷婷 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2019年第15期1156-1159,共4页
目的研究IN1基因表达水平与儿童肝母细胞瘤(HB)临床特点及疗效的相关性,阐明IN1基因对治疗及预后的预警价值。方法筛选2015年1月至2018年5月首都医科大学附属北京同仁医院确诊的初诊初治HB 40例。采用荧光免疫PCR法检测IN1基因mRNA表达... 目的研究IN1基因表达水平与儿童肝母细胞瘤(HB)临床特点及疗效的相关性,阐明IN1基因对治疗及预后的预警价值。方法筛选2015年1月至2018年5月首都医科大学附属北京同仁医院确诊的初诊初治HB 40例。采用荧光免疫PCR法检测IN1基因mRNA表达水平。收集HB患儿的临床资料,包括分期、分组、危险度、化疗疗效及预后。应用SPSS 21.0软件分析IN1基因mRNA表达水平与临床疗效、分期、预后的相关性。结果1.临床特点:40例患儿中位年龄(30.50±2.39)个月;男29例(72.5%),女11例(27.5%)。临床分期及分组:Ⅱ期1例(2.5%),Ⅲ期13(32.5%),Ⅳ期26例(65.0%);中低危组12例(30.0%),高危组28例(70.0%)。2.临床疗效及预后:随访至2017年7月1日,随访时间(12.2±10.1)个月,未行根治手术患儿4例(10%),手术治疗36例(90%);所有患儿均行化疗(100%),平均化疗(13.17±0.02)个周期。30例患儿存活,10例患儿死亡,总生存率(OS)75%;无事件生存20例(50%)。3.IN1基因mRNA表达:40例HB患儿IN1基因mRNA平均相对表达定量(2^-ΔCT):0.31±0.70。高危及中高危HB患儿的平均表达定量(2^-ΔCT):0.23±0.43、0.48±1.13(t=6.363,P=0.05);病理未分化小细胞型(12例)与其他病理分型(25例)的平均相对表达定量分别为:0.09±0.11、0.43±0.86(t=4.533,P=0.04)。未根治手术(n=4)及行根治性手术(n=36)患儿平均相对表达定量(2^-ΔCT)分别为0.04±0.03及0.34±0.74,二者比较差异有统计学意义(t=2.935,P=0.022);化疗敏感性差(19例)及化疗敏感患儿(21例)相对表达量(2^-ΔCT)分别为0.03±0.04及0.30±0.82,二者比较差异有统计学意义(t=5.688,P=0.018)。结论IN1基因mRNA呈低表达患儿化疗疗效欠佳。IN1基因低表达在提示临床疗效及预后方面具有积极的预警作用。 展开更多
关键词 肝母细胞瘤 IN1基因 mRNA定量 化疗 预后
Wnt/β-catenin信号通路及WNK 1基因在盆腔脏器脱垂发病机制中的作用
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作者 王莹莹 王君敏 +5 位作者 陈璐璐 徐锋 王肖帆 乔艳华 张志磊 赵冰 《中国计划生育和妇产科》 2019年第5期56-61,I0001共7页
目的研究盆腔脏器脱垂(pelvic organ prolapse,POP)患者中Wnt经典信号通路(Wnt/β-catenin通路)、WNK 1基因的表达变化及两者相关性,初步探讨POP发生发展的可能分子机制。方法选择2017年1月至2018年5月在郑州大学第三附属医院因POP行阴... 目的研究盆腔脏器脱垂(pelvic organ prolapse,POP)患者中Wnt经典信号通路(Wnt/β-catenin通路)、WNK 1基因的表达变化及两者相关性,初步探讨POP发生发展的可能分子机制。方法选择2017年1月至2018年5月在郑州大学第三附属医院因POP行阴式子宫切除术患者27例(POP组),及同期因妇科良性疾病行腹式或阴式子宫切除术患者21例(对照组)为研究对象。术中取子宫两侧主韧带组织,HE染色观察平滑肌束及成纤维细胞,Masson染色观察胶原纤维;WB及PCR检测通路相关蛋白(Wnt16、β-catenin、FZD 5)、WNK 1及Ⅰ型胶原蛋白(COL 1)的表达,并分析其与POP病理特征的关系,同时分析WNK 1基因与Wnt信号通路的相关性。结果①HE染色显示POP组平滑肌束萎缩断裂,成纤维细胞排列紊乱;②Masson染色可见胶原纤维明显受损、含量减少;③Western-blot及Real-TimePCR显示POP组Wnt 16、β-catenin、WNK 1、COL 1等mRNA及蛋白水平均明显下降,FZD 5 mRNA水平表达上升,蛋白水平表达无差异;WNK 1基因与Wnt通路表达趋势呈正相关;随着绝经时间延长及脱垂级别增加,β-catenin、WNK 1及COL 1表达下降。结论POP的发生发展可能与WNK 1激酶水平及Wnt经典信号通路表达下降有关,β-catenin、WNK 1及COL 1的表达与绝经时间、脱垂程度有关。 展开更多
关键词 盆腔脏器脱垂:WNK 1基因 Wnt经典信号通路 分子机制
非小细胞肺癌淋巴结Beclin 1表达与淋巴结转移的关系
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作者 熊健 吴蕾 +1 位作者 皮御阳 许咏冬 《中国胸心血管外科临床杂志》 CAS CSCD 2019年第10期984-987,共4页
目的探索非小细胞肺癌患者肿瘤组织及周围正常组织Beclin 1水平与淋巴结转移的关系。方法收集我院2011年9月至2016年9月共204例非小细胞肺癌手术患者手术标本,其中男116例、女88例,平均年龄(55.3±11.2)岁。根据肺癌淋巴结转移与否... 目的探索非小细胞肺癌患者肿瘤组织及周围正常组织Beclin 1水平与淋巴结转移的关系。方法收集我院2011年9月至2016年9月共204例非小细胞肺癌手术患者手术标本,其中男116例、女88例,平均年龄(55.3±11.2)岁。根据肺癌淋巴结转移与否将患者分为无淋巴结转移组(N0组),有肺叶间和叶内淋巴结转移,无纵隔淋巴结转移组(N1组),纵隔淋巴结转移组(N2组)。采用Western blotting法检测标本Beclin 1水平,统计分析患者肿瘤组织及淋巴结标本Beclin 1水平差异。结果 204例肺癌患者中,鳞癌36例、腺癌168例。N0组、N1组、N2组三组患者肿瘤组织中Beclin 1水平逐渐降低,差异有统计学意义(P<0.05)。三组患者肺门及肺内淋巴结Beclin 1(N1 Beclin 1)水平对比,N1组和N2组较N0组明显偏低,差异有统计学意义(P<0.01)。三组患者纵隔淋巴结Beclin 1(N2 beclin 1)水平对比,N2组较N0组及N1组明显偏低,差异有统计学意义(P<0.01)。N1组N1Beclin 1水平低于N2组,差异有统计学意义(P<0.01)。N2组N1 Beclin 1水平略低于N2,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论 Beclin 1水平可成为判断肺部肿瘤良恶性的一个参考指标,淋巴结Beclin 1水平可作为协助判断肺癌是否存在淋巴结转移的一个重要参考指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 BECLIN 1基因 淋巴结转移
沈阳地区1株猪流行性腹泻病毒S1基因序列测定与分析 预览
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作者 王宏燕 《现代畜牧兽医》 2019年第4期6-11,共6页
利用PEDV的S1基因的特异性引物,克隆了沈阳地区1株PEDV流行毒株(LNSY-2017)的S1基因,并通过S1基因序列比对,分析了此病毒株与其他相关毒株的亲缘关系。结果显示:LNSY-2017株S1基因(2 372 bp)与我国疫苗株CV777(2 364 bp)相比,存在16个... 利用PEDV的S1基因的特异性引物,克隆了沈阳地区1株PEDV流行毒株(LNSY-2017)的S1基因,并通过S1基因序列比对,分析了此病毒株与其他相关毒株的亲缘关系。结果显示:LNSY-2017株S1基因(2 372 bp)与我国疫苗株CV777(2 364 bp)相比,存在16个核苷酸的插入和8个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在6个氨基酸的插入(56G、59QGVN62和69G)和6个氨基酸的缺失(73N、157FA158、380YL381和521G),且在2个主要中和抗体表位(aa499~637和aa763~770)有11处氨基酸的突变。遗传进化分析结果显示,LNSY-2017与主要的疫苗株同源性较低(91.4%~92.5%),而与2012年韩国毒株、美国2013年毒株以及中国近年来流行毒株同源性最高(97.0%~98.7%),属于基因G2b型。结果表明,沈阳地区的PEDV流行株已经发生很大变异,因此很有必要加强对PEDV变异的监测。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S1基因 序列分析 遗传进化分析
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鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及其致病性的研究
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作者 刘帆 任广彩 +3 位作者 闫圆圆 王楠楠 陈展鸿 陈瑞爱 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期861-870,共10页
本研究从江苏省某鸡场疑似鸡传染性支气管炎(IB)的病料中,利用SPF鸡胚尿囊腔接种的方法分离出1株传染性支气管炎病毒(IBV),命名为CK/CH/JS/TZHY48。经RT-PCR检测,该株IBV的S1基因全长1638bp。遗传进化分析显示,分离株属于基因Ⅵ型,与常... 本研究从江苏省某鸡场疑似鸡传染性支气管炎(IB)的病料中,利用SPF鸡胚尿囊腔接种的方法分离出1株传染性支气管炎病毒(IBV),命名为CK/CH/JS/TZHY48。经RT-PCR检测,该株IBV的S1基因全长1638bp。遗传进化分析显示,分离株属于基因Ⅵ型,与常规疫苗株H120和H52的同源性较远。分离株对鸡胚有明显的致矮小化作用;对新城疫病毒有显著的干扰作用。动物回归试验结果显示,该分离株对7日龄SPF鸡的发病率为100%,致死率为40%,发病鸡出现气管啰音,甩头流鼻涕等呼吸道症状;病死鸡的剖检病理变化主要表现为肾苍白肿大,花斑肾,有大量明显的白色尿酸盐沉积,气管环出血。本研究可为IBV的遗传进化、致病机制以及免疫防控提供参考。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 分离鉴定 S1基因 致病性
S1基因结构解析与分子进化分析
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作者 马生健 刘耀光 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期458-465,共8页
S1是水稻(Oryza sativa L.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要的基因座,对杂种的雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座的候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’的S1等位基因序列全长7 kb,局倍区域有高GC分布。为... S1是水稻(Oryza sativa L.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要的基因座,对杂种的雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座的候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’的S1等位基因序列全长7 kb,局倍区域有高GC分布。为此本研究通过分多段运用有针对性的PCR方法,对所用的材料IRAT216与IRAT216S1进行了扩增并测序,获得了各自的S1全长序列,并进行了比对,发现IRAT216与‘日本晴’的序列完全相同,但IRAT216与IRAT216S1之间存在多处变异。同时针对有效变异区对S1基因进行了分子进化调查,建立了水稻的分子进化树,确定了S1在物种进化中的意义。本研究的S1基因序列测定,将为水稻分子标记辅助育种中分子标记的开发提供序列参照,同时也将为S1基因RNA的表达分析与蛋白功能研究、在各物种中的分化变异和水稻在进化中地位划分提供理论依据,并能为水稻的起源研究提供参考。 展开更多
关键词 栽培稻 杂种不育 分子进化 S1基因
皱皮香猪WIF1基因结构变异WIF1-I8-sv889的研究 预览
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作者 刘晓丽 冉雪琴 +3 位作者 刘畅 牛熙 黄世会 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第8期2423-2430,共8页
为探究WIF1(Wnt inhibitory factor 1)基因中WIF1-I8-sv889结构变异位点变异与皱皮香猪躯干被毛形成的关系,本试验采用冰冻组织切片观察皱皮香猪皮肤毛囊的组织学形态,采用PCR方法分析WIF1-I8-sv889位点在猪群中的分布频率,并通过在线软... 为探究WIF1(Wnt inhibitory factor 1)基因中WIF1-I8-sv889结构变异位点变异与皱皮香猪躯干被毛形成的关系,本试验采用冰冻组织切片观察皱皮香猪皮肤毛囊的组织学形态,采用PCR方法分析WIF1-I8-sv889位点在猪群中的分布频率,并通过在线软件UCSC、RegRNA 2.0对结构变异序列所含的功能元件进行分析。组织学研究显示,与正常香猪和大白猪皮肤相比,皱皮香猪毛囊毛根鞘伸入真皮层,形成棘突,且皱褶凹陷处毛囊聚集,相反皱褶凸起处毛囊较少;皱皮香猪皮肤毛囊中的毛球宽度显著增大(P<0.05),单个毛囊中的毛干数极显著增多(P<0.01)。在WIF1-I8-sv889结构变异断点两端设计特异性引物,扩增片段长1 383 bp,与参考基因组比,1383 bp中889 bp为结构变异区间,缺失581 bp,倒置308 bp。群体分布结果显示,猪群中WIF1-I8-sv889位点呈现出丰富的多态性,检测到3种基因型:正常的II型、杂合的DI型和缺失的DD型,皱皮香猪中未检测到II型;与正常香猪和大白猪相比,皱皮香猪中D等位基因占优势(94.44%);经卡方检验,皱皮香猪D等位基因显著或极显著高于正常香猪和大白猪(P<0.05;P<0.01)。结果提示,WIF1基因中的WIF1-I8-sv889结构变异可能与皱皮香猪毛囊的形态发生有关。 展开更多
关键词 皱皮香猪 毛囊 结构变异 WIF 1基因
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延边黄牛SCD 1基因多态性及其与经济性状的关联分析 预览
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作者 朴政玉 夏广军 +1 位作者 严昌国 冯健 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期2642-2650,共9页
本研究旨在探索延边黄牛硬脂酰辅酶A去饱和酶1(stearoy-CoA desaturase 1,SCD1)基因多态性及其与经济性状的相关性。以157头36月龄健康无病、体重相近的延边黄牛为研究对象,颈静脉采血提取基因组DNA,根据GenBank中牛SCD 1基因序列(登录... 本研究旨在探索延边黄牛硬脂酰辅酶A去饱和酶1(stearoy-CoA desaturase 1,SCD1)基因多态性及其与经济性状的相关性。以157头36月龄健康无病、体重相近的延边黄牛为研究对象,颈静脉采血提取基因组DNA,根据GenBank中牛SCD 1基因序列(登录号:AC_000181.1),利用Oligo 6.0软件设计特异性引物,应用PCR扩增SCD 1全长基因后直接测序,分析其多态位点,并应用生物信息学软件分析其蛋白结构;屠宰前测定活体重、胴体重、屠宰率、背膘厚等胴体性状,屠宰后采集背最长肌,测定眼肌面积、蒸煮损失、滴水损失、嫩度、系水力、pH、脂肪酸含量等肉质性状,并通过一般线性模型分析方法对延边黄牛SCD 1基因SNPs与肉质性状的相关性进行了分析。结果发现,延边黄牛SCD 1基因846 bp处存在A→G突变(g846 A→G)、1 022 bp处存在C→T突变(g1022 C→T),其中g1022 C→T突变导致丙氨酸(A)突变为缬氨酸(V),但未引起三级结构改变。关联分析结果表明,g846 A→G多态位点与延边黄牛宰前活重、胴体重、滴水损失及硬脂酸、亚油酸含量存在显著相关(P<0.05);g1022 C→T多态位点与延边黄牛宰前活重、胴体重及硬脂酸含量存在显著相关(P<0.05),说明上述2个位点与延边黄牛相关肉质性状存在显著相关,该突变位点可作为潜在的分子标记。 展开更多
关键词 延边黄牛 SCD 1基因 单核苷酸多态性(SNP) 胴体性状 肉质性状
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地高辛标记Nkx2.1基因RNA探针的制备及应用
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作者 张凯丽 孙雨晴 +5 位作者 王宇飞 赵虹 郝宇卉 杨丽红 白云 刘志贞 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第8期870-873,879共5页
目的制备地高辛(digoxigenin,DIG)标记的Nkx2. 1基因RNA探针,用于小鼠胚胎早期神经管发育关键时期Nkx2. 1基因表达的检测。方法巢式PCR法扩增Nkx2. 1基因,将其克隆至pGEM-T载体;以其为模板,通过Nkx2. 1特异性引物,PCR扩增RNA探针转录模... 目的制备地高辛(digoxigenin,DIG)标记的Nkx2. 1基因RNA探针,用于小鼠胚胎早期神经管发育关键时期Nkx2. 1基因表达的检测。方法巢式PCR法扩增Nkx2. 1基因,将其克隆至pGEM-T载体;以其为模板,通过Nkx2. 1特异性引物,PCR扩增RNA探针转录模板;采用T7 RNA聚合酶,制备DIG标记的正义、反义Nkx2. 1 RNA原位杂交探针。经全胚胎原位杂交(whole-mount in situ hybridization,WM-ISH)技术分析胚胎8. 5、9. 5、10. 5 d小鼠体内Nkx2. 1基因的表达情况。结果制备的探针浓度为1 521. 986 ng/mL,纯度A260/280=2. 39。Nkx2. 1基因反义探针能高效检测到Nkx2. 1基因在胚胎8. 5、9. 5及10. 5 d小鼠神经系统中表达,正义探针未能检测到表达信号。结论成功制备了特异高效的DIG标记的Nkx2. 1基因RNA原位杂交探针,为进一步研究Nkx2. 1基因在小鼠胚胎组织中的表达,探索其在神经管发育中的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 Nkx2. 1基因 RNA探针 全胚胎原位杂交
抚顺地区鸡传染性支气管炎病毒的分离及S1基因序列分析
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作者 郭文洁 康宏玲 +1 位作者 高锋 刘耀川 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第2期101-103,共3页
为了了解抚顺地区鸡传染性支气管炎病毒的流行情况,试验对该地区规模化养鸡场内的62只疑似发病病鸡进行了样品采集,经SPF鸡胚传代后提取基因组RNA,PCR扩增病毒S1基因并进行序列测定及遗传进化分析。结果表明:从62份疑似病料中共筛查到... 为了了解抚顺地区鸡传染性支气管炎病毒的流行情况,试验对该地区规模化养鸡场内的62只疑似发病病鸡进行了样品采集,经SPF鸡胚传代后提取基因组RNA,PCR扩增病毒S1基因并进行序列测定及遗传进化分析。结果表明:从62份疑似病料中共筛查到鸡传染性支气管炎病毒28株。其中27株分离株属于同一大的进化分支,且该地区分离株与疫苗株H120分布于不同的进化分支。说明该地区鸡传染性支气管炎病毒流行概率较高,且H120株疫苗对其保护效果差. 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 分离鉴定 S1基因 遗传进化 H120株疫苗
SRCIN1基因表达对肺癌细胞生长及替莫唑胺化疗敏感性的影响 预览
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作者 马琴 杨磊 刘喜婷 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2019年第3期650-653,共4页
目的探讨SRC激酶信号抑制剂(SRCIN) 1基因过表达对肺癌细胞活力、侵袭能力、凋亡率及替莫唑胺化疗敏感性的影响。方法人肺癌A549细胞分为4个处理组(空白对照组、pc DNA3. 1-SRCIN1组、替莫唑胺组和pc DNA3. 1-SR-CIN1+替莫唑胺组),其中... 目的探讨SRC激酶信号抑制剂(SRCIN) 1基因过表达对肺癌细胞活力、侵袭能力、凋亡率及替莫唑胺化疗敏感性的影响。方法人肺癌A549细胞分为4个处理组(空白对照组、pc DNA3. 1-SRCIN1组、替莫唑胺组和pc DNA3. 1-SR-CIN1+替莫唑胺组),其中噻唑蓝(MTT)法、Transwell小室和流式细胞术分别检测细胞活力、侵袭能力及凋亡率。Western印迹法检测SRCIN1、增殖细胞核抗原(PCNA)、基质金属蛋白酶(MMP)-2、B细胞淋巴瘤(Bcl-2)相关X蛋白(Bax)和β-catenin的蛋白表达。结果 pc DNA3. 1-SRCIN1组和替莫唑胺组均可抑制A549细胞活力、侵袭能力及PCNA、MMP-2和β-catenin的蛋白表达,诱导细胞凋亡及上调Bax表达,与空白对照组比较差异均有统计学意义(P<0. 05),pc DNA3. 1-SRCIN1+替莫唑胺组对细胞活力、侵袭能力及PCNA、MMP-2和β-catenin的表达抑制、细胞凋亡、Bax表达诱导作用更明显,且与pc DNA3. 1-SRCIN1组和替莫唑胺组比较差异均有统计学意义(P<0. 05)。结论 SRCIN1基因过表达可抑制肺癌细胞活力和侵袭能力,诱导细胞凋亡,增加替莫唑胺化疗敏感性,机制可能与Wnt信号下调有关。 展开更多
关键词 肺癌 SRC激酶信号抑制剂(SRCIN) 1基因 替莫唑胺 化疗敏感性 凋亡 侵袭
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Kisspeptin 1基因单核苷酸多态性与生长激素缺乏性侏儒症的相关性研究 预览
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作者 姜书琴 王伟 +1 位作者 陆文全 罗向阳 《实用医药杂志》 2018年第10期925-927,930共4页
目的分析河南地区生长激素缺乏性侏儒症(GHDD)患者及正常人群中Kisspeptin 1(Kiss-1)基因的单核苷酸多态性,以明确二者之间的相关性。方法随机选取初步确诊的GHDD患者60例作为GHDD组,同期、同年龄、同性别身高正常的健康儿童60例作为对... 目的分析河南地区生长激素缺乏性侏儒症(GHDD)患者及正常人群中Kisspeptin 1(Kiss-1)基因的单核苷酸多态性,以明确二者之间的相关性。方法随机选取初步确诊的GHDD患者60例作为GHDD组,同期、同年龄、同性别身高正常的健康儿童60例作为对照组。提取全血DNA,采用聚合酶链反应序列特异性引物方法(PCRSSP)对所有研究对象的Kisspeptin-1基因单核苷酸多态性位点(SNP)进行基因检测,分析并比较C.-89及c.-145SNP位点的基因型构成比及等位基因频率。结果对照组和GHDD组患者中均未检测到Kisspeptin-1基因单核苷酸多态性改变;GHDD组患者c.-145(rs5780218)位点和C.-89(rs3924587)位点基因型构成比及等位基因频率与对照组相比差异均无统计学意义(P>0.05)。结论Kisspeptin-1基因rs5780218及rs3924587位点多态性与GHDD的发生无明显相关,但此次样本数量较少,有地区特性,该结论只在河南地区GHDD患者中成立。 展开更多
关键词 生长激素缺乏性侏儒症 KISSPEPTIN 1基因 基因 等位基因
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猪流行性腹泻病毒中和表位区S1D的原核表达及免疫原性分析
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作者 张鸿鑫 韩昊莹 +4 位作者 侯华琳 赵宇 郑兰兰 杨明凡 陈红英 《畜牧与兽医》 北大核心 2018年第10期110-114,共5页
为了研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)S1蛋白中和表位区S1D的免疫原性,根据PEDV河南株(Gen Bank:YK649107)S1基因序列,设计1对特异性引物,PCR扩增S1D片段,克隆到p ET-28a(+)中,构建原核表达载体,经优化的IPTG浓度诱导后进行SDS-PAGE... 为了研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)S1蛋白中和表位区S1D的免疫原性,根据PEDV河南株(Gen Bank:YK649107)S1基因序列,设计1对特异性引物,PCR扩增S1D片段,克隆到p ET-28a(+)中,构建原核表达载体,经优化的IPTG浓度诱导后进行SDS-PAGE分析,利用His标签的特性重组蛋白进行纯化及Western blot分析。结果显示:中和表位S1D片段在p ET-28a(+)中高效表达;Western blot证明重组蛋白可以与PEDV阳性血清产生特异性反应;用纯化的蛋白免疫新西兰白兔,抗体水平升高,表明重组蛋白具有良好的免疫原性。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S1基因 中和表位区S1D 原核表达 免疫原性
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