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角鳖RNA-seq转录组分析及生长相关基因筛选
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作者 罗志嘉 李潇 +3 位作者 曾丹 王佩 彭娜 王晓清 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1480-1487,共8页
角鳖是一种具有极高经济价值的淡水动物,市场开发潜力较大。其生长上存在的显著差异,制约了角鳖养殖业的健康可持续发展。为了探索角鳖生长发育的相关分子机制,本研究以生长存在显著差异的快长组和慢长组角鳖肝脏为材料,采用Illumina Hi... 角鳖是一种具有极高经济价值的淡水动物,市场开发潜力较大。其生长上存在的显著差异,制约了角鳖养殖业的健康可持续发展。为了探索角鳖生长发育的相关分子机制,本研究以生长存在显著差异的快长组和慢长组角鳖肝脏为材料,采用Illumina HiSeq TM 2500高通量测序平台进行转录组分析,经过拼接组装共获得264 757 372条Clean reads,148 093个Unigene,序列平均长度为900.8 bp。将Unigene与NR、SWISSPROT、KOG、KEGG和GO进行比对,共有34 666条得到了注释结果。通过以快长组为对照组,慢长组为实验组进行基因表达情况对比,结果显示有2 246个基因表达存在差异,其中显著性上调的基因1 264个,显著性下调的基因982个。通过KEGG pathway分析,Fox O信号通路、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡、TGF-beta信号通路及胰岛素信号通路等生长发育相关代谢途径的部分基因表达存在显著的差异。本研究为进一步揭示角鳖生长发育的相关分子机制、生长相关基因克隆和表达等研究及奠定了坚实的基础,也为后续开展龟鳖类分子生物学研究提供了宝贵的基因数据来源。 展开更多
关键词 角鳖 RNA-SEQ 转录组 生长基因筛选
刺鳖生物学及人工繁殖的研究进展 预览
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作者 袁显春 何小燕 +2 位作者 于毅 殷守仁 潘志 《广东海洋大学学报》 CAS 2013年第1期93-98,共6页
介绍国内外有关刺鳖生物学和人工繁殖两方面的研究成果。根据形态特征数据,刺鳖可分为7个亚种,但根据分子系统地理学理论,刺鳖则分为2个地理种群,且认为A.S.hartwegi与A.S.spinifera为异名同种;刺鳖食性为肉食性兼腐食性,虾类和水生昆... 介绍国内外有关刺鳖生物学和人工繁殖两方面的研究成果。根据形态特征数据,刺鳖可分为7个亚种,但根据分子系统地理学理论,刺鳖则分为2个地理种群,且认为A.S.hartwegi与A.S.spinifera为异名同种;刺鳖食性为肉食性兼腐食性,虾类和水生昆虫为其主要食物的重要组成部分;水体DO丰富时,刺鳖可耐受不低于3℃的低温条件,但对缺氧状态耐受力较低;刺鳖性别由基因决定但未发现异形性染色体,野生雌性约9龄性成熟,繁殖力低;刺鳖与珍珠鳖(Apalone ferox)杂交是可行的。基于相关内容研究现状,提出了有关分类学、冬眠生理、以及资源开发利用的研究方向。 展开更多
关键词 刺鳖 分类地位 生活习性 繁殖习性 人工繁殖
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