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鱼肉DNA提取方法比较及物种鉴定研究 预览
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作者 杨珺茹 熊雄 +3 位作者 黄曼虹 袁方颖 陆利霞 熊晓辉 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2019年第6期161-170,共10页
本研究采用改进煮沸法(BP法)以及传统蛋白酶K法(TP法),从16种鱼肉样品中提取DNA,分析比对两种方法提取DNA的浓度、纯度、以及普通PCR和荧光PCR的效果。同时,运用BP法从70个市售鱼肉产品中提取总DNA,并采用DNA条形码技术进行物种鉴定。... 本研究采用改进煮沸法(BP法)以及传统蛋白酶K法(TP法),从16种鱼肉样品中提取DNA,分析比对两种方法提取DNA的浓度、纯度、以及普通PCR和荧光PCR的效果。同时,运用BP法从70个市售鱼肉产品中提取总DNA,并采用DNA条形码技术进行物种鉴定。结果表明,BP法提取DNA耗时较短,对于大部分鱼肉样品,BP法提取的DNA浓度低于TP法,但两种方法提取的DNA A260/A280无显著差异,均满足普通PCR和荧光PCR扩增要求。另外,BP法提取的DNA可用于市售鱼肉产品DNA条形码鉴定,通过比对发现,81.43%的鱼肉产品可匹配到相似度≥98%的物种,在种水平和属水平的鉴定成功率分别为48.57%和72.86%。BP法在提取DNA过程中可缩短时间,降低提取成本,便于大批量样品的检测。 展开更多
关键词 DNA提取 DNA条形码 鱼肉制品 煮沸法
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中药材种子DNA条形码鉴定研究进展
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作者 赵晴 谢红波 +4 位作者 赵红玲 赵春颖 谢利德 石林春 刘金欣 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期3471-3476,共6页
种子是中药产业的源头,中药材种子的准确鉴定不仅关系到中药材的真伪,更关系到中药的安全性和有效性。由于多数中药材种子体积较小、内含物丰富、形态特征易受种子成熟度和环境条件的影响,难以通过传统方法进行有效鉴定。DNA条形码技术... 种子是中药产业的源头,中药材种子的准确鉴定不仅关系到中药材的真伪,更关系到中药的安全性和有效性。由于多数中药材种子体积较小、内含物丰富、形态特征易受种子成熟度和环境条件的影响,难以通过传统方法进行有效鉴定。DNA条形码技术利用一段标准的DNA序列从基因层面对物种进行鉴定,不受环境等外部因素影响,具有通用、快速、准确等特点,逐渐成为中药材种子鉴定的研究热点。简述了DNA条形码技术在中药材种子鉴定中的研究现状,分析了中药材种子DNA条形码鉴定的技术要点,总结了不同类型中药材种子进行DNA条形码鉴定的原则,并提出了利用宏条形码技术鉴定市售混合中药材种子的研究方法,为中药材种子鉴定提供新的研究思路。 展开更多
关键词 中药材 种子 DNA条形码 宏条形码 分子鉴定
阿坝藏鸡三个品系线粒体DNA编码分析
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作者 杨小林 何世明 +5 位作者 吴锦波 余春林 杨朝武 王蓉芳 苏元君 李星亮 《中国家禽》 北大核心 2019年第16期18-22,共5页
试验旨在通过对阿坝藏鸡三个品系进行深入研究,利用COX1和D-LOOP基因某一特定区段作为DNA条形码对阿坝藏鸡三个品系进行分子鉴定,分析其遗传多态性并探讨DNA条形码在藏鸡分支鉴定工作的可行性和有效性。以阿藏1系、阿藏2系、阿藏3系三... 试验旨在通过对阿坝藏鸡三个品系进行深入研究,利用COX1和D-LOOP基因某一特定区段作为DNA条形码对阿坝藏鸡三个品系进行分子鉴定,分析其遗传多态性并探讨DNA条形码在藏鸡分支鉴定工作的可行性和有效性。以阿藏1系、阿藏2系、阿藏3系三个品系作为研究对象,利用DNA测序技术测定了COX1和D-LOOP基因的部分序列。两基因在三个品系的单倍型数量、平均核苷酸差异数(K)均不相同,阿藏3系的平均核苷酸差异数高于阿藏1系和阿藏2系;三个品系核苷酸多态度(Pi)相差不大,其中阿藏2系COX1基因核苷酸多态度略高于其他两品系。三个品系内COX1和D-LOOP两基因测算得出的遗传距离分别为2.21~2.40、4.02~4.34,且各品系间相差不大。通过构建两基因的UPGMA树显示,三品系间存在一定程度的基因交流。利用COX1和D-LOOP基因某一特定区段作为DNA条形码的基础,各有其优势特点,两基因工具搭配使用可提高品系鉴定的准确性。 展开更多
关键词 阿坝藏鸡 线粒体DNA DNA条码 品系鉴定
线粒体nad1/b-c及nad5/d-e在秦艽组植物中物种鉴定意义的评价
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作者 陆佳妮 赵志礼 +2 位作者 倪梁红 嘎务 米玛 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期166-172,共7页
龙胆科龙胆属Gentiana秦艽组Sect.Cruciata多种植物作为中药秦艽及藏药解吉(■)的基原,具有重要的药用价值。在课题组前期品种整理及遗传背景分析基础上,本文分别测定秦艽组10种23个居群69份样品以及外类群椭圆叶花锚Halenia elliptica ... 龙胆科龙胆属Gentiana秦艽组Sect.Cruciata多种植物作为中药秦艽及藏药解吉(■)的基原,具有重要的药用价值。在课题组前期品种整理及遗传背景分析基础上,本文分别测定秦艽组10种23个居群69份样品以及外类群椭圆叶花锚Halenia elliptica 3份样品的线粒体nad1基因第2内含子区(nad 1/b-c)以及nad5基因第4内含子区(nad5/d-e)部分序列,对其在秦艽组植物的分子系统发育分析及物种鉴定中的意义进行评价。结果显示:nad1/b-c具一粗壮秦艽G.robusta King ex Hook.f.稳定变异位点;同时,对粗茎秦艽G.crassicaulis Duthie ex Burk.及西藏秦艽G.tibetica King ex Hook.f.有一定物种分辨率;nad5/d-e序列相似度高,仅大叶秦艽G.macrophylla Pall.、黄管秦艽G.officinalis H.Smith及管花秦艽G.siphonantha Maxim.ex Kusnez.存在种内不同基因型。进而基于粗壮秦艽G.robusta King ex Hook.f.nad 1/b-c物种分子标记,设计一特异鉴定引物,建立粗壮秦艽特异性引物-PCR鉴定方法。本工作可为协同进化不完全、遗传背景复杂多样的中藏药高山基原植物DNA条形码的构建提供新思路。 展开更多
关键词 线粒体DNA nad1基因 b-c内含子 龙胆属 秦艽组 DNA条形码
冬虫夏草人工繁育品与野生冬虫夏草DNA条形码比较研究
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作者 过立农 刘杰 +5 位作者 袁航 昝珂 郑健 马双成 钱正明 李文佳 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期147-155,共9页
目的:从分子生物学的角度比较分析冬虫夏草人工繁育品和野生冬虫夏草的核糖体DNA内部转录间隔区(ITS)和细胞色素C氧化酶亚基1(COⅠ)条形码序列,并验证冬虫夏草人工繁育品与野生冬虫夏草虫和菌的来源是否符合《中华人民共和国药典》规定... 目的:从分子生物学的角度比较分析冬虫夏草人工繁育品和野生冬虫夏草的核糖体DNA内部转录间隔区(ITS)和细胞色素C氧化酶亚基1(COⅠ)条形码序列,并验证冬虫夏草人工繁育品与野生冬虫夏草虫和菌的来源是否符合《中华人民共和国药典》规定。方法:通过聚合酶链式反应(PCR)对冬虫夏草人工繁育品和野生冬虫夏草的ITS和COⅠ序列进行扩增,利用邻接法比较冬虫夏草人工繁育品与野生冬虫夏草的亲缘关系;通过与GenBank数据库进行Blast比对,确定冬虫夏草虫与菌的科属。结果:冬虫夏草人工繁育品与野生冬虫夏草ITS和COⅠ序列的电泳结果均显示为明亮单一条带,且条带大小介于500 bp和750 bp之间;COⅠ序列的系统树结果中冬虫夏草人工繁育品和野生冬虫夏草除野生冬虫夏草-18、野生冬虫夏草-20这2个样品均各自聚为一支,且支持率为99%,呈现良好的单系性,ITS序列的系统树结果中冬虫夏草人工繁育品和野生冬虫夏草混聚在一起,没有明确的分支;冬虫夏草人工繁育品的COⅠ序列经GenBank数据库比对结果均为小金蝠蛾(Hepialus xiaojinensis),为蝙蝠蛾科Hepialidae sp.昆虫,野生冬虫夏草的COⅠ序列经GenBank数据库比对结果均为蝙蝠蛾科Hepialidae sp.昆虫,其中野生冬虫夏草-8为人支蝠蛾(Thitarodes renzhiensis),野生冬虫夏草-12为贡嘎蝠蛾(Thitarodes gonggaensis),冬虫夏草人工繁育品及野生冬虫夏草的ITS序列与GenBank数据库比对后,相似度达99%以上,比对结果显示20批冬虫夏草人工繁育品和26批野生冬虫夏草的虫菌均为冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)。Ophiocordyceps sinensis和Cordyceps sinensis为同物异名。结论:20批冬虫夏草人工繁育品的虫体及虫菌来源与26批野生冬虫夏草的虫体及虫菌来源均符合《中华人民共和国药典》2015年版中的描述:冬虫夏草为麦角菌科真菌冬虫夏草菌Cordyceps sinensis(Berk.)Sacc.寄生在蝙� 展开更多
关键词 野生冬虫夏草 冬虫夏草人工繁育品 内部转录间隔区(ITS) 细胞色素C氧化酶亚基1(CO Ⅰ) 聚合酶链式反应(PCR) DNA条形码
杜鹃花属(Rhododendron L.)植物DNA条形码鉴定——参考序列库、分子标记与栽培品种野生亲本溯源 预览
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作者 白霄霞 沈风娇 +3 位作者 李志斌 赵建成 蒋淑磊 石硕 《天津农业科学》 CAS 2019年第10期1-7,共7页
杜鹃花属(Rhododendron L.)植物作为重要观赏和中药植物,市场前景广阔,发展潜力巨大。本文通过归纳杜鹃花属植物的分类、鉴定相关问题,发现利用DNA条形码可有效解决杜鹃花属植物(品种)的鉴定问题。基于杜鹃花属植物的具体情况,本文对序... 杜鹃花属(Rhododendron L.)植物作为重要观赏和中药植物,市场前景广阔,发展潜力巨大。本文通过归纳杜鹃花属植物的分类、鉴定相关问题,发现利用DNA条形码可有效解决杜鹃花属植物(品种)的鉴定问题。基于杜鹃花属植物的具体情况,本文对序列参考数据库建设、分子标记开发以及杜鹃花品种的野生亲本溯源三方面内容进行综述,并结合GenBank中1311条杜鹃花属DNA序列及作者测序获得的463条序列,初步建立杜鹃花属DNA条形码数据库,并通过非加权组平均法利用matK与psbA-trnH序列联合建立UPGMA树,部分杜鹃花属栽培品种可与野生种聚为一支。综合说明DNA条形码技术可用于对杜鹃花属栽培品种开展初步的野生亲本溯源。 展开更多
关键词 杜鹃花 DNA条形码 中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台
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DNA条形码技术在加工食品鉴定中的应用 预览
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作者 牛家乐 费鑫杨 +4 位作者 傅寅旭 张俊 潘迦明 陈毓 王旭 《山东化工》 CAS 2019年第10期61-64,共4页
近年来,全球范围不断出现有关食品产品与标签不符,肉类掺假,以次充好等商业欺诈问题。食品掺假造假问题影响着人们的利益与健康,也越来越受到各国政府重视。对加工食品而言,其生产加工过程的复杂性使得物种鉴别变得相对困难。传统的检... 近年来,全球范围不断出现有关食品产品与标签不符,肉类掺假,以次充好等商业欺诈问题。食品掺假造假问题影响着人们的利益与健康,也越来越受到各国政府重视。对加工食品而言,其生产加工过程的复杂性使得物种鉴别变得相对困难。传统的检测方法已不能满足对加工食品鉴定的需要。DNA条形码是一种从分子水平上对物种进行快速鉴定的技术,它弥补了传统鉴定方法的缺陷,以其准确、高效、简单的特点为加工食品鉴定领域带来了革命性的影响。本文在简要介绍DNA条形码研究现状的基础上,主要总结目前国内外关于DNA条形码技术在加工食品鉴定中的应用情况,包括在牲畜肉制品、动物源中药制品、植物源中药制品、加工海产品鉴定中的应用,并讨论DNA条形码技术在食品鉴定中的优缺点以及发展趋势。 展开更多
关键词 DNA条形码 加工食品 真伪鉴定
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《中国药典》收载动物药材DNA条形码鉴定研究策略与方法 预览
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作者 姚辉 张辉 陈士林 《中国现代中药》 CAS 2019年第9期1137-1146,共10页
动物药材应用历史悠久,是中药资源的重要组成部分。近年来动物药材混伪品、替代品不断出现,严重影响了动物药材临床应用效果和用药安全。DNA条形码技术作为一种新兴的生物鉴定方法,可对《中华人民共和国药典》收载动物药材进行快速、准... 动物药材应用历史悠久,是中药资源的重要组成部分。近年来动物药材混伪品、替代品不断出现,严重影响了动物药材临床应用效果和用药安全。DNA条形码技术作为一种新兴的生物鉴定方法,可对《中华人民共和国药典》收载动物药材进行快速、准确的鉴定。本文就以COI为主体、ITS2为补充的动物药材DNA条形码鉴定体系的建立、动物药材DNA条形码鉴定中的关键技术和动物药材DNA条形码鉴定数据库进行介绍,为《中华人民共和国药典》收载动物药材DNA条形码鉴定研究提供参考。 展开更多
关键词 动物药材 鉴定 DNA条形码 COI序列
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基于性状鉴别和DNA条形码联用的虎尾海马生药学研究 预览
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作者 来梦茹 方昀 +3 位作者 葛宇清 黄真 张光霁 程汝滨 《中国现代中药》 CAS 2019年第9期1173-1180,共8页
目的:采用性状-线粒体COI条形码联用的方法对市售海马药材伪品虎尾海马Hippocampuscomes进行生药学研究,提供主要海马药材伪品虎尾海马的性状和分子的鉴定特征,为海马药材的鉴定提供新方法。方法:利用外观性状鉴别方法对虎尾海马典型性... 目的:采用性状-线粒体COI条形码联用的方法对市售海马药材伪品虎尾海马Hippocampuscomes进行生药学研究,提供主要海马药材伪品虎尾海马的性状和分子的鉴定特征,为海马药材的鉴定提供新方法。方法:利用外观性状鉴别方法对虎尾海马典型性状特征进行研究;扩增获得虎尾海马样品的COI条形码序列,比较各序列的碱基组成、GC含量、变异率等,分析虎尾海马与常见海马药材的正品和伪品序列,明确其种内和种间遗传距离;利用NJ(neighbor-joining)法构建虎尾海马与常见海马样品的系统进化发育树,分析其亲缘关系。结果:虎尾海马最典型性状鉴别特征为尾部有交替出现的花斑,头冠低小且有5个显著的圆形突起;虎尾海马样品的COI序列长度为649bp,碱基GC平均含量为39.73%,种内的平均遗传距离为0.0011,其种内遗传距离远小于与另外8种海马药材的种间遗传距离,存在显著的条形码间隔;NJ系统发育树显示虎尾海马与其他海马药材各自聚为一支,其分支支持率为100%,与刺海马的亲缘关系最近。结论:基于性状鉴别-线粒体COI条形码的生药学研究方法能够准确鉴定虎尾海马,与其他海马进行准确区分,为虎尾海马的快速鉴定提供了新的手段,对改善市售海马混乱的流通现状、控制和提高海马药材质量具有重要意义。 展开更多
关键词 虎尾海马 COI序列 DNA条形码 分子鉴定
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鱼卵和仔稚鱼鉴定技术研究进展 预览
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作者 金雨婷 蒋日进 +2 位作者 赵进 刘志坚 管峰 《安徽农业科学》 CAS 2019年第15期18-20,39共4页
鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵... 鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵和仔稚鱼鉴定在渔业资源普查和科学研究中的重要意义以及2种主要鉴定技术的研究进展,为鱼卵和仔稚鱼鉴定研究提供基础知识。 展开更多
关键词 鱼卵和仔稚鱼 物种鉴定 形态学 分子鉴定 DNA条形码
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中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定
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作者 叶晓霞 王小敏 +3 位作者 陈善兰 赵仕花 吴仕蔓 杨玲 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期185-190,共6页
目的:评价和比较几个常用DNA条形码候选序列对地枫皮及伪品假地枫皮的鉴定作用。方法:采集不同产地的地枫皮及假地枫皮样品,进行总DNA提取,选取核基因内转录间隔区2(ITS2)序列、叶绿体rbcL,mat K基因序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,... 目的:评价和比较几个常用DNA条形码候选序列对地枫皮及伪品假地枫皮的鉴定作用。方法:采集不同产地的地枫皮及假地枫皮样品,进行总DNA提取,选取核基因内转录间隔区2(ITS2)序列、叶绿体rbcL,mat K基因序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,纯化产物测序,利用Condon Code Aligner V3. 7. 1校对拼接。结果:地枫皮及假地枫皮rbcL序列进行多次PCR扩增及测序结果均不理想,初步推测地枫皮及假地枫皮rbcL序列太长,进化较慢,不适合作为地枫皮及假地枫皮种间鉴别;地枫皮及假地枫皮的matK基因序列测序成功率分别为0和76. 8%,可能是不同类群的植物matK序列的引物标准不一;对地枫皮及假地枫皮的ITS2序列PCR扩增及测序结果最为理想,测序的成功率分别为89. 3%及91. 2%,对测序结果序列进行分析,地枫皮的ITS2序列总长度均为268个碱基,存在2个变异位点;假地枫皮的ITS2序列总长度均为430个碱基,存在4个或3个变异位点。实验结果说明地枫皮及假地枫皮ITS2序列较短,有明显的变异性,便于扩增,表明ITS2序列用于地枫皮及假地枫皮的分子鉴定优于rbcL和matK序列。结论:ITS2序列作为标准的DNA条形码能够有效地鉴定地枫皮及其伪品假地枫皮。 展开更多
关键词 地枫皮 假地枫皮 DNA条形码 分子鉴定
基于形态与DNA条形码的中国鲾科鱼类分类研究 预览
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作者 周琪 章群 +2 位作者 唐楚林 徐示 王业磷 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期1-8,共8页
鲾科鱼类因鳞片细小易脱落,鳍棘易折断,且部分物种具有性二态特征,导致传统分类鉴定困难。为明确中国鲾科(Leiognathidae)鱼类的分类地位,测量了小牙鲾(Gazzaminuta)、G.sp.A、黄斑鲾(Leiognathusbindus)、短吻鲾(L.brevirostris)、颈斑... 鲾科鱼类因鳞片细小易脱落,鳍棘易折断,且部分物种具有性二态特征,导致传统分类鉴定困难。为明确中国鲾科(Leiognathidae)鱼类的分类地位,测量了小牙鲾(Gazzaminuta)、G.sp.A、黄斑鲾(Leiognathusbindus)、短吻鲾(L.brevirostris)、颈斑鲾(L.nuchalis)、短棘鲾(L.equulus)、细纹鲾(L.berbis)、带纹鲾(L.striatus)、坚鲾(L.stercorarius)、仰口鲾(Secutorruconius)10种147尾中国鲾科鱼类的28个形态参数,消除异增长效应后进行主成分分析、判别分析以及聚类分析,发现不同物种间表观形态上具有较大的相似性,易造成鉴定错误。测定中国鲾科鱼类10种47尾DNA条形码序列,结合GenBank和BOLD下载数据进行联并分析,发现小牙鲾、G.sp.A、黄斑鲾、短吻鲾、颈斑鲾、短棘鲾、细纹鲾、带纹鲾、坚鲾、仰口鲾、曳丝鲾(L.leuciscus)、宽身小牙鲾(G.achlamys)12种鲾科鱼类105条序列聚类成11个自展数据支持率为100%的分支,分支间平均遗传距离(18.6%)是分支内(0.3%)的62倍,支持分支的物种分类地位。短吻鲾和颈带鲾分支间平均遗传距离(8.1%)是分支内(0.15%)的54倍,形态与分子均没有重叠,应为2个独立种。牙鲾属G.sp.A与宽身小牙鲾及小牙鲾的种间遗传距离分别是种内遗传距离的35倍和79倍,支持其为独立的物种。另外,发现本研究采集于广东阳江的坚鲾、海南博鳌的带纹鲾和G.sp.A为中国3个新纪录种。 展开更多
关键词 鲾科 DNA条形码 形态分类
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DNA条形码在热带龙脑香科树种鉴定中的应用
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作者 胡建霖 刘志芳 +1 位作者 慈秀芹 李捷 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期350-359,共10页
龙脑香科植物是东南亚地区重要的热带木材来源树种,对其开展DNA条形码评估在林业监管及森林资源保护等方面具有非常重要的实际应用价值。通过对龙脑香科植物样品进行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四个片段的扩增和测序,结合GenBank下载... 龙脑香科植物是东南亚地区重要的热带木材来源树种,对其开展DNA条形码评估在林业监管及森林资源保护等方面具有非常重要的实际应用价值。通过对龙脑香科植物样品进行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四个片段的扩增和测序,结合GenBank下载的数据,共获得龙脑香科树种14属244种共计899条序列。通过比较4个片段的通用性、序列特征、种内和种间的遗传变异,基于Best Match (BM)、Best Close Match (BCM)、相似性搜索算法(BLAST)和邻接树(NJ) 4种方法评估DNA条形码对于龙脑香科树种的鉴定能力。结果表明, ITS2在龙脑香科树种中鉴定效率最高,通过优化的扩增体系能够从该科植物叶片中获得较高质量的ITS2片段;叶绿体matK片段扩增和测序效率为100%,且种内及种间遗传变异明显,鉴定成功率高于其它叶绿体片段,并据此提出ITS2和matK适合作为龙脑香科树种的DNA条形码。 展开更多
关键词 龙脑香科 DNA条形码 ITS2 MATK 热带地区
从隐存种到我国生物多样性保护研究:现状与展望 被引量:1
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作者 徐伟 车静 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第4期519-530,共12页
分子技术的发展,在推动隐存种大量发现的同时,也凸显出我们对于生物多样性了解的局限性.在全球气候变化和人类活动的干扰下,生物多样性正面临着前所未有的威胁.对于隐存种的研究,有利于我们更好地认知和保护生物多样性.本文简述了隐存... 分子技术的发展,在推动隐存种大量发现的同时,也凸显出我们对于生物多样性了解的局限性.在全球气候变化和人类活动的干扰下,生物多样性正面临着前所未有的威胁.对于隐存种的研究,有利于我们更好地认知和保护生物多样性.本文简述了隐存种的概念和有关形成机制的主要假说,并着重介绍了分子技术带动下的隐存种研究的发展概况.通过文献搜集,统计归纳了国内关于隐存种研究现状,对于隐存种的逐渐认知已经在我国生物多样性研究多个领域产生积极作用,包括区域物种多样性的发掘、濒危物种保护遗传研究、入侵生物鉴别及防控、疾病防治等方面.未来,需将隐存种研究纳入到大尺度区域生物多样性评估体系中,在此基础上,加强对隐存种形态保守机制的探索研究. 展开更多
关键词 隐存多样性 DNA条形码 二代测序技术 基因组 生物多样性保护
基于DNA条形码技术的海参物种鉴定 预览
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作者 胡冉冉 邢冉冉 +2 位作者 王楠 葛毅强 陈颖 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第10期145-151,157共8页
DNA条形码技术(DNA barcoding)是一种新型高效的物种鉴别方法。本研究基于DNA条形码技术,以线粒体细胞色素氧化酶I基因(COI)和16S核糖体RNA(16S rRNA)基因作为靶基因对海参物种进行鉴别,结果表明COI基因或16S rRNA基因均能实现大部分海... DNA条形码技术(DNA barcoding)是一种新型高效的物种鉴别方法。本研究基于DNA条形码技术,以线粒体细胞色素氧化酶I基因(COI)和16S核糖体RNA(16S rRNA)基因作为靶基因对海参物种进行鉴别,结果表明COI基因或16S rRNA基因均能实现大部分海参的物种鉴定,部分样品需结合两个靶基因鉴定出来。将所建立的DNA条形码方法用于市售海参样品的物种鉴定,24份市售海参样品中10份市售海参样品的物种鉴定结果与标签名称相符,6份样品与标签名称不符,存在将低价海参品种标为高价海参的现象;其余8份样品的标签只有商品名但没有明确的物种信息,利用DNA条形码技术对其鉴定可得到明确的海参种名。本研究结果证实DNA条形码技术可应用于市售海参的物种鉴定,为海参的监管提供技术支撑。 展开更多
关键词 DNA条形码 海参 COI基因 16S RRNA基因 物种鉴定
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云南昭通蜜柑大实蝇和橘大实蝇的DNA条形码鉴定
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作者 张岳 李永青 +7 位作者 陈吉祥 贾仕康 陈敏 郑林宇 杨文钊 秦誉嘉 石安宪 李志红 《植物检疫》 北大核心 2019年第4期41-45,共5页
蜜柑大实蝇(Bactrocera tsuneonis)和橘大实蝇(Bactrocera minax)属果实蝇属(Bactrocera)大实蝇亚属(Tetradacus),是为害柑橘类作物的两种检疫性实蝇。两种实蝇为近似种,仅成虫可通过形态特征进行鉴定,幼虫等非成虫虫态需采用分子生物... 蜜柑大实蝇(Bactrocera tsuneonis)和橘大实蝇(Bactrocera minax)属果实蝇属(Bactrocera)大实蝇亚属(Tetradacus),是为害柑橘类作物的两种检疫性实蝇。两种实蝇为近似种,仅成虫可通过形态特征进行鉴定,幼虫等非成虫虫态需采用分子生物学技术才能实现快速、准确的鉴定。本研究对采自云南省昭通市大关县、彝良县和永善县的大实蝇成虫及幼虫样品分别进行了形态鉴定和DNA条形码鉴定。结果表明,通过形态特征的对比以及DNA条形码序列的测定、比对和分析,采自大关县和彝良县的20头成虫样品分别为蜜柑大实蝇和橘大实蝇,采自彝良县和永善县的20头幼虫样品均为橘大实蝇。本研究实现了云南昭通地区两种大实蝇的DNA条形码鉴定,为我国植物检疫相关部门提供实用技术及决策支持。 展开更多
关键词 蜜柑大实蝇 橘大实蝇 DNA条形码技术 鉴定
基于ITS2序列的15种淫羊藿属药用植物分类鉴定研究 预览
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作者 严福林 徐文芬 +2 位作者 孙庆文 魏升华 何顺志 《种子》 北大核心 2019年第6期43-47,共5页
为探讨内转录间隔区2(ITS2)序列及其二级结构在15种淫羊藿属(Epimedium)中的鉴定效率。利用试剂盒提取叶片总DNA,对ITS2序列进行PCR扩展与测序,计算K2P遗传距离,构建系统发育树,预测其二级结构。结果表明,ITS2序列在15种淫羊藿属植物中... 为探讨内转录间隔区2(ITS2)序列及其二级结构在15种淫羊藿属(Epimedium)中的鉴定效率。利用试剂盒提取叶片总DNA,对ITS2序列进行PCR扩展与测序,计算K2P遗传距离,构建系统发育树,预测其二级结构。结果表明,ITS2序列在15种淫羊藿属植物中的通用性好,扩增成功率与测序成功率均为100%。从K2P种间和种内遗传距离看,ITS2在淫羊藿属中的种间变异较小,部分种类种内遗传距离大于种间遗传距离,鉴定成功率约为60%。采用比对法(Blast)分析,ITS2鉴定效率为75%。由ITS2系统进化树可知,淫羊藿属与鬼臼属各为一支,易于分开。除薄叶淫羊藿、竹山淫羊藿、巫山淫羊藿外,其余种类均能较好的进行聚类;除粗毛淫羊藿、保靖淫羊藿外其余均不能与NCBI下载到的序列进行较好聚类。研究表明,15种淫羊藿属植物ITS2序列在ML系统进化树中具较好的鉴别能力,但淫羊藿属各样本种内与种间遗传较为混乱,遗传距离复杂,ITS2二级结构形态结构亦较为相似,将各种间进行区分存在一定难度,不适合单独作为该属条形码使用。 展开更多
关键词 淫羊藿属 ITS2 分类鉴定 DNA条形码
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桃实蝇的DNA条形码鉴定
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作者 张岳 Sandeep Singh +1 位作者 Simranpreet Kaur 李志红 《植物检疫》 北大核心 2019年第5期17-21,共5页
桃实蝇(Bactrocera zonata)严重危害桃、番石榴、番荔枝等经济作物,被我国列为进境植物检疫性有害生物。为明确桃实蝇各虫态的重要形态鉴定特征,并将DNA条形码技术应用于桃实蝇的鉴定,本研究针对采自于印度旁遮普邦的桃实蝇卵、幼虫、... 桃实蝇(Bactrocera zonata)严重危害桃、番石榴、番荔枝等经济作物,被我国列为进境植物检疫性有害生物。为明确桃实蝇各虫态的重要形态鉴定特征,并将DNA条形码技术应用于桃实蝇的鉴定,本研究针对采自于印度旁遮普邦的桃实蝇卵、幼虫、蛹和成虫样品进行了形态观察和分子鉴定。结果表明:桃实蝇成虫整体呈红褐色,头部具一对卵圆形黑色颜面斑。翅除前缘带和臀条外几乎透明,r2+3室端部具“痣状”小褐斑,延伸至r4+5室端部。实蝇成虫及蛹样品的COI条形码序列与GenBank中收录的桃实蝇序列相似度在99.24%~100%之间;基于COI条形码构建的系统发育树显示本研究所有样品和桃实蝇聚在一个分支上。本研究表明DNA条形码技术可有效应用于桃实蝇的准确鉴定。 展开更多
关键词 桃实蝇 形态特征 DNA条形码技术 鉴定
上海口岸截获的粉蝇属DNA条形码鉴定及系统发育研究 预览
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作者 杜鹃 邓耀华 +3 位作者 张子龙 赵彤言 李深伟 田桢干 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2019年第1期41-46,共6页
使用传统形态学分类方法进行干制标本的物种鉴定通常比较困难。本文按照《国境口岸医学媒介昆虫DNA条形码鉴定操作规程》对上海口岸截获的粉蝇属干制标本进行DNA条形码研究。经BOLD System v4比对,结果显示所得序列分别属于5个种:粗野粉... 使用传统形态学分类方法进行干制标本的物种鉴定通常比较困难。本文按照《国境口岸医学媒介昆虫DNA条形码鉴定操作规程》对上海口岸截获的粉蝇属干制标本进行DNA条形码研究。经BOLD System v4比对,结果显示所得序列分别属于5个种:粗野粉蝇Pollenia rudis、伪粗野粉蝇P.pediculata、游荡粉蝇P.vagabunda、匈牙利粉蝇P.hungarica和Pollenia sp.。引入1条COⅠ序列作为外群对全部序列构建系统发育树(NJ树),结果显示不同物种各自聚为一支。因此,COⅠ条形码技术可以弥补传统形态学分类方法的不足,提高蝇类干制标本鉴定的成功率。 展开更多
关键词 COⅠ基因 DNA条形码 粉蝇属 国境口岸
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橡胶树多主棒孢病菌Cassiicolin基因条形码数据库构建及分子检测技术 预览
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作者 李博勋 刘先宝 +2 位作者 冯艳丽 解惠婷 黄贵修 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第9期1770-1782,共13页
多主棒孢(Corynespora cassiicola)是为害我国主要热带作物的植物病原真菌,其寄主范围广、形态差异显著、症状类型多样,且含有一种寄主专化性毒素Cassiicolin,存在6种毒素类型。本研究利用已公布的Cassiicolin毒素基因(Cas1~Cas6型),构... 多主棒孢(Corynespora cassiicola)是为害我国主要热带作物的植物病原真菌,其寄主范围广、形态差异显著、症状类型多样,且含有一种寄主专化性毒素Cassiicolin,存在6种毒素类型。本研究利用已公布的Cassiicolin毒素基因(Cas1~Cas6型),构建了含287个菌株的国内橡胶树和部分热带作物多主棒孢Cassiicolin基因条形码数据库,建立了一套特异性强、灵敏度高的分子检测技术,可检测100pg/μL的目标基因组DNA,系统分析了我国橡胶树、木薯、番木瓜、瓜菜等主要热带作物的919株多主棒孢的毒素类型,发现国内仅存在Cas2和Cas5这2种毒素类型,其中Cas5型的菌株占94.8%,为橡胶树多主棒孢的优势种群和特有毒素类型。而Cas2型是橡胶树和其他作物多主棒孢共有的毒素型。系统发育分析发现,不同毒素类型的多主棒孢菌株与寄主来源密切相关,但与地理来源没有明显的相关性,且Cas5型多主棒孢具有明显的寄主专化性。通过构建多主棒孢Cassiicolin基因条形码数据库,为明确我国主要热带作物多主棒孢病菌的种群结构和优势种群情况,发掘、保存多主棒孢菌种资源以及制定病害的防治策略上具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 多主棒孢 Cassiicolin毒素基因 DNA条形码 分子检测
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