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广西北部湾5株骨条藻的分子鉴定 认领
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作者 张腾 徐轶肖 +2 位作者 陈云来 韦光领 何喜林 《海洋湖沼通报》 北大核心 2021年第1期109-115,共7页
骨条藻(Skeletonema)隶属于硅藻门(Bacillariophyta),是一种分布广泛的广温广盐性藻类,也是我国沿海常见的赤潮生物之一。为确定北部湾涠洲岛5株骨条藻的分类地位,采用PCR克隆了这5株骨条藻核糖体的大亚基基因(LSU)和内转录间隔区(ITS)... 骨条藻(Skeletonema)隶属于硅藻门(Bacillariophyta),是一种分布广泛的广温广盐性藻类,也是我国沿海常见的赤潮生物之一。为确定北部湾涠洲岛5株骨条藻的分类地位,采用PCR克隆了这5株骨条藻核糖体的大亚基基因(LSU)和内转录间隔区(ITS)序列。通过与GenBank数据库中骨条藻属的LSU、ITS序列进行比对,得出的结果一致:5株涠洲岛骨条藻均为热带骨条藻(Skeletonema tropicum)。本研究运用分子标记法,首次确定了北部湾涠洲岛海域存在有热带骨条藻,结果可为涠洲岛与广西北部湾海域浮游植物多样性、赤潮生物组成及赤潮的预警与有效防治提供科学依据。 展开更多
关键词 骨条藻 ITS LSU 分子鉴定 北部湾
Soil Salinity Detection in Semi-Arid Region Using Spectral Unmixing, Remote Sensing and Ground Truth Measurements 认领
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作者 Moncef Bouaziz Sarra Hihi +1 位作者 Mahmoud Yassine Chtourou Babatunde Osunmadewa 《地理信息系统(英文)》 2020年第4期372-386,共15页
Soil salinity is one of the serious environmental problems ravaging the soils of arid and semi-arid region, thereby affecting crop productivity, livestock, increase level of poverty and land degradation. Hyperspectral... Soil salinity is one of the serious environmental problems ravaging the soils of arid and semi-arid region, thereby affecting crop productivity, livestock, increase level of poverty and land degradation. Hyperspectral remote sensing is one of the important techniques to monitor, analyze and estimate the extent and severity of soil salt at regional to local scale. In this study we develop a model for the detection of salt-affected soils in arid and semi-arid regions and in our case it’s Ghannouch, Gabes. We used fourteen spectral indices and six spectral bands extracted from the Hyperion data. Linear Spectral Unmixing technique (LSU) was used in this study to improve the correlation between electrical conductivity and spectral indices and then improve the prediction of soil salinity as well as the reliability of the model. To build the model a multiple linear regression analysis was applied using the best correlated indices. The standard error of the estimate is about 1.57 mS/cm. The results of this study show that hyperion data is accurate and suitable for differentiating between categories of salt affected soils. The generated model can be used for management strategies in the future. 展开更多
关键词 HYPERION Linear Spectral Unmixing (LSU) Spectral Indices Ground-Truth Soil Salinity Gabes
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云南变绿红菇的遗传多样性与群体遗传分化研究 认领 被引量:1
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作者 余金凤 陈正启 +2 位作者 周汐 吴素蕊 郭相 《食药用菌》 2020年第3期178-184,共7页
以昆明、曲靖、楚雄、玉溪、昭通、临沧、大理等7个变绿红菇地理居群的30个子实体样本为试验材料,基于ITS序列和LSU序列,对其分子变异、遗传多样性、群体遗传分化进行分析。结果:30个样品中,基于ITS序列检测到18个单倍型,基于LSU序列检... 以昆明、曲靖、楚雄、玉溪、昭通、临沧、大理等7个变绿红菇地理居群的30个子实体样本为试验材料,基于ITS序列和LSU序列,对其分子变异、遗传多样性、群体遗传分化进行分析。结果:30个样品中,基于ITS序列检测到18个单倍型,基于LSU序列检测到10个单倍型;基于ITS序列和LSU序列分别构建的单倍型系统发育树及30个样品的系统发育树显示,各地理居群的遗传距离与地理距离之间没有形成对应关系,二者无明显相关性。基于两个序列的分析结果均显示,各地理居群内单倍型多样性较丰富,而核苷酸多样性低。表明变绿红菇在不同的地理居群中的适应能力强,遗传多样性较低,绝大部分遗传分化来自于个体间的差异。 展开更多
关键词 变绿红菇 ITS LSU 遗传多样性 群体遗传分化
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不同分子指标鉴定四川雅江鸡蛋菌的差异 认领
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作者 石家祺 渠文思 +2 位作者 周桂旭 崔金龙 石亚伟 《山西农业科学》 2020年第6期847-850,864,共5页
以采自四川雅江的一株野生鸡蛋菌作为研究材料,利用CTAB法提取基因组DNA,然后利用PCR技术分别扩增ITS、LSU、RPB2、β-tubulin和EFI-α等DNA序列相应区段,并连接到T载体上进行DNA测序;利用GenBank核酸数据库对测序得到的不同序列进行同... 以采自四川雅江的一株野生鸡蛋菌作为研究材料,利用CTAB法提取基因组DNA,然后利用PCR技术分别扩增ITS、LSU、RPB2、β-tubulin和EFI-α等DNA序列相应区段,并连接到T载体上进行DNA测序;利用GenBank核酸数据库对测序得到的不同序列进行同源比对,并从GenBank检索获取相似序列,与测序得到的不同序列分别构建系统发育树。结果揭示,以ITS和LSU序列分析鉴定该野生菌为肉桂鹅膏菌(Amanita cinnamomescens),而以RPB2、β-tubulin和EFI-α序列分析鉴定结果为红黄鹅膏黄褐变种(Amanita hemibapha var.ochracea);最后综合ITS、LSU、RPB2、β-tubulin和EFI-α序列分析和结合形态学观察,将四川雅江鸡蛋菌鉴定为红黄鹅膏黄褐变种(Amanita hemibapha var.ochracea)。在鸡蛋菌的分类鉴定中应考虑更多的分子指标,不能以单一的ITS和LSU序列作为单一的标准。 展开更多
关键词 鹅膏菌 ITS LSU RPB2 Β-TUBULIN EFI-α 分类鉴定
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A New Molecular Label Applied to the Study of the Yellow Sea Green Tide 认领
5
作者 SHEN Weijie HE Yuan SHEN Songdong 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期1507-1514,共8页
From 2007 to 2017,large-scale green tides occurred every year in the Yellow Sea of China,and Ulva prolifera was the main species leading to the green tide.In this study,we used the Polymerase chain reaction and 3'... From 2007 to 2017,large-scale green tides occurred every year in the Yellow Sea of China,and Ulva prolifera was the main species leading to the green tide.In this study,we used the Polymerase chain reaction and 3'Rapid-amplification of c DNA ends technique to amplify the nr DNA-LSU and IGS sequences in U.prolifera and one species of Blidingia.These techniques showed 3259 bp of nrD NA-LSU and 3388 bp of IGS in U.prolifera and 3282 bp nr DNA-LSU and 3059 bp IGS in Blidingia sp.At the same time,tandem repeats,short dyads,palindromic and multiple simple repeat sequences in the IGS sequence were found by analyzing the structure of the IGS sequence in U.prolifera and Blidingia sp.G+C contents of the IGS sequence in U.prolifera and Blidingia sp.were 52.42% and 53.09%,respectively.We divided the U.prolifera into two types according to the morphological characteristics.Although the specimens of U.prolifera from the Qingdao coastal area,Jiangsu coastal area and the Yellow Sea have different morphologies,their ITS and IGS sequences are almost identical.Therefore,the main species of the green tides in the Qingdao coastal area,Jiangsu coastal area and the Yellow Sea are the same and have the same origin. 展开更多
关键词 LSU IGS ULVA PROLIFERA green TIDE morphological characteristics
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药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSU rRNA基因的序列分析 认领
6
作者 蒋波 冯震 +2 位作者 秦峰 刘浩 杨美成 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1933-1939,共7页
目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因... 目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因组DNA,对ITS和LSU序列进行PCR扩增和序列测定,通过序列聚类关系分析,进一步评价不同序列对产毒真菌的分子鉴定能力。结果:分别采用ITS、LSU rRNA基因序列分析方法对产毒真菌的鉴定至少可达到"属"水平,采用ITS和LSU rRNA基因的串联序列可以将青霉属和曲霉属中的试验菌株鉴定至"种"水平。结论:ITS和LSU rRNA序列系统发育分析可作为产毒真菌的鉴定方法。 展开更多
关键词 产毒真菌 内转录间隔区 大亚基单元 系统发育分析
云南省美味牛肝菌的遗传多样性分析 认领 被引量:4
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作者 余金凤 陈正启 +3 位作者 周汐 郭相 罗瑞 吴素蕊 《北方园艺》 CAS 北大核心 2018年第6期139-144,共6页
以采自云南省昆明、迪庆、大理、玉溪、曲靖、楚雄、文山等地的美味牛肝菌子实体为试材,采用ITS、LSU保守区段克隆测序和序列同源性比对的方法,将从GenBank中获得的部分牛肝菌属物种ITS和LSU序列与美味牛肝菌通过邻接法进行系统发育分... 以采自云南省昆明、迪庆、大理、玉溪、曲靖、楚雄、文山等地的美味牛肝菌子实体为试材,采用ITS、LSU保守区段克隆测序和序列同源性比对的方法,将从GenBank中获得的部分牛肝菌属物种ITS和LSU序列与美味牛肝菌通过邻接法进行系统发育分析。结果表明:基于ITS系列构建的系统发育树表明,美味牛肝菌与Boletus reticulatus和Boletus aereus间序列差异较小,亲缘关系较近,以76%的支持率聚为一簇;基于LSU序列构建的系统发育树表明美味牛肝菌独立成为一枝,且除样品DJ外,其余样品以96%的支持率聚为一簇,表明它们有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 美味牛肝菌 ITS LSU 遗传多样性
基于ITS和LSU序列对一株野生鹅膏菌的分类鉴定 认领 被引量:4
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作者 渠文思 石家祺 石亚伟 《山西农业科学》 2018年第12期2073-2076,共4页
以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将rDNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和LS... 以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将rDNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和LSU序列,与测序得到的ITS和LSU序列分别做系统发育树。测序结果表明,ITS序列有666bp,LSU序列有968bp;系统发育树结果显示,ITS序列以100%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起,LSU序列以98%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起。结合形态学观察,将山西左权鹅膏菌鉴定为拟橙盖鹅膏菌(Amanita caesareoides)。 展开更多
关键词 鹅膏菌 RDNA 内转录间隔区 核糖体大亚基基因组序列 分类鉴定
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福建古田红曲生产用红曲霉菌主要种类的鉴别 认领 被引量:8
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作者 李志强 刘颖 +1 位作者 林风 吴丽云 《食品与发酵工业》 CSCD 北大核心 2017年第5期64-69,共6页
以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascussp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取... 以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascussp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(CYA)和甘油硝酸盐琼脂(G25N)培养基上的菌落形态特征进行初步分类,进而基于核糖体DNA内转录间隔区(rDNA internal transcribed spacer,rDNA ITS)、核糖体大亚基(28Snu-clear ribosomal large subunit rRNA gene,LSU)和核糖体小亚基(18S nuclear ribosomal small subunit rRNA gene,SSU)的基因片段的测序结果,在GenBank中通过BLAST进行分子生物学方面的鉴定研究,并用ITS序列构建系统发育树。通过形态特征及3个基因序列的比对,认为所选取的60株古田红曲霉菌分别归属红色红曲霉菌(M.ruber)、丛毛红曲霉菌(M.pilosus)或紫色红曲霉菌(M.purpureus)3个种。 展开更多
关键词 红曲霉菌 ITS LSU SSU 鉴定
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阿克苏红富士苹果采后腐烂病原真菌的分离与鉴定 认领 被引量:2
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作者 吴思雅 张志东 +1 位作者 庞学群 朱璇 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期205-209,共5页
为了明确阿克苏红富士苹果采后腐烂的主要病原菌种类。通过对阿克苏红富士苹果采后常温和低温条件下自然发病的果实进行病原菌的分离筛选,采用经典微生物分离筛选方法,结合形态学观察、基因间隔序列(Internal transcribed spacer,IT... 为了明确阿克苏红富士苹果采后腐烂的主要病原菌种类。通过对阿克苏红富士苹果采后常温和低温条件下自然发病的果实进行病原菌的分离筛选,采用经典微生物分离筛选方法,结合形态学观察、基因间隔序列(Internal transcribed spacer,ITS)、28S核糖体大亚基序列(large subunit rDNA,rDNA—LSU)及微管蛋白B(Beta tubulin,β-tubulin)序列的测定方法,并进行系统进化树的构建;同时,进行菌株的回接及病斑形态的验证。最终从腐烂的阿克苏红富士苹果病斑中分离出2类真菌,由形态学观察初步确定为链格孢霉(Alternaria sp.)和青霉(Penicillium sp.),通过进一步的多基因序列分析及菌株的回接及病斑的观察鉴定2种真菌分别为交链格孢霉(Alternaria alternata)和扩展青霉(Penicillium expansum)。本研究结果可为新疆阿克苏红富士采后病原真菌的快速鉴定及病害的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 苹果 采后病害 微管蛋白B 基因间隔序列 28S核糖体大亚基序列
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无柄灵芝遗传多样性的SRAP、ITS、TEF1-α和LSU分析 认领 被引量:5
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作者 谭秀梅 阿地力·沙塔尔 +4 位作者 朴春根 薛寒 郭民伟 汪来发 李永 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2667-2677,共11页
【目的】研究来自我国不同地区的45株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS、TEF1-α和LSU多基因分析及SRAP分子标记两种方法,对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和遗传多样性研究。【结果】筛选出8对SRAP引物共扩增出95条条带,其中... 【目的】研究来自我国不同地区的45株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS、TEF1-α和LSU多基因分析及SRAP分子标记两种方法,对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和遗传多样性研究。【结果】筛选出8对SRAP引物共扩增出95条条带,其中具有多态性条带79条,平均多态性比例为82.4%,多态性信息含量(PIC)变幅在0.28-0.43,平均为0.38。ITS、TEF1-α和LSU多基因序列分析结果显示,同一地域的部分菌株聚在一起,亲缘关系较近,而地域相隔较远的部分菌株也聚在同一个进化支上,其亲缘关系也很近,这与SRAP聚类分析结果相吻合。【结论】无柄灵芝菌株遗传多样性较为丰富,其遗传相似性与地理分布存在一定的相关性,ITS、TEF1-α、LSU基因及多基因分析更适合无柄灵芝分类鉴定,而SRAP分子标记更适合于无柄灵芝遗传多样性分析。 展开更多
关键词 无柄灵芝 SRAP ITS TEF1-α LSU 遗传多样性
大尺度不透水面遥感估算方法比较——以京津唐为例 认领 被引量:12
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作者 岳玉娟 周伟奇 +1 位作者 钱雨果 韩立建 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第13期4390-4397,共8页
城市不透水面既是常用的城市化程度指标,也是衡量环境质量的重要指标。采用遥感技术准确提取城市不透水面并分析其空间扩张过程,对生态城市建设具有重要意义。基于Landsat5TM影像,采用NDVI二元法和线性光谱分解法,分别提取北京、天... 城市不透水面既是常用的城市化程度指标,也是衡量环境质量的重要指标。采用遥感技术准确提取城市不透水面并分析其空间扩张过程,对生态城市建设具有重要意义。基于Landsat5TM影像,采用NDVI二元法和线性光谱分解法,分别提取北京、天津和唐山3个城市不透水面信息,并将不透水面估算结果与近同期的ALOS影像提取结果对比验证。结果表明,线性光谱分解法获取的不透水面结果较好,RMSE为20.6%,能有效提取大范围的不透水面信息。 展开更多
关键词 不透水面 遥感 NDVI二元法 线性光谱分解法
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基于多个核基因序列的1株皮伞属菌株的鉴定 认领 被引量:1
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作者 李芳 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第3期24-25,共2页
提取在北京市房山地区野外环境中采集的1株野生菌子实体的基因组DNA,并以此为模板进行ITS、LSU和SSU片段的扩增、测序及比对分析。结果发现,从菌丝体基因组DNA中扩增获得了700 bp左右的ITS片段、850 bp左右的LSU片段和1 800 bp左右的SS... 提取在北京市房山地区野外环境中采集的1株野生菌子实体的基因组DNA,并以此为模板进行ITS、LSU和SSU片段的扩增、测序及比对分析。结果发现,从菌丝体基因组DNA中扩增获得了700 bp左右的ITS片段、850 bp左右的LSU片段和1 800 bp左右的SSU片段,经序列测定及比对,表明该真菌是Marasmiellus属菌株。建立了一种野生真菌快速、准确的鉴定方法。 展开更多
关键词 皮伞属 分子鉴定 ITS LSU SSU
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蒙古口蘑分类地位研究 认领 被引量:8
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作者 董冬 图力古尔 《菌物研究》 CAS 2013年第3期172-175,共4页
利用LSU序列分析技术研究蒙古口蘑分类地位,用最大简约法和最大似然法构建系统发育树。结果表明:蒙古口蘑形成一独立分支,与白蘑属Trciholoma亲缘关系较远,蒙古口蘑应从Trciholoma属中划分出来,放入新属———白丽蘑属(新拟)Leucocal... 利用LSU序列分析技术研究蒙古口蘑分类地位,用最大简约法和最大似然法构建系统发育树。结果表明:蒙古口蘑形成一独立分支,与白蘑属Trciholoma亲缘关系较远,蒙古口蘑应从Trciholoma属中划分出来,放入新属———白丽蘑属(新拟)Leucocalocybe,并命名为蒙古白丽蘑(新拟)Leucocalocybe mongolicum(Imai)X.D.Yu&Y.J.Yao。 展开更多
关键词 蒙古口蘑 分类地位 LSU
线性波谱分离在城市LUCC中的应用 认领
15
作者 周红 刘琳 《城市勘测》 2013年第5期56-59,共4页
以合肥市区为研究区、以2002和2007年两个时相的TM影像为数据源,分别选择5种端元,利用Matlab的非负最小二乘算法,进行线性波谱分离,经综合后进行差值运算得到植被、水体和不透水面丰度变化数据,经与高分辨率图像勾绘结果进行对比... 以合肥市区为研究区、以2002和2007年两个时相的TM影像为数据源,分别选择5种端元,利用Matlab的非负最小二乘算法,进行线性波谱分离,经综合后进行差值运算得到植被、水体和不透水面丰度变化数据,经与高分辨率图像勾绘结果进行对比,证明该方法精度较高,在植被覆盖度方面精度高于原来的NDVI二分法,该方法可用于城市LUCC研究。 展开更多
关键词 线性波谱分离 非负最小二乘算法 混合像元 LUCC
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TM图像杨树林识别的MLC与LSU算法应用分析——以河北省文安县为例 认领 被引量:1
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作者 赵宇鸾 李秀彬 +1 位作者 辛良杰 张英 《地球信息科学学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期252-259,共8页
以Landsat5 TM1、TM2、TM3、TM4、TM5和TM7等图像数据,经预处理后进行植被指数提取和主成分分析,生成13个波段数据集;并用最优指数法(OIF)选取目视解译波段,运用最大似然法(MLC)和线性光谱分解法(LSU)对华北平原农区河北省文安县2... 以Landsat5 TM1、TM2、TM3、TM4、TM5和TM7等图像数据,经预处理后进行植被指数提取和主成分分析,生成13个波段数据集;并用最优指数法(OIF)选取目视解译波段,运用最大似然法(MLC)和线性光谱分解法(LSU)对华北平原农区河北省文安县2007年5月的杨树林地面积信息作了应用分析。结果表明:(1)TM数据中可见光红光波段、近红外波段和中红外波段,以及冠层植被指数和前三个主成分量在杨树信息提取中具有优势;(2)根据波段间相关系数分组计算最优指数值(OIF),可减少计算量;(3)MLC提取杨树林地面积为11 259.84hm2,占研究区总面积的10.95%。经野外实地验证,生产者精度和用户精度分别为84.07%和93.14%,分类和空间制图效果较好;(4)利用亚像元的LSU分析技术,提取地表破碎地类面积,且提取杨树林地面积为13 701.71hm2,达到研究区面积的13.33%(较前者大幅增加)。这可为杨树林资源快速调查监测和林-粮土地合理利用提供参考。 展开更多
关键词 MLC LSU TM影像 杨树林 图像识别
变端元混合像元分解冬小麦种植面积测量方法 认领 被引量:6
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作者 赵莲 张锦水 +2 位作者 胡潭高 陈联裙 李乐 《国土资源遥感》 CSCD 2011年第1期 66-72,共7页
针对线性混合像元分解(Linear Spectral Unmixing,LSU)在端元(Endmember)个数不变情况下常会出现端元分解过剩现象导致分解结果精度不高的问题,以地物分布的聚集性特征为基础,提出了基于格网的变端元线性混合像元分解(Dynamic E... 针对线性混合像元分解(Linear Spectral Unmixing,LSU)在端元(Endmember)个数不变情况下常会出现端元分解过剩现象导致分解结果精度不高的问题,以地物分布的聚集性特征为基础,提出了基于格网的变端元线性混合像元分解(Dynamic Endmember LSU,DELSU)方法。以冬小麦为研究目标,采用Landsat TM图像为实验数据、高分QuickBird图像目视解译冬小麦结果为真值精度评价数据,利用本文提出的DELSU方法进行冬小麦提取。实验结果表明:该方法比最大似然方法、LSU方法更能准确地获取冬小麦面积,在一定程度上吸收了传统分类方法的优点,提高了目标地物的测量精度;同时作为一种改进的LSU方法也适用于其他土地利用/覆盖类型的测量。 展开更多
关键词 DELSU LSU 格网 冬小麦 遥感
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苔藓动物的谱系发生位置与早期分歧时间(英文) 认领
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作者 郝家胜 孙晓燕 +1 位作者 石庆会 杨群 《微体古生物学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期 1-12,共12页
苔藓动物是后生动物系统进化研究中的关键类群之一。作者基于冠轮动物38个代表种类的LSU和SSU rRNA组合基因序列数据,以二胚层动物为外类群,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯分析法,重建了触手冠担轮动物的系统树;同时,基于分子钟的... 苔藓动物是后生动物系统进化研究中的关键类群之一。作者基于冠轮动物38个代表种类的LSU和SSU rRNA组合基因序列数据,以二胚层动物为外类群,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯分析法,重建了触手冠担轮动物的系统树;同时,基于分子钟的方法推测了苔藓动物主要类群的起源与分歧时间。分子系统学的分析结果表明:触手冠动物并非都是单种系群;而苔藓动物则为单种系群,并构成触手冠担轮动物的基部类群。尽管苔藓动物的最早化石记录仅发现于奥陶纪特马豆克期地层中,谱系年代分析结果显示:苔藓动物及其主要谱系在新元古代已经分化;其中,苔藓动物祖先类群的起源时间约为634Ma,基部类群(被唇纲)与其它苔藓动物的分歧时间大约为607Ma。这一结果说明,化石记录始于奥陶纪的苔藓动物根植于新元古代的埃迪卡拉纪,早期祖先类群可能缺乏钙化骨骼,因而不易保存为化石。从而支持关于动物主要门类起源于新元古代的谱系年代学研究成果。 展开更多
关键词 苔藓动物 系统发生 分子古生物学 谱系年代学 LSU RRNA SSU RRNA 化石校准点
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小麦AGPase基因LSU Ⅱ的克隆及反义表达与RNAi干扰载体的构建 认领 被引量:1
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作者 刘超 康国章 +2 位作者 郭天财 岳彩风 沈丙权 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期 1-6,共6页
采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出小麦淀粉合成关键酶—AGPase质体型大亚基(AGPase plastidial large subunit,LSU Ⅱ)cDNA一段特异保守序列,长度为535 bp(GenBank No.EF378944),与DQ409820(小麦)、U66876(大... 采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出小麦淀粉合成关键酶—AGPase质体型大亚基(AGPase plastidial large subunit,LSU Ⅱ)cDNA一段特异保守序列,长度为535 bp(GenBank No.EF378944),与DQ409820(小麦)、U66876(大麦)、AK069296(水稻)和DQ406819(玉米)分别有98%,97%,88%,88%的同源性,表明克隆出了小麦LSU Ⅱ基因的部分cDNA序列。以pWM101质粒表达载体为基础,将LSU Ⅱ反向置于pWM101质粒的CaMV35S启动子之后,构建了LSU Ⅱ的反义表达载体pWM101LSUIIA;另外,用pFGC5941干扰载体构建了LSU Ⅱ基因的RNAi载体pFGC5941 LSU ⅡSA,这些载体的构建为研究LSU Ⅱ基因的功能打下了基础。 展开更多
关键词 小麦 AGPASE LSU 表达载体
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Isolation and identification of Sclerotinia stem rot causal pathogen in Arabidopsis thaliana 认领
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作者 Ai-rong WANG Wen-wei LIN +3 位作者 Xiao-ting CHEN Guo-dong LU Jie ZHOU Zong-hua WANG 《浙江大学学报:B卷英文版》 SCIE CAS CSCD 2008年第10期 818-822,共5页
新茎腐烂疾病被发现在 Fuzhou 的温室在 Arabidopsis 植物上自然地发生,中国。识别它的病原体的无异状,我们进行了从 sclerotia 的一系列真菌的隔离和纯化,植物接种,和子囊和 ascospore 正式就职。在接种以后引起典型 water-soaked... 新茎腐烂疾病被发现在 Fuzhou 的温室在 Arabidopsis 植物上自然地发生,中国。识别它的病原体的无异状,我们进行了从 sclerotia 的一系列真菌的隔离和纯化,植物接种,和子囊和 ascospore 正式就职。在接种以后引起典型 water-soaked 损害并且在 Arabidopsis 植物和文化媒介盘子上两个都生产了 sclerotia 的 isolate,和 sclerotia 能被导致生产 discal apothecia 和 8 双性人起核心作用 ascospores 每子囊。这些疾病症状和真菌的形态学数据表明真菌 Sclerotinia sclerotiorum (解放) de Bary 是为 Arabidopsis 的病原体茎腐烂。证实这,我们进一步由聚合酶链反应(PCR ) 放大了它的大子单元 ribosomal DNA (LSU rDNA ) ,并且在 GenBank 把顺序与已知的 LSU rDNA 序列作比较。结果证明顺序与不同 S 的 LSU rDNAs 分享最高的身份。sclerotiorum 种类。一起拿所有这些数据,我们断定引起了 Arabidopsis 茎的真菌腐烂是 S。sclerotiorum (解放) de Bary。这是 Arabidopsis 被 S 自然地感染的第一份报告。sclerotiorum。 展开更多
关键词 核盘霉 LSU RDNA 真菌 生物研究
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