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Transcriptomic comparison to identify rapidly evolving genes in Braya humilis 预览
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作者 YuMing Wei XiaoFei Ma PengShan Zhao 《寒旱区科学:英文版》 CSCD 2018年第5期428-435,共8页
The Brassicaceae species Braya humilis shows broad adaptation to different climatic zones and latitudes.However,the molecular adaptation mechanism of B.humilis is poorly understood.In China,B.humilis is mainly distrib... The Brassicaceae species Braya humilis shows broad adaptation to different climatic zones and latitudes.However,the molecular adaptation mechanism of B.humilis is poorly understood.In China,B.humilis is mainly distributed on the Qinghai-Tibetan Plateau(QTP)and in the adjacent arid region.Previous transcriptome analysis of B.humilis has revealed that 39 salt and osmotic stress response genes are subjected to purifying selection during its speciation.To further explore the adaptation mechanism of B.humilis to an arid environment,OrthoMCL program was employed in this study and 6,268 pairs of orthologous gene pairs with high confidence were obtained between B.humilis and Arabidopsis thaliana.A comparative evolutionary analysis based on nonsynonymous to synonymous substitution ratio(Ka/Ks)was then conducted.There were 64 pairs exhibiting a Ka/Ks ratio more than 0.5 and among which,three instrumental candidate genes,T2_20487,T2_22576,and T2_13757,were identified with strong selection signatures(Ka/Ks>1).The corresponding A.thaliana orthologs are double-stranded RNA-binding domain protein,MADS-box family protein,and NADH-dehydrogenase subunit 6,which is encoded by mitochondria genome.This report not only demonstrates the adaptation contribution of fast evolving nuclear genes,but also highlights the potential adaptive value of mitochondria gene to the speciation and adaptation of B.humilis toward the extreme environment in an arid region. 展开更多
关键词 Braya humilis positive selection Ka/Ks MITOCHONDRIA gene variation NADH-dehydrogenase SUBUNIT 6
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高氧暴露胎鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞线粒体蛋白质组学初步研究以及ND4动态表达
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作者 李文斌 常立文 +3 位作者 卢红艳 容志惠 汪鸿 刘伟 《中华围产医学杂志》 CAS 2008年第4期258-261,共4页
目的初步分析高氧暴露下肺泡Ⅱ型上皮细胞(alveolar epithelial cell Ⅱ,AECⅡ)线粒体蛋白质表达谱的改变并就NADH脱氢酶亚单位4(NADH—dehydrogenase subunit4,ND4)的动态表达进行研究。方法原代培养胎鼠AECⅡ并随机分为空气组... 目的初步分析高氧暴露下肺泡Ⅱ型上皮细胞(alveolar epithelial cell Ⅱ,AECⅡ)线粒体蛋白质表达谱的改变并就NADH脱氢酶亚单位4(NADH—dehydrogenase subunit4,ND4)的动态表达进行研究。方法原代培养胎鼠AECⅡ并随机分为空气组和高氧组,采用双向电泳检测线粒体蛋白差异性表达,运用RT—PCR和Western blot方法分别检测ND4 mRNA及其蛋白表达。结果与空气组比较,高氧暴露24h导致55种AECⅡ线粒体蛋白质出现差异性表达;高氧暴露6、12、24和48h,原代胎鼠AECⅡ ND4 mRNA(1.20±0.12,1.20±0.12,0.69±0.07和1.54±0.10)表达均较对照组(2.3±0.13,4.61±0.43,2.15±0.14和2.21±0.21)显著降低,差异均有统计学意义(P均〈0.01)。高氧暴露12和24h时,原代胎鼠AECⅡ ND4蛋白表达(1.58±0.21和1.33±0.10)较对照组(2.77±0.19和2.23±0.05)下降,差异有统计学意义(P均〈0.01)。结论高氧暴露导致AECⅡ线粒体(包括呼吸链)功能状态改变可能是促使肺损伤发生发展的重要因素。 展开更多
关键词 高氧症 肺泡 上皮细胞 线粒体蛋白质类 蛋白质组 NADH脱氢酶
高氧对胎鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞NADH脱氢酶亚单位4、5表达的影响 预览 被引量:1
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作者 黄光焰 常立文 +2 位作者 汪鸿 陈燕 蔡成 《浙江医学》 CAS 2010年第10期1478-1482,1485共6页
目的 探讨高氧对胎鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞(AEC Ⅱ)还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4、5表达的影响.方法 原代培养Sprague-Dawley(SD)胎鼠AEC Ⅱ,待其生长至接近汇合状态时随机分为高氧组和正常对照组,高氧组持续暴露... 目的 探讨高氧对胎鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞(AEC Ⅱ)还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4、5表达的影响.方法 原代培养Sprague-Dawley(SD)胎鼠AEC Ⅱ,待其生长至接近汇合状态时随机分为高氧组和正常对照组,高氧组持续暴露于常压高浓度氧中(氧浓度〉90%.CO2浓度5%),正常对照组仍置于5%CO2培养箱中,两组均继续分别培养6、12、24h;采用免疫细胞化学染色SP法检测NADH脱氢酶亚单位4(DN4)蛋白的表达.采取半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)测定ND4、NADH脱氢酶亚单位5(ND5)mRNA的表达.结果 (1)SP法结果显示,与正常对照组比较,高氧组6h AEC Ⅱ ND4蛋白的表达增强,12h AEC Ⅱ ND4蛋白的表达减弱,但差异均无统计学意义(均P〉0.05),24hAEC Ⅱ ND4蛋白的表达显著减弱(P〈0.05);(2)RT-PCR检测结果显示,与正常对照组比较,高氧组6h AEC Ⅱ ND4、ND5 mRNA表达增强,差异均无统计学意义(均P〉0.05).12、24h AECⅡ ND4、ND5 mRNA表达显著减弱(P〈0.05).结论 持续高氧下调胎鼠AEC Ⅱ ND4、ND5 mRNA和AEC Ⅱ ND4蛋白的表达,这种改变可能参与高氧肺损伤的发病过程. 展开更多
关键词 高氧 胎鼠 肺泡Ⅱ型上皮细胞 NADH脱氢酶亚单位4 NADH脱氢酶亚单位5
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高氧暴露早产大鼠肺组织线粒体蛋白质组学初步研究以及ND4动态表达 预览 被引量:1
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作者 李文斌 常立文 +4 位作者 容志惠 卢红艳 汪鸿 刘伟 蔡成 《华中科技大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期 581-584,共4页
目的初步分析高氧暴露下早产大鼠肺组织线粒体蛋白质表达谱的改变,并对还原型尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4(ND4)的动态表达进行研究。方法建立高氧暴露早产大鼠动物模型,采用双向电泳检测线粒体蛋白质差异性表达,运用... 目的初步分析高氧暴露下早产大鼠肺组织线粒体蛋白质表达谱的改变,并对还原型尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4(ND4)的动态表达进行研究。方法建立高氧暴露早产大鼠动物模型,采用双向电泳检测线粒体蛋白质差异性表达,运用RT-PCR和Western blot方法分别检测ND4mRNA及其蛋白表达。结果与空气组比较,高氧暴露4d导致46种肺组织线粒体蛋白质出现差异性表达;高氧暴露1、4和7d,早产大鼠肺组织ND4mRNA和蛋白表达均较空气对照组显著降低(均P〈0.01),10d时,差异则无显著性意义(P〉0.05)。结论高氧暴露导致肺细胞线粒体(包括呼吸链)功能状态改变可能是促使肺损伤发生发展的重要因素。 展开更多
关键词 高氧 早产 线粒体 蛋白质组学 NADH脱氢酶亚单位4
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吗啡耐受大鼠脊髓蛋白质组双向电泳图谱的建立与差异蛋白鉴定 预览
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作者 和立穹 宋宗斌 +6 位作者 邢曼玉 李正弈棋 吴璟 邓美玲 李茂玉 郭曲练 邹望远 《中南大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期392-398,共7页
目的:建立吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织蛋白质组双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)图谱,比较分析吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织中蛋白质组的变化和差异表达,鉴定出差异表达的蛋白质点并进行验证。方法:将16只鞘内置管雄... 目的:建立吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织蛋白质组双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)图谱,比较分析吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织中蛋白质组的变化和差异表达,鉴定出差异表达的蛋白质点并进行验证。方法:将16只鞘内置管雄性SD大鼠随机分为吗啡耐受组(MT组,n=8)和生理盐水组(NS组,n=8),取其腰段脊髓组织蛋白以固相pH梯度等电聚焦(immobilized pH gradients isoelectric focusing,IPGIEF)为第一向,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electroporesis,SDS-PAGE)为第二向进行2-DE,应用PDQuest分析软件对考马斯亮蓝染色的2-DE图谱进行图像分析,对差异蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrixassistedlaser desorption/ionization time of fl ight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析,并利用Mascot查询软件搜索Swiss-Prot数据库进行生物信息学分析。采用蛋白质印迹法验证部分差异蛋白。结果:MT组和NS组大鼠脊髓组织2-DE图谱中各分离出约1 000个清晰的蛋白质点,其中明显差异表达的蛋白有36个。采用MALDI-TOF-MS分析,并利用Mascot查询软件搜索Swiss-Prot数据库,共搜索到14个蛋白质,与NS组比较,MT组中表达下调的蛋白质点有2个,表达上调的蛋白点有12个。采用蛋白质印迹法对其中的NADH脱氢酶及伽玛烯醇化酶蛋白质点进行验证,结果与蛋白质组学结果一致。结论:初步建立了吗啡耐受大鼠脊髓组织蛋白质组双向电泳图谱,证明吗啡耐受可以引起脊髓中多种蛋白质的表达改变。 展开更多
关键词 吗啡耐受 蛋白质组学 NADH脱氢酶 伽玛烯醇化酶
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ND3基因突变导致的线粒体脑肌病重叠综合征二例 预览 被引量:2
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作者 魏妍平 崔丽英 彭斌 《脑与神经疾病杂志》 2016年第10期626-630,共5页
目的 孤立的线粒体电子传递链复合物Ⅰ缺陷是线粒体病常见的原因之一,可导致几种独特的临床综合征。方法 本文报道2例NADH脱氢酶(ND)基因突变导致的线粒体脑肌病的临床资料,分析该2例线粒体脑肌病患者的临床表现,头颅影像学,血乳... 目的 孤立的线粒体电子传递链复合物Ⅰ缺陷是线粒体病常见的原因之一,可导致几种独特的临床综合征。方法 本文报道2例NADH脱氢酶(ND)基因突变导致的线粒体脑肌病的临床资料,分析该2例线粒体脑肌病患者的临床表现,头颅影像学,血乳酸,血生化,血氨基酸,尿有机酸等,脑电图(EEG),肌电图(EMG)和神经传导速度,以及线粒体全基因二代测序和线粒体相关核基因的检查。结果 例1患者部分症状符合线粒体脑肌病伴乳酸血症和卒中样发作(MELAS),部分症状符合伴破碎红纤维肌阵挛癫痫(MERRF)。该患者头颅MRI除MELAS常见的皮质病变外,还可见中脑和四叠体对称性异常信号,符合Leigh综合征(LS)影像学表现。线粒体基因二代测序发现MTND3,10158T>C突变。例2患者临床表现完全符合MELAS的临床特征,但头颅MRI可见中脑红核双侧对称性病变,又符合LS的影像学特征。线粒体全基因二代测序发现ND3,10191T>C突变。结论 对于难以解释的神经系统症状和体征,尤其有多系统受累表现,即使临床表现不符合某种独特的线粒体病综合征,也要提高警惕,避免漏诊。 展开更多
关键词 线粒体脑肌病 NADH脱氢酶 基因突变 孤立复合物Ⅰ缺陷 二代测序
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知柏地黄汤对解脲脲原体感染模型大鼠精子线粒体NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达的影响
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作者 宾东华 何清湖 +3 位作者 韩忠 陈虹历 李迎秋 刘朝圣 《中国男科学杂志》 CAS CSCD 2016年第7期3-7,共5页
目的:研究知柏地黄汤对解脲脲原体(UU)感染模型大鼠精子线粒体NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达的影响。方法取体质量为(220±10)g雄性SD大鼠80只,随机分成假手术组、模型组、中药组(知柏地黄汤)、西药组(强力霉素)、... 目的:研究知柏地黄汤对解脲脲原体(UU)感染模型大鼠精子线粒体NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达的影响。方法取体质量为(220±10)g雄性SD大鼠80只,随机分成假手术组、模型组、中药组(知柏地黄汤)、西药组(强力霉素)、中西药组(知柏地黄汤+强力霉素),造模成功后,假手术组与模型组给予等量的生理盐水灌胃,治疗组(中药组、西药组和中西药组)给予相应的药物灌胃,连续用药21d。末次给药24h后取标本,采用常规精液检测法检测精液质量,RT-PCR法检测精子NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达。结果假手术组、模型组、中药组、西药组、中西药组大鼠精子NADH脱氢酶mRNA表达水平分别为0.44750±0.017078、0.24750±0.015000、0.34250±0.017078、0.36500±0.012910、0.39400±0.012100;ATP合成酶mRNA表达水平分别为0.36500±0.012910、0.27250±0.009574、0.35250±0.018930、0.34750±0.017078、0.39500±0.012910;直线速度分别为(12.93±1.08)μm/s、(6.24±1.13)μm/s、(12.78±0.92)μm/s、(10.43±1.32)μm/s、(13.54±1.16)μm/s;平均速度分别为(20.32±2.08)μm/s、(12.48±3.54)μm/s、(20.48±2.16)μm/s、(17.12±3.15)μm/s、(21.72±1.83)μm/s。中西药组NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达水平与模型组、中药组、西药组比较均有上升,差异均有统计学意义(P<0.01),中西药组精子运动速度与模型组、中药组、西药组比较均上升,差异均有统计学意义(P<0.01)。结论 UU感染大鼠模型精子运动速度及NADH脱氢酶mRNA、ATP合成酶mRNA表达水平变化,提示其可能是UU感染所致不育症的机制之一。 展开更多
关键词 知柏地黄汤 解脲支原体 精子 NADH脱氢酶 ATP合成酶
大鳞副泥鳅部分线粒体基因的序列分析研究 预览
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作者 韩晓磊 王丹 +4 位作者 徐涛 朱绿定 王富凯 韩曜平 朱庆华 《常熟理工学院学报》 2015年第2期110-115,共6页
通过PCR和DNA测序技术,获得了大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)线粒体基因组的部分序列,所得4段序列长度共计11552 bp,包括5个蛋白质编码基因(ND1、ND2、ND4、ND4L、ND6和Cytb),14个tRNA基因.本研究获得序列的碱基组成为A 2... 通过PCR和DNA测序技术,获得了大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)线粒体基因组的部分序列,所得4段序列长度共计11552 bp,包括5个蛋白质编码基因(ND1、ND2、ND4、ND4L、ND6和Cytb),14个tRNA基因.本研究获得序列的碱基组成为A 28.9%、C 27.7%、G 15.7%、T 27.7%,可看出(A+T)>(C+G);测出的蛋白编码基因的碱基都有一个明显的现象,就是G的含量很明显的少于其他碱基,而C的含量都比较高,并且(A+T)>(C+G),这样的结果表现出明显的反G偏倚和碱基组成偏好性.将大鳞副泥鳅Cytb序列与GenBank其他6种鱼类的Cytb序列进行%对,表明大鳞副泥鳅与洛东江高丽鳅和俄罗斯泥鳅亲缘关系最近.用NJ法构建7种鱼类的进化关系树,结果表明:大鳞副泥鳅与洛东江高丽鳅和俄罗斯泥鳅最先聚类,再与其他鳅科鱼类相聚,最后与鲤科鱼类斑马鱼相聚,结果与传统分类一致. 展开更多
关键词 大鳞副泥鳅 线粒体DNA NADH还原酶复合体 CYTB
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线粒体ND2基因C5178A多态性与2型糖尿病患者并发心脑血管病的关系评价 被引量:5
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作者 郦卫星 吴含 吕建新 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期519-522,共4页
目的探讨线粒体DNA(mtDNA)ND2基因C5178A多态性与2型糖尿病(T2DM)患者并发心脑血管病的关系。方法本研究属于病例对照研究。选择2010至2011年期间在浙江省人民医院住院的448例无血缘关系的T2DM患者,男274例,女174例,采用PCR产物... 目的探讨线粒体DNA(mtDNA)ND2基因C5178A多态性与2型糖尿病(T2DM)患者并发心脑血管病的关系。方法本研究属于病例对照研究。选择2010至2011年期间在浙江省人民医院住院的448例无血缘关系的T2DM患者,男274例,女174例,采用PCR产物直接测序法对所有患者的mtDNAND2基因5178位点进行测序,同时收集每例患者的临床资料。根据测序结果分为5178C和5178A两组,检测所有患者的体重指数、血压、血脂、血糖,通过t检验和χ2检验,分析这些指标在T2DM患者5178C基因组和T2DM患者5178A基因组两组之间的差异以及不同性别的患者中的差异。结果在448例T2DM患者中共检测出348例5178C,100例5178A,mtDNA5178A组的T2DM患者收缩压为(124.6±9.0)mmHg,高密度脂蛋白(HDL)为(1.3±0.2)mmol/L,而5178C组的患者收缩压为(127.8±10.7)mmHg、HDL为(1.2±0.3)mmol/L,两组之间比较5178A组收缩压降低,HDL升高(t=2.700,P=0.007;t=2.968,P=0.003)。5178A组脑梗死的发生率为8.0%(8/100),5178C组脑梗死的发生率为21.0%(73/348),脑梗死的发生率在两组之间的差异有统计学意义(χ2=8.832,P=0.003)。C5178A的变异在不同性别之间的分布没有统计学差异(P〉0.05),进一步分析发现在女性T2DM患者中,5178A和5178C组的三酰甘油水平分别为(1.5±0.8)mmol/L和(1.8±1.0)mmol/L。收缩压分别为(123.6±6.6)mmHg和(128.0±9.0)mmHg,两组之间比较5178A组女性患者三酰甘油和收缩压明显降低(t=2.601,P=0.011;t=2.887,P=0.004)。女性5178A患者脑梗死的发生率为5.3%(2/38),5178C女性患者脑梗死发生率为21.3%(29/136),两组之间的差异有统计学意义(χ2=5.232,P=0.022)。在男性T2DM患者中,5178A组和5178C组的脑梗死发生率分别为9.7%(6/62)和20.7%(44/212),H 展开更多
关键词 糖尿病血管病变 糖尿病 2型 脑梗死 NADH脱氢酶 DNA 线粒体 态现象 遗传
AP—PCR结合进化树分析在幽门螺杆菌地域起源特征研究中的价值 被引量:2
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作者 刘炯 王忠灿 +6 位作者 金鑫鑫 汪芳裕 陈春燕 王震凯 朱乐明 陆恒 施慧 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2012年第3期 197-203,共7页
目的探讨随机引物PCR(Arbitrary primerPCR,AP—PCR)结合克隆测序及生物信息学分析等方法在研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hpylori)菌株地域起源特征中的价值和意义。方法针对临床分离培养的Hpylori菌株的基因组DNA,采用一... 目的探讨随机引物PCR(Arbitrary primerPCR,AP—PCR)结合克隆测序及生物信息学分析等方法在研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hpylori)菌株地域起源特征中的价值和意义。方法针对临床分离培养的Hpylori菌株的基因组DNA,采用一组10nt的寡核苷酸引物进行随机PCR扩增,选取相对保守的片段进行回收、克隆及测序,测序的基因序列提交GenBank数据库进行序列相似性的BLAST比对,收集BLAST比对得到的同源性较高不同地域来源螺杆菌的对应序列,用ClustalX软件进行排序,采用Mega4.0软件中的邻位相连法(Neighbor-joining)和最大简约法(Maximum—parsimony)进行进化树分析。结果随机引物扩增及筛选克隆测序得到的基因产物为NADH脱氢酶G和H亚单位的部分编码序列,与27株不同地域来源H.pylori及1株猫科动物来源螺杆菌菌株的同源性均高达90%以上,表明Hpylori中NADH脱氢酶基因序列为保守结构,进化树分析显示:采用AP.PCR方法得到的Hpylori临床菌株的基因序列,显示出东亚菌株来源的遗传特征,与具有东亚菌株特征的美洲秘鲁Sat464和Shi470菌株、韩国的52、51菌株、日本的1757菌株遗传距离较近,与南亚、欧洲菌株距离较远,与非洲的SouthAffica7菌株和猫科动物来源的Sheeba菌株的遗传距离最远。结论不仅某些特殊基因可以反映地域差异,随机定位相对保守的基因片段同样可以反映Hpylori的地域起源特征。AP—PCR、测序等技术方法与进化树分析相结合是探讨Hpylori地域起源特征的一种更为便捷有效的新方法。 展开更多
关键词 随机引物PCR 幽门螺杆菌 NADH脱氢酶 进化树分析
代谢综合征大鼠肝细胞线粒体损伤和mtDNA编码蛋白的表达变化
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作者 孙鲁宁 赵明沂 +3 位作者 宋晓宇 郑宁宁 李罡 张海鹏 《解剖科学进展》 CAS 2011年第3期271-275,共5页
目的通过观察代谢综合征(MS)大鼠肝细胞线粒体的损伤性改变及部分线粒体基因(mtDNA)编码蛋白的表达情况,探讨线粒体结构和功能改变的可能机制及其在MS发病中的作用。方法采用经典的饮食诱导法建立喂养型MS大鼠模型。动态监测大鼠... 目的通过观察代谢综合征(MS)大鼠肝细胞线粒体的损伤性改变及部分线粒体基因(mtDNA)编码蛋白的表达情况,探讨线粒体结构和功能改变的可能机制及其在MS发病中的作用。方法采用经典的饮食诱导法建立喂养型MS大鼠模型。动态监测大鼠收缩压(SBP)、空腹血糖(FBG)、甘油三酯(TG)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL—C)的变化,确认为MS的大鼠处死后分离肝细胞。电镜观察肝细胞线粒体结构改变,并对线粒体损伤进行半定量评分;WesternBlotting方法检测mtDNA编码蛋白NADH脱氢酶1(NDl)、细胞色素c氧化酶2(COX2)和线粒体复合体Ⅲ亚单位1的含量。结果电镜结果显示,MS大鼠肝细胞线粒体肿胀,呈空泡样变,嵴减少或消失,损伤级别为3.11±O.31,对照组损伤级别为0.30±0.03,二者差异显著(P〈O.01)。MS大鼠肝细胞NDl和COX2的表达较对照组明显减少(P〈O.05),线粒体复合体Ⅲ亚单位1的表达较对照组明显增加(P〈O.05)。结论mtDNA编码蛋白NDl、COX2和线粒体复合体Ⅲ亚单位1的表达异常可造成线粒体呼吸链电子传递障碍,使“电子漏”增多,自由基产生过多,从而引起线粒体的结构损伤和氧化磷酸化功能障碍,最终导致物质和能量代谢紊乱,这可能是MS的发病机制之一。 展开更多
关键词 代谢综合征 线粒体 NADH脱氢酶 细胞色素C氧化酶 线粒体复合体Ⅲ 大鼠
^60Co γ射线诱导线粒体复合体Ⅰ亚基因表达改变的研究 预览 被引量:1
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作者 李玉文 封江彬 +3 位作者 陆雪 范莉 陈德清 刘青杰 《辐射防护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期289-293,299共6页
为探讨电离辐射对人淋巴细胞线粒体复合物Ⅰ亚基因表达的影响,采用1、3、5、8和10Gy~(60)Co γ射线分别照射指数生长期的人淋巴细胞永生化细胞株,8h后利用逆转录PCR(RT-PCR)摸索各基因的最佳实验条件,进而利用实时荧光定量PCR(Real... 为探讨电离辐射对人淋巴细胞线粒体复合物Ⅰ亚基因表达的影响,采用1、3、5、8和10Gy~(60)Co γ射线分别照射指数生长期的人淋巴细胞永生化细胞株,8h后利用逆转录PCR(RT-PCR)摸索各基因的最佳实验条件,进而利用实时荧光定量PCR(Real-timePCR)方法定量检测各基因表达变化,观察辐射对复合物Ⅰ基因表达影响的剂量效应关系;同时以5Gy~(60)Co γ射线照射人淋巴细胞后,分别于不同时间点(0.5、4、8、12、24、48和72h),同样通过RT-PCR和Real-timePCR方法检测各基因表达的变化,观察其时效关系。结果表明,在mRNA水平上,线粒体复合物Ⅰ基因表达总体上调。剂量效应关系方面,ND2基因在8Gy剂量范围内呈现出随剂量增加基因表达增强的趋势;时效关系方面,7种亚基均在5Gy剂量照射后4h左右表达增强最显著,且大部分基因可持续高表达至48或72h左右。说明电离辐射可以诱导人淋巴细胞线粒体复合物Ⅰ基因表达的改变,表达总体上调。 展开更多
关键词 60Co Γ射线 人淋巴细胞株 线粒体 NADH脱氢酶 基因表达
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小分子干扰RNA抑制高氧暴露下人肺腺癌A549细胞中的硫氧还蛋白-2对还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位1、细胞色素C氧化酶I表达的影响
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作者 蔡成 常立文 +4 位作者 李文斌 陈燕 单瑞艳 刘伟 潘睿 《中华围产医学杂志》 CAS 2010年第2期128-133,共6页
目的探讨小分子干扰RNA(small interference RNA,siRNA)抑制高氧暴露下人肺腺癌A549细胞中硫氧还蛋白-2(thioredoxin-2,Trx-2)对还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NADH)脱氢酶亚单位1(NADHdehyd... 目的探讨小分子干扰RNA(small interference RNA,siRNA)抑制高氧暴露下人肺腺癌A549细胞中硫氧还蛋白-2(thioredoxin-2,Trx-2)对还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NADH)脱氢酶亚单位1(NADHdehydrogenase subunit1,NDl)及细胞色素c氧化酶I(eytochrome C oxidase I,COXI)表达的影响。方法体外传代培养A549细胞系,将Trx-2序列特异性的SiRNA转染A549细胞,随机分为无干扰空气组、无干扰高氧组、干扰后空气组与干扰后高氧组。分别于高氧或空气暴露12、24、48h提取A549细胞总RNA和蛋白。采用逆转录一聚合酶链反应技术测定Trx-2、ND1和COX I mRNA水平的表达,Western印迹技术检测Trx-2蛋白的表达。结果(1)序列特异性SiRNA可显著抑制Trx-2表达。(2)无干扰高氧组24hTrx-2mRNA水平为0.7799±0.1249,显著高于无干扰空气组(0.4424±0.1140)(P〈0.05)。干扰后高氧组24hTrx-2mRNA水平为0.2774±0.0174、48h为0.2587±0.0069,均显著低于干扰后空气组和无干扰高氧组(P〈0.05)。(3)无干扰高氧组24hND1 mRNA水平为0.6609±0.0368,显著低于无干扰空气组(0.8898±0.1049)(P〈0.05)。干扰后高氧组12hND1 mRNA水平为0.8848±0.0135,显著高于干扰后空气组(P〈0.05)。干扰后高氧组48hND1 mRNA水平为0.3808土0.0937,均显著低于干扰后空气组和无干扰高氧组(P〈0.05)。(4)无干扰高氧组12hCox 1 mRNA水平为1.7313±0.4331、24h为2.1929±0.6722、48h为2.0754±0.2584,均显著高于无干扰空气组(P〈0.05)。结论ND1、COXI参与高氧肺损伤发生发展过程,Trx-2对高氧肺损伤线粒体起重要的保护作用。 展开更多
关键词 RNA 小分子干扰 硫氧还蛋白质类 NADH脱氢酶 电子传递复合物IV 高氧症 肺疾病
具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶功能的家蚕l(3)neo18基因的克隆与表达特征 预览
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作者 王更先 鲁延军 +2 位作者 司马杨虎 张升祥 徐世清 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期 58-65,共8页
果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变,编码的蛋白质具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶(ND)的功能。利用生物信息学、cDNA末端快速扩增(RACE)和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等方法,克隆了家蚕l(3)neo1... 果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变,编码的蛋白质具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶(ND)的功能。利用生物信息学、cDNA末端快速扩增(RACE)和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等方法,克隆了家蚕l(3)neo18同源基因,分析了基因结构与表达谱。Bm-l(3)neo18基因(EU826676)的cDNA全长为868 bp,由573 bp的完整开放读码框(ORF)序列、25 bp的5′端非翻译区序列(5′-UTR)和251 bp的3′端非编码区序列(3′-UTR)组成,编码蛋白质为190个氨基酸残基,分子质量22.7 kD,pI 9.60。Bm-l(3)neo18基因由3个外显子和2个内含子组成,定位于家蚕第3染色体,位于nscaf2930的1 203.8-1 205.6 knt。Bm-l(3)neo18蛋白质在1-185氨基酸残基位置为ND的SGDH亚基保守区,在61-83氨基酸残基位置具有一个保守的跨膜区域。采用Clustal W进行多序列比对发现,Bm-l(3)neo18与埃及伊蚊等昆虫ND具有50%以上的蛋白质同源性,ND的保守区域高度一致,NJ法分子进化分析也显示Bm-l(3)neo18与昆虫ND进化上同源。该基因除在家蚕卵期的表达量较低外,在幼虫、蛹和蛾期均有较高表达,且存在组织差异性。 展开更多
关键词 家蚕 l(3)neo18基因 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶 基因表达
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猪囊尾蚴线粒体NADH脱氢酶的基因克隆 预览 被引量:7
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作者 张莉 刘殿武 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期 34-36,共3页
目的研究猪囊尾蚴线粒体NADH脱氢酶亚单位1基因的结构特点.方法提取猪囊尾蚴mRNA,反转录合成cDNA,构建cDNA文库.用兔抗囊尾蚴抗血清筛选文库,得到阳性克隆,将其亚克隆到pBluescript SK质粒中测序,并与GenBank中核苷酸序列进行同源性分析... 目的研究猪囊尾蚴线粒体NADH脱氢酶亚单位1基因的结构特点.方法提取猪囊尾蚴mRNA,反转录合成cDNA,构建cDNA文库.用兔抗囊尾蚴抗血清筛选文库,得到阳性克隆,将其亚克隆到pBluescript SK质粒中测序,并与GenBank中核苷酸序列进行同源性分析.结果与结论 3次筛选得到1个阳性克隆,其长度为1082bp.其中1~578 bp为开放阅读框,编码猪囊尾蚴线粒体NADH脱氢酶亚单位1的192个氨基酸残基,579~1082 bp为tRNA-Asn、tRNA-Ile与tRNA-Pro的基因编码区. 展开更多
关键词 猪囊尾蚴 线粒体 NADH脱氢酶 基因克隆 CDNA文库
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妊娠高血压综合征患者胎盘还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶基因的表达
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作者 杨丽媛 姚元庆 +2 位作者 时永全 王新 师娟子 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期 660-662,共3页
目的研究还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶基因在妊娠高血压综合征(妊高征)患者胎盘组织中的表达,了解其在妊高征发病中的作用.方法采用32P标记的NADH脱氢酶cDNA探针斑点印迹杂交方法,对10例正常妊娠妇女(对照组)及10例中、重度... 目的研究还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶基因在妊娠高血压综合征(妊高征)患者胎盘组织中的表达,了解其在妊高征发病中的作用.方法采用32P标记的NADH脱氢酶cDNA探针斑点印迹杂交方法,对10例正常妊娠妇女(对照组)及10例中、重度妊高征患者(妊高征组)的胎盘组织总RNA进行检测,以图像处理系统测量每个杂交点的平均吸光度(A)值,比较两组胎盘组织NADH脱氢酶mRNA水平.结果妊高征组和对照组胎盘组织NADH脱氢酶平均A值分别为21±6、56±16;妊高征组胎盘组织NADH脱氢酶mRNA的表达明显高于对照组,两组比较,差异有显著性(P<0.05).结论妊高征患者胎盘组织NADH脱氢酶基因表达的增加,可能在妊高征发病中起一定作用. 展开更多
关键词 妊娠高血压综合征 心血管 胎盘 NADH脱氢酶
NADPH—细胞色素C还原酶参与Graves病甲状腺过氧化氢生物合成 预览 被引量:2
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作者 黄国良 林芬 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第7期 636,646,共2页
目的:探讨NADPH-细胞色素C还原酶(CR)在Craves病甲状腺过氧化氢(H2O2)生物合成中作用。方法;应用高香草酸荧光分析等技术测定Graves病和正常甲状腺H2O2浓度和CR活性,观察CR活性变化对H2O2... 目的:探讨NADPH-细胞色素C还原酶(CR)在Craves病甲状腺过氧化氢(H2O2)生物合成中作用。方法;应用高香草酸荧光分析等技术测定Graves病和正常甲状腺H2O2浓度和CR活性,观察CR活性变化对H2O2合成的影响。结果:Graves病甲状腺CR活性和H12O2水平平均明显高于正常而H2O酶活性无改变。加CR抑制剂对氯汞苯甲酸后,Graves病笔正常甲状腺CR活性降低84%,同时H2O 展开更多
关键词 过氧化氢 GRAVES病 NADPH-细胞色素C还原酶
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镁离子对阿霉素线粒体毒性的防护作用 预览 被引量:10
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作者 徐霆 江文 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第4期 614-618,共5页
利用ESR技术研究了阿霉素与心肌线粒体的相互作用及Mg^2+的防护作用。结果表明:在线粒体及亚线粒体体系,Mg^2+可有效地抑制阿霉素半醌自由基产生,在一定浓度范围内抑制效果依赖于Mg^2+的浓度。另外,Mg^2+显... 利用ESR技术研究了阿霉素与心肌线粒体的相互作用及Mg^2+的防护作用。结果表明:在线粒体及亚线粒体体系,Mg^2+可有效地抑制阿霉素半醌自由基产生,在一定浓度范围内抑制效果依赖于Mg^2+的浓度。另外,Mg^2+显著抑制阿霉素诱导产生的线粒体脂质过氧化。在亚线粒体体系,我们观察到阿霉素半醌自由基的固定化信号,并发现Mg^2+能明显延缓固定化信号出现。 展开更多
关键词 阿霉素 抗癌药 镁离子 线粒体 毒性
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大鼠乌头碱中毒心肌酶的研究(Ⅲ)——线粒体NADHD的组织化学和细胞化学研究 预览 被引量:14
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作者 梁强荣 刘明俊 胡炳蔚 《中国法医学杂志》 CSCD 1991年第2期84-86,133共4页
本文用组织化学和细胞化学方法分别对乌头碱染毒后不同时间组大鼠心肌NADHD进行了光镜和电镜观察。结果表明:乌头碱染毒后30分钟,2小时和4小时的大鼠心肌NADHD活性明显降低并有定位改变,而染毒后12、24小时的心肌NADHD活性有所回升。... 本文用组织化学和细胞化学方法分别对乌头碱染毒后不同时间组大鼠心肌NADHD进行了光镜和电镜观察。结果表明:乌头碱染毒后30分钟,2小时和4小时的大鼠心肌NADHD活性明显降低并有定位改变,而染毒后12、24小时的心肌NADHD活性有所回升。证实产能较多的NADH氧化呼吸链在乌头碱中毒时受到抑制。 展开更多
关键词 乌头碱 还原型尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(NADHD)
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基于线粒体ND6基因检测犬感染细粒棘球绦虫的粪便PCR方法 预览
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作者 詹佳飞 宋宏宇 +5 位作者 王凝 郭承 李春燕 谢跃 古小彬 杨光友 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期626-632,共7页
目的旨在了解动物包虫病流行区内犬细粒棘球绦虫的感染情况。方法本研究利用Qiagen DNeasy Powersoil试剂盒对犬粪提取DNA,并从细粒棘球绦虫线粒体全基因组中筛选出完整线粒体ND6基因作为靶基因,建立一种可对犬粪中细粒棘球绦虫同时进... 目的旨在了解动物包虫病流行区内犬细粒棘球绦虫的感染情况。方法本研究利用Qiagen DNeasy Powersoil试剂盒对犬粪提取DNA,并从细粒棘球绦虫线粒体全基因组中筛选出完整线粒体ND6基因作为靶基因,建立一种可对犬粪中细粒棘球绦虫同时进行检测及基因分型的PCR方法。结果该法特异性很高,仅能扩增出细粒棘球绦虫的目的条带而对照组均无条带扩增。其灵敏度达到4pg的DNA含量。当犬人工感染约50000只原头蚴时,该法最早可以扩增出感染第13d粪便中的ND6目的基因。同时,对40份随机采自包虫病流行区的待检犬粪进行PCR检测,共有6份样品可扩增出目的条带且其基因型均属G1型,其检测及分型结果均与经典基因分型依据(COX1基因片段)的结果一致。结论本研究建立的粪便PCR方法具有很高的特异性和灵敏度,并可用于检测犬的细粒棘球绦虫早期感染情况。对于PCR检测阳性者,其产物经测序分析后也可用于细粒棘球绦虫的基因分型及种群遗传结构的分析研究。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 线粒体ND6基因 PCR检测 基因分型
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