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网状Meta分析中对R软件nlme程序包的开发与应用 认领
1
作者 王凤岐 《软件工程》 2017年第1期30-32,共3页
nlme程序包是以广义最小二乘法和线性混合效应模型的基础上研发的,能够对R软件进行广义线性和非线性混合的Meta分析。Nlme程序包能够对网状Meta进行分析,在此过程中要转换数据,这样才能够使其为对数值进行之后运算。本文主要介绍了R软件... nlme程序包是以广义最小二乘法和线性混合效应模型的基础上研发的,能够对R软件进行广义线性和非线性混合的Meta分析。Nlme程序包能够对网状Meta进行分析,在此过程中要转换数据,这样才能够使其为对数值进行之后运算。本文主要介绍了R软件nlme程序包的网状Meta分析过程,并且详细介绍了数据转化的过程步骤。 展开更多
关键词 网状Meta R软件 nlme程序包 开发和应用
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2011-2019年四川省手足口病时空特征分析 认领
2
作者 李羚 许军红 +5 位作者 蔺鸿 刘润友 张云娜 李蔚 彭艳秋 杨长虹 《预防医学情报杂志》 CAS 2020年第10期1271-1275,1284,共6页
目的了解四川省近年来手足口病时空特征,探究疫情变化特点,为手足口病防控提供更科学的依据。方法采用描述性流行病学方法,对四川省2011-2019年间报告手足口病例进行分析。手足口病热图采用R 3.6.1统计软件绘制,地区分布地图采用Arcgis ... 目的了解四川省近年来手足口病时空特征,探究疫情变化特点,为手足口病防控提供更科学的依据。方法采用描述性流行病学方法,对四川省2011-2019年间报告手足口病例进行分析。手足口病热图采用R 3.6.1统计软件绘制,地区分布地图采用Arcgis 10.2软件进行制作。结果2011-2019年四川省手足口病年均发病率为95.01/10万,年均死亡率为0.018/10万,发病率呈现波动上升的趋势,偶数年较奇数年发病率高,死亡率总体呈下降趋势;发病有明显的季节性和双峰性,高峰时间分别为4-7月和10-12月;各地区优势发病高峰略有不同,攀枝花市发病高峰较其他市州晚1个月,呈现晚峰;2011-2019年各市(州)均有手足口病病例报告,高发地区以成都市为中心向四周不断增加。结论2011-2019年四川省手足口病发病具有明显的周期性和季节性,疫情强度和范围不断增加。各市(州)月分布模式略有不同,应结合各市(州)发病特点,进一步探索不同发病模式的影响因素,控制手足口病的流行。 展开更多
关键词 手足口病 时空特征 高峰时间 R软件
基于CNKI数据库中医药治疗痔分析 认领
3
作者 钟雄东 古妮 +1 位作者 庞飞 陈雷 《医院与医学》 2020年第1期60-67,共8页
目的为了探索中医药在痔的治疗领域的现状、热点和趋势。方法借助CiteSpace.5.6.R2软件在中国知网数据库以主题词为“痔”“中医药”“治疗”进行检索,并且分别选择关键词、作者、机构来运算软件,最后绘制可视化图谱。结果根据检索结果... 目的为了探索中医药在痔的治疗领域的现状、热点和趋势。方法借助CiteSpace.5.6.R2软件在中国知网数据库以主题词为“痔”“中医药”“治疗”进行检索,并且分别选择关键词、作者、机构来运算软件,最后绘制可视化图谱。结果根据检索结果,总共有2216篇文献被纳入研究,关键词以频数从高到低排序主要是混合痔、中药熏洗、痔疮、内痔、中药、坐浴、中药坐浴、疼痛等,并生成13个聚类群;痔术后、熏洗、术后疼痛成为近年来的突现词;主要研究单位是山东省肥城市中医院肛肠分院、上海中医药大学、湖南省中医院等。结论中医药治疗痔的文献量呈现增多趋势,以中药熏洗的研究文献所占比值较大;中药熏洗治疗痔术后疼痛是中医药治疗痔领域的热点研究方向;主要的研究单位集中在中医药科研机构或中医院。 展开更多
关键词 痔 CNKI数据库 CiteSpace.5.6.R2软件 中医药 中药熏洗
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连续重评估方法无差异区间半宽度δ的校正与毒性概率估计 认领
4
作者 黄亚芳 谢文杰 《中国药物评价》 2019年第5期397-400,共4页
本文介绍了抗癌新药研发中Ⅰ期临床试验连续重评估方法(Continual reassessment method,CRM)中无差异区间半宽度δ的概念与校正方法。利用R软件,详细阐述了半宽度δ校正的实施步骤,最后,介绍了CRM毒性概率的生成方法和模型验证,旨在为... 本文介绍了抗癌新药研发中Ⅰ期临床试验连续重评估方法(Continual reassessment method,CRM)中无差异区间半宽度δ的概念与校正方法。利用R软件,详细阐述了半宽度δ校正的实施步骤,最后,介绍了CRM毒性概率的生成方法和模型验证,旨在为今后我国抗癌新药研发Ⅰ期临床试验设计提供方法学支持。 展开更多
关键词 连续重评估方法 无差异区间 毒性概率 Ⅰ期试验 R软件
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抗癌药Ⅰ期临床试验连续重评估方法及R软件实现 认领 被引量：1
5
作者 黄亚芳 谢文杰 《中国药物评价》 2019年第4期294-299,共6页
介绍了抗癌药Ⅰ期临床试验连续重评估方法(Continual reassessment method,CRM)的原理与实施步骤,以单骨架CRM为例,详细阐述了其在R软件中的实现方法,旨在为我国抗癌药Ⅰ期临床试验研究者和申办方提供生物统计学支持及技术参考。
关键词 Ⅰ期试验 抗癌药 连续重评估方法 R软件 贝叶斯统计
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The Analysis of Human Development Index (HDI) for Categorizing the Member States of the United Nations (UN) 认领
6
作者 Sivarajah Mylevaganam 《应用科学(英文)》 2017年第12期661-690,共30页
To categorize the nations to reflect the development status, to date, there are many conceptual frameworks. The Human Development index (HDI) that is published by the United Nations Development Programme is widely acc... To categorize the nations to reflect the development status, to date, there are many conceptual frameworks. The Human Development index (HDI) that is published by the United Nations Development Programme is widely accepted and practiced by many people such as academicians, politicians, and donor organizations. However, though the development of HDI has gone through many revisions since its formulation in 1990, even the current version of the index formulation published in 2016 needs research to better understand and to gap-fill the knowledge base that can enhance the index formulation to facilitate the direction of attention such as release of funds. Therefore, in this paper, based on principal component analysis and K-means clustering algorithm, the data that reflect the measures of life expectancy index (LEI), education index (EI), and income index (II) are analyzed to categorize and to rank the member states of the UN using R statistical software package, an open source extensible programming language for statistical computing and graphics. The outcome of the study shows that the proportion of total eigen value (i.e., proportion of total variance) explained by PCA-1 (i.e., first principal component) accounts for more than 85% of the total variation. Moreover, the proportion of total eigen value explained by PCA-1 increases with time (i.e., yearly) though the amount of increase with time is not significant. However, the proportions of total eigen value explained by PCA-2 and PCA-3 decrease with time. Therefore, the loss of information in choosing PCA-1 to represent the chosen explanatory variables (i.e., LEI, EI, and II) may diminish with time if the trend of increasing pattern of proportion of total eigen value explained by PCA-1 with time continues in the future as well. On the other hand, the correlation between EI and PCA-1 increases with time although the magnitude of increase is not that significant. This same trend is observed in II as well. However, in contrast to these observations, the correlation bet 展开更多
关键词 Human DEVELOPMENT Index Economy Sustainability UNITED Nations DEVELOPMENT PROGRAMME Education Life EXPECTANCY Per Capita Income JavaScript R Statistical Software Principal Component ANALYSIS K-Means Clustering HOPKINS Statistic
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概率论直观教学与R统计软件实现的探索 认领
7
作者 吕书龙 刘文丽 +2 位作者 涂淑珍 陈凤德 梁飞豹 《龙岩学院学报》 2015年第5期98-101,共4页
直观教学在任何一门课程的教与学中既是一种重要方式也是一种重要手段,可将R 软件引入到直观教学中.针对《概率论与数理统计》课程概率论部分的一些基本问题,从增强理解和提升教学效果角度出发,通过安排合理的教学流程,结合R 软件的随... 直观教学在任何一门课程的教与学中既是一种重要方式也是一种重要手段,可将R 软件引入到直观教学中.针对《概率论与数理统计》课程概率论部分的一些基本问题,从增强理解和提升教学效果角度出发,通过安排合理的教学流程,结合R 软件的随机模拟和图形绘制等功能,将问题程序化、图形化,以提升教学效果,为直观教学提供一种思路. 展开更多
关键词 R软件 概率论 直观教学 随机模拟
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R统计软件在统计教学中的应用 认领 被引量：7
8
作者 杨宜平 赵培信 《重庆工商大学学报：自然科学版》 2013年第3期74-76,共3页
在讲授统计基本思想方法的同时利用统计软件进行辅助教学,以提高学生利用专业知识解决实际问题的能力已成为现代统计教学的重点;以回归模型为例介绍了R统计软件在统计教学中的应用。
关键词 R统计软件 回归模型 线性回归 分位数回归
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关于Monte-Carlo方法应用的三点注记 认领
9
作者 吕书龙 梁飞豹 刘文丽 《福州大学学报：自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期291-296,共6页
指出应用Monte-Carlo方法必须注意的3个问题：优质随机数、精度和收敛速度.提出解决这3个问题的主要思路,并通过基于R统计软件的积分计算例子进一步论证了其有效性.
关键词 Monte-Carlo 随机数 积分 R统计软件
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指示值方法及其在昆虫中的应用 认领 被引量：7
10
作者 李巧 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期457-462,共6页
指示值（IndVal）方法于1997年由Dufrêne和Legendre提出,是生物指示方法论研究中最有意义的进步,在国外被广泛运用于生态指示物研究,然而在国内却没有得到应有的重视。本文介绍了如何运用R语言软件进行IndVal值的计算,IndVal方法... 指示值（IndVal）方法于1997年由Dufrêne和Legendre提出,是生物指示方法论研究中最有意义的进步,在国外被广泛运用于生态指示物研究,然而在国内却没有得到应有的重视。本文介绍了如何运用R语言软件进行IndVal值的计算,IndVal方法在指示昆虫研究中的应用,以及运用该方法进行昆虫指示物种的判断和检验。旨在普及该方法的运用,推动我国的生物指示研究。 展开更多
关键词 方法论 指示生物 生态指示 生物指示 R语言软件
基于R软件的医学统计学案例教学——以t检验为例 认领
11
作者 陈超 潘海燕 《高教学刊》 2021年第2期100-103,共4页
R软件具有强大的统计分析功能,将R软件作为辅助教学手段引入医学统计学课程的教学过程,能帮助学生加深对统计学理论知识的直观理解,提升教学质量,增强教学效果。以t检验这一章节为例,通过实际教学中的案例探讨进一步说明R软件辅助教学... R软件具有强大的统计分析功能,将R软件作为辅助教学手段引入医学统计学课程的教学过程,能帮助学生加深对统计学理论知识的直观理解,提升教学质量,增强教学效果。以t检验这一章节为例,通过实际教学中的案例探讨进一步说明R软件辅助教学的优势。 展开更多
关键词 R软件 医学统计学 教学
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文章速递A Stochastic Strategy for Optimizing the Cost of Systematic Screening of Some Diseases in a Situation of Insufficient Equipment 认领
12
作者 Lucien Zihindula Biguru 《应用数学(英文)》 2020年第12期1253-1274,共22页
In this work, we show that when there is insufficient equipment for detecting a disease whose prevalence is <em>t</em>% in a sub-population of size <em>N</em>, it is optimal to divide the <e... In this work, we show that when there is insufficient equipment for detecting a disease whose prevalence is <em>t</em>% in a sub-population of size <em>N</em>, it is optimal to divide the <em>N</em> samples into <em>n</em> groups of size r each and then, the value <img src="Edit_ce149849-3742-48fe-820b-02ccc0c92d83.bmp" alt="" /> allows systematic screening of all <em>N</em> individuals by performing less than <em>N</em> tests (In this expression, <img src="Edit_987eb236-a883-4894-ba2d-52bde5f35056.bmp" alt="" /> represents the floor function<sup>1</sup> of <em>x</em> ∈ R). Based on this result and on certain functions of the R software, we subsequently propose a probabilistic strategy capable of optimizing the screening tests under certain conditions. 展开更多
关键词 Stochastic Optimization Binomial Distribution Systematic Screening Prevalence R Software
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epiR软件包在肿瘤流行病学分层分析中应用 认领
13
作者 凡玉杰 陈娟 +2 位作者 张舒 茹文臣 王胜锋 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2020年第1期8-11,共4页
目的分层分析是将数据按照某个(些)需要控制的变量进行分层,然后再估计暴露与结局之间关联强度的一种资料分析方法,是肿瘤流行病学研究中最常用的控制混杂的方法之一。本研究旨在应用R软件的epiR软件包实现肿瘤流行病学资料的分层分析,... 目的分层分析是将数据按照某个(些)需要控制的变量进行分层,然后再估计暴露与结局之间关联强度的一种资料分析方法,是肿瘤流行病学研究中最常用的控制混杂的方法之一。本研究旨在应用R软件的epiR软件包实现肿瘤流行病学资料的分层分析,为识别和控制混杂因素提供新的统计学工具。方法结合2009年的一项关于乳腺癌的病例对照研究数据,以体质指数(body mass index,BMI)为分层变量,分析血清中抵抗素含量和乳腺癌发病的关系,计算采用epiR软件包实现。结果未经BMI调整时,血清中抵抗素含量与乳腺癌发生的关联强度ORc=3.431(95%CI:1.590~7.406),P=0.001;经BMI分层调整后,血清中抵抗素含量与乳腺癌发生的关联强度ORmh=3.809(95%CI:1.703~8.518),P=0.001。结论调整BMI混杂因素的影响之后,血清中抵抗素含量与乳腺癌发生的关联性依然存在,表明血清中抵抗素含量可能是乳腺癌的危险因素之一。epiR软件包程序书写简单,结果输出丰富,能方便地完成分层分析,可以为肿瘤流行病学研究人员开展分层分析提供参考。 展开更多
关键词 分层分析 R软件 epiR包 肿瘤流行病学
线性回归分析的R方法 认领
14
作者 王晓刚 《扬州职业大学学报》 2020年第2期34-38,共5页
SAS、SPSS等统计软件虽然功能强大但价格不菲,开源的R软件为我们提供了更好的选择。虽然在R社区中可以查到R的所有操作指南,但是信息分散而不成体系。本文针对线性回归分析符合基本假设的情况,借助具体例题,较系统地总结在R环境下的回... SAS、SPSS等统计软件虽然功能强大但价格不菲,开源的R软件为我们提供了更好的选择。虽然在R社区中可以查到R的所有操作指南,但是信息分散而不成体系。本文针对线性回归分析符合基本假设的情况,借助具体例题,较系统地总结在R环境下的回归分析过程。 展开更多
关键词 直线回归 多元线性回归 回归诊断 R软件
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R软件在地下水环境质量评价中的应用 认领
15
作者 丁振军 《环境保护与循环经济》 2020年第11期61-64,共4页
在“十三五”地下水考核点位和地下水试点与例行监测评价中,应用R软件基础包(base)中的cut(),cbind(),gsub(),write.table()等函数,将地下水考核点位19项评价指标R代码分为2类,地下水试点和例行监测93项评价指标分为4类,能够实现地下水... 在“十三五”地下水考核点位和地下水试点与例行监测评价中,应用R软件基础包(base)中的cut(),cbind(),gsub(),write.table()等函数,将地下水考核点位19项评价指标R代码分为2类,地下水试点和例行监测93项评价指标分为4类,能够实现地下水质量等级的自动划分,考核点位评价时可对综合评价分值自动赋分,新建CSV文件并保存等级划分与赋分结果。 展开更多
关键词 R软件 地下水 环境质量 等级划分
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R语言计算药动学参数及生物等效性分析 认领 被引量：1
16
作者 吴正宇 方文韬 +3 位作者 栾迪 丁言运 杨哲 赵亚男 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期308-313,共6页
目的使用R语言计算非房室模型药动学参数,并进行生物等效性分析。方法使用R语言中"NonCompart"包进行非房室模型药动学参数的计算。使用"nlme"包建立线性混合效应模型,进行多因素方差分析。使用"PowerTOST&qu... 目的使用R语言计算非房室模型药动学参数,并进行生物等效性分析。方法使用R语言中"NonCompart"包进行非房室模型药动学参数的计算。使用"nlme"包建立线性混合效应模型,进行多因素方差分析。使用"PowerTOST"包计算90%置信区间。将结果与Phoenix WinNonlin 6.4软件的计算结果对比。结果联合使用R包进行非房室模型药动学参数的计算与生物等效性分析的结果与Phoenix WinNonlin 6.4软件计算结果一致。结论可以通过R语言实现非房室模型药动学参数的计算与生物等效性分析,且结果可靠。 展开更多
关键词 R语言 药动学 生物等效性
Logistic回归模型参数的贝叶斯估计及应用 认领
17
作者 王纯杰 戚顺欣 张洪阳 《统计与决策》 CSSCI 北大核心 2020年第22期14-18,共5页
文章采用独立样本M-H算法、逐分量M-H算法和切片Gibbs算法,计算Logistic回归模型的后验分布。在蒙特卡洛模拟中,采用每隔15步抽样一次的方法来降低自相关性。通过绘制直方图、路径图、自相关图等来比较三种算法,分析每种算法的优缺点。... 文章采用独立样本M-H算法、逐分量M-H算法和切片Gibbs算法,计算Logistic回归模型的后验分布。在蒙特卡洛模拟中,采用每隔15步抽样一次的方法来降低自相关性。通过绘制直方图、路径图、自相关图等来比较三种算法,分析每种算法的优缺点。结果表明:在先验分布都选取正态分布的前提下,三种算法均具有可行性。随着样本量增大,切片Gibbs算法和独立样本M-H算法估计效果相对较差,逐分量M-H估计效果较好,并且采用Lasso算法进行变量选择可以提高抽样效率。 展开更多
关键词 M-H算法 切片Gibbs算法 LOGISTIC回归模型 Lasso R软件
基于中位数为效应量的Meta分析及R实现 认领 被引量：1
18
作者 黄桥 邝心颖 +11 位作者 童铁军 毛智 郑亮 陈昊 贺小峰 董圣杰 张超 仇成凤 翁鸿 桂裕亮 任学群 曾宪涛 《医学新知》 CAS 2020年第4期265-271,共7页
中位数是在连续变量为非正态分布时采用的统计描述方法,本文旨在探讨以中位数为效应量进行Meta分析的可行性。本文以中位数为效应量进行Meta合并的统计基础和常见实现方法,并用R软件实现。通过R软件中的metamedian程序包实现了以中位数... 中位数是在连续变量为非正态分布时采用的统计描述方法,本文旨在探讨以中位数为效应量进行Meta分析的可行性。本文以中位数为效应量进行Meta合并的统计基础和常见实现方法,并用R软件实现。通过R软件中的metamedian程序包实现了以中位数为效应量的Meta分析,并进行异质性分析。本文可为Meta分析中的对基于中位数的效应量的处理提供另外一种可行的方案。 展开更多
关键词 中位数 META分析 R软件 metamedian程序包
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ARIMA模型在安徽省梅毒发病预测中的应用 认领
19
作者 方兰兰 潘贵霞 《公共卫生与预防医学》 2020年第6期19-23,共5页
目的探讨应用时间序列基于季节性的差分自回归移动平均模型(autoregressive integrated moving average,ARIMA)预测安徽省梅毒的发病人数,为梅毒早期预警防控工作提供参考。方法借助R 3.6.2软件以安徽省2004年1月至2016年12月的梅毒发... 目的探讨应用时间序列基于季节性的差分自回归移动平均模型(autoregressive integrated moving average,ARIMA)预测安徽省梅毒的发病人数,为梅毒早期预警防控工作提供参考。方法借助R 3.6.2软件以安徽省2004年1月至2016年12月的梅毒发病人数进行模型拟合,利用所得到的模型对2017年1-12月的发病情况进行预测,并按照预测值与实际观察值之间的差异评价其预测效果。结果安徽省梅毒发病数呈上升趋势,且有明显的周期性。ARIMA(1,1,1)(0,1,2)12为最优模型,AIC=-264.81,BIC=-249.99。残差序列Box-Pierce检验结果λ^2=1.444,P=0.963,λ=10.459,P=0.576,差异无统计学意义(P>0.05),表明为白噪声序列。模型精度效果评价MAE=0.06;RMSE=0.09;MAPE=1.00%,说明模型拟合效果好。2017年数据以检验模型外推效果,MAPE=6.09%,表明模型外推效果较好,且实际值均落在预测值的95%的置信区间,模型预测效果比较理想。结论ARIMA(1,1,1)(0,1,2)12模型能较好的拟合、预测安徽省梅毒发病人数,为梅毒预警和防控工作提供理论依据。 展开更多
关键词 梅毒 ARIMA模型 R软件 预测
医学类专业概率论与数理统计教学实践:R软件与案例结合教学 认领
20
作者 沈新娣 侯丽英 《教育教学论坛》 2020年第22期284-285,共2页
运用医学案例与R软件结合的教学模式,采用多元化的考核方式,注重培养医学生医学科研思维,提高学生学习的积极性,加强了学生综合运用统计知识解决医学问题的能力。
关键词 案例教学法 R软件 概率论与数理统计
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