期刊文献+
共找到70篇文章
< 1 2 4 >
每页显示 20 50 100
RNA修饰对长链非编码RNA的调控作用
1
作者 马文博 颜景斌 《生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第1期49-54,共6页
长链非编码RNA (lncRNA)能在表观遗传、转录以及转录后水平上调控基因表达,与疾病的发生、发展和防治有着密切的联系。RNA修饰介导的表观转录组学调控是表观遗传的新领域,可以在转录后水平调控基因表达,并且可以作为一种重要的修饰手段... 长链非编码RNA (lncRNA)能在表观遗传、转录以及转录后水平上调控基因表达,与疾病的发生、发展和防治有着密切的联系。RNA修饰介导的表观转录组学调控是表观遗传的新领域,可以在转录后水平调控基因表达,并且可以作为一种重要的修饰手段对lncRNA进行调控。RNA修饰可以通过对lncRNA表达水平、剪切方式及二级结构的调控,影响各种生物学进程。现回顾和展望RNA修饰对lncRNA的调控作用和其潜在的生物学功能。 展开更多
关键词 RNA修饰 长链非编码RNA 表观遗传
CREBBP-m~6A报告系统的建立和验证 预览
2
作者 郭佳银 黄瑫 曾文先 《家畜生态学报》 北大核心 2019年第3期10-16,共7页
N~6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m~6A)是真核生物信使RNA(Messenger RNA,mRNA)上最丰富的一种化学修饰,受到甲基转移酶和去甲基化酶的调控而呈现动态变化的状态。m~6A识别蛋白可识别并特异性结合到m~6A修饰位点,调控mRNA的剪接、降... N~6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m~6A)是真核生物信使RNA(Messenger RNA,mRNA)上最丰富的一种化学修饰,受到甲基转移酶和去甲基化酶的调控而呈现动态变化的状态。m~6A识别蛋白可识别并特异性结合到m~6A修饰位点,调控mRNA的剪接、降解和翻译进程,从而调节基因的表达。选择包含3个m~6A修饰位点的CREBBP基因3’UTR序列连接到红色荧光mCherry序列的下游,将得到的mCherry-CREBBP 3’UTR片段插入到pCD513B-CMV载体的EcoRⅠ和BamHⅠ酶切位点之间,得到CREBPP-m~6A报告质粒pCMV-mCherry-CREBBP,并在GC-1细胞和293T细胞中验证了CREBBP-m~6A报告质粒的功能,发现红色荧光强度和m~6A水平呈负相关。研究结果提示,可将pCMV-mCherry-CREBBP质粒转入靶细胞,通过红色荧光的强度来检测m~6A修饰的变化。 展开更多
关键词 N6-甲基腺嘌呤(m6A) RNA修饰 CREBBP-m6A
在线阅读 下载PDF
PPR蛋白在植物生长发育中的作用 预览
3
作者 王婉珍 任育军 缪颖 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期225-234,共10页
PPR蛋白在陆生植物中属于最大的蛋白家族之一,其成员种类和数量均十分庞大。PPR蛋白主要的功能是通过在多种细胞器中进行定位从而参与细胞核和细胞器中特异单链RNA的转录后修饰和编辑,在植物生长发育的多个阶段均发挥着重要的作用。多数... PPR蛋白在陆生植物中属于最大的蛋白家族之一,其成员种类和数量均十分庞大。PPR蛋白主要的功能是通过在多种细胞器中进行定位从而参与细胞核和细胞器中特异单链RNA的转录后修饰和编辑,在植物生长发育的多个阶段均发挥着重要的作用。多数PPR蛋白编码基因的突变体呈现异常的发育表型,如胚胎致死、发育迟缓及绿化延迟等。对近年来植物PPR蛋白的分类、定位、RNA修饰的机制及其对植物生长发育影响进行了综述,并展望了植物PPR发挥功能区域和参与的调控网络研究。 展开更多
关键词 植物 生长发育 PPR蛋白 RNA修饰 发育表型 综述
在线阅读 下载PDF
m^6A修饰及其对病毒复制过程调控研究进展 预览
4
作者 薛鹏 蒋涛 沈兴家 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期404-412,共9页
N^6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine,m^6A)修饰是一种在真核生物中普遍存在的RNA修饰方式,在mRNA转运、稳定、翻译等过程中具有重要作用。m^6A修饰在病毒复制周期中扮演不同的角色,病毒的复制和宿主对病毒的免疫反应都受到m^6A甲基化... N^6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine,m^6A)修饰是一种在真核生物中普遍存在的RNA修饰方式,在mRNA转运、稳定、翻译等过程中具有重要作用。m^6A修饰在病毒复制周期中扮演不同的角色,病毒的复制和宿主对病毒的免疫反应都受到m^6A甲基化的影响。本文总结了近年来关于m^6A修饰方面的分子作用机制及其对病毒复制以及宿主免疫反应的影响相关研究,以期为病毒生命周期中的表观遗传调控研究提供一定的参考。 展开更多
关键词 N^6-甲基腺嘌呤 RNA修饰 病毒 复制 免疫
在线阅读 下载PDF
Deciphering nucleic acid modifications by chemical derivatization-mass spectrometry analysis
5
作者 Meng-Dan Lan Bi-Feng Yuan Yu-Qi Feng 《中国化学快报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期1-6,共6页
Now increasing chemical modifications are discovered on genomic DNA and RNA. Up to date, more than150 chemical modifications are identified in nucleic acids. These chemical modifications do not change the sequence of ... Now increasing chemical modifications are discovered on genomic DNA and RNA. Up to date, more than150 chemical modifications are identified in nucleic acids. These chemical modifications do not change the sequence of DNA and RNA, but alter their structures and biochemical properties, and eventually control or regulate the spatial and temporal expression of genes. Elucidation of the functional roles of these modifications is vital to our understanding of living organisms. However, the modifications in DNA and RNA generally have extremely low abundance in vivo. Therefore, sensitive and specific detection methods are essential to decipher the functional roles of these modifications. Chemical derivatization in combination with mass spectrometry(MS) analysis has been proved to be a promising strategy to efficiently analyze these modifications in DNA and RNA. In the last several years, many chemical derivatization-MS-based analytical methods were established for the sensitive and effective analysis of nucleic acid modifications. In this review, we summarize the recent advances for deciphering modifications in DNA and RNA by chemical derivatization-MS analysis. We hope this review can stimulate the future studies of DNA and RNA modifications. 展开更多
关键词 MASS SPECTROMETRY ANALYSIS Chemical DERIVATIZATION DNA MODIFICATION RNA MODIFICATION
RNA表观遗传修饰及其在植物中的研究进展 预览
6
作者 鲁良 陈博 +4 位作者 曹阳阳 邓玮杭 李晔 林金星 李瑞丽 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期189-200,共12页
RNA转录后修饰是将新生RNA分子加工成为成熟产物的修饰过程,它已经成为表观遗传学研究的一个崭新领域,在生物体的生殖、生长和发育等生命活动过程中发挥着十分重要的作用。近年来,人们对RNA的6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine,m^6A)、5... RNA转录后修饰是将新生RNA分子加工成为成熟产物的修饰过程,它已经成为表观遗传学研究的一个崭新领域,在生物体的生殖、生长和发育等生命活动过程中发挥着十分重要的作用。近年来,人们对RNA的6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine,m^6A)、5-甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,m^5C)以及假尿苷修饰(Pseudouridines,Ψ)等几种重要的RNA表观遗传修饰开展了广泛地研究。本文主要阐述了这几种RNA修饰的分布特征、形成机制以及检测方法,并着重总结了它们在植物生长发育中的功能与研究进展等,为今后系统开展RNA表观遗传学的研究提供理论参考。 展开更多
关键词 RNA修饰 6-甲基腺嘌呤 5-甲基胞嘧啶 假尿苷 表观遗传
在线阅读 下载PDF
Regulation of Virus Replication and T Cell Homeostasis by N~6-Methyladenosine
7
作者 Jing Yang Hong Wang Wenyan Zhang 《中国病毒学:英文版》 CAS CSCD 2019年第1期22-29,共8页
RNA modifications are abundant in eukaryotes, bacteria, and archaea. N~6-methyladenosine(m~6A), a type of RNA modification mainly found in messenger RNA(mRNA), has significant effects on the metabolism and function of... RNA modifications are abundant in eukaryotes, bacteria, and archaea. N~6-methyladenosine(m~6A), a type of RNA modification mainly found in messenger RNA(mRNA), has significant effects on the metabolism and function of m RNAs. This modification is governed by three types of proteins, namely methyltransferases as ‘‘writers’ ’, demethylases as ‘‘erasers’ ’,and specific m~6A-binding proteins(YTHDF1-3) as ‘‘readers’ ’. Further, it is important for the regulation of cell fate and has a critical function in many biological processes including virus replication, stem cell differentiation, and cancer development, and exerts its effect by controlling gene expression. Herein, we summarize recent advances in research on m~6A in virus replication and T cell regulation, which is a rapidly emerging field that will facilitate the development of antiviral therapies and the study of innate immunity. 展开更多
关键词 RNA MODIFICATION N~6-methyladenosine (m~6A) VIRUS REPLICATION T CELL HOMEOSTASIS
Solution structure of the RNA recognition domain of METTL3-METTL14 N^6-methyladenosine methyltransferase
8
作者 Jinbo Huang Xu Dong +8 位作者 Zhou Gong Ling-Yun Qin Shuai Yang Yue-Ling Zhu Xiang Wang Delin Zhang Tingting Zou Ping Yin Chun Tang 《蛋白质与细胞:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期272-284,共13页
N^6-methyladenosine(m6A),a ubiquitous RNA modification,is installed by METTL3-METTL14 complex.The structure of the heterodimeric complex between the methyltransferase domains(MTDs)of METTL3 and METTL14 has been previo... N^6-methyladenosine(m6A),a ubiquitous RNA modification,is installed by METTL3-METTL14 complex.The structure of the heterodimeric complex between the methyltransferase domains(MTDs)of METTL3 and METTL14 has been previously determined.However,the MTDs alone possess no enzymatic activity.Here we present the solution structure for the zinc finger domain(ZFD)of METTL3,the inclusion of which fulfills the methyltransferase activity of METTL3-METTL14.We show that the ZFD specifically binds to an RNA containing 5'-GGACU-3'consensus sequence,but does not to one without.The ZFD thus serves as the target recognition domain,a structural feature previously shown for DNA methyltransferases,and cooperates with the MTDs of METTL3-METTL14 for catalysis.However,the interaction between the ZFD and the specific RNA is extremely weak,with the binding affinity at several hundred micromolar under physiological conditions.The ZFD contains two CCCH-type zinc fingers connected by an anti-parallel P-sheet.Mutational analysis and NMR titrations have mapped the functional interface to a contiguous surface.As a division of labor,the RNA-binding interface comprises basic residues from zinc finger 1 and hydrophobic residues fromβ-sheet and zinc finger 2.Further we show that the linker between the ZFD and MTD of METTL3 is flexible but partially folded,which may permit the cooperation between the two domains during catalysis.Together,the structural characterization of METTL3 ZFD paves the way to elucidate the atomic details of the entire process of RNA m6A modification. 展开更多
关键词 RNA modification N^6-methyladenosine METTL3 target recognition DOMAIN zinc FINGER PARAMAGNETIC RELAXATION enhancement
tRNA cleavage:a new insight 预览
9
作者 Sherif Rashad Kuniyasu Niizuma Teiji Tominaga 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期47-52,共6页
Over the past decades,tRNA was found to be a rich hub of RNA modifications such as 1-methyladenosine and 5-methycytosine modifications and others,holding more than half of all modifications occurring in RNA molecules.... Over the past decades,tRNA was found to be a rich hub of RNA modifications such as 1-methyladenosine and 5-methycytosine modifications and others,holding more than half of all modifications occurring in RNA molecules.Moreover,tRNA was discovered to be a source of various small noncoding RNA species,such as the stress induced angiogenin cleaved tRNA halves(tiRNA)or the miRNA like tRNA derived fragments.tRNA cleavage under stress was fist discovered in bacteria and later was found to be conserved across different species,including mammals.Under cellular stress conditions,tRNA undergoes conformational changes and angiogenin cleaves it into 3′and 5′halves.5′tiRNA halves were shown to repress protein translations.tRNA cleavage is thought of to be a cytoprotective mechanism by which cells evade apoptosis,however some data hints to the opposite;that tiRNA are cytotoxic or at least related to apoptosis initiation.tRNA cleavage also was shown to be affected by tRNA modifications via different enzymes in the cytosol and mitochondria.In this review,we will highlight the biology of tRNA cleavage,show the evidence of it being cytoprotective or a marker of cell death and shed a light on its role in disease models and human diseases as well as possible future directions in this field of RNA research. 展开更多
关键词 ANGIOGENIN apoptosis cell stress RNA modification stress granules STROKE tiRNA translation repression TRNA tRNA cleavage
在线阅读 下载PDF
RNA修饰类型及调控蛋白
10
作者 陈宇晟 杨莹 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第4期391-406,共16页
RNA修饰是指发生在RNA上的各种修饰形式。自然界中的RNA修饰广泛存在于A、U、C、G四类核苷酸上,此外,极少的RNA修饰发生在次黄嘌呤核苷(I)上。目前已经在古细菌、细菌、病毒和真核生物中发现超过140种的RNA转录后修饰形式。在各种类型... RNA修饰是指发生在RNA上的各种修饰形式。自然界中的RNA修饰广泛存在于A、U、C、G四类核苷酸上,此外,极少的RNA修饰发生在次黄嘌呤核苷(I)上。目前已经在古细菌、细菌、病毒和真核生物中发现超过140种的RNA转录后修饰形式。在各种类型的RNA修饰中,甲基化修饰占到了三分之二,这些修饰广泛存在于各种RNA类型中,包括信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、核内小RNA(snRNA)、核仁小RNA(sno RNA)、微小RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)、piwi蛋白相互作用的RNA(piRNA)和长非编码RNA(lncRNA)等。现介绍主要的RNA修饰类型,并对其调控蛋白进行归纳总结。 展开更多
关键词 RNA修饰 RNA甲基化 N^6-甲基腺嘌呤 5-甲基胞嘧啶 甲基转移酶 去甲基化酶 结合蛋白
YTH Domain: A Family of N^6-methyladenosine (m^6A) Readers
11
作者 Shanhui Liao Hongbin Sun Chao Xu 《基因组蛋白质组与生物信息学报:英文版》 CAS CSCD 2018年第2期99-107,共9页
关键词 读者 家庭 RNA 蛋白质 生物功能 真核细胞 哺乳动物 DNA
RNA甲基化修饰与病理效应
12
作者 王蓬宇 杨财广 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第4期431-439,共9页
RNA甲基化修饰是表观转录组学重要的研究内容。在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,6-甲基腺嘌呤(m^6A)是m RNA上最丰富的内部修饰。RNA甲基化修饰受到甲基转移酶、去甲基化酶以及m^6A识别蛋白质的动态调控,与基因表达调控密... RNA甲基化修饰是表观转录组学重要的研究内容。在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,6-甲基腺嘌呤(m^6A)是m RNA上最丰富的内部修饰。RNA甲基化修饰受到甲基转移酶、去甲基化酶以及m^6A识别蛋白质的动态调控,与基因表达调控密切相关。RNA甲基化修饰失调可导致RNA功能紊乱,甚至一系列病理效应。现主要介绍几种较为常见的RNA甲基化修饰,并对其与病理效应的相关性进行归纳总结。 展开更多
关键词 RNA修饰 6-甲基腺嘌呤 病理效应 甲基转移酶 去甲基化酶 m^6A识别蛋白
RNA修饰检测技术
13
作者 马士清 彭金英 伊成器 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第4期440-446,共7页
目前在RNA上已发现超过一百种化学修饰,这些修饰相关的测序技术开发和功能研究发展迅速。关于RNA修饰的相关研究领域被称为"RNA表观遗传学"。为了对RNA修饰的含量和位置进行检测,研究人员利用液相色谱、质谱和高通量测序等技术开发了... 目前在RNA上已发现超过一百种化学修饰,这些修饰相关的测序技术开发和功能研究发展迅速。关于RNA修饰的相关研究领域被称为"RNA表观遗传学"。为了对RNA修饰的含量和位置进行检测,研究人员利用液相色谱、质谱和高通量测序等技术开发了多种定量或定点的RNA修饰检测方法。该文对这些方法进行了归纳整理,并对每种方法的基本原理和应用进行了介绍。 展开更多
关键词 RNA修饰 定量检测 定点检测 高通量测序
RNA修饰分布特征概述
14
作者 韩潇 孙宝发 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第4期407-413,共7页
RNA修饰研究是表观遗传研究领域的新热点之一,近年来多种RNA修饰陆续被研究者发现,如6-甲基腺嘌呤(m^6A)、5-甲基胞嘧啶(m^5C)、假尿嘧啶(ψ)等,通过高通量测序结合生物信息学分析揭示了这些RNA修饰的分布特征。不同的RNA修饰在... RNA修饰研究是表观遗传研究领域的新热点之一,近年来多种RNA修饰陆续被研究者发现,如6-甲基腺嘌呤(m^6A)、5-甲基胞嘧啶(m^5C)、假尿嘧啶(ψ)等,通过高通量测序结合生物信息学分析揭示了这些RNA修饰的分布特征。不同的RNA修饰在转录本上具有其特异的分布特征,并与所发挥的RNA加工和代谢功能密切相关。随着RNA修饰检测和测序技术的发展以及单细胞、单碱基分辨率等新兴技术的兴起,RNA修饰的分布特征及规律将会得到更精确、更深入的解析。该文主要介绍目前研究比较深入的几种RNA修饰在转录本上的分布特征,并对目前该方向面临的主要机遇与挑战进行讨论。 展开更多
关键词 RNA修饰 分布特征 转录后调控 6-甲基腺嘌呤 5-甲基胞嘧啶
RNA m^6A modification and its function in diseases
15
作者 Jiyu Tong Richard A. Flavell Hua-Bing Li 《医学前沿:英文版》 CAS CSCD 2018年第4期481-489,共9页
关键词 RNA 疾病 新陈代谢 管理者 FTO 蛋白质 包含域 阅读器
RNA修饰分析方法研究进展 预览
16
作者 游雪娇 袁必锋 冯钰锜 《分析测试学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1104-1118,共15页
迄今为止,在RNA分子中发现150多个转录后修饰。研究表明RNA中大量动态、可逆的修饰具有多种生物学功能,能够参与真核生物基因表达的调控。因此,了解RNA修饰的动态分布、机制、调控和功能可以扩展人们对生命体调控机制的深入认识和理... 迄今为止,在RNA分子中发现150多个转录后修饰。研究表明RNA中大量动态、可逆的修饰具有多种生物学功能,能够参与真核生物基因表达的调控。因此,了解RNA修饰的动态分布、机制、调控和功能可以扩展人们对生命体调控机制的深入认识和理解。破译RNA修饰的生物学功能主要依赖于对这些修饰的精确检测、定量和定位分析。近10年来,用于RNA修饰的分析方法得到显著发展,促使RNA修饰领域发生了巨大变革。该文总结了RNA修饰分析方法的原理、优点和缺点,并对RNA修饰研究技术的发展进行了展望。 展开更多
关键词 RNA修饰 分析方法 质谱分析 测序分析
在线阅读 下载PDF
Aberrant expression of enzymes regulating m^6A mRNA methylation: implication in cancer 预览
17
作者 Natalia Pinello Stephanie Sun Justin Jong-Leong Wong 《癌症生物学与医学:英文版》 CAS CSCD 2018年第4期323-334,共12页
N^6-methyladenosine (m^6A) is an essential RNA modification that regulates key cellular processes, including stem cell renewal,cellular differentiation, and response to DNA damage.Unsurprisingly, aberrant m6A methylat... N^6-methyladenosine (m^6A) is an essential RNA modification that regulates key cellular processes, including stem cell renewal,cellular differentiation, and response to DNA damage.Unsurprisingly, aberrant m6A methylation has been implicated in the development and maintenance of diverse human cancers. Altered m6A levels affect RNA processing, mRNA degradation, and translation of mRNAs into proteins, thereby disrupting gene expression regulation and promoting tumorigenesis. Recent studies have reported that the abnormal expression of m6A regulatory enzymes affects m6A abundance and consequently dysregulates the expression of tumor suppressor genes and oncogenes, including MYC, SOCS2, ADAM19, and PTEN. In this review, we discuss the specific roles of m6A “writers", “erasers”, and “readers” in normal physiology and how their altered expression promotes tumorigenesis. We also describe the potential of exploiting the aberrant expression of these enzymes for cancer diagnosis,prognosis, and the development of novel therapies. 展开更多
关键词 RNA modification N^6-methyladenosine (m^6A) CANCER tumor SUPPRESSOR ONCOGENE
在线阅读 下载PDF
Reversible RNA Modification N1-methyladenosine (m1A) in mRNA and tRNA
18
作者 Chi Zhang Guifang Jia 《基因组蛋白质组与生物信息学报:英文版》 CAS CSCD 2018年第3期155-161,共7页
关键词 MRNA TRNA 可逆 复杂网络 功能开发 蛋白质 mlA DNA
Biomedical applications of mRNA nanomedicine
19
作者 Qingqing Xiong Gha Young Lee +2 位作者 Jianxun Ding Wenliang Li Jinjun Shi 《纳米研究:英文版》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第10期5281-5309,共29页
关键词 MRNA 生物医学 应用程序 化学修正 治疗学 DNA 稳定性 免疫力
23S rRNA甲基转移酶RrmJ促进大肠杆菌50S亚基后期组装
20
作者 汪伟 李婉秋 高宁 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 北大核心 2017年第7期712-718,共7页
核糖体是所有细胞中负责蛋白质合成的分子机器。它自身在细胞内的组装成熟过程受到严密调控,需要诸多组装因子的参与。Rrm J是原核生物中一类保守的甲基转移酶,能够甲基化修饰核糖体上肽基转移酶中心(peptidyl transferase center,PTC... 核糖体是所有细胞中负责蛋白质合成的分子机器。它自身在细胞内的组装成熟过程受到严密调控,需要诸多组装因子的参与。Rrm J是原核生物中一类保守的甲基转移酶,能够甲基化修饰核糖体上肽基转移酶中心(peptidyl transferase center,PTC)内A环的U2552位点。敲除rrm J基因的大肠杆菌表现出显著的生长缺陷及50S亚基组装前体的累积,因而Rrm J在50S亚基组装中具有重要作用。本研究对细菌生长实验与核糖体图谱分析表明,回补表达Rrm J的质粒对于Δrrm J菌株生长缺陷有显著改善,50S前体累积现象也得到有效缓解。通过共沉淀实验证明,Rrm J与Δrrm J菌株中提取的50S前体结合能力显著强于缺失型或野生型菌株中纯化的成熟50S;当加入S-腺苷甲硫氨酸时,该酶与50S前体结合能力显著下降。冷冻电镜三维重构数据进一步阐明,缺失型菌株50S前体主要停滞在组装晚期两个PTC区域成熟程度不同的特定时段。综合上述结果表明,U2552位点的修饰发生在50S亚基组装晚期特定阶段,这一事件不仅会加速A环的RNA螺旋折叠,另有可能促进附近PTC区域结构成熟。 展开更多
关键词 RrmJ U2552甲基化修饰 核糖体组装 RNA修饰
上一页 1 2 4 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈