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岩生树花地衣型真菌NRPS基因的生物信息学分析
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作者 原晓龙 陈剑 +4 位作者 华梅 李云琴 王娟 杨宇明 王毅 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2018年第2期21-25,38共6页
为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(RiNRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及antiSMASH、NRPSpredictor、NaPDoS、Norin... 为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(RiNRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及antiSMASH、NRPSpredictor、NaPDoS、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌RiNRPS基因进行分析,结果显示,RiNRPS基因相对分子质量为702699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19098bp,编码6362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。 展开更多
关键词 岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶 生物信息学分析
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