期刊文献+
共找到1,301篇文章
< 1 2 66 >
每页显示 20 50 100
美国花生种质资源果腐病抗性分子标记的筛选及分析
1
作者 刘阳杰 何美敬 +4 位作者 崔顺立 杨鑫雷 穆国俊 Charles Y CHEN 刘立峰 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期743-751,共9页
花生(Arachis hypogaea)果腐病(pod rot)是一种由真菌引起的严重病害,直接影响花生的产量及品质。抗病育种是该病害防治最经济、有效的途径,而抗性相关分子标记的筛选和利用又是提高选择效率和加快育种进程的重要手段。本研究以引进的7... 花生(Arachis hypogaea)果腐病(pod rot)是一种由真菌引起的严重病害,直接影响花生的产量及品质。抗病育种是该病害防治最经济、有效的途径,而抗性相关分子标记的筛选和利用又是提高选择效率和加快育种进程的重要手段。本研究以引进的77份美国花生种质资源为材料,利用12对SSR标记和48对插入缺失(insertion-deletion, InDel)标记,通过Pearson相关分析和多元线性逐步回归筛选与花生果腐病抗性相关的标记,并利用构建的分离群体对相关标记进行了验证。结果表明,美国种质资源遗传多样性丰富,具有不同抗性级别的材料。利用12对SSR引物对77份美国种质资源进行扩增,共获得103条多态性条带,多态性比率在20%~100%,平均79.23%。从受害指数进行相关和多元线性回归分析,获得了4个与花生果腐病抗性显著相关的SSR标记,分别为3A8、GM1760、PM163和14H6。分离群体验证结果表明获得的4对SSR标记可用于花生果腐病抗性分子标记的深入研究。15对InDel标记在材料中具有多态性,通过果腐病抗性-标记相关性分析获得了2对InDel标记,分别是InDel-004和InDel-020。花生果腐病抗性相关分子标记的获得为分子辅助选择育种及抗病相关基因的挖掘提供了重要参考。 展开更多
关键词 花生 果腐病 SSR标记 INDEL标记
利用SSR和SRAP标记分析油菜骨干亲本的遗传多样性 预览
2
作者 臧珊 张云霄 +1 位作者 郭媛 胡胜武 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第5期7-14,共8页
【目的】分析甘蓝型油菜骨干亲本的遗传多样性,揭示参试材料的遗传差异。【方法】利用筛选到的8对SSR引物和12对SRAP引物,对30份甘蓝型油菜骨干亲本材料及1份芥菜型油菜和1份白菜型油菜材料进行遗传多样性分析,结合聚类分析、主成分分... 【目的】分析甘蓝型油菜骨干亲本的遗传多样性,揭示参试材料的遗传差异。【方法】利用筛选到的8对SSR引物和12对SRAP引物,对30份甘蓝型油菜骨干亲本材料及1份芥菜型油菜和1份白菜型油菜材料进行遗传多样性分析,结合聚类分析、主成分分析、群体结构分析以及分子方差分析揭示参试材料之间的遗传多样性。【结果】在参试材料中,8对SSR引物共扩增出49条多态性条带,多态性比率为96.08%,平均每对引物扩增6.1条,平均多态性信息含量(PIC)为0.43,遗传距离均值0.34;12对SRAP引物共扩增出77条多态性条带,多态性比率为98.72%,平均每对引物扩增6.4条,PIC为0.59,遗传距离均值0.46。UPGMA聚类分析表明,在遗传相似系数0.65处,大部分参试材料被分为两大类,第Ⅰ类包括19份材料,其中14份为恢复系,5份为保持系;第Ⅱ类包括9份材料,均为保持系。主成分分析、群体结构分析的结果与聚类分析结果基本一致。分子方差分析结果显示,参试甘蓝型油菜群体内变异系数为95.46%,群体间变异系数仅为4.54%。保持系与恢复系材料间差异为2.03%。【结论】参试甘蓝型油菜骨干亲本间存在一定的遗传差异,恢复系和保持系群体内部遗传变异大于群体间的遗传变异。 展开更多
关键词 油菜 骨干亲本 遗传多样性 SSR标记 SRAP标记
在线阅读 下载PDF
广东省鼎湖山国家级自然保护区球孢白僵菌遗传多样性研究 预览
3
作者 蔡悦 聂勇 +1 位作者 吴茜茜 黄勃 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期92-100,共9页
【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下... 【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下简称“DHS”)采集的81株球孢白僵菌进行遗传结构和多样性分析。【结果】使用8对SSR引物扩增81个菌株产生多态位点数为58个,多态位点比率为100%,其中,引物Ba12多态位点数最多(10个)。通过Popgene32软件包分析发现,DHS球孢白僵菌种群Nei’s基因多样性指数(h)为0.2126,Shannon信息指数(Is)为0.3487,可见其遗传多样性水平较高,群体异质性较强。将群体分别按照寄主和土壤、不同寄主目划分为不同亚群进一步分析,发现土壤亚群遗传多样性水平(h=0.1925,Is=0.3099)略高于寄主亚群(h=0.1769,Is=0.2783),种群间遗传分化程度较弱(Nm=1.6629,Gst=0.1307);不同寄主目群体间的遗传分化较小且基因流明显。基于UPGMA聚类分析发现,各分支菌株的分布趋势与分离基质、不同寄主目均没有相关性。【结论】DHS球孢白僵菌遗传谱系与分离基质和寄主来源均无明显相关性,不同生态环境和寄主类型的影响共同维持了DHS球孢白僵菌种群内遗传变异的多样性。 展开更多
关键词 球孢白僵菌 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 鼎湖山国家级自然保护区
在线阅读 下载PDF
分子标记技术在宜机收玉米品种选育中应用策略
4
作者 王瑞英 杨美丽 +4 位作者 王静 王志红 郭华 秦贵文 王帮太 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期917-922,共6页
推广玉米全程机械化操作,关键在于由机械收穗向机械收粒转型,是节约成本、增加效益的有效手段。选育宜机收品种主要应从抗倒性强、成熟期一致、穗位整齐、籽粒成熟后脱水速率快、苞叶宜脱离等性状进行入手。本研究从宜机收品种特征特性... 推广玉米全程机械化操作,关键在于由机械收穗向机械收粒转型,是节约成本、增加效益的有效手段。选育宜机收品种主要应从抗倒性强、成熟期一致、穗位整齐、籽粒成熟后脱水速率快、苞叶宜脱离等性状进行入手。本研究从宜机收品种特征特性分析,收集整理分子标记技术在相关性状方面研究成果,提出分子标记检测在宜机收品种选育中起到的作用。针对宜机收品种特征相关性状研究规律,提出了分子标记检测在玉米宜机收品种改良选育方向。研究结果为快速进行玉米宜机收品种选育提供综合的参考依据。 展开更多
关键词 玉米 宜机收 QTL SSR标记
基于NY/T 1433—2014推荐SSR标记检测不同世代恢复系配制杂交种的纯度研究
5
作者 王慧 张从合 +7 位作者 陈金节 黄艳玲 申广勒 严志 王林 周桂香 张云虎 庞战士 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2019年第2期59-62,共4页
采用田间性状稳定的不同世代恢复系YR179(F8、F9和F10代)、YR092(F8和F9代)和YR018(F8和F9代)及其与稳定不育系03S配制的杂交种为材料,利用《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法》(NY/T 1433—2014)中推荐的48对SSR引物检测各世代恢复系的... 采用田间性状稳定的不同世代恢复系YR179(F8、F9和F10代)、YR092(F8和F9代)和YR018(F8和F9代)及其与稳定不育系03S配制的杂交种为材料,利用《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法》(NY/T 1433—2014)中推荐的48对SSR引物检测各世代恢复系的纯合位点数,通过室内分子鉴定与田间植株性状鉴定的一一对应检测,研究不同世代恢复系所配杂交种种子室内分子鉴定纯度结果与田间种植鉴定纯度结果的吻合度,并对各杂株类型进行一一对应分析。结果表明,当YR179、YR092和YR018分别选育至F10、F9和F9代时,全部48个位点均已完全纯合,此时,其对应杂交种室内分子鉴定纯度与田间种植鉴定纯度吻合率分别为99.4%、99.4%和100%,且各杂株类型的室内与田间鉴定结果也基本一致。说明当恢复系完全纯合时,可用室内SSR分子标记鉴定替代田间种植鉴定来鉴定其杂交种的纯度。 展开更多
关键词 杂交水稻 恢复系 SSR标记 纯度 鉴定
黑龙江省建三江地区主栽粳稻DNA指纹图谱构建研究 预览
6
作者 陈羽红 李志江 张东杰 《黑龙江八一农垦大学学报》 2019年第1期14-20,共7页
利用农业行业标准(NY/T1433-2007)推荐的12对引物,采用简单重复系列(Simple Sequence Repeats,SSR)标记和毛细管电泳方法,对黑龙江省建三江地区的12个主栽粳稻品种进行检测,构建DNA指纹图谱和品种的分子身份证。12对引物在12份品种中共... 利用农业行业标准(NY/T1433-2007)推荐的12对引物,采用简单重复系列(Simple Sequence Repeats,SSR)标记和毛细管电泳方法,对黑龙江省建三江地区的12个主栽粳稻品种进行检测,构建DNA指纹图谱和品种的分子身份证。12对引物在12份品种中共检测到30个等位基因,每对引物检测到的等位基因数平均值为2.5个。根据引物在水稻品种中的扩增和毛细管电泳测定的结果,采用0/1矩阵构建由30位数字组成的DNA指纹图谱。分子身份证包括品种本身信息及SSR指纹信息,通过软件生成水稻品种身份证条形码和二维码,为水稻品种的鉴定及溯源管理提供技术支撑。 展开更多
关键词 粳稻 SSR标记 分子身份证 指纹图谱
在线阅读 免费下载
高通量RNA-seq技术开发文冠果目的基因SSR标记
7
作者 董旭 阮成江 +3 位作者 刘祾悦 闫蕊 韩平 庞延 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2943-2949,共7页
文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是中国北方重要的集药用、食用、观赏和绿化于一身的多用途经济树种。利用MISA软件从文冠果根、叶、花和果实高通量转录组库的45 335条Unigenes中,搜索挖掘出12 606个SSR标记。在这些SSR标记中,有... 文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是中国北方重要的集药用、食用、观赏和绿化于一身的多用途经济树种。利用MISA软件从文冠果根、叶、花和果实高通量转录组库的45 335条Unigenes中,搜索挖掘出12 606个SSR标记。在这些SSR标记中,有34.29%的单核苷酸重复、32.82%的二核苷酸重复、29.22%的三核苷酸重复、0.69%的四核苷酸重复、1.59%的五核苷酸重复和1.39%的六核苷酸重复。Unigenes中的408条涉及调控文冠果花色、叶色、果实开裂、成熟期、心室数、种子生长发育、大小和粒重等目的性状,从这些目的基因中共搜索挖掘到64个SSR标记,以辽冠1号叶片DNA为模板从这些SSR标记中共筛选出42对具有清晰扩增条带的SSR标记。以选取的5份表型性状差异明显的文冠果种质叶片为材料,通过对初筛的42对SSR引物的多态性筛选,获得了18对文冠果多态性SSR引物。本研究利用高通量RNA-seq开发的文冠果目的基因SSR标记,可为文冠果指纹图谱构建、遗传多样性分析和标记辅助选择育种等提供分子标记,对文冠果研究和开发利用具有重要意义。 展开更多
关键词 文冠果 RNA-SEQ 目的基因 SSR 多态性标记
玉米抗南方锈病基因的QTL定位
8
作者 陈文娟 路璐 +5 位作者 李万昌 张小杰 孙素丽 朱振东 王晓鸣 段灿星 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期521-529,共9页
为发掘新的抗南方锈病基因资源,本研究以感病自交系黄早四为母本、抗病自交系W456为父本,构建F2群体并开展抗病基因定位研究。采用人工接种鉴定的方法对两个亲本、F1、F2群体及对照材料进行表型鉴定和遗传分析。利用均匀覆盖10条染色体... 为发掘新的抗南方锈病基因资源,本研究以感病自交系黄早四为母本、抗病自交系W456为父本,构建F2群体并开展抗病基因定位研究。采用人工接种鉴定的方法对两个亲本、F1、F2群体及对照材料进行表型鉴定和遗传分析。利用均匀覆盖10条染色体的200个SSR标记,分析240个F2单株的基因型并构建含有200个SSR位点的遗传连锁图,连锁图总长度3331 cM,标记间平均距离16.6 cM。使用QTL IciMapping V4.1软件中的完备区间作图法对抗病QTL进行分析,共检测到6个控制南方锈病的QTL:qSCR3、qSCR7、qSCR8-1、qSCR8-2、qSCR9和qSCR10,邻近标记分别为umc2105和umc1729、umc1066和bnlg2271、umc1904和umc1984、umc1984和bnlg1651、umc1957和bnlg1401、umc2034和umc1291,分别位于3、7、8、9和10号染色体上,其中8号染色体上有两个位点,标记区间长度在5~19 cM之间。单个QTL的表型贡献率在2.61%~24.19%之间,可以解释表型总变异的62.3%,其中3个QTL贡献率大于10%,位于10号染色体上的qSCR10贡献率最大,可解释表型变异的24.19%。通过对目标区间标记加密,将该位点的定位区间进一步缩小到2.51 cM内,与两侧标记的距离分别是2.15 cM和0.36 cM。初步定位得到10号染色体上存在抗南方锈病的主效QTL,可为抗病品种的培育提供参考。 展开更多
关键词 玉米 南方锈病 抗性 SSR标记 QTL定位
利用SSR标记和SNP芯片对小麦EMS突变体进行真实性鉴定 预览
9
作者 耿皆飞 王娜 +5 位作者 蒋宏宝 刘录祥 许喜堂 魏红升 王成社 谢彦周 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-6,共6页
为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H... 为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H261与LF2010和LF2099之间的差异位点分别为66和12个,分别占总数的0.080 9%和0.014 7%,2个突变体与H261的纯合差异SNP数目均为0;而H261与LF2100之间的差异位点为2 846个,占总数的3.487 9%,二者之间纯合差异SNP为784,占总数的0.960 8%。综上所述,LF2010和LF2099突变体与亲本H261的遗传背景高度一致,是H261经过EMS诱变的后代,而LF2100是天然异交或机械混杂产生的假突变体。本研究结果为更好地发挥小麦突变体在遗传改良和功能基因组研究奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 普通小麦 90K基因芯片 SSR标记 突变体 真实性鉴定
在线阅读 免费下载
基于基因组重测序数据高效筛选梨SSR标记多态性引物 预览
10
作者 蒋爽 骆军 +1 位作者 王晓庆 施春晖 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期129-136,共8页
【目的】基于重测序数据开发一种快速筛选样品间SSR标记多态性的方法。【方法】通过基因组重测序技术对2个砂梨品种’早生新水’和’秋水’、1个西洋梨栽培品种’早红考密斯’以及3个梨属野生种豆梨、川梨和杜梨进行重测序,对已报道的44... 【目的】基于重测序数据开发一种快速筛选样品间SSR标记多态性的方法。【方法】通过基因组重测序技术对2个砂梨品种’早生新水’和’秋水’、1个西洋梨栽培品种’早红考密斯’以及3个梨属野生种豆梨、川梨和杜梨进行重测序,对已报道的446对梨SSR引物和新开发16对引物进行多态性测试,使用Magicblast匹配测序产生的Reads到上述SSR位点序列,获得SSR两侧保守序列之间的长度,筛选出多态性的引物。使用荧光PCR对部分筛选出的多态性引物进行验证。【结果】单个SSR位点在不同样品间获得匹配的平均Reads数能够超过16条,每个样品均获得了220个以上位点的信息,380对引物在不同样品间能够获得多态性的片段。精确分析了梨LG3早熟候选区域29个SSR位点在’早生新水’和’秋水’中的扩增情况,共鉴定出9个多态性表现好的位点。荧光PCR验证结果显示,通过预备筛选的引物表现出良好的多态性。【结论】本研究的方法一次能够筛选多对SSR引物,在常规PCR前可以预先获得不同引物的多态性信息,从而提高引物筛选效率。本方法不仅能应用于梨重测序数据快速筛选SSR引物,对其他动植物上的类似研究同样适用。 展开更多
关键词 重测序 SSR标记 多态性
在线阅读 下载PDF
基于RNA-Seq SSR标记的沙棘种质遗传多样性和群体结构分析
11
作者 李贺 阮成江 +3 位作者 王莉 李景滨 郭海 田兴军 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1567-1574,共8页
沙棘是中国重要的生态经济植物,遗传多样性分析对于其种质资源的评价与保存十分重要。现以80个沙棘品种/品系为试材,利用17对多态性的RNA-Seq SSR引物,研究其遗传多样性和群体遗传结构。17对SSR引物共扩增出50条谱带,其中多态性谱带41条... 沙棘是中国重要的生态经济植物,遗传多样性分析对于其种质资源的评价与保存十分重要。现以80个沙棘品种/品系为试材,利用17对多态性的RNA-Seq SSR引物,研究其遗传多样性和群体遗传结构。17对SSR引物共扩增出50条谱带,其中多态性谱带41条,每个位点条带数在2~5之间;多样性指数(PIC)介于0.150 7~0.588 6,平均0.271 0。利用PowerMarker 3.25和UPGMA方法进行聚类分析。结果显示,供试材料可分为两大类群,蒙古沙棘(ssp. mongolica)和杂交品种/品系聚为一个类群,中国沙棘(ssp. sinensis)构成另外一个类群。群体遗传结构分析中所有种质也被分成两个类群,杂交品种/品系介于中国沙棘和蒙古沙棘之间,与中国沙棘聚为一个类群。这些结果表明,沙棘的遗传多样性与它们的来源和遗传背景相符,可为沙棘种质资源保存和分子标记辅助育种提供理论依据。 展开更多
关键词 沙棘 SSR标记 遗传多样性 群体结构
基于SSR标记的冬瓜种质资源遗传多样性分析
12
作者 焦贤贤 刘文睿 +3 位作者 江彪 彭庆务 刘政国 谢大森 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期161-168,共8页
为了加强冬瓜种质资源的保护和评价,明确资源间的亲缘关系,本研究利用SSR标记在分子水平上对111份冬瓜种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,19对SSR引物共扩增出182条条带,其中多态性条带169条,多态率92.86%;通过POPGENE 1.31软件计... 为了加强冬瓜种质资源的保护和评价,明确资源间的亲缘关系,本研究利用SSR标记在分子水平上对111份冬瓜种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,19对SSR引物共扩增出182条条带,其中多态性条带169条,多态率92.86%;通过POPGENE 1.31软件计算每对引物的平均有效等位基因数(Ne)为1.393 2,平均Nei’s遗传多样性指数(He)为0.260 1,平均Shannon’s信息指数(I)为0.418 7。采用Jaccard相似系数进行种质间的聚类分析,在遗传距离为0.70的位置可将全部种质分为6个类群。通过聚类结果可知,种质材料未按照地理来源划分,但相同果型、籽型的种质资源间亲缘关系较近。本研究基于SSR标记分析冬瓜种质资源遗传多样性并进行亲缘关系的聚类,将为冬瓜种质的保存和利用提供理论依据。 展开更多
关键词 冬瓜 遗传多样性 SSR标记
紫苏SSR标记筛选及遗传关系分析
13
作者 温贺 王仙萍 +4 位作者 杨森 徐静 商志伟 王涛 沈奇 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期2285-2290,共6页
为开发适宜于紫苏的SSR标记,对紫苏遗传多样性及种群划分进行研究,本研究采用已报道的紫苏及近源种中的66对SSR引物对不同来源的42份紫苏材料进行扩增。结果表明:15对引物在42份材料中具有多态性,共扩增获得54个条带,平均每对引物扩增条... 为开发适宜于紫苏的SSR标记,对紫苏遗传多样性及种群划分进行研究,本研究采用已报道的紫苏及近源种中的66对SSR引物对不同来源的42份紫苏材料进行扩增。结果表明:15对引物在42份材料中具有多态性,共扩增获得54个条带,平均每对引物扩增条带3.6个,51个条带具有多态性,占扩增总条带的94.4%。使用UPGMA方法进行聚类分析,在SM=0.67处,供试紫苏分为2个主要聚类群。类群Ⅰ为紫苏原变种(Perilla frutescens var. frutescents),类群Ⅱ为回回苏变种(Perilla frutescens var. crispa),类群Ⅰ又可进一步划分为5个亚类群,各亚类群间表型具有一定的特征差异。本研究可为紫苏种质亲缘关系及资源鉴定研究提供参考依据。 展开更多
关键词 紫苏 SSR标记 标记筛选 遗传多样性
基于SSR标记的初烤烟叶品种快速鉴别 预览
14
作者 孙九喆 杨金初 +5 位作者 苏东嬴 王二彬 王君婷 张顺峰 李萌 马林 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期26-32,共7页
为有效区分和鉴别烤后烟叶品种,以卷烟企业常用的11个主要烟草品种初烤烟叶为材料,应用磁珠法提取烟叶基因组,并通过PCR和琼脂糖凝胶电泳构建不同品种的SSR指纹图谱。结果表明,从24对候选SSR引物对中筛选出5对多态性高、稳定性强的引物... 为有效区分和鉴别烤后烟叶品种,以卷烟企业常用的11个主要烟草品种初烤烟叶为材料,应用磁珠法提取烟叶基因组,并通过PCR和琼脂糖凝胶电泳构建不同品种的SSR指纹图谱。结果表明,从24对候选SSR引物对中筛选出5对多态性高、稳定性强的引物对,其扩增片段长度在100~300bp之间,经3%琼脂糖凝胶电泳获得了清晰条带。由5对SSR引物的电泳图谱构建了11个烟草品种指纹图谱,并绘制出鉴定流程图,实现了11个烟草品种的快速区分。本方法简单易行、操作性强,可用于选定范围内的初烤烟叶品种的真实性和一致性判定。 展开更多
关键词 初烤烟叶 品种 SSR标记 指纹谱库
在线阅读 免费下载
SSR标记在辣椒DUS测试中的应用研究
15
作者 管俊娇 余志慧 +4 位作者 杨晓洪 王江民 张鹏 黄清梅 张建华 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期396-405,共10页
为了评价SSR分子标记在辣椒(Capsicum annuum L.)品种特异性、一致性、稳定性(DUS)测试中的应用潜力,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对辣椒SSR引物进行筛选,采用入选的30对核心引物,构建130份不同来源品种的指纹图谱。30... 为了评价SSR分子标记在辣椒(Capsicum annuum L.)品种特异性、一致性、稳定性(DUS)测试中的应用潜力,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对辣椒SSR引物进行筛选,采用入选的30对核心引物,构建130份不同来源品种的指纹图谱。30对引物共检测到等位基因163个,每对引物等位基因变幅为2~15,平均等位基因数为5.43,多态信息量(PIC)的变异范围为0.17~0.76,平均为0.43。聚类分析表明,该套引物可以将所有参试品种区分开来,遗传基础相近的品种优先聚在一起。130个品种的遗传距离为0.01~0.91。有20对品种遗传距离小于0.10,其中3对品种有1个位点的差异,采用差异位点数判断品种特异性更适合目前辣椒品种现状。采用10对引物对品种0313963-4进行了一致性检测,综合一致性比率R值为96.5%,低于DUS测试中对表型性状一致性的要求。因此SSR标记直接用于辣椒DUS判定还需进一步研究,但是可用于近似品种筛选。 展开更多
关键词 辣椒 DUS测试 SSR标记 近似品种
‘巴柯’和‘尼加拉’葡萄疑似同物异名品种的SSR及形态学分析 预览
16
作者 李贝贝 张颖 +3 位作者 樊秀彩 李民 刘崇怀 姜建福 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期393-400,共8页
【目的】鉴定我国西南地区两组疑似同物异名葡萄品种的真实身份。【方法】利用38对SSR荧光标记引物对葡萄品种‘尼加拉’及其疑似同物异名品种‘关口葡萄’‘云南水晶’‘贵州水晶’和葡萄品种‘巴柯’及其疑似同物异名品种‘盐井黑珍... 【目的】鉴定我国西南地区两组疑似同物异名葡萄品种的真实身份。【方法】利用38对SSR荧光标记引物对葡萄品种‘尼加拉’及其疑似同物异名品种‘关口葡萄’‘云南水晶’‘贵州水晶’和葡萄品种‘巴柯’及其疑似同物异名品种‘盐井黑珍珠’‘茨中教堂葡萄’进行扩增,通过毛细管电泳进行基因分型,并对两组疑似同物异名葡萄品种进行田间形态特征观察,从而鉴定其身份。【结果】‘尼加拉’及其疑似同物异名品种和‘巴柯’及其疑似同物异名品种在38个SSR位点上分别具有相同的基因型,且两组疑似同物异名品种的田间形态特征也相似。【结论】初步认定‘云南水晶’‘贵州水晶’‘关口葡萄’为‘尼加拉’的同物异名品种;‘盐井黑珍珠’和‘茨中教堂葡萄’为‘巴柯’的同物异名品种,后期将通过DUS测试做进一步的鉴定。 展开更多
关键词 葡萄 SSR标记 形态学分析 同物异名
在线阅读 下载PDF
空心李RNA-seq SSR信息分析及分子标记开发
17
作者 丁健 阮成江 +3 位作者 吴茂宏 胡国均 张绍阳 韩平 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期2579-2586,共8页
为开发适用于空心李的目的基因SSR分子标记。基于空心李果实中果皮转录组测序数据,利用Trinity软件组装45 389条Unigene,其中32 822条获得功能注释。通过KEGG代谢通路分析发现817条Unigene与碳水化合物代谢相关。利用MISA软件在所有Unig... 为开发适用于空心李的目的基因SSR分子标记。基于空心李果实中果皮转录组测序数据,利用Trinity软件组装45 389条Unigene,其中32 822条获得功能注释。通过KEGG代谢通路分析发现817条Unigene与碳水化合物代谢相关。利用MISA软件在所有Unigene中共检测到9 797个SSR位点,分布于7 963条Unigene中,其占总Unigene数的17.54%。优势重复基序为二核苷酸(占总SSR位点数的40.57%)、单核苷酸(39.34%)和三核苷酸(18.58%)。AG/CT是二核苷酸中最多的重复类型(32.40%),三核苷酸重复类型以AAG/CTT为主(5.87%)。根据已注释的与果实品质(大小,糖和酸合成等)相关Uningene序列,挖掘到47个目的基因SSR分子标记,以‘李子王30号’空心李种质叶片基因组DNA为模板对这些SSR标记进行有效性验证,39对引物能扩增出清晰条带,其中11对引物在5份不同空心李种质中表现出多态性。开发的空心李目的基因SSR标记为空心李种质遗传多样性分析、指纹图谱构建和果实品质性状关联分析提供有效标记。 展开更多
关键词 空心李 RNA-SEQ 目的基因 SSR 分子标记
Transcriptome analysis of the endangered Notopterygium incisum: Coldtolerance gene discovery and identification of EST-SSR and SNP markers
18
作者 Yun Jia Ji-Qing Bai +4 位作者 Mi-Li Liu Zhen-Fang Jiang Yan Wu Min-Feng Fang Zhong-Hu Li 《植物多样性:英文版》 CAS CSCD 2019年第1期1-6,共6页
Notopterygium incisum C. C. Ting ex H. T. Chang(Apiaceae) is an endangered perennial herb in China. The lack of transcriptomic and genomic resources for N. incisum greatly hinders studies of its population genetics an... Notopterygium incisum C. C. Ting ex H. T. Chang(Apiaceae) is an endangered perennial herb in China. The lack of transcriptomic and genomic resources for N. incisum greatly hinders studies of its population genetics and conservation. In this study, we employed RNA-seq technology to characterize transcriptomes for the flowers, leaves, and stems of this endangered herb. A total of 56 million clean reads were assembled into 120,716 unigenes with an N50 length of 850 bp. Among these unigenes, 70,245(58.19%) were successfully annotated and 65,965(54.64%) were identified as coding sequences based on their similarities with sequences in public databases. We identified 21 unigenes that had significant relationships with cold tolerance in N. incisum according to gene ontology(GO) annotation analysis. In addition, 13,149 simple sequence repeats(SSRs) and 85,681 single nucleotide polymorphisms were detected as potential molecular genetic markers. Ninety-six primer pairs of SSRs were randomly selected to validate their amplification efficiency and polymorphism. Nineteen SSR loci exhibited polymorphism in three natural populations of N. incisum. These results provide valuable resources to facilitate future functional genomics and conservation genetics studies of N. incisum. 展开更多
关键词 ENDANGERED species ST-SSR marker NOTOPTERYGIUM incisum Single NUCLEOTIDE POLYMORPHISM TRANSCRIPTOME
Genetic diversity analysis of Sinojackia microcarpa,a rare tree species endemic in China,based on simple sequence repeat markers 预览
19
作者 Tailin Zhong Guangwu Zhao +2 位作者 Yongfeng Lou Xinchun Lin Xiaomin Guo 《林业研究:英文版》 CAS CSCD 2019年第3期847-854,共8页
Although most Sinojackia species are endangered, they contribute greatly to the biodiversity of local ecosystems. Sinojackia microcarpa, an endangered species, is distributed only in three provinces of eastern China. ... Although most Sinojackia species are endangered, they contribute greatly to the biodiversity of local ecosystems. Sinojackia microcarpa, an endangered species, is distributed only in three provinces of eastern China. Determining the genetic diversity of S. microcarpa provides key information for germplasm evaluation and species conservation. Here we used simple sequence repeat (SSR) markers to investigate the genetic diversity of eight natural populations of S. microcarpa. Leaf samples were collected from 144 individuals in 8 wild populations. The 156 bands were generated from 14 pairs of informative SSR primers, with an average percentage of polymorphic bands of 45.67%. The average values of Nei’s genetic diversity (He) and Shannon’s diversity index (I) were 0.1007 and 0.1658, respectively. The total genetic variation of S. microcarpa existed mainly within the eight populations, rather than among populations, and reached 86.41%. A cluster analysis showed that the eight wild populations of S. microcarpa could be classified into four groups, at a threshold of 4.0, based on an analysis of the SSR genotypes. Furthermore, there was a significant association between the phylogenetic relationships and the geographic locations of the S. microcarpa populations. In particular, populations from Fuyang, Jiande, and Lin’an in Zhejiang Province had close phylogenetic relationships and geographic distances. In addition, these three populations had the highest genetic diversity and the most individuals, suggesting that these three locations may be the S.microcarpa distribution center. This study serves as a model for studying the genetic diversity of endangered plant species. 展开更多
关键词 GENETIC DIVERSITY Sinojackia microcarpa SSR MARKER
在线阅读 下载PDF
基于SSR标记的葡萄品种鉴别和指纹图谱构建
20
作者 董志刚 李晓梅 +8 位作者 谭伟 赵旗峰 王敏 黄丽萍 刘伟 马小河 杨兆亮 唐晓萍 王兰 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2018年第11期3605-3614,共10页
本研究基于SSR标记技术,对山西省农业科学院果树研究所自育葡萄品种及其亲本进行分子鉴别,并建立其对应的指纹图谱。供试材料为山西省农业科学院果树研究所9个自育葡萄品种及其7个亲本,采用国际通用的SSR荧光标记引物进行扩增,毛细管电... 本研究基于SSR标记技术,对山西省农业科学院果树研究所自育葡萄品种及其亲本进行分子鉴别,并建立其对应的指纹图谱。供试材料为山西省农业科学院果树研究所9个自育葡萄品种及其7个亲本,采用国际通用的SSR荧光标记引物进行扩增,毛细管电泳进行基因分型,品种鉴别及构建指纹图谱。从44对SSR引物中筛选出15对特异性引物用于随后的SSR扩增,共扩增出56条条带,其中多态性条带51条,多态性百分率为94.4%。SSR扩增结果分析表明,16份葡萄种质遗传距离的变异范围为0.068 7-0.919 1。UPGMA聚类分析表明,15对SSR标记不仅可用于不同亲本、不同种群、不同亚属间的亲缘关系鉴定,更可用于相同亲本近缘姊妹系品种及其亲本间的鉴别。该SSR指纹图谱的建立,可为中国葡萄品种的种质资源数据库的完善,近缘品种鉴别以及品种保护提供参考依据。 展开更多
关键词 葡萄 SSR标记 亲缘关系 SSR指纹图谱
上一页 1 2 66 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈