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江西省季节性A(H1N1)流感病毒的基因特点及耐药性分析 被引量:2
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作者 熊英 龚甜 +3 位作者 李健雄 周珺 施勇 徐刚 《中国卫生检验杂志》 2015年第2期153-156,共4页
目的分析江西省2005年-2009年季节性H1N1流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为流感防控提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择26株季节性A(H1N1)流感病毒,经核酸提取和one-step RTPCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定... 目的分析江西省2005年-2009年季节性H1N1流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为流感防控提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择26株季节性A(H1N1)流感病毒,经核酸提取和one-step RTPCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar 5.0和Mage 4.0序列分析软件分析M2以及NA基因特征以及耐药性位点。结果除2005年分离的3株病毒和2009年分离的2株病毒的M2基因重要位点未发生变异外,其他21株病毒均发生了S31N的氨基酸替换;2009年的5株分离株均发生H274Y突变外,其他21株病毒NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论 2005年分离株均对奥司他韦敏感,部分毒株对金刚烷胺类药物耐药;2006年-2008年的分离株对金刚烷胺类药物耐药,但对奥司他韦敏感;2009年的分离株均对奥司他韦耐药,部分毒株对金刚烷胺类药物也耐药,应加强流感病毒耐药性监测。 展开更多
关键词 季节性A(H1N1)流感病毒 M2基因 NA基因 耐药性
南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征研究
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作者 吴春敏 谢克锦 +3 位作者 黄火寿 郑鹃 罗宏活 谢剑锋 《海峡预防医学杂志》 CAS 2013年第3期6-8,共3页
目的了解南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征。方法随机选取4株从哨点医院分离到的季节性H1N1流感毒株,进行核酸提取和RT-PCR扩增,获得HA1基因片段,测定核苷酸序列,分析其基因特征。结果 4株季节性H1N1流感病毒与A/Califo... 目的了解南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征。方法随机选取4株从哨点医院分离到的季节性H1N1流感毒株,进行核酸提取和RT-PCR扩增,获得HA1基因片段,测定核苷酸序列,分析其基因特征。结果 4株季节性H1N1流感病毒与A/California/01/2009(H1N1)高度同源,同源性高达99.1%;相对于当前疫苗代表株A/Brisbane/59/2007(H1N1),其HA1区出现V131A、S141N、I184V、G185A、N186D、A189T和F260Y的氨基酸位点的改变;糖基化位点未发生改变。结论南平市2009年分离的季节性H1N1流感病毒抗原性发生一定的突变,但变异程度不大,应密切关注疫苗株对毒株的免疫效果。 展开更多
关键词 季节性H1N1流感病毒 血凝素 HA1基因 变异位点
一株2011年出现的季节性甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特性的研究 预览
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作者 沈佳仁 赵百慧 +7 位作者 高烨 俞雪莲 王嘉瑜 袁政安 吴凡 谢晓红 陶力新 张曦 《微生物与感染》 2012年第3期157-163,共7页
本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型HINl流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型HINl流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意... 本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型HINl流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型HINl流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意义。采用反转录一聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增病毒的HA和神经氨酸酶(NA)片段,并进行测序;应用分子生物学软件对获得的序列进行分析,绘制基因进化树;同时,通过血凝抑制试验检测2011年下半年健康人群中该流感病毒的抗体水平。结果显示,A/Shanghai/1167/2011(H1N1)的HA基因序列与世界卫生组织(WHO)2007~2008年季节性甲型H1N1流感病毒疫苗株A/Brisbane/59/2007(HiNl)最接近,同源性达99.2%,与新型甲型HINl流感病毒A,/california/07/2009疫苗株同源性仅为72.4%。其HA基因裂解位点为PSIQSR0GLF,尚未出现高致病性的分子特征。HA片段共编码557个氨基酸,有9个潜在的糖基化位点,序列与2009年前WHO疫苗株A/NewCaledonia/20/1999(HINl)、A/SolomonIslands/3/2006(H1N1)和/Brisbane/59/2007(HINl)相比,分别有15、12和4处不同,这些差异分布在Sa、Sb、Cal、Ca2、Cb5个抗原决定簇的氨基酸差异分别有5、5和2处。该毒株在健康人群血清的抗体阳性率为34.33%,几何平均效价(GMT)为10.38。A/Shan曲ai/1167/201l(H1N1)是2011年出现在上海地区的一个季节性甲型HINl流感病毒毒株,其抗原变异与既往季节性甲型HINl流感病毒相比不大,但在以A(HINl)pdm09为主要流行株的年份检测到散在发生的既往季节性甲型HINl流感病毒毒株应当引起重视,其在人群中的抗体水平较低,易引起流行,需要提高对类流感人群中此种毒株的持续监测。 展开更多
关键词 流行性感冒病毒 季节性甲型H1N1流行性感冒病毒 血凝素序列
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季节性流感病毒H1N1实时荧光定量PCR检测方法的建立 预览 被引量:8
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作者 许黎黎 鲍琳琳 秦川 《中国比较医学杂志》 2011年第7期 62-66,共5页
目的建立一种快速定量检测季节性流感病毒H1N1核酸的实时荧光定量PCR检测方法及试剂盒。方法选择季节性流感病毒H1N1的保守基因NP基因作为检测靶目标,应用Clustal W软件进行序列同源性比对分析,筛选出季节性流感病毒H1N1特异性的保守序... 目的建立一种快速定量检测季节性流感病毒H1N1核酸的实时荧光定量PCR检测方法及试剂盒。方法选择季节性流感病毒H1N1的保守基因NP基因作为检测靶目标,应用Clustal W软件进行序列同源性比对分析,筛选出季节性流感病毒H1N1特异性的保守序列作为引物候选区域,然后应用Primer Express及PrimerPremier 5.0软件包对候选引物进行进一步配对及筛选,得到最优特异性检测引物。同时,由病毒全长cDNA扩增出NP基因,琼脂糖凝胶电泳检测NP基因的扩增情况并对目的条带进行切胶回收及纯化,对回收后的NP全长基因进行核酸浓度测定,并换算成拷贝数,作为定量标准品。结果应用ABI公司的Power SYBR Green PCR MasterMix及StepOne实时荧光定量PCR仪,该检测系统灵敏度可达102 copies/μL,不同梯度标准品间线性关系(R2)达0.999,斜率为-0.3433,扩增效率为95.572%,所有标准品均在83.2℃出现尖且窄的特异性熔解峰。结论利用该检测系统可以快速定量检测季节性流感病毒H1N1,灵敏度高,可用作基础及临床实验室对季节性流感病毒H1N1感染的辅助诊断方法和临床效果的监测手段,对实验操作者要求相对较低,具有实际的应用价值。 展开更多
关键词 季节性流感病毒H1N1 荧光定量PCR 病毒载量
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