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Recent Progress on Functional Genomics Research of Enterovirus 71
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作者 Huiqiang Wang Yuhuan Li 《中国病毒学:英文版》 CAS CSCD 2019年第1期9-21,共13页
Enterovirus 71(EV71) is one of the main pathogens that causes hand-foot-and-mouth disease(HFMD). HFMD caused by EV71 infection is mostly self-limited;however, some infections can cause severe neurological diseases, su... Enterovirus 71(EV71) is one of the main pathogens that causes hand-foot-and-mouth disease(HFMD). HFMD caused by EV71 infection is mostly self-limited;however, some infections can cause severe neurological diseases, such as aseptic meningitis, brain stem encephalitis, and even death. There are still no effective clinical drugs used for the prevention and treatment of HFMD. Studying EV71 protein function is essential for elucidating the EV71 replication process and developing anti-EV71 drugs and vaccines. In this review, we summarized the recent progress in the studies of EV71 noncoding regions(50 UTR and 30 UTR) and all structural and nonstructural proteins, especially the key motifs involving in viral infection, replication, and immune regulation. This review will promote our understanding of EV71 virus replication and pathogenesis, and will facilitate the development of novel drugs or vaccines to treat EV71. 展开更多
关键词 ENTEROVIRUS 71 (EV71) FUNCTIONAL GENOMICS Structural PROTEIN Nonstructural PROTEIN VIRAL PROTEIN function
细菌脲酶蛋白复合物及其活化机制
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作者 李晓姣 赵圣国 +2 位作者 郑楠 程建波 王加启 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期204-215,共12页
脲酶能够催化尿素分解生成氨,在农业和医学领域中具有重要的意义。细菌脲酶蛋白包括结构蛋白(UreA、UreB和UreC)和辅助蛋白(UreD/UreH、UreE、UreF和UreG),它们在脲酶活化过程中各自具有独特的作用,结构蛋白形成脲酶活性中心,而辅助蛋... 脲酶能够催化尿素分解生成氨,在农业和医学领域中具有重要的意义。细菌脲酶蛋白包括结构蛋白(UreA、UreB和UreC)和辅助蛋白(UreD/UreH、UreE、UreF和UreG),它们在脲酶活化过程中各自具有独特的作用,结构蛋白形成脲酶活性中心,而辅助蛋白主要负责镍离子的传递。文中综述了细菌脲酶蛋白复合物的结构和功能,以及各蛋白之间如何相互作用完成其活化过程,以期为脲酶活性调控研究及脲酶抑制剂开发等提供理论指导。 展开更多
关键词 细菌脲酶 结构蛋白 辅助蛋白 活化机制
慢性蜜蜂麻痹病毒SP1蛋白的原核表达及免疫原性分析
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作者 李明 孙莉 +1 位作者 马鸣潇 侯振中 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期473-478,共6页
慢性蜜蜂麻痹病毒(Chronic bee paralysis virus,CBPV)主要侵袭成年工蜂,造成患病蜜蜂神经麻痹,丧失飞行能力,出现爬行现象。CBPV据推测有两个结构蛋白SP1和SP2,通过对SP1蛋白的免疫原性探索,为SP1蛋白的功能研究和CBPV生物制剂研制奠... 慢性蜜蜂麻痹病毒(Chronic bee paralysis virus,CBPV)主要侵袭成年工蜂,造成患病蜜蜂神经麻痹,丧失飞行能力,出现爬行现象。CBPV据推测有两个结构蛋白SP1和SP2,通过对SP1蛋白的免疫原性探索,为SP1蛋白的功能研究和CBPV生物制剂研制奠定基础。本研究根据大肠杆菌密码子的偏嗜性,对CBPVSP1基因进行优化和合成,将其克隆至原核表达载体pET-32a,获得重组表达质粒pET-Opti-SP1。将重组质粒转化至宿主菌BL21(DE3)中诱导表达,用SDS-PAGE和Western Blot方法对该蛋白进行分析和鉴定,然后对最佳表达条件进行摸索。在此基础上,用纯化后的SP1蛋白免疫接种BALB/c小鼠,同时设置纯化病毒组、pET-32a对照组和空白对照组,检测免疫小鼠的淋巴细胞增殖指数(SI)和血清中抗体水平。结果表明,首次成功表达和纯化了重组SP1蛋白,且该蛋白能诱导产生特异性抗CBPV的抗体,促进淋巴细胞的增殖和提高IL-4、IL-10、IFN-γ水平,具有较好的免疫原性。本研究为进一步研究CBPV SP1蛋白的功能和防治CBPV生物制剂的研发提供了帮助。 展开更多
关键词 慢性蜜蜂麻痹病毒(CBPV) 慢性蜜蜂麻痹病(CBPD) 结构蛋白 原核表达 免疫原性
结构蛋白质组学研究进展 预览
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作者 周烨 刘哲益 王方军 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期788-797,共10页
蛋白质结构与其生物学功能直接相关,蛋白质功能的调控也主要依赖于其构象和相互作用的动态调节。对蛋白质结构和功能的研究一直是生命科学领域的研究热点,也是当前蛋白质组学研究的重要发展方向。该综述重点讨论了近年来基于质谱的结构... 蛋白质结构与其生物学功能直接相关,蛋白质功能的调控也主要依赖于其构象和相互作用的动态调节。对蛋白质结构和功能的研究一直是生命科学领域的研究热点,也是当前蛋白质组学研究的重要发展方向。该综述重点讨论了近年来基于质谱的结构蛋白质组学主要分析方法的原理、进展和应用,主要包括非变性质谱法、限制性蛋白质酶切法、化学交联法、氢氘交换法、共价化学标记法、热稳定性分析法等;最后对结构蛋白质组学的发展进行了总结与展望。 展开更多
关键词 结构蛋白质组学 质谱 蛋白质相互作用 综述
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传染性支气管炎病毒中和表位研究进展
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作者 李雯雯 黄勇 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第2期233-237,共5页
传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)能引起急性、高度接触性传染病,严重危害全球家禽业。目前主要通过接种疫苗来控制该病,但效果不佳。中和表位能使中和抗体与相应抗原相互作用,中和抗体能抵御病毒感染、消除病毒并... 传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)能引起急性、高度接触性传染病,严重危害全球家禽业。目前主要通过接种疫苗来控制该病,但效果不佳。中和表位能使中和抗体与相应抗原相互作用,中和抗体能抵御病毒感染、消除病毒并防止病毒传播和扩散,在免疫中发挥重要的作用。因此鉴别出中和表位对预防和控制疾病以及有效疫苗和诊断试剂的发展十分重要。本文主要通过该病毒的四个结构蛋白来介绍其中和表位,以期对IBV中和表位的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 结构蛋白 中和表位 疫苗
东南亚地区寨卡病毒的流行及结构蛋白分子进化特征分析
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作者 林垚 洪珊 +1 位作者 蓝青萍 孙强明 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期958-964,共7页
目的分析寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)在东南亚地区的感染传播情况,探讨其分子水平上的进化特征。方法用关键词和主题词检索ZIKV在东南亚地区暴发感染流行情况。在GenBank中获取ZIKV东南亚病毒株全基因序列,采用BIOEDIT软件进行比对;利用M... 目的分析寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)在东南亚地区的感染传播情况,探讨其分子水平上的进化特征。方法用关键词和主题词检索ZIKV在东南亚地区暴发感染流行情况。在GenBank中获取ZIKV东南亚病毒株全基因序列,采用BIOEDIT软件进行比对;利用MEGA 7. 0软件绘制系统进化树;将结构蛋白核苷酸翻译获得其相应的氨基酸序列,分析突变情况;统计不同株型间结构蛋白核苷酸突变和氨基酸替代位点;预测包膜蛋白第三结构域(envelop domainⅢ,ED-Ⅲ)的二级结构。结果 ZIKV在东南亚国家均有血清学感染或回顾性检测阳性报道,其中越南、泰国和新加坡ZIKV感染病例较多,疾病负担较为严重。系统进化树表明,东南亚ZIKV株均属于亚洲型,2016年新加坡株(序列号:KY241788)与2015年巴西株亲缘关系最近,1966年分离的马来西亚株与其他东南亚株亲缘关系较远。东南亚ZIKV各株型间衣壳蛋白(capsid protein,C)的碱基突变点为22处,突变率为6. 36%,造成非同义氨基酸突变点为19处,突变率为16. 52%。前膜蛋白(pre-membrane protein,prM)的碱基突变点为51处,突变率为10. 12%,造成非同义氨基酸突变点为37处,突变率为22. 02%。包膜蛋白(envelope protein,E)的碱基突变点为141处,突变率为9. 33%,造成非同义氨基酸突变点为101处,突变率为20. 04%。ED-Ⅲ二级结构预测结果显示,在该区域2株代表株有相同数量的蛋白结合位点,代表株2(1966 Malaysia KX377336)存在1个蛋白结合位点富集区(ED-Ⅲ:55-63),而代表株1(2014 Thailand KU681081)蛋白结合位点分布较均匀,代表株2的ED-Ⅲ存在1个二硫键,而代表株1不存在,代表株1(ED-Ⅲ:79-80)存在1个解螺旋,而代表株2不存在。结论通过病例统计分析、系统发育分析、蛋白质核苷酸及氨基酸序列比较分析、ED-Ⅲ二级结构预测,为研究东南亚地区ZIKV不同株型间的生物学和流行致病性差异提供参考。 展开更多
关键词 寨卡病毒 东南亚 流行 结构蛋白 分子特征
巴氏杀菌和超巴氏杀菌对牛乳清蛋白结构及热稳定性的影响 预览
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作者 王喜波 张安琪 +3 位作者 王玉莹 崔强 周国卫 王琳 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期307-313,共7页
为了研究巴氏杀菌与超巴氏杀菌处理对牛乳清蛋白结构的影响,采用热力学和光谱学等方法测定乳清蛋白结构及稳定性。红外光谱分析结果显示巴氏杀菌处理对乳清蛋白二级结构影响不显著,而经超巴氏杀菌处理后的乳清蛋白中α-螺旋结构含量显... 为了研究巴氏杀菌与超巴氏杀菌处理对牛乳清蛋白结构的影响,采用热力学和光谱学等方法测定乳清蛋白结构及稳定性。红外光谱分析结果显示巴氏杀菌处理对乳清蛋白二级结构影响不显著,而经超巴氏杀菌处理后的乳清蛋白中α-螺旋结构含量显著减少,无规则卷曲结构含量显著增多,结构转变的更为无序,其稳定性更好;荧光光谱分析结构表明经121℃、5 s超巴氏杀菌处理的乳清蛋白样品发生红移,说明超巴氏杀菌改变了乳清蛋白二级和三级结构;差示扫描量热法分析结果显示121℃、5 s热处理的乳清蛋白样品热变性温度为99.9℃,高于巴氏杀菌处理的乳清蛋白样品,表明超巴氏杀菌处理后的乳清蛋白样品的稳定性显著提高,期望为制备高品质乳提供理论基础。 展开更多
关键词 热处理 结构分析 热性能 巴氏杀菌 超巴氏杀菌 乳清蛋白
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Detecting molecular vibrational modes of side chains and endpoints in nanoscale proteins with graphene plasmon
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作者 吴晨晨 刘宁 +7 位作者 胡海 郭相东 廖宝鑫 刘佳明 王黎明 陈春英 杨晓霞 戴庆 《中国光学快报:英文版》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第6期86-91,共6页
Monitoring the chemical and structural changes in protein side chains and endpoints by infrared(IR)spectroscopy is important for studying the chemical reaction and physical adsorption process of proteins.However,the d... Monitoring the chemical and structural changes in protein side chains and endpoints by infrared(IR)spectroscopy is important for studying the chemical reaction and physical adsorption process of proteins.However,the detection of side chains and endpoints in nanoscale proteins is still challenging due to its weak IR response.Here,by designing a double layered graphene plasmon sensor on MgF2/Si substrate in the IR fingerprint region,we detect the vibrational modes in side chains and endpoints(1397 cm^-1 and 1458 cm^-1)of monolayer protein.The sensor could be applied on biochemistry to investigate the physical and chemical reaction of biomolecules. 展开更多
关键词 Monitoring the chemical structural changes in protein REACTION of biomolecules
冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)蛋白结构特性分析
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作者 匡志新 柴博雅 +7 位作者 李春艳 孙宏亮 朱美宣 熊晋峰 谢冰丽 王帆 解辉 邹勇 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第4期375-379,共5页
目的分析冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)蛋白的结构特性。方法 SDS-PAGE电泳分离4批冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)原液,电泳条带经nano LC-MS/MS进行蛋白鉴定,Native-PAGE分析病毒颗粒的完整性,并分析蛋白相对分子质量。同时进行N-末端... 目的分析冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)蛋白的结构特性。方法 SDS-PAGE电泳分离4批冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)原液,电泳条带经nano LC-MS/MS进行蛋白鉴定,Native-PAGE分析病毒颗粒的完整性,并分析蛋白相对分子质量。同时进行N-末端氨基酸序列分析。结果 SDS-PAGE分析可见5个主条带,分别为狂犬病毒G、M、N、P蛋白及G蛋白二聚体(G-1),经nano LC-MS/MS鉴定,确定相对分子质量分别为74 000、21 885、57 287、40 934及141 067,各结构蛋白均包含在病毒颗粒中,M、N、P、G蛋白的N-末端起始氨基酸序列为分别为MNFLR、MDADR、MSKIF、MVPQA,与预期一致。结论 4批冻干人用狂犬病疫苗(Vero细胞)原液所含结构蛋白源于狂犬病病毒。 展开更多
关键词 狂犬病疫苗 结构蛋白 SDS-PAGE分析 nano LC-MS/MS 氨基酸序列分析 VERO细胞
柯萨奇病毒B组2型(CVB2)病毒蛋白转染上皮细胞后诱导的免疫应答信号分子的特征分析
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作者 牟唐维 吴化叶 +3 位作者 柳蕾 王建斌 张莹 李琦涵 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期321-326,共6页
目的分析柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CVB2)病毒蛋白转染上皮细胞后诱导的免疫应答信号分子特征。方法构建CVB2结构蛋白重组真核表达质粒转染16HBE细胞,收集转染后的16HBE细胞培养上清和裂解物。利用RT-Q-PCR技术检测转染后的16... 目的分析柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CVB2)病毒蛋白转染上皮细胞后诱导的免疫应答信号分子特征。方法构建CVB2结构蛋白重组真核表达质粒转染16HBE细胞,收集转染后的16HBE细胞培养上清和裂解物。利用RT-Q-PCR技术检测转染后的16HBE细胞中与固有免疫应答相关的信号分子的mRNA表达水平。利用ELISPOT检测转染后的16HBE细胞上清和裂解物与T细胞共培养后该T细胞的增殖效应。结果CVB2结构蛋白VP1~VP4转染16HBE细胞后与固有免疫相关的信号分子如TAK、NIK、IKKα、IFN-β等基因表达量均发生了不同程度的上调;CVB2 VP1~VP4转染后的16HBE细胞上清和裂解物与T细胞共培养发现,均能刺激T细胞增殖。结论CVB2结构蛋白VP1~VP4可以不同程度地激活与固有免疫相关信号分子的表达,并且对适应性免疫的激活具有促进作用。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组2型 结构蛋白 免疫应答
登革病毒1型Ⅰ~Ⅴ基因亚型的基因组差异分析
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作者 文送娇 陈曦 +8 位作者 洪珊 席珏敏 王晓丹 陈俊英 潘玥 叶超 管娇琼 林垚 孙强明 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第2期152-156,共5页
目的分析登革病毒1型(Dengue virus type 1,DENV-1)Ⅰ~Ⅴ基因亚型基因组全长核苷酸及氨基酸序列差异。方法通过GenBank搜索DENV-1 5个不同基因亚型的全长基因组序列,获得其相应的氨基酸序列。采用BIOEDIT软件,统计基因亚型间核苷酸突变... 目的分析登革病毒1型(Dengue virus type 1,DENV-1)Ⅰ~Ⅴ基因亚型基因组全长核苷酸及氨基酸序列差异。方法通过GenBank搜索DENV-1 5个不同基因亚型的全长基因组序列,获得其相应的氨基酸序列。采用BIOEDIT软件,统计基因亚型间核苷酸突变和氨基酸替代位点,分析其相似度,通过RNA二级结构在线预测网站预测DENV-1不同亚型间3′UTR的二级结构差异,蛋白结构在线预测网站预测主要流行于中国的Ⅰ及ⅤDENV-1基因亚型结构蛋白的二级结构,对其氨基酸组成及编码序列中可能存在的蛋白结合区域等进行差异分析。结果DENV-1 5个基因亚型核苷酸相似性为91. 40%~94. 50%,氨基酸序列相似性为97. 11%~98. 38%,5个基因亚型各自编码3 392个氨基酸,其中共有195个位点有氨基酸的变化。DENV-1不同亚型的3′UTR的二级结构各不相同。DENV-1基因型为Ⅰ、Ⅴ的775个氨基酸中占组成比例最多的均是苏氨酸(T),Ⅰ型可能的蛋白结合位点有26个,多聚核苷酸结合位点有9个。Ⅴ型可能的蛋白结合位点有24个,多聚核苷酸结合位点有7个。他们均有相同数量的螺旋和跨膜螺旋。结论通过对DENV-1 5个不同的基因亚型的全长核苷酸和氨基酸序列的比较分析,及Ⅰ、Ⅴ基因亚型结构蛋白二级结构的预测,为研究DENV-1不同基因型之间的生物学和致病性差异提供参考。 展开更多
关键词 登革病毒1型 基因亚型 基因组 结构蛋白 二级结构
弹状病毒基因组及功能基因研究进展
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作者 张莉娟 杨圆圆 +6 位作者 方伟 李宁求 梁红茹 林强 刘礼辉 黄志斌 付小哲 《基因组学与应用生物学》 CSCD 北大核心 2018年第2期815-826,共12页
弹状病毒(rhabdovirus)是一类有包膜的负链RNA病毒,其宿主范围广泛,包括哺乳动物、鸟类、爬行动物、鱼类、昆虫以及植物等。大多数的弹状病毒是动植物重要病原,具有较强的致病性。解析病毒基因组及功能基因可为该病毒的致病机理、与... 弹状病毒(rhabdovirus)是一类有包膜的负链RNA病毒,其宿主范围广泛,包括哺乳动物、鸟类、爬行动物、鱼类、昆虫以及植物等。大多数的弹状病毒是动植物重要病原,具有较强的致病性。解析病毒基因组及功能基因可为该病毒的致病机理、与宿主的互作机制以及疫苗研制等相关研究提供理论依据。本综述对弹状病毒的分类、基因组结构、结构蛋白及非结构蛋白功能等方面研究进行概述、归纳与简评,旨在为弹状病毒相关研究提供借鉴。 展开更多
关键词 弹状病毒 基因组 结构蛋白 非结构蛋白
轮状病毒NSP5结构与功能的研究进展 预览
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作者 刘洋 林晓晨 李鸿钧 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期72-74,共3页
轮状病毒(RV)是世界范围内导致婴幼儿胃肠道疾病的主要病原体,RV基因组由11个分节段的双链RNA组成,分别编码6个结构蛋白(VP1、VP2、VP3、VP4、VP6和VP7)和6个非结构蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5和NSP6),其中第11基因片... 轮状病毒(RV)是世界范围内导致婴幼儿胃肠道疾病的主要病原体,RV基因组由11个分节段的双链RNA组成,分别编码6个结构蛋白(VP1、VP2、VP3、VP4、VP6和VP7)和6个非结构蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5和NSP6),其中第11基因片段编码非结构蛋白NSP5。NSP5蛋白较大,NSP5在病毒感染细胞中以二聚体形式存在,是一个高度磷酸化的蛋白,可与轮状病毒其他非结构蛋白或结构蛋白相互作用,具有RNA结合活性,在病毒复制过程中主要通过与 NSP2的一系列相互作用发挥功能。对轮状病毒的相关结构与功能的研究十分必要,近年来,对轮状病毒的非结构蛋白进行了大量研究,主要集中在其结构、表达、功能及免疫学性质方面,现就目前国内外对轮状病毒NSP5结构与功能的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 轮状病毒 结构蛋白 非结构蛋白 NSP5
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寨卡病毒蛋白结构与功能研究进展
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作者 程梦丽 李晓峰 秦成峰 《微生物学通报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1787-1793,共7页
2015年以来,南美暴发大规模寨卡疫情,因其与新生儿小头症等严重神经发育疾病密切相关,被世界卫生组织列为国际关注的突发公共卫生事件。与其他虫媒黄病毒类似,寨卡病毒为单股正链RNA病毒,其基因组编码的3种结构蛋白构成病毒颗粒,7种非... 2015年以来,南美暴发大规模寨卡疫情,因其与新生儿小头症等严重神经发育疾病密切相关,被世界卫生组织列为国际关注的突发公共卫生事件。与其他虫媒黄病毒类似,寨卡病毒为单股正链RNA病毒,其基因组编码的3种结构蛋白构成病毒颗粒,7种非结构蛋白参与病毒复制生活周期的调控。在全球科学家的共同努力下,寨卡病毒蛋白结构与功能的研究取得了突破性进展,极大地促进研究者对病毒复制与致病机制的认识,也为疫苗和药物研发提供了重要科学依据和潜在靶标。本文将对寨卡病毒蛋白的结构与功能的最新研究进展作一综述,并讨论当前面临的挑战和机遇。 展开更多
关键词 寨卡病毒 结构蛋白 非结构蛋白 结构
鹅细小病毒安徽分离株NS和VP基因的克隆及序列分析 预览
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作者 戴银 张丹俊 +5 位作者 赵瑞宏 胡晓苗 沈学怀 侯宏艳 潘孝成 周学利 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第5期1177-1183,共7页
为研究安徽省鹅细小病毒(goose parvovirus,GPV)的遗传变异特征,本研究通过PCR扩增获得GPV基因AH,并与天鹅、番鸭、雁鹅等宿主的GPV相应基因序列进行了比对。序列分析可见,AH基因包括完整的NS和VP基因,长度分别为1 884和2 199bp,分别... 为研究安徽省鹅细小病毒(goose parvovirus,GPV)的遗传变异特征,本研究通过PCR扩增获得GPV基因AH,并与天鹅、番鸭、雁鹅等宿主的GPV相应基因序列进行了比对。序列分析可见,AH基因包括完整的NS和VP基因,长度分别为1 884和2 199bp,分别编码2个非结构蛋白和3个结构蛋白。遗传进化分析显示,安徽分离株AH基因与重庆分离株毒株RC16及安徽分离的强毒株Y、E、Yan-2等基因序列的遗传距离较近;而与安徽分离的鸭源细小病毒株DS15和匈牙利分离株Virulent B,尤其是与疫苗株SYG61v遗传距离较远。同源性分析结果表明,AH-NS基因与毒株RC16核苷酸序列同源性最高,为99.6%;与疫苗株SYG61v同源性最低,为94.3%;AH-VP基因与毒株RC16的核苷酸序列一致,而与毒株DS15同源性仅为95.2%。安徽GPV AH基因序列与强毒株的基因位点一致,在VP3基因的第797、1 141、1 144、1 169和1 185bp处分别为G、A、G、C、T,结合该毒株引发疾病的严重程度,符合高致病力毒株特点。本试验结果表明,GPV同源性普遍较高,宿主范围较广泛,对不同品种水禽均有较强的侵染力。 展开更多
关键词 鹅细小病毒(GPV) 非结构蛋白 结构蛋白 序列分析
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肿瘤相关Smads家族蛋白的计算机模拟修饰 预览
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作者 许宏宣 刘小强 常凯 《西华师范大学学报:自然科学版》 2018年第4期383-389,共7页
本文旨在比较分析Smad蛋白家族的结构与功能特性,进而对不稳定蛋白进行模拟修饰,为深入开展Smad蛋白功能研究奠定基础;应用生物信息学对比分析Smad蛋白质家族成员的理化特性、结构特点及功能差异,基于各自特征对不稳定蛋白质进行修饰预... 本文旨在比较分析Smad蛋白家族的结构与功能特性,进而对不稳定蛋白进行模拟修饰,为深入开展Smad蛋白功能研究奠定基础;应用生物信息学对比分析Smad蛋白质家族成员的理化特性、结构特点及功能差异,基于各自特征对不稳定蛋白质进行修饰预测并评估其稳定性;结果表明氨基酸序列的相似性在Smad亚家族内极高;亚家族间则较低。家族各成员分子量、等电点、消光系数等理化性质差异显著,各成员均为疏水性蛋白(GRAVY<0)且体外稳定性较差(Instabilityindex>40)。测定Smad蛋白质的pI值和消光系数能够有效对Smad进行快速分类。比较分析亚家族间蛋白质结合位点和三维结构均具有与蛋白质的功能相对应的标志性特征,体现了各成员的功能多样性。最后就研究热点蛋白Smad4,6,7的不稳定结构进行模拟突变,预测蛋白质在体外环境15~50℃区间相对稳定;对Smad蛋白家族进行了系统的对比分析,并对不稳定蛋白进行了理想的模拟修饰,为进一步开展Smad在肿瘤发生途径与作用机制中的研究提供依据。 展开更多
关键词 SMAD蛋白 信息学分析 结构模拟 蛋白修饰
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PRRSV标记病毒样颗粒的制备及其鉴定
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作者 王俊 代军飞 +9 位作者 马炳 丁耀忠 李茜 侯谦 乌云达来 李克斌 杨儒爱 刘永生 张永光 张杰 《中国兽医科学》 CSCD 北大核心 2018年第11期1341-1351,共11页
当今预防猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)的灭活苗和弱毒苗都存在不可避免的局限性,所以研制新型疫苗势在必行。病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)在形态结构上与天然病毒粒子无异,... 当今预防猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)的灭活苗和弱毒苗都存在不可避免的局限性,所以研制新型疫苗势在必行。病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)在形态结构上与天然病毒粒子无异,生物安全指数高,是理想的传统疫苗替代品。猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)粒子主要由能够诱导产生中和抗体的GP5蛋白和具有强细胞免疫力的M蛋白组成基本框架结构。本研究以2型高致病性PRRSV的GP5蛋白和M蛋白为研究对象,通过Bac-to-Bac昆虫杆状病毒表达系统,构建标记型PRRSV VLPs,同时探索核衣壳蛋白N对VLPs形成的影响。在本试验中将含有Myc标签的GP5(Myc-GP5)和含有His标签的M(His-M)蛋白基因分别克隆至pFastBac dual载体的p10和pH双元启动子下;N蛋白基因克隆至pFastBac HTB载体上,转染sf9和Highfive细胞后,GP5、M和N蛋白均被成功表达。透射电镜观察结果表明,Myc-GP5和His-M能够自动组装成VLPs,并且与天然PRRSV形态一致,具有双层膜结构,直径大小在40-60 nm。采用抗M蛋白的家兔血清进行免疫电镜观察,结果显示,Myc和His双标记型VLPs与天然病毒一样都能够被金颗粒标记,而且共感染的N蛋白不影响标记型VLPs的组装。本研究首次采用昆虫杆状病毒表达系统成功制备了PRRSV的双标记型VLPs,具备与天然病毒相似的特性,为开发高效安全以及能够区分感染与免疫VLPs疫苗奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征 标记病毒样颗粒 结构蛋白 昆虫杆状病毒表达 共感染
禽安卡拉病毒的鉴定和主要结构蛋白基因分子特征分析 被引量:1
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作者 常超越 张召兴 +5 位作者 张志强 贾青辉 张建文 李蕴玉 吴同垒 李佩国 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期895-899,916共6页
安卡拉病毒属禽腺病毒C群Ⅳ血清型,临床上以引起患病鸡心包积液和肝炎为典型病理变化,发病急,死亡快,对养禽业造成巨大的经济损失。2016年5月秦皇岛市昌黎县某养鸡场养殖肉鸡大量死亡,死亡率高达80%,剖检见典型的心包积液、肝脏... 安卡拉病毒属禽腺病毒C群Ⅳ血清型,临床上以引起患病鸡心包积液和肝炎为典型病理变化,发病急,死亡快,对养禽业造成巨大的经济损失。2016年5月秦皇岛市昌黎县某养鸡场养殖肉鸡大量死亡,死亡率高达80%,剖检见典型的心包积液、肝脏坏死和肾脏肿大,结合PCR鉴定、鸡胚和雏鸡接种试验,以及电镜观察,证明病原为安卡拉病毒,并命名为FAV-4QHD;通过对病毒主要结构蛋白Hexon、Penton、Fiber1和Fiber2基因测序和构建系统发育树发现,FAV-4 QHD与近几年的国内分离株亲缘关系最近,与FAV-4标准株0N1和国外分离株差异较大。研究结果为进一步分析安卡拉病毒毒力增强机制奠定基础。 展开更多
关键词 禽安卡拉病毒 结构蛋白 分子特征
Fh8明显增强PCV2Cap蛋白的可溶性表达及抗原性 预览
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作者 郭芸芸 张碧成 +4 位作者 孙小涵 汪伟 何孔旺 牛家强 张雪寒 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期356-360,共5页
猪圆环病毒2型(Porcine circovims type2,PCV2)的主要功能蛋白Cap蛋白,很难在体外获得可溶性表达。本研究旨在以Fh8蛋白为融合标签实现PCV20flf2基因在大肠杆菌中的可溶性表达,以小鼠评价可溶性Cap蛋白的抗原性。以病毒基因组为模板,扩... 猪圆环病毒2型(Porcine circovims type2,PCV2)的主要功能蛋白Cap蛋白,很难在体外获得可溶性表达。本研究旨在以Fh8蛋白为融合标签实现PCV20flf2基因在大肠杆菌中的可溶性表达,以小鼠评价可溶性Cap蛋白的抗原性。以病毒基因组为模板,扩增0flf2靶基因,插人pCold原核表达质粒,成功构建的pCold-ORF2阳性质粒转人大肠杆菌BL21中。利用SDS-PAGE分析Cap蛋白的可溶性表达情况,利用Western blotting鉴定Cap蛋白的反应原性。重组蛋白与佐剂乳化制备免疫原,免疫Balb/c小鼠,ELISA方法检测血清中Cap抗体,利用PCR检测组织脏器中病毒载量,以评估可溶性Cap蛋白的免疫原性。PCR结果表明,和PCV20flf2基因被成功扩增。SDS-PAGE结果表明MS标签显著提高了0flf2在大肠杆菌中的可溶性表达,分子量35000。Western blotting结果显示,猪PCV2阳性血清能够特异性的识别可溶性Cap蛋白。小鼠一次接种Cap蛋白28d后,抗体全部转阳,免于PCV2的攻击。表明通过新型小标签实现了PCV20flf2基因的可溶性表达,且具有良好的免疫原性。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 结构蛋白 Fh8 可溶性表达 抗原性
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猪流行性腹泻病毒结构蛋白的研究进展
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作者 王加圆 汪怿旸 金文杰 《畜牧与兽医》 北大核心 2018年第5期129-131,共3页
猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的一种急性、高度传染性的肠道疾病,PEDV由4个结构蛋白、15个非结构蛋白和ORF3组成。15个非结构蛋白仅在病毒复制过程中发挥了一定的作用,而4个结构蛋白构成了整个病毒颗粒,在病毒的复制... 猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的一种急性、高度传染性的肠道疾病,PEDV由4个结构蛋白、15个非结构蛋白和ORF3组成。15个非结构蛋白仅在病毒复制过程中发挥了一定的作用,而4个结构蛋白构成了整个病毒颗粒,在病毒的复制和转录过程中均发挥了重要的作用。现对结构蛋白S(纤突蛋白)、M(小包膜糖蛋白)、E(膜糖蛋白)和N(核衣壳蛋白)在病毒复制和转录中的作用、免疫保护中的作用以及在细胞侵入及流行病学中的作用进行综述。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 结构蛋白 细胞侵入
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