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人参属植物达玛烷合成酶基因的生物信息学分析 预览
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作者 张莹 王广 +4 位作者 左天 张小海 徐燃 张祚 张绍鹏 《武汉轻工大学学报》 2019年第2期25-30,共6页
对人参属植物皂苷生物合成途径中已知的达玛烷合成酶基因及其蛋白序列进行分子层面的比较分析,揭示该基因在不同物种间的进化关系。从Genbank中找到目前已公布的12种人参属植物达玛烷合成酶基因的序列信息,利用生物信息学方法对这些序... 对人参属植物皂苷生物合成途径中已知的达玛烷合成酶基因及其蛋白序列进行分子层面的比较分析,揭示该基因在不同物种间的进化关系。从Genbank中找到目前已公布的12种人参属植物达玛烷合成酶基因的序列信息,利用生物信息学方法对这些序列进行开放阅框预测、核酸及氨基酸序列的比对、序列理化性质分析、蛋白结构域预测以及系统发育树的构建。结果表明不同物种间的达玛烷合成酶基因在核苷酸和氨基酸平均相似性分别为99.13%和98.85%。通过系统发育树分析发现这12种不同来源的达玛烷合成酶基因按照聚类关系主要分为两个大分支,其中大部分之间有着较高的亲缘关系。通过生物信息学方法对人参属植物达玛烷合成酶基因进行分析,为深入阐明人参属植物中达玛烷皂苷途径的在不同物种间的进化关系,为探索人参皂苷合成的分子机制提供理论上的依据。 展开更多
关键词 人参属 达玛烷合成酶 理化性质 生物信息学分析
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白桦环阿齐醇合成酶(CAS)基因与达玛烯二醇合成酶(DS)基因的双基因RNA干扰载体构建 预览 被引量:1
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作者 梁甜 马泓思 +2 位作者 尹静 詹亚光 张梦岩 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期355-362,共8页
环阿齐醇合成酶(Cycloartenol synthase,cas)和达玛烯二醇合成酶(Dammarenediol synthase,DS)为白桦三萜合成过程分支途径关键酶基因,对CAS和DS基因的抑制或沉默将有利于三萜前体-2,3氧化角鲨烯向目标产物白桦脂醇和齐墩果酸合... 环阿齐醇合成酶(Cycloartenol synthase,cas)和达玛烯二醇合成酶(Dammarenediol synthase,DS)为白桦三萜合成过程分支途径关键酶基因,对CAS和DS基因的抑制或沉默将有利于三萜前体-2,3氧化角鲨烯向目标产物白桦脂醇和齐墩果酸合成。利用同源序列PCR方法及pRNAi-GG新型载体,进行D5单基因RNAi及DS与CAS双基因RNAi载体的构建。结果显示,分别克隆获得CAS和DSeDNA序列长度为300和509bp,Blast同源序列比对与已知日本白桦BPX1和OSCBPD相似度为100%和92%。依据基因RNAi引物设计及pRNAi-GG使用原则,分别将CAS、DS的正向片段和反向片段有序地连接到pRNAi-GG载体PDK内含子两侧,并转化大肠杆菌Transl-T1中,经PCR及克隆测序验证,获得白桦DS单基因和CAS、DS双基因干扰载体,并通过三亲杂交方法分别获得含有两个RNAi载体的工程农杆菌菌株。该研究为进一步通过基因工程手段阻断白桦三萜分支途径及促进前体物质向目标产物白桦酯醇和齐墩果酸方向合成奠定了基础。 展开更多
关键词 白桦 三萜 RNA干扰载体 环阿齐醇合成酶(CAS) 达玛烯二醇合成酶(DS)
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