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从专利分析角度看口蹄疫表位疫苗 预览
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作者 余璨 《山东化工》 CAS 2019年第18期61-63,共3页
口蹄疫(Foot and Mouth Disease,FMD)作为口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV)引起的偶蹄动物的A类传染病之首,其防治对于畜牧业的健康发展起到举足轻重的作用。作为一种新型疫苗,FMD表位疫苗由于其针对性强、特异性高、广... 口蹄疫(Foot and Mouth Disease,FMD)作为口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV)引起的偶蹄动物的A类传染病之首,其防治对于畜牧业的健康发展起到举足轻重的作用。作为一种新型疫苗,FMD表位疫苗由于其针对性强、特异性高、广谱性强,安全可靠以及便于规模化生产而具有广泛的应用前景。近年来,FMD表位疫苗的专利技术取得了很大进步,现以专利数据为基础对FMD表位疫苗构建中涉及到的FMDV相关的细胞表位、表位疫苗的构建以及制备方式的研究进展进行综述,为安全可靠的FMD疫苗的研制以及其他疾病的表位疫苗研究提供参考。 展开更多
关键词 口蹄疫 口蹄疫病毒 表位 表位疫苗
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加强动物病毒学研究,促进动物生产
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作者 李震 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1759-1760,共2页
动物病毒学与教育科研、社会生产、百姓生活等密切相关。我们在利用和享受动物病毒学研究成果的同时,也需要随时应对动物病毒性疫病新发和再现的严峻挑战。跟踪和展示动物病毒学领域最新研究成果有助于我们了解病毒这种最简单的生命形式... 动物病毒学与教育科研、社会生产、百姓生活等密切相关。我们在利用和享受动物病毒学研究成果的同时,也需要随时应对动物病毒性疫病新发和再现的严峻挑战。跟踪和展示动物病毒学领域最新研究成果有助于我们了解病毒这种最简单的生命形式,也有助于我们驯服和控制病毒并让其服务于社会需要。本专栏稿件包含了冠状病毒、非洲猪瘟病毒、圆环病毒、流感病毒、鸡马立克氏病毒、牛病毒性腹泻病毒等6种动物病毒病原体相关研究报告和综述,汇集了病原进化、表位筛选、病原与宿主互作等诸多研究内容,期望该专栏的出版有助于促进动物病毒性疫病相关研究领域的交流与进步。 展开更多
关键词 家禽 病毒 进化 表位 免疫应答 专栏
结核分枝杆菌基因Rv2660c、Rv2460c、Rv3875、Rv3804c细胞表位融合蛋白的表达及其免疫原性评价
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作者 周玉真 刘思静 +2 位作者 唐明圆 蒋宫羽 汪川 《四川大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期506-511,共6页
目的评价结核分枝杆菌基因Rv2660c、Rv2460c、Rv3875和Rv3804c的细胞表位融合蛋白的免疫原性,为研制新型多阶段结核疫苗提供可靠的靶抗原。方法将Rv2660c、Rv2460c、Rv3875和Rv3804c基因中的细胞表位串联构成融合抗原基因(命名为msv),... 目的评价结核分枝杆菌基因Rv2660c、Rv2460c、Rv3875和Rv3804c的细胞表位融合蛋白的免疫原性,为研制新型多阶段结核疫苗提供可靠的靶抗原。方法将Rv2660c、Rv2460c、Rv3875和Rv3804c基因中的细胞表位串联构成融合抗原基因(命名为msv),克隆到原核表达载体pEASY-Blunt E1中,诱导表达后采用亲和层析纯化表达产物,经SDS-PAGE和Western blot鉴定后,用纯化的融合抗原蛋白免疫小鼠,ELISA法检测免疫小鼠的特异性抗体滴度;分离免疫小鼠的脾淋巴细胞,采用淋巴细胞增殖法检测其免疫原性。结果成功构建了能表达融合抗原基因msv的原核表达质粒;SDS-PAGE和Western blot结果表明,表达产物亲和层析纯化后,获得相对分子质量为41.3×10^3的目的蛋白;ELISA检测免疫小鼠血清抗体滴度,结果表明特异性抗体效价约为1∶81 920;淋巴细胞增殖实验结果表明,抗原致敏的淋巴细胞经融合蛋白msv刺激后明显增殖。结论成功表达并纯化出融合蛋白msv,该融合蛋白可诱导小鼠特异性抗体表达和刺激细胞免疫应答,可作为结核疫苗的抗原组分。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 多阶段 Rv2660c Rv2460c Rv3875 Rv3804c 细胞表位
美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒GP4蛋白中和活性单克隆抗体制备及其抗原表位鉴定 预览
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作者 刘梦莹 李敏华 +2 位作者 王倩 田志军 周伦江 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期641-644,共4页
为制备具有中和活性的抗猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的单克隆抗体(MAb)并鉴定其抗原表位,本研究利用PRRSVSD53株的超离病毒作为免疫原,按常规方法免疫BALB/c小鼠并进行细胞融合。采用PRRSVSD53株和真核表达的PRRSV各结构蛋白作为检... 为制备具有中和活性的抗猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的单克隆抗体(MAb)并鉴定其抗原表位,本研究利用PRRSVSD53株的超离病毒作为免疫原,按常规方法免疫BALB/c小鼠并进行细胞融合。采用PRRSVSD53株和真核表达的PRRSV各结构蛋白作为检测抗原,应用间接免疫荧光试验(IFA)筛选到一株稳定分泌抗SD53株GP4蛋白的杂交瘤细胞株(LM26)。抗体亚类鉴定其为IgG2a,轻链为κ链。原核表达一系列截短的GP4蛋白鉴定LM26的抗原表位结果显示,LM26识别的抗原表位序列为57VVLQDI^62,此抗原表位在美洲型PRRSV中相对保守。病毒中和试验结果显示,MAb LM26仅针对PRRSV SD53株具有中和活性,中和效价最高为1∶50,对其它美洲株PRRSV均不具有中和活性。该MAb的制备为进一步研究PRRSVGP4蛋白的结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 单克隆抗体 GP4蛋白 表位 中和活性
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酶解大豆分离蛋白的抗原活性变化及其抗原表位分析 预览
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作者 王章存 袁路阳 +3 位作者 张露 胡金强 安广杰 赵学伟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第10期64-69,共6页
研究酶解过程中大豆蛋白分子成分和抗原性变化规律及酶解物中是否存在抗原表位序列。用碱性蛋白酶水解大豆分离蛋白后,首先分别用电泳和酶联免疫法分析蛋白质分子组分和抗原活性变化,结果发现,酶解过程中新生成23 ku和21 ku抗酶解肽链... 研究酶解过程中大豆蛋白分子成分和抗原性变化规律及酶解物中是否存在抗原表位序列。用碱性蛋白酶水解大豆分离蛋白后,首先分别用电泳和酶联免疫法分析蛋白质分子组分和抗原活性变化,结果发现,酶解过程中新生成23 ku和21 ku抗酶解肽链直到酶解120min时仍未消失,同时酶解物中剩余28%抗原活性。进一步通过胰蛋白酶对这两个肽链胶内酶解并用基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪分析后,将所得肽段氨基酸序列分别与抗原数据库中抗原表位序列和大豆分离蛋白氨基酸序列进行匹配解析,结果发现,在21 ku组分中含有两个完整的序列抗原表位(LQRFNQRSPQLQNLR和SEDKPFNLRSRDPIYSNKLGKFFEITPEKN),且均来自β-伴大豆球蛋白中的α-亚基,21 ku组分抗原剩余率为15.7%;在23 ku肽链中含有抗原表位的部分氨基酸序列,但未发现含有完整的抗原表位序列,23 ku组分抗原剩余率为2.1%,该组分中是否含有新的未知抗原表位或是否与糖链有关尚待深入研究。上述研究结果揭示了大豆蛋白酶解物中仍残留抗原性的部分原因。 展开更多
关键词 大豆分离蛋白 酶解 抗原活性 抗原表位
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埃博拉病毒包膜糖蛋白变异及抗原表位研究进展
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作者 刘硕 张黎 +2 位作者 王玉琳 黄维金 王佑春 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期801-812,共12页
埃博拉病毒在人类和非人灵长类中引起严重出血热疾病,死亡率高。包膜糖蛋白为埃博拉病毒唯一与病毒吸附宿主细胞、融合和进入等功能相关的蛋白。包膜糖蛋白突变会影响病毒感染力、细胞嗜性和与抗血清的中和敏感性。本文系统分析了埃博... 埃博拉病毒在人类和非人灵长类中引起严重出血热疾病,死亡率高。包膜糖蛋白为埃博拉病毒唯一与病毒吸附宿主细胞、融合和进入等功能相关的蛋白。包膜糖蛋白突变会影响病毒感染力、细胞嗜性和与抗血清的中和敏感性。本文系统分析了埃博拉病毒包膜糖蛋白的氨基酸突变,结合抗体结合位点和T细胞表位分析其对于埃博拉病毒感染和疫苗保护效果的影响。 展开更多
关键词 出血热 埃博拉病毒 抗原表位 基因突变
粪肠球菌Ace抗原表位预测及重组表位疫苗载体构建与表达 预览
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作者 郭珍珍 和春昊 +4 位作者 李滨洲 楚红燕 张晨昕 杨国宇 陈丽颖 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期379-384,共6页
利用生物信息学软件预测抗原表位,然后将筛选出的6个抗原表位基因片段分别与铁蛋白H亚基基因片段连接,并克隆到pET-32a表达载体中,构建能融合表达Ace抗原表位和铁蛋白H亚基的重组质粒pET-32a-ace1、pET-32a-ace2、pET-32a-ace3、pET-32a... 利用生物信息学软件预测抗原表位,然后将筛选出的6个抗原表位基因片段分别与铁蛋白H亚基基因片段连接,并克隆到pET-32a表达载体中,构建能融合表达Ace抗原表位和铁蛋白H亚基的重组质粒pET-32a-ace1、pET-32a-ace2、pET-32a-ace3、pET-32a-ace4、pET-32a-ace5、pET-32a-ace6,并经测序验证;优化诱导条件获得原核表达的重组蛋白后,用SDS-PAGE和WesternBlot验证其相对分子质量大小和免疫原性;将重组蛋白进行纯化超滤,然后进行透射电镜成像检查。结果显示,本研究成功构建了7种原核表达载体;在IPTG诱导下获得了5种可溶性表达的融合蛋白,且均有较强的免疫原性;重组融合蛋白Ace1-H、Ace3-H、Ace5-H和Ace6-H在透射电镜下观察到了具有与天然铁蛋白类似的特殊中空结构,且其直径与天然铁蛋白纳米笼类似;而带多表位的重组蛋白Ace-H虽然也能自组装成纳米级颗粒,但没有中空核心,其直径也比天然铁蛋白略大。 展开更多
关键词 粪肠球菌 胶原蛋白黏附素 铁蛋白 纳米笼 表位
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多房棘球蚴四跨膜蛋白的生物信息学分析
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作者 杨宇 张耀刚 +2 位作者 张灵强 任利 樊海宁 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期165-170,177共7页
目的采用生物信息学方法分析多房棘球蚴四跨膜蛋白(EmTspan)的结构与抗原表位。方法从NCBI数据库中下载EmTspan蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam、ProtScale、SOSUI、DNASTAR、SignalP、Cell-PLoc、SOMPA、NetPhos、Motif Scan、Phyre 2... 目的采用生物信息学方法分析多房棘球蚴四跨膜蛋白(EmTspan)的结构与抗原表位。方法从NCBI数据库中下载EmTspan蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam、ProtScale、SOSUI、DNASTAR、SignalP、Cell-PLoc、SOMPA、NetPhos、Motif Scan、Phyre 2、TMHMM等生物信息学软件分析蛋白质的理化性质、亚细胞定位、跨膜区域、磷酸化和翻译后修饰位点及二、三级结构,利用ABCpred、IEDB、SYFPEITHI软件分析并预测B细胞、T细胞的抗原表位,通过MEGA-X软件构建Tspan的分子进化树。结果 EmTspan蛋白是由236个氨基酸序列组成,分子式为C1163H1853N291O315S21,不稳定指数为32.77,为稳定蛋白;有4个跨膜区,定位于细胞膜;二级结构中,α螺旋占46.19%,β折叠占20.34%,β转角占8.05%,无规则卷曲占25.42%;EmTspan蛋白含有的B细胞、TCL细胞及Th细胞的抗原表位分别为7、15、8个;分子进化分析多房棘球蚴的Tspan和小口膜壳绦虫的Tspan亲缘关系较近。结论生物信息学预测EmTspan蛋白存在多个潜在的B细胞及T细胞表位,抗原性好,可为多房棘球蚴疫苗的研制、免疫诊断等提供理论依据。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 四跨膜蛋白 生物信息学 抗原表位
非对称流场流分离-超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱用于过敏原蛋白表位筛选 预览
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作者 李阳 杨奕 +5 位作者 邵兵 邹悦 宋宇 舒琳 梁启慧 韩南银 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期398-403,共6页
应用非对称流场流分离(AF4)技术结合超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)对过敏原蛋白表位进行筛选。将选择的过敏原蛋白(虾原肌球蛋白,TM)酶解后经UPLC-QTOF-MS分析,建立蛋白质肽谱。将TM酶解后的肽段与免疫球蛋白E混合孵... 应用非对称流场流分离(AF4)技术结合超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)对过敏原蛋白表位进行筛选。将选择的过敏原蛋白(虾原肌球蛋白,TM)酶解后经UPLC-QTOF-MS分析,建立蛋白质肽谱。将TM酶解后的肽段与免疫球蛋白E混合孵育30min,孵育过程中含有抗原表位的特异性肽段与免疫球蛋白E(IgE)结合,未结合的肽段仍留在溶液中。将孵育后的溶液进行AF4分离,已结合的肽段随IgE一起由出口流出,未结合的肽段透过分离通道膜,滤出至废液。收集出口流出的组分进行UPLC-QTOF-MS分析,与蛋白质肽谱匹配,找到特异性肽段,进而检测抗原表位。本研究扩展了非对称流场流分离技术的应用,对过敏原蛋白表位的检测进行了初步探索,为过敏原蛋白表位的研究提供了一种新的研究策略。 展开更多
关键词 非对称流场流分离 质谱 过敏原 表位 免疫球蛋白E
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利用E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白的研究 预览
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作者 王幸 张建楼 +2 位作者 霍珊珊 仲飞 张辉 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期90-95,共6页
为通过E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白,本试验利用DNAstar软件确定含有抗原表位的NS1蛋白片段,然后运用PCR方法从含有NS1基因的载体中扩增NS1抗原表位区基因片段,并将该基因片段插入到原核表达载体pGEX4T1中,构建成与GS... 为通过E.coli表达系统制备猪细小病毒NS1抗原表位区蛋白,本试验利用DNAstar软件确定含有抗原表位的NS1蛋白片段,然后运用PCR方法从含有NS1基因的载体中扩增NS1抗原表位区基因片段,并将该基因片段插入到原核表达载体pGEX4T1中,构建成与GST标签融合的NS1抗原表位基因的表达载体pGEXGSTNS1,将表达载体转化BL21大肠杆菌筛选出工程菌。经IPTG诱导表达NS1融合蛋白,经GST琼脂糖凝胶磁珠分离纯化,制备出与GST融合的NS1抗原表位蛋白。经SDSPAGE以及Westernblot鉴定,制备的NS1融合蛋白分子量和预期一致,并且可以和抗GST标签抗体进行特异反应,表明NS1抗原蛋白已成功制备,为下一步NS1抗体的研制提供了必要的条件。 展开更多
关键词 猪细小病毒 NS1蛋白 抗原表位 分离纯化
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基于纳米抗体CDR3区抗原表位展示制备生存素抗体及其鉴定 预览
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作者 王蕾 霍景瑞 +5 位作者 张国安 贾力 杨晓晖 张晶晶 刘颖 刘英富 《生物技术通讯》 CAS 2019年第3期321-325,共5页
目的:通过纳米抗体CDR3区展示生存素N端表位的方式,探索纳米抗体在抗原表位展示中的作用。方法:通过基因合成方法将生存素N端起始表位(氨基酸序列1~15)插入纳米抗体CDR3区,再构建到原核表达载体pET24a中,IPTG诱导表达,用带His标签的填... 目的:通过纳米抗体CDR3区展示生存素N端表位的方式,探索纳米抗体在抗原表位展示中的作用。方法:通过基因合成方法将生存素N端起始表位(氨基酸序列1~15)插入纳米抗体CDR3区,再构建到原核表达载体pET24a中,IPTG诱导表达,用带His标签的填料纯化,获得高纯度的目的蛋白,免疫雌性BALB/c小鼠,间接ELISA检测5次免疫后的效价,用抗原偶联纯化介质纯化免疫多抗,Western印迹检测多抗特异性。结果:IPTG诱导后,目的蛋白主要以包涵体形式存在,亲和层析获得纯度大于96%的目的蛋白,包涵体经复性后免疫小鼠,效价可达1∶512000,West?ern印迹特异性检测显示免疫多抗能够特异性结合生存素。结论:纳米抗体CDR3区生存素抗原N端表位展示的方法可用于抗生存素抗体的制备,并为今后纳米抗体表位展示相关研究奠定基础。 展开更多
关键词 纳米抗体 生存素 表位 抗体制备 鉴定
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Localization Analysis of Heterophilic Antigen Epitopes of H1N1 Influenza Virus Hemagglutinin
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作者 Chun-Yan Guo Hai-Xiang Zhang +8 位作者 Jun-Jun Zhang Li-Jun Sun Hui-Jin Li Dao-Yan Liang Qing Feng Yan Li Yang-Meng Feng Xin Xie Jun Hu 《中国病毒学:英文版》 CAS CSCD 2019年第3期306-314,共9页
Previous studies have indicated that two monoclonal antibodies(mAbs;A1-10 and H1-84)of the hemagglutinin(HA)antigen on the H1N1 influenza virus cross-react with human brain tissue.It has been proposed that there are h... Previous studies have indicated that two monoclonal antibodies(mAbs;A1-10 and H1-84)of the hemagglutinin(HA)antigen on the H1N1 influenza virus cross-react with human brain tissue.It has been proposed that there are heterophilic epitopes between the HA protein and human brain tissue(Guo et al.in Immunobiology 220:941-946,2015).However,characterisation of the two mAbs recognising the heterophilic epitope on HA has not yet been performed.In the present study,the common antigens of influenza virus HA were confirmed using indirect enzyme-linked immunosorbent assays and analysed with DNAMAN software.The epitopes were localized to nine peptides in the influenza virus HA sequence and the distribution of the peptides in the three-dimensional structure of HA was determined using PyMOL software.Key amino acids and variable sequences of the antibodies were identified using abYsis software.The results demonstrated that there were a number of common antigens among the five influenza viruses studied that were recognised by the mAbs.One of the peptides,P2(LVLWGIHHP191-199),bound both of the mAbs and was located in the head region of HA.The key amino acids of this epitope and the variable regions in the heavy and light chain sequences of the mAbs that recognised the epitope are described.A heterophilic epitope on H1N1 influenza virus HA was also introduced.The existence of this epitope provides a novel perspective for the occurrence of nervous system diseases that could be caused by influenza virus infection,which might aid in influenza prevention and control. 展开更多
关键词 H1N1 INFLUENZA virus HA ANTIGEN Monoclonal antibody LOCALIZATION Heterophilic EPITOPE
Identification of a Novel Universal Potential Epitope on the Cytoplasmic Tail of H7N9 Virus Hemagglutinin
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作者 Xi Liu Li Ding +8 位作者 Jing Yuan Jian Liao Lian Duan Wenfei Wang Weiguo Tan Weiye Yu Boping Zhou Xinchun Chen Zheng Yang 《中国病毒学:英文版》 CAS CSCD 2019年第3期334-337,共4页
Dear Editor,H7N9 is a recently identified subtype of influenza A virus that caused a major outbreak in humans in China in 2013.According to the latest data provided by the Chinese Center for Disease Control and Preven... Dear Editor,H7N9 is a recently identified subtype of influenza A virus that caused a major outbreak in humans in China in 2013.According to the latest data provided by the Chinese Center for Disease Control and Prevention(http://www.moh.gov.cn/zwgk/yqbb3/ejlist.shtml,updated on October 31,2018),the mortality rate of H7N9 infections in China amounts to 39.7%(611/1536).Thus,H7N9 poses a serious public health threat. 展开更多
关键词 IDENTIFICATION NOVEL UNIVERSAL POTENTIAL EPITOPE Cytoplasmic Tail
乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析 预览
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作者 李滚 张涛 +1 位作者 杨鑫荣 卢香香 《生物信息学》 2019年第2期86-94,共9页
乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关,它存在逆转录过程并且具有极强的潜伏性。本论文应用生物信息学分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在线分析软件预测乙肝病毒S蛋白的理化性质和亲疏水性、跨膜区域、信号肽特征、磷酸... 乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关,它存在逆转录过程并且具有极强的潜伏性。本论文应用生物信息学分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在线分析软件预测乙肝病毒S蛋白的理化性质和亲疏水性、跨膜区域、信号肽特征、磷酸化位点、二级结构以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。结果显示了乙肝病毒S蛋白由226个氨基酸组成,理论等电点是8.21,为不稳定蛋白,总平均亲水性为0.649,是疏水蛋白质,并且该蛋白存在信号肽,有4个跨膜区,有30个潜在的磷酸化位点,主要二级结构为α螺旋和无规则卷曲,同时,结合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、线性表位、β转角、柔性、抗原性的预测结果,可以找到潜在的抗原表位区域,为乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的参考依据,有利于进一步对乙型肝炎S蛋白的抗原性进行研究。 展开更多
关键词 HBV病毒 S蛋白 抗原表位 生物信息学
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幽门螺杆菌金属蛋白酶基因生物信息学分析
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作者 余飞艳 张惠娟 +5 位作者 张荣光 王琛 王海燕 何梦雅 范清堂 段广才 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第1期1-5,11共6页
目的测定幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)金属蛋白酶(metalloprotease,Mtp)基因mtp编码区核苷酸序列,采用生物信息学方法分析其编码蛋白(Mtp)的结构特征和生物学功能。方法用PCR方法从Hp MEL-Hp27菌株基因组DNA中扩增mtp基因,并通... 目的测定幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)金属蛋白酶(metalloprotease,Mtp)基因mtp编码区核苷酸序列,采用生物信息学方法分析其编码蛋白(Mtp)的结构特征和生物学功能。方法用PCR方法从Hp MEL-Hp27菌株基因组DNA中扩增mtp基因,并通过基因测序获得mtp基因序列,运用生物信息学软件分析其编码的蛋白Mtp的氨基酸序列、理化性质、跨膜区、信号肽、糖基化和磷酸化位点、空间结构以及抗原表位。结果 MEL-Hp27mtp基因编码区长615bp,编码204个氨基酸;生物信息学分析显示mtp基因在不同菌株间的同源性为91%~98%,其编码的Mtp蛋白为一种性质不稳定、偏碱性、亲水蛋白;该蛋白无跨膜区和信号肽,含有糖基化和磷酸化位点;二级结构中α螺旋占52.45%,延长链占16.67%,β转角占4.41%,无规则卷曲占26.47%;三级结构分析显示Mtp为球形低分子质量蛋白;该蛋白含有M48蛋白家族特征性结构域、B淋巴细胞和CTL淋巴细胞相关抗原表位。结论 Hp Mtp为小分子碱性亲水性蛋白,定位于胞质或胞核,可能参与细胞信号传递、功能调控和Hp感染免疫及其致病过程。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 金属蛋白酶 生物信息学 磷酸化位点 抗原表位
丙型肝炎病毒E2蛋白的生物信息学分析
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作者 李滚 张甜甜 +2 位作者 李蓓 张涛 卢香香 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第5期511-514,共4页
目的探讨研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物学特征。方法从NCBI数据库中获取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在线分析软件分析其生物学特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜区、信号肽,磷酸化位点、二级结构特征等,通过综合分析丙型肝... 目的探讨研究丙型肝炎病毒E2蛋白的生物学特征。方法从NCBI数据库中获取丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列,利用在线分析软件分析其生物学特征,包括分子式、半衰期、疏水性、跨膜区、信号肽,磷酸化位点、二级结构特征等,通过综合分析丙型肝炎病毒E2蛋白的各类性质,得到最佳抗原表位区域,并对丙型肝炎病毒E2蛋白氨基酸序列预测结果进行了比对分析。结果丙肝病毒E2蛋白由344个氨基酸组成,分子式为C1696H2543N463O490S21,不稳定系数为35.6,理论等电点为7.2,总体平均亲水性为-0.131,为稳定性亲水蛋白质,E2蛋白二级结构中主要成分为无规则卷曲(占比43.6%)。该蛋白无信号肽且无跨膜区,约存在50个磷酸化位点,最佳抗原区域位于95-100氨基酸位置。结论生物信息学方法预测丙型肝炎病毒E2蛋白属于稳定性亲水蛋白,含有抗原表位区域,可为丙型肝炎表位疫苗的研制提供参考依据。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 E2蛋白 抗原表位 生物信息学
IDH1单克隆抗体的制备及表位鉴定和双抗体夹心ELISA的建立 预览
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作者 杜晓娟 孟麟 +1 位作者 孙天一 寿成超(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1482-1486,共5页
目的:制备抗异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)单克隆抗体,并确定其识别IDH1的表位区域,在此基础上建立双抗体夹心ELISA法,为检测人外周血IDH1蛋白奠定基础。方法:用原核表达的IDH1-GST蛋白免疫Balb/c小鼠,经常规细胞融合技术和ELISA筛选获得抗IDH... 目的:制备抗异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)单克隆抗体,并确定其识别IDH1的表位区域,在此基础上建立双抗体夹心ELISA法,为检测人外周血IDH1蛋白奠定基础。方法:用原核表达的IDH1-GST蛋白免疫Balb/c小鼠,经常规细胞融合技术和ELISA筛选获得抗IDH1的单抗克隆。构建并表达IDH1的不同截短体融合蛋白,用Western blot和ELISA检测不同单抗与不同截短体蛋白的反应。通过双抗体夹心ELISA进行两两配对,获得有较好检测效果的配对抗体。结果:通过GSTIDH1和GST蛋白的ELISA双筛和Western blot的进一步鉴定,获得了8株抗IDH1的单克隆抗体,分别命名为1H8、4H7、5C8、7C3、7E12、13F6、16B11和16H7;5C8和7C3抗体识别的抗原表位位于IDH1 119~197位氨基酸;4H7的识别表位位于197~211位氨基酸,7E12和16B11的识别表位位于211~314位氨基酸,1H8和16H7的识别表位位于314~329位氨基酸,13F6的识别表位位于314~415位氨基酸。在双抗体夹心配对实验中,1H8包被抗体,4H7作为检测抗体,可获得相对较高的检测敏感性。结论:制备获得了8株抗IDH1特异性单克隆并鉴定了各自的抗原表位识别区域,初步建立了ELISA双抗体夹心检测法,为后续外周血中IDH1的检测奠定了基础。 展开更多
关键词 IDH1 单克隆抗体 抗原表位 双抗体夹心ELISA
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多房棘球绦虫SEVERIN蛋白基因的克隆及T、B细胞表位预测
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作者 王芬 赵明才 +4 位作者 胡容 王洁 王明霞 叶彬 刘家瑞 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期171-177,共7页
目的采用RT-PCR方法克隆多房棘球绦虫SEVERIN蛋白基因(EmSEVERIN),并进行T、B细胞表位等生物信息学分析。方法根据细粒棘球绦虫SEVERIN基因序列设计特异引物,以多房棘球绦虫原头蚴cDNA为模板扩增目的基因并测序。利用ProtParam、SMART、... 目的采用RT-PCR方法克隆多房棘球绦虫SEVERIN蛋白基因(EmSEVERIN),并进行T、B细胞表位等生物信息学分析。方法根据细粒棘球绦虫SEVERIN基因序列设计特异引物,以多房棘球绦虫原头蚴cDNA为模板扩增目的基因并测序。利用ProtParam、SMART、MotifScan、SWISS-MODEL等在线分析程序,结合DNAStar、DNAMAN等生物信息学软件分析、预测Emseverin基因编码蛋白的理化性质、保守结构域、翻译后修饰位点、三维结构及T、B细胞表位。结果成功克隆了长度为1 002 bp的EmSEVERIN基因,该基因编码蛋白由333 aa组成,等电点为6.10,含有3个类凝溶胶蛋白结构域,属于凝溶胶蛋白超家族。多房棘球绦虫SEVERIN蛋白含有5个T、B细胞联合表位,分别为34-49 aa、78-97 aa、160-187 aa、251-272 aa、295-314 aa。结论通过生物信息学方法筛选出多房棘球绦虫SEVERIN蛋白的5个T、B细胞联合表位,为抗棘球蚴病短肽疫苗的研制提供了理论基础。 展开更多
关键词 多房棘球绦虫 肌切蛋白 基因克隆 生物信息学 表位
细粒棘球绦虫磷酸丙糖异构酶抗原表位预测与分析
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作者 彭文军 李超群 +3 位作者 张耀刚 姜博璠 刘佳 曹得萍 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期180-183,共4页
目的利用生物信息学的方法对细粒棘球绦虫EgTPI B、T细胞表位进行预测,为细粒棘球绦虫诊断抗原的筛选提供分子生物学依据。方法采用Expasy中的protparam数据库推测EgTPI的理化性质;利用IEDB、ABCpred软件分析B细胞抗原表位。AMPHI法预... 目的利用生物信息学的方法对细粒棘球绦虫EgTPI B、T细胞表位进行预测,为细粒棘球绦虫诊断抗原的筛选提供分子生物学依据。方法采用Expasy中的protparam数据库推测EgTPI的理化性质;利用IEDB、ABCpred软件分析B细胞抗原表位。AMPHI法预测Th细胞的抗原表位;使用Jpred 4软件和SWISS-MODEL构建TPI的二、三级结构;应用MEGA 4.0软件比对细粒棘球绦虫TPI和人类TPI、日本血吸虫TPI、肝片吸虫TPI等7种生物的序列。结果通过分析得出EgTPI二级结构中直链结构占15.6%、α螺旋占38.9%、转角结构占12.0%、其他结构占42.2%;经多序列比对,人类TPI与细粒棘球绦虫TPI-致度仅为40.08%,较大的差异更有利于形成抗原表位。预测可能的T细胞表位有16-30、71-85、98-119、142-154、178-200;可能的B细胞表位有28-39、50-60、70-80、131-139、150-159、213-231。结论 EgTPI可能形成T细胞表位区域有5个,B细胞表位的区域有6个,EgTPI抗原表位预测分析为疾病诊断的候选分子筛选奠定分子生物学理论依据。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 磷酸丙糖异构酶(TPI) 抗原表位 生物信息学
结核分枝杆菌Rv0674的抗原表位预测
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作者 杨延辉 董利军 +5 位作者 梁忠喆 刘通 崔烨挺 林源 张炜 杨玉荣 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期394-396,400共4页
目的预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)H37Rv的Rv0674蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar Lasergene软件中的Protean程序分析MTB Rv0674蛋白的二级结构,包括表面可能性、可变性、亲疏水性、抗原性等,预测Rv0674的B、T细... 目的预测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)H37Rv的Rv0674蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar Lasergene软件中的Protean程序分析MTB Rv0674蛋白的二级结构,包括表面可能性、可变性、亲疏水性、抗原性等,预测Rv0674的B、T细胞表位。结果MTB Rv0674蛋白的二级结构多样化,预测得到9个亲水区,含有的B细胞表位分布在24-30、46-63、87-88、114-118、154-157、161-185、192-196、207-209和222-225位氨基酸残基及其附近,表位抗原性较好,均含有β转角和不规则卷曲结构,表面可能性和可变区较多;含有T细胞表位可能分布在26-29、38-42、47-50、53-56、66-70、76-79、83-86、104-108、122-126、137-141、154-157、164-167、171-174、195-199、217-221和232-235位氨基酸残基及其附近。结论生物信息学方法预测Rv0674蛋白为亲水性蛋白,且含有丰富的B、T细胞抗原表位,为研究Rv0674蛋白的免疫学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 Rv0674 抗原表位 预测
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